何 易, 李旭東, 王東寧, 肖若芝, 王文文, 胡 元, 林東軍△
(中山大學(xué)1附屬第三醫(yī)院血液科,2血液病研究所,廣東廣州510630)
涉及11q23的染色體異常是造血系統(tǒng)腫瘤中常見(jiàn)的遺傳學(xué)改變,分子水平研究揭示此異常導(dǎo)致位于11q23的混合譜系白血病(mixed-lineage leukemia,MLL)基因發(fā)生重排,此基因亦被稱(chēng)為 ALL1、HTRX、HRX或TRX1基因。MLL異??煞譃閮深?lèi),一類(lèi)為MLL重排,包括涉及MLL的易位、倒位和串聯(lián)重復(fù)序列(partial tandem duplication,PTD);第二類(lèi)為MLL擴(kuò)增,包括多倍體、均勻染色區(qū)(homogeneously staining region,hsr)和雙微染色體(double minutes,dmin)以及標(biāo)記染色體(marker chromosome,mar)。WHO已將涉及11q23/MLL基因重排的急性白血病單獨(dú)列為11q23/MLL白血病,累及的白血病大多惡性程度高,對(duì)常規(guī)化療不敏感,生存期短,是預(yù)后差的獨(dú)立因素[1-2],而早期進(jìn)行造血干細(xì)胞移植可能為改善預(yù)后帶來(lái)好處[3-4]。因此,MLL基因重排的檢測(cè)對(duì)急性白血病(acute leukemia,AL)預(yù)后判斷和治療方案選擇具有重要意義。我們對(duì)201例已進(jìn)行常規(guī)染色體核型分析(conventional cytogenetics analysis,CCA)的AL患者回顧性地總結(jié)熒光原位雜交技術(shù)(fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)和逆轉(zhuǎn)錄多重巢式聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)(reverse transcriptionmultiplex nested PCR,multiplex RT-PCR)對(duì)MLL基因異常的檢出率,探討兩者聯(lián)合應(yīng)用的價(jià)值。
自2008年1月~2011年5月于我院住院并行常規(guī)CCA、FISH和multiplex RT-PCR檢測(cè)的原發(fā)AL患者共201例,包括急性髓細(xì)胞白血病(acute myeloid leukemia,AML)患者128例及急性淋巴細(xì)胞白血病(acute lymphoid leukemia,ALL)患者73例。共檢出19例MLL基因重排患者,其中13例為AML,按FAB分型M5 10例,M4 2例,M2 1例;6例為ALL。19例患者中男12例,女7例,中位年齡25.5 (2~68)歲。所有病例均進(jìn)行形態(tài)學(xué)、免疫學(xué)、分子生物學(xué)和細(xì)胞遺傳學(xué)(MICM)分型。
2.1 細(xì)胞遺傳學(xué)分析 取患者治療前骨髓3 mL,采用短期培養(yǎng)法培養(yǎng)骨髓24 h,終止培養(yǎng)前1 h加0.05 g/L秋水仙堿,按常規(guī)方法制備染色體,采用RHG顯帶技術(shù)進(jìn)行核型分析,染色體核型描述參照ISCN2005的標(biāo)準(zhǔn)。
2.2 間期FISH檢測(cè) 采用染色體短期培養(yǎng)法的標(biāo)本,氣干法滴片,并于2×SSC中洗片2 min,70%、85%、100%乙醇梯度脫水各2 min,加入MLL breakpoint探針(Cytocell),實(shí)驗(yàn)方法按說(shuō)明書(shū)操作。橡皮水泥密封,37℃恒溫雜交儀過(guò)夜,次日洗片后用含0.1 mg/L二咪基苯基吲哚(DAPI)的抗褪色液復(fù)染標(biāo)本10 min后在熒光顯微鏡下觀察,分析間期細(xì)胞200個(gè)。11q23/MLL基因重排陰性的細(xì)胞顯示2個(gè)黃色融合信號(hào)(0R0G2Y),重排陽(yáng)性的細(xì)胞顯示1個(gè)黃色融合信號(hào)和1個(gè)紅色及1個(gè)綠色信號(hào)(1R1G1Y),MLL擴(kuò)增顯示為3個(gè)以上的黃色融合信號(hào)。
2.3 中期FISH檢測(cè) 方法同間期FISH,選擇分散較好的中期分裂相在熒光顯微鏡下觀察MLL信號(hào)。
2.4 Multiplex RT-PCR檢測(cè) 取治療前EDTA抗凝的骨髓2 mL,采用 Trizol(Invitrogen)試劑提取(1~2)×106個(gè)有核細(xì)胞總RNA,用Maxima試劑盒(Fermentas)反轉(zhuǎn)錄為cDNA。MLL融合基因引物設(shè)計(jì)及檢測(cè)方法參照文獻(xiàn)[5]進(jìn)行。2%瓊脂糖凝膠電泳,凝膠成像儀(Tanon 2500)軟件分析。共檢測(cè)11種較常見(jiàn)的MLL融合基因,包括:MLL/AFX、MLL/ AF1p、MLL/AF1q、MLL/AF4、MLL/AF6、MLL/AF9、MLL/AF10、dupMLL(11q23)、MLL/AF17、MLL/ELL和MLL/ENL。
用SPSS 16.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行分析,分類(lèi)資料用χ2檢驗(yàn)。
正常分界值的計(jì)算為陰性對(duì)照組中所觀察到的陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)的均數(shù)±3×標(biāo)準(zhǔn)差。陰性對(duì)照組為10例經(jīng)骨髓形態(tài)學(xué)確診的患者,包括特發(fā)性血小板減少性紫癜4例,缺鐵性貧血4例,大致正常骨髓象2例。間期FISH檢測(cè)該組陽(yáng)性細(xì)胞百分率為1%~2.5%,均數(shù)為2%,標(biāo)準(zhǔn)差為0.51%,分界值=2%+ 3×0.51%=3.53%。將陽(yáng)性細(xì)胞百分率大于該值的標(biāo)本定為MLL基因重排陽(yáng)性。
共有19例患者出現(xiàn)11q23/MLL基因重排,見(jiàn)表1。在AML中檢出13例(13/128,10.2%),ALL中檢出6例(6/73,8.2%)。11例(11/201,5.47%)經(jīng)CCA檢測(cè)到11q23異常,分別為:t(4;11)伴+11 1例,t(6;11)2例,t(9;11)2例,t(10;11)3例,t(11; 19)3例。FISH檢測(cè)見(jiàn)15例(15/201,7.46%)出現(xiàn)陽(yáng)性MLL異常信號(hào),其中11例為MLL分離信號(hào),2例為擴(kuò)增信號(hào),同時(shí)出現(xiàn)分離和擴(kuò)增信號(hào)的2例。第4例患者CCA正常,中期FISH見(jiàn)MLL分離的紅綠信號(hào)分別位于11號(hào)染色體的長(zhǎng)短臂上,提示inv (11),見(jiàn)圖1。18例患者(18/201,8.86%)檢出MLL融合基因陽(yáng)性表達(dá),分別為:dup MLL(11q23)6例,MLL/AF6 2例,MLL/AF10 3例,MLL/AF9 2例,MLL/ ELL 2例,MLL/ENL、MLL/AF4和 MLL/ELL伴 dup MLL(11q23)各1例,見(jiàn)表1。
表1 19例11q23/MLL基因重排陽(yáng)性患者核型、FISH和PCR結(jié)果Table 1 .The results of karyotype,F(xiàn)ISH and PCR in 19 MLL-positive cases
Figure 1.FISH results of the MLL probe.MLL gene exhibit yellow fluorescent.The break-apart of red and green signals stands for MLL rearrangement.圖1MLL探針的FISH結(jié)果
將CCA中無(wú)11q23重排的患者分為2組,一組為正常核型組,另一組為其它附加染色體異常組。5例正常核型組患者經(jīng)FISH檢測(cè)1例為inv(11),1例為MLL擴(kuò)增;multiplex RT-PCR檢出4例dup MLL (11q23)。3例具有其它染色體異常的患者中1例為超二倍體,F(xiàn)ISH檢測(cè)發(fā)現(xiàn)MLL擴(kuò)增,1例 +8,F(xiàn)ISH未發(fā)現(xiàn)異常,這2例患者multiplex RT-PCR檢出均為 dup MLL(11q23);第3例患者為四倍體,F(xiàn)ISH檢測(cè)發(fā)現(xiàn)MLL重排并擴(kuò)增,multiplex RT-PCR檢出MLL/ELL并dup MLL(11q23),見(jiàn)圖2。FISH聯(lián)合multiplex RT-PCR檢出MLL異常率為9.45% (19/201),較CCA檢出MLL異常率(5.47%)明顯提高,χ2=100.558,P<0.01。19例MLL陽(yáng)性的患者中,CCA敏感度為57.9%(11/19),F(xiàn)ISH敏感度為78.9%(15/19),multiplex RT-PCR敏感度為94.7%(18/19)。
Figure 2.PCR results for MLL rearrangement.A:dup(MLL) positive product.Lane 1:MLLex5/MLLex2.B:MLL/ ELL(+)product.Lane 1,2:CBF/MYH11;Lane 3: MLL/AFX Lane 4:MLL/AF6;Lane 5:MLL/ELL.M:DNA marker.圖2MLL重排的PCR結(jié)果
染色體易位是白血病常見(jiàn)的遺傳學(xué)改變,不同染色體或同一染色體不同區(qū)段易位后可造成2個(gè)基因融合,從而導(dǎo)致相應(yīng)基因功能的異常獲得或喪失,使細(xì)胞發(fā)生惡性轉(zhuǎn)化并出現(xiàn)增生異常、分化障礙和凋亡減少。MLL易位、串聯(lián)重復(fù)和擴(kuò)增等可造成HOX基因的持續(xù)表達(dá)而分化失控,導(dǎo)致造血干細(xì)胞惡變[6]。MLL重排是白血病重現(xiàn)性的遺傳學(xué)改變之一,具有MLL重排的急性白血病對(duì)常規(guī)化療反應(yīng)差,對(duì)急性白血病的分型診斷、治療方案選擇和預(yù)后評(píng)價(jià)有指導(dǎo)意義,因此是急性白血病的常規(guī)檢查項(xiàng)目。CCA能全面分析人類(lèi)23對(duì)染色體異常情況,是分析11q23重排的常用方法,但由于受染色體中期分裂相數(shù)量和質(zhì)量以及染色體隱匿易位或PTD的影響,CCA將導(dǎo)致部分11q23異常漏檢。MLL重現(xiàn)性易位已達(dá)100種以上,已鑒定的伙伴基因達(dá)60多種[7],龐大的易位種類(lèi)也給CCA帶來(lái)一定的困難。本研究中CCA檢出11q23重排的敏感度為57.9%,而FISH和multiplex RT-PCR檢出MLL敏感度分別為78.9%和94.7%,提示CCA并非為檢測(cè)11q23/MLL重排的敏感方法。
FISH是結(jié)合了細(xì)胞遺傳學(xué)、分子生物學(xué)和免疫學(xué)的一種新技術(shù),具有快速直觀、敏感性和特異性高、可重復(fù)性好等特點(diǎn)。間期FISH不受染色體質(zhì)量的影響,可用于單細(xì)胞水平的直接觀察[8-9]。11q23/MLL易位的斷裂點(diǎn)絕大多數(shù)發(fā)生在8.5 kb的BamH I酶切片段、包含了外顯子5~11的斷裂集中區(qū)(breakpoint cluster region,BCR),我們使用的11q23/MLL雙色分離信號(hào)探針正是以BCR為界線,用2個(gè)DNA片段以不同的熒光染料分別標(biāo)記MLL基因斷裂集中區(qū)的中心粒端和端粒端。11q23/MLL雙色分離探針在間期細(xì)胞中易于觀察累及11q23/ MLL的各種易位、缺失和擴(kuò)增而無(wú)需預(yù)先知道伙伴基因,但不能判斷倒位、插入和PTD。結(jié)合中期FISH則可明確易位的伙伴基因、倒位和插入。本研究中第4例患者CCA未見(jiàn)異常,于間期細(xì)胞中僅見(jiàn)分離信號(hào),而中期分裂相上見(jiàn)MLL分離的紅綠信號(hào)分別位于11號(hào)染色體的長(zhǎng)短臂上,證實(shí)為 inv(11)。FISH檢出的4例MLL擴(kuò)增,包括多倍體和mar,CCA只報(bào)告了1例11三體和1例四倍體。這提示FISH能檢出CCA難以發(fā)現(xiàn)的MLL隱匿易位、倒位和擴(kuò)增,其敏感性要高于CCA。
MLL與伙伴基因融合后轉(zhuǎn)錄出融合基因轉(zhuǎn)錄本,雖然涉及的伙伴基因眾多,但以MLLT2(AF4)、MLLT3(AF9)、MLLT1(ENL)、MLLT10(AF10)和MLLT4(AF6)出現(xiàn)頻率最高[10]。多數(shù)研究表明具有MLL基因重排的患者對(duì)常規(guī)化療反應(yīng)差,預(yù)后不良,尤其年齡小于1歲的嬰幼兒治療效果更差[1-2]。PTD為MLL自身融合的形式,具有MLL-PTD的患者同樣生存期也較MLL-PTD陰性者短[11]。我們采用的multiplex RT-PCR方法中包含了MLL/AFX、 MLL/AF1P、MLL/AF1q、MLL/AF4、MLL/AF6、MLL/ AF9、MLL/AF10、MLL/AF17、MLL/ELL和 MLL/ENL等常見(jiàn)的融合基因,也包含了dupMLL(11q23)這種不能被CCA和FISH方法檢測(cè)出的串聯(lián)重復(fù)形式。本研究確定了12例MLL的伙伴基因,還檢出了7例dupMLL(11q23),彌補(bǔ)了CCA和FISH的不足。
綜上所述,F(xiàn)ISH的雙色分離探針能夠檢測(cè)間期細(xì)胞和中期分裂相上的MLL信號(hào),無(wú)需預(yù)先知道伙伴基因,其檢測(cè)范圍大大高于multiplex RT-PCR;而multiplex RT-PCR能夠明確常見(jiàn)的MLL融合基因及其伙伴基因,還能檢出FISH無(wú)法測(cè)到的MLLPTD,兩者結(jié)合顯著提高了MLL重排的檢出率。
[1] Shih LY,Liang DC,F(xiàn)u JF,et al.Characterization of fusion partner genes in 114 patients with de novo acute myeloid leukemia and MLL rearrangement[J].Leukemia,2006,20 (2):218-223.
[2] Balgobind BV,Raimondi SC,Harbott J,et al.Novel prognostic subgroups in childhood 11q23/MLL-rearranged acute myeloid leukemia:results of an international retrospective study[J].Blood,2009,114(12):2489-2496.
[3] Isoyama K,Eguchi M,Hibi S,et al.Risk-directed treatment of infant acute lymphoblastic leukaemia based on early assessment of MLL gene status:results of the Japan Infant Leukaemia Study(MLL96)[J].Br J Haematol,2002,118(4):999-1010.
[4] 趙 杰,殷宇明,趙艷麗,等.36例11q23/MLL融合基因白血病的分子生物學(xué)和臨床特點(diǎn)分析[J].中國(guó)實(shí)驗(yàn)血液學(xué)雜志,2010,18(6):1381-1385.
[5] Pallisgaard N,Hokland P,Riish?j DC,et al.Multiplex reverse transcription-polymerase chain reaction for simultaneous screening of 29 translocations and chromosomal aberrations in acute leukemia[J].Blood,1998,92(2):574-588.
[6] Muntean AG,Hess JL.The pathogenesis of mixed-lineage leukemia[J].Annu Rev Pathol,2012,7:283-301.
[7] Meyer C,Kowarz E,Hofmann J,et al.New insights to the MLL recombinome of acute leukemias[J].Leukemia,2009,23(8):1490-1499.
[8] 侯紅瑛,章 鈞,范建輝,等.MLPA聯(lián)合FISH在DMD基因突變產(chǎn)前診斷中的價(jià)值探討[J].中國(guó)病理生理雜志,2010,26(10):1895-1900.
[9] 方 嬿,黃必軍,梁?jiǎn)⑷f(wàn),等.原發(fā)性肝癌p53基因高頻缺失的雙色熒光原位雜交證據(jù)[J].中國(guó)病理生理雜志,2003,19(3):306-309.
[10] Meyer C,Schneider B,Jakob S,et al.The MLL recombinome of acute leukemias[J].Leukemia,2006,20(5):777-784.
[11] Caligiuri MA,Strout MP,Lawrence D,et al.Rearrangement of ALL1(MLL)in acute myeloid leukemia with normal[J].Cancer Res,1998,58(1):55-59.