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        RPT對秩和檢驗的改進(jìn)及Matlab實現(xiàn)

        2012-03-11 14:01:22
        中國衛(wèi)生統(tǒng)計 2012年4期
        關(guān)鍵詞:方法

        朱 凱 李 悅

        秩和檢驗作為一種方便、有效的非參數(shù)檢驗方法,在實際中有著廣泛的應(yīng)用,特別是在總體分布、參數(shù)均未知時,可以用來比較兩樣本的均值〔1〕。本文針對秩和檢驗對來自非正態(tài)總體兩樣本均值比較可能遇到準(zhǔn)確性問題,介紹可以有效解決這一問題的方法——randomized permutation test(簡稱RPT),并運用Matlab軟件編寫程序?qū)崿F(xiàn)該方法。

        RPT方法簡介

        在實際應(yīng)用秩和檢驗對兩樣本均數(shù)進(jìn)行比較時,采用的方法為:首先求出樣本所有可能組合下的分布,根據(jù)現(xiàn)有樣本計算某一樣本的秩和,記為Robs,稱Robs為秩和的臨界值,然后根據(jù)該分布求出大于或等于Robs的頻率,即為p值。該方法稱為exact permutation test(簡稱EPT)。然而當(dāng)樣本量較大時往往由于組合數(shù)太多(當(dāng)n1=n2=10時組合數(shù)為C1020=184756)難以獲得秩和的確切分布,此時EPT方法難以實現(xiàn)。因此,在樣本量較大時,秩和檢驗將檢驗統(tǒng)計量近似服從正態(tài)分布,利用矩法估計求出其參數(shù)(下稱正態(tài)近似法),這將產(chǎn)生一定的誤差。此外,當(dāng)樣本存在相同秩次較多時,要求對檢驗統(tǒng)計量進(jìn)行校正,這不僅增加計算難度且進(jìn)一步增大誤差〔1-2〕。EPT的一個替代方法是:利用軟件產(chǎn)生隨機(jī)數(shù),通過基于樣本的大量重復(fù)的隨機(jī)組合,得到某一樣本秩和的近似抽樣分布,即對所有可能的組合進(jìn)行隨機(jī)抽樣后計算抽樣秩和大于臨界秩和的頻率,稱之為RPT〔3〕,該方法的關(guān)鍵步驟如下:

        1. 建立假設(shè),確定檢驗水準(zhǔn),H0:μ1= μ2,H1:μ1>μ2,α =0.05(單側(cè)檢驗);

        2.計算現(xiàn)有檢驗統(tǒng)計量Robs;

        3.構(gòu)造檢驗統(tǒng)計量R,在H0假設(shè)成立的條件下,利用軟件從兩樣本構(gòu)成的總體中抽取與樣本容量相同的樣本,并計算其秩和,反復(fù)進(jìn)行該步驟得到檢驗統(tǒng)計量的經(jīng)驗抽樣分布;

        實例應(yīng)用與Matlab實現(xiàn)

        為研究兩位化驗員讀得某種液體黏度讀數(shù)的差異,現(xiàn)對同一液體進(jìn)行重復(fù)讀數(shù),數(shù)據(jù)見表1,試判斷兩化驗員讀數(shù)是否有差異(α=0.05)〔1〕。

        表1 A、B兩位化驗員讀數(shù)結(jié)果

        解:H0:μ1= μ2,H1:μ1> μ2,其中 μ1,μ2分別為兩總體的均值。

        由題中數(shù)據(jù)可知n1=10,n2=11,將第一組秩和定為檢驗統(tǒng)計量,Robs=121。用RPT模擬100000次,即從上述兩組的21個數(shù)值中有放回地隨機(jī)抽取10個數(shù)值,重復(fù)進(jìn)行100000次,求這10個數(shù)的秩和RA大于Robs的頻率。筆者編寫了相應(yīng)的Matlab程序?qū)崿F(xiàn)該方法,程序及注釋如下:

        a=[82 73 91 84 77 98 81 79 87 85];

        b=[80 76 92 86 74 96 83 79 80 75 79];%數(shù)據(jù)錄入

        n1=length(a);n2=length(b);n=n1+n2;%數(shù)據(jù)量統(tǒng)計

        c=[a,b;ones(1,n)〕];

        [,,stats]=ranksum(a,b);%計算秩和

        rank1=stats.ranksum;%計算Robs

        m=100000;%模擬次數(shù)

        t=0;rank0=zeros(1,m);%數(shù)據(jù)清零

        for k=1:m

        d=randperm(n);%生成1-21個隨機(jī)排列的整數(shù)

        for k0=1:n1

        rank0(k)=rank0(k)+c(2,d(k0));% 隨機(jī)抽取10個數(shù)并求其秩和

        end

        if rank0(k)>rank1

        t=t+1;%統(tǒng)計超過臨界秩和的數(shù)目

        end

        end

        p=t/m;%超過臨界秩和的頻率

        通過運行該程序,得到p=P(R≥Robs)=0.21811,p值均大于0.05,故接受H0,認(rèn)為兩位化驗員所測得的數(shù)據(jù)無顯著差異。若使用EPT方法進(jìn)行全排列,所有組合將達(dá)到C1021=352716種,且隨著樣本量的增加EPT方法運算次數(shù)還將呈幾何數(shù)增長,故EPT方法在實踐中是難以實現(xiàn)的。對上述程序進(jìn)行適當(dāng)修改后我們可以得出該問題的確切概率p'=P(R≥Robs)=0.2181239,RPT方法與之相比相對誤差只有0.0063626%。若使用傳統(tǒng)方法,求得的概率 p″=0.21891,此時相對誤差達(dá)到了0.36%,是RPT方法的近60倍。當(dāng)P值較小時,傳統(tǒng)方法的相對誤差還將進(jìn)一步增大。由此我們可知RPT方法較傳統(tǒng)方法減少了誤差,較EPT方法減少了運算次數(shù),且該方法可根據(jù)實際情況適當(dāng)調(diào)整抽樣次數(shù),以達(dá)到增加精度或減少計算量的目的。

        結(jié) 論

        在樣本量較大、總體分布未知,沒有其他合適方法進(jìn)行兩樣本均值比較時,可以使用秩和檢驗來進(jìn)行統(tǒng)計推斷〔4-6〕。在應(yīng)用RPT方法進(jìn)行秩和檢驗時需注意如下幾個問題:

        1.秩和檢驗作為一種非參數(shù)檢驗,由于不依賴資料的分布類型,故適用范圍廣泛,尤其在等級資料的分析中有較高的功效。

        2.編秩時相同值要取平均秩次,否則將使秩和的臨界值發(fā)生錯誤,影響最終結(jié)果。

        3.模擬誤差來源于Monte Carlo模擬抽樣。理論上,無限次的模擬將會完全消除模擬誤差,但顯然這是不可能也沒有必要的。因此確定模擬誤差足夠小并且計算可行的RPT抽樣次數(shù)是有效控制模擬誤差的必要步驟〔3〕。

        4.由于程序運行中要用到隨機(jī)數(shù),最終的結(jié)果有一定的誤差,因此建議反復(fù)運行程序,待結(jié)果相對穩(wěn)定時再下結(jié)論。

        RPT作為EPT的一種近似方法,具有使用方便、誤差小、執(zhí)行效率高的優(yōu)點,對出現(xiàn)較多相同秩次時處理能力較強,是一種有效提高秩和檢驗效率的好方法。

        1.盛驟,謝式千,潘承毅.概率論與數(shù)理統(tǒng)計(第二版).北京:高等教育出版社,1989:118-121.

        2.顏杰,李彩霞,等.完全隨機(jī)設(shè)計兩組t檢驗與秩和檢驗的功效比較.中國衛(wèi)生統(tǒng)計,2004,21(1):10-13.

        3.丁元林,孔丹莉.多個樣本及其兩兩比較的秩和檢驗SAS程序.中國衛(wèi)生統(tǒng)計,2002,19(5):313-314.

        4.荀鵬程,趙楊,柏建嶺,等.Permutation Test在假設(shè)檢驗中的.?dāng)?shù)理統(tǒng)計與管理,2006,26(5):616.

        5.Cai JW,Shen Y.Permutation tests for comparing marginal survival functions with clustered failure time data.Statist.Med,2000,19:2963-2973.6.王試會,徐勇勇.隨機(jī)區(qū)組設(shè)計資料秩和檢驗的改進(jìn)方法.中國衛(wèi)生統(tǒng)計,2003,20(4):231-232.

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