王輝林,李江華,劉龍,宋江寧,堵國成,4
1 中科院天津工業(yè)生物技術研究所 工業(yè)酶國家工程實驗室,天津 300308
2 中科院天津工業(yè)生物技術研究所 系統(tǒng)微生物工程中科院重點實驗室,天津 300308
3 江南大學生物工程學院 工業(yè)生物技術教育部重點實驗室,江蘇 無錫 214122
4 江南大學 食品科學與技術國家重點實驗室,江蘇 無錫 214122
堿性果膠酶 (Alkaline polygalacturonate lyase,PGL,E.C.4.2.2.2) 是一類能在堿性條件下高效分解植物組織中果膠質 (由 D-半乳糖醛酸以 α-1,4糖苷鍵連接形成的直鏈狀聚合物) 的酶的總稱[1]。它是紡織用酶的一種,主要應用于棉織物的生物精煉,除去棉纖維中的果膠等雜質。與傳統(tǒng)高能耗、高污水排放的堿處理法相比,酶處理法具有條件溫和、環(huán)境友好、低能耗、易實現清潔生產等優(yōu)勢[2-4],也可提高棉織物的品質[5-6]。因此,以堿性果膠酶為主的酶處理法取代傳統(tǒng)高溫高堿的化學工藝具有重要意義。
甲醇營養(yǎng)型畢赤酵母 (The methylotrophic Pichia pastoris) 從上世紀70年代被開發(fā)應用于外源蛋白的表達開始,現在已經成為研究和使用最廣泛的表達系統(tǒng)之一[7]。超過500種重組蛋白在畢赤酵母中表達成功[8],外源蛋白表達水平可達到胞外蛋白的80%或總蛋白的30%[9]。畢赤酵母表達系統(tǒng)的改造及高效表達是目前生化工程研究的熱點[10]。表達系統(tǒng)改造方面,Mehmet Inan等[11]通過過量表達蛋白質二硫鍵異構酶,促進畢赤酵母翻譯后修飾與胞外分泌。Brigitte Gasser等[12]構建生物素原養(yǎng)型畢赤酵母,使發(fā)酵過程不再需要添加生物素。在發(fā)酵優(yōu)化方面,研究主要集中在高密度發(fā)酵、誘導條件優(yōu)化、甲醇流加控制策略等方面。雙碳源混合流加、低溫誘導、富氧培養(yǎng)、降低蛋白酶降解作用等也常作為優(yōu)化策略以提高外源蛋白的表達效率。
本研究室諸葛斌等[13]擴增出野生芽胞桿菌Bacillus sp. WSHB04-02的堿性果膠酶編碼基因,并成功表達于P. pastoris GS115中。王蕓等[14-15]應用高密度培養(yǎng)和低溫誘導等策略,使堿性果膠酶產量達到國際領先水平。但是,高密度發(fā)酵在工業(yè)化放大生產過程中,易出現供氧不足、冷凝水能耗過大、發(fā)酵高粘度、高死亡率和高蛋白酶分泌等問題[16]。這些不利因素容易導致生產失敗。在3 L和30 L發(fā)酵罐中,PGL的產量可分別達到890 U/mL和1 425 U/mL。但是,在5 t工業(yè)發(fā)酵罐進行放大后,酶活僅為504 U/mL[16]。因此,為了進一步提高 PGL的生產強度并尋找適合于工業(yè)化生產的發(fā)酵新模式,本文系統(tǒng)研究了細胞密度對重組畢赤酵母分批補料發(fā)酵和連續(xù)培養(yǎng)生產 PGL的影響,并發(fā)展出恒細胞密度發(fā)酵表達PGL的新策略。
宿主為P. pastoris GS115,同時具有Mut+和的His+表型,整合了來自Bacillus sp. WSHB04-02中的PGL基因,拷貝數為2~3個,本實驗室保藏[13]。
1.2.1 YPD種子培養(yǎng)基
1%酵母膏(Yeast extract),2%蛋白胨(Peptone),2%葡萄糖(Glucose)。
1.2.2 甘油分批發(fā)酵培養(yǎng)基 (Batch media)
甘油 (Glycerol) 40.0 g/L,K2SO418.2 g/L,CaSO40.93 g/L,MgSO4·7H2O 14.9 g/L,85% H3PO426.7 mL/L,KOH 4.13 g/L,微量元素溶液(PTM1)[16]4.35 mL/L,115 ℃滅菌15 min,再用25% NH4OH調pH至5.5。
1.2.3 甘油補料生長培養(yǎng)基
含12 ml/L PTM1的 50% (W/V) 的甘油溶液。
1.2.4 發(fā)酵誘導培養(yǎng)基
分批補料誘導培養(yǎng)基:含12 mL/L PTM1的100%甲醇溶液 (分析純) 。
連續(xù)培養(yǎng)誘導培養(yǎng)基:w1% (W/V) CCM (Continuous culture media, 即為5倍含量的 (除甘油、氨水、PTM1外) 的Batch media培養(yǎng)基) + w2% (W/V)甲醇 (分析純) + w3% ( W/V) PTM1,其中w1~w3的值參見3.1.2。
1.3.1 種子搖瓶培養(yǎng)
種子甘油管于-80 ℃保藏,從甘油管中接1 mL菌液于50 mL YPD培養(yǎng)基中 (搖瓶裝液量為10%),于30 ℃、200 r/min搖床培養(yǎng)24 h,OD600為8~16。
1.3.2 高密度發(fā)酵培養(yǎng)
將種子培養(yǎng)液接入 3 L全自動發(fā)酵罐(LiFlus GM BioTRON, Korea) 中,接種量為10%。初始培養(yǎng)條件為:裝液量800~1 000 mL,起始攪拌轉速為300 r/min,通氣量2 vvm。生長階段溫度為30 ℃,采用攪拌關聯控制使DO維持在 (30±5)%,攪拌轉速最高值設置為950 r/min。采用30%的磷酸溶液和25%的濃氨水控制pH在5.5。
當甘油耗盡時 (DO迅速上升至60%以上),采用指數流加方式補加50% (W/V) 的甘油。通過控制指數流加時間以實現不同誘導初始細胞密度。指數流加結束后,待甘油再次耗盡,DO再次反彈至60%以上時,開始流加誘導培養(yǎng)基,并將誘導溫度降低至22 ℃。通過控制誘導培養(yǎng)基的流加速度,使培養(yǎng)基中甲醇濃度迅速達到并維持在1.8% (V/V),此時,FC2002型甲醇檢測流加控制器的甲醇殘留濃度值為1.8% (V/V)。發(fā)酵過程使用發(fā)酵罐控制系統(tǒng)軟件自動控制與數據采集[16]。
1.4.1 菌體干重的測定
準確移取10 mL 發(fā)酵液于50 mL離心管中,先經過10 000 r/min冷凍離心5 min,棄上清,再用蒸餾水重懸,重復洗滌離心2次。然后將菌體放在恒溫烘箱105 ℃烘干至恒重。最后,稱量并計算干重 (DCW,g/L)。
1.4.2 堿性果膠酶活性的測定
一個標準酶活單位 (IU) 定義為:每分鐘使聚半乳糖醛酸裂解產生1 μmol的不飽和聚半乳糖醛酸的酶量[17]。
1.4.3 醇氧化酶AOX活力的測定
取發(fā)酵液放置于干冰中迅速冷凍后轉移到-80 ℃超低溫冰箱中。測定時,將樣品置于冰水中解凍,于4 ℃、10 000 r/min離心5 min,用50 mmol/L磷酸緩沖液 (pH 7.0) 洗滌2次,再用緩沖液重懸。然后,將重懸菌液進行超聲波破碎處理,破碎時間為10 min,再離心收集上清酶液。
AOX測定標準分析混合液 (3 mL):甲醇200 μmol,4-氨酰安替比林1 μmol,PBS (pH 7.0) 100 μmol,苯酚4.3 μmol,辣根過氧化物酶15 U和稀釋后的待測酶液。反應體系于可控溫的UV2450分光光度計 37 ℃下動態(tài)測定吸光度變化斜率,通過公式計算出醌的變化量來表示AOX的酶活力。AOX酶活的定義為:在上述條件下,每分鐘生成1 μmol H2O2需要的酶量[18]。
1.4.4 細胞活力和出芽率測定
細胞活性 (或死亡率) 采用臺盼藍染色細胞存活率檢測試劑盒進行檢測。取一定量樣品用50 mmol/L磷酸緩沖液 (pH 7.0) 洗滌2次,再用細胞稀釋液稀釋重懸。吸取100 μL細胞懸液到離心管內,加入100 μL臺盼藍染色液,混合均勻,染色3~5 min (時間不宜過長),然后于血球計數板計數。由于健康的酵母細胞能夠排斥臺盼藍,臺盼藍不進入細胞;而死亡的細胞,喪失膜的完整性,通透性增加,臺盼藍將細胞染成藍色。因此顯微鏡下藍色細胞為死亡細胞,透明細胞為活性細胞。為了得到更高的準確率,每個樣品將進行500個細胞以上的計數。
另外,每個樣品都測定其出芽率。如果芽體大于母細胞的一半體積則計為1個細胞,否則不計為細胞。
1.4.5 胞外蛋白酶測定
發(fā)酵液經過10 000 r/min離心10 min,收集上清液作為待測樣品。胞外的總蛋白酶酶活力采用Pierce Colorimetric QuanticleaveTM的蛋白酶檢測試劑盒進行測定[19]。
高密度發(fā)酵技術是提高重組畢赤酵母表達外源蛋白效率的一種重要技術手段。高密度發(fā)酵能有效地提高目的產物的濃度,降低下游分離純化成本。細胞密度是畢赤酵母發(fā)酵過程的重要控制參數,尤其在工業(yè)化放大過程中,基于細胞密度的放大對于發(fā)酵的成敗至關重要。因此,在發(fā)酵過程中,控制合理的細胞密度,對于實現異源蛋白的高效表達具有重要意義。
根據王蕓等[20]采用甘油指數流加方法,實現畢赤酵母生長階段的高密度培養(yǎng)。通過控制甘油的流加,即分別進行5 h、9 h、14 h的流加,誘導初始細胞密度可分別達到56.7 g/L、83.4 g/L、124.9 g/L。
在誘導表達階段,甲醇不但是啟動子(pAOX1) 的誘導劑,也為菌體生長提供碳源和能源。因此,在誘導階段,畢赤酵母表達外源蛋白的同時,菌體密度也在不斷增加。如圖1所示,3種不同誘導初始細胞密度 (分別為 56.7 g/L、83.4 g/L、124.9 g/L) 誘導120 h后,最終菌體密度分別達到115 g/L、140 g/L、155 g/L。低誘導初始細胞密度發(fā)酵 (56.7 g/L) 的菌體生長最快,比生長速率最高可達到0.029 h-1。菌體密度影響產品的總收率:發(fā)酵結束時細胞密度越高,總上清液與總發(fā)酵液的比例越小,固液分離操作過程中的產品的收率越低。酶液的回收率與發(fā)酵液的細胞密度呈線性負相關 (y=-0.0026x+0.999, R2=0.9966,數據未顯示)。此外,過高的細胞密度也加大工業(yè)化后處理的操作困難。
如圖 1D所示,細胞密度與比生長速率 (μ)密切相關,菌體密度限制了細胞生長。μ隨著細胞密度的增大而下降,當細胞干重達到130 g/L以上,菌體生長緩慢,μ約為0.008 h-1。而細胞密度為75 g/L時,μ可高達0.029 h-1。
在相同的發(fā)酵條件下,增加誘導初始細胞密度,發(fā)酵過程的溶氧水平下降。當初始菌體濃度為56.7 g/L時,發(fā)酵過程的DO值維持在20%以上。而誘導初始細胞濃度為83.4 g/L和124.9 g/L時,發(fā)酵過程的DO僅分別為10% (維持在8%~15%) 和5% (維持在3%~6%)。表明這兩種高細胞密度的發(fā)酵出現了供氧不足的現象。
如圖 1和表 2所示,當初始細胞密度為56.7 g/L,誘導77 h,酶活為691.4 U/mL。而當初始菌體密度增加到124.9 g/L,誘導101 h,酶活可達到961.4 U/mL,比初始菌體密度為56.7 g/L提高了39.1%。但是,初始細胞密度為56.7 g/L的單位菌體生產強度 (Average specific enzyme production rate,QX) 和單位發(fā)酵液體積生產強度 (PGL productivity,QV) 可分別達到了44.3 U/(g·h)、5.09 U/(g·h)。該過程的QX值比初始時的 83.4 g/L (35.1 U/(g·h))、124.9 g/L (27.9 U/(g·h)) 分別高出26.2%、58.8%。QV也分別比另外兩種發(fā)酵策略 (4.56 U/(mL·h)、4.30 U/(mL·h)) 高出11.6%、18.4%。QX隨著誘導初始細胞密度的升高而下降,說明控制合理細胞密度發(fā)酵有利于提高QX。
一般來說,利用重組畢赤酵母發(fā)酵生產外源蛋白的發(fā)酵周期較長 (如高密度對照組的發(fā)酵周期為137 h)。而初始細胞密度為56.7 g/L的發(fā)酵方式的周期比高密度對照組縮短了39 h,發(fā)酵總周期僅為98 h。
上述結論表明,細胞密度是影響重組畢赤酵母高效表達 PGL的關鍵因素,合理地控制細胞密度能有效地提高 PGL的表達效率。因此,本文進一步研究細胞密度對連續(xù)培養(yǎng)過程 PGL表達的影響,并提出恒細胞密度 (Constant cell concentration by methanol feeding,簡稱為CCCM)發(fā)酵策略以提高PGL的表達效率。
圖1 控制誘導初始細胞密度對PGL表達過程的影響Fig. 1 Time evolution of biomass (Dry cell weight, DCW), dissolve oxygen, PGL activity under different cell concentrations in the prior-induction phase. (A) 56.7 g/L. (B) 83.4 g/L. (C) 124.9 g/L. (D) The relationship between the specific growth rate and biomass.
在誘導階段,傳統(tǒng)的誘導方式采用流加100%的甲醇,導致誘導階段細胞密度不斷上升。因此,為了準確控制誘導階段的細胞密度,必須調控甲醇流加的比例。本研究通過分析恒細胞密度發(fā)酵策略的動力學方程,并確定了動力學參數,使之更好地指導甲醇的流加。在連續(xù)培養(yǎng)過程中,使用25%氨水和30%磷酸調節(jié)pH,使體系的pH控制在 5.5,氨水和磷酸的補料體積相比甲醇補料培養(yǎng)基可忽略不計
其中,F為補料流速,Fccm為連續(xù)培養(yǎng)基本補料培養(yǎng)基的流速,Fm為甲醇培養(yǎng)基 (含PTM1的甲醇溶液) 的流速,w1、w2(見公式4) 分別為CCM、甲醇補料比例,單位為% (W/V)。D為稀釋率,V為發(fā)酵液體積,μ為比生長速率。w1的值是根據單位菌體對基本補料培養(yǎng)基 (CCM)的需求量 (本文中每克細胞干重需1.3 mL CCM培養(yǎng)基),確定其流加比例。PTM1的添加量參考分批補料流加,即12 mL PTM1/1 000 mL甲醇。
恒細胞密度發(fā)酵過程,通過控制流加甲醇的速率和比例,使甲醇殘留濃度維持在 1.8% (V/V)。因此需要準確計算出 w2的預期值,以實現恒細胞密度培養(yǎng)。當發(fā)酵過程不考慮細胞維持系數,則:
式 (3) 中,wt為培養(yǎng)基中甲醇的殘留濃度,即為1.8% (V/V)。在畢赤酵母高密度發(fā)酵的誘導過程中,甲醇不僅為菌體提供碳源;也可被氧化,為細胞提供能量,維持細胞的能量代謝。因此,細胞維持系數并不可忽略,則:
在恒細胞密度發(fā)酵過程中,發(fā)酵過程可以分成2個階段,即適應期 (Adaption stage) 與穩(wěn)定期 (Stable stage)。在適應期,甲醇消耗速度較慢;而在穩(wěn)定期,甲醇消耗速率較快,并趨于穩(wěn)定。通過多次發(fā)酵求解可以得到:
如表1所示,在恒細胞密度發(fā)酵過程中,w2的計算值與實際控制值極為接近,說明上述動力學參數求解值能很好地反應發(fā)酵過程的真實情況。因此,可以根據上述公式和參數值,計算出恒細胞密度發(fā)酵過程的甲醇流加方式。
2.3.1 恒細胞密度發(fā)酵對重組畢赤酵母生長與產酶的影響
通過對恒細胞密度培養(yǎng)的流加策略和動力學研究,本研究預設了3種不同的細胞密度,分別為DCW 55 g/L、75 g/L和105 g/L。如圖2所示,通過3種不同流加策略實現恒細胞密度培養(yǎng),其發(fā)酵過程的細胞密度都能夠很好地維持在預設值。在誘導的適應期 (0~10 h),甲醇代謝途徑的關鍵酶開始表達,此時甲醇的利用速率較慢。在穩(wěn)定期 (>10 h),甲醇代謝途徑關鍵酶維持在相對穩(wěn)定的高水平,甲醇被快速利用,為細胞生長和代謝提供所需的碳源和能源。與 Fed-batch culture (FBC) 相比,CCCM培養(yǎng)的菌體生長速率更快,穩(wěn)定期的平均 μ值分別達到 0.018 h-1(DCW 55 g/L)、0.017 h-1(DCW 75 g/L) 和0.012 h-1(DCW 105 g/L)。恒細胞密度培養(yǎng)穩(wěn)定期的出芽率分別維持在23% (DCW 55 g/L)、21% (DCW 75 g/L) 和17% (DCW 105 g/L),說明該培養(yǎng)模式下細胞穩(wěn)定地快速生長。
表1 恒細胞密度發(fā)酵過程w2流加理論值和實際值的比較Table 1 Comparison of the theoretical and practical values of w2 for methanol feeding in the CCCM culture
由于CCCM策略很好地控制細胞密度維持在合理水平,氧氣的需求量降低,不同程度地避免了供氧限制,因此該模式下的溶解氧維持在較高水平。CCCMDCW 55 g/L、CCCMDCW 75 g/L和CCCMDCW105g/L的DO值分別為30%、15%和10%。當溶解氧小于15%時,預示著供氧不足,不利于產酶。溶解氧是發(fā)酵過程一個重要的參數,富氧培養(yǎng)有利于促進氧化磷酸化和 ATP的再生,提高外源蛋白表達效率,促進發(fā)酵過程的適應性[21]。甲醇代謝途徑有兩條途徑,分別為氧化途徑和生長途徑。氧化途徑需消耗大量的氧氣,最終產生大量的能量。而生長途徑需要的氧氣量較少,甲醇最終轉化為生物質 (如下化學式[1-2])。CCCM控制相比FBC,耗氧量少 (高DO值),菌體生長速率快 (高μ值);說明CCCM策略的甲醇生長途徑比例上升,而氧化途徑的比例降低。因此 CCCM發(fā)酵模式降低了代謝產熱,有利于緩解工業(yè)化冷卻壓力。
根據C平衡[22],甲醇代謝途徑:
在CCCM培養(yǎng)中,PGL酶活力隨著細胞密度的增加而升高,3種控制策略PGL酶活可分別達到305.9 U/mL、441.9 U/mL和528.7 U/mL,并于誘導45 h后達到穩(wěn)定水平。如圖2中虛線所示,這表明 CCCM培養(yǎng)過程維持較為穩(wěn)定的產酶速率。
如表2所示,相比于FBC,雖然CCCM培養(yǎng)方式的最終酶活力較低,但是該發(fā)酵策略的生產強度更高。在CCCM培養(yǎng)中,QX值隨著細胞密度的增加而降低,特別是當細胞密度大于75 g/L。CCCMDCW55g/L和CCCMDCW75g/L的QX分別高達 84.5 U/(g·h) 和 81.5 U/(g·h),比CCCMDCW105g/L高出85.7%和79.1%,也分別比分批補料高密度發(fā)酵策略 (FBCDCW124.9g/L) 提高了202.9%和192.1%。相比于不控制細胞的傳
統(tǒng)發(fā)酵方式 (FBCDCW 56.7 g/L和FBCDCW 83.4 g/L),
圖2 恒細胞密度發(fā)酵過程曲線Fig. 2 Time evolution of dissolve oxygen, biomass (Dry cell weight, DCW), budding rate and PGL activity using CCCM culture with different cell concentrations in the post-induction phase. The dash lines are the expectant values of PGL activity in CCCM cultures. (A) 55 g/L. (B) 75 g/L. (C) 105 g/L.
表2 兩種不同發(fā)酵策略表達 (Fed-batch culture和CCCM culture) PGL過程參數的比較Table 2 Comparison of parameters in PGL production by the recombinant P. pastoris during fed-batch culture and constant cell concentration cultrures by methanol feeding (CCCM cultures)
這兩種發(fā)酵過程的 QX值也分別高出 90.7%和 132.2%。在限定的發(fā)酵條件下,高密度培養(yǎng)易導致供氧不足并導致生化條件的惡化,影響了外源蛋白的表達效率。因此,合理控制細胞密度對于提高發(fā)酵的表達效率是非常有意義的。另外,從QV方面105 g/L考慮,DCW為75 g/L的CCCM策略的 QV最高,達到 6.11 U/(mL·h),比CCCMDCW75g/L、CCCMDCW105g/L高出31.4%、27.8%,也分別比 CCCM 比高密度對照組(FBCDCW124.9g/L) 提高了 42.1%。因此,CCCM發(fā)酵策略有利于提高單位發(fā)酵液體積的產酶效率,既提高了發(fā)酵罐的利用效率,又更好發(fā)揮重組菌的產酶潛力。
綜合考慮以上的各個參數,如菌體比產酶速率 (QX)、發(fā)酵液單位體積比產酶速率 (QV) 和PGL酶活等,研究認為DCW為75 g/L的CCCM培養(yǎng)為最優(yōu)的發(fā)酵策略。
2.3.2 恒細胞密度培養(yǎng)對AOX酶活的影響
重組P. pastoris表達外源蛋白受AOX1啟動子 (pAOX1) 調控,在 Mut+型中,AOX的表達水平可作為啟動子效率與外源蛋白表達水平的一個指標[23]。如下圖3所示,采用CCCM控制比 FBC的胞內 AOX表達量更高,也說明了CCCM發(fā)酵策略的PGL的表達效率比FBC策略高。CCCMDCW55g/L的平均AOX酶活為180.8 U/L,比FBCDCW56.70g/L的平均AOX酶活77.2 U/L高出1.34倍。CCCMDCW75g/L和CCCMDCW105g/L也
分別比FBCDCW 83.39 g/L和FBCDCW 124.90 g/L的AOX
表達水平高。AOX是甲醇代謝途徑的第一個酶,因此AOX的高效表達有利于CCCM培養(yǎng)過程菌體的快速生長。在傳統(tǒng)的分批補料發(fā)酵,AOX酶活在發(fā)酵后期開始下降,特別是誘導90 h后。說明此時菌體的產酶能力下降甚至菌體不產酶。而CCCM發(fā)酵策略穩(wěn)定期的AOX維持在相對恒定的水平,說明菌體處于長期的高效表達的狀態(tài)。因此,CCCM發(fā)酵模式有利于重組畢赤酵母延長高效產酶的發(fā)酵周期。
2.3.3 應用恒細胞密度發(fā)酵策略提高細胞活性
圖3 比較兩種不同發(fā)酵策略 (分批補料發(fā)酵和連續(xù)培養(yǎng)) 的AOX酶活Fig. 3 Comparison of the AOX activities under two different fermentation strategies in the post-induction phase. (A) CCCM cultures. (B) Fed-batch cultures with different initial cell concentration.
圖4 恒細胞密度培養(yǎng)的細胞活性變化曲線Fig. 4 Time evolution of cell viability in the CCCM cultures with different cell concentrations in the post-induction phase.
外源蛋白的表達效率與細胞活性密切相關。傳統(tǒng)畢赤酵母發(fā)酵后期,細胞活性往往低于70%,說明細胞承受著各種環(huán)境壓力[24]。甲醇代謝途徑的中間代謝產物 (H2O2、甲酸、甲醛等)對細胞具有毒害作用,導致細胞的死亡。尤其是高密度發(fā)酵,菌體死亡更為明顯,而高死亡率將影響PGL的表達和穩(wěn)定性。CCCM發(fā)酵策略可以有效地提高酵母細胞的活性。如圖 4所示,3種不同的恒細胞密度培養(yǎng)方式維持高的細胞活性,細胞存活率都在 92%以上。特別是 DCW 55 g/L和75 g/L的控制策略,存活率在94%以上。相比之下,傳統(tǒng)高密度發(fā)酵的細胞活力下降很快,誘導120 h后細胞活性僅為83.8%。CCCM培養(yǎng)實現菌體的高活性,主要的原因可能是:1) CCCM 是一種連續(xù)培養(yǎng)過程,菌體生長速度快,具有高的稀釋率,菌體不斷被更新。一部分衰老和死亡細胞被洗出,并被新細胞所取代。CCCM 培養(yǎng)能較好地維持發(fā)酵液新老細胞的更替。2) 細胞受到各種壓力脅迫下,容易引起菌體死亡。CCCM培養(yǎng)控制細胞密度維持在較為合理水平,細胞受到的由于高密度發(fā)酵引起的壓力得到緩解。因此,細胞處于較為舒適的外界環(huán)境,死亡率下降。
2.3.4 應用恒細胞密度培養(yǎng)降低胞外蛋白酶的降解作用
胞外蛋白酶對異源蛋白的降解作用,一直是重組畢赤酵母高效生產外源蛋白的難題,尤其是發(fā)酵后期。因此,很多發(fā)酵策略被應用于降低蛋白酶的降解作用,如低溫誘導、添加蛋白酶競爭抑制劑等。
CCCM培養(yǎng)具有更高的細胞活性,降低了細胞死亡裂解的蛋白酶的釋放水平,因此 CCCM培養(yǎng)的胞外蛋白酶的含量降低。如圖 5所示,DCW為55g/L和75 g/L的CCCM發(fā)酵策略,誘導120 h后,胞外總蛋白酶分別為1.4 mg/L和1.9 mg/L (Pierce QuantiCleaveTMProtease Assay Kit,胰蛋白酶當量酶活單位)。而傳統(tǒng)高密度發(fā)酵策略120 h的胞外總蛋白酶達到12 mg/L。胞外蛋白酶總含量隨著發(fā)酵的進行,不斷積累,特別是發(fā)酵后期尤為嚴重。過量胞外蛋白酶的存在,不利于發(fā)酵液 PGL的積累,也影響酶的穩(wěn)定性。
利用基因工程菌重組表達堿性果膠酶是該酶最主要的生產方法[25-26]。在前期發(fā)酵優(yōu)化的基礎上,已實現了該酶的工業(yè)化生產[14]。本研究以畢赤酵母表達 PGL為模式,研究了細胞密度對重組畢赤酵母表達異源蛋白的影響,并發(fā)展了恒細胞密度發(fā)酵的新策略。研究表明,細胞密度是影響 PGL生產強度的一個關鍵因素。合理地控制細胞密度能有效地提高 PGL的表達效率,并提高發(fā)酵的適應性。在分批補料培養(yǎng)中,控制合適的誘導初始細胞密度有利于提高 PGL的生產強度,縮短發(fā)酵周期。恒細胞密度培養(yǎng)是一種連續(xù)培養(yǎng)過程。相比于傳統(tǒng)的高密度分批補料發(fā)酵,恒細胞密度發(fā)酵模式極大地提高了單位菌體和單位體積的生產強度。此外,該發(fā)酵策略還具有提高細胞活性和降低胞外蛋白酶的降解作用等優(yōu)勢。因此,恒細胞發(fā)酵策略是一種具有潛在價值的重組畢赤酵母工業(yè)規(guī)模生產 PGL的新方法。雖然恒細胞密度發(fā)酵有諸多的優(yōu)勢,但是最終的產物濃度較低,一定程度上制約了該模式的應用。
汪志浩等[27]報道山梨醇作為輔助碳源,能夠有效提高堿性果膠酶在重組畢赤酵母中的表達能力。因此,應用雙碳源流加以實現恒細胞密度發(fā)酵,可作為研究 PGL在畢赤酵母中高效表達的新策略。
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