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        動(dòng)物溶菌酶基因的研究進(jìn)展

        2012-01-24 02:12:10孫國慶苗永旺李大林
        中國牛業(yè)科學(xué) 2012年3期
        關(guān)鍵詞:溶菌酶外顯子編碼

        孫國慶,哈 福,苗永旺,李大林

        (1.云南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,云南 昆明 650201;2.云南省家畜改良工作站,云南 昆明 650225)

        溶菌酶全稱為1,4-O-溶菌酶,又稱N-乙?;谒崴饷福且环N堿性水解酶,存在于微生物和多種動(dòng)、植物的組織及體液中。它可以裂解細(xì)菌細(xì)胞壁 N-乙酰胞壁酸和 N-乙酰葡糖胺之間的β-(1,4)-糖苷鍵,具有抗菌、抗腫瘤、抑制血管生成等活性。堿和氧化劑對(duì)其有抑制作用,食鹽則對(duì)其有活化作用。

        奶牛乳房炎是奶牛業(yè)中危害大、可導(dǎo)致嚴(yán)重經(jīng)濟(jì)損失的常見疾病之一,目前此種疾病已成為奶牛養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展的瓶頸。全世界約有2.2億多頭奶牛,其中10%~30%患有各種類型的乳房炎,中國奶牛乳房炎發(fā)病率普遍高于國外。近幾十年來,由于濫用抗生素,菌株耐藥性越來越強(qiáng),傳統(tǒng)的乳房炎抗生素療法的弊端已日益明顯,由此乳房炎抗性基因的研究逐漸成為熱點(diǎn),溶菌酶基因就是其中的重要候選基因之一。

        1 溶菌酶的發(fā)現(xiàn)及分類

        1921年,Alexander Fleming(1881~1955)發(fā)現(xiàn)了一種驚人的溶菌物質(zhì),后來稱之為溶菌酶(lysozyme,LYZ)。由于當(dāng)時(shí)人們未發(fā)現(xiàn)其對(duì)許多人類致病菌并有殺菌作用,所以一開始并未被重視。90多年后的今天,溶菌酶不僅作為一種模式系統(tǒng)廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)化學(xué)、酶學(xué)、晶體學(xué)和分子生物學(xué),而且其溶菌功能已為世人普遍接受并被廣泛應(yīng)用于食品工業(yè)和藥物制劑。溶菌酶生物學(xué)功能的很多方面還沒完全搞清楚,比如溶解肽聚糖所得的片段在細(xì)菌-宿主相互作用中發(fā)揮的作用、存在于同一宿主中的各種溶菌酶之間的生物學(xué)關(guān)聯(lián)性等[1]。

        1937年,Abraham與Robinson從卵蛋白中最先分離出溶菌酶晶體,此后人們?cè)谌撕蛣?dòng)物的多種組織、分泌液及某些植物、微生物中也發(fā)現(xiàn)了溶菌酶的存在。1984年,Jolles等在蛋白質(zhì)水平上對(duì)不同來源的人溶菌酶(human LYZ,hLYZ)進(jìn)行了研究,并率先發(fā)表了hLYZ氨基酸序列。1988年Castanon等從人組織細(xì)胞系(U-937)和胎盤文庫中篩選出hLYZ cDNA,并對(duì)其進(jìn)行了系統(tǒng)的描述。同年,Yoshimura等用免疫學(xué)方法從胎盤λgt11文庫中篩選到hLYZ cDNA,并在酵母中表達(dá)成功。然后,Chung等和Huang等分別從人的巨噬細(xì)胞、帕內(nèi)特細(xì)胞和中國人胎盤中克隆出hLYZ cDNA[2]。2001年,Strausberg等直接向GenBank提交了從人結(jié)腸腺瘤中克隆的hLYZ cDNA。

        溶菌酶按其來源與氨基酸序列的差異可分為6類:c型(chicken or conventional type,雞蛋清)溶菌酶,包括來自于胃的溶菌酶和結(jié)合鈣離子的溶菌酶;g型(goose-type,鵝)溶菌酶;細(xì)菌溶菌酶;i型(in-vertebrate type,無脊椎動(dòng)物)溶菌酶;植物溶菌酶和噬菌體溶菌酶。目前,動(dòng)物界中發(fā)現(xiàn)三類溶菌酶,即c型、g型和i型。i型溶菌酶是溶菌酶家族的一個(gè)較新的成員,最初在海星(Asterias rubens)中發(fā)現(xiàn),近年來被廣泛研究。對(duì)各類溶菌酶的系統(tǒng)發(fā)育分析得出,c型溶菌酶主要存在于脊索動(dòng)物門,節(jié)肢動(dòng)物門的一些綱中也以c型溶菌酶為主,在一些脊索動(dòng)物和雙殼貝類軟體動(dòng)物(無脊椎動(dòng)物)中發(fā)現(xiàn)了g型溶菌酶(至少是與其相關(guān)的基因)的存在。

        一般來說,較高等的動(dòng)物都有i型溶菌酶的產(chǎn)生。雞蛋清溶菌酶是唯一同時(shí)存在于脊椎動(dòng)物、原索動(dòng)物和無脊椎動(dòng)物中的類型,也是目前研究得最廣泛、最透徹的類型。盡管這三類溶菌酶典型的一級(jí)結(jié)構(gòu)同源性并不高,但是它們的三級(jí)結(jié)構(gòu)卻有著驚人的相似。溶菌酶在抗菌防御方面的生物功能已普遍被人們所接受,此外,有些溶菌酶(不止在一類溶菌酶中)還可發(fā)揮消化酶的作用[1]。

        牛LYZ基因主要在乳腺中表達(dá),特別是在奶?;既榉垦椎臅r(shí)期,LYZ基因的表達(dá)量明顯增加,這可能是生物自身的一種防御機(jī)制。溶菌酶能夠水解微生物細(xì)胞壁的N-乙酰葡萄糖胺(NAG)和N-乙酰胞壁質(zhì)酸(NAM)間的β-1,4糖苷鍵,肽聚糖的空間結(jié)構(gòu)被破壞,細(xì)胞壁破裂。溶菌酶不但對(duì)革蘭氏陽性細(xì)菌具有直接的溶菌作用,而且還在相應(yīng)輔助因子(分泌型免疫球蛋白A和補(bǔ)體)的參與下,對(duì)革蘭氏陰性菌(如大腸桿菌)和真菌具有間接的溶解作用。另外,溶菌酶還能與各種誘發(fā)炎癥的酸性物質(zhì)結(jié)合使其滅活,并能夠增強(qiáng)抗菌素和其它藥物的療效,改善組織基質(zhì)的粘多糖代謝,從而達(dá)到消炎、修復(fù)組織的目的。

        2 溶菌酶的基因結(jié)構(gòu)及其進(jìn)化

        1965年,Phillips等人用x射線晶體結(jié)構(gòu)分析法闡明了溶菌酶的三維結(jié)構(gòu),確認(rèn)溶菌酶分子近橢圓形,大小為4.5nm×3.0nm×3.0nm,α螺旋僅占25%,在分子的一些區(qū)域有伸展著的β片層結(jié)構(gòu)。溶菌酶內(nèi)部幾乎均為非極性,疏水作用在溶菌酶的折疊構(gòu)象中起到重要作用,分子表面有一個(gè)容納多糖底物的裂隙,是溶菌酶的活性部位。

        不同物種LYZ基因都由4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子構(gòu)成。外顯子2編碼酶催化中心的殘基(Glu-35和Asp-52);外顯子3編碼連接外顯子2區(qū)域的框架,確定底物位置,完善活性位點(diǎn),提高催化效率;外顯子1和4編碼溶菌酶前體信號(hào)肽及N端和C端[3]。最先被測(cè)序的哺乳動(dòng)物溶菌酶基因是人類溶菌酶基因,該基因位于人類第12條染色體上,總長5 856bp,內(nèi)含子和第4外顯子中都存在重復(fù)序列,與雞溶菌酶基因的主要差別集中在內(nèi)含子和3'非編碼區(qū)[4]。牛的LYZ基因位于5號(hào)染色體,全長5 673bp,5′-UTR長度為31bp,3′-UTR長度為489 bp,由4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子組成,編碼區(qū)核苷酸序列全長為444bp,編碼148個(gè)氨基酸;四個(gè)外顯子對(duì)應(yīng)的編碼區(qū)大小分別為136bp、165bp、76bp和67bp[5]。1979年Baldacci等用分子克隆的方法獲得雞溶菌酶基因,全長約3.9kb,是其mRNA長度的6倍。在牛中最先發(fā)現(xiàn)了多基因編碼溶菌酶的現(xiàn)象,從此反芻動(dòng)物溶菌酶及其基因作為一種重要的模式系統(tǒng)在DNA復(fù)制、基因重組、遺傳進(jìn)化等研究領(lǐng)域被廣泛關(guān)注[6]。

        C型溶菌酶可分為鈣結(jié)合溶菌酶和非鈣結(jié)合溶菌酶兩類。非鈣結(jié)合溶菌酶在一些鳥類和哺乳類中有發(fā)現(xiàn),進(jìn)化上與α乳清蛋白關(guān)系較近,兩者氨基酸序列相似性約有40%,都擁有保守的二硫鍵和一段相似的內(nèi)含子-外顯子結(jié)構(gòu),它們的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)也都相同。但表達(dá)部位和功能差別顯著。

        與廣泛存在于動(dòng)物各種體液中的溶菌酶相比,α乳清蛋白只存在于哺乳動(dòng)物的乳汁和初乳中。另外,α乳清蛋白也沒有催化活性,但是它能改變半乳糖轉(zhuǎn)移酶的特異性,其與半乳糖轉(zhuǎn)移酶的相互作用可以促進(jìn)乳糖合成。有人認(rèn)為,哺乳動(dòng)物中溶菌酶和α乳清蛋白共存的進(jìn)化因素是共同祖先基因的重復(fù)突變及隨后的遺傳分化[7]。一般來說,α乳清蛋白不具備溶菌酶的活性,溶菌酶也不參與乳糖的合成,但是已有人在針鼴乳中發(fā)現(xiàn)了一種蛋白,它同時(shí)具備了α乳清蛋白(很弱)和溶菌酶的特性[8]。這一發(fā)現(xiàn)有力地支持了溶菌酶和α乳清蛋白來自于同一祖先的假設(shè)。

        溶菌酶在動(dòng)物界普遍存在,不同溶菌酶也可同時(shí)發(fā)現(xiàn)于某一類物種中(例如,脊椎動(dòng)物中的c型和g型溶菌酶,節(jié)肢動(dòng)物中的c型和i型溶菌酶,軟體動(dòng)物中的g型和i型溶菌酶),由此事實(shí)可自然聯(lián)想到三種溶菌酶的進(jìn)化關(guān)系。不同類型的動(dòng)物溶菌酶在結(jié)構(gòu)上的一致性也揭示它們有可能來自于同一前體,但是其氨基酸序列的巨大差異又使這一猜測(cè)充滿了不確定性[1]。

        3 溶菌酶基因的多態(tài)性研究

        陳仁金等利用PCR-SSCP技術(shù)對(duì)30個(gè)公牛家系的610頭中國荷斯坦牛LYZ基因進(jìn)行多態(tài)性檢測(cè),利用最小二乘均數(shù)法對(duì)LYZ基因的多態(tài)位點(diǎn)與體細(xì)胞評(píng)分(somatic cell score,SCS)和305d產(chǎn)奶量進(jìn)行相關(guān)分析[9]。根據(jù)PCR產(chǎn)物的測(cè)序結(jié)果與GenBank公布的牛的LYZ基因(GenBank登錄號(hào):NC-007303)序列比對(duì)表明,在LYZ基因的外顯子1的115位點(diǎn)發(fā)生T>G的核苷酸替換,此替換使編碼蛋白質(zhì)的相應(yīng)氨基酸由Arg變?yōu)長eu;該位點(diǎn)經(jīng)PCR-SSCP法檢測(cè)發(fā)現(xiàn)了3種基因型TT、TG和GG。研究表明,115T>G位點(diǎn)的GG基因型對(duì)中國荷斯坦牛的SCS和305d產(chǎn)奶量有較大的遺傳效應(yīng),可作為分子標(biāo)記用于奶牛乳房炎抗性的篩選[9]。Sahoo等通過對(duì)印度河流型水牛的研究發(fā)現(xiàn),在LYZ基因外顯子3上存在多態(tài)位點(diǎn),并闡明了其與LYZ活性和體細(xì)胞數(shù)(somatic cell count,SCC)的關(guān)聯(lián)性[10]。孫懷昌等人研究結(jié)果表明,表達(dá)人溶菌酶基因的重組質(zhì)粒對(duì)奶牛乳房炎具有可靠、持久的治療效果,可以代替抗菌素使用[11]。

        陳仁金等對(duì)牛亞科6個(gè)群體溶菌酶基因的編碼區(qū)核苷酸序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測(cè)序,結(jié)合GenBank上海福特牛該基因(GenBank登錄號(hào):NC_007303)編碼區(qū)核苷酸序列進(jìn)行了遺傳和進(jìn)化分析。結(jié)果表明,在檢測(cè)的樣本中(水牛除外),有5個(gè)核苷酸多態(tài)位點(diǎn),定義了9種單倍型;群內(nèi)核苷酸多樣性(Pi)在0.00000~0.00196之間,揭示群體內(nèi)遺傳多樣性較低。構(gòu)建的分子系統(tǒng)發(fā)育樹表明,瘤牛、蒙古牛和魯西黃牛間關(guān)系密切,瘤牛和普通牛與牦牛關(guān)系相對(duì)較近,而與大額牛關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),為牛亞科的系統(tǒng)進(jìn)化研究提供了一定理論基礎(chǔ)[12]。李銳等用PCR的方法擴(kuò)增并測(cè)定了大額牛LYZ基因的編碼區(qū)核苷酸序列(444bp),其中 AT含量(53.95%)明顯高于GC含量(46.05%),并與GenBank上8個(gè)物種相應(yīng)基因編碼區(qū)核苷酸序列進(jìn)行比對(duì)分析和系統(tǒng)發(fā)育分析,發(fā)現(xiàn)大額牛與普通牛(核苷酸序列一致性為99.3%)首先聚為一類,再與其他物種(與人、豬、家鼠、溝鼠、猊猴、雞和斑馬魚核苷酸序列一致性為76.6%、79.4%、81.8%、71.3%、68.2%、58.9% 和50.5%)聚為一類。該系統(tǒng)聚類結(jié)果與動(dòng)物學(xué)分類基本一致,亦與攀寶良利用乳蛋白基因構(gòu)建反芻動(dòng)物種系發(fā)生樹結(jié)果[13]基本一致,表明LYZ基因適合構(gòu)建不同物種間系統(tǒng)進(jìn)化樹[14]。

        侯其瑞等對(duì)京海黃雞的LYZ基因的SNPs與生長、產(chǎn)蛋性能和體重的關(guān)聯(lián)分析得出,LYZ基因可能是控制京海黃雞生長發(fā)育的主基因或與主基因緊密連鎖,暗示在選種、育種過程中,可將雞LYZ基因作為京海黃雞體重候選基因應(yīng)用于遺傳標(biāo)記輔助選擇[15-16]。許罕華等在編碼細(xì)菌氯霉素乙?;D(zhuǎn)移酶的融合基因序列中插入雞LYZ基因3'端核基質(zhì)附著區(qū)(MAR)表達(dá)試驗(yàn)結(jié)果表明,雞LYZ基因3'端MAR在同源細(xì)胞系對(duì)基因表達(dá)沒有激活作用,與該基因5'端MAR在同源或異源細(xì)胞系中能激活基因表達(dá)形成鮮明對(duì)照,表明5'端MAR和3'端 MAR在調(diào)節(jié)雞LYZ基因表達(dá)上存在一種協(xié)調(diào)關(guān)系。人溶菌酶突變可導(dǎo)致遺傳性非神經(jīng)系統(tǒng)淀粉樣病變癥(h ereditary systemic amylo idosis),由溶菌酶氨基酸序列中Phe57Ile、Trp64Arg、Ile56Thr和 Asp67His改變引起[17-18],該病患者組織中有大量的淀粉樣物質(zhì)沉淀,臨床表現(xiàn)伴隨腎臟、心臟和肝臟的病變。

        4 溶菌酶及其基因的應(yīng)用前景

        溶菌酶具有多種藥理作用,現(xiàn)在已經(jīng)廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)臨床。作為一種存在于人體正常體液及組織中的非特異性免疫因素,具有抗菌、抗病毒、抗腫瘤的功效。溶菌酶具有破壞細(xì)菌細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)的功能,用溶菌酶處理G+細(xì)菌可以在破壞細(xì)胞壁后得到原生質(zhì)體,所以被廣泛用于生物技術(shù)中,成為基因工程、細(xì)胞工程中細(xì)胞融合操作必不可少的工具酶。溶菌酶作為一種非特異性免疫因子,對(duì)腸道中腐敗性微生物有特殊殺滅作用,溶菌酶是雙歧桿菌增長因子,有防止腸炎和變態(tài)反應(yīng)的作用,對(duì)嬰、幼兒的腸道菌群有平衡作用。有試驗(yàn)表明,在低度酒中每公斤添加20mg的溶菌酶替代水楊酸作防腐劑,對(duì)酒的風(fēng)味無不良影響,且受酒類澄清劑的影響很小,并可以去除水楊酸的毒性,是低度酒類較好的防腐劑。日本成功把溶菌酶用于清酒的防腐劑。最近的研究表明,水牛奶中的溶菌酶與歐洲牛(bovine)的有56.5%同源性,與馬的有30.4%同源性。水牛溶菌酶的特異活性是普通牛的10倍,并且具有更加廣的pH耐受范圍。該酶主要對(duì)革蘭氏陽性菌有效。據(jù)奶水牛產(chǎn)地當(dāng)?shù)厝朔Q,食用水牛奶不易生病,具有良好的增強(qiáng)免疫力功效。

        雖然溶菌酶廣泛存在于動(dòng)植物體內(nèi),但天然含量少,提取純化過程步驟繁瑣,產(chǎn)量低,無法大量獲取,若采用化學(xué)合成方法成本昂貴,大多數(shù)普通患者無法承受。與此相比,若采用基因工程的方法來合成溶菌酶,它具有操作簡單,成本比較廉價(jià),能大量獲取,重復(fù)性好,有廣闊的市場應(yīng)用前景。牛乳溶菌酶作為c型溶菌酶中的一種,在治療奶牛子宮內(nèi)膜炎、乳房炎等細(xì)菌性疾病中不僅具有相似的生物學(xué)作用,還具有同源性的優(yōu)勢(shì)。付世新等通過畢赤酵母GS115分泌表達(dá)系統(tǒng)獲得了重組牛乳溶菌酶,為溶菌酶的規(guī)?;a(chǎn)奠定了基礎(chǔ)[19]。

        對(duì)LYZ基因的研究多集中在轉(zhuǎn)基因和疾病防治上,而對(duì)牛的LYZ基因其在機(jī)體中的生物功能和作用途徑還有很多尚待探索的地方。而目前對(duì)牛的LYZ基因多態(tài)性與奶牛乳房炎關(guān)聯(lián)分析的研究較少。劉梅等認(rèn)為未來的研究重點(diǎn)已經(jīng)不是溶菌酶的殺菌作用,而是其消化功能和其他未知的生物學(xué)功能[20]。研究發(fā)現(xiàn),反芻動(dòng)物的皺胃、食葉鳥的嗉囊、文昌魚腸和一些昆蟲(如果蠅、工蟻、臭蟲和蚊子等)消化道的不同部位以及唾液腺中,溶菌酶c的含量豐富,推測(cè)可能與溶菌酶c的消化功能相適應(yīng)[20]。Lee-Huang等研究發(fā)現(xiàn),人溶菌酶作為人絨毛膜促性腺激素的組分之一,其107~115位的9個(gè)氨基酸(RAWVAWRNR)能有效抑制HIV病毒的復(fù)制,并能調(diào)節(jié)HIV感染細(xì)胞的基因表達(dá),具有抗HIV病毒的作用[21]。此外,在工業(yè)上,溶菌酶可以作為食品的保鮮劑或添加劑。例如,在嬰兒食品中添加溶菌酶可以使其更接近人乳的成分。同時(shí),溶菌酶能夠增強(qiáng)抗生素的作用效力,增加機(jī)體的抗感染能力。隨著溶菌酶功能的不斷發(fā)現(xiàn),在未來的工業(yè)、醫(yī)學(xué)和其他領(lǐng)域中,溶菌酶必將具有重要的應(yīng)用價(jià)值。已有人嘗試?yán)肔YZ基因來研究生物的進(jìn)化,并得到與傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)方法、生化方法等基本一致的結(jié)果,表明LYZ基因可能對(duì)生物進(jìn)化研究有幫助。

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