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        框鏡鯉維氏氣單胞菌溶血素基因片段的克隆與序列分析

        2011-08-07 10:10:16單曉楓郭偉生吳同壘王偉利錢愛東
        中國獸醫(yī)雜志 2011年12期
        關(guān)鍵詞:維氏單胞菌菌種

        單曉楓,郭偉生,吳同壘,王偉利,錢愛東

        (1.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,吉林 長春 130118;2.吉林進出口檢驗檢疫局,吉林 長春 130062)

        維氏氣單胞菌(Aeromonas veronii,AV)屬于弧菌科、氣單胞菌屬,其廣泛分布于水體和陸地,可導(dǎo)致人食物中毒,引發(fā)胃腸炎、腹膜炎、敗血癥、腦膜炎等疾?。?-2];此外,該菌還可引起各種水產(chǎn)動物的不同疾病的暴發(fā),如框鏡鯉敗血癥、青蝦軟殼綜合征、魚的流行性潰瘍綜合征等等[3-5]。維氏氣單胞菌可產(chǎn)生一系列的毒力因子,如氣溶素、溶血素、胞外蛋白酶、內(nèi)毒素、粘附素等。其中溶血素(hemolysin,hly)是基因組DNA編碼的毒力因子,其聚合后插到細胞膜上,形成通道,導(dǎo)致溶血。但有關(guān)維氏氣單胞菌溶血素的研究并不充分,有許多研究甚至將氣溶素與溶血素混為一談,目前,GenBank上尚未見維氏氣單胞菌溶血素的全基因序列。鑒于此,本試驗依據(jù)不同氣單胞菌屬菌種的溶血素基因,設(shè)計1對特異性引物,克隆了維氏氣單胞菌的溶血素基因片段,并對其編碼蛋白進行相關(guān)分析,以期為研究維氏氣單胞菌溶血素在致病、毒力誘導(dǎo)免疫保護,以及建立特異性免疫學(xué)檢測方法等方面建立基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 菌種 維氏氣單胞菌CY0806,分離于吉林省某漁場框鏡鯉,經(jīng)生理生化、16SrRNA序列分析,鑒定為維氏氣單胞菌,由吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)研究室保存;基因工程菌E.coli DH5α,由本實驗室保存制備;pMD18-T載體,購自寶生物工程(大連)有限公司。

        1.2 主要試劑 DL-~Marker、Taq DNA聚合酶、dNTP,均購自寶生物工程(大連)有限公司;DNA凝膠回收試劑盒,購自愛思進生物技術(shù)有限公司;細菌基因組DNA提取試劑盒、質(zhì)粒小量抽提試劑盒,購自北京索萊寶科技有限公司;氣單胞菌培養(yǎng)基RS,購自北京陸橋技術(shù)有限責任公司;其他試劑均為進口或國產(chǎn)分析純。

        1.3 溶血活性檢測 將維氏氣單胞菌CY0806劃線接種于1%兔血平板,30℃培養(yǎng)24h,觀察其溶血活性。

        1.4 引物設(shè)計與合成 根據(jù)GenBank報道的氣單胞菌屬不同菌種的溶血素基因,用生物軟件Primer Premer 5.0設(shè)計一對特異性引物,上游引物P1:5′-GCGGAATTCATGCAAAAACTAAAAA-3′,下游引物 P2:5′-ATCAAGCTTTTAAAACTGGCTCTCGGC-3′。引物由寶生物工程(大連)有限公司。

        1.5 維氏氣單胞菌hly基因片段的PCR擴增 以維氏氣單胞菌CY0806株基因組DNA為模板,P1、P2為引物,采用50μL反應(yīng)體系進行PCR。反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性2min;94℃變性40s,48℃復(fù)性40s,72℃延伸80s,共34循環(huán);72℃10min。擴增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,切取目的條帶用凝膠回收試劑盒純化回收。

        1.6 目的基因的克隆與鑒定 將回收產(chǎn)物與pMD18-T載體連接后,轉(zhuǎn)化至DH5α感受態(tài)細胞中,在含氨芐青霉素培養(yǎng)基平板上37℃培養(yǎng)12~16 h,挑取單個菌落,增菌,提取質(zhì)粒,以此為模板進行PCR鑒定。將陽性重組質(zhì)粒送至寶生物工程(大連)有限公司測序。

        1.7 序列分析與結(jié)構(gòu)預(yù)測 利用相關(guān)生物信息學(xué)軟件或網(wǎng)站,將克隆基因片段的同源性、遺傳演化關(guān)系、編碼蛋白的二級結(jié)構(gòu)、B細胞康威進行分析和預(yù)測。

        2 結(jié)果

        2.1 溶血性分析 菌株CY0806在血平板上出現(xiàn)明顯的溶血圈,為β-溶血。

        2.2 目的基因的PCR擴增與鑒定 用P1、P2引物對維氏氣單胞菌CY0806溶血素基因片段進行擴增,獲得一條與目的片段大小相符的條帶(圖1);以陽性重組質(zhì)粒為模板,通過PCR得到約400bp的片段,表明溶血素基因已成功克隆于載體中。

        圖1 維氏氣單胞菌hly基因的PCR擴增

        2.3 目的基因的序列分析及系統(tǒng)進化樹構(gòu)建 經(jīng)序列測定,擴增出的基因片段長432bp,編碼137個氨基酸,相對分子量15768.75u,含有17個強堿性氨基酸(K、R)、13個強酸性氨基酸(D、E)、45個疏水氨基酸(A、I、L、F、W、V)、40個極性氨基酸(N、C、Q、S、T、Y)。

        在NCBI上檢索并下載不同菌種的溶血素基因,用Mega4.0軟件與菌株CY0806溶血素基因片段構(gòu)建系統(tǒng)進化樹(圖2)。分析顯示,菌株CY0806溶血素基因片段與氣單胞菌屬菌種處于同一分支,同源性在95%以上。

        2.4 目的基因編碼蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測 以Garmier-Robson方法預(yù)測蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn),α螺旋占38.4%,β折疊占5.07%,β轉(zhuǎn)角占28.3%,無規(guī)則蜷曲占29.7%;而通過Chou-Fosman分析:α螺旋占26.1%,β折疊占21.7%,β轉(zhuǎn)角占40.6%(圖3)。

        2.5 B細胞表位預(yù)測 以Kyte-Doolittle的氨基酸親水預(yù)測結(jié)果、Emini的蛋白表面可及性預(yù)測結(jié)果、Chou-Fasman方案的β轉(zhuǎn)角分析結(jié)果、Karplus-Sohulz的原則預(yù)測柔性蛋白結(jié)果,綜合分析預(yù)測,得到以下四個區(qū)域:5~10、48~52、99~104、126~130可能形成B細胞表位。

        3 討論

        維氏氣單胞菌是近年來新型的人-獸-魚共患病原菌,其可感染人并引發(fā)多種疾??;此外,也可危害大部分淡水魚類、蝦、蟹等水生動物。而溶血素是氣單胞菌的主要致病因子之一,其毒力作用與其結(jié)構(gòu)密切相關(guān),研究表明,溶血素具有水溶性跨膜毒素的特征--溶血素N端可與三段β折疊的溶血素結(jié)構(gòu)組成一個“門閂”結(jié)構(gòu)[6-7]。本試驗克隆的溶血素基因雖然只是一個片段,但二級結(jié)構(gòu)分析表明,此片段存在β折疊,至于是否能形成“門閂”結(jié)構(gòu),還需用其他方法擴增出溶血素全長序列,推導(dǎo)出三級結(jié)構(gòu)驗證。

        本試驗克隆到框鏡鯉維氏氣單胞菌分離株CY0806的溶血素基因片段,其序列與氣單胞菌屬不同菌種有著較高的同源性(95%以上),但與大腸桿菌、弧菌等溶血素同源性較低,說明氣單胞菌屬內(nèi)各菌種的溶血素基因可能有著相同起源,為尋找氣單胞菌共同抗原提供幫助。

        蛋白質(zhì)的親水性、柔韌性、β轉(zhuǎn)角、表面可及性等在抗原的形成方面發(fā)揮著重要作用,本試驗綜合了不同參數(shù),預(yù)測該溶血素片段有4個氨基酸區(qū)域指標達到抗原區(qū)標準,說明溶血素具有很好的抗原性。

        本試驗成功的克隆了維氏氣單胞菌CY0806株的溶血素基因片段,并對其同源性、編碼蛋白的二級結(jié)構(gòu)、B細胞表位進行預(yù)測分析,結(jié)果為維氏氣單胞菌溶血素全長基因的擴增、其作為基因工程疫苗的候選抗原,以及維氏氣單胞菌特異性免疫學(xué)檢測方法的建立奠定了基礎(chǔ)。

        [1]Chim H,Song C.Aeromonas infection in critically ill burn patients[J].BURNS,2007,33:756-759.

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        [3]龔倩,高淑琴,單曉楓,等.框鏡鯉致病性維氏氣單胞菌的分離鑒定[J].中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)學(xué)報,2010,32(12):981-983.

        [4]潘曉藝,沈錦玉,李建應(yīng),等.青蝦“軟殼綜合征”病原及其特性[J].微生物學(xué)通報,2009,36(10):1571-1576.

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