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        斜帶石斑魚(yú)轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β1(TGF-β1)基因的克隆及表達(dá)分析*

        2011-07-24 09:55:02平海林吳金英徐勝威胡開(kāi)順段志剛
        關(guān)鍵詞:虹鱒石斑魚(yú)草魚(yú)

        平海林,吳金英,徐勝威,胡開(kāi)順,段志剛

        (中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院水生經(jīng)濟(jì)動(dòng)物研究所∥廣東省水生經(jīng)濟(jì)動(dòng)物良種繁育重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東 廣州 510275)

        轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β(TGF-β)主要由巨噬細(xì)胞、成纖維細(xì)胞和血小板產(chǎn)生[1],能參與調(diào)節(jié)多種細(xì)胞功能,例如細(xì)胞增殖、分化、存活、遷移以及免疫細(xì)胞的活化和失活等[2]。進(jìn)化研究表明,TGF-β基因相當(dāng)保守,其配體、受體和與家族蛋白有關(guān)的信號(hào)分子在節(jié)肢動(dòng)物中也存在,表明該基因在10億年前就已存在[3]。哺乳動(dòng)物中發(fā)現(xiàn)TGF-β有3種異構(gòu)體:TGF-β1、2、3,其中TGF-β1在所有免疫細(xì)胞中都有所表達(dá),并在出現(xiàn)各種壓力和多種疾病信號(hào)后,參與細(xì)胞反應(yīng)[4]。如阻斷免疫細(xì)胞TGF-β1的表達(dá),會(huì)導(dǎo)致疾病,并伴隨慢性炎癥的纖維化過(guò)程[5],寄生蟲(chóng)病中,TGF-β1分泌可以阻斷巨噬細(xì)胞活化,并削弱它們的氧化反應(yīng)[6],人類(lèi)腹腔和腸道炎癥疾病中,TGF-β1信號(hào)減少[7]。在免疫系統(tǒng)中,成熟的TGF-β1多肽是一種強(qiáng)有力的細(xì)胞分化調(diào)節(jié)劑和免疫抑制劑,并能下調(diào)許多細(xì)胞因子的表達(dá)。例如,TGF-β1通過(guò)Smad3信號(hào)通路抑制巨噬細(xì)胞生長(zhǎng)[8],通過(guò)誘導(dǎo)TGF-β靶基因Id3抑制B細(xì)胞的增殖[9],也可以誘導(dǎo)結(jié)締組織生長(zhǎng)因子(CTGF),促使傷口上的成纖維細(xì)胞增殖[10]。

        在魚(yú)類(lèi)研究中,TGF-β1序列已經(jīng)從虹鱒、斑馬魚(yú)、鯉魚(yú)、草魚(yú)、金魚(yú)、真鯛和海鱸中克隆得到[11-17],其功能研究報(bào)道主要如下:哺乳類(lèi)重組TGF-β1可以抑制虹鱒巨噬細(xì)胞呼吸爆發(fā)活動(dòng)和頭腎白細(xì)胞產(chǎn)生巨噬細(xì)胞活化因子[18-19];可以誘導(dǎo)草魚(yú)外周血液淋巴細(xì)胞的增殖,也可以阻斷由植物血凝素或者脂多糖刺激引起的草魚(yú)外周血液淋巴細(xì)胞的增殖[14];可以抑制斑馬魚(yú)卵細(xì)胞成熟,其作用的多位點(diǎn)包括LHR, 20β HSD 和mPR-β[12,20]。重組金魚(yú)TGF-β1蛋白能夠誘導(dǎo)金魚(yú)成纖維細(xì)胞(CCL71)的增殖,對(duì)TNF-α活化巨噬細(xì)胞的硝化氧化反應(yīng)有下調(diào)作用[15]。在大西洋鮭中,TGF-β1下調(diào)可導(dǎo)致上皮內(nèi)淋巴細(xì)胞敏化性增強(qiáng),不能維持正常的遠(yuǎn)端腸道黏膜的完整性[21]。

        本研究通過(guò)中間片段克隆并結(jié)合RACE技術(shù),克隆得到了斜帶石斑魚(yú)EpinepheluscoioidesTGF-β1 cDNA全長(zhǎng)序列,并通過(guò)Realtime PCR技術(shù)檢測(cè)了該基因在健康斜帶石斑魚(yú)不同組織的分布情況,還檢測(cè)了用PolyI:C或ConA刺激斜帶石斑魚(yú)頭腎淋巴細(xì)胞不同時(shí)間后,TGF-β1基因的表達(dá)情況。

        1 材料和方法

        1.1 實(shí)驗(yàn)魚(yú)和樣品的采集

        實(shí)驗(yàn)用健康斜帶石斑魚(yú),2齡,長(zhǎng)25~30 cm,體質(zhì)量約700 g,購(gòu)自大亞灣水產(chǎn)實(shí)驗(yàn)中心,實(shí)驗(yàn)前至少暫養(yǎng)1周。取樣時(shí)先用 MS-222(Sigma,美國(guó))麻醉實(shí)驗(yàn)魚(yú)并抽出血液,再取所需各組織樣品,用液氮速凍保存,然后放于 -80 ℃冰箱備用。

        1.2 TGF-β1 cDNA的克隆和測(cè)序

        用常規(guī)Trizol(Invitrogen,美國(guó))抽提法從斜帶石斑魚(yú)腎臟中提取總RNA,將總RNA用反轉(zhuǎn)錄試劑盒(TOYOBO,日本)反轉(zhuǎn)錄合成cDNA第一鏈,并以此作為模板利用簡(jiǎn)并引物(表1)擴(kuò)增TGF-β1中間片段,然后利用特異性引物(表1)結(jié)合RACE技術(shù)得到全長(zhǎng)TGF-β1 cDNA序列。PCR產(chǎn)物連接到pMD19-T 載體中(TaKaRa,日本),序列測(cè)序由華大基因公司完成。

        1.3 生物信息學(xué)分析

        用BLAST程序搜索基因庫(kù)分析TGF-β1分子的同源性,通過(guò)DNAtools 6.0分析開(kāi)放讀碼框和相應(yīng)的氨基酸序列。多重比對(duì)通過(guò)CLUSTAL W(www.ebi.ac.uk/clustalw)來(lái)實(shí)現(xiàn)。通過(guò)Mega 3.1軟件的N-J方法來(lái)構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)。

        1.4 Realtime PCR分析

        Realtime PCR分析所用儀器為ABI的PRISM-7900。每個(gè)實(shí)驗(yàn)樣品設(shè)3個(gè)重復(fù),根據(jù)TGF-β1基因序列合成定量用特異性引物(表 1),以斜帶石斑魚(yú)的β-肌動(dòng)蛋白cDNA作為內(nèi)參,分析TGF-β1 mRNA的表達(dá)譜。

        1.5 細(xì)胞孵育和免疫刺激

        實(shí)驗(yàn)魚(yú)先用MS-222麻醉并抽出血液,斷頭后取出頭腎,用RPMI-1640培養(yǎng)基(Invitrogen,美國(guó))洗除表面血液,并將組織塊在冰上剪碎,研磨成單細(xì)胞,過(guò)300目篩得到單細(xì)胞懸浮液。4 ℃,2 000 r/min 離心10 min,用RPMI-1640 培養(yǎng)基洗滌沉淀兩次,去上清,加入4 mL組織培養(yǎng)液重懸細(xì)胞。將細(xì)胞懸液小心地鋪在3 mL淋巴細(xì)胞分離液(GE Healthcare,瑞士)中,19 ℃,1 500 r/min 離心50 min,收集淋巴細(xì)胞,然后轉(zhuǎn)入培養(yǎng)瓶中,在27 ℃,φ=5% CO2的條件下培養(yǎng)5 h之后除去粘附細(xì)胞,收集懸浮細(xì)胞,重新培養(yǎng)在六孔板中,再向培養(yǎng)基中加入50 μg/mL的 PolyI:C(Amersham Bio-science,美國(guó))或10 μg/mL 的ConA(Sigma,美國(guó)),以沒(méi)加刺激物的細(xì)胞做陰性對(duì)照,設(shè)2、4、8、16和24 h 5個(gè)時(shí)間段,每個(gè)條件組設(shè)3個(gè)重復(fù)。通過(guò)離心收集細(xì)胞,加入1 mL Trizol用于總RNA的提取,最后用Realtime PCR分析TGF-β1的表達(dá)情況。

        表1 引物序列和用途

        1.6 統(tǒng)計(jì)分析

        統(tǒng)計(jì)數(shù)值采用算術(shù)平均數(shù) ± 標(biāo)準(zhǔn)差來(lái)表示(n=3)。統(tǒng)計(jì)差異性用單因子方差分析中的LSD和Duncan’s檢測(cè),0.05和0.01水平用來(lái)指示差異的顯著性,所有數(shù)據(jù)采用SPSS Statistics 16.0軟件分析。

        2 結(jié) 果

        2.1 斜帶石斑魚(yú)TGF-β1 cDNA全長(zhǎng)序列

        利用中間片段非特異性擴(kuò)增并結(jié)合RACE技術(shù),克隆得到了斜帶石斑魚(yú)TGF-β1 cDNA全長(zhǎng)序列(GenBank 登錄號(hào)為GQ503351),全長(zhǎng)為2 477 bp,5′非編碼區(qū)為47 bp,3′非編碼區(qū)為1 269 bp,開(kāi)放讀碼框(Open Reading From, ORF)為1 161 bp,編碼一種含386個(gè)氨基酸的多肽,包括含信號(hào)肽的前導(dǎo)肽和含112個(gè)氨基酸的成熟肽。在3′非編碼區(qū)polyA前共有5個(gè)在細(xì)胞因子上常見(jiàn)的mRNA不穩(wěn)定點(diǎn)(ATTTA)和一個(gè)多聚腺苷酸加尾信號(hào)(AATAAA)。

        2.2 斜帶石斑魚(yú)TGF-β1的同源性和系統(tǒng)進(jìn)化分析

        選取的其它物種及其基因在GenBank的氨基酸序列號(hào)列舉如下:斜帶石斑魚(yú)Epinepheluscoioides,ACV96791;海鱸Moronechrysops×Moronesaxatilis,AAD46997;真鯛Sparusaurata,AAN03842;虹鱒Oncorhynchusmykiss,CAA67685;斑馬魚(yú)Daniorerio,AAI62361;大西洋鮭Salmosalar,ACN11294;草魚(yú)Ctenopharyngodonidella,ABU84814;鯉魚(yú)Cyprinuscarpio,AAF22573;金魚(yú)Carassiusauratus,ABU55371;蠑螈Ambystomamexicanum,ABX24523;牛Bostaurus,AAA30778;馬Equuscaballus,AAD49431;豬Susscrofa,AAC83807;挪威鼠Rattusnorvegicus,AAH76380;家鼠Musmusculus,AAH13738;長(zhǎng)尾猴Chlorocebusaethiops,AAA35369;人Homosapiens,AAH01180。

        氨基酸序列比對(duì)結(jié)果顯示,在前導(dǎo)肽區(qū)域有整合素結(jié)合位點(diǎn)(RGD)和KEX-Furin樣蛋白酶識(shí)別位點(diǎn)(RKKR);成熟肽區(qū)域有36位點(diǎn)的脯氨酸和46位點(diǎn)的甘氨酸以及由9個(gè)半胱氨酸組成的典型的“cysteine knot”結(jié)構(gòu)(圖 1)。用MEGA3.1鄰接法構(gòu)建TGF-β1家族進(jìn)化樹(shù)結(jié)果表明,斜帶石斑魚(yú)和其他魚(yú)類(lèi)進(jìn)化樹(shù)在同一分支上,與海鱸親緣關(guān)系最近,與兩棲類(lèi)和哺乳類(lèi)親緣關(guān)系較遠(yuǎn)(圖 2)。

        圖1 斜帶石斑魚(yú)TGF-β1的氨基酸序列與已知的其它魚(yú)類(lèi)序列的比較

        2.3 斜帶石斑魚(yú)TGF-β1的組織表達(dá)分析

        Realtime PCR 結(jié)果表明,斜帶石斑魚(yú)TGF-β1基因在腎臟、頭腎、脾臟、鰓、肝臟、腸道、心臟、肌肉、腦、性腺、眼各組織中均有表達(dá),其中在腎臟中表達(dá)最高,其次是頭腎和脾臟,在肌肉和眼中表達(dá)最少(圖 3)。

        圖2 斜帶石斑魚(yú)和其它動(dòng)物TGF-β1氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化數(shù)構(gòu)建

        圖3 TGF-β1在健康斜帶石斑魚(yú)各組織中的表達(dá)分析

        2.4 斜帶石斑魚(yú)TGF-β1在刺激頭腎淋巴細(xì)胞中的表達(dá)分析

        Realtime PCR 結(jié)果表明,用PolyI:C或ConA刺激頭腎淋巴細(xì)胞后,斜帶石斑魚(yú)TGF-β1表達(dá)量都明顯上升,刺激4 h后達(dá)到最高,其中ConA組是對(duì)照組表達(dá)量的27倍,PolyI:C組是對(duì)照組的3倍。刺激4 h后表達(dá)量均有所下降,其中用PolyI:C刺激頭腎淋巴細(xì)胞16、24 h后,TGF-β1基本無(wú)表達(dá),而用ConA刺激實(shí)驗(yàn)組,雖然在4 h后TGF-β1表達(dá)量有所下降,但一直高于對(duì)照組(P<0.05),特別在刺激4、8、16 h后,表達(dá)量顯著高于對(duì)照組(P<0.01)(圖 4)。

        圖4 斜帶石斑魚(yú)TGF-β1在刺激頭腎淋巴細(xì)胞中的表達(dá)

        3 討 論

        本研究克隆得到了斜帶石斑魚(yú)TGF-β1全長(zhǎng)cDNA序列,在成熟肽區(qū)域,具有和其他魚(yú)類(lèi)一樣保守的9個(gè)半胱氨酸組成的典型的“cysteine knot”結(jié)構(gòu)[12,15,17,22],其中的8個(gè)半胱氨酸以成對(duì)的方式形成分子中心區(qū)的4對(duì)鏈內(nèi)二硫鍵,結(jié)合第9個(gè)半胱氨酸形成鏈間二硫鍵一起形成TGF-β二聚體[11]。整合素結(jié)合位點(diǎn)(RGD)能夠與整合素特異結(jié)合,例如能夠與αvβ6特異結(jié)合,從而使?jié)摶钚偷腡GF-β1活化[23],KEX-Furin樣蛋白酶識(shí)別位點(diǎn)(RKKR)可以使前體蛋白轉(zhuǎn)化為成熟蛋白,另有研究顯示C型膠原蛋白酶也可通過(guò)此位點(diǎn)裂解TGF-β前期復(fù)合物[11],以及成熟肽36位點(diǎn)的脯氨酸和46位點(diǎn)的甘氨酸,都表明斜帶石斑魚(yú)TGF-β1具有超家族特征標(biāo)志[22],延續(xù)了TGF-β1基因在進(jìn)化過(guò)程中的保守性。

        TGF-β1基因在所取斜帶石斑魚(yú)的各個(gè)組織中都表達(dá),而在虹鱒和草魚(yú)中,TGF-β1基因在肝臟中檢測(cè)不到表達(dá)[11,14],在鯉魚(yú)肌肉中檢測(cè)不到表達(dá)[13],表明TGF-β1在魚(yú)類(lèi)各組織中的表達(dá)具有一定差異性。在硬骨魚(yú)類(lèi),像草魚(yú)和斑馬魚(yú),腎臟是主要的B細(xì)胞產(chǎn)生和結(jié)合位點(diǎn)[24];虹鱒中,發(fā)育中的B細(xì)胞在頭腎中成熟,然后遷移到脾臟或者后腎的活化位點(diǎn)[25];脾臟是免疫球蛋白M在軟骨魚(yú)類(lèi)表達(dá)的第一個(gè)站點(diǎn)[26],斜帶石斑魚(yú)TGF-β1基因在腎臟、頭腎、脾臟中高表達(dá),表明TGF-β1基因在斜帶石斑魚(yú)免疫系統(tǒng)中可能具有潛在功能。

        用PolyI:C和ConA刺激斜帶石斑魚(yú)頭腎淋巴細(xì)胞后,TGF-β1基因表達(dá)量升高,這與在鯉魚(yú)頭腎白細(xì)胞中觀察到的結(jié)果一致[13]。另有報(bào)道表明,在金魚(yú)和虹鱒中,用LPS和rTNF-α刺激的巨噬細(xì)胞中,TGF-β1基因表達(dá)量也上升[15,27]。因此,斜帶石斑魚(yú)TGF-β1的表達(dá)量在刺激后有所上升,表明了TGF-β1對(duì)類(lèi)似有絲分裂類(lèi)因子的刺激,與其它典型的細(xì)胞因子一樣做出了積極反應(yīng),對(duì)淋巴細(xì)胞的活化是必不可少的[28]。在刺激超過(guò)4 h后,可能是前4 h大幅增加的TGF-β1抑制了淋巴細(xì)胞的增殖,從而使TGF-β1表達(dá)量下降,有研究報(bào)告表明,LPS和ConA可誘導(dǎo)鯉魚(yú)外周血液淋巴細(xì)胞的增殖[29],而rTGF-β1可以阻斷由PHA和LPS誘導(dǎo)的草魚(yú)外周血液淋巴細(xì)胞的增殖[14],表明TGF-β1在調(diào)控魚(yú)類(lèi)淋巴細(xì)胞的增殖方面和哺乳類(lèi)具有相似的作用,但其作用的分子機(jī)制還有待進(jìn)一步研究。

        TGF-β1作為一種多效應(yīng)的細(xì)胞免疫因子,其功能在哺乳動(dòng)物中研究較多,作用的效果取決于多項(xiàng)因素,如分泌的時(shí)間,濃度,受體的表達(dá),細(xì)胞分化的周期等[30-32],但是在魚(yú)類(lèi),對(duì)TGF-β1的功能研究還比較少,有待進(jìn)一步發(fā)展和完善。

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