亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        小花堿茅HKT1;4基因片段的克隆與序列分析

        2011-04-25 09:42:42趙常玉吳永娜包愛科王鎖民張金林
        草業(yè)科學(xué) 2011年6期
        關(guān)鍵詞:抗鹽小花克隆

        李 劍,趙常玉,吳永娜,包愛科,馬 清,郭 強(qiáng),王鎖民,張金林

        (蘭州大學(xué)草地農(nóng)業(yè)科技學(xué)院 農(nóng)業(yè)部草地農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)學(xué)重點開放實驗室,甘肅 蘭州 730020)

        大多數(shù)農(nóng)作物不能在高鹽環(huán)境下生長,灌溉地鹽漬化對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)力造成了嚴(yán)重威脅[1-2]。鹽漬化土壤中,Na+是一種毒害離子,它可以抑制K+的吸收,降低酶活性,影響植物新陳代謝,最終表現(xiàn)為植株生長緩慢甚至死亡[3-4]。K+是植物生長發(fā)育所必需的礦質(zhì)元素之一,也是植物細(xì)胞中最豐富的一價陽離子,占植物干質(zhì)量的2%~10%,它參與調(diào)節(jié)細(xì)胞膨壓、電荷平衡、氣孔開閉和酶活性等許多重要的生理生化過程[5-6]。在鹽脅迫下,限制Na+吸收,增加Na+外排,同時提高對K+的選擇性吸收能力,維持細(xì)胞中高的K+/Na+是植物抗鹽性的關(guān)鍵[7]。大量研究發(fā)現(xiàn),高親和性K+轉(zhuǎn)運蛋白(high-affinity K+transporter,HKT)在高等植物拒Na+和選擇性吸收K+過程中發(fā)揮著重要作用[8-9]。Schachtman和Schroeder[10]首次從小麥(Triticumaestivum)幼根中克隆到TaHKT2;1,隨后相繼在其他植物中也發(fā)現(xiàn)了HKT類蛋白。根據(jù)異源表達(dá)差異,Platten等[11]將HKT類蛋白分為兩類:第1類以擬南芥(Arabidopsisthaliana)AtHKT1;1為代表,主要轉(zhuǎn)運Na+,在Na+回收中發(fā)揮作用,包括水稻(Oryzasativa)OsHKT1;5、一粒小麥(T.monococcum)TmHKT1;4-A2、TmHKT1;5-A1和小麥TaHKT1;5-D1;第2類以小麥TaHKT2;1為代表,為K+和Na+的共轉(zhuǎn)運體,在K+、Na+選擇性吸收中發(fā)揮重要作用,包括水稻OsHKT2;1和OsHKT2;2等。

        小花堿茅(Puccinelliatenuiflora)廣泛分布于我國東北和西北地區(qū),是禾本科堿茅屬多年生優(yōu)質(zhì)牧草,耐鹽堿[12-13]。近年來,小花堿茅極強(qiáng)的抗鹽堿性引起人們的廣泛關(guān)注。閻秀峰等[14]通過洗葉技術(shù),認(rèn)為小花堿茅的耐鹽機(jī)制是其具有泌鹽能力。韋存虛等[15]采用掃描電鏡和X射線電子探針研究發(fā)現(xiàn)蠟質(zhì)層泌鹽可能是其正常功能。但解剖學(xué)和葉表面觀察都沒有發(fā)現(xiàn)鹽腺或泌鹽結(jié)構(gòu)[16-18]。研究表明,小花堿茅根部對K+/Na+選擇吸收能力很強(qiáng),約是小麥的2倍[19];最新研究表明,葉片泌鹽并不是小花堿茅耐鹽的主要機(jī)制;限制Na+單向內(nèi)流速率,減少體內(nèi)Na+凈積累,維持高的K+/Na+則是小花堿茅抗鹽的關(guān)鍵[20]。本研究在已經(jīng)克隆小花堿茅Actin[12]和AKT1[13]的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步克隆其HKT1;4基因片段,旨為進(jìn)一步探明小花堿茅拒Na+的分子機(jī)制奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1材料 小花堿茅種子2010年采自甘肅省張掖市臨澤縣白寨村。EscherichiacoliDH5a菌株由農(nóng)業(yè)部草地農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)學(xué)重點開放實驗室保存。

        1.2主要試劑 植物總RNA提取試劑盒(生工生物工程上海有限公司生產(chǎn)),反轉(zhuǎn)錄試劑盒(寶生物工程大連有限公司生產(chǎn)),PCR擴(kuò)增試劑盒、PCR產(chǎn)物回收試劑盒、pMD19-T Simple載體(寶生物工程大連有限公司生產(chǎn)),DNA ladder(天根生化科技北京有限公司生產(chǎn)),其他生化試劑均為進(jìn)口或國產(chǎn)分析純。

        1.3試驗方法

        1.3.1總RNA的提取 從小花堿茅幼根(K+饑餓處理24 h)中提取總RNA,方法參考總RNA提取試劑盒說明書。

        1.3.2引物的設(shè)計與合成 通過對高粱(Sorghumbicolor)、水稻和一粒小麥等幾種植物HKT1;4基因的氨基酸序列進(jìn)行同源性比對,找出高度保守的片段,對應(yīng)于核苷酸片段,根據(jù)引物設(shè)計原則,利用DNAMAN和Primer Premier 5.0生物軟件設(shè)計一對簡并引物PF和PR,推測目的片段長度為635 bp。引物由上海生工合成。PF:5′-TCGYCTACTTCSTCRCCRTCTCCT-3′,PR:5′-CATGWACCCGCAGYTSGAGAACGT-3′,其中,Y=C/T,S=C/G,R=A/G,W=A/T。

        1.3.3RT-PCR擴(kuò)增 反轉(zhuǎn)錄過程按照試劑盒操作說明進(jìn)行。PCR反應(yīng)體系:10×PCR Buffer 5 μL,25 mmol/L MgCl23 μL,2 mmol/L dNTP 5 μL、10 μmol/L PF 1 μL、PR 1 μL,Taq DNA polymerase(5 U/μL) 0.5 μL,cDNA 2 μL,加無菌水至總體積50 μL。反應(yīng)程序:94 ℃熱啟動2 min;94 ℃變性30 s、58 ℃退火45 s、72 ℃延伸50 s,30個循環(huán);最后72 ℃延伸7 min。瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物后,按照膠回收試劑盒說明書回收和純化目的片段,保存于-20 ℃?zhèn)溆谩?/p>

        1.3.4陽性克隆的篩選與鑒定 將回收目的片段與pMD19-T Simple載體按照物質(zhì)的量10∶1混合,于16 ℃連接2 h。連接產(chǎn)物全部加入到100 μL感受態(tài)大腸桿菌細(xì)胞中,冰浴30 min;42 ℃熱激90 s;冰浴1 min。加入800 μL無氨芐青霉素的液體LB培養(yǎng)基,搖菌1 h(37 ℃,180 r/min)。將菌液加入含有氨芐、x-gal和IPTG的LB固體培養(yǎng)基上,37 ℃過夜培養(yǎng)。次日,挑選白色單菌落,經(jīng)PCR檢測后送生工生物工程上海有限公司測序。

        1.3.5序列的生物信息學(xué)分析 BLAST在NCBI網(wǎng)站(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)上進(jìn)行;序列的翻譯和分析比較通過DNAMAN和Primer Premier 5.0生物軟件進(jìn)行。

        2 結(jié)果

        2.1總RNA的提取與檢測 以小花堿茅幼根為材料提取總RNA,甲醛變性膠電泳和NANODROP1000核酸蛋白檢測儀檢測表明,提取的總RNA完全滿足下一步試驗需要。

        2.2RT-PCR擴(kuò)增 以總RNA反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA為模板,用簡并引物PF和PR進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR產(chǎn)物經(jīng)凝膠電泳檢測后發(fā)現(xiàn)在比600 bp略高處有一條帶,且上下無雜帶,與預(yù)測的目的片段大小基本一致(圖1),推測可能是HKT1;4基因片段,有待進(jìn)一步檢測。

        圖1 PCR產(chǎn)物凝膠電泳圖

        2.3陽性克隆的鑒定 將目的片段連接到pMD19-T Simple載體上,轉(zhuǎn)化E.coliDH5a。從LB培養(yǎng)基平板上隨機(jī)挑選5個白色單菌落,分別搖菌后提取質(zhì)粒,進(jìn)行PCR檢測,得到的擴(kuò)增片段大小與所克隆片段一致(圖2),表明這些為陽性克隆,可以進(jìn)行測序。

        圖2 陽性克隆的PCR檢測

        2.4測序結(jié)果與序列分析 陽性克隆測序結(jié)果表明,本試驗得到一段長629 bp的HKT1;4序列片段,與GenBank中注冊的高等植物HKT1;4基因核苷酸序列同源性在74%以上;編碼209個氨基酸(圖3),將此氨基酸片段與其他植物HKT1;4蛋白氨基酸進(jìn)行同源性比對后發(fā)現(xiàn),與一粒小麥TmHKT1;4-A2、TmHKT1;4-A1、高粱(Sorghumvulgare)SbHKT1;4和水稻OsHKT1;4的同源性分別為73%、70%、67%和61%,從而確定本試驗克隆的片段為小花堿茅HKT1;4基因,并命名為PutHKT1;4(圖4)。采用在線TMpred Server軟件(http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html) 對小花堿茅PutHKT1;4氨基酸序列進(jìn)行跨膜區(qū)預(yù)測發(fā)現(xiàn)可能存在5個跨膜區(qū),序列位置分別為1-17,32-51,61-82,154-171,193-209(圖3、圖5)。多重比對后發(fā)現(xiàn),小花堿茅PutHKT1;4氨基酸序列上存在編碼P-loop A區(qū)域的一段保守序列IDLFFTAVSSMS,箭頭所指的S為P-loop A區(qū)域的特異性絲氨酸離子選擇性位點(圖6)。

        圖3 小花堿茅PutHKT1;4基因片段核苷酸及推測的氨基酸序列

        圖4 PutHKT1;4與其他植物HKT1;4氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹

        圖5 PutHKT1;4氨基酸片段的跨膜區(qū)預(yù)測

        3 討論與結(jié)論

        土壤中過多的Na+對植物是有害的,尤其是對鹽比較敏感的農(nóng)作物。研究Na+在植物體內(nèi)的再循環(huán)途徑,對于提高植物抗鹽性意義重大。水稻OsHKT1;5的作用是從木質(zhì)部中回收Na+,參與Na+在植物體中的再循環(huán),從而減少Na+在植株地上部的積累[8]。 James等[21]從硬粒小麥(T.turgidum)耐鹽品系149中分離到兩個排Na+的主效基因Nax1和Nax2,擁有任意一個基因的品系植株比其他品系有更低的從根部向地上部轉(zhuǎn)運Na+的比率,同時增加吸收K+的比率。Nax1位點能夠從葉鞘和根木質(zhì)部卸載Na+,防止Na+在地上部的過多積累,而Nax2位點只能在根部發(fā)揮作用。后來研究表明,一粒小麥TmHKT1;4-A2可能是Nax1的候選基因,TmHKT1;5-A1可能是Nax2的候選基因[22-23]。本研究所克隆的PutHKT1;4基因和一粒小麥TmHKT1;4基因一樣,屬于HKT家族的第1類。通常第1類HKT在第1個P-loop區(qū)域都有一個絲氨酸離子選擇性位點,第2類為甘氨酸離子選擇性位點(個別除外,如水稻OsHKT2;1),這些位點可能與K+、Na+選擇性吸收相關(guān)[11],本試驗克隆到的小花堿茅PutHKT1;4也有一段12個氨基酸的保守P-loop區(qū)域,且有絲氨酸位點。小花堿茅蘊藏著豐富的抗鹽基因資源,PutHKT1;4基因片度的克隆將為進(jìn)一步研究小花堿茅耐鹽的分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。

        圖6 PutHKT1;4氨基酸序列與其他植物HKT1;4氨基酸序列多重比對圖

        [1]張宏飛,王鎖民.高等植物Na+吸收、轉(zhuǎn)運及細(xì)胞內(nèi)Na+穩(wěn)態(tài)平衡研究進(jìn)展[J].植物學(xué)通報,2007,24(5):561-571.

        [2]Horie T,Hauser F,Schroeder J I.HKT transporter-mediated salinity resistance mechanisms inArabidopsisand monocot crop plants[J].Trends in Plant Science,2009,14(12):660-668.

        [3]Tester M,Davenport R.Na+tolerance and Na+transport in higher plants[J].Annals of Botany,2003,91(5):503-527.

        [4]Munns R,Tester M.Mechanisms of salinity tolerance[J].Annual Review of Plant Biology,2008,59:651-681.

        [5]Leigh R A,Wyn Jones R G.A hypothesis relating critical potassium concentrations for growth to the distribution and function of this ion in the plant cell[J].New Phytologist,1984,97:1-13.

        [6]Ashley M K,Grant M,Grabov A.Plant responses to potassium deficiencies:a role for potassium transport proteins[J].Journal of Experimental Botany,2006,57(2):425-436.

        [7]Zhu J K.Regulation of ion homeostasis under salt stress[J].Current Opinion of Plant Biology,2003,6:441-445.

        [8]Ren Z H,Gao J P,Li L G,etal.A rice quantitative trait locus for salt tolerance encodes a sodium transporter[J].Nature Genetics,2005,37:1141-1146.

        [9]Sunarpi,Horie T,Motoda J,etal.Enhanced salt tolerance mediated by AtHKT1 transporter-induced Na+unloading from xylem vessels to xylem parenchyma cells[J].Plant Journal,2005,44(6),928-938.

        [10]Schachtman D P,Schroeder J I.Structure and transport mechanism of a high-affinity potassium uptake transporter[J].Nature,1994,370:655-658.

        [11]Platten J D,Cotsaftis O,Berthomieu P,etal.Nomenclature for HKT transporter,key determinants of plant salinity tolerance[J].Trends in Plant Science,2006,11(8):372-374.

        [12]王生銀,張永超,李莉,等.拒鹽型鹽生植物小花堿茅肌動蛋白基因片段的克隆及序列分析[J].基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué),2009,28(4):673-677.

        [13]郭強(qiáng),周向睿,王沛,等.鹽生植物小花堿茅K+通道PtAKT1基因片段的克隆及序列分析[J].草地學(xué)報,2010,18(5):683-688.

        [14]閻秀峰,孫國榮,李景信.星星草泌鹽能力的初步研究[J].草業(yè)科學(xué),1994,11(3):36-39.

        [15]韋存虛,王建波,陳義芳,等.鹽生植物星星草葉表皮具有泌鹽功能的蠟質(zhì)層[J].生態(tài)學(xué)報,2004,24(11):2451-2456.

        [16]朱興運,王鎖民,閻順國,等.堿茅屬植物抗鹽性與抗鹽機(jī)制的研究進(jìn)展[J].草業(yè)學(xué)報,1994,3(3):9-15.

        [17]閻順國.堿茅葉表面超微結(jié)構(gòu)的觀察——堿茅不是泌鹽植物的結(jié)構(gòu)證據(jù)[J].草業(yè)學(xué)報,1997,6(3):55-59.

        [18]沈禹穎.三種鹽生植物葉表的掃描電鏡觀察[J].草業(yè)學(xué)報,1997,6(3):32-36.

        [19]Wang S M,Zhao G Q,Gao Y S,etal.Puccinelliatenuifloraexhibits stronger selectivity for K+over Na+than wheat[J].Journal of Plant Nutrition,2004,27:1841-1857.

        [20]Wang C M,Zhang J L,Liu X S,etal.Puccinelliatenuifloramaintains a low Na+level under salinity by limiting unidirectional Na+influx resulting in a high selectivity for K+over Na+[J].Plant,Cell and Environment,2009,32:486-496.

        [21]James R A,Davenport R J,Munns R.Physiological characterization of two genes for Na+exclusion in durum wheat,Nax1 and Nax2[J].Plant Physiology,2006,142(4):1537-1547.

        [22]Byrt C S,Platten J D,Spielmeyer W,etal.HKT1;5-like cation transporters linked to Na+exclusion loci in wheat,Nax2 and Kna1[J].Plant Physiology,2007,143(4):1918-1928.

        [23]Zhang J L,Flowers T J,Wang S M.Mechanisms of sodium uptake by roots of higher plant[J].Plant and Soil,2010,326:45-60.

        猜你喜歡
        抗鹽小花克隆
        克隆狼
        每一朵小花都應(yīng)該盡情綻放
        小花
        黃河之聲(2021年2期)2021-03-29 01:20:10
        浙江:誕生首批體細(xì)胞克隆豬
        無名的小花
        送你一把小花傘
        兒童繪本(2019年12期)2019-07-08 21:18:44
        抗BP5-KLH多克隆抗體的制備及鑒定
        鋼纖維和膨脹劑對混凝土抗碳化和抗鹽凍性能的影響
        抗鹽降失水劑HTF-110L的研制及性能評價
        Galectin-7多克隆抗體的制備與鑒定
        国产精品原创巨作av无遮| 久久久精品人妻一区二区三区妖精 | 亚洲av噜噜狠狠蜜桃| 在线亚洲精品中文字幕美乳色| 91伦理片视频国产精品久久久| 人人爽人人爽人人片av| 18禁超污无遮挡无码免费游戏| 国产女奸网站在线观看| 成人短篇在线视频夫妻刺激自拍| 人妻少妇艳情视频中文字幕| 精品国产偷窥一区二区| 九九99久久精品国产| 国产精品天天看大片特色视频| 一区二区三区在线观看视频免费| 精品人妻一区二区三区视频| 狂野欧美性猛xxxx乱大交| 精产国品一二三产区m553麻豆 | 久久久久亚洲AV无码去区首| 久久精品国产一区老色匹| 又硬又粗进去好爽免费| 国偷自产视频一区二区久| 青春草国产视频| 亚洲一区二区三区在线| 精品视频一区二区三区日本| 三级做a全过程在线观看| 扒开双腿疯狂进出爽爽爽视频| 欧美破处在线观看| 人妻体体内射精一区中文字幕| 久久无码潮喷a片无码高潮| 和外国人做人爱视频| 国产成人8x视频网站入口| 一区二区三区在线观看精品视频 | 免费人成在线观看视频播放| 国产精品白浆无码流出| 国产精品一区二区三区成人| 蜜桃视频在线看一区二区三区| 最近中文字幕完整版免费| 乱人伦视频69| 亚洲av高清一区三区三区| 18禁在线永久免费观看| 亚洲精品乱码久久久久久蜜桃图片|