《中國海洋湖沼學(xué)報(bào)》(英文版, SCI-E收錄) Chinese Journal of Oceanology and Limnology 2011年第5期論文導(dǎo)讀

Cloning and nucleotide sequence of D-hydantoinase gene of marine polyphosphate-accumulating bacterium,Halomonassp. YSR-3

任世英, 劉飛, 李相前, 等: 以海洋聚磷菌(Halomonas)YSR-3的總DNA為模板, 用PCR法擴(kuò)增D-海因酶基因, 將擴(kuò)增片段克隆到 pGM-T載體, 轉(zhuǎn)化大腸桿菌(Escherichia coli)TOP10菌株, 經(jīng)藍(lán)白斑篩選、菌落 PCR得到陽性克隆,測序后對序列進(jìn)行 Blast比對分析。得到的基因序列長度為1 510 bp, 與假單胞菌(Pseudomonas entomophila)L48的海因酶基因序列的相似性為77%。翻譯后的序列與熒光假單胞菌(Pseudomonas fluorescens)Pf-5, 南極嗜冷菌(Marinomonassp.) MED121, 越南伯克氏菌(Burkholderia vietnamiensis)G4的海因酶蛋白序列相似性分別為75%、73%和70%。

Sequence and phylogenetic analyses of the chloroplast 16S rRNA,tufA, andrbcL genes fromBryopsis hypnoides

呂芳, 王廣策: 利用鳥槍法測序數(shù)據(jù)獲得青島產(chǎn)蘚羽藻(Bryopsis hypnoides)葉綠體編碼的16S rRNA和tufA基因全長。序列分析表明16S rRNA含有兩個(gè)I型的內(nèi)含子, 其結(jié)構(gòu)和插入位點(diǎn)與蕨藻(Caulerpa sertularioides)的相似;tufA基因長1230 bp, 富含AT區(qū), 其序列與羽藻屬相應(yīng)基因相似?；?6S rRNA,tufA和rbcL基因序列的系統(tǒng)進(jìn)化分析初步表明: Bryopsidineae, Halimedineae和Ostreobidineae為3個(gè)獨(dú)立的分支,Bryopsis屬與Derbesia屬互為姊妹群, 羽藻種群呈現(xiàn)特殊的生物地理分布格局。

Development and application of antibody microarray for white spot syndrome virus detection in shrimp

徐曉麗, 繩秀珍, 戰(zhàn)文斌: 本研究制備了對蝦白斑癥病毒(WSSV)抗體芯片用于養(yǎng)殖中WSSV的特異性、多樣品平行檢測。選擇瓊脂糖修飾玻片作芯片載體, 將純化的兔抗WSSV抗體(捕獲抗體)點(diǎn)陣于芯片載體上, 芯片與待檢樣品的組織勻漿液孵育, 所形成的抗原抗體復(fù)合物被Cy3標(biāo)記的抗WSSV單克隆抗體所識別。結(jié)果顯示所制備的WSSV抗體芯片最低檢測限為0.62 μg/mL, 檢測結(jié)果與傳統(tǒng)的間接酶聯(lián)免疫吸附法達(dá)到100%的符合。

Identification of a novel C-type lectin from the shrimpLitopenaeus vannameiand its role in defense against pathogens infection

羅展, 張繼泉, 李富花, 等: 作為一種模式識別受體, C-型凝集素參與“非己”識別和對入侵病原的清除過程, 在無脊椎動物先天性免疫防御中發(fā)揮重要的作用。本研究采用Real-time PCR、原核重組表達(dá)、RNA干擾等分子生物學(xué)技術(shù), 對凡納濱對蝦(Litopenaeus vannamei)的一種新型C-型凝集素LvLec1的生物學(xué)功能進(jìn)行了研究。Gene cloning and prokaryotic expression of recombinant outer membrane protein fromVibrio parahaemolyticus

袁野, 王秀利, 郭社平, 等: 從副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)克隆了外膜蛋白基因(ompW), 并在大腸桿菌BL21 (DE3)細(xì)胞中進(jìn)行了該基因的表達(dá)研究。研究結(jié)果表明,該基因編碼的蛋白相對分子量是42.78 kDa, OmpW蛋白作為候選疫苗來抵御副溶血弧菌的感染奠定了基礎(chǔ)。

The loss of genetic diversity during captive breeding of the endangered sculpin,Trachidermus fasciatus, based on ISSR markers; implications for its conservation

畢瀟瀟, 楊巧莉, 高天翔, 等: 利用ISSR技術(shù)對松江鱸(Trachidermus fasciatus, 國家二級保護(hù)動物)的野生群體和養(yǎng)殖群體進(jìn)行了遺傳多樣性分析和比較。6對引物在85個(gè)個(gè)體中, 共擴(kuò)增出353個(gè)位點(diǎn), 多態(tài)位點(diǎn)324個(gè)。養(yǎng)殖群體的多態(tài)性位點(diǎn)比例、Nei遺傳多樣性指數(shù)和Shannon遺傳多樣性指數(shù)均低于野生群體, 分別為 73.80%, 0.1782, 0.2769。UPGMA聚類分析和AMOVA分析表明松江鱸養(yǎng)殖群體與野生群體存在一定程度的遺傳隔離, 并發(fā)生了顯著的遺傳分化。

Genetic identification of two species ofPleuronichthysthrough DNA barcoding

張輝, 張巖, 高天翔, 等: 長木葉鰈(Pleuronichthys cornutus)和角木葉鰈(Pleuronichthys japonicus)是木葉鰈屬僅有的兩個(gè)形態(tài)相似種, 而長木葉鰈在中國海域未見報(bào)道。本研究基于在舟山近海采集到的兩種木葉鰈樣品, 運(yùn)用 DNA條形碼標(biāo)準(zhǔn)基因(COI), 結(jié)合線粒體CR和Cytb序列對兩者進(jìn)行了鑒定, 結(jié)果發(fā)現(xiàn)COI基因在兩個(gè)種的鑒別中最為有效。

Characterization and application of monoclonal antibodies againstShewanella marisflavi, a novel pathogen ofApostichopus japonicas

李強(qiáng), 景宏麗, 李華, 等: 制備了 4株抗仿刺參(Apostichopus japonicas)病原菌——黃海希瓦氏菌(Shewanella marisflavi, AP629)的單克隆抗體(3C1, 3D9, 2F2和2A8),并應(yīng)用免疫學(xué)技術(shù)對單抗進(jìn)行了特性分析, 最后應(yīng)用免疫組織化學(xué)技術(shù)對不同感染方式下菌株 AP629在仿刺參化皮體壁中的定位進(jìn)行了研究。

Enzyme responses and lipid peroxidation in the gills and the hepatopancreas of the clamMactra vereformis, following cadmium exposure

王曉宇, 楊紅生, 劉廣斌, 等: 研究了四角蛤蜊(Mactra vereformis)在室內(nèi)不同濃度鎘不同時(shí)間脅迫下, 鰓和肝胰腺中抗氧化系統(tǒng)酶、水解酶以及脂質(zhì)過氧化產(chǎn)物含量的變化。結(jié)果表明, SOD、CAT、GPx和ACP的變化能反應(yīng)鎘脅迫的壓力, 可作為重金屬污染評估的生物標(biāo)志物使用。

Estimated reproductive success of brooders and heritability of growth traits in large yellow croaker (Larimichthys crocea) using microsatellites

劉賢德, 隋班良, 王志勇, 等: 為估算大黃魚(Larimichthys crocea)親本的繁殖成功率和生長相關(guān)性狀的遺傳力, 采用因子設(shè)計(jì)構(gòu)建了2個(gè)混合交配小群體——組1和組3, 其親本組合分別為4♀×4♂和3♀×4♂。使用6個(gè)微衛(wèi)星引物對親本及子代進(jìn)行了分析。根據(jù)微衛(wèi)星分析的結(jié)果進(jìn)行系譜重建, 得 20月齡各生長性狀的遺傳力分別為: 體長0.19 cm±0.13 cm, 體高 0.09 cm±0.06 cm, 體質(zhì)量 0.13 g± 0.10 g。20月齡大黃魚各生長性狀之間的遺傳相關(guān)及表型相關(guān)值極大, 接近于1, 說明對其中一個(gè)性狀進(jìn)行選擇, 其他生長性狀也會取得相應(yīng)的遺傳進(jìn)展。該研究結(jié)果為大黃魚的遺傳育種工作提供了有用的參考資料。

Pyrolytic characteristics and kinetics of the marine green tide macroalgae,Enteromorpha prolifera

趙輝, 閆華曉, 劉明, 等: 通過熱重分析法對滸苔(Enteromorpha prolifera)熱解特性和動力學(xué)進(jìn)行了考察, 結(jié)果表明: 滸苔熱解過程仍可分為 3個(gè)階段, 起始熱解溫度、活化能值和最大失重峰都低于陸生生物質(zhì), 并計(jì)算了活化能和指前因子, 并以數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)推測了機(jī)理函數(shù)。

The eco-nutrition requirements for dietary protein and its rhomb characteristics in juvenile turbot (Scophthalmus maximusL.)

李勇, 蔣克勇, 孫國祥, 等: 從生態(tài)營養(yǎng)學(xué)方面, 本研究總結(jié)出試驗(yàn)結(jié)果關(guān)鍵指標(biāo)變化趨勢模擬圖。可見, 達(dá)到最高蛋白質(zhì)效率的飼料蛋白質(zhì)水平低于獲得最大生長性能的飼料蛋白質(zhì)水平; 飼料蛋白質(zhì)水平從生態(tài)適宜到生態(tài)過量(生長性能最大), 會導(dǎo)致糞氮排除和水中氨氮濃度的顯著增加。

Periodic exposure to ambient solar irradiance benefits the growth of juvenile seedlings ofHizikia fusiformis

單體鋒, 逄少軍, 高素芹: 在利用同步受精技術(shù)培育羊棲菜(Hizikia fusiformis)幼苗的過程中, “黑苗”和雜藻等問題嚴(yán)重威脅幼苗的健康。本研究為了優(yōu)化適合羊棲菜幼苗生長的條件, 用直接照射日光、接種滸苔屬海藻和次氯酸鈉清洗等方法處理接種了羊棲菜幼苗的苗簾, 結(jié)果發(fā)現(xiàn)每天2 h的直接日光照射可以有效促進(jìn)幼苗的生長, 同時(shí)還能抑制雜藻的生長。

Effects of photoperiod on daily activity rhythm of juvenile sea cucumber,Apostichopus japonicus(Selenka)

董貫倉, 董雙林, 田相利, 等: 實(shí)驗(yàn)研究了刺參(Apostichopus japonicus) 在不同光照周期下的行為特性: (1)刺參在全黑暗及全光照下存在顯著的晝夜節(jié)律, 但是節(jié)律性較弱, 且 “晝”及 “夜”狀態(tài)不同; (2)6～12 h光照下, 刺參存在一個(gè)移入及兩個(gè)移出的過程; (3)參礁外刺參數(shù)量隨光照的延長逐漸減少而后增加, 平均數(shù)量隨光照的延長逐漸減少。

The radular morphology ofNassariidae(Gastropoda: Caenogastropoda) in China seas

楊靜文, 張素萍: 此研究一共檢查了 22種織紋螺(Nassariidae)的齒舌, 它們分別隸屬于2個(gè)亞科, 2屬, 10個(gè)亞屬。通過光學(xué)顯微鏡和電子掃描顯微鏡作者觀察了織紋螺的齒舌的構(gòu)造, 作為織紋螺齒舌的主要區(qū)別特征, 對中央齒、側(cè)齒和中間附屬板的形態(tài)進(jìn)行比較研究。由于在大部分的亞屬中, 織紋螺的齒舌形態(tài)變化較大, 不能歸納出明顯的亞屬特征, 研究的結(jié)果不支持只依據(jù)齒舌的形態(tài)而對織紋螺進(jìn)行亞屬的劃分。同時(shí), 實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示: 織紋螺中央齒的小齒數(shù)量在同一個(gè)種類中可能會發(fā)生變動, 但是中間附屬板的有或無是不會改變的(即中間附屬板的有無是具有種間差異的),因此, 中間附屬板可以作為外形近似種的一個(gè)有價(jià)值的鑒別特征。

Trophic ecology of small yellow croaker (LarimichthyspolyactisBleeker): stable carbon and nitrogen isotope evidence

紀(jì)煒煒, 陳雪忠, 姜亞洲, 等: 根據(jù)2009年7月到9月東海北部調(diào)查所采集的小黃魚(Larimichthys polyactis)樣品,采用穩(wěn)定同位素分析的方法研究了小黃魚的營養(yǎng)生態(tài)學(xué)。研究結(jié)果顯示, δ13C和δ15N的范圍跨度較大且重合度低, 不同站位間的δ13C和δ15N具有一定的空間變異性。此外, 隨著個(gè)體發(fā)育和生長, 小黃魚體內(nèi)δ15N和δ13C值顯著變化。作者闡釋了小黃魚的攝食、洄游等生態(tài)特征, 并對穩(wěn)定同位素方法在營養(yǎng)生態(tài)學(xué)中的應(yīng)用進(jìn)行了探討。

Selectivity of escape-hole size in tube traps for white-spotted congerConger myriaster

楊炳忠, 唐衍力, 梁振林: 采用比較作業(yè)法, 在黃海區(qū)中對出水孔直徑分別為8、15、18、20、22 mm的鰻魚籠對星康吉鰻(Conger myriaster)的選擇性進(jìn)行研究。用SELECT(Share Each Length’s Catch Total)選擇性模型估算選擇性參數(shù), 由AIC (Akaike’ s Information Criterion)值判斷并選擇較優(yōu)選擇性模型, 并用由 Logistic模型模擬實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)獲得選擇性曲線。

Photosynthetic efficiency, cell volume, and elemental stoichiometric ratios inThalassirosira weissflogiiunder phosphorus limitation

劉勝, 郭志靈, 李濤, 等: 磷限制培養(yǎng)下威氏海鏈藻(Thalassirosira weissflogii)細(xì)胞明顯變大, 生源要素含量顯著下降, 但N/P比卻對磷供應(yīng)表現(xiàn)不敏感, 基本維持在25左右,略高于Redfield比。墨角藻黃素和葉綠素a的比值(Fuco/Chla)與實(shí)際光量子產(chǎn)量(ΔF/Fm’)與細(xì)胞營養(yǎng)狀態(tài)一致。在評估藻類營養(yǎng)狀態(tài)時(shí)需慎用N/P比, 而ΔF/Fm’、Fuco/Chla比和細(xì)胞大小則可彌補(bǔ)部分不足。

Seasonal variation in functional phytoplankton groups in Xiangxi Bay, Three Gorges Reservoir

楊敏, 畢永紅, 胡建林: 從2007年8月～2008年7月, 每月在香溪庫灣定期定點(diǎn)采集浮游植物樣品一次。結(jié)果表明,按照Reynolds的浮游植物功能分類法, 香溪庫灣共有10個(gè)浮游植物優(yōu)勢功能類群, 以 C-strategists類群以及S-strategists、R-strategists中耐受范圍較廣的類群占優(yōu)勢。以水庫水利調(diào)度的10月份、1月份以及5月份為分界線, 可分為4個(gè)水體相對穩(wěn)定期, CCA分析表明浮游植物優(yōu)勢功能類群的分布同各水體穩(wěn)定期相對應(yīng)。功能類群C(以美麗星桿藻(Asterionella formosa)為代表)、P(以顆粒溝鏈藻(Aulacoseria granulata)為代表)在8～9月份密度較高; Lo(甲藻)在春季2～4月占優(yōu)勢, 并在庫灣形成甲藻水華; 以漢斯冠盤藻(Stephanodiscus hantzschii)為代表的 B類群、以尖尾逗隱藻(Komma acudata)為代表的 X2類群和以嚙蝕隱藻(Cryptomonas erosa)為代表的 Y類群(單細(xì)胞硅隱藻)幾乎在全年都有分布, 為全年優(yōu)勢類群, 在晚春時(shí)的密度尤其高; 6～7月份, H1(水華魚腥藻(Anabaena flos-aquae)、M(微囊藻Microcystis aeruginosa,M. wesenbergii)類群取得競爭優(yōu)勢,庫灣暴發(fā)藍(lán)藻水華, 在水華后期, 以 G、J(群體綠藻)類群為代表的綠藻密度較高。浮游植物在周年內(nèi)的演替類型為Lo(甲藻)→B/X2/Y(單細(xì)胞硅隱藻)→H1/M/J/G(群體藍(lán)綠藻)→C/P(群體硅藻)。水體穩(wěn)定狀況、光照、水溫以及營養(yǎng)鹽結(jié)構(gòu)可能是影響香溪庫灣浮游植物季節(jié)演替的關(guān)鍵因子。

Population dynamics of four dominant copepods in Prydz Bay, Antarctica, during austral summer from 1999 to 2006

楊光, 李超倫, 孫松: 基于1999～2006年6次中國南極考察浮游動物樣品資料, 對普里茲灣4種橈足類優(yōu)勢種種群的年際變動進(jìn)行了分析, 結(jié)果顯示: 4種橈足類種群存在顯著的年際變動, 海冰及冰間湖等環(huán)境因子是引起種群變動的主要因素。

Classification of marine diatoms using pigment ratio suites

姚鵬, 于志剛, 鄧春梅, 等: 作者使用高效液相色譜測定分析了分離自中國海域的 14個(gè)品系的海洋浮游硅藻的光合色素組成, 并計(jì)算了色素比值。通過對樣品的聚類分析,發(fā)現(xiàn)3個(gè)色素之間的比值, 即葉綠素c2: 葉綠素c1、巖藻黃素: 葉綠素c和硅甲藻黃素: 硅藻黃素具有將14個(gè)硅藻品系分成和生物學(xué)分類相一致的4個(gè)類別的能力。

Purification and characterization of cold-active endo-1,4-βglucanase produced byPseudoalteromonassp. AN545 from Antarctica

沈繼紅, 闞光鋒, 史翠娟, 等: 本研究從南極海冰中分離到一株能降解羧甲基纖維素的菌株, 經(jīng)16S rDNA分析鑒定為嗜冷菌Pseudoalteromonassp.。純化的纖維素酶分子量約為47.5 kDa, 能水解羧甲基纖維素、微晶纖維和β-葡聚糖,最佳作用溫度和pH值分別為30°C和pH6.0, 30°C溫育1 h (pH 5.0～6.5)仍有80%的酶活, 能被Ca2+和Mg2+激活, 被Cu2+抑制,Km和Vmax分別為3.96 mg/mL、6.06×10-2mg/(min·mL),為一種新型的酸性低溫內(nèi)切-1,4-β-葡聚糖酶。

Detection of 36 antibiotics in coastal waters using high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry

那廣水, 顧佳, 葛林科, 等: 建立了一種快速檢測近岸海水中 36種四環(huán)素類、磺胺類和喹諾酮類抗生素殘留的高效液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜(HPLC-MS/MS)方法。采用固相萃取法,通過HLB串聯(lián)MCX小柱對樣品進(jìn)行凈化和濃縮。液相色譜采用C18柱, 甲醇和0.1%甲酸作為流動相對樣品進(jìn)行梯度洗脫, 選擇反應(yīng)監(jiān)測(SRM)正離子模式測定。36種抗生素的回收率范圍在67.4%～109.3%, 相對標(biāo)準(zhǔn)偏差均小于14.6%。36種抗生素檢出限范圍為0.45～7.97 pg。應(yīng)用此方法對黃海沿岸的海水樣品進(jìn)行了檢測, 其中31種抗生素被檢出, 濃度范圍為在低于檢出限到212.5 ng/L之間。

Evaluating the performance of accelerated-solvent extraction, microwave-assisted extraction, and ultrasonic-assisted extraction for determining PCBs, HCHs and DDTs in sediments

張蓬, 葛林科, 周傳光: 本文比較了加速溶劑萃取(ASE)、微波萃取(MAE)和超聲萃取(UAE)在定量萃取沉積物標(biāo)準(zhǔn)參考物質(zhì)IAEA-417中PCBs, HCHs和DDTs的萃取效率。one-way ANOVA分析的結(jié)果顯示ASE和MAE的實(shí)際回收率之間無顯著差異, UAE則顯著低于ASE和MAE, 綜合考慮儀器的購置費(fèi)用, 耗材, 處理時(shí)間和溶劑用量, MAE優(yōu)于ASE。

Seismic sequence and depositional evolution of slope basins in mid-northern margin of the South China Sea

黎明碧, 金翔龍, 李家彪, 等: 通過多道地震數(shù)據(jù), 在研究區(qū)新生代沉積中識別出 15個(gè)主要反射界面。通過層序標(biāo)定及其與鄰區(qū)的對比, 對各層序界面的年齡進(jìn)行定年。研究區(qū)新生代沉積經(jīng)歷了河湖相-海陸過渡相-濱淺海相-陸坡深海相, 分別對應(yīng)同裂谷期, 早期漂移期和晚期漂移期的構(gòu)造事件。

Comment on “Estimation of potential distribution of gas hydrate in the northern South China Sea” by Chunjuan Wang et al.

張毅: 本文是對 Wang等在 Chinese Journal of Oceanology and Limnology (28(3): 693-699)所發(fā)表文章“Estimation of potential distribution of gas hydrate in the northern South China Sea”評論。本文認(rèn)為Wang等文章中所給出有關(guān)珠江口盆地北部及鶯歌海盆地中甲烷水合物的概率分布存在著不妥。在簡要介紹甲烷水合物穩(wěn)定帶計(jì)算工作的基礎(chǔ)上, 我們指出 Wang等文中沒有考慮天然氣水合物存在的基本溫度-壓力條件, 建議在其模型中考慮水深、海底溫度及地溫梯度等與水合物分布相關(guān)的變量。

Variability of the subduction rates of the subtropical North Pacific mode waters

胡海波, 劉秦玉, 張媛, 等: 采用IAP-LASG-LICOM1.0海洋模式進(jìn)行了北太平洋模態(tài)水和潛沉率的數(shù)值試驗(yàn)。給出了模式中北太平洋潛沉率的氣候態(tài)及年際變化特征。證實(shí)了北太平洋副熱帶3個(gè)潛沉率極大值海域也是副熱帶模態(tài)水的生成區(qū)。研究了海面風(fēng)及凈熱通量的改變對3個(gè)模態(tài)水形成區(qū)逐年潛沉率的影響, 揭示了在這3個(gè)海域控制潛沉率年際和年代際變化的機(jī)制。

Storm surge disaster evaluation model based on an artificial neural network

紀(jì)芳, 侯一筠: 風(fēng)暴潮預(yù)測是一種重要的災(zāi)害預(yù)測方法,文章采用反向傳播方法通過風(fēng)暴潮的各種特征預(yù)測風(fēng)暴潮潮位。信息擴(kuò)散方法用于處理地質(zhì)災(zāi)害預(yù)測中的模糊信息問題。首先, 單步預(yù)測模型和神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測模型被用來收集相關(guān)的信息, 從而預(yù)測極限潮位。然后, 采用信息擴(kuò)散方法進(jìn)行信息挖掘。信息擴(kuò)散方法可以在信息不足的時(shí)候, 提高風(fēng)險(xiǎn)估計(jì)的精度。通過實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn), 文章中提出的方法簡單、有效率, 與其他方法相比, 可以得到較好的預(yù)測結(jié)果。在未來的工作中, 本研究將著重于提出一種更加精確的預(yù)測模型。

(文/《中國海洋湖沼學(xué)報(bào)》(英文版); 編輯/譚雪靜)