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        人參銹腐病拮抗放線菌的鑒定及發(fā)酵條件1)

        2011-03-29 08:06:48姜云陳長卿王琳馬貴龍
        關(guān)鍵詞:酵母粉放線菌氮源

        姜云 陳長卿 王琳 馬貴龍

        (吉林農(nóng)業(yè)大學(xué),長春,130118)

        人參銹腐病(Cylindrocarpon destructans)是對人參根部危害最大的1種土傳病害,對人參產(chǎn)量和品質(zhì)影響極大,常年發(fā)病率為24.9%~44.1%[1],目前仍沒有較好的解決辦法,已成為人參連作的主要障礙。凡種過人參的土地,在幾十年內(nèi)不能再植參,否則大部分乃至整個參根都會腐爛[2-3]。近年來,用化學(xué)防治措施來防治人參銹腐病的結(jié)果遠(yuǎn)遠(yuǎn)未達(dá)到人們預(yù)想的效果,而且過量使用化學(xué)農(nóng)藥會破壞土壤的微生物環(huán)境,加重環(huán)境污染,也使得有毒物質(zhì)在參根內(nèi)大量積累,降低人參的商品價值,因此,人們把防治重點(diǎn)逐步轉(zhuǎn)向生物防治措施和農(nóng)業(yè)防治措施上[4-5]。其中農(nóng)用抗生素由于其具有無污染、不易使有害生物產(chǎn)生抗藥性等特點(diǎn)而成為重要的生物防治措施。農(nóng)用抗生素來源于微生物,特別是放線菌[6]。目前從微生物中發(fā)現(xiàn)的大約8 000種生物活性物質(zhì)中,近70%是由放線菌產(chǎn)生的[7]。本研究對采自吉林省人參主要種植區(qū)(集安市、通化市等)的土壤樣品進(jìn)行了拮抗放線菌的篩選[8],對優(yōu)良菌株1a-3進(jìn)行了鑒定并對其培養(yǎng)配方和發(fā)酵條件進(jìn)行了研究,以便為抗生物質(zhì)的分離提純提供試驗依據(jù),為進(jìn)一步的小試和中試生產(chǎn)奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        主要試劑和儀器:試劑均為國產(chǎn)分析純;主要儀器為基恩士國際貿(mào)易有限公司的數(shù)碼顯微鏡(KEYENCE VHX-600),太倉市實驗設(shè)備廠的恒溫振蕩培養(yǎng)箱(HZQX100),德國KONTRON公司的高速冷凍離心機(jī)(T-42K),上海精密科學(xué)儀器有限公司的酸度計(PHS-3C),Ultra-Violet Products Ltd公司的自動凝膠圖像分析儀(GelDoc-It 200)。

        菌株及保存:菌株1a-3按常規(guī)方法在高氏一號培養(yǎng)基上繁殖保存。

        基礎(chǔ)發(fā)酵培養(yǎng)基(同種子培養(yǎng)基):每升含大豆粉20 g,葡萄糖10 g、NaCl 10 g、CaCO33 g、KH2PO41 g,pH值7.0。

        1.2 菌株鑒定

        形態(tài)學(xué)觀察:①采用插片法[9]將菌株1a-3劃線接種在高氏一號培養(yǎng)基上,同時將滅菌的蓋玻片(1 cm×1 cm)斜插入培養(yǎng)基內(nèi),28℃培養(yǎng)5 d后,取出蓋玻片在生物顯微鏡下觀察菌絲形態(tài)。②取在高氏一號平板上培養(yǎng)7 d的菌株1a-3進(jìn)行掃描電鏡樣品加工處理。樣品用3%戊二醛室溫下固定4~6 h,后經(jīng)系列丙酮脫水、CO2臨界點(diǎn)干燥、粘樣、鍍膜后在掃描電鏡下觀察菌絲和孢子形態(tài)。

        培養(yǎng)特征和生理生化特征:參照《鏈霉菌鑒定手冊》[10]中推薦的部分培養(yǎng)基和方法進(jìn)行,28℃培養(yǎng)12~15 d后觀察記錄特征。

        細(xì)胞壁化學(xué)成分分析:采用快速薄板層析法[11-12]對菌株1a-3的細(xì)胞進(jìn)行全細(xì)胞水解液氨基酸和糖型的分析。

        分子鑒定:按照徐平的方法[13]提取菌株1a-3基因組DNA,采用通用引物[14](F:5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCA G-3';R:5'-AAGGAGGTGATCCAGCCGCA-3')進(jìn)行16 S rDNA的PCR擴(kuò)增,經(jīng)回收、連接和轉(zhuǎn)化后,在測序儀上進(jìn)行測序,將所得序列與GenBank數(shù)據(jù)庫中序列進(jìn)行BLAST分析比對,并選取相似性較高的菌株與菌株1a-3用MEGA4.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。

        1.3 菌株發(fā)酵培養(yǎng)及抑菌活性的測定

        菌株發(fā)酵培養(yǎng)及發(fā)酵上清液的制備:發(fā)酵培養(yǎng)首先在種子培養(yǎng)基上28℃振蕩培養(yǎng)24 h(150 r/min)制成種子液;然后加3 mL種子液在基礎(chǔ)發(fā)酵培養(yǎng)基中(30 mL),于28℃振蕩培養(yǎng)(200 r/min)72 h后,10 000 r/min離心10 min,取上清液備用。

        混菌法測定發(fā)酵上清液的抑菌活性:將1 mL無菌水加入人參銹腐病菌的培養(yǎng)試管中,用接種針將菌絲和孢子刮下制成菌懸液與PDA培養(yǎng)基10 mL混合后到入9 cm的培養(yǎng)皿中制成平板,用直徑1 cm的打孔器在固體平板中打孔,然后向孔中加入發(fā)酵上清液200μL,25℃培養(yǎng)3d后測定抑菌圈大小。

        1.4 發(fā)酵條件的研究

        不同碳、氮源對發(fā)酵液抑菌活性的影響:在氮源質(zhì)量濃度和其它培養(yǎng)條件不變的情況下[15],分別用蔗糖、麥芽糖、甘油、正丁醇、玉米粉、淀粉等量替換基礎(chǔ)發(fā)酵培養(yǎng)基中的葡萄糖;在碳源質(zhì)量濃度和其它培養(yǎng)條件不變的情況下,分別用酵母粉、蛋白胨、牛肉膏、硝酸銨、硝酸鉀、硝酸鈉等量替換基礎(chǔ)發(fā)酵培養(yǎng)基中的大豆粉,以基礎(chǔ)發(fā)酵培養(yǎng)基作對照,采用混菌法測定不同碳、氮源的發(fā)酵上清液對C.destructans抑菌活性的影響。

        碳、氮源單因子試驗和正交試驗:在確定主要碳、氮源的基礎(chǔ)上,對大豆粉(0~22 g/L,按2 g/L遞增)、葡萄糖(0~6 g/L,按1 g/L遞增)、酵母粉(0~0.5 g/L,按0.1 g/L遞增)、玉米粉(0~18 g/L,以1.5 g/L遞增)進(jìn)行單因子試驗,以確定其合適使用的質(zhì)量濃度梯度。在此基礎(chǔ)上選擇L9(34)的正交試驗進(jìn)行發(fā)酵抑菌試驗,因子水平見表1,發(fā)酵試驗重復(fù)3次,用混菌法測定抑菌活性,將3次的平均值作為試驗結(jié)果[16],進(jìn)行分析和統(tǒng)計后確定發(fā)酵配方。

        表1 基于L9(34)的發(fā)酵抑菌試驗的因子水平

        培養(yǎng)條件的摸索:在確定發(fā)酵培養(yǎng)基成分后測定不同培養(yǎng)條件下發(fā)酵液對C.destructans的抑菌活性,測定方法用混菌法,①種齡試驗。取30 mL種子培養(yǎng)基裝入250 mL三角瓶中,種子培養(yǎng)基成分同發(fā)酵培養(yǎng)基,用直徑10 mm的打孔器打取1塊1a-3菌碟接入種子培養(yǎng)基中,分別培養(yǎng)12、24、36、48、60、72 h后,以10%的接種量將其分別接種在發(fā)酵培養(yǎng)基中。②接種量試驗。在其它培養(yǎng)條件一致的條件下,將種子液分別以體積分?jǐn)?shù)2%、4%、6%、8%和10%的水平接種到發(fā)酵培養(yǎng)基中,測定各搖瓶中發(fā)酵液的抑菌活性。③初始pH試驗。在其它培養(yǎng)條件一致的條件下,用酸度計將培養(yǎng)基的起始pH值(滅菌前pH值)分別調(diào)至5.0、6.0、7.0、8.0、9.0搖床培養(yǎng)后,測定各搖瓶中發(fā)酵液的抑菌活性。④發(fā)酵溫度試驗。在其它培養(yǎng)條件一致的條件下,分別在24、28、32℃恒溫?fù)u床培養(yǎng),測量各搖瓶中發(fā)酵液的抑菌活性。⑤發(fā)酵時間試驗。在其它培養(yǎng)條件一致的條件下,發(fā)酵分別培養(yǎng)12~120 h(12 h遞增),測定各搖瓶中發(fā)酵液的抑菌活性。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 菌株鑒定

        2.1.1 形態(tài)學(xué)觀察

        通過光學(xué)顯微鏡和電子顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn),菌株1a-3的孢子絲呈寬大頂端螺旋形,帶有長柄,孢子柱形,表面光滑,常在氣生菌絲上形成長孢子鏈(圖1)。

        圖1 菌株1a-3的菌絲和孢子形態(tài)

        2.1.2 培養(yǎng)特征和生理生化特征

        菌株1a-3在不同培養(yǎng)基上的培養(yǎng)結(jié)果見表2,其中在高氏一號培養(yǎng)基上氣生菌絲呈銀鼠灰色,菌落有水珠,長勢飽滿,基內(nèi)菌絲黃色,有可溶性色素產(chǎn)生。生理生化測定結(jié)果表明,菌株1a-3能使明膠液化,淀粉水解,牛奶凝固,產(chǎn)生H2S,但不能在纖維素上生長;耐鹽性結(jié)果表明,菌株1a-3只能忍受5 g/L以下的鹽脅迫,在7~25 g/L鹽脅迫培養(yǎng)基上不生長。

        2.1.3 細(xì)胞壁化學(xué)成分

        細(xì)胞壁化學(xué)成分分析顯示,菌株1a-3含LL-二氨基庚二酸和甘氨酸;無特征性糖,糖型C。因此其細(xì)胞壁化學(xué)組分屬于Ⅰ型,符合鏈霉菌(Streptomyces)的化學(xué)分類特性。

        2.1.4 分子鑒定

        菌株1a-3 16 S rDNA的PCR擴(kuò)增得到了1條1 500 bp左右大小的條帶,將測序所得的1 525 bp DNA序列與NCBI數(shù)據(jù)庫Blast比對,登錄號為HM560727。與其同源性較高的菌株均屬于鏈霉菌屬,選取8株模式菌株進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,用MEGA4.0構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖2),可以看出菌株1a-3與S.griseochromogenes(AB184387)聚于同一分支中,其相似性達(dá)到99%。

        2.2 發(fā)酵條件

        不同碳、氮源對發(fā)酵液抑菌活性影響:在供試的6種碳源中(表3),除了淀粉為碳源時不產(chǎn)生抑菌圈外,其它碳源的抑菌活性都低于葡萄糖(對照),在發(fā)酵過程中常選用速效碳源和緩慢碳源混合作為碳源,結(jié)合應(yīng)用成本考慮,選用葡萄糖與玉米粉復(fù)合使用,作為本試驗碳源。在供試的6種氮源中(表4),以硝酸銨、硝酸鉀、硝酸鈉為氮源時無抗菌物質(zhì)產(chǎn)生,對無機(jī)氮源的利用不好,而有機(jī)氮源中以大豆粉為氮源時產(chǎn)素能力最強(qiáng),當(dāng)以酵母粉單獨(dú)作氮源時,抑菌效果雖然一般,但酵母粉有提供氮源又促進(jìn)發(fā)酵的雙重作用,所以選擇大豆粉和酵母粉作為氮源。

        表2 菌株1a-3的培養(yǎng)特征

        圖2 菌株1a-3與相關(guān)菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹(分支處的數(shù)值為支持強(qiáng)度值)

        表3 不同碳源對菌株1a-3產(chǎn)素的影響

        表4 不同氮源對菌株1a-3產(chǎn)素的影響

        碳、氮源單因子試驗和正交試驗結(jié)果表明,大豆粉按2 g/L遞增(2~6 g/L)、酵母粉按0.1 g/L遞增(0.2~0.4 g/L)、葡萄糖按1 g/L遞增(0~2 g/L)、玉米粉按1.5 g/L遞增(0~3 g/L)比較合適,每個因子3個水平,能反映出趨勢的變化。在此基礎(chǔ)上進(jìn)行了正交試驗,9次試驗的抑菌圈直徑依次為20、22、17、21、20、23、19、24、22 mm。極差分析結(jié)果(表5)表明:4因子對發(fā)酵液抑菌活性的影響大小依次為大豆粉、玉米粉、葡萄糖、酵母粉。最佳碳氮源發(fā)酵配方為大豆粉2 g/L、酵母粉0.3 g/L、玉米粉3 g/L、葡萄糖1 g/L。

        2.3 培養(yǎng)條件

        在確定發(fā)酵培養(yǎng)基成分的條件下,對發(fā)酵培養(yǎng)條件進(jìn)行了摸索,首先是將種子培養(yǎng)液培養(yǎng)24 h,以6%的接種量接入發(fā)酵培養(yǎng)基中培養(yǎng);培養(yǎng)條件為:培養(yǎng)基的起始pH為7.0,恒溫?fù)u床上28℃培養(yǎng)60 h,搖瓶裝量30 mL種子培養(yǎng)基于250 mL三角瓶中,轉(zhuǎn)速為200 r/min,發(fā)酵后,其抑菌活性最好,所以選擇此培養(yǎng)條件作為發(fā)酵培養(yǎng)條件。

        表5 正交試驗極差分析結(jié)果mm

        3 結(jié)論與討論

        絕大多數(shù)抗生素產(chǎn)生菌為鏈霉菌屬,其次是諾卡氏菌屬(Nocardia)、游動放線菌屬(Actinoplanes)以及馬杜拉放線菌屬(Actinomadura)等,其中鏈霉菌已成為放線菌中數(shù)量最多、而且產(chǎn)生抗生素種類也最多的一個屬。本研究在傳統(tǒng)分類原則的基礎(chǔ)上,通過分子生物學(xué)方法對目的生防菌株進(jìn)行了分類鑒定。菌株1a-3在形態(tài)特征、培養(yǎng)特征、生理生化特征和細(xì)胞壁成分上與已知的灰產(chǎn)色鏈霉菌相似,并且結(jié)合分子生物學(xué)鑒定結(jié)果,最后歸為灰產(chǎn)色鏈霉菌。目前尚不能確定該菌株是否為1新種,還需要與模式種進(jìn)行生理生化性質(zhì)比較,并進(jìn)行DNA雜交,根據(jù)同源性作進(jìn)一步分析。另外,該菌株是否可被看作是農(nóng)用抗生素的一個新來源,還需要后續(xù)試驗的進(jìn)一步驗證。

        發(fā)酵是抗生素產(chǎn)業(yè)化的基礎(chǔ),這是因為盡管抗生素產(chǎn)生菌的性能優(yōu)良,但若缺乏合理的發(fā)酵工藝,也不能將其潛力充分發(fā)揮??股匕l(fā)酵除受營養(yǎng)因素的限制以外,合適的發(fā)酵條件也是不可忽視的重要因素[17]。通過試驗確定菌株1a-3的合適搖瓶發(fā)酵配方和培養(yǎng)條件為:葡萄糖1 g/L、玉米粉3 g/L、大豆粉2 g/L、酵母粉0.3 g/L、KH2PO40.1 g/L、CaCO30.3 g/L、NaCl 0.1 g/L,起始pH值7.0、28℃搖瓶培養(yǎng)60 h,搖瓶裝量30 mL種子培養(yǎng)基于250 mL三角瓶中,轉(zhuǎn)速為200 r/min發(fā)酵后,其效果較好。此試驗在考慮為放大中試及大規(guī)模生產(chǎn)的發(fā)酵條件打基礎(chǔ)的同時,還要考慮到后續(xù)活性物質(zhì)的分離、提純,因此,除了考慮成本還要看是否會產(chǎn)生過多的色素和離子。并且,發(fā)酵是一個復(fù)雜動態(tài)的生命過程,試驗只對發(fā)酵條件中一些主要影響因子進(jìn)行了分析,為了使其得到充分的產(chǎn)業(yè)化,在后續(xù)的試驗中還將采用生化等方法對其代謝過程進(jìn)行檢測和研究,以明確發(fā)酵培養(yǎng)基中各成分的利用情況與菌絲生長和發(fā)酵液活性之間的關(guān)系[18],從而有目的地選擇培養(yǎng)基和發(fā)酵條件。參考文獻(xiàn)

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