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        湖北及山東地區(qū)栽培芋病毒病的田間調(diào)查及其病原的分子檢測

        2011-03-22 07:59:38施世明洪霓
        長江蔬菜 2011年16期
        關鍵詞:檢測

        施世明,洪霓

        (華中農(nóng)業(yè)大學植物科學技術學院,湖北武漢,430070)

        湖北及山東地區(qū)栽培芋病毒病的田間調(diào)查及其病原的分子檢測

        施世明,洪霓

        (華中農(nóng)業(yè)大學植物科學技術學院,湖北武漢,430070)

        對湖北及山東地區(qū)種植的芋調(diào)查發(fā)現(xiàn),田間芋病毒病發(fā)生普遍,癥狀表現(xiàn)主要有花葉、羽狀斑駁、畸形皺縮、褪綠斑點等。2010年9月30日對武漢蔬菜科學研究所國家種質(zhì)武漢水生蔬菜資源圃種植的芋進行調(diào)查發(fā)現(xiàn),以上4種癥狀的田間顯癥率分別為26.92%,16.67%,28.21%和3.85%,田間調(diào)查時未發(fā)現(xiàn)蚜蟲等媒介昆蟲。對不同來源的芋葉片樣品進行芋花葉病毒(Dasheen mosaic virus,DsMV)的RT-PCR檢測,各癥狀田間檢出率為21.1%~42.9%。

        芋;病毒病;芋花葉病毒;田間調(diào)查;分子檢測

        芋[Colocasia esculenta(L.)Schott]又名芋頭、芋艿、毛芋等,為天南星科(Araceae)芋屬(Colocasia)多年生宿根草本植物,原產(chǎn)于中國、印度和馬來半島等熱帶沼澤地區(qū),現(xiàn)已在世界各國廣泛種植。芋是一種具有地域特色的水生蔬菜,主要以其膨大的肉質(zhì)球莖供食用,有些種類的葉柄和花梗也可作蔬菜食用。芋屬典型的無性繁殖作物,多采用球莖繁殖,在其長期的無性繁殖過程中,植株中病毒數(shù)量不斷積累、種類不斷增加,導致病毒病為害逐年加重,且品種退化嚴重,造成芋產(chǎn)量和品質(zhì)下降。隨著我國芋種植面積逐步增大,芋病毒病在我國栽培芋上發(fā)生越來越普遍[1],因此防治芋病毒病已引起人們的高度重視。前期研究表明,侵染芋植株的病毒達8種之多[2~6],國內(nèi)報道的有芋花葉病毒(DsMV)和黃瓜花葉病毒(CMV)2種,其中DsMV分布最廣,為害最大[6]。本研究主要對湖北及山東種植芋的病毒病進行了相關田間調(diào)查,并對其主要病原病毒DsMV進行了RT-PCR檢測,以期為生產(chǎn)實踐提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 芋病毒病田間調(diào)查

        2010年4~11月對湖北武漢華中農(nóng)業(yè)大學周邊、蔡甸馬家渡、蔡甸索河鎮(zhèn)、武漢蔬菜科學研究所、仙桃、山東臨沂等地種植的水芋及旱芋進行了田間調(diào)查并采集病樣,選取武漢蔬菜科學研究所國家種質(zhì)武漢水生蔬菜資源圃所種植的芋進行病毒病癥狀調(diào)查,記錄不同癥狀顯癥株數(shù)并計算發(fā)生頻率。

        1.2 芋花葉病毒的RT-PCR檢測

        ①樣品來源 從湖北及山東收集芋葉片樣品共81份,其中多數(shù)樣品植株的葉片表現(xiàn)花葉或羽狀斑駁等癥狀。

        ②所用引物 用于該病毒檢測的引物為DsMV-1/DsMV-2:5'-GGGCTTGGGTGATGATGGA-3'/5'-GCCTTTCAGTGTTCTCGCTTG-3',根據(jù)陳集雙[7]的報道合成序列,其擴增片段為357 bp,擴增區(qū)域為cp基因中間部分核心序列;所用引物由上海生工生物技術有限公司合成。

        ③總RNA提取 取待檢材料嫩葉0.1 g,加液氮研磨成粉狀,快速轉(zhuǎn)入1.5 mL離心管中,加入1 mL RNA提取緩沖液 (含50%異硫氰酸胍、5 mol/L苯酚等),劇烈混勻,室溫靜置5 min后離心,上清液經(jīng)氯仿抽提2次后,加入2/3體積的異丙醇沉淀核酸,沉淀物經(jīng)75%乙醇洗滌2次,風干后,溶于30 μL DEPC處理水中,-20℃保存。

        ④RT-PCR 以提取的總RNA為模板,合成cDNA第1鏈,反應體系為20 μL,含5×反轉(zhuǎn)錄沖液4 μL、dNTPs(5 μmol/μL)1 μL、Rnasin(40 U/μL)0.5 μL、M-MLV(200 U/μL)0.5 μL、隨機引物(100 pmol/μL)1 μL、RNA模板3 μL和DEPC處理水10 μL。PCR反應總體系為25 μL,含10×PCR buffer 2.5 μL、dNTPs(5 μmol/μL)0.5 μL、Taq DNA聚合酶 (5 U/μL)0.2 μL、正反向引物各0.5 μL(10μmol/μL)、cDNA2μL和滅菌的去離子水18.8 μL。擴增條件為:94℃變性3 min;然后94℃30 s,56℃30 s,72℃30 s,35個循環(huán);72℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物在1%瓊脂糖凝膠上電泳后在溴化乙錠中染色10 min,最后凝膠成像、觀察結(jié)果。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 芋病毒病田間調(diào)查結(jié)果

        調(diào)查發(fā)現(xiàn)田間芋病毒病發(fā)生普遍,發(fā)病重的田塊田間病毒病顯癥率達50%以上。芋從苗期(4月)到收獲期 (11月)的整個生長期內(nèi)均表現(xiàn)出病毒病癥狀,其中在生長盛期(6~8月)癥狀表現(xiàn)最為明顯。癥狀表現(xiàn)主要有花葉、羽狀斑駁、畸形皺縮、矮化、黃化、褪綠斑點等(圖1),其中水芋表現(xiàn)以花葉為主,旱芋病癥則表現(xiàn)多樣。2010年9月30日調(diào)查武漢市蔬菜科學研究所國家種質(zhì)武漢水生蔬菜資源圃種植的旱芋病毒病癥狀統(tǒng)計情況見表1。田間調(diào)查時未發(fā)現(xiàn)蚜蟲等為害芋的媒介昆蟲。

        圖1 芋病毒病田間癥狀

        表1 武漢蔬菜科學研究所國家水生蔬菜資源圃的芋病毒病癥狀田間調(diào)查統(tǒng)計結(jié)果

        2.2 DsMV的RT-PCR檢測結(jié)果

        對來自湖北的79份芋葉片樣品進行了DsMV的RT-PCR檢測,部分樣品中檢測到357 bp的目標片段(圖2),對目標片段進行回收、克隆、測序,序列比對確定其為DsMV。檢測結(jié)果顯示,湖北不同地區(qū)樣品的DsMV檢出率為21.1%~42.9%,其中來自湖北蔡甸2個種植園的17份樣品的DsMV檢出率相對較高,為30.0%~42.9%;來自山東臨沂的3份隨機收集樣品中未檢測到該病毒,所有樣品總檢出率為24.7%(表2)。

        3 小結(jié)與討論

        調(diào)查中發(fā)現(xiàn),芋病毒病從北到南發(fā)生逐步加重,水芋比旱芋發(fā)病重,可能與氣候、品種的抗性、栽培方式、生長環(huán)境等有關。北方以旱芋種植為主,因氣候寒冷干燥,不利于病毒的增殖,故病毒病為害發(fā)生較輕;因水芋產(chǎn)量較旱芋高,南方以水芋種植為主,南方氣候溫暖濕潤,利于病毒的增殖和傳播,加上水芋栽培中傳統(tǒng)的大水大肥的管理模式導致水芋病毒病發(fā)生嚴重。

        圖2 部分芋葉片DsMV RT-PCR產(chǎn)物凝膠電泳結(jié)果(M:Marker II;1~8:待檢樣品;9:空白對照)

        表2 不同來源芋的DsMV RT-PCR檢測結(jié)果

        本研究中,與芋植株病毒病顯癥率相比,DsMV的檢出率明顯偏低,且低于前人的報道[6],而且DsMV的檢出結(jié)果和樣品顯癥情況無明顯相關性,有些顯癥明顯的樣品未檢出DsMV,而有些檢出DsMV的樣品無明顯病毒病癥狀,這與前人研究結(jié)果一致[8]。造成此結(jié)果的原因可能有以下幾種:芋病毒病原存在著混合侵染現(xiàn)象,造成芋病毒病癥狀的病原可能有多種,而本研究只檢測了分布最廣、為害最大的DsMV,其他表現(xiàn)病毒病癥狀但未檢出DsMV的樣品可能是其他病原侵染所致。而且據(jù)前人報道[9],DsMV也存在著較高的分子多樣性,可能存在著多種株系,而本研究所用的RT-PCR技術較高的特異性可能也導致了DsMV較低的檢出率。另外,DsMV侵染芋植株的顯癥機理尚不清楚,有待進一步研究。

        [1]Zettler F W,Tsai J H,Faan H C,et al.Dasheen mosaic virus infecting taro in People's Republic of China[J].Plant Disease,1987,71(9):837-839.

        [2]Zettler F W,Hartman R D.Dasheen somaic virus as a pathogen of cultivated aroids and control of the virus by tissue culture[J].Plant Disease,1987,71(11):958-963.

        [3]Ram R D,Summanwar A S.Colocasia esculenta(L.)Schoot a reservoir of bunchy top disease of banana[J].Current Sci, 1984,53(3):145-146.

        [4]Revill P A,Trinh X,Dale J,et al.Taro vein chlorosis virus: characterization and variability of a new nucleorhabdovirus [J].Journal of General Virology,2005,86:491-499.

        [5]Revill P A,Jackson G V H,Hafner G J,et al.Incidence and distribution of viruses of Taro (Colocasia esculenta)in Pacific island countries[J].Australasian Plant Pathology, 2005,34:327-331.

        [6]李永偉.天南星科植物病毒研究[D].杭州:浙江大學,2002.

        [7]陳集雙.天南星科植物病毒的分子診斷和半夏研究[M].杭州:浙江大學出版社,2006.

        [8]陳集雙,李德堡.我國13種天南星科作物上的芋花葉病毒[J].微生物學報,1996,36(2):126-131.

        [9]Pappu S S,Pappu H R,Rybicki E P,et al.Unusual aminoterminal sequence repeat characterizes the capsid protein of dasheen mosaic potyvirus[J].Journal of General Virology, 1994,75:239-242.

        Field Investigation of Viral Disease and Molecular Detection of Pathogenic Virus on Cultivated Taro[Colocasia esculenta(L.)Schott]in Hubei and Shangdong

        SHI Shiming,HONG Ni
        (College of Plant Science and Technology,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070)

        Field investigation of cultivated taro [Colocasia esculenta(L.)Schott]in Hubei province were carried out.The results showed that taro viral diseases were happened widespread,with the main symptoms of mottle-leaf,pinnate mottle, deformity shrinks and chlorotic spots.The rates of 4 symptoms occurring were 26.92%,16.67%,28.21%and 3.85%when the investigation conducted in the National Aquatic Vegetables Resources Nursery of Wuhan Vegetables Research Institute on the September 30th,2010.No insect vectors such as aphid were found in the investigation.RT-PCR was implemented to detect DsMV of taro from Hubei.The results showed that the rates of 4 symptoms occurring ranged from 21.1% -42.9%.

        Colocasia esculenta;Viral diseases;Field investigation;Dasheen mosaic virus;Molecular detection

        10.3865/j.issn.1001-3547.2011.16.028

        公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(200903017-08)施世明(1986-),男,碩士,研究方向為植物病毒學

        洪霓,教授,通信作者,研究方向為植物病毒學,電話:027-87283278,E-mail:whni@mail.hzau.edu.cn

        2011-07-10

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