緱敬軒, 董文賓, 曾 橋
(1.浙江溫州輕工研究院, 浙江 溫州 325003;2.陜西科技大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院, 陜西 西安 710021)
幾丁質(zhì)(Chitin)又稱甲殼素、甲殼質(zhì), 是以β-1,4-N-乙酰-D-氨基葡萄糖為基本單位的直鏈多聚物.幾丁質(zhì)廣泛存在于甲殼綱動物蝦、蟹的甲殼,昆蟲的甲殼,真菌(酵母, 霉菌)的細(xì)胞壁中,是地球上蘊藏最豐富的有機物之一,在蝦蟹殼中的含量高達(dá)15%~30%[1].
幾丁質(zhì)的降解產(chǎn)物幾丁寡糖、殼聚糖和N-乙酰氨基葡萄糖具有抗癌、抗菌、調(diào)節(jié)免疫和植物生長等作用,在醫(yī)藥、農(nóng)業(yè)和食品工業(yè)等方面具有廣闊的應(yīng)用前景和經(jīng)濟價值[2].目前這些產(chǎn)品主要用化學(xué)降解的方法來制取,造成比較嚴(yán)重的環(huán)境污染.酶降解法具有條件溫和、得率高且不污染環(huán)境等優(yōu)點[3],目前所篩選的產(chǎn)幾丁質(zhì)酶菌株產(chǎn)酶量低,且酶活不穩(wěn)定,這是微生物產(chǎn)幾丁質(zhì)酶應(yīng)用中所面臨的主要問題.篩選產(chǎn)酶量高的菌株,尋找合適的發(fā)酵工藝,是微生物產(chǎn)幾丁質(zhì)酶研究的當(dāng)務(wù)之急.由于沿海地區(qū)每年生產(chǎn)大量的蝦蟹,因此目前篩選用的樣品主要采自沿海地帶[2,4,5],而從內(nèi)陸淡水環(huán)境中采集樣品并篩選降解蝦蟹殼中幾丁質(zhì)的菌株則不多見.本研究從秦嶺山脈中有蝦蟹分布的河流采集土壤,從中篩選到產(chǎn)幾丁質(zhì)酶的高產(chǎn)菌株并對其進行了初步鑒定.
土壤樣品采自源于秦嶺的灃河、漢江等河道周圍.
富集培養(yǎng)基(g/L):蟹殼粉30.0,NH4NO35.0,土壤浸提液500 mL,自然pH.
分離和篩選培養(yǎng)基(g/L):瓊脂粉14~20,KH2PO40.3,K2HPO40.7,F(xiàn)eSO4·2H2O 0.01,MgSO4·7H2O 0.5,ZnSO40.001,膠體幾丁質(zhì)2,酵母膏2,pH7.0.
菌種保藏培養(yǎng)基:牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基[6].
種子和液體發(fā)酵培養(yǎng)基分別是不含瓊脂的分離和篩選培養(yǎng)基.
膠體幾丁質(zhì)的配制參考文獻(xiàn)[7]的方法并略作修改:稱20 g幾丁質(zhì)加入200 mL濃鹽酸,在40 ℃攪拌3 min,使之溶解.溶液中加入2 L 5 ℃的冷水,幾丁質(zhì)就作為膠體懸浮液沉淀下來.用粗濾紙過濾,過濾后的膠體沉淀用蒸餾水洗滌至中性.
參照宋宏新等的配方配制[8].
1.5.1 富集培養(yǎng)
稱取1 g土壤樣品放入100 mL的富集培養(yǎng)基中,于27 ℃、150 r/min振蕩培養(yǎng)3 d.
1.5.2 分離和初步篩選
將富集培養(yǎng)液經(jīng)梯度稀釋后,涂布于分離培養(yǎng)基上,27 ℃恒溫培養(yǎng)3~5 d,挑出透明圈相對較大的菌株,經(jīng)多次劃線純化并鏡檢為純培養(yǎng)物后于4 ℃斜面保存.根據(jù)培養(yǎng)3 d后菌株透明圈和菌落直徑大小的比值,挑選出酶活力大的菌株進行復(fù)篩選.
1.5.3 復(fù)篩選
初篩選得到的菌株在種子培養(yǎng)基培養(yǎng)24 h后以3%接種量加入到發(fā)酵培養(yǎng)基中,于27 ℃、150 r/min振蕩培養(yǎng)3 d.將發(fā)酵液離心后取上清液,通過DNS法測定酶活進行復(fù)篩選.
1.5.4 酶活測定方法
參照Antonio的方法[9]:取0.5 mL上清液與0.5 mL 1%膠體幾丁質(zhì)混合,于37 ℃恒溫30 min,放入沸水浴5 min,立即冷卻,并用DNS法[8]測定還原糖.相同方法制作N-乙酰氨基葡萄糖(NAG)的標(biāo)準(zhǔn)曲線.酶活力單位定義為:在上述反應(yīng)條件下,每分鐘釋放相當(dāng)于1μmol NAG所需酶量為1個酶活力單位(U).
1.5.5 菌株的鑒定
形態(tài)學(xué)研究:菌株活化后接種分離培養(yǎng)基,于27 ℃恒溫培養(yǎng)2 d后觀察菌落形態(tài);革蘭氏染色后于普通光學(xué)顯微鏡下觀察菌體的細(xì)胞形態(tài).
16S rDNA序列分析:細(xì)菌總DNA的提取使用通用基因組小量抽提試劑盒SK1252(上海生工).PCR擴增采用16S rDNA通用引物[10]27f和1495r.反應(yīng)體系(50μL)為:Buffer 1× ; Mg2+2 mmol/L ; dNTP 各0.2 mmo l/L ;引物各1μmol/L;DNA聚合酶2U;模板20μg/mL .擴增程序:95 ℃、3 min 變性后于 95 ℃、1 min; 54 ℃、40 s; 72 ℃、1 min進行30 個循環(huán),最后于72 ℃維持10 min .PCR產(chǎn)物由上海生工進行純化和測序.將所得序列提交GenBank數(shù)據(jù)庫并進行BLAST分析比對.
富集以后的菌懸液在分離培養(yǎng)基中形成的產(chǎn)透明圈的菌落占總菌落的比例顯著高于未經(jīng)富集培養(yǎng)的土壤菌懸液,證明富集培養(yǎng)可以有效地增加產(chǎn)幾丁質(zhì)酶菌株的數(shù)量,從而提高有效菌株的可能性.
表1 初篩選菌株的酶活力比較
R=透明圈直徑/菌落直徑.
根據(jù)篩選分離培養(yǎng)基上透明圈的有無及大小,共分離到200個產(chǎn)透明圈的菌株,經(jīng)多次劃線分離純化后接種斜面保存.這些菌株絕大多數(shù)為細(xì)菌,只有4個為放線菌.通過比較透明圈直徑(D)與菌落直徑(d)的比值R(見表1),共選出R值較大的5個菌株進行進一步的篩選,其中D23透明圈最大(見圖1),培養(yǎng)48 h其R值就達(dá)到9.
圖1 D23在篩選培養(yǎng)基中的生長情況(由于菌落周圍的幾丁質(zhì)被降解,形成透明區(qū)域,培養(yǎng)基局部含有幾丁質(zhì),因此為非透明區(qū)域)
對初篩選得到的5株細(xì)菌進行發(fā)酵并用DNS法測定發(fā)酵液的酶活力.測定結(jié)果(見表1)同初篩選相比,各菌株的酶活力大小順序是一致的.菌株D23的酶活最大,達(dá)到了0.75 U/mL,超過了目前國際工業(yè)化幾丁質(zhì)酶產(chǎn)生菌粘質(zhì)沙雷氏菌的原始出發(fā)菌株[5].
目前的文獻(xiàn)報道有若干菌株在最優(yōu)條件下得到的發(fā)酵液其酶活力比D23的酶活力略高[11,12],但是考慮到以下兩個原因:第一,復(fù)篩選過程中,D23的發(fā)酵條件并未優(yōu)化,若采用最佳發(fā)酵條件,推測其發(fā)酵液的酶活會更高;第二,同已經(jīng)報道的菌株相比,D23的透明圈與菌落直徑比值明顯大一些,預(yù)計在進一步研究的基礎(chǔ)上,通過優(yōu)化產(chǎn)酶的發(fā)酵條件及酶反應(yīng)條件,酶的產(chǎn)量和酶活會有更大的提高,D23具有潛在的較高工業(yè)應(yīng)用價值.
圖2 菌株D23的形態(tài)學(xué)特征(1 000×)
圖3 菌株D23的16S rDNA的PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果
2.3.1 菌株的形態(tài)觀察
菌株D23的菌落近似圓形,邊緣不整齊,扁平,表面有皺褶不光滑,在液體培養(yǎng)基中生長時形成菌膜.革蘭氏染色后在光學(xué)顯微鏡下觀察為革蘭氏陽性桿菌,其大小為3.52×1.23 μm左右(見圖2).
2.3.2 16S rDNA序列分析
利用16S rDNA通用引物對D23進行PCR擴增,擴增產(chǎn)物電泳結(jié)果如圖3所示,表明擴增產(chǎn)物接近1 500 bp.對PCR產(chǎn)物進行測序,結(jié)果得到D23 16S rDNA的序列片段為1 414 bp. 將所得序列輸入GenBank中用Megablast進行同源性分析,發(fā)現(xiàn)相似性較高的16S rDNA序列均來自芽孢桿菌屬,其中同幾個已知的蘇云金芽孢桿菌(Bacillusthuringiensis)和蠟樣芽孢桿菌(Bacilluscereus)16S rDNA序列相似性達(dá)到99%以上.綜合形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)分析,推斷該菌屬于芽孢桿菌屬的一個種(Bacillussp).
本研究采用透明圈法和DNS法測發(fā)酵液酶活相結(jié)合的辦法,從土壤樣品中篩選到一株產(chǎn)酶能力強,具有較高的潛在工業(yè)應(yīng)用價值的菌株D23.通過形態(tài)觀察以及16S rDNA序列分析,確定該菌株屬于芽孢桿菌屬.
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