陶永清,劉崇基,李健嬌,徐新,王津晗,韓娜,張磊,趙輝,阮海華,王昌祿
沙門菌是嚴重威脅人類健康的主要食源性致病菌之一。據(jù)統(tǒng)計,在世界各國的細菌性食物中毒中,沙門菌引起的食物中毒常列榜首[1],我國內(nèi)陸地區(qū)也以沙門菌導致的食物中毒為首位[2]。
SopB 是沙門菌主要致病性蛋白成分,是由沙門菌 SPI-1 III 型分泌系統(tǒng)分泌的一種由 561 個氨基酸構(gòu)成的蛋白質(zhì)分子,具有肌醇磷脂酶(phosphoinositide phosphatase)活性[3]。SopB 在沙門菌感染過程中發(fā)揮著不同的重要功能[4-8]。細胞蛋白激酶 MAPK,包括 Erk1/2(extracellular signalregulated kinases 1 and 2)、p38(P38 mitogenactivated protein kinases)和 JNK(c-Jun N-terminal kinases),其對沙門菌感染均具有重要的調(diào)節(jié)作用,因此,研究 SopB 對細胞蛋白激酶 MAPK 信號的影響非常必要。本文采用基因克隆的方法將沙門菌SopB 基因克隆至質(zhì)粒載體上,檢測 SopB 在細胞中的過量表達對細胞蛋白激酶 MAPK 磷酸化水平的調(diào)節(jié)作用,為 SopB 的功能研究提供更多的信息。
1.1.1 供試菌株、宿主菌和質(zhì)粒載體 鼠傷寒沙門菌 Salmonella Typhimurium LT2、大腸桿菌E. coli Trans 10 宿主菌由本實驗室保存;表達用質(zhì)粒 pCS2-EGFP 由本實驗改造,該質(zhì)粒由 pCS2 改造而來,將綠色熒光蛋白(GFP)的基因克隆至質(zhì)粒表達框的 N 端,并在 pCS2 質(zhì)粒的多克隆位點(MCS)上加入 FseI 和 AscI 兩個酶切位點。
1.1.2 酶和試劑 質(zhì)粒 DNA 提取試劑盒和膠回收試劑盒為英國 Omega 公司產(chǎn)品;Vent DNA polymeras 和限制性內(nèi)切酶 FseI 和 AscI 購自美國 NEB 公司;細菌基因組提取試劑盒購自北京天根公司;T4 DNA 連接酶購自美國 Promega 公司;PVDF 膜購自德國 Milipore 公司;兔抗、Tubulin單抗購自美國 Cell Signaling 公司;其他試劑為國產(chǎn)分析純試劑。
1.2.1 引物設(shè)計與合成 根據(jù) GenBank 上已登錄的鼠傷寒沙門菌 Salmonella Typhimurium LT2基因組的全序列(NC_003197)查找到 SopB 基因序列(NP_460064.1)。利用 Primer 5.0 軟件設(shè)計引物,以擴增 SopB 基因的全序列。根據(jù) SopB 基因全序列設(shè)計相應的引物,以擴增 SopB 基因的Δ29、Δ46 以及 Δ112 的各種基因片段。引物由上海生工生物技術(shù)有限公司合成,引物序列見表 1。1.2.2 重組質(zhì)粒 pCS2-EGFP-SopB 以及各種truncation 的構(gòu)建 將沙門菌 LT2 接種于普通LB 液體培養(yǎng)基中,37 ℃ 培養(yǎng) 18 h。取 1 ml 菌液提取基因組 DNA,具體操作參照試劑盒推薦的方法,提取的基因組 DNA 經(jīng) 0.8% 瓊脂糖凝膠電泳檢測,–20 ℃ 保存?zhèn)溆谩?/p>
表 1 SopB 以及各種 SopB 基因片段的擴增與載體構(gòu)建所用的引物Table 1 Primers for cloning of SopB and its several derives of truncations
以該基因組 DNA 作為模板,利用 P1-FseI 和P2-AscI 引物進行 PCR 擴增。反應條件為:94 ℃6 min;94 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 2 min,30 個循環(huán);72 ℃ 10 min。瓊脂糖凝膠電泳檢測 PCR 產(chǎn)物?;厥占兓?PCR 產(chǎn)物,用限制性內(nèi)切酶 FseI 和AscI 進行雙酶切并純化。同時將質(zhì)粒 pCS2-EGFP也經(jīng)同樣雙酶切和純化。其中,pCS2-EGFP 是本實驗室改造的載體,該載體能夠在細胞中高效表達N 端帶有綠色熒光蛋白(GFP)的融合蛋白。把pCS2-EGFP 與目的片段的酶切純化產(chǎn)物用 T4 連接酶體系連接,轉(zhuǎn)化 Trans 10 大腸桿菌感受態(tài)細胞,涂布于含 Ampr的 LB 平板上,37 ℃ 培養(yǎng)12 ~ 16 h。挑取單個菌落接種于含 Ampr的 LB 液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min 振蕩過夜,酶切鑒定,測序確認插入正確。
對 SopB 各種 truncation 的構(gòu)建分別采用 P3與 P2、P4 與 P2、P5 與 P2 引物對進行 PCR 擴增并將其 PCR 產(chǎn)物酶切,連接至 pCS2-EGFP 質(zhì)粒上構(gòu)建重組質(zhì)粒,測序確認插入正確。
1.2.3 定點突變體的構(gòu)建 SopB C460S 突變體的構(gòu)建采用的是 Site-directed Mutagenesis Kit 的方法,如表 1 所示,設(shè)計一對互補的引物 P460F和 P460R,其中的 SopB 第 460 位 Cys 被突變?yōu)?Ser。PCR 反應條件為 94 ℃ 6 min;94 ℃ 30 s,62 ℃ 30 s,72 ℃ 10 min,16 個循環(huán);72 ℃ 15 min。取 20 μl PCR 產(chǎn)物利用 DpnI 酶切 1 h,將酶切后產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到大腸桿菌 Trans 10 感受態(tài)細胞,37 ℃培養(yǎng) 12 ~ 16 h。挑取單個菌落接種于含 Ampr的LB 液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min 振蕩過夜,測序確認基因突變。
1.2.4 利用磷酸鈣法將重組質(zhì)粒 pCS2-EGFPSopB 轉(zhuǎn)染 HeLa 細胞 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染 HeLa 細胞采用的是 VigoFect(威格拉斯)試劑,取 5 μg DNA,加入稀釋液中至總體積為 100 μl,輕輕混勻,室溫放置。取 VigoFect 2 μl 加入稀釋液中至總體積為 100 μl,輕輕混勻,室溫放置 5 min。將稀釋的 VigoFect 逐滴加入稀釋的 DNA 溶液中,輕輕混勻,所得的轉(zhuǎn)染工作液在室溫放置 15 min。將轉(zhuǎn)染工作液輕輕混勻,逐滴加入 2 ml 培養(yǎng)液中,輕輕混勻培養(yǎng)液,置 37 ℃,5% CO2培養(yǎng) 24 h 后收集細胞。
1.2.5 Western blot 蛋白表達的檢測采用 western blot 的方法。將收集的細胞進行 SDS-PAGE 電泳,轉(zhuǎn)膜,利用相應的一抗和二抗進行雜交,洗膜,通過辣根過氧化物酶作為底物進行化學發(fā)光,X 光片壓片,洗片。
圖 1 融合蛋白 GFP-SopB 及其 truncation 在 HeLa 細胞中的表達分析Figure 1 Expression of the recombinant protein GFP-SopB and its truncation derivates in HeLa cells
由于 SopB 的重組質(zhì)粒表達的是 GFP-SopB融合蛋白,因此,首先利用 GFP 蛋白作為標簽檢測了 SopB 及其各種 truncation 在 HeLa 細胞中的表達情況,結(jié)果如圖 1 所示,SopB 全長蛋白及其各種 truncation 均表達,而且其表達量隨著SopB 蛋白的截短而逐漸提高,這可能與 SopB 轉(zhuǎn)染引起的細胞死亡有關(guān),當 SopB 蛋白的 N 端的112個氨基酸被去掉后,SopB 不再引起細胞死亡,SopB Δ112 的表達量會顯著增加(結(jié)果未列)。2009年,Cell 雜志發(fā)表了SopB蛋白在沙門菌感染宿主細胞的過程中發(fā)生泛素化修飾的結(jié)果,這是 SopB的重要特征[7]。本研究結(jié)果也發(fā)現(xiàn),當 SopB 蛋白在 HeLa 細胞中過量表達時有部分蛋白能夠明顯發(fā)生泛素化修飾,當 SopB 的 N 端 29 以及 46 個氨基酸分別被截取后不影響 SopB的泛素化,當其N 端 112 個氨基酸被截取后,SopB 不再發(fā)生泛素化修飾,這與 Cell 雜志報道結(jié)果相一致,即 SopB發(fā)生泛素化修飾的位點為其 N 端 112 個氨基酸區(qū)域內(nèi)的賴氨酸。與細菌感染實驗不同,將 SopB蛋白在 HeLa 細胞中過量表達僅檢測到 SopB 的單泛素化修飾,而未能檢測到在沙門菌感染實驗中的 SopB 的多泛素化修飾,這可能由于感染過程中有多種因子,包括 LPS、Effector、CpG,DNA 等的參與有關(guān),所以在沙門菌感染過程中可能存在其他的因素促進 SopB 的多泛素化修飾。
由于在沙門菌感染上皮細胞的過程中,LPS、效應分子中的 SopE/SopE2 以及 SpvC 均被發(fā)現(xiàn)對上皮細胞蛋白激酶 MAPK,包括 Erk1/2,p38 和JNK 具有調(diào)節(jié)作用。為研究 SopB 對上皮細胞蛋白激酶 MAPK 的調(diào)節(jié)作用,將 SopB 在細胞中進行表達并檢測細胞蛋白激酶 MAPK 的磷酸化水平。如圖 2 所示,SopB 轉(zhuǎn)染與否對 HeLa 細胞蛋白激酶 Erk1/2、p38 和 JNK 的水平影響不大。但與轉(zhuǎn)染空載體的對照相比,SopB 的表達顯著激活了 pErk1/2、p-p38 以及 pJNK 的磷酸化水平,而當 SopB 肌醇磷脂酶活性關(guān)鍵氨基酸 C460 的突變則不能夠誘導 pErk1/2、p-p38 以及 pJNK 的磷酸化。表明,SopB 對 HeLa 細胞蛋白激酶pErk1/2、p-p38 以及 pJNK 的磷酸化的激活與其肌醇磷脂酶活性直接相關(guān)。
圖 2 SopB 激活 HeLa 細胞 pErk、p-p38 以及 pJNK 的表達Figure 2 SopB activates the level of pErk、p-p38 and pJNK in HeLa cells
為進一步研究 SopB 上與誘導 HeLa 細胞MAPK 蛋白激酶 Erk1/2,p38 和 JNK 激活有關(guān)的結(jié)構(gòu)域,我們通過 PCR 的方法構(gòu)建了 SopB N端分別缺失 29 個、46 個以及 112 個氨基酸的truncation,并將各種 truncation 轉(zhuǎn)染 HeLa 細胞。結(jié)果如圖 3 所示,當 SopB 的 N 端缺失掉 29 個氨基酸后,SopB 不再激活 HeLa 細胞蛋白激酶MAPK 的磷酸化,表明 SopB N 端 29 個氨基酸與 Erk1/2,p38 和 JNK 的磷酸化激活有關(guān),但是到目前為止,SopB 通過何種機制激活 HeLa 細胞蛋白激酶以及其 N 端 29 個氨基酸在此機制中通過何種方式起作用仍有待于進一步研究。
圖 3 SopB 及其相應 truncation 激活 HeLa 細胞 pErk、p-p38 以及 pJNK 的情況Figure 3 The phosphorylation of pErk、p-p38 and pJNK in HeLa cells induced by SopB and its derivates
SopB 是由沙門菌 SPI-1 III 型分泌系統(tǒng)分泌的一種由 561 個氨基酸構(gòu)成的蛋白質(zhì)分子, 是一種肌醇磷脂酶。目前的研究發(fā)現(xiàn),不同類型的沙門菌基因組間存在不同差異,其致病機制也有差異。但在引起人類疾病的五大類沙門菌中,除鴨沙門菌基因組未測序以外,SopB 廣泛存在于其他幾種能夠?qū)θ祟惔嬖谇秩拘缘牟煌愋偷纳抽T菌中,足見其功能的重要性[6]。
目前已有的研究結(jié)果表明,SopB 的 N 端在SopB 誘導的信號轉(zhuǎn)導途徑中可能發(fā)揮重要的作用,其 N 端是 SopB 發(fā)生泛素化修飾的重要位點,SopB 的泛素化與其在細胞內(nèi)的定位和功能直接相關(guān)[7]。因此,為了進一步研究與 SopB 誘導HeLa 細胞 MAPK 蛋白激酶 Erk1/2,p38 和 JNK激活有關(guān)的結(jié)構(gòu)域,通過 PCR 的方法構(gòu)建了SopB N 端分別缺失 29 個、46 個以及 112 個氨基酸的 truncation,并將各種 truncation 轉(zhuǎn)染 HeLa細胞。結(jié)果如前所示,當 SopB 的 N 端缺失掉 29個氨基酸后,SopB 不再激活 HeLa 細胞蛋白激酶MAPK 的磷酸化,表明 SopB N 端 29 個氨基酸與 Erk1/2,p38 和 JNK 的磷酸化激活有關(guān),但是到目前為止,SopB 通過何種機制激活 HeLa 細胞蛋白激酶以及其 N 端 29 個氨基酸在此機制中通過何種方式起作用仍不清楚。目前的研究表明,SopE、SopE2 和 SopB 通過不同的機制刺激 Rho-家族 GTP 酶信號,其中 SopE 和 SopE2 是Rac1、Cdc42 和 RhoG 交互作用因子,而 SopB 則是通過其磷脂酰肌醇磷酸酶活性刺激 RhoG 的交互作用蛋白 SGEF 來激活 RhoG[8],但是目前SopB 通過何種機制激活 Cdc42 尚不清楚。而Cdc42 對于細菌進入細胞雖然可有可無,但是它能夠有效地激活 MAPKs 信號。那么,SopB 激活宿主細胞的 MAPKs 是否與 Cdc42 的激活有關(guān)將是我們今后研究的一個靶點。
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