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        副溶血弧菌中具有Mg2+轉(zhuǎn)運功能的MgtE基因的分子克隆與功能鑒定

        2010-09-04 02:59:38李來梅
        湖南農(nóng)業(yè)科學(xué) 2010年17期
        關(guān)鍵詞:相似性家族離子

        李來梅 ,于 峰 ,2 ,靳 磊

        (1.湖南省微生物研究所,湖南 長沙 410009;2.湖南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,湖南 長沙 410081)

        Mg2+具有獨特的幾何特性和化學(xué)特性,研究人員推測其轉(zhuǎn)運系統(tǒng)也具有獨特性[1]。目前,整個生物界中已發(fā)現(xiàn)有五大Mg2+轉(zhuǎn)運家族:CorA家族,Mg2+/H+交換體,離子通道,P型磷酸酶和MgtE基因家族[2]。主要的Mg2+轉(zhuǎn)運家族是細(xì)菌中的CorA家族,蛋白拓?fù)浞治鲲@示其具有獨特結(jié)構(gòu):N端有一個酸性的周質(zhì)區(qū),C端有2個疏水的跨膜區(qū),有很強(qiáng)的螺旋性。CorA序列上存在保守基序GMN,是其轉(zhuǎn)運Mg2+所必需的,若GMN基序中有一個氨基酸突變,其轉(zhuǎn)運能力就會喪失[3]。

        MgtE基因家族首先在Bacillus firmus OF4中被Ronald等人在尋找新的CorA基因時發(fā)現(xiàn)。目前一般認(rèn)為其具有五個跨膜區(qū)。其跨膜區(qū)的分布和CorA具相似性,都主要分布于C端,其N端位于胞質(zhì)區(qū)。MgtE和CorA兩基因家族在轉(zhuǎn)運離子的類別上也具有部分相似性。MgtE的突變株和CorA一樣可增強(qiáng)對Co2+的抗性。MgtE可功能互補(bǔ)缺失CorA,MgtA,MgtB Mg2+轉(zhuǎn)運系統(tǒng)的沙門氏桿菌突變株MM281,使其可在低濃度 Mg2+濃度(<10 mM)下生長。同時MgtE 也具有Co2+,Cd2+,Mn2+等二價金屬離子的轉(zhuǎn)運能力。多序列比對表明其第二和第五個跨膜區(qū)較保守。基因組序列搜索顯示MgtE家族在古細(xì)菌,原核生物和真核生物中都有分布,但其分布的廣泛性不如CorA家族。目前對MgtE基因家族轉(zhuǎn)運Mg2+的分子機(jī)制還了解甚少。為了更進(jìn)一步了解MgtE基因家族轉(zhuǎn)運Mg2+的分子機(jī)制,筆者從副溶血弧菌中克隆了其MgtE基因,將之稱為VP-MgtE,并對其進(jìn)行了功能鑒定和定點突變等實驗。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        1.1.1 供試菌株 E.coli DH5α 在37℃,LB培養(yǎng)基中生長,必要時添加相應(yīng)抗生素。副溶血弧菌于37℃,LB中培養(yǎng)。S.typhimurium MM281需要高濃度Mg2+才可以生長,它被用于功能互補(bǔ)實驗,于37℃,Mg2+(以MgSO4的形式添加)終濃度為100 mM,氯霉素濃度為34μg/mL的LB或N-minimal培養(yǎng)基中生長。

        1.1.2 試 劑 2pMD18-T載體和所有酶類均購自大連寶生物工程有限公司。質(zhì)粒純化及膠回收試劑盒購自長沙安比奧生物技術(shù)公司。pTrc-99A由本室保存。

        1.2 方法

        1.2.1 VP-MgtE基因的克隆及載體構(gòu)建 VP基因組DNA按照Flamm[4]的方法提取。根據(jù)VP-MgtE基因序列用Primer Premier5.0設(shè)計一對引物,并添加酶切位點SacⅠ和KpnⅠ。正向引物為[TATGAGCTCGAACGAATGGCAG(SacⅠ)]反向引物為[ATAGGTACCACTGGCTTAGATCAGC(KpnⅠ)]。用高保真酶Pyrobest DNA polymerase進(jìn)行PCR擴(kuò)增?;厥漳康钠?,連接到pMD18-T載體上,再用SacⅠ和KpnⅠ酶切,定向克隆至表達(dá)載體pTrc99A,并酶切鑒定陽性克隆。

        1.2.2 生物信息學(xué)分析的主要軟件及數(shù)據(jù)庫 基因序列數(shù)據(jù)由NCBI中獲得??缒^(qū)分析軟件為TMHMM,多序列比對軟件為ClustalW,常規(guī)的核酸蛋白分析軟件利用DNAMAN進(jìn)行。

        1.2.3 MM281的功能互補(bǔ)和鋁離子毒害實驗 將pTrc99A-VP-MgtE質(zhì)粒電擊轉(zhuǎn)化進(jìn)入MM281。鑒定陽性克隆,分別挑取MM281-VP-MgtE,MM281-pTrc,MM281單菌落在試管中過夜培養(yǎng)。然后再按50∶1(LB∶菌液=50 mL∶1 m)的比例接種于含有相應(yīng)抗生素的錐形瓶中擴(kuò)大培養(yǎng)。同時測值。當(dāng)達(dá)到0.6~0.7之間時,加入1mM/L的IPTG進(jìn)行誘導(dǎo),當(dāng)?shù)竭_(dá)1.0時取出,取菌液100μL加入 900 μL 水中。分別稀釋成 10-1、10-2、10-3、10-4、10-5五個梯度。取稀釋的菌液2μL點樣于不同Mg2+濃度的互補(bǔ)平板上,Al3+(以AlCl3的形式添加)毒害中點樣于pH 5,Mg2+濃度為100 mM的LB固體培養(yǎng)基上。37℃倒置培養(yǎng)2 d后觀察菌落生長情況并拍照。

        1.2.4 液體生長曲線 挑取MM281,MM281-pTrc,MM281-VP-pTrc的單菌落在含相應(yīng)抗生素的LB中搖菌,當(dāng)OD600=0.6~0.8時,1 200 rpm離心收集細(xì)胞,用去離子水清洗兩遍,以除去殘留的Mg2+,然后用去離子懸浮。準(zhǔn)備7種不同濃度(0μM,50μM,100μM,500μM,1 mM,5 mM,10 mM)和相應(yīng)抗生素的N-minimal培養(yǎng)基,將上述準(zhǔn)備好的培養(yǎng)物(起始=0.001~0.002)加入N-minimal培養(yǎng)基中。37℃搖菌,每2 h測一次并記錄數(shù)據(jù)。共測24 h。

        1.2.5 離子敏感性實驗 按功能互補(bǔ)實驗過程一樣準(zhǔn)備好菌液,然后點至不同濃度的金屬離子板上。37℃倒置培養(yǎng)2 d后觀察其生長情況并拍照。

        1.2.6 定點突變 定點突變的方法按照分子克隆上介紹的重疊延伸誘變的方法分別設(shè)計兩對引物。從野生型VP-MgtE-pTrc99A中用高保真酶Pyrobest DNA polymerase進(jìn)行三次PCR。再SacⅠ,KpnⅠ雙酶切,定向構(gòu)建至pTrc-99A上產(chǎn)生特異位點的突變。突變引物設(shè)計見表1。再按照1.2.3的方法進(jìn)行功能互補(bǔ)實驗。

        表1 突變引物設(shè)計表

        2 結(jié)果與討論

        2.1 VP-MgtE與MgtE基因家族其它成員相比顯示部分序列相似性

        VP-MgtE的編碼一個含451個氨基酸的蛋白質(zhì)??缒し治鲲@示其具有五個跨膜區(qū)。其與Bacillus firmus OF4和Providencia stuartii中的MgtE序列分別具有21.15%,14.69%的相似性。多序列比對表明它們在第二和第五個跨膜區(qū)具有較高的相似性(見圖1)。

        圖1 VP-MgtE與MgtE家族其他基因clustalw比對圖

        圖1 為VP-MgtE和MgtE家族其他成員運用ClustalW的比對結(jié)果。TM2,TM5方框標(biāo)示處的A、G、D、G位點表示突變后對其功能影響很大者,TM4,TM5方框標(biāo)示處的D、L位點表示對其功能影響較少者,TM4方框標(biāo)示處的P位點表示無影響。圖中標(biāo)出的五個跨膜區(qū)(TM1-TM5)為根據(jù)VPMgtE的蛋白拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)預(yù)測所得到。比對中其他基因 GenBank登陸號分別為 B.firmus:U18744;P.stuartii:U23806;Human;NM_173854。

        2.2 VP-MgtE可功能互補(bǔ)MM281的生長

        MM281是一類喪失了 CorA,MgtA,MgtB Mg2+轉(zhuǎn)運系統(tǒng)的沙門氏桿菌突變株。它只能在高濃度Mg2+(>100 mM)下達(dá)到最佳生長速度。結(jié)合功能互補(bǔ)的方法,它可作為一個研究Mg2+轉(zhuǎn)運的很好的系統(tǒng)。表達(dá)了VP-MgtE的MM281重組菌株可在低濃度Mg2+情況下生長,甚至在不加Mg2+的LB培養(yǎng)基上生長。而其陰性對照MM281,pTrc99A-MM281則只能在大于10 mM的N-minimal培養(yǎng)基上生長(見圖2)。結(jié)果說明,VP-MgtE的表達(dá)互補(bǔ)了MM281在Mg2+轉(zhuǎn)運上的功能缺失,使之重新具有了Mg2+轉(zhuǎn)運能力。從而使其可在含低濃度(<10mM)Mg2+的培養(yǎng)基中生長。生長曲線結(jié)果也再次證明了目的基因的轉(zhuǎn)運能力。由圖3、圖4可知,表達(dá)了目的基因的MM281轉(zhuǎn)化子可在 100μM的N-minimal培養(yǎng)基中生長。而陰性對照只能在10 mM的培養(yǎng)基中生長。

        圖2 MM281,MM281-pTrc,MM281-VP-MgtE在不同Mg2+濃度的N-minimal互補(bǔ)平板上的生長結(jié)果

        圖3 MM281,MM281-pTrc,MM281-VP-MgtE 在 10 mM Mg2+的N-minimal培養(yǎng)基中的生長結(jié)果

        圖4 MM281,MM281-pTrc,MM281-VP-MgtE 在 100 μM Mg2+的N-minimal培養(yǎng)基中的生長結(jié)果現(xiàn)差別

        2.3 VP-MgtE的表達(dá)改變了MM281的離子敏感性

        已有研究顯示,當(dāng)細(xì)菌中積累一定量的重金屬離子(如 Co2+,Cd2+,Mn2+,Zn2+)時,就會對細(xì)菌本身產(chǎn)生毒害作用并使之死亡。由圖5可知,表達(dá)了VP-MgtE基因的轉(zhuǎn)化子增加了對Ni2+,Co2+,Mn2+,Cu2+的敏感性,當(dāng) Ni2+,Co2+,Mn2+,Cu2+離子濃度分別達(dá)到500μM,500μM,500μM,1 mM 時,表達(dá)了目的基因的菌株就會死亡。可以認(rèn)為VP-MgtE有Co2+,Cd2+,Mn2+,Zn2+,Ni2+,F(xiàn)e2+,Cu2+離子的轉(zhuǎn)運能力。

        2.4 VP-MgtE的表達(dá)提高了MM281對鋁毒害的抗性

        研究表明當(dāng)pH<6時鋁離子就可從結(jié)合態(tài)釋放出來產(chǎn)生毒害作用。在pH=5時研究了VP-MgtE的鋁抗性,結(jié)果表明VP-MgtE的表達(dá)可提高M(jìn)M281對鋁毒害的抗性(見圖6)。為了證實確實是Al3+而不是Cl-在起毒害作用,同時做了KCl的實驗,與對照相比,實驗數(shù)據(jù)沒有區(qū)別。

        2.5 定點突變改變了VP-MgtE的Mg2+轉(zhuǎn)運能力

        圖5 MM281,MM281-pTrc,MM281-VP-MgtE在含有不同金屬離子濃度的N-minimal固體培養(yǎng)基上的生長結(jié)果

        圖6 MM281,MM281-pTrc,MM281-VP-MgtE在含不同鋁離子濃度的LB平板上的互補(bǔ)結(jié)果

        運用定點突變的方法對VP-MgtE蛋白中的7個氨基酸進(jìn)行了突變,由圖7可以發(fā)現(xiàn),VP-J1,VP-J2,VP-J5,VP-J6 的突變使目的蛋白的 Mg2+轉(zhuǎn)運能力有很大的降底,VP-J4的轉(zhuǎn)運能力和目的蛋白相比,有輕微的降底,VP-J3,VP-J7出乎實驗預(yù)期,在10μM情況下和目的蛋白相比這兩個突變株的轉(zhuǎn)運能力明顯提高。這些突變都集中在第2和第5跨膜區(qū)。在這兩個跨膜區(qū)的每個突變對其轉(zhuǎn)運能力都有影響,這也說明了這兩個跨膜區(qū)在Mg2+裝運中的重要性。

        圖7 定點突變結(jié)果

        3 討論

        序列分析顯示VP-MgtE的蛋白序列與目前已知的MgtE家族成員顯示了部分相似性,多序列比對表明,它們在第2和第5個跨膜區(qū)和其它成員有較高的相似性。在一些特定的保守基序中MgtE家族成員具有完全的相似性,如第5個跨膜區(qū)的DP基序。實驗運用定點突變的方法研究了這些保守區(qū)域,結(jié)果顯示,當(dāng)這兩個跨膜區(qū)中的一些保守氨基酸突變以后,它的鎂離子轉(zhuǎn)運能力和野生型相比有明顯下降,甚至是完全喪失。同時本課題組還從不同的菌種克隆了3個MgtE家族成員并進(jìn)行了功能鑒定,它們在這些保守的基序中也是完全一致的。由此可見,這些保守的氨基酸是MgtE家族發(fā)揮Mg2+轉(zhuǎn)運功能所必需的。

        此外,實驗結(jié)果還表明VP-MgtE轉(zhuǎn)運Mg2+不受pH值的影響。同時在實驗中還發(fā)現(xiàn)VP-MgtE在高濃度的Mg2+下的生長反而不如在低濃度的情況下生長的快,因此猜測VP-MgtE可能為一類高親和性,轉(zhuǎn)運鎂離子的載體蛋白。

        [1]Gibson M M,Bagga,Maguire M E.Magnesium transport in Salmo nella yphimurium:The influence of new mutation conferring Co2+resistance on the CorA Mg2+transporter system[J].Mol.Microbiol,1991,(5):2753-2762.

        [2]Richard CG.Genes for magnesium transport[J].Current Opinion,2003,(6):263-267.

        [3]Li L,Ana F T,Revel S M,et al.A Novel Family of Magnesium Transport Genes in Arabidopsis[J].The Plant Cell,2001,(13):2761-2775.

        [4]Flamm R K,Hinrichs D J,Thomashow M F.Introduction of pAM beta 1 into Listeria monocytogenes by conjugation and homology between native L[J].monocytogenes plasmids,1984,44:157-161.

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