段一凡,王賢榮,梁麗麗,向其柏,伊賢貴
(南京林業(yè)大學(xué) 森林資源與環(huán)境學(xué)院,江蘇 南京 210037)
桂花(Osmanthusfragrans(Thunb.) Lour.)為木犀科(Oleaceae)木犀屬(OsmanthusLour.)著名觀賞花木,屬我國十大傳統(tǒng)名花之一,在我國已有2 500余年的栽培歷史.湖北省咸寧市是我國著名的五大桂花老產(chǎn)區(qū)之一,地處湖北省東南部,地跨東經(jīng)113°32′~114°58′,北緯29°02′~30°19′,地勢東南高,西北低,山地、丘陵、平原兼而有之.咸寧屬亞熱帶大陸性季風(fēng)氣候,氣候溫和,年平均氣溫16.8℃;降水充沛,年平均降水量1 577.4 mm;日照充足,四季分明,年平均日照時(shí)間為1 754.5 h;無霜期長,年平均無霜期為245~258 d;土壤pH值適中,適宜桂花的生長.
數(shù)量分類學(xué)是以定量的觀點(diǎn)來描述親緣關(guān)系,并在此基礎(chǔ)上進(jìn)行分類[1].因此作為一門邊緣學(xué)科,近年來隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)的發(fā)展,特別是各種統(tǒng)計(jì)軟件的不斷出現(xiàn),使得該學(xué)科得到了飛快的發(fā)展,并逐漸成為研究品種分類的一個(gè)重要方法,應(yīng)用廣泛.在對(duì)湖北咸寧桂花品種資源調(diào)查的基礎(chǔ)上[2],對(duì)咸寧市桂花品種進(jìn)行了數(shù)量分類,探討了咸寧桂花品種之間的親緣關(guān)系,并對(duì)桂花品種分類依據(jù)進(jìn)行了討論.
以湖北咸寧所產(chǎn)的26個(gè)桂花品種作為分類運(yùn)算單位(operational taxonomic unit,OTU),試驗(yàn)材料來源于咸寧市桂花鎮(zhèn)、潛山國家森林公園、195醫(yī)院、咸寧學(xué)院等地,詳見表1.
表1 26個(gè)桂花品種
通過對(duì)桂花品種的觀察、分析,選取了26個(gè)比較穩(wěn)定、能夠反映品種間特征差異的性狀作為數(shù)量分類性狀.其中7個(gè)為二元性狀(簡稱“二”),8個(gè)為多態(tài)性狀(簡稱“多”),11個(gè)為連續(xù)數(shù)值性狀(簡稱“數(shù)”),詳見表2.
用MVSP3.1軟件對(duì)選取的26個(gè)分類性狀進(jìn)行主成分分析(principal component analysis,PCA),并對(duì)26個(gè)OTU進(jìn)行聚類分析(cluster analysis).聚類分析采用類平均法(UPGMA)和歐氏距離(euclidean distance)進(jìn)行運(yùn)算,并用最遠(yuǎn)距離法(farthest neighbour)、最近距離法(nearest neighbour)和中間距離法(WPGMA)加以比較分析.
表2 桂花品種分類性狀及編碼
續(xù)表2
編號(hào)性狀編碼類型編碼值編號(hào)性狀編碼類型編碼值9葉基形狀多圓形(0)、闊楔形(1)、窄楔形(2)、平截(3)22結(jié)實(shí)與否二不結(jié)實(shí)(0)、結(jié)實(shí)(l)10葉柄長數(shù)5~8mm(0)、8~11mm(1)、11~14mm(2)、>14mm(3)23花期二秋季開花(0)、四季開花(1)11側(cè)脈對(duì)數(shù)數(shù)6~8對(duì)(0)、8~10對(duì)(1)、>10對(duì)(2)24秋季首開花時(shí)間二8月中下旬開花(0)、9月中下旬開花(1)12每節(jié)花芽對(duì)數(shù)數(shù)1~2對(duì)(0)、2~3對(duì)(1)、>3對(duì)(2)25葉柄顏色二黃綠色(0)、紫紅色(1)13每花序花朵數(shù)數(shù)5~7朵(0)、7~9朵(1)、>9朵(2)26花枝長度數(shù)5~10cm(0)、10~15cm(1)、15~20cm(2)、>20cm(3)
表3 部分性狀主成分的負(fù)荷量
表4 因子負(fù)荷量
原始數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化后,通過MVSP3.1軟件運(yùn)算,得到26個(gè)性狀主成分的負(fù)荷量表(選取了分析中有涉及的部分主成分列于表3和表4)和26個(gè)OTU的樹形聚類圖(利用結(jié)合線法Joint broken line method對(duì)26個(gè)桂花品種進(jìn)行劃分,見圖1~4.
主成分分析是一種通過降維的方法將多個(gè)指標(biāo)簡化為少數(shù)幾個(gè)綜合指標(biāo),使這幾個(gè)少數(shù)綜合指標(biāo)可以反映原來所有指標(biāo)的信息的多元統(tǒng)計(jì)方法,主成份分析從本質(zhì)上講是聚類方法的一種.但除此之外,主成份分析還可以提供有關(guān)性狀間相關(guān)性的信息,以及某一綜合性狀在分類中的意義及其對(duì)分類的影響程度等多種信息,因此我們說主成份分析有著它獨(dú)特的優(yōu)越性[3,4].
一般情況下累計(jì)貢獻(xiàn)率在70%以上,事物的基本面貌能得到反映,且累計(jì)貢獻(xiàn)率在很大程度上決定主成分個(gè)數(shù)m.一般當(dāng)m大于3時(shí),宣告該組數(shù)據(jù)不適于主成分分析,也就是說沒有突出的主要成分可依據(jù)[1].由表3可以看出,直到第5個(gè)主成分時(shí),累計(jì)貢獻(xiàn)率才達(dá)73.224%,這說明主成分的貢獻(xiàn)率比較分散,主成分分析方法在對(duì)桂花數(shù)量分類的研究上不太可行.但這也從另一個(gè)角度說明桂花品種性狀變異的多樣性,品種間性狀差異的復(fù)雜性,同時(shí)也說明桂花品種正向多方向演化,產(chǎn)生了不同的分支類群,主成分分析方法為桂花演化多向性提供了定量分析依據(jù).
另外,由表3和表4可以看出,第1個(gè)主成分的貢獻(xiàn)率較高,占32.753%,對(duì)其作用最大的性狀主要為花序總梗情況(0.272)、花梗長度(0.271) 、花色RHS值(0.265)等,因此這些性狀應(yīng)成為桂花品種分類中優(yōu)先考慮的性狀,這和向其柏、劉玉蓮的桂花品種分類系統(tǒng)對(duì)桂花品種主要分類性狀的選擇相一致[5],也佐證了該分類系統(tǒng)的合理性.
相同數(shù)據(jù)用不同聚類方法分析,其結(jié)果會(huì)有一定的差異,故對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析時(shí),須進(jìn)行聚類分析方法篩選[6,7].本文比較了類平均法、最遠(yuǎn)距離法、最近距離法和中間距離法等聚類方法,聚類結(jié)果如圖1~4.
聚類圖反映了品種間的親緣關(guān)系,親緣越近,越早聚在一起.從上圖中可以看出,不同聚類方法聚類結(jié)果差別較大,特別是圖3最近距離法聚類結(jié)果與其他3圖差異最大.如:該圖中大葉四季桂與丹桂品種聚在一起,不符合桂花品種分類常識(shí),故該聚類結(jié)果不太可行.圖1、2、4較為相近,在此3圖中四季桂類和秋桂類都分別聚在了一起,說明四季桂類具有獨(dú)立的分類位置.圖2中秋桂類3個(gè)品種群區(qū)分效果不太明顯.圖1和圖4最為相近,但圖4中白潔、秋桂、長梗白、折葉銀桂4個(gè)銀桂品種與金桂類品種較早的聚在了一起,不如圖1中聚類結(jié)果更為理想.
圖1 桂花品種系統(tǒng)聚類圖(類平均法) 圖2 桂花品種系統(tǒng)聚類圖(最遠(yuǎn)距離法)
綜上可以看出,4種聚類方法的聚類效果為:類平均法>中間距離法>最遠(yuǎn)距離法>最近距離法.從圖1可以看出:
1)在λ=8.052處,26個(gè)桂花品種分為兩大類,即四季桂類和秋桂類,如L1所示.可以看出花期在桂花品種分類性狀中的重要地位,這和前人的研究結(jié)論相一致[8-10].對(duì)于四季桂的分類地位一直存在爭論[11,12],越來越多的分子標(biāo)記證據(jù)也表明四季桂分類地位的獨(dú)立性[13-17].因此,如何處理四季桂的分類位置,是做為桂花原變種、新變種還是新種等亟待進(jìn)一步研究.
2)在λ=6.783時(shí),秋桂類被分成3組,如L2所示.其中丹桂類品種-硬葉丹桂和金桂類品種-麩金各成一組,最先分出.由此可以看出花色在桂花品種分類上的重要性,這和前文主成分分析中對(duì)花色的討論相吻合.同時(shí)第3組中(包括A、B、C,3個(gè)分組,如圖1所示)的C分組除球桂外都為銀桂,包括11個(gè)品種,較早的聚合在了一起,表明這些品種親緣關(guān)系較近,也表明花色這一分類性狀的穩(wěn)定性.
圖3 桂花品種系統(tǒng)聚類圖(最近距離法) 圖4 桂花品種系統(tǒng)聚類圖(中心距離法)
3)B分組中有潢川金桂、早籽黃、醉云、紫梗、籽銀桂5個(gè)品種,其中潢川金桂和早籽黃作為2個(gè)結(jié)籽的金桂品種最先聚合在一起,然后為金桂醉云和銀桂紫梗,最后為籽銀桂.這其中除紫梗外都為結(jié)籽的品種,這說明結(jié)實(shí)這一分類性狀的重要性和穩(wěn)定性,同時(shí)也表明,金桂品種群和銀桂品種群中部分品種間較近的親緣關(guān)系.
4)在A分組中注意到墨葉丹桂沒有跟另一丹桂品種-硬葉丹桂聚合在一起,而是跟闊葉早銀桂和江南麗人等銀桂品種聚在了一起,并且葉形等方面與闊葉早銀桂、江南麗人十分相似,由此推測丹桂類雖為單系起源,但其起源途徑可能不同;一般認(rèn)為丹桂系由金桂芽變而來,但綜上可以推測一些丹桂品種或許可以直接由銀桂品種變異而來.
或者說,品種之間花色等性狀的演化應(yīng)是多途徑的,不是簡單的單線變化,如一些金桂品種和銀桂聚合在一起[8],一些丹桂品種和金桂品種聚合在一起[16,17],這正說明了桂花品種性狀演化途徑的多樣性,也和桂花品種性狀不太適合做主成分分析的結(jié)論相一致.
通過對(duì)湖北省咸寧市桂花品種的數(shù)量分類研究,探討了桂花品種性狀主成分分析的可行性,就花期、花色、結(jié)實(shí)與否等性狀的分類意義進(jìn)行了討論,并通過Q型聚類探討了品種之間的親緣關(guān)系,得到了一些有益的結(jié)論.
作為一種以表型性狀為主要分類依據(jù)的方法,數(shù)量分類法在實(shí)際應(yīng)用中有其局限性,特別是在性狀的選取、編碼等方面有很強(qiáng)的主觀性,不同處理所得結(jié)果往往不盡相同.但因?yàn)樵摲椒軌蚓C合各方面的來源不同的性狀指標(biāo),能夠得出一個(gè)總體把握的分類體系,所以仍不失為進(jìn)行品種分類的一種有益的方法.近年來,以分子標(biāo)記為主要手段的遺傳多樣性研究已經(jīng)在品種分類上得以廣泛應(yīng)用[18-22].因此,在探討湖北咸寧桂花品種分類時(shí),綜合運(yùn)用分子標(biāo)記等方法將是今后研究的方向.
致謝:論文寫作過程中得到南京森林公安學(xué)院偵查系謝春平博士的諸多幫助,在此致以最誠摯的謝意!
參考文獻(xiàn):
[1]徐克學(xué).數(shù)量分類學(xué)[M].北京:科學(xué)出版社,1994.
[2]梁麗麗,段一凡,王賢榮.湖北省咸寧市桂花品種初探[C]//全國博士生論壇(植物生物學(xué))論文集.開封:河南大學(xué),2010:145-152.
[3]文彬,晁瑞堂,陳玉山.草莓品種的數(shù)量分類研究[J].華南師范大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,2000(1):99-103.
[4]王賢榮,謝春平,伊賢貴,等.不同居群野生早櫻形態(tài)變異研究[J].植物研究,2007,27(6):746-752.
[5]向其柏,劉玉蓮.中國桂花品種圖志[M].杭州:浙江科學(xué)技術(shù)出版社,2008.
[6]王玉柱,劉奇志.不同聚類方法對(duì)杏品種分類的影響[J].北京農(nóng)業(yè)科學(xué),1996,14(1):32-36.
[7]馬玉敏.中國野生板栗群體遺傳結(jié)構(gòu)和核心種質(zhì)構(gòu)建方法[D].泰安:山東農(nóng)業(yè)大學(xué),2009.
[8]劉龍昌,向其柏.桂花品種數(shù)量分類研究[J].福建林學(xué)院學(xué)報(bào),2004,24(3):233-236.
[9]唐冬芹.桂花品種數(shù)量分類研究[J].南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),1998,22(1):37-42.
[10]曾明穎.四川省桂花品種的數(shù)量分類研究[J].南方農(nóng)業(yè),2009(3):68-70.
[11]胡紹慶,宣子燦,周煦浪,等.杭州市桂花品種的分類整理[J].浙江林學(xué)院學(xué)報(bào),2006,23(2):179-187.
[12]胡紹慶,張后勇,吳光洪,等.桂花品種分類系統(tǒng)研究[J].浙江大學(xué)學(xué)報(bào):農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版,2005,31(4):445-448.
[13]伊燕杰,黃瑩,尚富德.利用RAPD標(biāo)記研究桂花品種間的親緣關(guān)系[J].南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,2004,28(增刊):65-70.
[14]趙小蘭,姚崇懷.桂花品種的同功酶研究[J].華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2000,19(6):595-599.
[15]Liu L C,Xiang Q B,Liu Y L.The application of RAPD marker in diversity detection and cultivar Identification of Osmanthus fagrans[J].Journal of Nanjing Foresry University (Natural Science Edition),2004,28:76-82.
[16]韓遠(yuǎn)記,董美芳,袁王俊,等.部分桂花栽培品種的AFLP分析[J].園藝學(xué)報(bào),2008,35(l):137-142.
[17]李梅,侯喜林,單曉政,等.部分桂花品種親緣關(guān)系及特有標(biāo)記的ISSR分析[J].西北植物學(xué)報(bào),2009,29(4):674-682.
[18]孫雪梅,喬愛民,孫敏,等.27個(gè)菜心品種遺傳多樣性的ISSR分析[J].西南師范大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,2010,35(1):119-123.
[19]鄭鷺,祁建民,方平平,等.蓖麻品種遺傳多樣性與親緣關(guān)系的SRAP分析[J].武漢植物學(xué)研究,2010,28(1):1-6.
[20]勞方業(yè),劉睿,何慧怡,等.廣東甘蔗品種遺傳多樣性的AFLP分析[J].熱帶亞熱帶植物學(xué)報(bào),2008,17(1):43-48.
[21]葉蘭欽,辛明明,杜金昆,等.SSR標(biāo)記應(yīng)用于煙草品種遺傳多樣性研究[J].中國農(nóng)學(xué)通報(bào),2009,25(1):56-62.
[22]朱根發(fā),李冬梅,郭振飛.中國墨蘭品種遺傳多樣性的AFLP分析[J].中山大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,2009,48(3):69-73.