曹 健,周美啟,楊 影
(安徽中醫(yī)學(xué)院,安徽合肥 230038)
基因芯片技術(shù)是一項(xiàng)融分子生物學(xué)、半導(dǎo)體微電子、激光、化學(xué)染料、生物住處學(xué)等領(lǐng)域各項(xiàng)技術(shù),一次微排列實(shí)驗(yàn)可對(duì)上千種基因的表達(dá)水平、突變和多態(tài)性進(jìn)行快速、準(zhǔn)確檢測(cè)的高新技術(shù),主要包括芯片制備、樣品制備、雜交反應(yīng)、信號(hào)檢測(cè)和結(jié)果分析4個(gè)主要步驟,是當(dāng)今微觀整體研究的一項(xiàng)最新技術(shù)。目前,基因芯片技術(shù)主要應(yīng)用于基因表達(dá)譜分析、新基因發(fā)現(xiàn)、基因突變及多態(tài)性分析、基因組文庫(kù)作圖、疾病診斷和預(yù)測(cè)、藥物篩選、基因測(cè)序等領(lǐng)域?;蛐酒娘w速發(fā)展引起世界各國(guó)的廣泛關(guān)注和重視。近年來(lái),應(yīng)用基因芯片技術(shù)在尋找中醫(yī)證候的基因組、探索針灸作用機(jī)制以及研究中藥療效的基因表達(dá)譜方面取得了一定的成果。
中醫(yī)證候是中醫(yī)藥研究的核心,證候本質(zhì)的研究是中醫(yī)現(xiàn)代化研究的熱點(diǎn)和難點(diǎn),如能獲得突破性進(jìn)展,必將使中醫(yī)理論研究取得質(zhì)的飛躍。應(yīng)用現(xiàn)代醫(yī)學(xué)理論和分子生物學(xué)技術(shù)闡明中醫(yī)證候本質(zhì)是實(shí)現(xiàn)中醫(yī)藥現(xiàn)代化的基礎(chǔ)和關(guān)鍵,具有重大科學(xué)意義。中醫(yī)藥在功能基因調(diào)控方面具有潛在的優(yōu)勢(shì)[1],通過(guò)對(duì)足夠數(shù)量的同一病位或病性患者的基因表達(dá)進(jìn)行分析,建立辨證要素的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)庫(kù),再相互組合便可建立證型基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)庫(kù),以此可作為辨證的客觀規(guī)范化標(biāo)準(zhǔn)。
楊裕華等[2]應(yīng)用基因芯片檢測(cè)了“勞倦過(guò)度、房室不節(jié)”腎陽(yáng)虛小鼠模型腦基因的改變情況,研究結(jié)果提示,腎陽(yáng)虛模型小鼠基因表達(dá)改變涉及生長(zhǎng)激素、泌乳素、促性腺激素、黑色素和腦脂肪酸結(jié)合蛋白(B-FABP)相關(guān)基因;炎癥/免疫、促細(xì)胞凋亡相關(guān)基因以及影響多巴胺生成的限速酶、影響凝血纖溶機(jī)制和精子發(fā)育代謝的相關(guān)基因。宋潔等[3]觀察了“勞倦過(guò)度、房室不節(jié)”腎陽(yáng)虛小鼠模型睪丸基因的改變,共篩選出差異表達(dá)基因5 505個(gè),其中上調(diào)2 425個(gè),下調(diào)3 080個(gè)。上調(diào)基因前百位中已知基因41個(gè),下調(diào)基因前百位中已知基因62個(gè),主要涉及細(xì)胞結(jié)構(gòu)/功能、物質(zhì)/能量代謝、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)/傳遞、炎癥/免疫、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄/翻譯、增殖/分化及細(xì)胞周期等。潘志強(qiáng)等[4]探索絲裂原激活蛋白激酶(MAPK)信號(hào)通路基因在不同證候H22 肝癌荷瘤小鼠腎上腺中的表達(dá)特征,結(jié)果提示,不同證候肝癌小鼠的腎上腺組織主動(dòng)參與了MAPK 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程。楊麗萍等[5]則利用基因芯片數(shù)據(jù)挖掘的最新技術(shù)手段——基因功能模塊,從功能模塊水平研究虛寒證發(fā)生的分子機(jī)制,結(jié)果發(fā)現(xiàn),用25個(gè)差異基因分類樣本準(zhǔn)確率為93%,用11個(gè)功能模塊分類樣本準(zhǔn)確率為87%~100%。認(rèn)為基于特征功能模塊法研究基因表達(dá)譜更有利于對(duì)疾病的闡釋。
針灸以其明顯的臨床療效已在世界范圍內(nèi)被廣泛認(rèn)可,而基因芯片技術(shù)是建立在基因探針和雜交測(cè)序技術(shù)上的一種高效快速的核酸序列分析手段,可以在一次試驗(yàn)中同時(shí)對(duì)成千上萬(wàn)個(gè)基因進(jìn)行分析。針刺既然可引起人體多系統(tǒng)、多功能的同步變化,因此可以設(shè)想,通過(guò)觀察不同穴位、刺激方法、頻率、強(qiáng)度等,導(dǎo)致有關(guān)組織基因轉(zhuǎn)錄的差異,從而在分子水平全面而深刻地反映其廣泛的作用途徑和治療靶點(diǎn),探明針刺的作用機(jī)制,體現(xiàn)針灸的整體調(diào)節(jié)作用,完善針灸理論,為臨床治療提供依據(jù)和指導(dǎo)。
筆者在既往的實(shí)驗(yàn)中,采用結(jié)扎冠狀動(dòng)脈前降支法復(fù)制大鼠急性心肌梗死模型,比較肺經(jīng)組與模型組、心經(jīng)組與模型組、小腸經(jīng)組與模型組的下丘腦基因表達(dá)譜變化。結(jié)果發(fā)現(xiàn),與模型組比較,肺經(jīng)組中大于2倍的差異表達(dá)基因(包括EST)有26個(gè)下調(diào)和57個(gè)上調(diào),心經(jīng)組中有34個(gè)下調(diào)和190個(gè)上調(diào),小腸經(jīng)組中有97個(gè)下調(diào)和122個(gè)上調(diào)。就大于2倍的表達(dá)基因而言,僅僅在心經(jīng)組和小腸經(jīng)組出現(xiàn)促甲狀腺激素釋放激素(TRH)基因表達(dá)明顯上調(diào)和促腎上腺皮質(zhì)激素釋放激素(CRH)基因表達(dá)明顯下調(diào)。認(rèn)為下丘腦差異表達(dá)基因,特別是TRH和CRH 基因表達(dá),可能參與了電針心經(jīng)、小腸經(jīng)對(duì)急性心肌缺血的保護(hù)作用[6-8]。曲怡等[9]應(yīng)用基因芯片技術(shù)研究電針對(duì)局灶性腦缺血-再灌注大鼠腦組織基因表達(dá)譜的影響,研究結(jié)果表明,篩選出的差異表達(dá)基因可能參與腦缺血-再灌注后腦損傷的發(fā)生及發(fā)展過(guò)程,并參與了針灸抗損傷的機(jī)制。江勵(lì)華等[10]采用基因芯片技術(shù)觀察了電針治療抑郁癥的機(jī)制,結(jié)果表明,電針治療抑郁癥的機(jī)制與調(diào)控凝血、免疫、炎癥反應(yīng)和凋亡等相關(guān)的基因表達(dá)有關(guān)。
中藥由于所含有效成分復(fù)雜、作用靶點(diǎn)不明確、重現(xiàn)性差,難以用現(xiàn)行生物醫(yī)學(xué)理論解釋,嚴(yán)重地制約了中藥的現(xiàn)代化發(fā)展。基因芯片作為一種高通量、大規(guī)模研究基因功能的新技術(shù),能夠從基因表達(dá)水平上闡明中醫(yī)藥治病的機(jī)制。伴隨后基因組時(shí)代的來(lái)臨,基因芯片技術(shù)平臺(tái)可以將中藥的藥性、功能及主治與其對(duì)特定模型細(xì)胞相關(guān)基因表達(dá)和調(diào)控的影響關(guān)聯(lián)起來(lái),在分子水平上用現(xiàn)代基因組學(xué)的理論來(lái)解釋傳統(tǒng)中藥理論及作用機(jī)制。
李昊等[11]應(yīng)用基因芯片研究藤梨根對(duì)胃癌細(xì)胞的作用,結(jié)果表明,ERBB2、TRAILR2、p53、TNF、Cyclin E 基因的表達(dá)改變可能與藤梨根殺傷和誘導(dǎo)胃癌細(xì)胞凋亡有關(guān)。于華蕓等[12]利用基因芯片技術(shù)研究寒性中藥黃連對(duì)正常大鼠肝臟全基因表達(dá)譜的影響,結(jié)果提示,黃連可上調(diào)炎癥反應(yīng)、免疫反應(yīng)、防御反應(yīng)相關(guān)基因,增強(qiáng)抗感染、防御能力,調(diào)控代謝、凋亡相關(guān)基因,影響P450 家族成員,發(fā)揮代謝抑制、抗感染作用。其后,于華蕓等[13]又利用基因芯片技術(shù)探討大黃“清熱瀉火解毒”作用的分子機(jī)制,結(jié)果表明,調(diào)控機(jī)體防御反應(yīng)、花生四烯酸代謝相關(guān)基因表達(dá),可能是大黃發(fā)揮“清熱瀉火解毒”作用的分子機(jī)制之一。
毛秉豫等[14]觀察加味四物湯對(duì)自發(fā)性高血壓大鼠(SHR)的心肌組織基因表達(dá)譜的影響。結(jié)果表明,陽(yáng)性基因重疊有18 條,其中高表達(dá)的基因有4 條,低表達(dá)的有14 條。該方作用靶點(diǎn)較多,可上調(diào)或下調(diào)SHR 的某些與生物酶、血管活性物質(zhì)、心肌纖維化、脂肪酸代謝有關(guān)基因的表達(dá),這可能是其產(chǎn)生藥理作用的重要因素。王剛等[15]利用基因芯片技術(shù)對(duì)復(fù)方丹參滴丸對(duì)心肌梗死大鼠基因表達(dá)的影響進(jìn)行評(píng)價(jià)和研究,基因芯片結(jié)果表明,復(fù)方丹參滴丸可通過(guò)調(diào)節(jié)Wnt 信號(hào)通路等多個(gè)基因和信號(hào)途徑來(lái)減少心肌梗死模型大鼠心臟缺血區(qū)的心肌損傷。袁丁等[16]觀察中藥復(fù)方小金丹對(duì)人肝癌細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)基因表達(dá)的影響,結(jié)果表明,小金丹能顯著影響SMMC-7721 細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)基因表達(dá)。
呂純芳等[17]應(yīng)用基因芯片研究藏花素對(duì)膀胱移行細(xì)胞癌T24 細(xì)胞基因表達(dá)譜的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn),3 mmol/L 藏花素作用于T24 細(xì)胞48h 引起該細(xì)胞系基因表達(dá)譜的廣泛改變,其中表達(dá)差異2倍以上的基因共836個(gè),這些差異表達(dá)基因的功能涉及多個(gè)方面,最為明顯的是與細(xì)胞生長(zhǎng)調(diào)節(jié)相關(guān)的細(xì)胞周期調(diào)節(jié)基因、細(xì)胞凋亡調(diào)控基因、DNA 復(fù)制相關(guān)基因等類型。譚敏等[18]觀察補(bǔ)骨脂素對(duì)人乳腺癌MCF-7(ER陽(yáng)性)細(xì)胞基因表達(dá)譜的影響。結(jié)果顯示,經(jīng)補(bǔ)骨脂素作用的實(shí)驗(yàn)組細(xì)胞樣本與對(duì)照組細(xì)胞樣本比較,呈現(xiàn)差異表達(dá)的基因有1 113個(gè)。其中,表達(dá)上調(diào)的有456個(gè),表達(dá)下調(diào)的有657個(gè)。差異表達(dá)明顯的基因主要與細(xì)胞凋亡、細(xì)胞周期調(diào)控、核酸轉(zhuǎn)譯調(diào)節(jié)、轉(zhuǎn)譯因子活性、核苷酸轉(zhuǎn)移酶活性、血管收縮調(diào)節(jié)等有關(guān)。黃杉等[19]應(yīng)用基因芯片技術(shù)研究黃芩素對(duì)白色念珠菌基因表達(dá)譜的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn),共有522個(gè)差異表達(dá)基因,其中,上調(diào)基因251個(gè),下調(diào)基因271個(gè)。差異基因功能主要涉及細(xì)胞周期、跨膜物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)、多藥耐藥、毒力因子及熱休克蛋白等。
從基因概念的提出到人類基因組學(xué)計(jì)劃的完成,基因芯片相關(guān)技術(shù)得到了飛速的發(fā)展。目前,基因芯片技術(shù)以其具有高通量、簡(jiǎn)便、微縮、集約化、平行化等優(yōu)點(diǎn),而廣泛應(yīng)用于中醫(yī)藥領(lǐng)域,主要體現(xiàn)在:中醫(yī)證候、中藥藥效及藥理學(xué)研究、中藥有效成分篩選研究、中藥毒性及不良反應(yīng)研究等方面,在基因組學(xué)與中醫(yī)藥學(xué)研究之間架起了一座橋梁,為中醫(yī)藥客觀化、定量化、標(biāo)準(zhǔn)化研究提供了技術(shù)上的保證。雖然基因芯片技術(shù)費(fèi)用相對(duì)昂貴,部分芯片特異性相對(duì)較低等局限了其在中醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用,但仍有其廣闊的發(fā)展和應(yīng)用前景。
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