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        醫(yī)學(xué)圖像分割進(jìn)展

        2010-02-14 10:50:54李強(qiáng)
        中國醫(yī)療設(shè)備 2010年5期
        關(guān)鍵詞:方法

        李強(qiáng)

        紹興第二醫(yī)院 設(shè)備科,浙江 紹興312000

        醫(yī)學(xué)圖像分割進(jìn)展

        李強(qiáng)

        紹興第二醫(yī)院 設(shè)備科,浙江 紹興312000

        圖像分割是解決醫(yī)學(xué)圖像在臨床上廣泛應(yīng)用的關(guān)鍵性問題。本文簡述了醫(yī)學(xué)圖像分割技術(shù)的進(jìn)展,綜述醫(yī)學(xué)圖像分割技術(shù)、發(fā)展趨勢,展望了醫(yī)學(xué)圖像分割的前景和面臨的挑戰(zhàn)。

        醫(yī)學(xué)影像處理;醫(yī)學(xué)圖像分割

        0 前言

        信息技術(shù)的飛速發(fā)展和計算機(jī)應(yīng)用水平的不斷提高,促使了醫(yī)學(xué)成像技術(shù)的突飛猛進(jìn),人們能夠獲得大量高分辨率的醫(yī)學(xué)圖像,如:計算機(jī)斷層成像(Computed Tomography,CT)、核磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,MRI)、超聲成像(Ultrasonography,US)等技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于醫(yī)療診斷、術(shù)前計劃、治療、術(shù)后監(jiān)測等各個環(huán)節(jié),如何把這些成像技術(shù)中獲得的各種定量、定性數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,是至關(guān)重要的問題。只有把感興趣的目標(biāo)從圖像背景中提取出來,才能夠進(jìn)一步對它們進(jìn)行定量分析或識別,進(jìn)而對圖像進(jìn)行理解。目前,醫(yī)學(xué)圖像分割主要以各種細(xì)胞、組織和器官的圖像作為處理的對象或內(nèi)容。圖像分割是根據(jù)某種均勻性或一致性原則將圖像分成若干個有意義的部分,使得每一部分都符合某種一致性的要求[1]。

        1 醫(yī)學(xué)圖像分割技術(shù)的發(fā)展

        醫(yī)學(xué)圖像分割技術(shù)的發(fā)展是一個從人工分割到半自動分割再到自動分割逐步發(fā)展的過程。人工分割是指由經(jīng)驗豐富的臨床醫(yī)生在原始膠片圖像上直接勾畫出有關(guān)組織的邊界,或者通過圖像編輯器用鼠標(biāo)在計算機(jī)監(jiān)視器上勾畫出有關(guān)組織的邊界成感興趣的區(qū)域[2]。目前,人工分割的精度在所有分割方法中是最高的,被視為金標(biāo)準(zhǔn)。雖然人工分割的精度極高,但該方法費(fèi)時、費(fèi)力,其分割結(jié)果的優(yōu)劣完全取決于操作者的經(jīng)驗知識,且分割結(jié)果難以重現(xiàn)。半自動分割方法是隨著計算機(jī)科學(xué)的發(fā)展而產(chǎn)生的,它是把計算機(jī)強(qiáng)大的數(shù)據(jù)處理、存貯和記憶能力與人的知識和經(jīng)驗有機(jī)地結(jié)合起來,通過人機(jī)交互的形式完成圖像分割的全過程。半自動方法與人工分割相比,分割速度明顯提高,但分割結(jié)果很大程度上仍然依賴于操作者的經(jīng)驗知識,這種情況在一定程度上影響了半自動分割技術(shù)在臨床上的推廣應(yīng)用。自動分割是由計算機(jī)完成圖像分割的全過程,完全脫離了人為干涉。由于該方法不存在人為因素的影響,因此能夠很好地再現(xiàn)分割結(jié)果,為精確定量測量奠定了基礎(chǔ)。但自動分割算法復(fù)雜,運(yùn)算量較大,在有些情況下,仍然需要人工干預(yù)。因此,研究新的自動分割方法一直是近年來圖像分割方法研究的重點(diǎn)。從目前圖像分割技術(shù)的發(fā)展趨勢來看,新分割方法的研究大多以下列幾個方向為其目標(biāo):① 自動,以最少的人機(jī)交互完成分割的全過程;② 精確,以最優(yōu)化的結(jié)果與解剖結(jié)構(gòu)接近;③快速,以實時處理為最終目標(biāo);④ 自適應(yīng)性,對于不同的應(yīng)用可以自我學(xué)習(xí),自我適應(yīng);⑤ 魯棒性,對噪聲、模糊等干擾具有較強(qiáng)的免疫力。

        2 醫(yī)學(xué)圖像分割方法

        醫(yī)學(xué)圖像分割是正常組織和病變組織的三維重建、定量分析等后續(xù)操作的基礎(chǔ),也是臨床醫(yī)學(xué)應(yīng)用的瓶頸,分割的準(zhǔn)確性對醫(yī)生判斷疾病的真實情況并做出正確的診斷計劃至關(guān)重要。由于醫(yī)學(xué)圖像具有極為繁雜的多樣性和復(fù)雜性,加上目前醫(yī)學(xué)影像設(shè)備(CT、MRI、PET等)成像技術(shù)上的特點(diǎn),使得醫(yī)學(xué)圖像存在一定的噪聲,圖像中目標(biāo)物體邊緣也可能不清楚,這使得醫(yī)學(xué)圖像分割更加困難。因此,目前在醫(yī)學(xué)圖像分割方面仍然沒有可以通用的理論和方法。一般來說,圖像分割主要可分為基于區(qū)域的分割方法和基于邊界的分割方法[3]?;趨^(qū)域的分割方法,依賴于圖像的空間局部特征,如:灰度、紋理及其它像素統(tǒng)計特性的均勻性等。基于邊界的分割方法主要是利用梯度信息確定目標(biāo)的邊界,這種方法不依賴于已處理像素的結(jié)果,適于并行化,缺點(diǎn)是對噪聲敏感,而且當(dāng)邊緣像素值變化不明顯時,容易產(chǎn)生假邊界或不連續(xù)的邊界,在實際應(yīng)用中往往需要把這兩種方法結(jié)合起來。

        2.1 基于區(qū)域的分割方法

        2.1.1 區(qū)域生長法[4]

        區(qū)域生長法是將具有相似性質(zhì)的像素集中起來構(gòu)成區(qū)域,該方法需要先選取一個種子點(diǎn),然后依次將種子像素周圍的相似像素合并到種子像素所在的區(qū)域中。區(qū)域生長法的優(yōu)點(diǎn)是計算簡單,特別適用于描繪腫瘤和傷口等小而簡單的結(jié)構(gòu),區(qū)域生長很少單獨(dú)使用,往往與其他分割方法一起并用。區(qū)域生長法的缺點(diǎn)是:它需要人工交互以獲得種子點(diǎn),這樣,使用者必須在每個需要抽取的區(qū)域中植入一個種子點(diǎn)。同時,區(qū)域生長法對噪聲也敏感,導(dǎo)致抽取的區(qū)域有空洞,或者在局部體效應(yīng)的情況下將原本分開的區(qū)域連接起來。為了克服這些缺點(diǎn),陸劍鋒[5]提出了一種通過計算種子點(diǎn)附近領(lǐng)域統(tǒng)計信息,自適應(yīng)改變生長標(biāo)準(zhǔn)參數(shù)用于頭骨CT、肝臟CT以及人腦MRI圖像的分割算法,在切片圖像預(yù)處理進(jìn)程中,考慮到體數(shù)據(jù)相鄰切片之間高度的相關(guān)性,在相鄰層之間采取高斯核濾波去除噪聲,并通過各向異性濾波算法對濾層切片進(jìn)行濾波,結(jié)果表明,該算法可有效地提取出圖像區(qū)域,具有較好的魯棒性。

        2.1.2 基于統(tǒng)計學(xué)的方法[6,7]

        隨機(jī)場的方法是空間像素點(diǎn)之間空間關(guān)聯(lián)的統(tǒng)計學(xué)方法,如基于馬爾科夫隨機(jī)場(MRF)方法。統(tǒng)計學(xué)方法的實質(zhì)是從統(tǒng)計學(xué)的角度出發(fā)對數(shù)字圖像進(jìn)行建模,把圖像中各個像素點(diǎn)的灰度值看作具有一定概率分布的隨機(jī)變量。MRF模型應(yīng)用的難點(diǎn)在于選取合適的參數(shù),控制空間相關(guān)性的強(qiáng)度,強(qiáng)度過強(qiáng)將導(dǎo)致分割圖像邊緣過度平滑,從而丟失一些重要的解剖細(xì)節(jié)信息。另外,應(yīng)用MRF模型的算法計算量很大。盡管有這些缺點(diǎn),MRF還是一種應(yīng)用廣泛的模型。MRF模型常被用于估計和校正核磁圖像中的局部體效應(yīng)和強(qiáng)度不均勻現(xiàn)象。另一種常用的基于統(tǒng)計學(xué)的方法為標(biāo)記法(Labeling),此方法就是將圖像分割成的幾個物體各以一個不同的標(biāo)號來表示,對圖像中的每一個像素,用一定的方式賦予其中一個標(biāo)號,標(biāo)號相同的像素就組成該標(biāo)號所代表的物體。Weian Deng[8]等人給出了一種以概率標(biāo)記法作為邊緣檢測后處理的迭代算法。2.1.3 人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)法[9]

        人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN)是一種大規(guī)模并行連續(xù)處理系統(tǒng)。ANN具有模擬人類信號處理能力并且非常擅長解決模式識別領(lǐng)域中的模式分類問題,而醫(yī)學(xué)圖像分割問題正是對圖像中的各個解剖結(jié)構(gòu)進(jìn)行分類和標(biāo)記的問題。ANN的主要特點(diǎn)有:具有通過實例學(xué)習(xí)的能力,并能利用前饋網(wǎng)絡(luò)概括所學(xué)內(nèi)容;對于隨機(jī)噪聲有很強(qiáng)的魯棒性,具有容錯的能力和最優(yōu)搜索能力。因此,當(dāng)利用其它方法進(jìn)行圖像分割時,對于噪聲、組織不均勻性、生物形態(tài)的多變性等問題,利用ANN技術(shù)可以得到很好的解決。但是,使用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)法時,因為網(wǎng)絡(luò)中有許多相互連接,所以空間信息就能很容易地包含在分類過程中。此分割方法分為兩種:有標(biāo)準(zhǔn)圖像樣本集和無標(biāo)準(zhǔn)樣本集分割。有標(biāo)準(zhǔn)樣本集的分割方法是首先對標(biāo)準(zhǔn)樣本進(jìn)行訓(xùn)練,得到神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分類器,待分割圖像時根據(jù)分類器進(jìn)行分類,沒有標(biāo)準(zhǔn)標(biāo)本集的分割方法是對像素特征設(shè)計一個非線性聚類器,目前這種分割方法主要集中對神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的改進(jìn)上。

        2.2 基于邊緣的分割方法

        2.2.1 基于形變模型的方法[10]

        此類方法目前在醫(yī)學(xué)圖像分割中應(yīng)用最廣,它的特點(diǎn)是將圖像數(shù)據(jù)、初始輪廓、目標(biāo)輪廓和基于知識的約束統(tǒng)一于特征提取的進(jìn)程中。形變模型包括二維形變輪廓模型(又稱Snake)和三維形變曲面模型,還有一些利用形狀先驗知識和使用點(diǎn)集合先驗知識的改進(jìn)模型。形變曲面模型是活動輪廓在三維空間的推廣形式。三維形變曲面模型可以更高效、更快捷地利用三維數(shù)據(jù),而且更少地需要用戶交互或指導(dǎo)。形變模型分為兩大類:參數(shù)形變模型和幾何形變模型?;趨?shù)形變模型分割過程就是使模型在外能和內(nèi)能作用下向物體邊緣靠近,外力推動輪廓曲線運(yùn)動,而內(nèi)力保持輪廓的光滑性。幾何形變模型方法利用曲線演化理論來實現(xiàn)。輪廓對應(yīng)于一個更高維曲面的演化函數(shù)的零水平集,演化函數(shù)可用某種形式的偏微分方程來表示,利用圖像信息(如邊緣)來控制曲面演化過程的停止。形變模型的主要優(yōu)點(diǎn)是能夠直接產(chǎn)生閉合曲線或曲面,并對噪聲和偽邊界有很強(qiáng)的魯棒性;缺點(diǎn)是:它對初始邊界位置十分敏感,有時要求人工選擇合適的參數(shù)。

        2.2.2 基于數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)的方法[11,12]

        隨著數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)理論的不斷完善和發(fā)展,數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)在圖像邊緣檢測中得到廣泛的研究和應(yīng)用。數(shù)學(xué)形態(tài)是一門新興科學(xué),它建立在嚴(yán)格的數(shù)學(xué)理論基礎(chǔ)上,其基本思想和方法對圖像處理的理論和技術(shù)產(chǎn)生了重大影響,數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)已經(jīng)構(gòu)成一種新興的圖像處理方法和理論。形態(tài)學(xué)圖像處理以在圖像中移動一個結(jié)構(gòu)元素并進(jìn)行卷積的方式進(jìn)行,結(jié)構(gòu)元素可以任意大小。形態(tài)學(xué)的基本操作是膨脹、腐蝕、開閉運(yùn)算,它們算法簡單,同時能較好地保持圖像的細(xì)節(jié)特征,很好地解決邊緣檢測精度與抗噪聲性能的協(xié)調(diào)問題,缺點(diǎn)是算法的適應(yīng)性差。形態(tài)學(xué)理論在圖像分割中的應(yīng)用有代表性的是Luc Vincent[13]等人提出的分水嶺方法(Watershed)[14]。該算法的思想來源于地理學(xué)。經(jīng)過分水嶺方法處理后,將輸出原始圖像的過度分割圖(分割的區(qū)域數(shù)目超過圖像中包含的實際對象數(shù)),過度分割的區(qū)域數(shù)目取決于參數(shù)的大小。雖然這些方法已成功用于圖像分割,但它們需要用戶的交互或準(zhǔn)確的關(guān)于圖像結(jié)構(gòu)的先驗知識。為改進(jìn)早期方法的這些問題,分水嶺算法往往與其他方法結(jié)合使用。

        2.2.3 基于小波變換的方法[15]

        近年來,在低頻和高頻分析時有“變焦”特征的小波變換在醫(yī)學(xué)圖像分割中,得到廣泛應(yīng)用。用小波進(jìn)行醫(yī)學(xué)圖像閾值分割的思想是利用二進(jìn)制小波變換將圖像直方圖分解為不同層次的小波系數(shù),依照給定的分割準(zhǔn)則和小波系數(shù)選擇閾值門限,整個過程由粗到細(xì),由尺度來控制。如果分割不理想,則可利用直方圖在精細(xì)的子空間上的小波系數(shù)逐步細(xì)化圖像分割;用小波進(jìn)行邊緣檢測,則是利用小波系數(shù)模的極大值。文獻(xiàn)[16]提出了一種小波多尺度幾何活動的曲線模型,就是小波邊緣檢測的方法;采用間隔采樣的離散小波變換提取圖像特征,在矢量量化聚類的基礎(chǔ)上,通過增加馬爾可夫隨機(jī)場的限制條件,建立起小波空間內(nèi)的分割統(tǒng)計模型。在小波最高層空間簡單設(shè)置初始聚類情況,經(jīng)過優(yōu)化迭代過程以及相鄰空間內(nèi)的分割結(jié)果的遺傳,使其逐層自適應(yīng)地收斂到最佳聚類狀態(tài)。在多尺度分析下,圖像的類別信息和位置信息是一對矛盾,兩者之間存在不確定性[17]。因此,必須充分考慮各尺度之間的拓?fù)潢P(guān)系和對稱性,如此會大大提高分割算法的計算效率。

        3 醫(yī)學(xué)圖像分割新技術(shù)

        3.1 基于模糊技術(shù)分割[18]

        模糊技術(shù)是建立在模糊集合理論基礎(chǔ)上的,能很好地處理三維醫(yī)學(xué)圖像內(nèi)在的模糊性,而且對噪聲不敏感。由生物醫(yī)學(xué)成像設(shè)備獲取的圖像數(shù)據(jù)具有內(nèi)在的不確定性,這種不確定性的程度依賴于許多因素,包括在空間、時間和參數(shù)分辨率方面的局限性以及成像設(shè)備的其它物理限制等。這些不確定性是模糊技術(shù)在圖像分割中得到廣泛應(yīng)用的一個決定性的因素,因為模糊技術(shù)正是為了處理事物的不確定性而誕生的。

        2003年,Hiew等人[19]提出了一種應(yīng)用于對三維MR圖像進(jìn)行分割的自適應(yīng)空間FCM算法[20]。輸入的圖像可能由于噪聲和強(qiáng)度的不均勻而渾濁,該算法考慮了空間連續(xù)性的約束,采用相異索引(dissimilarity index)的方法,使獲得的局部空間連續(xù)性約束能夠減少噪聲的影響和分類的不明確性。與其它已公開的算法比較,該算法的有效性在廣義模糊試驗中用模擬和實際的MR圖像都得到了證實。

        3.2 基于知識的分割[21,22]

        基于知識的分割是所有圖像分割方法中最重要的方法之一。近年來隨著人工智能技術(shù)的發(fā)展,基于知識的分割方法也得到了廣泛地研究和應(yīng)用?;谥R的分割方法主要包括兩個方面的內(nèi)容:知識的獲取,即歸納及提取相關(guān)的知識,建立知識庫;知識的應(yīng)用,即有效地利用知識實現(xiàn)圖像的自動分割。基于知識的分割,其知識來源主要有:① 臨床知識,即某種疾病的癥狀及它們所處的位置;② 解剖學(xué)知識,即某器官的解剖學(xué)和形態(tài)學(xué)信息,以及其幾何學(xué)與拓?fù)鋵W(xué)的相互關(guān)系,這種知識通常是用圖譜來表示的;③ 成像知識,這類知識與成像方法及其具體的設(shè)備有關(guān);④ 統(tǒng)計知識,例如MRI的質(zhì)子密度(PD)、T1和T2統(tǒng)計數(shù)據(jù),并把它們與解剖學(xué)的有關(guān)數(shù)據(jù)聯(lián)系起來。

        2002年,Boscolo等人[23]提出了一種新穎的基于知識的分割方法。醫(yī)學(xué)圖像分割通常需要醫(yī)學(xué)專家對感興趣的解剖結(jié)構(gòu)區(qū)域提供準(zhǔn)確、持續(xù)的鑒定,而Boscolo等人的分割方法將基于知識的分割系統(tǒng)與一套熟練的主動輪廓模式(active contour mode1)[24]相結(jié)合,此方法利用一種高級過程的引導(dǎo)對不同的解剖結(jié)構(gòu)進(jìn)行粗略的分割,使用者無需提供初始輪廓放置,而由高級過程自動執(zhí)行必須的參數(shù)優(yōu)化。關(guān)于被分割的解剖結(jié)構(gòu)的知識,則用一個叫做可能性密度函數(shù)根據(jù)統(tǒng)計學(xué)規(guī)律定義成位置、大小、圖像亮度等參數(shù)。目前,該方法正在進(jìn)一步研究是否確實能夠提供持續(xù)的高級分割。

        3.3 基于仿生模式識別的分割[25]

        近年來出現(xiàn)的仿生模式識別方法,一經(jīng)提出便受到了廣泛的關(guān)注,該方法以多維空間幾何分析理論為基礎(chǔ),利用特征空間同類樣本的連續(xù)性規(guī)律,對一類事物的“認(rèn)識”,實際上是對這類事物的全體在特征空間中形成的無窮點(diǎn)集合的“形狀”的分析和認(rèn)識,再根據(jù)這種規(guī)律性建立起“多維空間中非超球復(fù)雜幾何形體覆蓋”,將簡單的點(diǎn)劃分轉(zhuǎn)換為點(diǎn)的覆蓋過程,從而從根本上改變傳統(tǒng)模式識別的弊端,將誤識率基本降為零,避免由于誤識而產(chǎn)生的嚴(yán)重后果。仿生模式識別已成功應(yīng)用于多個領(lǐng)域并取得了一定的成果[26,27],也為醫(yī)學(xué)圖像分割開辟了一個嶄新的研究方向。

        吳海珍等人[28]提出一種基于仿生模式識別的醫(yī)學(xué)圖像分割算法,該算法以仿生模式識別為基礎(chǔ),采取先覆蓋后分割的方法。以核磁共振(MRI)腦圖像分割為例,并與神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法、支持向量機(jī)方法進(jìn)行了分割效果比較。實驗結(jié)果表明,該方法有效地提高了分割精度,改善了分割性能,具有更強(qiáng)的魯棒性和實用性。

        4 醫(yī)學(xué)圖像分割方法評價

        醫(yī)學(xué)圖像分割評價通過對圖像分割算法性能的研究達(dá)到優(yōu)化分割的目的。通過評價可以掌握各個算法在不同分割任務(wù)中的表現(xiàn),以通過選擇算法參數(shù)來適應(yīng)不同類型圖像的需要。另外,通過比較多個算法分割特定圖像的性能,有助于在具體分割任務(wù)中選取合適的算法。這對于醫(yī)學(xué)圖像的分割尤為重要,因為分割的準(zhǔn)確度直接關(guān)系到臨床應(yīng)用效果?,F(xiàn)有的評價方法可分為兩類:直接分析法和間接實驗法。分析法直接研究分割算法本身的原理特性,通過分析得到算法性能;實驗法則根據(jù)分割圖像的質(zhì)量間接地評判算法的性能。分析法得到的結(jié)果比較客觀,但許多算法直接分析比較困難,且分析法不可能獲得分割算法的所有性質(zhì),常與其他算法結(jié)合使用。但是,由于人體解剖結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性、組織器官形狀的不規(guī)則性及不同個體間的差異等原因,目前還沒有一種能對所有圖像都產(chǎn)生滿意分割效果的分割方法。各種算法都具有很強(qiáng)的針對性,往往是基于特定的領(lǐng)域、特定的成像模型。如今對醫(yī)學(xué)圖像分割算法的評價還是以主觀評價為主,盡管主觀評價存在很多缺點(diǎn),但是由于醫(yī)學(xué)圖像的復(fù)雜性以及圖像分割理論的不完善,目前還不能完全用客觀評價的方法對醫(yī)學(xué)圖像分割算法進(jìn)行評價,所以今后對醫(yī)學(xué)圖像分割算法的主觀評價仍將占主導(dǎo)地位。

        5 展望

        新的圖像分割方法的研究主要以自動、精確、快速、自適應(yīng)性等幾個方向作為研究目標(biāo)。醫(yī)學(xué)圖像分割作為一種特殊的圖像分割領(lǐng)域,除了有上述的趨勢外,圍繞它的另一重要發(fā)展是臨床上的應(yīng)用。計算機(jī)分割方法在輔助診斷和放射療法中已顯示出它的作用。雖然全自動分割方法永遠(yuǎn)不會取代醫(yī)生的地位,但它漸漸成為了醫(yī)學(xué)圖像分析中至關(guān)重要的部分。隨著基因工程的發(fā)展,微觀結(jié)構(gòu)的分割也提上了日程,而不能僅僅局限于現(xiàn)在的“器官”層次上的處理和分析。相信隨著各種理論的不斷完善和成熟,以及新理論在圖像分割領(lǐng)域的嘗試應(yīng)用,醫(yī)學(xué)圖像分割的方法也會更先進(jìn)、更成熟。

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        General Review of Medical Image Segmentation

        LI Qiang
        Equipment Department,Shaoxing Second Hospital,Shaoxing Zhejiang 312000,China

        R445

        A

        10.3969/j.issn.1674-1633.2010.05.051

        1674-1633(2010)05-0121-04

        2009-09-07

        作者郵箱:sxlq163.com@163.com

        Abstract: Image segmentation is a key factor to solve medical image segmentation in clinic.In this paper the development of medical image segmentation techniques was sketched, and a review of the medical image segmentation techniques was given. The prospects and the challenge of medical image segmentation was discussed.

        Key words: medical image processing;medical image segmentation

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