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        基于分子動(dòng)力學(xué)的纖維素在氯化膽堿/尿素中的溶解行為模擬研究

        2025-08-18 00:00:00覃星添胡殿赫秦利明吳朝軍陳業(yè)紅
        中國(guó)造紙 2025年7期
        關(guān)鍵詞:氫鍵纖維素尿素

        摘要:本研究采用模擬計(jì)算方法研究了氯化膽堿/尿素低共熔溶劑(DES)體系與纖維素微晶纖維相互作用的過程,旨在探討其對(duì)纖維素結(jié)晶區(qū)發(fā)生的動(dòng)力學(xué)行為。通過模擬探究了DES體系中纖維素分子間和分子內(nèi)的氫鍵變化過程和規(guī)律。使用CelluloseBuilder對(duì)纖維素建模,利用Gromacs軟件進(jìn)行了溶解體系動(dòng)力學(xué)模擬。結(jié)果表明,氯化膽堿/尿素體系破壞了纖維素晶體中纖維素之間原有的氫鍵網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),纖維素晶型有一定程度的溶解,其中尿素起到了主要的作用,并且DES對(duì)分子內(nèi)氫鍵的破壞程度大于分子間氫鍵,分子內(nèi)氫鍵O2-H---O6下降2.7個(gè)百分點(diǎn);分子內(nèi)氫鍵03-H---05下降0.8個(gè)百分點(diǎn);而分子間氫鍵O6-H--03下降0.6個(gè)百分點(diǎn)。氫鍵破壞主要發(fā)生在纖維素表面的羥基上,重建的氫鍵網(wǎng)絡(luò)最后趨于穩(wěn)定,形成穩(wěn)定的纖維素包合體結(jié)構(gòu)。

        關(guān)鍵詞:纖維素;低共熔溶劑;分子動(dòng)力學(xué);氯化膽堿;尿素中圖分類號(hào):TS71 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A DOI: 10.11980/j.issn.0254-508X.2025.07.003

        Abstract:Inthispaper,theinteractionbetweecholinechloride/ureadeepeutecticsolvent(DES)systemandcelulosecrystalinfbers wasstudiedbimulationmetd,nodertoexploeitsneticavioontcstalineregioofcellos.Tehangingpod regularityofinteleularydrogenondsandintramolecularhdrogenbondsofcelluloseinthSsystemereinvestigatdtoghthe simulation.CeluloseBuilderwasusedtomodelceluloseandthedissolutionkineticsweresimulatedunderGromacssofware.Theesults showedthatthecholinchloride/ureaDESsystemdestroedtheoriginalhdrogenbondnetworkstructurebetweencellosefibersincellu losecrystalregion,andthecellosecrystalregionhadacertaindegreofdisolution,inhichureaplayedamajorrole,ndtedestruc tionofintrachainhdrogenbondsasgreaterthantatofteinterchainhydrogenbonds.TheitramolecularhydrogenondO-H-6decreasedby2.7percentagepoints,heoveralldecreaseofitramolecularhydrogenbodO3-H-OasO.8percengepoints,hilethe overalldecreaeofteiteoeularydogenodO6--OasO.peretagepoits.Teestuctioofhydogenodsainlyc curredonthehdroxylgrouponthesurfaceofcellose.Thereconstructedhydrogenbondingnetwork eventuallytabilized,esultingina stable cellulose inclusion structure.

        Keywords: cellulose;deep eutectic solvent;molecular kinetics; choline chloride;urea

        纖維素作為一種自然界中儲(chǔ)量豐富的可再生資源,因其可生物降解和低成本等特性,被視為替代石油基材料的理想選擇。然而,木質(zhì)纖維素不易溶解,是制約其進(jìn)一步應(yīng)用的瓶頸。木質(zhì)纖維素中主要包含纖維素、半纖維素和木質(zhì)素等不同組分,這些組分天然混生不易分離。其中,纖維素晶體內(nèi)部的氫鍵網(wǎng)絡(luò)是其難以溶解的主要原因-2,因此,開發(fā)新型綠色溶劑以打破這種氫鍵網(wǎng)絡(luò),是實(shí)現(xiàn)纖維素溶解和木質(zhì)纖維素組分分離的關(guān)鍵。

        近年來(lái),綠色化學(xué)領(lǐng)域?qū)w維素溶解的研究不斷深入。傳統(tǒng)的離子液體如咪唑類離子液體雖能在一定程度上溶解纖維素,但存在溶劑回收能耗大的弊病,限制了其廣泛應(yīng)用。為了尋找更經(jīng)濟(jì)環(huán)保的溶劑體系,2003年,Abbott等研究了一種由尿素和氯化膽堿(ChCI)組成的低共熔溶劑(DES),利用DES溶解和分離木質(zhì)纖維素組分,成為了一種新型環(huán)保的木質(zhì)纖維高值化利用手段。薛智敏等4采用ChCI基的DES進(jìn)行生物質(zhì)預(yù)處理,分析了ChCI基DES的理化性質(zhì)與預(yù)處理效果之間的關(guān)聯(lián)性。以羧酸、醇、氨基或酰胺基為氫鍵供體組成DES對(duì)木質(zhì)纖維進(jìn)行預(yù)處理,重點(diǎn)分析了預(yù)處理溫度及時(shí)間、氫鍵供體的結(jié)構(gòu)及其與ChCI的物質(zhì)的量比、固液比等因素對(duì)預(yù)處理效果的影響。此外,還討論了ChCI基DES與其他輔助技術(shù)結(jié)合在生物質(zhì)預(yù)處理中的應(yīng)用、ChCI基DES的回收、預(yù)處理后木質(zhì)纖維素各組分的再生等熱點(diǎn)問題。汪心娉等綜述了利用DES溶解和分離木質(zhì)纖維素及組分分離的研究進(jìn)展,提出利用DES對(duì)木質(zhì)纖維素組分實(shí)施選擇性分離,進(jìn)而生產(chǎn)生物質(zhì)能源與材料,是一種新型環(huán)保的木質(zhì)纖維高值化利用方法。許慧敏等采用三元DES預(yù)處理玉米秸稈,研究發(fā)現(xiàn)木質(zhì)纖維素中木質(zhì)素和纖維素的溶解程度不同 (圖1)。從圖1中可以看出,ChCI/醇基/4-羥基苯磺酸三元DES均可溶解較多木質(zhì)素組分,有較高的木質(zhì)素脫除率,同時(shí)纖維素的保留率較高,可以實(shí)現(xiàn)木質(zhì)纖維素組分中木質(zhì)素的有效脫離。曹甜凱以楊木為生物質(zhì)原料,采用ChCI/草酸對(duì)其進(jìn)行組分分離,并制備了一系列生物基材料。研究表明,在特定條件下(如 110°C 下反應(yīng) 3h ),纖維素的保留率為 89.0% ,木質(zhì)素溶出率為 71.6% ;經(jīng)過DES處理后再經(jīng)超聲處理,可以得到一定比例的納米纖維素。

        綜上所述,三元DES或二元DES均具有溶解纖維素的能力。雖然不能完全溶解纖維素,但可實(shí)現(xiàn)木質(zhì)素的脫除。目前的實(shí)驗(yàn)測(cè)量手段和理論分析,不能更深入地探究纖維素溶解過程,解釋這種選擇性分離的原因。分子動(dòng)力學(xué)模擬作為一種強(qiáng)大的計(jì)算工具,能夠模擬分子間的相互作用和運(yùn)動(dòng)軌跡,為深入理解纖維素在DES中的溶解過程提供了有力支持。

        Atilhan等采用分子動(dòng)力學(xué)模擬研究了由ChCl作為氫鍵受體,尿素、乙二醇和甘油作為氫鍵供體組成的混合DES的納米級(jí)特性。結(jié)果表明,在混合DES中存在由氫鍵競(jìng)爭(zhēng)引起的納米級(jí)不均勻性,據(jù)推測(cè)這種不均勻性能夠調(diào)控DES的性質(zhì)。Zhang等研究了基于ChCI的DES從烷醇共沸體系中分離1-丁醇的萃取機(jī)制。通過分子動(dòng)力學(xué)模擬了萃取過程。模擬結(jié)果表明,ChCI/尿素( 1:2 ,分子比例)的萃取效果最佳。Wang等o采用模擬計(jì)算方法研究了3種DES(ChCl/甘油、ChCI/乳酸和ChCI/尿素)與纖維素、半纖維素和木質(zhì)素混合體系的相互作用,旨在模擬自然界中真實(shí)木質(zhì)纖維素生物質(zhì)的DES預(yù)處理過程,結(jié)果表明,ChCI/尿素體系比ChCI與多元醇或酸的體系對(duì)纖維素有更好溶解,尿素含量的增加促進(jìn)了DES與木質(zhì)纖維素混合體系之間的相互作用;在模擬溫度353.15K ,ChCl/尿素( 1:2 ,分子比例)對(duì)纖維素的去除率為 78.3% 。值得注意的是,該模擬過程中的纖維素模型為多個(gè)纖維二糖分子,因?yàn)榫酆隙?lt;6 的多糖可以溶解于水中,這與纖維素原料中實(shí)際的情況有很大不同。因此,采用聚合度更大的纖維素模型進(jìn)行研究更有意義。

        圖1ChCI/醇基/PSA三元DES預(yù)處理對(duì)玉米秸稈主要組分含量、脫除/保留率、纖維素聚合度的影響6

        本研究采用尿素和ChCI組成的DES作為溶劑,通過分子動(dòng)力學(xué)模擬的方法,從分子尺度上探究其對(duì)纖維素溶解的作用機(jī)制。對(duì)一個(gè)聚合度更大的纖維素晶體結(jié)構(gòu)建模,并對(duì)其在DES中的溶解過程進(jìn)行研究,探討系統(tǒng)建模,力場(chǎng)選擇與可視化的現(xiàn)象觀察。模擬溫度設(shè)置為 353.15K ,通過多種分析手段(能量分析、氫鍵分析和徑向分布分析等)觀察纖維素的結(jié)構(gòu)變化,探究DES各組分在纖維素溶解過程中發(fā)揮的作用。

        1模擬體系組成

        由于植物細(xì)胞壁中的纖維素主要由纖維素Iβ組成,因此選擇的纖維素模型為纖維素Iβ,并通過cel-lulose-builder軟件建立。由 β -1-4糖苷鍵連接的8個(gè)I型纖維素二糖單元構(gòu)建一個(gè)纖維素納米原纖維,最終構(gòu)建了葡萄糖殘基數(shù)為16、鏈數(shù)為36的纖維素微晶體,模型如圖2所示。通過GaussView6軟件畫出氯化膽堿(ChCI)、尿素的結(jié)構(gòu),建模示意圖如圖3所示。

        2模擬方法

        本研究使用的軟件為GROMACS.2024。所有的低共熔溶劑(DES)分子在結(jié)構(gòu)上均使用Gaussian09軟件在 b3lyp/6-311g(d,p)[11] 基組上進(jìn)行結(jié)構(gòu)和頻率優(yōu)化,然后在 b3lyp/6-311g(d,p) 進(jìn)行單點(diǎn)計(jì)算后獲得分子波函數(shù)信息。ChCI、尿素分子結(jié)構(gòu)及靜電勢(shì)圖見圖3。由圖3可知,靠近氧原子的區(qū)域呈負(fù)電。因?yàn)轶w系中有游離的氯離子和部分帶電基團(tuán),不同方法計(jì)算得到的電荷對(duì)模擬的影響很大,由于RESP電荷是比較適合小分子動(dòng)力學(xué)模擬的原子電荷,因此本研究中DES的原子電荷均使用RESP電荷[12。使用基于分子表面靜電勢(shì)信息的Multiwfn 13.7[13] 程序計(jì)算DES分子的RESP電荷。優(yōu)化后的分子是通過AmberTools4生成模擬需要的GAFF力場(chǎng)參數(shù),再通過ACPYPE將其轉(zhuǎn)換成gro-macs需要的拓?fù)湮募?,然后將?jì)算出的RESP電荷寫入到相應(yīng)的拓?fù)湮募?。纖維素由基于 amber14SB[15] 力場(chǎng)文件生成參數(shù),使用gromacs自帶的 x2top 命令來(lái)生成具有周期性綁定參數(shù)的拓?fù)洹?/p>

        圖2纖維素模型示意圖

        Fig.2Schematic diagram of cellulose model

        圖3ChCl和尿素的建模示意圖

        Fig.3Model schematic diagram of ChCl and urea

        首先,采用Packmol軟件,構(gòu)建1個(gè)盒子,將纖維素置于盒子中心,盒子的尺寸為長(zhǎng)度 8nm× 寬度7nm× 高度 8.304nm 。然后,把ChCI和尿素(分子比例1:2 )加入盒子中。2組實(shí)驗(yàn)的系統(tǒng)組成見表1。在添加ChCl時(shí),需分別插入膽堿陽(yáng)離子和氯離子,因?yàn)樵趯?shí)際的DES中,氯離子以游離狀態(tài)存在,將其單獨(dú)插入盒子中有助于促進(jìn)DES各組分的充分混合,從而使模擬更接近實(shí)際情況。隨后,對(duì)體系實(shí)施了能量最小化。在模擬步驟中,選用了PME(particlemeshewald)方法以應(yīng)對(duì)長(zhǎng)程靜電效應(yīng),設(shè)定靜電力與范德華力的截?cái)嗑嚯x為 1.2nm ,在 x 、 y ! z3 個(gè)維度上均施加周期性邊界條件。然后,運(yùn)用最速下降算法,迭代直至體系中原子間所受的最小力降低至 100kJ/(mol?nm) 以下,以此消除潛在的坐標(biāo)重合問題。

        表1不同體系纖維素及溶劑分子數(shù)

        Table1Numberofcelluloseand solventmoleculesin different systems

        在溫度353.15K條件下,進(jìn)行NVT系綜平衡模擬,經(jīng)過時(shí)長(zhǎng)為 1ns 。然后再進(jìn)行 1ns 的NPT平衡模擬。壓力值設(shè)置為1個(gè)標(biāo)準(zhǔn)大氣壓( 101.325kPa 。2個(gè)平衡模擬階段中,纖維素與DES均設(shè)置位置限制,預(yù)防DES在模擬期間的快速團(tuán)聚,確保纖維素與DES的初始狀態(tài)在分析過程中保持不變。隨后,啟動(dòng)了時(shí)長(zhǎng)為100ns 的分子動(dòng)力學(xué)生產(chǎn)模擬,溫度維持在 353.15K 。在此階段,每 500ps 記錄一次原子坐標(biāo)、速度和能量數(shù)據(jù),以供后續(xù)分析使用。模擬進(jìn)行時(shí),時(shí)間步長(zhǎng)被設(shè)定為 0.1ps ,壓強(qiáng)調(diào)控時(shí)間設(shè)為 2ps ,采用V-rescale算法控制體系溫度,同時(shí)運(yùn)用Berendsen算法調(diào)控體系壓強(qiáng),步長(zhǎng)設(shè)為 0.002ps 。對(duì)于所有包含氫原子的共價(jià)鍵,采用了h-bonds方法進(jìn)行約束處理。

        3結(jié)果和討論

        3.1DES體系中纖維素的溶解

        對(duì)表1中所列的第1組參數(shù),進(jìn)行 100ns 的分子動(dòng)力學(xué)模擬,并繪制了纖維素/ChCI/尿素體系總能量的變化曲線,如圖4(a)所示。反應(yīng)體系的總能量可用于判斷模擬體系是否達(dá)到了平衡狀態(tài)。由圖4(a)可知,在模擬開始后,能量迅速下降,在 10ns 后體系能量基本保持穩(wěn)定,由此判斷體系達(dá)到了平衡狀態(tài)。圖4(b)顯示了結(jié)束后體系的狀態(tài)。由圖4b可以看出,所有DES分子聚集到了纖維素表面,形成了一個(gè)合理的纖維素分子包合物構(gòu)型。本研究收集了分子運(yùn)動(dòng)軌跡文件,并作出氫鍵和徑向分布函數(shù)(RDF)圖以進(jìn)行后續(xù)的分析。

        由于纖維素分子中存在的大量羥基,在分子間與分子內(nèi)形成了較強(qiáng)的氫鍵網(wǎng)絡(luò),導(dǎo)致纖維素難以溶解于常規(guī)溶劑。溶解過程的關(guān)鍵即破壞纖維素分子中存在的強(qiáng)氫鍵網(wǎng)絡(luò),從而影響纖維素束原有的晶體結(jié)構(gòu)來(lái)實(shí)現(xiàn)其溶脹和溶解。纖維素的氫鍵在溶解過程中有著舉足輕重的作用,因此,本研究詳細(xì)分析了纖維素的氫鍵變化。在本研究的模擬系統(tǒng)中,氫鍵形成的標(biāo)準(zhǔn)有2個(gè)條件:其一是氫鍵供體與受體之間的距離lt;0.35nm ;其二是形成氫鍵的氫-供體-氫-受體間的夾角 lt;30° ,只有同時(shí)滿足這2個(gè)條件的氫鍵才會(huì)被統(tǒng)計(jì)記錄[20]。

        圖4系統(tǒng)模擬達(dá)到平衡態(tài)可視化圖示Fig.4Visual illustration of the system simulation reaching the equilibrium state

        纖維素晶體內(nèi)部的氫鍵大致可劃分為2類:纖維素分子內(nèi)氫鍵與分子間氫鍵,其共同決定了纖維素的力學(xué)及熱穩(wěn)定性2。圖5中顯示了按照上述標(biāo)準(zhǔn)統(tǒng)計(jì)的氫鍵數(shù)量隨模擬時(shí)間的變化情況。由圖5(a)可知,初始體系中的纖維素氫鍵數(shù)量大約為1240,這表明在初始狀態(tài)下,纖維素中存在大量氫鍵。隨著溶劑中進(jìn)行的動(dòng)力學(xué)模擬過程,纖維素晶體內(nèi)部氫鍵數(shù)量逐漸下降。具體來(lái)看,鏈內(nèi)的氫鍵數(shù)量逐步減少,而分子間氫鍵數(shù)量基本保持不變,導(dǎo)致總氫鍵數(shù)量呈下降趨勢(shì)。經(jīng)過 5ns 模擬后,纖維素晶體內(nèi)部氫鍵數(shù)量趨于穩(wěn)定,因此本研究選擇分析 0~5ns 內(nèi)的氫鍵演變規(guī)律。由于纖維素中的氫鍵數(shù)量并未降至0,且仍存在較多分子間氫鍵,這表明DES并未能完全溶解纖維素。DES具有氫鍵供體與受體的特性,ChCI和尿素與纖維素之間存在較強(qiáng)的氫鍵相互作用,有助于打破纖維素原有的氫鍵網(wǎng)絡(luò),從而實(shí)現(xiàn)與纖維素表面羥基形成新的氫鍵。由圖5(a還可以看出,纖維素的分子內(nèi)氫鍵數(shù)量略高于分子間氫鍵數(shù)量。分子內(nèi)氫鍵與纖維素自身構(gòu)型相關(guān),可能促進(jìn)不同晶型的轉(zhuǎn)變,而分子間氫鍵則反映了纖維素鏈的溶解狀態(tài)。模擬軌跡指出纖維素鏈逐漸變得松弛,纖維素層與鏈之間發(fā)生潤(rùn)脹,但整體的分離程度較低。

        由圖5(b)可知,在0~0.5ns區(qū)間內(nèi),纖維素與DES分子間形成的氫鍵數(shù)量迅速上升并達(dá)到峰值,在0.5ns 后保持穩(wěn)定。這說明DES分子通過與纖維素形成氫鍵來(lái)破壞纖維素分子間的氫鍵結(jié)構(gòu),有效抑制其分子間聚集。纖維素與DES形成的氫鍵及與尿素形成的氫鍵的折線圖表現(xiàn)出相似的趨勢(shì),而與ChCI形成的氫鍵數(shù)量則相對(duì)較少,這表明尿素在氫鍵競(jìng)爭(zhēng)能力方面優(yōu)于膽堿離子,能夠更有效地打破纖維素的氫鍵網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),促進(jìn)其溶解。研究表明,尿素與ChCI配制的DES對(duì)纖維素具有一定的溶解作用,其中尿素發(fā)揮了更大的作用。

        圖5氫鍵數(shù)量隨模擬時(shí)間的變化情況

        Fig.5Variation of the number of hydrogenbonds along the simulation time

        分子內(nèi)氫鍵的主要形式涵蓋O3-H---05和02-H---06,而分子間氫鍵則以O(shè)6-H---03等為主要代表。圖6為纖維素晶體內(nèi)部的氫鍵網(wǎng)絡(luò)。為深入探討纖維素分子內(nèi)與分子間氫鍵隨時(shí)間的變化規(guī)律,在纖維素的分子重復(fù)單元里,總共有5種氧原子,其被歸為2類:羥基氧(包括02、03、06)和醚鍵氧(包括連接糖環(huán)的01及糖環(huán)上的05)。由于所處的化學(xué)環(huán)境各異,這5種氧原子周圍的溶劑粒子分布呈現(xiàn)出顯著的差異性。本研究對(duì)分子內(nèi)及分子間氫鍵的平均占比進(jìn)行了分析,具體結(jié)果如表2所示。由表2可知,在 0ns 時(shí),O6-H---03、O2-H---O6和03-H---05的占有率分別為 24.0% 、 19.2% 和 8.5% ;在 5ns 時(shí),這些氫鍵的占有率分別為 23.2% 、 16.9% 和 8.6% ;而在 10ns 時(shí),占有率則分別為 23.4% 、 16.5% 和 7.7% 。由此可以看出,分子內(nèi)氫鍵O2-H---06呈現(xiàn)出持續(xù)下降的趨勢(shì),總體下降2.7個(gè)百分點(diǎn);分子內(nèi)氫鍵03-H---05先略有增加,隨后也開始下降,總體下降0.8個(gè)百分點(diǎn);而分子間氫鍵06-H---03則在初期下降后變化不大,總體下降0.6個(gè)百分點(diǎn)。簡(jiǎn)而言之,ChCI/尿素對(duì)纖維素分子內(nèi)氫鍵的影響更為顯著,主要體現(xiàn)在氫鍵02-H---O6的顯著減少。而纖維素分子間氫鍵的下降幅度顯著低于分子內(nèi)氫鍵的下降幅度。由于分子間氫鍵對(duì)纖維素晶型的穩(wěn)定性具有重要意義,因此結(jié)晶區(qū)域不能被完全破壞,這可能是ChCl/尿素?zé)o法徹底溶解纖維素的重要原因。

        3.2纖維素包合物的空間構(gòu)型

        在ChCI/尿素體系中,纖維素分子完全溶解后體系達(dá)到平衡,ChCI和尿素與纖維素鏈形成穩(wěn)定的氫鍵網(wǎng)格結(jié)構(gòu)。本研究選取了表1中的第2組參數(shù),以1條含有16個(gè)葡萄糖殘基的纖維素鏈作為模型,模擬了ChCI/尿素和纖維素的單鏈體系。進(jìn)行 100ns 的分子動(dòng)力學(xué)模擬后體系達(dá)到平衡,從中提取出纖維素包合體的結(jié)構(gòu),見圖7(本研究選擇性地顯示所有距離纖維素鏈0.5ns 范圍內(nèi)的溶劑分子并隱藏了相距過遠(yuǎn)的分子)。

        由圖7可知,尿素分子主要與纖維素分子中的羥基建立氫鍵連接,并且有能力與相鄰的醚鍵氧原子及羥基氧原子構(gòu)建氫鍵。研究推斷,溶劑分子與纖維素分子官能團(tuán)間形成的氫鍵將對(duì)纖維素包合物結(jié)構(gòu)的穩(wěn)固性產(chǎn)生重要影響。

        選取系統(tǒng)模擬達(dá)到平衡后的最后 10ns ,計(jì)算徑向RDF,該函數(shù)反映了一個(gè)粒子周圍出現(xiàn)另一個(gè)粒子的分布,可以顯示出局域密度的峰值。RDF分析中,纖維素上選擇了02、03、05和06這4個(gè)觀測(cè)點(diǎn),詳細(xì)考察不同氧原子附近溶劑粒子的分布情況。一般纖維素預(yù)處理前后的聚合度沒有變化,纖維素糖昔鍵氧(01,04)位置對(duì)稱,不作為氫鍵觀察點(diǎn)。

        DES中的觀察粒子在膽堿離子上選擇了羥基上的氫原子,尿素選擇了氮原子上的氫原子和氯離子。圖8展示了不同氧原子周圍溶劑粒子的徑向RDF,由圖8(a)可知,纖維素吡喃葡萄糖環(huán)上05周圍溶劑粒子的空間分布情況,可以觀察到尿素和膽堿離子的RDF峰值出現(xiàn)在 0.5ns 后,這一距離已經(jīng)超出了系統(tǒng)中設(shè)定的氫鍵形成的預(yù)設(shè)范圍,表明該位置不易形成氫鍵。同理,圖8(b)~圖8(d)展示了纖維素分子上羥基氧(02、03、06)周圍溶劑粒子的空間分布情況。由圖8(b)~圖8(d)可知,對(duì)于這3種氧原子,溶劑粒子分布結(jié)果相對(duì)一致,尿素和膽堿離子在 0.235ns 處形成第一溶劑殼,可被視為氫鍵形成的主要粒子。氯離子在 0.32ns 處形成第一溶劑殼,其峰值顯著,有文獻(xiàn)指出,氯離子與纖維素之間的相互作用主要為靜電作用[23],可以看出這些位置處纖維素與尿素及膽堿氯化物之間的作用距離縮短,呈現(xiàn)出更加緊密的關(guān)聯(lián),表明這里是氫鍵大量出現(xiàn)的區(qū)域。值得注意的是,在圖8(c)中,膽堿離子的RDF峰值出現(xiàn)在離纖維素氧原子(O3)較近的位置,而其與其他纖維素氧原子的RDF峰值距離已經(jīng)超過 0.5ns 。尿素在圖8(b)和圖8(c)中顯示出與纖維素氧原子(O2、O3)較近的RDF峰值出現(xiàn)在 0.216ns ,極短的距離表明尿素與纖維素分子的羥基氧存在較強(qiáng)的相互作用,而氯離子的峰值則相對(duì)靠后。因此,尿素與纖維素的相互作用力大于尿素與膽堿離子和氯離子的相互作用力。

        圖6纖維素晶體內(nèi)部的氫鍵網(wǎng)絡(luò)

        Fig.6Hydrogenbond networkwithin cellulose crystal

        表2DES模擬體系中纖維素3種分子間/分子內(nèi)氫鍵與總氫鍵的比值隨時(shí)間變化情況 Table2Ratioofthethreeinterchain/intrachainhydrogenbondstothetotalhydrogenbondsofceluloseintheDESsimulation systemwith time

        圖7溶劑體系中纖維素包合體結(jié)構(gòu)

        圖8不同氧原子周圍溶劑粒子的徑向分布函數(shù)RDF

        Fig.8RDF of solvent particles around different oxygen atoms

        通過比較纖維素吡喃葡萄糖環(huán)上的醚鍵氧(05)及纖維素羥基氧(02、03、06)周圍的溶劑粒子分布情況,發(fā)現(xiàn)DES與纖維素分子上的羥基氧更接近,這也進(jìn)一步說明了DES主要與纖維素分子上的羥基發(fā)生作用。

        3.3纖維素包合物中溶劑粒子的擴(kuò)散系數(shù)

        為探究氫鍵對(duì)溶劑分子擴(kuò)散的影響,本研究計(jì)算了均方位移(MSD)[24來(lái)分析溶劑分子的擴(kuò)散特性。首先將纖維素分子附近 0.35nm 范圍的溶劑分子視為包合物分子, 0.35nm 以外的溶劑分子視為非包合物分子,MSD曲線如圖9所示,其中曲線斜率即擴(kuò)散系數(shù)。由圖9可知,包合物膽堿離子的MSD曲線斜率0 1.75058×10-5cm2/s) )與非包合物膽堿離子的MSD曲線斜率( 1.71379×10-5cm2/s) )相差不大,這是由于纖維素與膽堿離子形成的氫鍵數(shù)量較少。包合物尿素的MSD曲線斜率( )明顯小于非包合物尿素的MSD曲線斜率( 1.65145×10-5cm2/s) ,這是由于纖維素與尿素形成的氫鍵數(shù)量較多,對(duì)尿素?cái)U(kuò)散有阻攔。然而,包合物氯離子的MSD曲線斜率(( 1.42157×10-5cm2/s, )大于非包合物氯離子的MSD曲線斜率( 1.0913×10-5cm2/s) 。這可能是因?yàn)槁入x子和纖維素間的連接主要是靜電作用,非包合物中氯離子與其他溶劑粒子的關(guān)聯(lián)作用比包合物中對(duì)氯離子的束縛影響更大。由此可見,包合物中溶劑粒子的擴(kuò)散運(yùn)動(dòng)受到了一定的限制,特別是對(duì)于尿素分子,纖維素分子對(duì)尿素?cái)U(kuò)散運(yùn)動(dòng)的束縛作用最為顯著。然而,纖維素分子對(duì)膽堿離子擴(kuò)散運(yùn)動(dòng)的束縛作用并不明顯。此外,纖維素分子對(duì)氯離子擴(kuò)散運(yùn)動(dòng)的束縛作用相對(duì)較小,甚至不及其他溶劑組分對(duì)氯離子的束縛作用。

        4結(jié)論

        本研究構(gòu)建了1個(gè)氯化膽堿(ChCI)/尿素低共熔溶劑(DES)體系,并運(yùn)用分子動(dòng)力學(xué)模擬的方法深入探究了其溶解機(jī)制。在溶解前后,對(duì)纖維素的結(jié)構(gòu)變遷進(jìn)行了詳細(xì)分析。通過評(píng)估體系的總能量狀態(tài),確定體系是否達(dá)到平衡,進(jìn)一步探討纖維素與DES之間的相互作用,具體計(jì)算了氫鍵數(shù)量的變動(dòng)、徑向分布函數(shù)的特性及溶劑粒子的擴(kuò)散速率。

        4.1ChCI/尿素形成的低共熔溶劑可以促進(jìn)纖維素的氫鍵斷裂,纖維素與尿素形成了更多氫鍵,使纖維素分子間氫鍵斷裂,促進(jìn)溶解。然而纖維素分子內(nèi)與分子間的氫鍵沒有完全斷裂,依然存在一定數(shù)量的氫鍵, 10ns 后,分子間氫鍵占有率為 23.4% ,分子內(nèi)氫鍵占有率為 24.2% 。所以ChCI/尿素體系不能完全溶解纖維素。

        4.2通過徑向分布函數(shù),ChCI/尿素主要與纖維素分子上的羥基作用,形成氫鍵。

        4.3纖維素與尿素分子之間較強(qiáng)的相互作用有助于纖維素分子包合物結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定。該包合物的存在限制了纖維素分子周邊溶劑粒子的擴(kuò)散,包合物尿素溶劑組分的擴(kuò)散系數(shù)( 1.470 37×10-5cm2/s) 明顯低于非包合物的尿素?cái)U(kuò)散系數(shù)( 1.651 45×10-5cm2/s ),這一現(xiàn)象是因?yàn)槟蛩嘏c纖維素之間形成的氫鍵更多,導(dǎo)致尿素分子在纖維素周圍受限制,進(jìn)而阻礙了尿素深人纖維素層間的進(jìn)程,因此不能進(jìn)一步破壞纖維素內(nèi)部氫鍵。

        未來(lái),將進(jìn)一步對(duì)比氯化膽堿基DES中不同供體的影響,通過建模和預(yù)測(cè)的方法,找到能最大程度溶解纖維素晶型的供體選項(xiàng)和DES配比與合成工藝。

        致謝

        在本次工作中,感謝胡偉教授給予寶貴建議和鼓勵(lì),蘇洋同學(xué)給予大量協(xié)助。

        參考文獻(xiàn)

        [1]ZHANG LH,YU DM,CHENY H,et al. Effect of urea/choline chloride treatment on removing hemicellulose during alkali extraction inthepreparation of high-purity dissolving pulps[J].Industrial Crops and Products,2024,222(2):1-12.

        [2]CHEN Q H,CHEN Y H,WU C J. Probing the evolutionary mechanism of the hydrogen bond network of cellulose nanofibrils usingthreeDESs[J].InternationalJournalofBiological Macromolecules,2023,234(6):1-9.

        [3]ABBOTT A P,CAPPER G,DAVIES D L. Novel solvent properties of choline chloride/urea mixtures[J].Chemical Communications, 2003,9(1):70-71.

        [4]薛智敏,閆何戀.氯化膽堿類低共熔溶劑用于木質(zhì)纖維素預(yù)處理 的研究進(jìn)展[J].林業(yè)工程學(xué)報(bào),2024,9(1):32-44. XUE Z M,YAN HL. Research Progress on Choline Chloride Eutectic Solvents for Lignocellulose Pretreatment[J].Transactions of the CSF,2024,9(1):32-44.

        [5]汪心娉,余璟,朱瑞琦.低共熔溶劑選擇性溶解木質(zhì)纖維原料 的研究進(jìn)展[J].中國(guó)造紙學(xué)報(bào),2021,36(2):79-86 WANG X P,YU J,ZHU RQ. Research Progress on Selective DissolutionofWoodFiberRawMaterialswithEutectic Solvents[J].Transactions of China Pulp and Paper,2021,36(2):79-86.

        [6]許慧敏,左一蘭,李海潮.多元醇基三元DES預(yù)處理提高玉米秸 稈酶解性能研究[J].中國(guó)造紙,2024,43(12):17-22. XU H M,ZUO YL,LI HC. Study on Enzymatic Hydrolysis Improvement of Corn Stalk with Polyol-based Ternary DES Pretreatment[J]. China Pulpamp;Paper,2024,43(12):17-22.

        [7]曹甜凱.氯化膽堿/草酸低共熔溶劑分離木質(zhì)纖維素組分及其利 用的研究[D].濟(jì)南:齊魯工業(yè)大學(xué),2024. CAO TK. Study on the separation of lignocellulosic components from choline chloride/oxalic acid eutectic solvent and its utilization[D]. Ji'nan:Qilu University of Technology,2024.

        [8]ATILHAN M,APARICIO S. Molecular dynamics simulations of mixed deep eutectic solventsand their interaction with nanomaterials [J]. Journal of Molecular Liquids,2019,283(65):147-154.

        [9]ZHANG Z L,XING Y Y,DONG M,et al. Molecular kinetic extraction mechanism analysis of 1-butanol from n -heptane-1-butanol by choline-based DESs as extractants[J]. Journal of Molecular Liquids,2021,322(1) :1-9.

        [10]WANG W,XU Y,ZHU B,et al.Exploration of the interaction mechanism of lignocellulosic hybrid systemsbased on deep eutectic solvents[J].Bioresource Technology,DOI: 10.1016/j.biortech.2023. 129401.

        [11]FRISCH MJ,TRUCKS G W,SCHLEGEL H B,et al.Gaussian 16,Version B.O1[M].Wallingford,CT:Gaussian,Inc,2016.

        [12]JANECEK M,KUHROVA P,MLYNSKY V. W-RESP:Wellrestrained Electrostatic Potential-derived Charges.Revisiting the Charge Derivation Model[J].Journal of Chemical Theory and Computation,2021,17(6):3495-3509.

        [13]LU T,CHEN F. Multiwfn:A Multifunctional Wavefunction Analyzer[J]. Journal of Computational Chemistry,2012,33(5): 580-592.

        [14] SALOMON-FERRER R,CASE D A,WALKER R C. An overview oftheAmber biomolecular simulationpackage[J].Wiley Interdisciplinary Reviews:Computational Molecular Science,2013, 3(2):198-210.

        [15]JAMES A,MARTINEZ M C,KASAVAJHALA K. ff14SB: Improving the Accuracy of Protein Side Chain and Backbone Parametersfrom ff99SB[J].Journal of Chemical Theory and Computation,2015,11(8):3696-3713.

        [16]MARTINEZ L,ANDRADE R,BIRGIN E G. Packmol: A package forbuilding initial configurations for molecular dynamics simulations [J].Journal of Computational Chemistry,2009,30(13):2157-2164.

        [17]石 靜,李曉霞.Particle-Mesh-Ewald(PME)算法在GPU上的實(shí) 現(xiàn)[J].計(jì)算機(jī)與應(yīng)用化學(xué),2012,29(57),548-554. SHI J,LI X X. Implementation of Particle-Mesh-Ewald(PME)Algorithm on GPU[J]. Journal of Computer and Applied Chemistry, 2012,29(57):548-554.

        [18]LIN Y Q,PAN D Y,LI JM, Application of berendsen barostat in dissipative particle dynamics for nonequilibrium dynamic simulation [J].The Journal of Chemical Physics,DOI:10.1063/1.4978807.

        [19]BOGDAN D,YU Q, NICHOLAS H, et al. Crossover from hydrogen to chemical bonding[J]. Science,2021,371(6525):160-164.

        [20]李承杰.纖維素在離子液體中溶解及再生過程的分子動(dòng)力學(xué)模 擬[D].青島:青島大學(xué),2022. LI C J.Molecular dynamics simulation of cellose dissolution and regeneration process in ionic liquids[D].Qingdao:Qingdao University,2022.

        [21]NISHIYAMA Y,LANGAN P,CHANZY H. Crystal Structure and Hydrogen-bonding System in Cellulose Iβ from Synchrotron X-ray andNeutron FiberDiffraction[J].Journal of the American Chemical Society,2002,124(31):9074-9082.

        [22] ZHANG Q,BULONE V,AGREN H. A molecular dynamics study ofthethermal response of crystalline cellulose Iβ[J].Cellulose, 2011,18(2):207-221.

        [23]QIAN WL,YUAN D,KARLD.H.Revealing the role of hydrogen bonding interactions and supramolecular complexes in lignindissolution by deep eutecticsolvents[J].Journalof MolecularLiquids,DOI:10.1016/j. moliq.2021.117779.

        [24]MELI R,BIGGIN P C. Spyrmsd:Symmetry-corrected RMSD calculationsin Python[J].Journal of Cheminformatics,2020, 12(1): 1-7.

        (責(zé)任編輯:宋佳翼)

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