摘 要:藍藻具較強的適應(yīng)能力,不僅能生活在淡水和海洋等各種水體生境中,也能在土壤、沙漠、極地、溫泉等極端生境中生存.通過野外樣品采集,從中國廣西壯族自治區(qū)桂林市九馬畫山生物土壤結(jié)皮中成功分離到1株藍藻藻株JM-1001,采用形態(tài)學(xué)、生態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)相結(jié)合的多相分析方法對其進行了系統(tǒng)發(fā)育分析和分類特征研究.該藻株為單細胞、絲狀體或群體生活,具有明顯的生活史,具異形胞和厚壁孢子,與科馬雷克藻屬Komarekiella形態(tài)特征極其相似.基于16S rRNA基因系統(tǒng)發(fā)育分析表明,該藻株聚集在科馬雷克藻屬支系中,并且JM-1001和大西洋科馬雷克藻Komarekiella atlantica的序列緊密聚為一個系統(tǒng)進化分支,具有很高的步展值(98/93/1).藻株JM-1001與模式種大西洋科馬雷克藻K. atlantica的16S rRNA基因相似性99.9%.同時,藻株JM-1001和大西洋科馬雷克藻ITS二級結(jié)構(gòu)中的D1-D1′、Box-B和V3螺旋結(jié)構(gòu)一致.這些結(jié)果共同支持了本研究分離的藻株屬于模式種大西洋科馬雷克藻,該屬是中國首次發(fā)現(xiàn)的新記錄屬.
關(guān)鍵詞:藍藻;新記錄屬;系統(tǒng)發(fā)育;分類
中圖分類號:X52;Q949.22""""" 文獻標志碼:A文章編號:1000-2367(2025)02-0073-09
藍藻是一類古老的光合放氧原核生物,為地球有氧環(huán)境做出巨大的貢獻,在地球生命進化過程中扮演著重要角色[1].藍藻是許多生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,其適應(yīng)性很強,能夠在淡水、海洋甚至是極端生境中生存[2].正是藍藻這種較強的適應(yīng)能力、巨大的擴散能力和較快的生長速度[3],使其在生物土壤結(jié)皮和亞氧濕壁組合中也頻繁出現(xiàn)[4].
在過去的20多年里,基于多相分析方法,藍藻分類學(xué)研究發(fā)現(xiàn)了比以前更多的屬,如果僅根據(jù)藻株的形態(tài)結(jié)構(gòu)特征評估,那些最新描述的屬都將被錯誤地認定為傳統(tǒng)屬的成員[5].近年來的研究中,DNA序列及其二級結(jié)構(gòu)在鑒定藍藻類群和解決其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系等問題中起到了關(guān)鍵作用.16S rRNA基因序列是區(qū)分藍藻屬或種的重要標識,也是重組和修訂整個藍藻分類體系的要素[6].但是,單靠該基因也并不能充分地在物種水平上解決藍藻系統(tǒng)發(fā)育問題[7-9],ENGENE等[8]也發(fā)現(xiàn)了16S rRNA基因內(nèi)的差異性并不能作為藍藻分類的絕對標準,也不能準確反映藍藻內(nèi)的物種形成.因此,16S-23S ITS作為新的基因組位點被應(yīng)用于系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建和ITS區(qū)域二級結(jié)構(gòu)的分析中[10].許多研究證實了16S rRNA基因系統(tǒng)發(fā)育和16S-23S ITS二級結(jié)構(gòu)相結(jié)合的綜合性方法對于復(fù)雜的藍藻分類系統(tǒng)來說是非常有用和可靠的[11-12].目前,應(yīng)用分子系統(tǒng)發(fā)育學(xué)、細胞形態(tài)學(xué)和生態(tài)學(xué)等相結(jié)合的多相分析法進行藍藻新類群的鑒定已成為藍藻分類學(xué)研究的最佳
收稿日期:2023-11-07;修回日期:2023-12-15.
基金項目:國家自然科學(xué)基金(32000166).
作者簡介:陳嘉欣(1999-),女,河南南陽人,武漢輕工大學(xué)碩士研究生,研究方向為藍藻的分類與系統(tǒng)發(fā)育學(xué)研究,E-mail:2407525663@qq.com.
通信作者:蔡芳芳(1991-),女,湖北黃岡人,武漢輕工大學(xué)講師,博士,研究方向為藍藻的系統(tǒng)發(fā)育、分子進化與生態(tài)學(xué),藍藻有害產(chǎn)物的研究,E-mail:fangfangcai@whpu.edu.cn.
引用本文:陳嘉欣,席雨,李姝衡,等.中國陸生藍藻新記錄屬——科馬雷克藻屬(Komarekiella)[J].河南師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版),2025,53(2):73-81.(Chen Jiaxin,Xi Yu,Li Shuheng,et al.Komarekiella(Nostocale,Cyanobacteria):a terrestrial novel recorded genus from China[J].Journal of Henan Normal University(Natural Science Edition),2025,53(2):73-81.DOI:10.16366/j.cnki.1000-2367.2023.11.07.0002.)
方法[13-15].
科馬雷克藻屬(Komarekiella)隸屬于念珠藻目(Nostocales),念珠藻科(Nostocaceae)[16].科馬雷克藻屬在形態(tài)特征上與念珠藻屬相似,都具有異形胞和厚壁孢子的分化,藻絲聚集形成群體.但是系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn)科馬雷克藻屬與念珠藻屬在系統(tǒng)進化樹上不聚集在同一個分支,親緣關(guān)系相對較遠,因此,HENTSCHKE等[17]把科馬雷克藻屬Komarekiella從念珠藻屬中分離出來,形成了一個新的藍藻屬.科馬雷克藻屬的模式種是大西洋科馬雷克藻Komarekiella atlantica,是SCOTTA等[17]在2017年從大西洋熱帶雨林(巴西沿海森林)的樹木上首次分離出來的.此模式種的特征如下:藻體最初呈亮藍綠色,隨著增長逐漸變成較暗的藍綠色,并由許多不規(guī)則藻絲體聚集組成,長度可達1 cm;起初藻絲體排列不可見,后來慢慢明顯且分散開來形成多列藻絲體,寬度可達10 μm;成熟的藻絲體再聚集變成球形或壓縮成亞球形,在一個以上的平面上進行分裂,平鋪開來.目前已報道的科馬雷克藻屬有5個物種[15],分別是Komarekiella atlantica[17],K. chia[18],K. delphini-convector[19],K. globosa[20],K. gloeocapsoidea[20].Komarekiella atlantica發(fā)現(xiàn)于大西洋熱帶雨林(巴西沿海森林),K. chia發(fā)現(xiàn)于希臘俄斯島洞穴內(nèi),K. delphiniconvector發(fā)現(xiàn)于美國佛羅里達州杰克遜維爾的圣約翰河,K. globosa發(fā)現(xiàn)于西班牙加那利群島、K. gloeocapsoidea發(fā)現(xiàn)于捷克某地區(qū)的巖石上,這5個種均發(fā)現(xiàn)于國外,而國內(nèi)目前并無該屬的相關(guān)報道.
本研究從中國廣西壯族自治區(qū)桂林市九馬畫山采集并分離到1株藍藻藻株,在形態(tài)特征上與科馬雷克藻屬的物種相似.基于16S rRNA基因序列相似性和系統(tǒng)發(fā)育分析表明,該藻株與科馬雷克藻屬的模式種聚為緊密的一個系統(tǒng)進化分支,且基因序列相似性99.9%;進一步通過ITS二級結(jié)構(gòu)對比分析,確定該藻株為科馬雷克藻屬的模式種:大西洋科馬雷克藻Komarekiella atlantica.這也是我國首次對科馬雷克藻屬的報道.
1 材料與方法
1.1 樣品采集與藻株的分離、純化與培養(yǎng)
1.1.1 藻株樣品的采集
2023年5月,在中國廣西壯族自治區(qū)桂林市九馬畫山潮濕的山體墻壁上(110.496 821°E,24.915 794°N)用鑷子刮取,采集到該藻株的陸生樣品,然后將樣品放入濾紙袋內(nèi)保存,運回實驗室.將陸生樣品放在50 mL容量瓶中復(fù)蘇.
1.1.2 藻株樣品的分離純化與培養(yǎng)
首先將采集到的藻株樣品置于光學(xué)顯微鏡(NEXCOPE,Ningbo,China)下觀察,待藻體或者藻絲分散開來后,用經(jīng)典的毛細管分離法[21]分離純化單根藻體或藻絲,然后轉(zhuǎn)移至裝有無菌BG11液體培養(yǎng)基[22]的24孔培養(yǎng)板中進行培養(yǎng).待藻絲長成肉眼可見的群體時,置于光學(xué)顯微鏡(NEXCOPE,Ningbo,China)下觀察,若為純藻株,即可將24孔培養(yǎng)板中的樣品轉(zhuǎn)移至裝有15 mL無菌BG11培養(yǎng)基的螺旋管中培養(yǎng).24孔培養(yǎng)板和螺旋管的培養(yǎng)條件均為:培養(yǎng)溫度25 ℃,光照周期12h∶12h,光照強度2 000 lx.獲得的純藻株編號為JM-1001,保存于武漢輕工大學(xué)藻類實驗室.
1.2 藻株的形態(tài)學(xué)觀察
待藻株生長至對數(shù)生長期,具有一定的生物量時,即可進行形態(tài)學(xué)觀察.藻株于光學(xué)顯微鏡(NEXCOPE,Ningbo,China)下觀察,用自帶的拍照軟件拍攝獲得該藻株的顯微照片,同時用自帶的輔助軟件(Imageview)測量并記錄細胞的形態(tài)特征數(shù)據(jù),如厚壁孢子、營養(yǎng)細胞、異形胞的長與寬,進行60~100次測量.
1.3 DNA提取、PCR擴增、克隆及測序
分離得到的藻株采用改良后的十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法[23]進行 DNA的提取.16S rRNA基因和16S-23S ITS片段的擴增引物為 PA(5′-AGAGTT-TGATCCTGGCTCAG-3′)和B23S(5′-CTTCGCCTCTGTGTGCCTAGGT-3′)[24-25].PCR擴增體系為:25 μL Premix Taq,2 μL模板DNA,1 μL上游引物,1 μL下游引物,最后加入ddH2O至50 μL.PCR擴增程序為:在95 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸2 min,共34個循環(huán)反應(yīng).PCR產(chǎn)物通過質(zhì)量分數(shù)1%瓊脂糖凝膠電泳分析,目的條帶使用膠純化試劑盒(Omega,USA)進行純化回收,然后將得到的PCR反應(yīng)產(chǎn)物用于克隆測序.
1.4 16S rRNA基因序列比對與系統(tǒng)發(fā)育分析
獲得的序列首先在NCBI網(wǎng)站上進行BLAST對比分析,檢測序列是否正確擴增為所需要的目的片段.為進一步確定藻株JM-1001的系統(tǒng)發(fā)育位置,將目的序列與NCBI網(wǎng)站上下載的念珠藻科的其他種的相關(guān)序列進行比對分析,使用MAFFT v7.312[26]將序列對齊,并使用MEGA v.7.0[27]手工檢查并校正,校正后的序列用于系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建.
用于系統(tǒng)發(fā)育分析的類群包括86條序列,選擇Gloebacter vioiaceus PCC8105作為外類群.系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建采用鄰接法(neighbor joining,NJ),最大似然法(maximum likelihood,ML)和貝葉斯推理法(bayesian inference,BI).其中ML基于GTR+I+G 核酸替代模型,采用PAUP v4.0b10[28]軟件構(gòu)建.BI分析使用軟件CIPRES Science Gateway V.3.3[29]構(gòu)建.最后系統(tǒng)進化樹使用軟件TreeView 1.6.6進行顯示,用Adobe Photoshop CS6 V 13.0進行編輯.16S rRNA的基因序列用MEGA v.7.0[27]軟件進行計算,確定16S rRNA數(shù)據(jù)的序列一致性(100×(1-p)).
藻株JM-1001的16S rRNA和16S-23S ITS基因序列已上傳NCBI GenBank數(shù)據(jù)庫,登錄號為OR758489,OR758490,OR763295,OR763296.
1.5 16S-23S ITS二級結(jié)構(gòu)分析
選取所研究藻株的16S-23S ITS進行二級結(jié)構(gòu)的分析.采用RNA structure ver.6.4軟件[30]測定該藻株的D1-D1′,Box-B和V3螺旋的ITS二級結(jié)構(gòu).并與該屬的2個種類的二級結(jié)構(gòu)進行比較分析.二級結(jié)構(gòu)是在理想條件下創(chuàng)建的,默認溫度固定在37 ℃,結(jié)構(gòu)分配為untangle loop fix.然后使用Adobe Acrobat DC重新繪制二級結(jié)構(gòu).
2 結(jié) 果
2.1 形態(tài)學(xué)觀察
科馬雷克藻屬(念珠藻目,念珠藻科).
大西洋科馬雷克藻Komarekiella atlantica Hentschke,G. S.,Johansen,J. R. et Sant′Anna,C. L. 2017(圖1).
形態(tài)描述:單細胞、絲狀體或群體.群體肉眼可見,小型群體聚集形成大的不規(guī)則群體.藻絲顏色最初呈藍綠色,隨著藻絲生長逐漸變成較暗的藍綠色,生活史前期藻絲細胞單列、雙列或多列排列,寬度可達5~10 μm;后期藻絲緊密聚集形成群體.群體起初可看到多列藻絲,后逐漸無法分辨單個細胞和單列藻絲.成熟的藻絲再變成球形或壓縮成亞球形細胞,在1個以上的平面上進行分裂,營養(yǎng)細胞球形或半球形,直徑為3.4~5.5 μm.異形胞直徑為2.0~3.0 μm,厚壁孢子直徑為3.5~5.0 μm.
實驗藻株:JM-1001.
采樣地區(qū):中國廣西壯族自治區(qū)桂林市九馬畫山.
生境:在潮濕的山體壁上自由生活.
標本號:WHPU-GXGL202305.
2.2 系統(tǒng)發(fā)育分析
通過測序,獲得本研究藻株16S rRNA基因的2個克隆序列,全長分別為1 484 bp和1 483 bp.結(jié)果顯示,藻株與科馬雷克藻屬下的5個種基因序列相似性為96.8%~99.9%,與模式種K. atlantica藻株16S rRNA 基因序列相似性高達99.9%(表1).
基于鄰接法、最大似然法和貝葉斯法3種方法構(gòu)建的16S rRNA基因系統(tǒng)發(fā)育樹(圖2)可知,藻株JM-1001與科馬雷克藻屬下的K. atlantica、K. globosa、K. gloeocapsoidea和K. delphini-convector的序列聚為1個系統(tǒng)進化分支,具有較高的自展支持值(81/93/0.92),說明藻株JM-1001屬于科馬雷克藻屬的類群.藻株JM-1001與模式種K. atlantica在系統(tǒng)進化樹中具有更近的親緣關(guān)系,自展支持率更高(98/93/1),說明JM-1001屬于模式種K. atlantica.
2.3 16S-23S ITS二級結(jié)構(gòu)分析
將本研究的藻株JM-1001,與K. atlantica CCIBt 3483、K. delphini-convector SJR-PJCV1和K. chia TAU-MAC 0117(無V3螺旋)的ITS二級結(jié)構(gòu)進行比較分析(圖3).因K. globosa和K. gloeocapsoidea沒有16S-23S ITS基因序列,相關(guān)文獻也未記錄ITS二級結(jié)構(gòu),所以沒有與這2個種的ITS二級結(jié)構(gòu)進行比較分析.
D1-D1′螺旋分析表明(圖3),實驗藻株JM-1001的D1-D1′'螺旋有66個核苷酸,基部莖包含1個4 bp的螺旋,緊接著為一個右側(cè)帶有9 bp莖環(huán)結(jié)構(gòu)的雙側(cè)凸起,1個雙側(cè)對稱凸起和1個4∶5的雙側(cè)凸起,末端為3 bp的環(huán)狀結(jié)構(gòu).K. atlantica CCIBt3483和K. atlantica CCIBt3487的D1-D1′'螺旋也有66個核苷酸,基部莖包含1個4 bp的螺旋,緊接著為一個右側(cè)帶有9 bp莖環(huán)結(jié)構(gòu)的雙側(cè)凸起,1個雙側(cè)對稱凸起和1個4∶5的雙側(cè)凸起,末端為3 bp的環(huán)狀結(jié)構(gòu).與實驗藻株JM-1001的D1-D1′螺旋一致.K. delphini-convector SJR-PJCV1的D1-D1′螺旋有65個核苷酸,基部莖包含1個5 bp的螺旋,其上為1個2∶7的雙側(cè)凸起,緊接著為1個1∶2的雙側(cè)凸起和1個2∶1的雙側(cè)凸起,其后是1個4∶5的雙側(cè)凸起,末端為3 bp的環(huán)狀結(jié)構(gòu).與實驗藻株JM-1001的D1-D1′螺旋的基部堿基對有差別.K. chia TAU-MAC 0117的D1-D1′螺旋有54個核苷酸,基部莖包含1個5 bp的螺旋,其上為1個6∶1的雙側(cè)凸起,1個2∶1的雙側(cè)凸起,緊接著為1個4∶5的雙側(cè)凸起,末端為3 bp的環(huán)狀結(jié)構(gòu).與實驗藻株JM-1001的D1-D1′螺旋的差別較大.
Box-B螺旋分析表明(圖3),實驗藻株JM-1001的Box-B螺旋有27個核苷酸,基部莖包含1個4 bp的螺旋,其后為1個3 bp雙側(cè)對稱凸起,緊接著為1個4 bp螺旋,末端含有1個5 bp環(huán)狀結(jié)構(gòu)(GAAUA).K. atlantica CCIBt 3483和K. atlantica CCIBt 3487的Box-B螺旋有26個核苷酸,基部莖包含1個4 bp的螺旋,緊接著為1個3 bp雙側(cè)對稱凸起和1個4 bp螺旋,末端為1個4 bp環(huán)狀結(jié)構(gòu)(AAUA).K. delphini-convector SJR-PJCV1的Box-B螺旋有30個核苷酸,基部莖包含1個4 bp的螺旋,緊接著為1個3 bp雙側(cè)對稱凸起和1個6 bp螺旋,末端為1個4 bp環(huán)狀結(jié)構(gòu)(CAGA).K. chia TAU-MAC 0117的Box-B螺旋有27個核苷酸,基部莖包含1個4 bp的螺旋,緊接著為1個3 bp雙側(cè)對稱凸起和1個4 bp螺旋,末端為1個5 bp環(huán)狀結(jié)構(gòu)(GAAUA).
V3螺旋分析表明(圖3),實驗藻株JM-1001的V3螺旋的基部莖包含1個3 bp螺旋,其后緊接著3個雙側(cè)對稱凸起,末端環(huán)狀結(jié)構(gòu)含有4 bp.K. atlantica CCIBt 3483和K. atlantica CCIBt 3487的V3螺旋的基部莖也包含1個3 bp的螺旋,緊接著為3個雙側(cè)對稱凸起,末端為1個4 bp環(huán)狀結(jié)構(gòu).K. delphini-convector SJR-PJCV1的V3螺旋的基部莖包含1個3 bp的螺旋,緊接著為4個雙側(cè)對稱凸起和1個4∶5的雙側(cè)凸起,末端含1個4 bp環(huán)狀結(jié)構(gòu).K. chia TAU-MAC 0117無V3螺旋.
3 討 論
藍藻是生物土壤結(jié)皮群落的主要組成部分,它們是土壤表層的第一批棲息者[31],為創(chuàng)造土壤穩(wěn)定環(huán)境并為下一個生物的產(chǎn)生提供條件[32].研究表明,形態(tài)上相似的藍藻并不屬于同一個類群,而且其命名方式也不符合“藻類、真菌和植物國際命名規(guī)則”[33].近年來,隨著分子生物學(xué)的不斷發(fā)展,利用16S rRNA基因描述新的藍藻分類群變得越來越廣泛,出現(xiàn)了許多新屬和新種,從目到屬和種,揭示了藍藻的遺傳多樣性遠高于其形態(tài)多樣性[5].通過藍藻新類群的不斷發(fā)現(xiàn)或?qū)σ恍┮阎惾旱闹匦陆忉?,藍藻類群的分類體系不斷更新和完善[34].
念珠藻屬是一多系、形態(tài)學(xué)上難以區(qū)分的類群,科馬雷克藻屬是從念珠藻屬中分離出來[35-36].科馬雷克藻屬在形態(tài)上與微觀的念珠藻屬相似,因為它們有重疊的特征,藻絲都具有厚壁孢子和異形胞分化,且藻絲能形成群體.然而,科馬雷克藻屬與典型的念珠藻屬有明顯的不同,它不形成念珠藻屬中發(fā)現(xiàn)的大量藻絲聚集或緊密纏繞形成的由膠被包裹的肉眼可見的圓球形群體.科馬雷克藻屬的獨特之處還在于其特殊的厚壁孢子的萌發(fā)方式,在第1次分裂時會產(chǎn)生1個較大的營養(yǎng)細胞和1個較小的異形胞.其模式種Komarekiella atlantica的典型特征是呈現(xiàn)多束藻絲和不均等的厚壁孢子.本研究分離得到的藻株JM-1001與科馬雷克藻屬模式種的形態(tài)特征相同,都有厚壁孢子,且出現(xiàn)由營養(yǎng)細胞分化形成的異形胞,整個生活史的過程也相似,細胞外無膠被包裹.從生態(tài)學(xué)上看,模式種參考藻株發(fā)現(xiàn)于大西洋巴西沿岸熱帶雨林的樹皮上;本研究藻株發(fā)現(xiàn)于我國桂林市陽朔縣九馬畫山(亞熱帶地區(qū)),從山體墻壁上分離下來,與模式種具有相似的生境.16S rRNA基因相似性表明,實驗藻株與參考藻株Komarekiella atlantica CCIBt 3481、K. atlantica CCIBt 3552、K. chia TAU-MAC 0117、K. delphini-convector SJR-PJCV1、K. globosa PJ104和K. gloeocapsoidea PJ101的基因序列相似性極高,達到96.8%~99.9%,高于細菌學(xué)上屬的劃分界限,進一步說明實驗藻株屬于科馬雷克藻屬;并且實驗藻株與模式種K. atlantica CCIBt 3481和K. atlantica CCIBt 3552的序列同源相似性最高,達到99.9%,說明實驗藻株屬于模式種K. atlantica的藻株.16S rRNA系統(tǒng)發(fā)育樹分析表明,實驗藻株與科馬雷克藻屬中的模式種參考藻株單獨聚在1個分支上,具有很近的親緣關(guān)系;同時,16S-23S ITS二級結(jié)構(gòu)也表明,實驗藻株JM-1001的D1-D1′、Box-B和V3螺旋結(jié)構(gòu)也與模式種參考藻株一致.因此,綜合形態(tài)學(xué)特征、生態(tài)學(xué)、16S rRNA系統(tǒng)發(fā)育分析和ITS二級結(jié)構(gòu)的結(jié)果,分離自廣西壯族自治區(qū)桂林市陽朔縣九馬畫山的陸生藍藻藻株JM-1001屬于大西洋科馬雷克藻.科馬雷克藻屬是中國的新記錄屬,大西洋科馬雷克藻Komarekiella atlantica JM-1001是中國的新記錄種.
本研究中還發(fā)現(xiàn),在系統(tǒng)進化樹中Komarekiella chia與Parakomarekiella sp. 9E-03聚為1個緊密的分支,親緣關(guān)系很近;其與科馬雷克藻屬的另外4個種處于不同屬水平上的分支中.SOARES等[16]在2020年曾提出Parakomarekiella與科馬雷克藻屬在形態(tài)學(xué)上非常相似,但是在異形胞大小、厚壁孢子內(nèi)容物上有較小的區(qū)別.并且通過系統(tǒng)發(fā)育分析表明Parakomarekiella與Komarekiella分別處于獨立的分支中.這與本研究系統(tǒng)發(fā)育分析的結(jié)果較為一致.因此,科馬雷克藻屬的分類盡管現(xiàn)在取得了一些較好的進展,但是未來希望能夠進一步的修訂,使其分類地位更加完善和精確.
本研究中的科馬雷克藻屬是在中國(桂林市陽朔縣九馬畫山)的首次報道,顯示出我國陸生藍藻的物種多樣性.未來希望能夠繼續(xù)應(yīng)用多相分析方法去發(fā)現(xiàn)、分離和鑒定更多的藍藻,也期待探索不同生境下藍藻多樣性和豐富度信息,為藍藻分類學(xué)和其他生物學(xué)的研究提供更多的材料.
參 考 文 獻
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Komarekiella(Nostocale,Cyanobacteria):a terrestrial novel recorded genus from China
Chen Jiaxin1, Xi Yu2, Li Shuheng1, Cai Fangfang1
(1. School of Animal Science and Nutritional Engineering, Wuhan Polytechnic University, Wuhan 430072, China;
2. Ecological Environment Monitoring and Scientific Research Center, Taihu Basin" amp;" East China
Sea Ecological Environment Supervision and Administration Bureau, Ministry of
Ecology and Environment, Shanghai 200125, China)
Abstract: Cyanobacteria, with strong adaptability, living in not only freshwater and marine environments, but also desert, polar, hot springs and other extreme habitats. In this study, a strain of cyanobacteria, JM-1001, was isolated and purified from the soil layer of Jiumahuashan, Guilin City, Guangxi Zhuang Autonomous Region, China. The phylogenetic and taxonomic characteristics of JM-1001 were studied based on"" polyphasic analysis combining morphological, ecological and molecular data. Morphological characteristics of the cyanobacteria strain was very similar to Komarekiella, which with unicellular, filamentous or in colonies, distinct life history, heterocytes and akinete. The phylogenetic analysis of 16S rRNA gene sequence manifested that this strain was clustered in the Komarekiella clade, and JM-1001 and Komarekiella atlantica were closely clustered into a phylogenetic clade with high bootstrap values(98/93/1). The 16S rRNA gene similarity between JM-1001 and K." atlantica is 99.9%, which supports it to be a member of K. atlantica. In addition, the 16S-23S ITS secondary structure of JM-1001 is consistent with that of K. atlantica. All results supported it to be a member of K. atlantica. And the genus Komarekiella is a newly recorded genus in China.
Keywords: cyanobacteria; new recorded genus; phylogenetic; taxonomy
[責任編校 劉洋 趙曉華]