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        基于Logistic模型的上海青生長模擬三維可視化建模技術(shù)

        2024-12-31 00:00:00葉榮向萬娥許俊強(qiáng)章廣傳高泉
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2024年20期
        關(guān)鍵詞:可視化作物葉片

        doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.20.007

        摘要:虛擬作物的三維可視化研究在計(jì)算機(jī)教學(xué)、生態(tài)學(xué)等領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用前景,尤其在作物生長過程研究方面更是具有重要意義。針對(duì)上海青形態(tài)結(jié)構(gòu)復(fù)雜、上海青生長可視化不易實(shí)現(xiàn)的問題,以上海青作為研究對(duì)象,在國內(nèi)外已有的研究基礎(chǔ)上,應(yīng)用物聯(lián)網(wǎng)技術(shù)對(duì)溫室大棚進(jìn)行數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)采集,并在試驗(yàn)數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上構(gòu)建Logistic方程模擬隨有效積溫變化的上海青生長模型。通過Logistic模型擬合參數(shù)發(fā)現(xiàn),上海青葉長、葉寬、株高3個(gè)模型的絕對(duì)誤差值分別為0~3.88、0~0.28、0~2.72 cm,RMSE值分別為0.09~1.68、0.02~0.15、0.04~1.26 cm,da值分別為0.20~1.44、0.02~0.12、0.36~1.11 cm,dap值分別為1.03%~9.69%、1.72%~9.0%和1.4%~16.5%,所建模型精度較高,能較好地預(yù)測不同生長周期的上海青生長發(fā)育,實(shí)現(xiàn)了上海青生長過程的動(dòng)態(tài)三維可視化表達(dá)。本研究結(jié)果為上海青作物的栽培管理調(diào)控和動(dòng)態(tài)生長預(yù)測提供了有效的可視化工具,為上海青作物的高產(chǎn)、高效和理想株型篩選提供了技術(shù)支撐。

        關(guān)鍵詞:上海青;生長模擬;三維可視化;形態(tài)結(jié)構(gòu);Logistic模型;葉長;葉寬;株高;有效積溫

        中圖分類號(hào):S126:TP391.9" 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

        文章編號(hào):1002-1302(2024)20-0049-07

        收稿日期:2023-11-28

        基金項(xiàng)目:云南省基礎(chǔ)研究計(jì)劃(編號(hào):202101AU070096);云南省重大科技專項(xiàng)(編號(hào):202302AE090020);云南省基礎(chǔ)研究計(jì)劃面上項(xiàng)目(編號(hào):202201AT070981)。

        作者簡介:葉" 榮(1993—),男,云南玉溪人,博士研究生,研究方向?yàn)槭称钒踩畔⒒c數(shù)字農(nóng)業(yè)。E-mail:307176152@qq.com。

        通信作者:高" 泉,研究方向?yàn)橹腔坜r(nóng)業(yè)。E-mail:312441310@qq.com。

        隨著科技的發(fā)展和計(jì)算機(jī)圖形技術(shù)的不斷進(jìn)步,三維可視化(3D)技術(shù)在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域的應(yīng)用日益廣泛[1-3]。作物生長過程是一個(gè)復(fù)雜的動(dòng)態(tài)過程,通過三維可視化技術(shù),研究人員可以將作物的生長過程以立體圖形的形式展現(xiàn)出來,更直觀地觀察作物的形態(tài)結(jié)構(gòu)和生理功能的變化。本試驗(yàn)重點(diǎn)通過對(duì)上海青的生長模型與形態(tài)結(jié)構(gòu)模型相結(jié)合的研究,建立起上海青的三維生長可視化模型,真實(shí)地展現(xiàn)田間實(shí)際生產(chǎn)條件下上海青形態(tài)結(jié)構(gòu)的動(dòng)態(tài)變化。三維可視化技術(shù)可以為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)提供新的技術(shù)手段,有助于作物種植的規(guī)劃、管理和預(yù)測,提高作物產(chǎn)量和質(zhì)量。利用三維可視化和虛擬現(xiàn)實(shí)技術(shù),可以生動(dòng)展現(xiàn)作物的生長過程和形態(tài),使用戶能夠通過虛擬交互方式參與其中,深入理解農(nóng)業(yè)知識(shí)。這種技術(shù)不僅可以為作物教學(xué)和知識(shí)傳播提供強(qiáng)大工具,同時(shí)也可廣泛應(yīng)用于作物優(yōu)化栽培管理和揭示產(chǎn)量形成規(guī)律等領(lǐng)域。因此,建立的三維動(dòng)態(tài)模型在當(dāng)前國內(nèi)外農(nóng)業(yè)科技研究中具有重要意義,也是該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。

        作物模型通常分為形態(tài)結(jié)構(gòu)模型和生長模型,形態(tài)模型為選擇作物的理想形態(tài)和提高產(chǎn)量提供技術(shù)支持[4-6],生長模型在作物管理和產(chǎn)量預(yù)測方面扮演著關(guān)鍵角色。馬戰(zhàn)林等利用集合卡爾曼濾波算法對(duì)不同生長點(diǎn)的產(chǎn)量進(jìn)行估測[7];而金梁等指出,作物生長模型可以評(píng)估土壤、微氣候、水分和管理因素對(duì)作物生長的影響,從而預(yù)測作物的生長狀態(tài)[8]。在形態(tài)結(jié)構(gòu)模型研究方面,研究人員利用形態(tài)學(xué)建模方法,在Lab色彩空間中建立裁剪顏色模型,以實(shí)現(xiàn)裁剪圖像的分割和為作物創(chuàng)建3D模型仿真[9-11]。

        以上研究分別針對(duì)作物生長模型和形態(tài)結(jié)構(gòu)模型展開,但是沒有將兩者結(jié)合起來,目前國內(nèi)外研究作物小麥、黃瓜等生育期模擬研究已有報(bào)道,但在上海青中至今尚未報(bào)道。因此,本試驗(yàn)以上海青作為研究對(duì)象,基于上海青形態(tài)特征參數(shù),利用計(jì)算機(jī)圖形學(xué)顯示技術(shù)構(gòu)建上海青器官的三維幾何模型。在前述研究基礎(chǔ)上,結(jié)合計(jì)算機(jī)圖形學(xué)的三維圖形處理相關(guān)庫函數(shù),對(duì)上海青器官模型進(jìn)行顏色渲染、光照處理和紋理映射等高級(jí)圖形真實(shí)感顯示技術(shù)的處理。通過利用這些技術(shù),能夠更加生動(dòng)地展現(xiàn)上海青在不同生長階段的形態(tài)結(jié)構(gòu)和生長狀態(tài),使得觀察者可以更直觀地感受到作物生長的動(dòng)態(tài)過程(圖1)。本研究結(jié)果為上海青作物種植規(guī)劃、產(chǎn)量預(yù)測、栽培管理調(diào)控等提供重要參考,進(jìn)一步促進(jìn)農(nóng)業(yè)知識(shí)的傳播和教學(xué)工作,為農(nóng)業(yè)領(lǐng)域的科研和生產(chǎn)工作帶來更多的創(chuàng)新和發(fā)展機(jī)遇。

        1" 材料與方法

        1.1" 試驗(yàn)區(qū)概況

        云南農(nóng)業(yè)大學(xué)為本研究的試驗(yàn)基地,其優(yōu)越的地理位置和環(huán)境條件為“滇臺(tái)農(nóng)業(yè)技術(shù)轉(zhuǎn)移及產(chǎn)業(yè)化示范中心”提供了理想條件,以推進(jìn)對(duì)上海青的研究。該中心依托云南在高原特色農(nóng)業(yè)領(lǐng)域的專業(yè)優(yōu)勢,專注解決云南園藝作物研發(fā)中的關(guān)鍵問題和共性技術(shù)挑戰(zhàn)。該基地還配備各種傳感器,如溫度、光照度、濕度等傳感器(具體參數(shù)見表1),能夠自動(dòng)采集溫室內(nèi)的環(huán)境數(shù)據(jù),同時(shí)實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的管理和分析。根據(jù)需要,可自動(dòng)或半自動(dòng)控制溫室內(nèi)的卷簾、風(fēng)機(jī)等設(shè)備,實(shí)現(xiàn)智能化、 自動(dòng)化的溫室環(huán)境調(diào)控,為溫室作物提供理想舒適的生長環(huán)境。

        1.2" 田間試驗(yàn)設(shè)計(jì)

        田間試驗(yàn)在2個(gè)試驗(yàn)基地進(jìn)行,分別在云南農(nóng)業(yè)大學(xué)滇臺(tái)中心溫室大棚內(nèi)和大棚外,試驗(yàn)基地式樣如圖2所示。

        具體試驗(yàn)方案如下:

        試驗(yàn)1,于2021年11月至2022年2月在云南農(nóng)業(yè)大學(xué)滇臺(tái)中心后面試驗(yàn)基地進(jìn)行。2021年11月2日播種,分別在3個(gè)不同環(huán)境(盆栽、穴盤、土壤栽培)進(jìn)行播種,6次重復(fù),共計(jì)27個(gè)小區(qū)。在苗期每天適當(dāng)澆水,后期澆水加入適量的天澤豐有機(jī)水溶肥料。定植后,中耕與施肥結(jié)合進(jìn)行。施肥前疏松表土,定植1周后開始追肥,每隔10 d施肥1次,施肥量為4 kg/次水+0.05 kg/次肥,全期追肥3~4次,濃度由淡至濃,逐步提高。室內(nèi)和室外均一致,統(tǒng)一管理。每個(gè)處理室內(nèi)、室外(盆栽、穴盤、土壤栽培)選取3株上海青,利用直尺人工定株測量上海青葉長、葉寬和株高等形態(tài)指標(biāo),每隔5~7 d采集1次上海青形態(tài)數(shù)據(jù)。用品氏基質(zhì)(PINDSTRUP)與土壤混合起來,采用水蘚泥炭制成的基質(zhì)有利于植物根系生長,這是因?yàn)楦抵車鯕夂投趸嫉葰怏w充分交換。葉片長度為葉片伸直狀態(tài)下自葉片底部到葉片尖端的直線距離,葉片寬度為葉片中部位置測量長度,葉片株高為地面到葉片尖端的距離。

        試驗(yàn)2,于2021年11月29日在云南農(nóng)業(yè)大學(xué)試驗(yàn)基地大棚內(nèi)、大棚外播種,種植作物上海青,品種為華冠青梗菜,采用盆栽、穴盤、土壤栽培等作對(duì)比。植株行間距為20~30 cm,使用天澤豐有機(jī)水溶肥料,施肥量為4 kg/次水+0.05 kg/次肥,室內(nèi)和室外均一致,統(tǒng)一管理。從出苗開始,在每個(gè)小區(qū)內(nèi)選取長勢相近的3株上海青,作為3次重復(fù)定點(diǎn)定株測量。測量周期:出苗到幼苗期測量2次,幼苗期到成長期測量2次,成長期到成熟期測量2次。

        試驗(yàn)3,于2021年12月29日在云南農(nóng)業(yè)大學(xué)試驗(yàn)基地大棚內(nèi)、大棚外播種,采用盆栽、穴盤、土壤栽培等作對(duì)比。植株行間距為20~30 cm,使用天澤豐有機(jī)水溶肥料,施肥量為4 kg/次水+0.05 kg/次肥,室內(nèi)和室外均一致,統(tǒng)一管理。從出苗開始,在每個(gè)小區(qū)內(nèi)選取長勢相近的3株上海青,作為3次重復(fù)定點(diǎn)定株測量;與試驗(yàn)1和試驗(yàn)2均一致。

        在研究期間,總共4個(gè)生長周期(2021年11月至2022年2月),合計(jì)進(jìn)行了16次數(shù)據(jù)測量工作。每次測量周期內(nèi)均分別對(duì)大棚內(nèi)、大棚外選取形態(tài)相似的3株進(jìn)行測量,并在每個(gè)田間小區(qū)拍攝不同時(shí)期葉片的生長狀態(tài)、紋理細(xì)節(jié)等。為了方便進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì),將每次測量的形態(tài)數(shù)據(jù)記入上海青形態(tài)數(shù)據(jù)記錄表(表2)。

        1.3" 上海青器官模型構(gòu)建

        本研究以華冠青梗菜上海青為研究對(duì)象,前期多次農(nóng)業(yè)試驗(yàn)數(shù)據(jù)表明,上海青葉長、葉寬和株高的生長速率表現(xiàn)為初期生長緩慢、中期逐漸加快,接近線性生長后期達(dá)到一定界限后生長速率趨于緩慢,生長規(guī)律符合“S”形生長曲線特點(diǎn),故適用于Logistic模型擬合[12-15]。利用Microsoft Excel 2020和MySQL數(shù)據(jù)庫對(duì)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,并利用均方誤差(RMSE)、絕對(duì)誤差(da)以及實(shí)測數(shù)據(jù)與平均準(zhǔn)確測量值的比率(dap),構(gòu)建了上海青的形態(tài)結(jié)構(gòu)模型。

        RMSE=∑ni=1(OBSi-SIMi)2n;

        di=|OBSi-SIMi|;da=∑ni=1din;

        dap=daOBSi×100%。

        式中:OBSi是測量值;SIMi是模擬值;OBSi實(shí)測得到的平均值;n為樣本數(shù);di為絕對(duì)誤差值。dap取值越小,實(shí)測值與模擬值一致性越好,它的取值范圍為 0~100%。da的取值范圍和RMSE的取值范圍為(0,+∞),其中0為最優(yōu)值,它的取值越接近于0,模擬值越接近實(shí)測值。

        1.4" 上海青模型構(gòu)建

        1.4.1" 基于Logistic理論與有效積溫生長模型的構(gòu)建

        通過實(shí)際形態(tài)數(shù)據(jù)的采集,利用Logistic方程建立上海青葉長、葉寬和株高的生長模擬模型,并對(duì)其進(jìn)行了驗(yàn)證。根據(jù)上海青對(duì)環(huán)境變化的反應(yīng),本試驗(yàn)記錄了室內(nèi)、室外的日平均氣溫(圖3)。本研究以度日(d)為時(shí)間步長,逐時(shí)累計(jì)計(jì)算出上海青 1 d 內(nèi)累計(jì)的有效積溫,并逐日累積計(jì)算出生育期上海青的有效積溫(圖4)。由于成長期收集到的信息豐富,容易建立模型,因此本研究以成長期的形態(tài)數(shù)據(jù)信息建立模擬模型,并對(duì)所建模型進(jìn)行檢驗(yàn)。

        1.4.2" 葉長、葉寬、株高模擬模型的構(gòu)建

        通過對(duì)上海青主要性狀的生長數(shù)據(jù)進(jìn)行Logistic擬合,得到上海青生長曲線的回歸方程。同時(shí),導(dǎo)出“試驗(yàn)3”中的田間實(shí)際測量數(shù)據(jù)進(jìn)行模型驗(yàn)證,葉長、葉寬、株高的誤差表見表3、表4、表5。

        葉長的回歸方程:

        LN=3.865+0.005Tn+0.000 008×T2n。

        葉寬的回歸方程:

        SD=3+0.002 4Tn+0.000 004×T2n。

        株高的回歸方程:

        PH=4.5+0.000 93Tn+0.000 007×T2n。

        利用溫度數(shù)據(jù)計(jì)算上海青生長期間的平均有效積溫,并將“試驗(yàn)3”的實(shí)測值與之進(jìn)行擬合,葉長、葉寬、株高的擬合度分別為0.99、0.97、0.99。表3、表4、表5表明,上海青葉長模型的絕對(duì)誤差值為0~3.88 cm,RMSE值為0.09~1.68 cm、da值為0.20~1.44 cm、dap值為1.03%~9.69%;上海青葉寬的模型絕對(duì)誤差值為0~0.28 cm,RMSE值為0.02~0.15 cm,da值為0.02~0.12 cm,dap值為1.72%~9.00%; 上海青株高模型的絕對(duì)誤差值為 0~2.72 cm,RMSE值為0.04~1.26 cm,da值為0.36~1.11 cm, dap值為1.40%~16.50%, 表明模

        型精度較高。

        2" 結(jié)果與分析

        在計(jì)算機(jī)輔助幾何等領(lǐng)域,使用NURBS曲線和曲面建模方法對(duì)上海青曲面的擬合過程,可以逐步優(yōu)化上海青曲面的三維結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì),以達(dá)到最優(yōu)的設(shè)計(jì)效果[16-19],同時(shí)非均勻有理B樣條(NURBS樣條)曲線具有局部性、靈活性、自由曲面表達(dá)清晰等優(yōu)點(diǎn),通過物聯(lián)網(wǎng)技術(shù)采集到的上海青形狀數(shù)據(jù)信息,獲取上海青的狀態(tài)參數(shù),并成功創(chuàng)建了上海青的實(shí)體模型。結(jié)合Blender中的OpenGL圖形庫[20],成功顯示了上海青形狀幾何模型的三維可視化。

        2.1" 上海青葉片紋理映射效果

        在對(duì)上海青形態(tài)結(jié)構(gòu)模型進(jìn)行深度模擬過程中,不僅要準(zhǔn)確地模擬三維形態(tài),還需要在生長細(xì)節(jié)表達(dá)上下工夫,以達(dá)到更加逼真的視覺效果。參考國內(nèi)外的研究成果,對(duì)上海青器官的幾何模型進(jìn)行真實(shí)感圖形渲染,生成形象逼真的上海青三維可視化模型。在圖形渲染的過程中,特別需要注意處理上海青葉片的紋理效果(圖5)[21-22]。從圖5可以看出,在進(jìn)行紋理映射之前,上海青葉片形態(tài)模型距離田間環(huán)境真實(shí)效果差距較大,真實(shí)感效果有待加強(qiáng),進(jìn)行紋理映射后,葉片的細(xì)節(jié)信息得到表達(dá),上海青葉片器官模型真實(shí)感強(qiáng)。但對(duì)于上海青葉片、莖稈等器官,不同生長期紋理圖片較難獲得,因此,真實(shí)模擬田間環(huán)境中的上海青紋理變化存在較大難度。

        2.2" 上海青葉片顏色渲染和光照處理效果

        為了更加真實(shí)地呈現(xiàn)上海青不同器官的細(xì)節(jié)信息,本研究對(duì)上海青葉片和莖稈采用了紋理映射和光照處理的方法,處理效果如圖6所示。經(jīng)過顏色渲染和光照處理[23-25]后,上海青的葉片顏色更加生動(dòng),光照效果更加逼真,整體呈現(xiàn)出更強(qiáng)的真實(shí)感。

        目前,國內(nèi)外研究在作物生長可視化方面做了許多工作,但作物是一個(gè)有生命的個(gè)體,其中它的形態(tài)結(jié)構(gòu)極其復(fù)雜,其生長過程受環(huán)境的影響,逼真實(shí)現(xiàn)作物形態(tài)結(jié)構(gòu)的生長可視化是一個(gè)巨大的挑戰(zhàn)。因此,作物生長可視化模擬仍然存在許多待研究解決的技術(shù)問題。虛擬上海青可作為虛擬作物的一個(gè)研究方向。

        2.3" 上海青生長模擬與三維可視化技術(shù)實(shí)現(xiàn)

        在已構(gòu)建的上海青生長模擬模型、實(shí)測數(shù)據(jù)、形態(tài)結(jié)構(gòu)模型基礎(chǔ)上,實(shí)現(xiàn)上海青生長個(gè)體的動(dòng)態(tài)可視化,即上海青生長階段的個(gè)體三維可視化表達(dá)(圖7)。

        3" 討論與結(jié)論

        目前,國內(nèi)外已有關(guān)于作物如小麥、黃瓜等生育期模擬研究的報(bào)道,但關(guān)于上海青的研究尚未見報(bào)道。本研究不僅實(shí)現(xiàn)了對(duì)上海青的三維動(dòng)態(tài)模擬,還結(jié)合上海青生長模擬模型的輸出數(shù)據(jù),通過

        逐日展現(xiàn)上海青的動(dòng)態(tài)生長過程,成功構(gòu)建了上海青生長模擬與三維可視化模型。

        通過對(duì)上海青葉長、葉寬、株高等不同生長指標(biāo)進(jìn)行擬合,發(fā)現(xiàn)生長規(guī)律均符合“S”形生長曲線,擬合效果達(dá)到了0.97以上,效果較好。

        未來的工作需要進(jìn)一步完善上海青形態(tài)結(jié)構(gòu)模型,包括對(duì)上海青根系進(jìn)行三維建模,以使整個(gè)模型更加完整。同時(shí),還需要利用不同品種和栽培條件下的試驗(yàn)數(shù)據(jù),實(shí)現(xiàn)上海青群體的可視化,并利用試驗(yàn)數(shù)據(jù)廣泛測試和驗(yàn)證上海青的生長情況,不斷提高模型的準(zhǔn)確性和可靠性,使得上海青生長的可視化能夠更加逼真地模擬其自然生長過程。

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