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        基于改進(jìn)Swin-Unet的小麥條銹病分割方法

        2024-12-27 00:00:00臧賀藏任帥王從勝王盛威趙瑞玲陳丹丹趙晴張杰鄭國清李國強(qiáng)
        山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2024年12期

        摘要:條銹病是影響小麥產(chǎn)量及糧食安全的重要因素,條銹病圖像的精準(zhǔn)分割是實(shí)現(xiàn)計(jì)算機(jī)輔助精準(zhǔn)防治的重要基礎(chǔ)。針對(duì)小麥條銹病圖像中病斑形態(tài)復(fù)雜、病斑與非病斑之間邊界模糊、分割精度低的問題,本研究提出了一種基于改進(jìn)Swin-Unet的小麥條銹病圖像分割方法,通過在Swin-UneT中引入SENet(Squeeze-and-Excitation Networks)和殘差網(wǎng)絡(luò)(ResNeT)模塊來增強(qiáng)模型對(duì)條銹病特征的表達(dá)能力。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,改進(jìn)Swin-UneT對(duì)背景、孢子和葉片的查準(zhǔn)率分別為99.24%、82.32%和94.36%,可以從復(fù)雜環(huán)境中有效分割出背景、孢子和葉片圖像,具有較好的計(jì)算機(jī)視覺處理能力和分割評(píng)估效果。改進(jìn)Swin-Unet總體分割準(zhǔn)確率、平均交并比和均像素準(zhǔn)確率分別為96.88%、84.91%和90.50%,較Swin-Unet分別提高了2.84、4.64個(gè)和5.38個(gè)百分點(diǎn);與其他網(wǎng)絡(luò)模型(U-Net、PSPNet、DeepLabV3+和Swin-Unet)相比,改進(jìn)Swin-Unet具有最佳分割效果。表明本研究提出的方法可以精準(zhǔn)檢測和分割小麥條銹病圖像,這可為田間復(fù)雜環(huán)境下小麥條銹病的自動(dòng)檢測和早期預(yù)防提供技術(shù)支持。

        關(guān)鍵詞:小麥條銹??;語義分割;Swin-Unet;注意力機(jī)制

        中圖分類號(hào):S126 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A 文章編號(hào):1001-4942(2024)12-0147-07

        小麥?zhǔn)鞘澜缟现匾募Z食作物,可為全球約三分之一的人口提供糧食。國家統(tǒng)計(jì)局網(wǎng)站數(shù)據(jù)顯示,2023-2024年度河南省小麥播種面積2 309萬hm2,產(chǎn)量1 382億kg。隨著我國人口基數(shù)的增加、耕地面積的減少,實(shí)現(xiàn)小麥自給自足的根本出路在于提高單產(chǎn)。然而,據(jù)FAO估算,全世界每年由病蟲害導(dǎo)致的糧食減產(chǎn)約占總產(chǎn)量的25%。條銹病是我國華北小麥種植區(qū)常年頻發(fā)的病害之一,可導(dǎo)致部分麥田大量減產(chǎn),嚴(yán)重影響我國小麥生產(chǎn)和糧食安全,培育抗病小麥品種和早期防治是降低其危害的重要手段。鑒于此,探索快速、智能的小麥條銹病圖像分割方法,實(shí)現(xiàn)田間復(fù)雜環(huán)境下小麥條銹病的自動(dòng)檢測,可為其早期防治提供技術(shù)支持。

        目前,在作物育種實(shí)踐中,研究者致力于培育抗病小麥品種,開發(fā)小麥抗病表型精準(zhǔn)預(yù)測方法。但在實(shí)際生產(chǎn)中,小麥條銹病的調(diào)查大多仍主要依靠人工田間調(diào)查,耗時(shí)耗力且準(zhǔn)確性低。隨著遙感技術(shù)的快速發(fā)展,諸多學(xué)者借助遙感技術(shù),基于遙感圖像中光譜特征的提取,實(shí)現(xiàn)了作物病害識(shí)別及發(fā)病程度估算?;谶b感技術(shù)的病害檢測方法主要有經(jīng)驗(yàn)統(tǒng)計(jì)模型和機(jī)器學(xué)習(xí)方法,其中經(jīng)驗(yàn)統(tǒng)計(jì)模型較為簡單且只需要較少的輸入數(shù)據(jù),被廣泛用作基于過程模型的常見替代方案,可以評(píng)估作物病害的嚴(yán)重程度;機(jī)器學(xué)習(xí)方法近年來發(fā)展較快,常見的隨機(jī)森林法、支持向量機(jī)法和偏最小二乘法等已在作物病害監(jiān)測領(lǐng)域取得成功。例如:Pujari等利用Radon變換和投影算法處理小麥、玉米等谷物感染白粉病、葉銹病等真菌病害的圖像,使用支持向量機(jī)算法實(shí)現(xiàn)了不同病害的檢測與分類;Xu等將清晰的小麥葉銹病圖像轉(zhuǎn)換為RGB模型中的G單通道灰度圖像,基于Sober算法進(jìn)行垂直邊緣檢測,通過計(jì)算病斑與葉片的面積比例對(duì)小麥發(fā)病等級(jí)做出準(zhǔn)確診斷:Guo等基于無人機(jī)圖像提取的植被指數(shù)和紋理特征,建立了基于偏最小二乘回歸法的小麥黃銹病監(jiān)測模型。

        近年來,基于深度學(xué)習(xí)的各種神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)由于對(duì)圖像處理的高效性和成本優(yōu)勢,被廣泛用于作物病害圖像的自動(dòng)檢測,能夠解決傳統(tǒng)人工方法效率低且費(fèi)時(shí)費(fèi)力的問題,進(jìn)一步提高病害檢測的效率和準(zhǔn)確性。例如為了解決傳統(tǒng)圖像在分割場景和任務(wù)需求方面的局限性,鮑文霞等根據(jù)小麥赤霉病發(fā)生區(qū)域與健康區(qū)域的顏色分布特點(diǎn),利用多路卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)小麥赤霉病圖像進(jìn)行識(shí)別;Zhang等利用全卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和脈沖耦合神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)田間背景下麥瘟病的嚴(yán)重程度進(jìn)行了快速、準(zhǔn)確的識(shí)別與劃分。

        隨著計(jì)算機(jī)視覺技術(shù)的快速發(fā)展,深度學(xué)習(xí)在作物病害圖像分割任務(wù)中取得顯著進(jìn)展:Zhang等提出了小麥赤霉病孢子分割模型CRF_ResUNet++,MIoU達(dá)到0.943;Li等提出了一種采用注意力引導(dǎo)和規(guī)模感知策略的改進(jìn)Res-UNet網(wǎng)絡(luò)。以上研究能夠?qū)π←溔~片病害圖像的特征進(jìn)行深層次的提取,但不能充分利用小麥葉片圖像豐富的上下文信息,仍然會(huì)存在細(xì)節(jié)丟失、邊界模糊等問題。因此,如何實(shí)現(xiàn)病斑區(qū)域的精準(zhǔn)分割,是作物病害檢測的關(guān)鍵問題。隨著人工智能技術(shù)的不斷進(jìn)步,Transformer架構(gòu)在計(jì)算機(jī)視覺領(lǐng)域取得了突破性進(jìn)展,Swin-Un-et是基于iranstormer的分割網(wǎng)絡(luò),利用Transformer有效解決了U型網(wǎng)絡(luò)在處理大尺度圖像時(shí)計(jì)算量過大、物體邊緣分割不清晰等問題。張?jiān)降忍岢隽嘶诟倪M(jìn)Swin-Unet的遙感圖像分割方法,解決了遙感圖像邊界分割不連續(xù)、目標(biāo)漏分等問題,提高了遙感圖像分割的精度。目前在小麥條銹病圖像分割方面也取得了一定的研究成果,如Su等提出了一種將語義分割模型UNet、無人機(jī)多光譜和RGB影像相結(jié)合的小麥條銹病識(shí)別框架。然而,該方法用到的標(biāo)簽數(shù)據(jù)較為稀缺,使得準(zhǔn)確率不高,因此不能做到大范圍推廣。本研究針對(duì)小麥條銹病的病斑形態(tài)復(fù)雜、病斑與非病斑之間邊界模糊、分割精度低的問題,提出了基于改進(jìn)Swin-Unet的小麥葉片條銹病圖像分割方法,以Swin-Unet模型為基礎(chǔ)架構(gòu),結(jié)合SENet和ResNet模塊來增強(qiáng)模型對(duì)條銹病特征的表達(dá)能力,以期為小麥條銹病精準(zhǔn)分割及病害自動(dòng)化檢測提供技術(shù)支撐。

        1材料與方法

        1.1數(shù)據(jù)集構(gòu)建

        基于人工智能系統(tǒng)的作物病害處理數(shù)據(jù)集(Crop Disease Treatmem Dataset,CDTS)是青海省第一個(gè)開放的小麥條銹病圖像數(shù)據(jù)集(數(shù)據(jù)來源:https://pan.baidu.com/s/lhYmyjxyFsWQpMr06FixOug?pwd=fpOk)。青海省農(nóng)業(yè)科學(xué)院科研人員在小麥條銹病栽培溫室中使用不同的移動(dòng)設(shè)備拍攝,共獲得2 353張538種不同分辨率的原始圖像,包含了上午、中午、晚上不同光照和不同角度下的圖像:將原始圖像劃分為多個(gè)512×512像素的小圖像,構(gòu)建了含有33 238張圖像的CDTS數(shù)據(jù)集。該數(shù)據(jù)集中小麥條銹病圖像示例如圖1所示。CDTS數(shù)據(jù)集提供的圖像和標(biāo)注為使用深度學(xué)習(xí)算法進(jìn)行小面積、高相似度語義分割提供了數(shù)據(jù)支持。

        本研究從CDTS數(shù)據(jù)集中隨機(jī)挑選2 000張小麥條銹病圖像,然后按照8:1:1的比例劃分訓(xùn)練集、驗(yàn)證集和測試集。

        1.2改進(jìn)Swin-Unet的小麥條銹病分割模型

        Swin-Unet的整體結(jié)構(gòu)由編碼器、瓶頸、解碼器和跳躍連接組成,是基于Transformer結(jié)構(gòu)的語義分割網(wǎng)絡(luò),結(jié)合了Swin-Transformer和Unet,在圖像分割任務(wù)上取得了顯著的性能提升。Swin-Unet中的補(bǔ)丁合并層可以增加圖像的特征維數(shù),補(bǔ)丁擴(kuò)展層可以實(shí)現(xiàn)對(duì)圖像的上采樣操作:此外,在圖像的編碼和解碼過程中,該網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)能夠?qū)崿F(xiàn)局部到全局的自注意,對(duì)全局特征進(jìn)行像素級(jí)分割和預(yù)測任務(wù),更好地保留圖像特征,能有效防止感興趣區(qū)域的誤分類。

        針對(duì)小麥條銹病的病斑形態(tài)復(fù)雜、病斑與非病斑之間邊界模糊、分割精度低的問題,本研究對(duì)Swin-Unet進(jìn)行優(yōu)化和改進(jìn),提出了基于改進(jìn)Swin-Unet的小麥條銹病圖像分割方法,改進(jìn)Swin-Unet的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)如圖2所示。

        1.2.1引入SENet模塊 通道注意力機(jī)制的目標(biāo)是自適應(yīng)調(diào)整通道特征的權(quán)重,使得網(wǎng)絡(luò)可以更好地關(guān)注重要特征,抑制不重要特征。SENet是通過學(xué)習(xí)通道間的相關(guān)性來動(dòng)態(tài)調(diào)整特征圖的權(quán)重,以增強(qiáng)重要特征的表示,從而提高模型性能。本研究對(duì)Swin-Unet網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行改進(jìn),在每次跳躍連接時(shí),首先將跳躍連接的特征張量作為SENet模塊的輸入,然后應(yīng)用Squeeze操作和Excitation操作來獲得特征加權(quán)的結(jié)果,最后將SENet模塊的輸出添加到解碼器對(duì)應(yīng)的特征張量中,在跳躍連接處形成輸出特征張量,用于后續(xù)的解碼器操作。這種方法增強(qiáng)了低級(jí)和高級(jí)特征之間的聯(lián)系,從而為多尺度預(yù)測和分割提供了更精細(xì)的特征。

        1.2.2引入ResNet模塊 ResNet是一種深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),被廣泛應(yīng)用于目標(biāo)檢測和語義分割等計(jì)算機(jī)視覺任務(wù)中。由于ResNet中殘差塊的設(shè)計(jì)不會(huì)導(dǎo)致特征提取的計(jì)算能力隨著網(wǎng)絡(luò)的加深而降低,因此,適合用該殘差塊替換位于瓶頸位置的兩個(gè)連續(xù)的Transtormer塊。為了更好地提取小麥條銹病區(qū)域特征,提高整體分割效果,本研究經(jīng)過優(yōu)化和比較,利用ResNet34中的Layer4結(jié)構(gòu)作為Swin-Unet中的瓶頸,使用ResNet網(wǎng)絡(luò)層來增加子特征圖像的提取,從而提高模型對(duì)小麥葉片病斑區(qū)域的分割精度。

        1.3評(píng)價(jià)指標(biāo)

        為了有效和客觀地評(píng)估小麥條銹病圖像的分割效果,本研究采用交并比(Intersection over Umon,IoU)、查準(zhǔn)率(Precision)、召回率(Recall)、準(zhǔn)確率(Accuracy)、均交并比(Mean Intersection over Uruon,MIoU)和均像素準(zhǔn)確率(Mean PixelAccuracy,MPA)作為語義分割的評(píng)價(jià)指標(biāo)。具體計(jì)算公式如下:

        1.4實(shí)驗(yàn)環(huán)境及模型參數(shù)

        實(shí)驗(yàn)選用Intel CoreTM i7 10600 CPU,主頻2.90 GHz,GPU選擇NVIDIA GeForce RTX3090,顯存24 GB,使用PyTorch作為深度學(xué)習(xí)框架。本實(shí)驗(yàn)中所有模型訓(xùn)練使用的優(yōu)化器為Adam,初始學(xué)習(xí)率為0.01,動(dòng)量因子為0.9,訓(xùn)練迭代輪次為100,批處理量為4,輸入網(wǎng)絡(luò)圖像設(shè)置為512x512像素。

        2結(jié)果與分析

        2.1改進(jìn)Swin-Unet網(wǎng)絡(luò)模型的訓(xùn)練結(jié)果

        圖3顯示了改進(jìn)Swin-Unet模型的訓(xùn)練損失曲線,可以看出,在網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練迭代初期,改進(jìn)Swin-Unet的訓(xùn)練損失曲線迅速降低:在訓(xùn)練迭代中期,改進(jìn)Swin-Unet的訓(xùn)練損失曲線保持適度降低:在訓(xùn)練迭代后期,改進(jìn)Swin-Unet訓(xùn)練損失曲線趨于穩(wěn)定。同時(shí)驗(yàn)證損失曲線與訓(xùn)練損失曲線之間的差距極小。表明改進(jìn)后的RSE-Swin Unet具有出色的穩(wěn)定性。

        2.2不同網(wǎng)絡(luò)模型對(duì)背景及小麥條銹病孢子和葉片的分割性能比較

        為驗(yàn)證改進(jìn)Swin-Unet網(wǎng)絡(luò)模型對(duì)小麥條銹病圖像的分割效果,選擇U-Net、PSPNet、DeepLabV3+和Swin-Unet網(wǎng)絡(luò)模型與其進(jìn)行對(duì)比實(shí)驗(yàn),表1展示了不同網(wǎng)絡(luò)模型對(duì)背景、孢子和葉片的分割性能。在背景分類中,改進(jìn)Swin-Unet網(wǎng)絡(luò)模型分割效果最好,IoU、查準(zhǔn)率和召回率分別為98.41%、99.24%、99.16%,與Swin-Unet相比,分別提高了2.39、0.23、1.04個(gè)百分點(diǎn)。在條銹病孢子分類中,改進(jìn)Swin-Unet的分割效果較好,IoU和召回率分別為65.79%和76.62%,分別比Swin-Unet提高12.01、16.48個(gè)百分點(diǎn):而查準(zhǔn)率為82.32%,與Swin-Unet相當(dāng)。在葉片分類中,U-Net的分割效果最好,IoU、查準(zhǔn)率和召回率分別為92.16%、94.69%、97.18%;改進(jìn)Swin-Unet模型的分割效果較好,IoU、查準(zhǔn)率和召回率分別為90.53%、94.36%和95.71%,與Swin-Unet相比,查準(zhǔn)率高出0.94個(gè)百分點(diǎn),而其余兩指標(biāo)略低。

        2.3不同網(wǎng)絡(luò)模型的小麥條銹病分割性能比較

        表2展示了不同網(wǎng)絡(luò)模型的小麥條銹病總體分割性能,可以看出,改進(jìn)Swin-Unet具有最佳分割結(jié)果,準(zhǔn)確率、MIoU、MPA分別為96.88%、84.91%、90.50%,與Swin-Unet相比,分別提高了2.84、4.64、5.38個(gè)百分點(diǎn)。表明本研究提出的方法能夠準(zhǔn)確識(shí)別和分割小麥條銹病病斑,適合于小麥條銹病圖像分割。

        2.4不同網(wǎng)絡(luò)模型的小麥條銹病分割結(jié)果比較

        對(duì)改進(jìn)Swin-Unet網(wǎng)絡(luò)與其他主流分割網(wǎng)絡(luò)在小麥條銹病圖像分割任務(wù)中的結(jié)果進(jìn)行比較(圖4),可以看出,改進(jìn)Swin-Unet取得了最佳分割效果:其他主流網(wǎng)絡(luò)模型雖也能準(zhǔn)確分割出病斑區(qū)域,但不能有效分割病斑與非病斑之間邊界模糊區(qū)域。這可能是本研究使用ResNet34的Layer4作為模型的瓶頸,增加了圖像特征計(jì)算的收斂性,因而可以獲得較好的分割效果。綜上表明,改進(jìn)Swin-Unet展現(xiàn)出卓越性能,較好地解決了病斑與非病斑之間邊界模糊的問題,顯著提升了對(duì)相似紋理和復(fù)雜背景的精準(zhǔn)識(shí)別能力,尤其在小麥條銹病的分割結(jié)果中表現(xiàn)最優(yōu)。

        3討論與結(jié)論

        深度學(xué)習(xí)算法可以有效地分割背景、條銹病孢子和葉片,但對(duì)于原始算法來說,當(dāng)圖像的背景復(fù)雜度高、對(duì)比度低且存在粘連現(xiàn)象時(shí),原始網(wǎng)絡(luò)對(duì)目標(biāo)的特征提取較差,容易造成漏分割。研究認(rèn)為,農(nóng)作物病害識(shí)別網(wǎng)絡(luò)EssNet可以在復(fù)雜環(huán)境下對(duì)農(nóng)作物的11種病害進(jìn)行識(shí)別,準(zhǔn)確率為95.21%。本研究以Swin-Unet模型為基礎(chǔ)架構(gòu),引入SENet和ResNet模塊,提出了基于改進(jìn)Swin-Unet的小麥葉片條銹病圖像分割方法,該方法在小麥條銹病數(shù)據(jù)集上取得了較好的分割結(jié)果,可以精準(zhǔn)分割小麥條銹病圖像,能夠滿足小麥條銹病檢測的基本需求,可為小麥條銹病的自動(dòng)檢測和早期預(yù)防提供技術(shù)支持。

        Li等采用深度學(xué)習(xí)對(duì)小麥條銹病圖像進(jìn)行語義分割,將難以區(qū)分的孢子和斑點(diǎn)分為不同的類別,并對(duì)背景、葉片(含斑點(diǎn))和孢子進(jìn)行了精確的分割。然而,他們的方法不能充分利用小麥葉片圖像豐富的上下文信息,仍然會(huì)存在細(xì)節(jié)丟失、邊界模糊等問題。相比之下,本研究所用數(shù)據(jù)集中有大量的圖像,改進(jìn)Swin-Unet較好地解決了信息丟失和邊界模糊的問題,能夠有效地捕獲條銹病圖像中的全局和局部特征信息,增強(qiáng)模型對(duì)條銹病特征的表達(dá)能力。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,該方法的小麥條銹病圖像整體分割準(zhǔn)確率、MIoU和MPA分別達(dá)到96.88%、84.91%和90.50%,較Swin-Unet分別提高了2.84、4.64、5.38個(gè)百分點(diǎn),也明顯優(yōu)于其他網(wǎng)絡(luò)模型(U-Net、PSPNet、Deep-LabV3+)。

        綜合來看,本研究提出的方法具有較好的計(jì)算機(jī)視覺處理能力和性能評(píng)估檢測效果,分割性能好,可以精準(zhǔn)地檢測和分割小麥條銹病,為田間復(fù)雜環(huán)境下小麥條銹病的自動(dòng)檢測提供了新的方法。

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