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        黃土區(qū)農(nóng)田土壤細(xì)菌和真菌群落對(duì)長(zhǎng)期施氮的響應(yīng)特征

        2024-05-21 00:00:00張薇王潤(rùn)澤李彤彤郭苗苗郭勝利王蕊

        關(guān)鍵詞: 施氮量; 全氮; 碳氮比; 酶活性; 微生物群落結(jié)構(gòu)

        微生物是陸地生態(tài)功能的重要影響因素,在調(diào)控土壤養(yǎng)分的“源”和“庫(kù)”過(guò)程中發(fā)揮著重要作用[ 1 ? 3 ]。不同土壤微生物類群能感知土壤性質(zhì)的改變,從而做出差異化的響應(yīng)[4?5]。氮肥的持續(xù)施用雖然提高了土地生產(chǎn)力,但也顯著改變微生物棲息的微環(huán)境[6]。近年來(lái),雖然我國(guó)實(shí)行了氮肥增效減施行動(dòng),但2022 年中國(guó)氮肥施用量仍高達(dá)1654.1 萬(wàn)t[7]。因此,探究施氮條件下微生物群落的變化有助于農(nóng)田土壤培肥和健康措施的制定。

        細(xì)菌和真菌可以調(diào)控土壤生物化學(xué)過(guò)程和生態(tài)系統(tǒng)功能,但氮肥對(duì)細(xì)菌和真菌群落的影響尚未明確。有報(bào)道指出,細(xì)菌和真菌多樣性均隨氮肥施用量增加呈降低趨勢(shì)[8],且施氮量越高多樣性的降低幅度越大[9]。也有部分研究發(fā)現(xiàn)短期施氮降低細(xì)菌多樣性,對(duì)真菌多樣性無(wú)顯著影響[10],但也存在施氮顯著增加細(xì)菌和真菌多樣性的結(jié)論[11]。此外也有學(xué)者發(fā)現(xiàn)施氮對(duì)細(xì)菌和真菌多樣性均無(wú)顯著影響[12]。對(duì)于細(xì)菌和真菌群落組成而言,施氮增加肉座菌目、被孢霉目等真菌及放線菌門(mén)、綠彎菌門(mén)等細(xì)菌的豐度,降低變形菌門(mén)、酸桿菌門(mén)和厚壁菌門(mén)的豐度[13],但也有研究指出施氮降低放線菌門(mén)、酸桿菌門(mén)等細(xì)菌豐度,增加厚壁菌門(mén)和擬桿菌門(mén)等細(xì)菌豐度[14],另有部分關(guān)于施氮在門(mén)水平對(duì)細(xì)菌和真菌群落組成無(wú)顯著影響的報(bào)道[12]。此外,施氮對(duì)細(xì)菌和真菌各類群間關(guān)系的影響研究,也存在降低共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜性[10]與提高共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜性[15]的不一致報(bào)道。

        黃土高原水土流失嚴(yán)重,土壤肥力匱乏,大量氮肥投入土壤中以保證糧食產(chǎn)量[16]。但是,黃土區(qū)細(xì)菌和真菌的群落結(jié)構(gòu)和功能對(duì)長(zhǎng)期施氮的響應(yīng)并不清楚。本研究基于長(zhǎng)期氮肥管理試驗(yàn),測(cè)定不同施氮量(0、45、90、135、180 kg/hm2) 的細(xì)菌和真菌特性、土壤微生物活性(7—9 月休閑季土壤呼吸量)、碳氮養(yǎng)分含量等理化性質(zhì);分析土壤細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)對(duì)施氮的響應(yīng)特征;辨析土壤理化性質(zhì)與微生物特性、碳代謝功能之間的關(guān)系。

        1 材料與方法

        1.1 研究區(qū)及長(zhǎng)期定位試驗(yàn)概況

        陜西長(zhǎng)武農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)國(guó)家野外科學(xué)觀測(cè)研究站長(zhǎng)期氮肥管理試驗(yàn)于1984 年建立。該試驗(yàn)地點(diǎn)位于黃土高原溝壑區(qū)長(zhǎng)武縣十里鋪村(107°40′E,35°12′N,海拔1200 m),屬于典型旱作雨養(yǎng)農(nóng)業(yè)區(qū),無(wú)灌溉條件;1 9 5 7—2 0 1 8 年年均降水量為580 mm,7—9 月份降水量占年降水量的49.0% 左右;平均氣溫為9.1℃,年日照時(shí)數(shù)2230 h,日照率為51.0%,年輻射總量為484 kJ/cm2。土壤為黏壤質(zhì)黑壚土,1984 年布設(shè)試驗(yàn)時(shí)土壤有機(jī)碳6.5 g/kg,全氮0.6 g/kg,pH 8.4,CaCO3 含量10.5%,黏粒(lt;0.002 mm) 含量24.0%。試驗(yàn)共設(shè)24 個(gè)肥料處理,每個(gè)處理3 次重復(fù),共72 個(gè)小區(qū),區(qū)組隨機(jī)排列,小區(qū)長(zhǎng)6 m,寬4 m,小區(qū)間距0.3 m,區(qū)組間距0.8 m,四周路寬1 m。種植制度為冬小麥(Triticumaestivum L.) 連作,所用化肥為尿素、重過(guò)磷酸鈣,不施用鉀肥,氮磷肥全部在播種前撒施地表后耕翻入土,后期不再追肥。

        1.2 土壤樣品采集

        于2022 年7 月小麥?zhǔn)斋@后,選取同一施磷水平(P 39 kg/hm2) 下5 個(gè)氮肥施用量處理:N 0、45、90、135、180 kg/hm2 (N0、N45、N90、N135、N180)小區(qū),采集0—20 cm 土層樣品。每個(gè)小區(qū)以“S”形采樣法采集5 鉆土樣,制成混合樣品,共計(jì)15 個(gè)樣品。新鮮土樣通過(guò)2 mm 篩后,剔除根系殘?bào)w,用冷藏箱帶回實(shí)驗(yàn)室:一部分樣品在?80℃ 保存供土壤微生物群落結(jié)構(gòu)測(cè)定;另一部分樣品4℃ 保存供微生物量碳、土壤酶活性、硝態(tài)氮(NO3?-N) 等理化性質(zhì)的測(cè)定;剩余樣品在室溫下風(fēng)干,用于土壤pH、有機(jī)碳、氮素含量等理化性質(zhì)的測(cè)定。根系在小麥成熟后,利用根鉆在行間和行上各采集三鉆,將根系揀出,沖洗干凈,70℃~80℃ 烘干至質(zhì)量恒定,再分別稱量和記錄[17]。

        1.3 土壤理化性狀分析

        土壤有機(jī)碳(soil organic carbon,SOC) 測(cè)定利用H2SO4–K2CrO7 外加熱法[18],全氮(total nitrogen,TN) 測(cè)定利用凱氏定氮法[19],土壤微生物量碳(soilmicrobial biomass carbon,SMBC) 采用氯仿熏蒸―萃取法[20],土壤NO3?-N 用2 mol/L KCl 溶液浸提鮮土樣后,用流動(dòng)分析儀測(cè)定(SAN++,Skalar,Holland)。土壤微生物量碳的測(cè)定方法中未用氯仿熏蒸步驟測(cè)定的碳含量即為土壤可溶性有機(jī)碳(dissolved organic carbon,DOC)。土壤酶活性采用微孔板熒光法測(cè)定[21]。土壤水分采用恒溫箱烘干法,有機(jī)質(zhì)芳香程度(SUV254) 采用紫外?可見(jiàn)分光光度計(jì)測(cè)定254 nm 處的紫外吸光度[22]。

        土壤微生物活性為7—9 月土壤呼吸速率的平均值。7 月到9 月為休閑季節(jié),土壤呼吸值為微生物呼吸,可表征微生物活性[23],選擇晴好天氣在9:00—11:00 利用土壤碳通量測(cè)量系統(tǒng)LI-8100 (LI-COR,Lincoln,NE,USA) 測(cè)定土壤呼吸速率,大約每10 天測(cè)定1 次。

        1.4 DNA 提取和高通量測(cè)序

        采用Fast DNA SPIN Kit for soil 試劑盒和MPFastPrep-24 核酸提取儀提取土壤中的DNA,使用帶B a r c o d e 的特異引物進(jìn)行P C R 擴(kuò)增: 3 3 8 F(5′?ACTCCTACGGGAGGCAGCAG?3′) 和806R(5′?GGACTACHVGGGTWTCTAAT?3′) 擴(kuò)增細(xì)菌16S rRNA 基因V3~V4 區(qū)域,ITS1 (5′?ACTCCTACGGGAGGCAGCAG?3′) 和ITS2 (5′?GGACTACHVGGGTWTCTAAT?3′) 擴(kuò)增真菌ITS 基因區(qū)域[ 2 4 ]。純化擴(kuò)增產(chǎn)物并制備序列文庫(kù),然后用Qubit@2.0 Fluorometer (Thermo Scientific) 和AgilentBioanalyzer 2100 系統(tǒng)檢測(cè)文庫(kù)質(zhì)量。在北京諾禾致源科技股份有限公司利用Illumina HiSeq2500PE250 平臺(tái)進(jìn)行高通量測(cè)序。將雙末端序列根據(jù)Barcode 序列和PCR 擴(kuò)增引物標(biāo)簽拆分出各個(gè)樣品的數(shù)據(jù),將每個(gè)樣品的序列借助FLASH (V1.2.7,http://ccbjhu.edu/software/FLASH) 進(jìn)行拼接,然后根據(jù)QⅡME[25]質(zhì)控流程進(jìn)行質(zhì)量控制。根據(jù)UCHIME算法[ 2 6 ]去除嵌合體序列,然后將剩余的序列利用UParse 軟件[27]以97% 的相似度聚類劃分OTU。對(duì)于OTU 的每一個(gè)代表序列,使用RDP Classifier 算法與Green Gene 數(shù)據(jù)庫(kù)以80% 的置信閾值進(jìn)行物種注釋分析。最后以數(shù)據(jù)量最少的樣品為標(biāo)準(zhǔn)對(duì)得到的OTU 豐度數(shù)據(jù)進(jìn)行均一化處理,后續(xù)的alpha 和beta 多樣性分析均基于均一化處理后的數(shù)據(jù)。此外,細(xì)菌的功能預(yù)測(cè)是通過(guò)PICRUSt 生物信息軟件包實(shí)現(xiàn),根據(jù)16S 測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行基于KEGG 數(shù)據(jù)庫(kù)的功能預(yù)測(cè)[28]。

        1.5 數(shù)據(jù)分析方法

        采用SPSS 2.0 軟件對(duì)土壤性狀和微生物群落α-、β-多樣性指數(shù)進(jìn)行單因素方差分析(ANOVA),并進(jìn)行F 顯著性檢驗(yàn)。采用R (4.3.0) 對(duì)微生物數(shù)據(jù)進(jìn)行整理,通過(guò)ggplot2 包繪制門(mén)、綱水平排名前10 的細(xì)菌和真菌群落相對(duì)豐度圖和土壤微生物群落豐富度(Chao1 指數(shù)) 及多樣性(Shannon 指數(shù))、功能結(jié)構(gòu),利用“vegan”包繪制主坐標(biāo)分析圖(PCoA),用“corrplot”數(shù)據(jù)包繪制微生物群落結(jié)構(gòu)與土壤理化性狀的相關(guān)關(guān)系圖。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 施氮對(duì)土壤生物理化性質(zhì)的影響

        施氮顯著影響土壤生物理化性質(zhì)(表1)。土壤有機(jī)碳、可溶性有機(jī)碳、全氮和NO3?-N 隨施氮量的增加呈上升趨勢(shì);土壤碳氮比(C/N) 隨施氮量增加而降低。與N0 處理相比,N180 處理土壤有機(jī)碳和可溶性有機(jī)碳的上升幅度最高,分別提高13.0% (6.50 νs.7.35 g/kg) 和55.0% (22.43 νs. 34.87 mg/kg);而N180 處理顯著降低C/N (13.0%)。N45、N90 與N135 處理下微生物量碳較N0 處理(112.96 mg/kg) 分別升高79.0% (202.58 mg/kg)、73.0% (195.65 mg/kg)和107.0% (234.00 mg/kg)。土壤微生物活性(土壤呼吸量) 隨著施氮量的增加而增加,與N0 相比,N45、N135、N90、N180 處理分別提高18.0%、29.1%、35.4%、47.6%;施氮使木糖苷酶活性提高了13.5%~39.3%,纖維二糖水解酶活性提高了50.3%~126.8%(圖1)。施氮使土壤pH 顯著降低。

        2.2 施氮對(duì)細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)及功能的影響

        氮肥施用量影響細(xì)菌群落的豐富度和多樣性,對(duì)真菌群落無(wú)顯著影響(圖2)。N45 和N180 處理顯著降低細(xì)菌豐富度(Chao1),分別降低4.0% 和12.3%。細(xì)菌多樣性(Shannon) 隨著施氮量的增加而降低,降低幅度為1.6%~1.8%,其中N180 處理的降幅達(dá)到顯著性水平。對(duì)于群落結(jié)構(gòu)而言,長(zhǎng)期施氮改變細(xì)菌群落結(jié)構(gòu),且施氮量之間存在顯著差異,但真菌群落結(jié)構(gòu)在各施氮量間無(wú)顯著差異(圖3)。與N0 處理相比,施氮量越高對(duì)細(xì)菌的影響越大(圖4、圖5),N180 處理顯著降低變形菌門(mén)(Proteobacteria,2.4%~16.4%),芽單胞菌門(mén)(Gemmatimonadetes,2.1%~26.3%),擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes,24.1%~50.0%),增加放線菌門(mén)(Actinobacteria,10.4%~34.7%) 和酸桿菌門(mén)(Acidobacteria,37.8%~54.1%)及綠灣菌門(mén)(Chloroflexi,14.3%~28.6%) 的相對(duì)豐度。與細(xì)菌相比,真菌受氮肥影響較弱,不同施氮量之間對(duì)真菌群落結(jié)構(gòu)的影響差異不大。施氮顯著提高子囊菌門(mén)(Ascomycota,8.3%~73.8%)、座囊菌綱(Dothideomycetes,29.4%~58.8%)、傘菌綱(Agaricomycetes,44.4%~88.9%) 和銀耳綱(Tremellomycetes,18.2%~45.5%) 的相對(duì)豐度。此外,施氮也顯著影響了參與碳氮循環(huán)過(guò)程的相關(guān)功能菌的豐度。化能異養(yǎng)、好氧化能異養(yǎng)等功能菌豐度占據(jù)總功能菌豐度的30% 左右,且在不同施氮量處理中相對(duì)豐度變化存在差異,其中硝化作用菌豐度(14.3%~39.6%)、好氧氨氧化功能菌豐度(25.1%~48.2%) 和芳香烴降解功能菌豐度隨著施氮量的增加而升高(圖6)。

        3 討論

        施氮對(duì)細(xì)菌和真菌多樣性的影響存在差異。長(zhǎng)期施氮顯著降低了細(xì)菌的多樣性和豐富度,但施氮條件下真菌的多樣性和豐富度并無(wú)顯著變化(圖2)。其原因可能與細(xì)菌比真菌具有更強(qiáng)的生境關(guān)聯(lián)性有關(guān),而真菌具有更強(qiáng)的抵抗外界干擾的能力[29]。本研究中,施氮使土壤NO3?-N 含量從1.38 mg/kg 增加到1.78~2.25 mg/kg,C/N 值從8.90 降低到8.64~7.74 (表1),刺激了特定微生物類群大量繁殖,從而縮小其他物種的生存空間[30],這種競(jìng)爭(zhēng)排斥作用降低了細(xì)菌多樣性。其次,施氮促進(jìn)植物生長(zhǎng),根系生物量從1.73 t/hm2 提高到2.32~2.98 t/hm2 (表1),土壤水分含量從39.40% 降低到38.45%~36.72%,降低了土壤中可利用底物的運(yùn)移,而真菌具有更寬的碳/氮養(yǎng)分化學(xué)計(jì)量適應(yīng)范圍和水分適應(yīng)性[31?32]。上述土壤理化性狀變化對(duì)真菌無(wú)顯著影響。Xing 等[33]研究發(fā)現(xiàn),施氮不僅提高細(xì)菌多樣性,而且也顯著增加真菌的多樣性。這可能與土壤養(yǎng)分的背景值存在較大差異有關(guān),Xing 等[33]研究中的供試土壤有機(jī)碳(13.83 g/kg) 和全氮(1.98 g/kg) 顯著高于本研究的相應(yīng)值(土壤有機(jī)碳6.50 g/kg,全氮0.6 g/kg),因此施用氮肥后沒(méi)有造成養(yǎng)分競(jìng)爭(zhēng)引起的多樣性降低。

        施氮肥對(duì)細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)的影響也存在差異。細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)不僅因施氮而變化,并且還會(huì)因施氮量而改變,但真菌群落并不因施氮而變化(圖3~圖5)。細(xì)菌和真菌群落組成變化的差異源于對(duì)土壤環(huán)境變化的敏感性不同。已有土壤性質(zhì)變化對(duì)細(xì)菌影響更大的報(bào)道[34],證實(shí)了本研究中細(xì)菌群落發(fā)生顯著變化而真菌群落無(wú)明顯變化的結(jié)論。細(xì)菌群落的變形菌門(mén)相對(duì)豐度隨著土壤可溶性有機(jī)碳升高而降低,而放線菌門(mén)豐度隨著土壤有機(jī)碳、可溶性有機(jī)碳和NO3?-N 的升高而升高。施氮條件下可溶性有機(jī)碳含量的大幅升高促進(jìn)了放線菌、厚壁菌和子囊菌等主要利用易分解有機(jī)碳組分的微生物的生長(zhǎng)[35?36]。但真菌因?qū)ν寥拉h(huán)境變化不敏感,所以群落組成的變化(子囊菌升高,擔(dān)子菌降低) 與土壤理化性質(zhì)間的關(guān)系不顯著(圖7)。

        施氮顯著改善了木糖苷酶和纖維二糖水解酶等與碳氮循環(huán)過(guò)程相關(guān)的胞外酶活性。本研究中木糖苷酶和纖維二糖水解酶分別升高13.5%~39.3% 和50.3%~126.8%,這與施氮改變細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)有關(guān)。施氮增加了酸桿菌、放線菌和子囊菌等具有編碼纖維素酶、半纖維素酶和木糖苷酶功能基因的微生物類群豐度[37];隨之分泌更多木糖苷酶和纖維二糖水解酶,從而提高了土壤微生物中與碳循環(huán)相關(guān)的功能菌豐度(芳香烴降解)。但是,也有報(bào)道發(fā)現(xiàn),施氮降低了土壤微生物分解木質(zhì)素的功能菌豐度,這可能與施氮降低了傘菌目等含木質(zhì)素分解的基因的微生物類群豐度有關(guān)[38]。在本研究中施氮提高了含有木質(zhì)素水解酶基因的變形菌、擬桿菌、子囊菌等微生物類群豐度。

        本研究明確了不同施氮量下土壤微生物的活性、群落結(jié)構(gòu)組成和功能的變化,從微生物的角度解釋了氮肥用量對(duì)黃土區(qū)土壤質(zhì)量的影響。未來(lái)的研究將從功能基因變化以及真菌與細(xì)菌之間的相互作用方面,進(jìn)一步解釋不同施氮量引起的微生物群落結(jié)構(gòu)變化的原因。

        4 結(jié)論

        在黃土高原地區(qū),長(zhǎng)期施氮顯著提高了土壤微生物量和活性,改變了土壤細(xì)菌和真菌群落多樣性和結(jié)構(gòu)組成,細(xì)菌較真菌對(duì)施氮的響應(yīng)更敏感。細(xì)菌多樣性和豐富度隨施氮量增加而顯著降低,群落結(jié)構(gòu)也因施氮發(fā)生改變,而真菌豐富度、多樣性對(duì)施氮量無(wú)響應(yīng),真菌群落結(jié)構(gòu)在不同施氮量間無(wú)顯著差異。細(xì)菌群落組成的變化與土壤有機(jī)碳、可溶性有機(jī)碳和NO3?-N 含量呈顯著正相關(guān),與全氮含量和C/N 呈顯著負(fù)相關(guān)。此外,氮肥施用增加了土壤中與碳循環(huán)相關(guān)的功能菌豐度,促進(jìn)了木糖苷酶和纖維二糖水解酶的分泌。

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