張雨潔 胡珊珊 史元元 朱青梅 李東鋒
新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院藥學(xué)部,新疆 烏魯木齊 830011
柴胡注射液(Chaihu Injection,CI)是北柴胡(Bupleurum chinense DC.)經(jīng)水蒸氣蒸餾法制成的注射劑,主成分為柴胡揮發(fā)油[1-2]。2020 版《中華人民共和國藥典》收載的北柴胡為傘形科植物柴胡的干燥根。該藥在1941 年研制,1954 年實(shí)現(xiàn)工業(yè)化生產(chǎn)[3]。2022 年8 月至2023 年1 月新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院急診有273 例發(fā)熱患者使用該藥,單用者119 例,聯(lián)合萘普生片者79 例,聯(lián)合安痛定注射液者65例,聯(lián)合萘普生片及安痛定注射液者10例。期間不良反應(yīng)上報(bào)0 起,其退熱效果好且較為安全。既往研究中柴胡主要含三萜皂苷類、揮發(fā)油、黃酮類等成分,具有解熱、抗炎、抗病毒、保肝、抗腫瘤、降血脂、調(diào)節(jié)免疫等作用[2]。但對其退熱機(jī)制的研究尚存在一定空缺,本研究旨在通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及分子對接探究該機(jī)制。
在中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(tái)(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)[4]中以口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%且類藥性(drug-like,DL)≥0.18 檢索柴胡活性成分,同時(shí)結(jié)合文獻(xiàn)補(bǔ)充。從PubChem 數(shù)據(jù)庫[5]中收集分子結(jié)構(gòu)。
從UniProt 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫[6]中查詢活性成分對應(yīng)的靶點(diǎn),并進(jìn)行整理。
以“ fever”為關(guān)鍵詞在GeneCards 數(shù)據(jù)庫[7]、DurgBank 數(shù)據(jù)庫[8]、人類在線孟德爾遺傳數(shù)據(jù)庫(online Mendelian inheritance in man,OMIM)[9]中檢索、去重。
使用Venny 2.1 平臺(tái)對1.2 和1.3 的結(jié)果取交集。使用STRING 數(shù)據(jù)庫[10]對交集靶點(diǎn)進(jìn)行互作分析。
把1.4 的結(jié)果導(dǎo)入Cytoscape 軟件[11],并進(jìn)行分析獲得“ CI-活性成分-靶點(diǎn)基因-發(fā)熱”網(wǎng)絡(luò)關(guān)系。
通過DAVID 數(shù)據(jù)庫[12]獲取GO、KEGG 信號通路信息(P≤0.01),取前20 位結(jié)果進(jìn)行分析解讀。
從PDB 數(shù)據(jù)庫下載核心靶點(diǎn)結(jié)構(gòu)信息,使用PyMOL 軟件對結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)處理。利用AutoDock 軟件處理靶蛋白,AutoDock Vina 模擬分子對接。
將數(shù)據(jù)庫中的活性成分與文獻(xiàn)報(bào)道[2,13]的檸檬烯(limonene)、α-姜黃烯(α-curcumene)等12 個(gè)成分進(jìn)行整合,見表1。有17 個(gè)柴胡活性成分對應(yīng)210 個(gè)靶點(diǎn)。
表1 柴胡注射液活性成分
將210 個(gè)藥物靶點(diǎn)與1208 個(gè)疾病靶點(diǎn)取交集,獲得102 個(gè)CI 退熱的關(guān)鍵靶點(diǎn),使用Venny 2.1 作圖,見圖1。
圖1 CI 和發(fā)熱交集靶點(diǎn)Venn 圖
PPI 網(wǎng)絡(luò)中有101 個(gè)點(diǎn)存在相互關(guān)系,點(diǎn)之間有1634 條連線,平均節(jié)點(diǎn)度值為32.4,平均局部聚類系數(shù)值為0.676,表明這些蛋白質(zhì)之間有較多相互作用且在生物學(xué)上是部分相連的。見圖2。
圖2 柴胡注射液退熱靶點(diǎn)PPI 網(wǎng)絡(luò)
以鄰近中心度數(shù)值>中位數(shù)0.5824、中介中心性數(shù)值>中位數(shù)0.0037、度值>中位數(shù)37 進(jìn)行數(shù)據(jù)整理,獲得核心靶點(diǎn)17 個(gè),包括IL-6、TNF、AKT1 等,見表2。
表2 CI退熱核心靶點(diǎn)
用Cytoscape 3.9.1 軟件建立關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò),點(diǎn)與點(diǎn)之間的關(guān)聯(lián)以線條進(jìn)行連接,連線越多表明存在的相互作用關(guān)系密切,核心作用的可能性越大,見圖3。
圖3 “ CI-活性成分-靶點(diǎn)基因-發(fā)熱”關(guān)系網(wǎng)絡(luò)
GO 分析獲得生物過程(biological process,BP)條目584 個(gè),涉及對外來刺激的反應(yīng)、細(xì)胞對腫瘤壞死因子的反應(yīng)、炎癥反應(yīng)、對脂多糖的反應(yīng)、血管生成、缺氧反應(yīng)等過程;得到細(xì)胞成分(cellular component,CC)條目60 種,涉及細(xì)胞外隙、細(xì)胞表面、小窩等;獲得分子功能(molecular function,MF)條目103 項(xiàng),涉及酶結(jié)合、蛋白質(zhì)結(jié)合等。選取P值排序選前10 位條目作圖,見圖4。
圖4 GO 功能富集分析
通過分析獲得156 條通路信息(P< 0.01),涉及AGE-RAGE、TNF、IL-17、人巨細(xì)胞病毒感染、Toll樣受體等信號通路。取前20 位作氣泡圖,見圖5。
圖5 KEGG 通路富集分析
以活性成分的度值排名靠前、相互連接關(guān)系多為條件,選出8 個(gè)活性化合物以及10 個(gè)核心靶點(diǎn)進(jìn)行分子對接,見表3。取結(jié)合能低、結(jié)合能力強(qiáng)的4 組信息,即槲皮素-PTGS2、山奈酚-PTGS2、異鼠李素-PTGS2、槲皮素-TP53,進(jìn)行可視化作圖,見圖6。
圖6 CI 成分與靶蛋白結(jié)合模式圖
表3 CI成分與核心靶蛋白的結(jié)合能(kJ/mol)
CI 是普通感冒、流感及瘧疾等所致發(fā)熱的常用制劑之一。發(fā)熱多為病原體引起機(jī)體應(yīng)激反應(yīng),白細(xì)胞釋放內(nèi)源性致熱源穿過血- 腦屏障,影響體溫調(diào)節(jié)中樞的體溫控制導(dǎo)致發(fā)熱[14]。該藥臨床應(yīng)用多、退熱效果顯著。分子對接中山奈酚、異鼠李素、槲皮素與核心靶點(diǎn)的結(jié)合能最低、結(jié)合構(gòu)象更穩(wěn)定。既往研究中槲皮素的抗炎作用與抑制細(xì)胞因子產(chǎn)生、降低環(huán)氧合酶和脂氧合酶表達(dá)相關(guān)[15]。山奈酚可調(diào)節(jié)促炎酶活性和炎癥基因表達(dá)[16],通過抑制轉(zhuǎn)錄因子、黏附分子以及基質(zhì)金屬蛋白酶等途徑發(fā)揮抗炎作用[17]。異鼠李素可通過抑制炎癥因子TNF-α、IL-1β、IL-6 的產(chǎn)生,發(fā)揮出強(qiáng)效的抗炎活性[18]。這3 種成分是CI 退熱的中心活性成分。
KEGG 結(jié)果提示CI 退熱作用與AGE-RAGE、TNF、IL-17、人巨細(xì)胞病毒感染等通路相關(guān)。它們均可觸發(fā)NF-κB、MAPK 途徑,另外還涉及PI3KAKT-mTOR、C/EBPs 途徑等。通路激活后引起多種促炎細(xì)胞因子的表達(dá),如IL-1、IL-6、GM-CSF、IL-8。其中,IL-1 與lL-1RI 結(jié)合可觸發(fā)Toll 樣受體信號通路。該通路能識(shí)別脂多糖、肽聚糖、脂蛋白及病毒后活化成熟樹突細(xì)胞,提供獲得性免疫的共刺激信號,促進(jìn)lL-1β、IL-1α、IL-6、TNF-α 等細(xì)胞因子表達(dá)[19]。
PTGS2、TP53 是分子對接中最有可能發(fā)揮作用的靶點(diǎn),PTGS2 的生物學(xué)功能是通過生成PGE2 和PGD2 進(jìn)而控制身體溫度、保護(hù)心血管健康、調(diào)節(jié)情緒等。TP53 編碼抑癌蛋白能對多種細(xì)胞產(chǎn)生應(yīng)激反應(yīng),調(diào)節(jié)靶基因表達(dá)從而誘導(dǎo)細(xì)胞周期阻滯、凋亡、DNA 修復(fù)等。
此外本研究結(jié)果提示CI 可能通過脂質(zhì)和動(dòng)脈粥樣硬化、AGE-RAGE、癌癥途徑等相關(guān)通路發(fā)揮作用。綜上所述,本研究探討了CI 退熱中心成分、核心靶點(diǎn)和通路之間的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系。但本研究局限在于分子對接驗(yàn)證是模擬狀態(tài),初步闡述了機(jī)制,今后將進(jìn)一步探索CI 的作用機(jī)制。