陳美樺,徐含翠,王林旭,羅洪,齊琦,王勃,段小濤
(1.南京中醫(yī)藥大學(xué),江蘇南京 210023;2.軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院毒物藥物研究所,國家安全特需藥品全國重點實驗室,北京 100850)
水皰性口炎病毒(vesicular stomatitis virus,VSV)是彈狀病毒科水皰病毒屬,是一種負(fù)鏈RNA病毒。VSV 具有廣泛的宿主范圍,能夠感染豬、馬和人類等各類哺乳動物,其癥狀表現(xiàn)為舌、唇和乳頭等部位出現(xiàn)水皰和潰爛,頭疼和發(fā)熱等癥狀[1-3]。由于VSV 結(jié)構(gòu)簡單,且復(fù)制快,已被廣泛用于研究RNA病毒轉(zhuǎn)錄和復(fù)制[4]。
單純皰疹病毒Ⅰ型(herpes simplex virus 1,HSV-1)屬于皰疹病毒亞科,是一種DNA 病毒[5]。人類是HSV-1 天然宿主,病毒經(jīng)呼吸道、口腔、生殖器粘膜以及破損皮膚等途徑侵入機(jī)體,引起口唇皰疹、角膜炎、腦炎和生殖器感染等疾?。?]。有研究報道,HSV-1可增加人類免疫缺陷病毒感染的風(fēng)險[7],其復(fù)制快,致病性高,可使宿主終身感染[8]。
真核翻譯延伸因子1A1(eukaryotic translation elongation factor1A,eEF1A1)屬于GTP 結(jié)合蛋白,在mRNA 翻譯時促進(jìn)多肽鏈延伸[9]。eEF1A1具有多種功能,包括蛋白質(zhì)翻譯[10]、細(xì)胞生長[11-12]、腫瘤增殖[13]和病毒復(fù)制等[14-16]。eEF1A1參與多種蛋白的合成和翻譯,而大多數(shù)病毒的復(fù)制都需要宿主蛋白的參與,因此提示eEF1A1 是病毒復(fù)制的一個重要因素。但目前關(guān)于eEF1A1影響病毒復(fù)制的研究大多都停留在eEF1A1 與RNA 病毒相互作用,如eEF1A1 可以與人類免疫缺陷病毒Ⅰ型的逆轉(zhuǎn)錄酶或乙型肝炎病毒X 蛋白相互作用[15-16];eEF1A1 對不同種類病毒基因組復(fù)制的影響尚未明確報道。
因此,本研究用VSV 與HSV-1 分別建立RNA與DNA 病毒感染體系,探究eEF1A1 對不同種類病毒復(fù)制的影響,以確定一個廣譜抗病毒新靶點;用雙鏈RNA 類似物聚胞苷酸〔polyinosinic-polycytidylic acid,poly(I:C)〕或脫氧核糖核酸鈉鹽(herringtestis DNA,HT-DNA)去探究eEF1A1 是否參與天然免疫,嘗試從宿主角度出發(fā)探究eEF1A1 對病毒復(fù)制的影響。
人皮膚成纖維細(xì)胞株BJ-5ta 購自美國模式培養(yǎng)物集存庫。VSV和HSV-1由本實驗室于-80 ℃保存。poly(I:C)與HT-DNA,美國Sigma公司。
DMEM 培養(yǎng)基,德國Sigma 公司;胎牛血清、胰酶和磷酸鹽緩沖液,北京中科邁晨;LipofectamineiMAX轉(zhuǎn)染試劑,美國Invitrogen公司;苯甲基磺酰氟(phenylmethanesulfonyl fluoride,PMSF)、蛋白酶抑制劑和磷酸酶抑制劑,美國Selleck公司;Bradford蛋白定量試劑盒和ECL顯影液,美國Thermo公司;辣根過氧化物酶(horseradish peroxidase,HRP)標(biāo)記的山羊抗鼠IgG 抗體(批號:AS003)和HRP 標(biāo)記山羊抗兔IgG 抗體(批號:AS014),武漢愛博泰克生物科技有限公司;eEF1A1抗體(批號:sc21758),美國SantaCruz;VSV 糖蛋白(VSV-G)抗體(批號:Ab50549)、HSV 糖蛋白B(HSV-gB)抗體(批號:Ab6506)、干擾素調(diào)節(jié)因子3(Interferon regulatory factor 3,IRF3)抗體(批號:Ab68481)和p-IRF3 抗體(批號:Ab76393),英國Abcam 公司;TANK 結(jié)合激酶1(TANK binding kinase 1,TBK1)抗體(批號:3504S)和p-TBK1 抗體(批號:5483S),美國CST公司;PVDF 轉(zhuǎn)印膜,美國Millipore 公司;RNA 提取試劑盒(批號:DP419),天根生化科技(北京)有限公司;逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(批號:RR035A-1),日本TaKaRa 公司。siRNA 核酸序列,廣州銳博生物科技有限公司。
CFX96 實時熒光定量PCR 儀,美國Bio Rad 公司;Synergy H1 多功能酶標(biāo)儀,美國Bio Tek 公司;JY300HE電泳儀,北京君意東方電泳設(shè)備有限公司;2720 梯度PCR 儀、1384 生物安全柜、Heracell VIOS 160i CO2 細(xì)胞培養(yǎng)箱、NanoDrop One 分光光度計,美國Thermo 公司;TS2-FL 倒置熒光顯微鏡,德國Nikon 公司;KLCZ-1220A 超凈工作臺,北京亞泰科隆儀器技術(shù)有限公司。
將BJ-5ta 細(xì)胞用DMEM 完全培養(yǎng)基(含10%胎牛血清和1%青/鏈霉素)培養(yǎng)于37 ℃,5%CO2飽和濕度培養(yǎng)箱中。細(xì)胞密度至80%,按1∶3傳代。
將對數(shù)生長期BJ-5ta細(xì)胞以7×107L-1接種于24孔板,待細(xì)胞融合率達(dá)35%,轉(zhuǎn)染siRNA。siRNA 核酸序列見表1。A 液:Lipofectamine-iMAX 1 μL 與opti-MEM 25 μL 混合,靜置5 min;B 液:siRNA(20 μmol·L-1)0.6 μL 與opti-MEM 25 μL 混合,靜置5 min;將A 液和B 液輕輕混勻,室溫靜置15 min。均勻滴加至每孔培養(yǎng)基中,培養(yǎng)6 h 后更換新完全培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)48 h后,進(jìn)行后續(xù)實驗。
Tab.1 Sequences of small interfering RNA(siRNA)
將VSV 或HSV-1 病毒以感染復(fù)數(shù)(multiplicity of infection,MOI)為0.1 或1.0,加入至1.3 制備的細(xì)胞,培養(yǎng)2 h 后,更換新的含2%血清的培養(yǎng)基,放置37 ℃,5%CO2飽和濕度培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。VSV 和HSV-1病毒均在Ⅱ級生物安全柜中使用。
取1.3 制備的細(xì)胞,然后轉(zhuǎn)染poly(I:C)或HT-DNA。轉(zhuǎn)染前1 h 更換DMEM 完全培養(yǎng)基,A液:Lipofectamine-iMAX 1 μL與opti-MEM 25 μL混合,靜置5 min;B 液:poly(I:C)或HT-DNA(1 mg·mL-1)0.25 μL分別和opti-MEM 25 μL混合,靜置5 min;將A 液和B 液輕輕混勻,室溫靜置15 min。均勻滴加至每孔培養(yǎng)基中,繼續(xù)培養(yǎng)3 h和6 h 后收集細(xì)胞樣品,提取RNA和蛋白檢測相關(guān)分子的表達(dá)。
按照RNA 提取試劑說明書提取細(xì)胞總RNA,將其逆轉(zhuǎn)錄為cDNA(反應(yīng)條件:37 ℃15 min,85 ℃10 s),以cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增(反應(yīng)條件:95 ℃10 min,95 ℃10 s,60 ℃30 s,共45個循環(huán)),數(shù)值均以GAPDH 為內(nèi)參進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化,用2-ΔΔCt法計算目標(biāo)基因mRNA 的相對表達(dá)水平,每組設(shè)置3復(fù)孔;相關(guān)引物序列見表2。
Tab.2 Primer sequence for RT-qPCR
PBS 洗細(xì)胞,加入RIPA 裂解液(含蛋白酶和磷酸酶抑制劑)冰上靜置5 min,BCA 法定量蛋白,取15 μg 蛋白樣品經(jīng)SDS-PAGE 電泳分離蛋白,蛋白濕轉(zhuǎn)至PVDF 膜上,5%脫脂牛奶封閉1 h,一抗〔抗VSV-G,HSV-gB,p-IRF3,p-TBK1,IRF3 和TBK1(均1∶2500),GAPDH(1∶10 000)〕4 ℃孵育過夜,TBST 洗膜3 次,加入HRP 標(biāo)記的山羊抗鼠或山羊抗兔lgG 抗體(1:5000)室溫孵育1 h,TBST 洗膜3次,增強(qiáng)化學(xué)發(fā)光法(ECL)顯影,暗室中曝光膠片。通過Image J軟件對蛋白條帶的積分吸光度進(jìn)行分析,以目的蛋白與內(nèi)參蛋白積分吸光度值的比值表示目標(biāo)蛋白表達(dá)水平。
實驗結(jié)果數(shù)據(jù)用±s表示,用Graphpad prism 8.3.0 軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析。多組間采用單因素方差分析,兩組間比較采用t檢驗。P<0.05 為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。
圖1 顯示,與陰性對照組相比,eEF1A1基因沉默組eEF1A1 的mRNA 和蛋白水平顯著降低(P<0.01),表明eEF1A1基因沉默的細(xì)胞模型構(gòu)建成功。
Fig.1 Efficiency verification of knocking down of eEF1A1. BJ-5ta cells were transfected with siRNA for 48 h. A:the mRNA level of eEF1A1 was detected by RT-qPCR. B:the protein level of eEF1A1 was detected by Western blotting. C was the semi-quantitative result of B.IA:integrated absorbance.±s,n=3.**P<0.01,compared with si-control group.
圖2 顯示,與陰性對照組相比,eEF1A1基因沉默組的VSV 基因拷貝數(shù)下降70%~80%(P<0.01);VSV蛋白表達(dá)顯著降低(P<0.01)。
Fig.2 Knockdown of eEF1A1 inhibits vesicular stomatitis virus(VSV)replication.BJ-5ta cells were transfected with siRNA for 48 h and then stimulated with VSV for 12 h. A:the genome copy number of VSV was detected by RT-qPCR.B:the protein level of VSV was detected by Western blotting. C was the semi-quantitativeresultof B. x±s,n=3.**P<0.01,comparedwith si-control group.
圖3顯示,與陰性對照組相比,eEF1A1基因沉默組HSV-1 的mRNA 水平下降50%~60%(P<0.01);HSV-1蛋白水平顯著降低(P<0.01)。
Fig.3 Knockdown of eEF1A1 inhibits herpes simplex virus 1 (HSV-1)replication. BJ-5ta cells were transfected with siRNA for 48 h and then stimulated with HSV-1 for 12 h. A:the mRNA level of HSV-1 was detected by RT-qPCR. B:the protein level of HSV-1 was detected by Western blotting.C was the semi-quantitative result of B. x±s,n=3. *P<0.05,**P<0.01,compared with si-control group.
圖4 和5 顯示,poly(I:C)或HT-DNA 誘導(dǎo)后,與陰性對照組相比,eEF1A1基因沉默組的IFN-β、ISG56和CXCL10的mRNA水平以及IRF3與TBK1的蛋白磷酸化水平無顯著差異。
Fig.4 Knockdown of eEF1A1 does not affect the innate immune response to polyinosinic-polycytidylic acid[poly(l∶C) ]. BJ-5ta cells were stimulated with poly(I:C)after transfected with siRNA for 48 h.A:the mRNA levels of IFN-β,CXCL10 and ISG56 were detected by RT-qPCR. B1:the protein levels of p-IRF3 and p-TBK1 were detected by Western blotting. B2 was the semiquantitative result of B1.
Fig.5 Knockdown of eEF1A1 does not affect the innate immune response to herringtestis DNA (HT-DNA). BJ-5ta cells were stimulated with HT-DNA after transfected with siRNA for 48 h. A: the mRNA levels of IFN-β,CXCL10 and ISG56 were detected by RT-qPCR.B1:the protein levels of p-IRF3 and p-TBK1 were detected by Western blotting.B2 was the semi-quantitative result of B1.
病毒基因組mRNA 和蛋白是評價病毒復(fù)制量的關(guān)鍵因素。研究報道,eEF1A1 參與RNA 病毒轉(zhuǎn)錄酶復(fù)合體的形成[17],但未涉及eEF1A1 對不同種類病毒基因組復(fù)制的影響。VSV 和HSV-1 常被當(dāng)作工具病毒運(yùn)用于先天免疫信號通路的研究中[18]。本研究表明,抑制eEF1A1 后,VSV 的基因拷貝數(shù)和蛋白水平顯著降低;HSV-1的mRNA 和蛋白水平顯著降低。以上結(jié)果提示,eEF1A1 對RNA 病毒和DNA病毒具有潛在的廣譜調(diào)控作用。
病毒感染的先天免疫反應(yīng)是由模式識別受體識別病毒核酸而引發(fā)的,其中包括Toll 樣受體,RIG-I樣受體和胞質(zhì)DNA傳感器。天然免疫是宿主抵抗病原入侵的第一道防線。感染病毒后,機(jī)體通過模式識別受體識別病毒的DNA 或RNA,快速啟動固有免疫反應(yīng),有效清除入侵的病毒并進(jìn)行機(jī)體損傷修復(fù)。在感知危險信號后,調(diào)控細(xì)胞抗病毒免疫的關(guān)鍵激酶TBK1 被激活,并進(jìn)一步磷酸化轉(zhuǎn)錄因子IRF3,使其入核,誘導(dǎo)下游干擾素的產(chǎn)生[19]。TBK1 是固有免疫細(xì)胞抗病毒信號通路的中心節(jié)點,其活性和穩(wěn)定性均需受到精細(xì)的控制,功能異常將導(dǎo)致自身免疫疾病和慢性炎癥等疾病發(fā)生。本研究表明,干擾素激動劑雙鏈RNA 類似物Poly(I:C)或HT-DNA刺激eEF1A1基因沉默的細(xì)胞后,IFN-β、CXCL10和ISG56的mRNA 水平以及TBK1與IRF3 的蛋白磷酸化水平均無顯著差異。因此推測,eEF1A1 在體內(nèi)對病毒復(fù)制量的影響可能不通過胞內(nèi)核酸識別的天然免疫,但不排除eEF1A1 會通過其他天然免疫機(jī)制抑制病毒。同時有研究報道,eEF1A1 可與病毒相互作用[15-16],推測其可能是直接靶向病毒。因此,關(guān)于eEF1A1 對病毒的具體作用機(jī)制還需進(jìn)一步探究。
綜上所述,本研究首次提出eEF1A1 影響DNA病毒復(fù)制,也可影響RNA 病毒復(fù)制,為新型廣譜抗病毒藥物的研發(fā)提供了新思路?;谝种芿EF1A1 對Poly(I:C)或HT-DNA 刺激的天然免疫分子無影響,提示eEF1A1 可能不參與胞內(nèi)核酸識別的天然免疫,可能會通過其他機(jī)制幫助病毒進(jìn)行免疫逃逸,為宿主免疫和病毒逃逸的研究提供基礎(chǔ)。