亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        獨活揮發(fā)油低共熔溶劑輔助微波水蒸氣蒸餾法提取及質(zhì)量標(biāo)志物(Q-Marker)研究

        2024-03-02 08:08:40尹轉(zhuǎn)霖丁小琴
        中草藥 2024年4期

        李 欠,尹轉(zhuǎn)霖,丁小琴,姜 侃

        甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,省部共建干旱生境作物學(xué)國家重點實驗室,甘肅 蘭州 730070

        獨活A(yù)ngelicaePubescentisRadix是我國重要的傳統(tǒng)中藥材,有很高的藥用價值。而獨活揮發(fā)油作為獨活的主要藥理成分,具有抗炎、抗氧化、鎮(zhèn)痛、理氣、抗菌、抗腫瘤等作用[1-2]。現(xiàn)階段對獨活揮發(fā)油的高效提取與質(zhì)量控制缺少系統(tǒng)的研究。目前,提取揮發(fā)油的傳統(tǒng)方法有:水蒸氣蒸餾法(steam distillation,SD)、溶劑提取法、索氏提取法、機械萃取法等[3]。傳統(tǒng)的提取工藝有萃取時間長、效率低、耗能大,部分方法采用有毒溶劑等弊端。微波輔助提取技術(shù)作為一種新的提取方法,具有能量傳遞快、提取效率高、耗時短、耗能低、綠色環(huán)保等優(yōu)勢,在揮發(fā)油提取方面具有較好的應(yīng)用前景[4-7]。另一方面,低共熔溶劑(deep eutectic solvents,DESs)作為一種環(huán)境友好型溶劑,被廣泛用于提取中藥活性成分領(lǐng)域,具有提取效率高的優(yōu)點[8-13],目前其在揮發(fā)油的提取方面應(yīng)用較少,具有非常廣闊的前景。

        中藥質(zhì)量評價方法可以分為化學(xué)評價、生物評價和化學(xué)-生物相結(jié)合的評價方法[14]。在已有質(zhì)量評價方法的基礎(chǔ)上,劉昌孝院士[15]于2016 年提出利用中藥質(zhì)量標(biāo)志物(quality markers,Q-Marker)評價中藥質(zhì)量的方法,該方法能夠更加全面客觀的評價中藥質(zhì)量,為中藥質(zhì)量控制提供了新的思路。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)能夠揭示中藥成分與相關(guān)靶點相互作用的機制,系統(tǒng)地、全面地展示了疾病與靶點蛋白、靶點蛋白與藥物以及藥物與藥物之間的相互聯(lián)系[16-17],能夠預(yù)測潛在生物機制下的有效成分或組分,鑒定Q-Marker。

        分子對接技術(shù)可以在理論上研究藥物小分子與靶點蛋白的作用,進一步預(yù)測小分子的生物活性。將網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法與成分分析方法相結(jié)合,能夠快速、準(zhǔn)確地找到Q-Marker,并利用分子對接的方法,確認(rèn)了主要活性物質(zhì)的作用靶點[18-20],為中藥Q-Marker 預(yù)測提供理論基礎(chǔ),具有良好的應(yīng)用前景。本研究采用DESs 輔助微波水蒸氣蒸餾法(DESs assisted microwave steam distillation,DES-A- MSD)提取獨活揮發(fā)油,并與SD 法和微波輔助水蒸氣蒸餾法(microwave assisted steam distillation,MASD)2 種提取方法進行對比,確定獨活揮發(fā)油的最佳提取工藝。利用氣相色譜-質(zhì)譜法(gas chromatographymass spectrometry,GC-MS)分析不同提取方法得到的獨活揮發(fā)油的化學(xué)成分的差異,根據(jù)揮發(fā)油化學(xué)成分,結(jié)合網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接預(yù)測獨活揮發(fā)油Q-Marker,為其質(zhì)量控制提供依據(jù)。

        1 儀器與材料

        1.1 儀器

        XH-MC-1 型實驗室微波合成反應(yīng)儀,北京祥鵠科技發(fā)展有限公司;INNOTEG-Science One MR1 型磁力攪拌器,德祥科技有限公司;HX203T 型電子天平,1.0 mg,慈溪市天東衡器廠;WK-1000 型小型高速粉碎機,山東精誠醫(yī)藥裝備制造有限公司;Agilent 7890B-7000D 型三重四極桿氣相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀,美國安捷倫公司;PTHW 型電熱套,鄭州科豐儀器設(shè)備有限公司。

        1.2 材料

        獨活藥材采自湖北省宜昌市五峰土家族自治縣,由甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)陳垣教授鑒定并確認(rèn),為傘形科當(dāng)歸屬植物重齒毛當(dāng)歸AngelicapubescensMaxim. f.biserrataShan et Yuan 的干燥根。將獨活藥材清洗干燥后粉碎成粉末,過40 目篩,于4 ℃下儲存。正己烷為色譜純,氯化膽堿、尿素、甘油、乙二醇、乳酸、葡萄糖、檸檬酸、1,3-丁二醇為分析純,均購自國藥集團化學(xué)試劑有限公司。

        2 方法與結(jié)果

        2.1 DES 的制備

        本研究采用加熱攪拌法,以氯化膽堿、尿素、甘油、乙二醇、乳酸、葡萄糖、檸檬酸、1,3-丁二醇為原材料制備DES。按照表1 將氫鍵供體(H-bond donor,HBDs)和氫鍵受體(H-bond acceptor,HBAs)以一定的物質(zhì)的量比和/或水混合在圓底燒瓶中,使用磁力攪拌器將其加熱攪拌,直至形成均勻、透明、穩(wěn)定的液體。

        表1 不同DESs 的制備Table 1 Preparation of different DESs

        2.2 獨活揮發(fā)油不同提取方法的比較

        為了獲得一種高效、綠色、低耗能的提取工藝采用SD 法和MASD 法提取獨活揮發(fā)油,并與DESA-MSD 法進行比較。SD 法是將混合物加熱至沸騰狀態(tài)后保持5 h;MASD 法用蒸餾水作為溶劑進行微波萃取。具體實驗參數(shù)如下。①SD 法條件:料液比1∶5,蒸餾時間5 h;②MASD 法條件:料液比1∶5,微波功率400 W,溫度100 ℃,蒸餾時間60 min;③DES-A-MSD 法條件:料液比(獨活粉末-DESs)1∶3,預(yù)處理后再加一定量蒸餾水,微波功率400 W,溫度100 ℃,蒸餾時間60 min。

        SD 法、MASD 法與DES-A-MSD 法的揮發(fā)油得率分別為0.28%、0.36%和0.50%。DES-A-MSD法提取率最高,大約是傳統(tǒng)提取工藝SD 法的2 倍,且此法顯著縮短了提取時間。微波技術(shù)會加熱獨活細胞內(nèi)部的水分,使細胞壁破裂,加速了細胞內(nèi)揮發(fā)性成分的溶出,DESs 相比于水具有更好的溶解性和穿透力,能夠增大獨活在溶劑中的溶解度,使細胞內(nèi)成分不斷的擴散出來,進而提高獨活揮發(fā)油得率[21-22]。因此,DES-A-MSD 法的獨活揮發(fā)油得率高,且提取時間短,更利于獨活揮發(fā)油的提取。

        2.3 最佳DESs 的篩選

        DESs 由不同的天然化合物混合制備而成,其中氫鍵受體和氫鍵供體的不同組合會影響DESs 的理化性質(zhì)。通過尿素、甘油、乙二醇、乳酸、葡萄糖、檸檬酸、1,3-丁二醇與氯化膽堿的混合,制備出7 種DESs。其中一些DESs 需加入一定量的水以降低其黏度。精確稱取100 g 獨活粉末,使用磁力攪拌器,將稱好的獨活粉末與制備好的DESs,按照1∶3 的料液比進行混合攪拌,后轉(zhuǎn)入微波反應(yīng)器中,在微波功率600 W、溫度80 ℃的條件下反應(yīng)10 min,對混合物進行微波輻射預(yù)處理,然后加入200 mL 蒸餾水,磁力攪拌將其混勻,后將所有樣品溶液轉(zhuǎn)移至三頸燒瓶內(nèi)并放入微波反應(yīng)器中,如圖1 所示。將燒瓶與V 型提取器和回流冷凝管相連,實現(xiàn)獨活揮發(fā)油的收集和凝結(jié)水的回流。先設(shè)置微波功率600 W、溫度為103 ℃、反應(yīng)時間為5 min,讓混合物的溫度迅速升高,使其接近沸點,最后在微波功率400 W、溫度100 ℃的條件下持續(xù)蒸餾60 min。每次提取均有3 次重復(fù)。將收集的揮發(fā)油脫水處理,低溫(4 ℃)保存。揮發(fā)油得率計算公式如下。結(jié)果表明,不同的DESs 均可以提取出一定量獨活揮發(fā)油,但是得率有較大差異。其中,DES-4(氯化膽堿-乳酸)所提取的揮發(fā)油得率最高,得率達0.5%;DES-2(氯化膽堿-甘油)和DES-6(氯化膽堿-檸檬酸)所提取的揮發(fā)油得率次之,DES-5(氯化膽堿-葡萄糖)所提取的揮發(fā)油得率最低。這可能是由于有機酸類成分能夠更好吸收微波輻射,并促進獨活細胞大量釋放揮發(fā)性成分,進而提高揮發(fā)油得率[23]。最終考慮到揮發(fā)油得率,選擇DES-4 用于后續(xù)優(yōu)化實驗。

        圖1 微波提取揮發(fā)油裝置示意圖Fig. 1 Diagram of microwave extraction unit for volatile oil

        Y=V/W

        Y是揮發(fā)油得率,V是揮發(fā)油的體積,W是獨活粉末的質(zhì)量

        2.4 揮發(fā)油成分GC-MS 分析

        采用SH-Rxi-5 MS 色譜柱(30 m×0.25 mm×0.25 μm),對揮發(fā)油進行GC-MS 分析。程序初始溫度為50 ℃,保持3 min,后以4 ℃/min 升溫,溫度升至250 ℃,保持1 min。進樣口溫度為250 ℃,體積流量為1 mL/min,氦氣為載氣。離子源溫度設(shè)置為200 ℃,掃描范圍m/z33~500,質(zhì)譜采集3.5~54 min。分別使用數(shù)據(jù)庫(NIST14)比對和峰面積歸一化法對檢測到的化合物進行定性和定量分析。

        GC-MS 分析結(jié)果(表2)表明,SD 法得到揮發(fā)油成分占總峰面積的83.52%,MASD 法占97.92%,DES-A-MSD 法占80.6%。由此可見,DES-A-MSD法的揮發(fā)油得率最高,但是純度較低;而MASD 法提取的揮發(fā)油得率中等,純度最高。微波提取法加熱時間短,會降低揮發(fā)油熱降解,所以MASD 法提取出來的揮發(fā)油純度較高。SD 法加熱時間長,提取效率低,會導(dǎo)致熱降解,所以揮發(fā)油純度較低。另一方面,由于DESs 的溶解能力強,可能與部分非目標(biāo)成分有較好的親和力,導(dǎo)致一些非揮發(fā)性成分被萃取出來,雖然提高了得油率,但是降低了揮發(fā)油純度[24-25]。以上3 種方法得到的獨活揮發(fā)油中主要活性成分有β-瑟林烯、α-蛇床烯、紅沒藥醇、蛇床子素、2-羥基環(huán)十五酮。

        表2 獨活揮發(fā)油的主要成分Table 2 Main components of volatile oils from Angelica Pubescens Radix

        2.5 單因素試驗考察不同因素對揮發(fā)油得率的影響

        根據(jù)單因素試驗來探究HBA 與HBD 不同物質(zhì)的量、微波功率和DESs 含水量對獨活揮發(fā)油得率的影響。每個試驗均有3 次重復(fù)。

        2.5.1 HBA 與HBD 不同物質(zhì)的量比對獨活揮發(fā)油得率的影響 當(dāng)合成DESs 時,氫鍵受體(HBA)和氫鍵供體(HBD)的物質(zhì)的量比會影響DESs 的極性、黏度和表面張力[26]。保證其他實驗條件不變,本實驗考察了HBA 與HBD 不同物質(zhì)的量比(1∶1、1∶2、1∶3、1∶4、1∶5)合成的DESs 對獨活揮發(fā)油提取的影響,獨活揮發(fā)油得率分別為0.42%、0.50%、0.45%、0.38%、0.30%,當(dāng)物質(zhì)的量比從1∶1 減小到1∶2 時,揮發(fā)油得率不斷上升,且當(dāng)物質(zhì)的量比為1∶2 時,揮發(fā)油得率達到最大值,最利于獨活揮發(fā)油的提取,但當(dāng)物質(zhì)的量比小于1∶2 時,揮發(fā)油得率開始下降,這可能是因為物質(zhì)的量比的不同會影響DESs 的理化性質(zhì),在物質(zhì)的量比為1∶2 時,DESs 與獨活之間的氫鍵相互作用較強,進而促進了獨活揮發(fā)油的釋放[26]。

        2.5.2 不同含水量對獨活揮發(fā)油得率的影響 保證其他實驗條件不變,考察DESs 不同含水量(0、10%、20%、30%、40%)對揮發(fā)油得率的影響。大部分DESs 與傳統(tǒng)有機溶劑相比,黏稠度高,流動性較差,然而添加適量的水會使DESs 分子間的氫鍵逐漸斷裂,可顯著降低DESs 的黏度[27-28]。本研究設(shè)置5 個DESs 含水量梯度,考察DESs 含水量對獨活揮發(fā)油得率的影響,結(jié)果獨活揮發(fā)油得率分別為0.50%、0.53%、0.48%、0.45%、0.42%。發(fā)現(xiàn)DESs的含水量從0 增加到40%時,DESs 的流動性明顯增強,當(dāng)DESs 含水量從10%增加到40%時,揮發(fā)油得率呈下降趨勢,且達到最低值;當(dāng)含水量為10%時,揮發(fā)油得率達到最大值,這表明加入適量的水有利于揮發(fā)油的提取,可提高揮發(fā)油得率,而少量或者過量的水會削弱DESs 的溶解度,進而減弱其與獨活的相互作用,導(dǎo)致?lián)]發(fā)油得率降低。因此,DESs 含水量為10%時,最利于獨活揮發(fā)油的提取。

        2.5.3 不同微波功率對獨活揮發(fā)油得率的影響 微波作為一種介質(zhì)加熱模式,可以快速升溫,促進分子的振動,進而加速植物細胞纖維素的溶解[29-30],微波功率是影響揮發(fā)油得率至關(guān)重要的因素之一。保證其他實驗條件不變,考察不同微波功率(300、400、500、600、700 W)對獨活揮發(fā)油得率的影響。結(jié)果獨活揮發(fā)油得率分別為0.43%、0.50%、0.52%、0.46%、0.35%,當(dāng)微波功率從300 W 增加到500 W時,揮發(fā)油得率不斷上升且達到最大值,但當(dāng)微波功率超過500 W 時,揮發(fā)油得率開始呈下降趨勢。這可能是因為隨著微波輻射的增強,會激發(fā)DESs與獨活細胞的相互作用,但當(dāng)微波功率超過500 W時,較高的微波能量會使獨活細胞突然破裂,大量的混合物涌出,導(dǎo)致較多揮發(fā)性成分難以收集。綜上,微波功率為500 W 時最利于獨活揮發(fā)油的提取。

        2.5.4 獨活揮發(fā)油的最佳提取工藝 通過單因素試驗對獨活揮發(fā)油的提取工藝進行優(yōu)化,結(jié)果表明,最佳提取工藝為HBA 和HBD 的物質(zhì)的量比為1∶2,微波功率為500 W,DESs 含水量為10%,對此提取條件驗證后,獨活揮發(fā)油提取率為0.54%。與傳統(tǒng)的提取方法相比,DES-A-MSD 法具有綠色、環(huán)保、低能耗、高產(chǎn)能等優(yōu)點,這為天然產(chǎn)物中揮發(fā)油等活性成分的提取提供了新思路。

        2.6 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析

        選擇共有成分作為Q-Marker 的候選化合物,并通過TCMSP 和Swiss Target Prediction 數(shù)據(jù)庫來確定這些候選化合物的靶標(biāo),然后利用UniProt 數(shù)據(jù)庫獲得了與候選化合物有關(guān)的基因信息。將化合物與靶點導(dǎo)入到Cytoscape 3.2.1 軟件中,從而創(chuàng)建每個化合物與靶點作用的網(wǎng)絡(luò)圖。利用STRING 數(shù)據(jù)庫,成功地建立了蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間的相互作用(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)。結(jié)合DAVID數(shù)據(jù)庫,進行基因本體(gene ontology,GO)功能富集,并對京都基因和基因組大百科全書(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)的通路進行富集分析[31-33]。

        2.6.1 Q-Marker 候選成分的選擇 基于獨活揮發(fā)油GC-MS 分析的結(jié)果,將不同提取方法下?lián)]發(fā)油相對含量較高的主要共有成分作為候選成分,結(jié)果見表3。

        表3 揮發(fā)油質(zhì)量標(biāo)志物候選成分Table 3 Candidate ingredients of Q-Marker for volatile oils

        2.6.2 候選化合物的靶點預(yù)測 查找候選化合物作用靶點和靶點基因名,物種選定為“Human”,以可能性大于0 為篩選標(biāo)準(zhǔn),得到相應(yīng)的預(yù)測靶點。其中2-羥基環(huán)十五酮預(yù)測到了100 個靶標(biāo),紅沒藥醇預(yù)測到了100 個靶標(biāo),α-蛇床烯預(yù)測到了99 個靶標(biāo),β-瑟林烯預(yù)測到了23 個靶標(biāo),蛇床子素預(yù)測到了100 個靶標(biāo)。將所有靶點取并集、篩去重復(fù)值后得到268 個靶點。圖2 為成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖(V 形和圓形節(jié)點分別表示化合物和對應(yīng)的靶點,節(jié)點大小表示度值大?。?;從圖中可知,α-蛇床烯、紅沒藥醇、蛇床子素、2-羥基環(huán)十五酮對應(yīng)的靶點更多,影響更大。

        圖2 成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖Fig. 2 Component-target network

        2.6.3 PPI 分析 PPI 是細胞發(fā)揮功能的基礎(chǔ),具有調(diào)節(jié)機體生理病理狀態(tài)的重要作用[34-35]。使用STRING 數(shù)據(jù)庫對268 個與候選成分相關(guān)靶點進行深入分析,設(shè)定了蛋白交互參數(shù)的評分值超過0.9。將結(jié)果以tsv 格式的文件導(dǎo)入到Cytoscape 3.2.1 中,從而構(gòu)建了PPI 網(wǎng)絡(luò)(選取degree 大于中位數(shù)且大于14 的節(jié)點制作PPI 網(wǎng)絡(luò)圖),結(jié)果見圖3。選取網(wǎng)絡(luò)中度值(degree)前5 的靶點腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor,TNF)、絲裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)、雌激素受體1(estrogen receptor 1,ESR1)、半胱天冬酶3(caspase 3,CASP3)和過氧化物酶體增殖物激活受體γ(peroxisome proliferator activated receptor γ,PPARG)作為關(guān)鍵靶點。

        圖3 PPI 網(wǎng)絡(luò)圖Fig. 3 PPI network

        2.6.4 GO 與KEGG 富集分析 GO,即基因和蛋白質(zhì)功能的注釋體系,涵蓋了3 個獨立的本體類別:分子功能(molecular function,MF)、細胞組成(cellular component,CC)以及生物過程(biological process,BP),GO 提升了對基因功能進行預(yù)測的準(zhǔn)確度。KEGG 將基因、酶、化合物以及代謝和信號通路網(wǎng)絡(luò)整合在一起,是一個綜合性數(shù)據(jù)庫[36]。通過DAVID 數(shù)據(jù)庫,對268 個關(guān)鍵目標(biāo)靶點執(zhí)行了GO 功能的富集分析,共獲得858 個條目,其中BP 570 個、MF 201 個、CC 87 個,圖4 為P<0.05 的前5 的GO 富集分析條形圖。生物過程有胞漿鈣離子濃度的正調(diào)控、藥物反應(yīng)、疼痛感知等,分子功能有核受體活性、配體激活轉(zhuǎn)錄因子活性、鋅離子結(jié)合等,細胞組成為質(zhì)膜的組成部分、胞質(zhì)溶膠等。KEGG 分析獲得126 條通路,圖5 展示了P值小于0.05 的前9 個重要的KEGG 通路富集分析條形圖。這些通路包括了神經(jīng)活性配體與受體之間的交互作用、癌癥途徑和鈦信號等。

        圖4 GO 富集分析條形圖Fig. 4 Bar chart of GO enrichment analysis

        圖5 KEGG 富集分析條形圖Fig. 5 Bar diagram of KEGG enrichment analysis

        2.6.5 成分-靶點-通路網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建 圖6 為成分-靶點-通路的網(wǎng)絡(luò)圖。參照連接的度值(degree),分析得出紅沒藥醇(連接度為2)和α-蛇床烯(連接度為4)在網(wǎng)絡(luò)中顯示出較高的連接度。因此,紅沒藥醇和α-蛇床烯可以作為揮發(fā)油的Q-Marker。5 個關(guān)鍵靶點TNF、MAPK3、ESR1、CASP3 和PPARG 的連接度分別是98、73、65、64 和63,連接度較高,表明這5 個靶點的作用尤為重要;9 條通路中癌癥通路的度值是4 為最大值,是最為重要的一條通路。

        圖6 成分-靶點-通路網(wǎng)絡(luò)圖Fig. 6 Network of component-target-pathway

        2.6.6 關(guān)鍵靶點的組織分布 運用The Human Protein Atlas 數(shù)據(jù)庫查找TNF、MAPK3、ESR1、CASP3 和PPARG 5 個核心靶點的組織分布數(shù)據(jù),圖7 展示了運用Cytoscape 3.2.1 軟件構(gòu)建的靶點-組織網(wǎng)絡(luò)圖。結(jié)果顯示,MAPK3 與45 個組織相連接、PPARG 與32 個組織相連接、CASP3 與25 個組織相連接、ESR1 與6 個組織相連接、TNF 與5個組織相連接。度值前8 的組織分別是脾(spleen,4)、肺(lung,4)、骨髓(bone marrow,4)、扁桃體(tonsil,4)、甲狀腺(thyroid gland,3)、闌尾(appendix,3)、乳房(breast,3)和子宮頸(cervix,3)。關(guān)鍵靶點及其分布的組織與文獻所報道的獨活揮發(fā)油抗炎、抗腫瘤、理氣等藥理作用相對應(yīng)。

        圖7 靶點-組織網(wǎng)絡(luò)圖Fig. 7 Network of target-tissue

        2.7 分子對接分析

        通過Auto Dock Vina進行分子對接后用PyMOL軟件和Discovery Studio 進行可視化分析。

        2.7.1 受體與配體結(jié)構(gòu)獲取 根據(jù)成分-靶點-通路中節(jié)點的連接度,選取紅沒藥醇和α-蛇床烯2 個小分子作為配體,選取α-蛇床烯的作用靶點雌激素受體(estrogen receptor 1,ESR1)、過氧化物酶體增生激活受體γ(peroxisome proliferator activated receptor gamma,PPARG)、絲裂原活化蛋白激酶3(mitogenactivated protein kinase 3,MAPK3)和腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor,TNF)和紅沒藥醇可作用的靶點ESR1、PPARG 作為受體。從RCSB 數(shù)據(jù)庫下載PDBID 分別為6kn5、5gtn、2zoq 和4y6o 的ESR1、PPARG、MAPK3 和TNF 蛋白[37]。從Pubchem數(shù)據(jù)庫下載小分子紅沒藥醇和α-蛇床烯的3D 結(jié)構(gòu)用來對接。

        2.7.2 分子對接與可視化 在PyMOL(4.3.0)軟件中分離原始配體和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),在AutodockTools 中對其進行加氫、檢查電荷等處理,構(gòu)建對接網(wǎng)格盒等。使用Auto Dock Vina 進行分子對接,計算ESR1、PPARG、MAPK3 和TNF 與α-蛇床烯組合,以及ESR1、PPARG 與紅沒藥醇對接組合的得分。QMarker 與靶點蛋白結(jié)合位置見圖8。小分子α-蛇床烯與ESR1、PPARG、MAPK3 和TNF 蛋白之間的結(jié)合能分別為-26.8、-30.1、-31.8、-25.1 kJ/mol。小分子紅沒藥醇與ESR1和PPARG蛋白之間的結(jié)合能分別為-24.3 和-27.6 kJ/mol。如果小分子與蛋白之間的結(jié)合能是負值,且數(shù)值越?。ǎ?20.9 kJ/mol),則表明小分子與靶蛋白之間親和活性越強[38],因此,6 對對接小分子和蛋白之間均結(jié)合穩(wěn)定。

        圖8 分子對接圖Fig. 8 Molecular docking diagram

        3 討論

        本實驗采用SD 法、MASD 法和DES-A-MSD法提取中藥獨活中的揮發(fā)油,分析其化學(xué)成分的差異。通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測分析了揮發(fā)油的 QMarker。結(jié)果表明,DES-A-MSD 法的得油率最高,而MASD 法提取的揮發(fā)油含量最高。MASD 法能夠更加有效的提取揮發(fā)油的Q-Marker,而進一步篩選出更加優(yōu)異的DESs 用于揮發(fā)油的提取,是值得深入研究的課題。

        核心靶點TNF、MAPK3、ESR1、CASP3 和PPARG 與獨活揮發(fā)油Q-Marker 神經(jīng)保護、抑制相關(guān)酶活性、抗腫瘤、理氣作用等相關(guān)。TNF 能影響胰島素誘導(dǎo)的機體對葡萄糖的攝取進而控制血糖的迅速升高,還可以在脂肪細胞中誘導(dǎo)GKAP42 蛋白降解進而誘導(dǎo)對胰島素的抵抗,減緩脂代謝生物過程[39]。MAPK3 主要與癌癥和炎癥類疾病有關(guān),可以顯著降低血管內(nèi)皮細胞的炎癥反應(yīng)、氧化應(yīng)激、細胞凋亡[40]。ESR1 對性發(fā)育和生殖功能至關(guān)重要[41]。CASP3 是重要的抑癌基因,具有重要的生物學(xué)功能[42]。PPARG 與PPARA 相似,是結(jié)合降血脂藥物和脂肪酸的受體,一旦被激活,就可控制脂肪酸的過氧化β途徑,是血糖、血脂穩(wěn)態(tài)的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子[43]。分子對接分析進一步強化了Q-Marker 與其主要靶點間的緊密結(jié)合能力,理論上確立了Q-Marker 的顯著生物活性。該研究基于獨活揮發(fā)油提取及其成分含量的測定,探討了成分與靶點、靶點與組織的聯(lián)系,并通過分子對接等手段,揭示了獨活揮發(fā)油潛在Q-Marker 的特性。這為獨活揮發(fā)油的高效提取和質(zhì)量控制提供了更全面的參考,也為后期深入研究獨活作用機制提供基礎(chǔ)。

        利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突

        国产一国产一级新婚之夜| 亚洲人成网站色7799| 久久综合给合综合久久| 中国精品久久精品三级| 国产精品女同学| 国内自拍视频一区二区三区| 少妇精品无码一区二区三区| 丰满人妻无奈张开双腿av| 免费视频成人 国产精品网站| 特级国产一区二区三区| 欧美激情综合色综合啪啪五月 | 一二三四五区av蜜桃| 中文日韩亚洲欧美制服| 中文字幕大屁股熟女乱| 亚洲中文字幕免费精品| 久久精品国产99国产精品澳门| 欧美天欧美天堂aⅴ在线| AV无码免费不卡在线观看| 中文字幕人妻一区二区二区| 色综合久久久无码中文字幕| 久久天天躁狠狠躁夜夜96流白浆| 亚洲AV无码一区二区三区精神| 亚洲中文字幕精品久久a| 久久久久免费看成人影片| 欧洲色综合| 天堂av中文在线官网| 可以免费看亚洲av的网站| 青青草原精品99久久精品66| 国产国拍亚洲精品福利| 日韩五码一区二区三区地址| 久久久久久九九99精品| 精品国产自产久久久| 又污又黄又无遮挡的网站| 国产呦系列视频网站在线观看| 国产综合开心激情五月| 亚洲国产成人无码av在线影院| 亚洲制服无码一区二区三区| 日本在线综合一区二区| 色综合久久中文综合网亚洲| 国产黄在线观看免费观看不卡| 亚洲熟妇大图综合色区|