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        基于外表面修飾的固態(tài)納米通道用于生物標(biāo)志物分析的研究進(jìn)展

        2024-02-23 11:24:16袁麗珍林妮婭張?jiān)品?/span>胡晶晶婁筱叮
        應(yīng)用化學(xué) 2024年1期
        關(guān)鍵詞:生物檢測(cè)

        袁麗珍 林妮婭 張?jiān)品?胡晶晶 婁筱叮 夏 帆

        (中國(guó)地質(zhì)大學(xué)(武漢)生物地質(zhì)與環(huán)境地質(zhì)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 納米礦物材料及應(yīng)用教育部工程研究中心,材料與化學(xué)學(xué)院, 武漢 430074)

        生物標(biāo)志物是正常生理過(guò)程、致病過(guò)程或暴露/干預(yù)反應(yīng)的可測(cè)量指標(biāo),可以反映生物系統(tǒng)與潛在危害(可能是化學(xué)、物理或生物危害)之間的相互作用,可能是功能性的生理反應(yīng),也可能是細(xì)胞層面的生化反應(yīng),還可能是分子間的相互作用[1],因此建立準(zhǔn)確、靈敏和方便的生物標(biāo)志物檢測(cè)方法對(duì)于疾病研究[2]、早期診斷[3]、藥物評(píng)價(jià)[4]和人類健康監(jiān)測(cè)[5]具有重要意義。 離子、小分子、蛋白質(zhì)、多糖、核酸和細(xì)胞等物質(zhì)參與生物體的構(gòu)建,在大多數(shù)生物功能中起著關(guān)鍵作用。 大多數(shù)疾?。ㄈ绨┌Y)的發(fā)生和預(yù)后均與這些物質(zhì)的變化有關(guān)[6]。 因此,對(duì)離子、小分子、蛋白質(zhì)、多糖、核酸和細(xì)胞等生物標(biāo)志物進(jìn)行高靈敏、特異性地檢測(cè),對(duì)于研究其基本功能、了解生物過(guò)程和發(fā)展分子診斷具有重要意義。

        目前,科研工作者已經(jīng)開(kāi)發(fā)出了多種檢測(cè)生物標(biāo)志物的方法,如熒光法[7]、酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定[8]、比色測(cè)定[9]、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)[10]和表面等離子體共振和電泳[11]等。 這些方法可以檢測(cè)存在于血液、尿液和唾液中的生物標(biāo)志物。 然而,昂貴的儀器、復(fù)雜的樣品制備和緩慢的檢測(cè)速率限制了這些檢測(cè)技術(shù)的廣泛應(yīng)用。 固態(tài)納米通道傳感系統(tǒng)具有小型化、靈敏度高、分析速度快、無(wú)標(biāo)記和操作簡(jiǎn)單等優(yōu)勢(shì)而備受關(guān)注[12]?;诠虘B(tài)納米通道的傳感系統(tǒng)主要分為兩組: 內(nèi)壁修飾固態(tài)納米通道和外表面功能化固態(tài)納米通道[13]。 內(nèi)壁修飾固態(tài)納米通道可以實(shí)現(xiàn)對(duì)各類靶標(biāo)的原位和實(shí)時(shí)檢測(cè),然而,由于納米通道的直徑有限,內(nèi)壁修飾固態(tài)納米通道無(wú)法實(shí)現(xiàn)對(duì)大于納米通道孔徑的生物標(biāo)志物(如細(xì)胞)的原位和直接檢測(cè)[14]。 外表面功能化固態(tài)納米通道可以在納米通道的外表面進(jìn)行修飾,大的外表面積,使生物靶標(biāo)識(shí)別的可能性提高,也不受目標(biāo)大小的限制。 近年來(lái),外表面功能化固態(tài)納米通道已被廣泛研究,實(shí)現(xiàn)了對(duì)離子、小分子、蛋白質(zhì)、多糖、核酸和細(xì)胞的直接檢測(cè)。

        本文綜述了外表面功能化固態(tài)納米通道在生物標(biāo)志物分析的研究進(jìn)展。 內(nèi)容主要分為3個(gè)部分:首先,簡(jiǎn)要介紹了固態(tài)納米通道外表面功能化的方法; 其次,重點(diǎn)總結(jié)了外表面修飾固態(tài)納米通道傳感器在生物標(biāo)志物檢測(cè)方面的研究進(jìn)展,按檢測(cè)目標(biāo)分類,包括離子、小分子、生物大分子和細(xì)胞(圖1);最后,總結(jié)并展望了外表面修飾的固態(tài)納米通道所面臨的挑戰(zhàn)與發(fā)展機(jī)遇。

        圖1 本綜述內(nèi)容概覽Fig.1 The content of this review

        1 固態(tài)納米通道外表面功能化

        固態(tài)納米通道是指直徑在1~100 nm 且通道的長(zhǎng)度遠(yuǎn)大于孔徑的結(jié)構(gòu),因固態(tài)納米通道具有良好的幾何結(jié)構(gòu)、尺寸、機(jī)械穩(wěn)定性、易于改進(jìn)以及具有宏觀量子隧道效應(yīng)等優(yōu)點(diǎn),使固態(tài)納米通道成為材料學(xué)、物理化學(xué)和生物醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域的重點(diǎn)研究對(duì)象[15]。 納米通道功能化是豐富納米通道性能的重要方式,可以有效拓寬納米通道的應(yīng)用領(lǐng)域。 采用一系列功能化技術(shù),如物理氣相沉積、化學(xué)氣相沉積、化學(xué)鍍層、原子力沉積、等離子體聚合、共價(jià)鍵接枝、自組裝單分子層以及層層自組裝等[16],將特定功能性小分子、特定功能的聚合物、配體分子、核酸適配體、抗體以及納米顆粒等功能分子或者涂層,通過(guò)共價(jià)鍵或者非共價(jià)鍵作用,對(duì)稱或非對(duì)稱方式修飾到納米通道表面,可以賦予納米通道可以面向各種場(chǎng)景應(yīng)用的性質(zhì)和功能。 在基于固態(tài)納米通道的傳感系統(tǒng)中,外表面功能化固態(tài)納米通道的檢測(cè)主要是基于離子信號(hào)的變化來(lái)實(shí)現(xiàn)的,通過(guò)對(duì)外表面探針的接枝密度、電荷密度、潤(rùn)濕性和帶電性的調(diào)控實(shí)現(xiàn)對(duì)生物標(biāo)志物的檢測(cè)[17-22]。

        2 外表面修飾的固態(tài)納米通道用于生物標(biāo)志物檢測(cè)

        在近些年的發(fā)展過(guò)程中,基于固態(tài)納米通道的傳感器憑借表面功能化和選用功能分子作為探針,實(shí)現(xiàn)了對(duì)生物標(biāo)志物的廣泛檢測(cè)。 本節(jié)按檢測(cè)目標(biāo)分類,對(duì)外表面修飾的固態(tài)納米通道在離子、小分子、生物大分子和細(xì)胞等生物標(biāo)志物分析檢測(cè)的研究進(jìn)展進(jìn)行總結(jié)。

        2.1 離子的檢測(cè)

        生命體內(nèi)的各種離子在維持生命體各種生命活動(dòng)中扮演者不可或缺的作用,如維持細(xì)胞和生物體的酸堿平衡、構(gòu)成細(xì)胞某些復(fù)雜化合物的重要組成成分等。 這些離子的缺乏或者過(guò)量均會(huì)導(dǎo)致生命體的正常生命活動(dòng)出現(xiàn)嚴(yán)重的問(wèn)題。 例如,汞離子在體內(nèi)積累會(huì)嚴(yán)重影響身體健康[23]。 目前,已有電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)、熒光、比色和電化學(xué)等方法來(lái)檢測(cè)汞離子濃度。 然而,昂貴的儀器、復(fù)雜的樣品制備和緩慢的檢測(cè)速率限制了這些檢測(cè)技術(shù)的廣泛應(yīng)用,開(kāi)發(fā)高靈敏度和快速檢測(cè)的離子檢測(cè)工具具有相當(dāng)重要的意義。 Yan 等[24]報(bào)道了一種通過(guò)外表面功能化固態(tài)納米孔道特定識(shí)別汞的傳感方法,如圖2a 所示,將硫脲連接的2D 共價(jià)有機(jī)框架(JNU-3)作為識(shí)別單元,共價(jià)鍵合在多孔氧化鋁薄膜(AAO)的外表面上,由于硫脲連接的JNU-3 與Hg(Ⅱ)具有強(qiáng)特異性親和力,JNU-3@AAO 可檢測(cè)0.01~100 pg/mL的汞離子,檢測(cè)限低至3.28 fg/mL,10 pg/mL下Hg(Ⅱ)重復(fù)測(cè)定11次的相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差僅為3.8%。 硫脲連接的JNU-3和Hg(Ⅱ)可以在90 s內(nèi)實(shí)現(xiàn)相互作用,提高了檢測(cè)Hg(Ⅱ)的速度。

        圖2 (a) JNU-3@AAO 的納米流體傳感器檢測(cè)汞(Ⅱ)示意圖[24]; (b)仿生固態(tài)納米通道(DNA@IWHydrophilic+DNA@OSHydrophilic和DNA@IWHydrophilic+None@OSHydrophobic)傳感目標(biāo)的示意圖[25]Fig. 2 (a) Schematic illustration of JNU-3@AAO-based nanofluidic sensor for the detection of Hg(Ⅱ)[24];(b) Schematic diagram of bio-inspired solid-state nanochannels (DNA@IWHydrophilic+DNA@OSHydrophilic and DNA@IWHydrophilic+None@OSHydrophobic) sensing target[25]

        除了提高檢測(cè)速度,提高檢測(cè)離子的靈敏度也是目前研究者們面對(duì)的主要問(wèn)題之一。 受生物納米孔協(xié)同效應(yīng)的啟發(fā),Jiang等[25]在固態(tài)納米通道的內(nèi)壁涂覆親水性DNA探針(DNA@IWHydrophilic),外表面涂覆疏水性涂層(None@OSHydrophobic)構(gòu)建具有協(xié)同效應(yīng)的固態(tài)納米通道傳感器(圖2b)。 外表面修飾的疏水性涂層(None@OSHydrophobic)導(dǎo)致納米通道的有效直徑減小,可以阻止干擾元素進(jìn)入納米通道,通過(guò)與內(nèi)表面修飾相結(jié)合實(shí)現(xiàn)在復(fù)雜環(huán)境中對(duì)離子的準(zhǔn)確檢測(cè),使汞離子的檢測(cè)限降低至1 nmol/L,提升了檢測(cè)靈敏度。

        2.2 小分子的檢測(cè)

        除了離子,基于納米通道的傳感器也被用作分子傳感的新平臺(tái)[26]。 Xia 等[27]利用亞甲基藍(lán)的共價(jià)標(biāo)記和陽(yáng)離子RuHex 探針的靜電吸附,建立了一種雙電流信號(hào)生成的納米通道傳感平臺(tái),實(shí)現(xiàn)在限域空間內(nèi)檢測(cè)腺苷三磷酸(ATP)。 該平臺(tái)利用亞甲基藍(lán)電活性標(biāo)簽標(biāo)記,組裝后的DNA框架作為分子開(kāi)關(guān),介導(dǎo)電子轉(zhuǎn)移(ET)產(chǎn)生電解電流(EC)信號(hào),并引導(dǎo)跨膜離子傳輸(IT)產(chǎn)生IC信號(hào)。 DNA內(nèi)層框架上大量吸附的RuHex離子進(jìn)行電化學(xué)還原,通過(guò)ET過(guò)程產(chǎn)生EC信號(hào),自由存在的RuHex離子被ATP分解時(shí),逃離納米通道的內(nèi)部空間,從而產(chǎn)生明顯的信號(hào)變化,實(shí)現(xiàn)對(duì)ATP的靈敏檢測(cè)。

        氯霉素(CAP)作為一種常見(jiàn)的獸藥抗生素,被廣泛用于治療傷寒、霍亂和腦膜等傳染病。 然而,食物中微量的CAP殘留可能會(huì)對(duì)人體產(chǎn)生嚴(yán)重的副作用[28]。 因此,Yan等[29]開(kāi)發(fā)了一種基于適配體自組裝功能化的納米通道傳感器用于檢測(cè)食品中的CAP(圖3a)。 CAP 適配體(Apt)接枝到氨基功能化AAO 上(Apt@AAO),Apt 在Apt@AAO 進(jìn)一步自組裝成AAs 功能化的AAO(AAs@AAO)。 Apt 與CAP 的選擇性相互作用導(dǎo)致Apt 從AAs@AAO 分離,引發(fā)AAs@AAO 納米通道靈敏電流變化,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)復(fù)雜樣品中CAP的精確測(cè)定。 開(kāi)發(fā)的AAs@AAO納米通道傳感器顯示出從0.32~1600 pg/mL的寬線性范圍,檢測(cè)限低至0.1 pg/mL,相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差為2.9%的高精確性,以及在牛奶、奶粉和蜂蜜樣品中加標(biāo)CAP的回收率為93.4%~102.2%,實(shí)現(xiàn)了寬線性范圍、高精度和高靈敏度的CAP檢測(cè)。

        手性分子具有非對(duì)稱性質(zhì),其鏡像異構(gòu)體(對(duì)映體)在生物學(xué)、醫(yī)藥學(xué)和化學(xué)合成等領(lǐng)域中具有不同的生物活性、藥效和化學(xué)反應(yīng)性質(zhì)。 因此,準(zhǔn)確檢測(cè)手性分子的存在和濃度對(duì)于藥物研發(fā)、藥物安全性評(píng)估、環(huán)境監(jiān)測(cè)和化學(xué)合成等方面具有重要意義。 Kuang 等[30]采用界面自組裝技術(shù)構(gòu)建了一個(gè)含有手性配體且納米孔尺寸可定制的大規(guī)模非均膜體系,用以檢測(cè)具有手性結(jié)構(gòu)的萘普生(圖3b)。 該體系由帶負(fù)電荷的零維Cu2-x@Se NP 陣列組成。通過(guò)將帶負(fù)電荷的L-青霉胺(L-pen)插入Cu2-x@ Se(L-pen Cu2-x@ Se)膜中,提高離子整流,在近紅外區(qū)域(800~1600 nm)表現(xiàn)出圓二色性(CD)帶,在1440 nm 處最大強(qiáng)度為164.5 mdeg。 此外,通過(guò)控制層數(shù)、減少孔徑和調(diào)整功能配體,導(dǎo)致整流增加到114。 青霉胺的加入使得對(duì)萘普生的高對(duì)映選擇性識(shí)別成為可能,其顯示出極高的靈敏度,檢測(cè)限低至0.027 nmol/L。

        甲醛(HCHO)是一種常見(jiàn)的揮發(fā)性有機(jī)物,廣泛用于化工行業(yè),人一旦吸入過(guò)量的甲醛,容易患上白血病。 因此,檢測(cè)甲醛的存在和濃度對(duì)于保護(hù)人體健康非常重要。 目前,已經(jīng)發(fā)展出多種甲醛傳感器,但這些傳感器主要集中在改變探針的成分和結(jié)構(gòu)上,而很少研究界面潤(rùn)濕性對(duì)傳感器性能的影響。 由于甲醛在水中的溶解度較高,傳感器的納米通道應(yīng)具有較強(qiáng)的親水性,以確保甲醛可以自由地?cái)U(kuò)散到納米通道中并與探針充分接觸。 然而,過(guò)多的親水性基團(tuán)會(huì)導(dǎo)致“淹沒(méi)”現(xiàn)象,即過(guò)高的膜滲透性會(huì)嚴(yán)重削弱納米通道的整流效應(yīng)和檢測(cè)性能。 基于此,Zhang等[31]受生物水通道的啟發(fā),提出了一種后修飾可調(diào)控納米通道親水/疏水性平衡的策略(圖3c)。 通過(guò)利用2-氨基對(duì)苯二甲酸在AAO納米通道上可控地原位組裝配位聚合物(CPs)來(lái)調(diào)節(jié)親水/疏水平衡,以促進(jìn)HCHO檢測(cè)。研究發(fā)現(xiàn)CP/AAO異質(zhì)體中的疏水/親水平衡對(duì)于HCHO 的有效檢測(cè)起到了重要作用。 疏水的AAO屏障層有助于支撐限制效應(yīng),而親水性CPs 可以最大限度地降低接觸電阻并增加活性胺單元的數(shù)量,從而促進(jìn)HCHO 富集和反應(yīng),更有效地形成亞胺。 對(duì)HCHO的定量分析,經(jīng)過(guò)優(yōu)化的CP/AAO展現(xiàn)出從100 pmol/L~1 mmol/L的寬線性檢測(cè)范圍。

        2.3 生物大分子的檢測(cè)

        2.3.1 蛋白質(zhì)的檢測(cè)

        蛋白質(zhì)是生命的物理基石,它們?cè)谏矬w的結(jié)構(gòu)功能、催化調(diào)節(jié)、運(yùn)輸和儲(chǔ)存等方面發(fā)揮著重要作用,對(duì)蛋白質(zhì)的高靈敏檢測(cè)有助于深入了解生物過(guò)程。 蛋白質(zhì)由20種不同的氨基酸組成,這些氨基酸折疊成不同的空間構(gòu)型,造就蛋白質(zhì)特定的3D 結(jié)構(gòu)[32]。 核酸適配體是一類短單鏈DNA(ssDNA)、RNA(ssRNA)或XNA(異種核酸,一種合成核酸類似物),可以通過(guò)核苷酸堿基互補(bǔ)配對(duì)、氫鍵、π-π堆積和靜電作用力等多種相互作用力發(fā)生自身適應(yīng)性折疊后形成特定的三維結(jié)構(gòu)來(lái)適應(yīng)具有高親和力和特異性的靶標(biāo)[33]。 基于此,Xia 等[34]將凝血酶適配體通過(guò)共價(jià)鍵固定在離子通道的外表面來(lái)檢測(cè)血清中的凝血酶(圖4a)。 當(dāng)目標(biāo)生物分子與適配體發(fā)生反應(yīng)時(shí),會(huì)阻塞通過(guò)納米通道-離子通道的離子流動(dòng),同時(shí)表面電荷和空間位阻效應(yīng)也會(huì)影響傳質(zhì)性能的變化,利用電化學(xué)檢測(cè)器可以實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)傳質(zhì)性能的變化。 在最佳pH 值條件下,凝血酶的檢測(cè)限可以低至0.22 fmol/L。 同樣,Kuang 等[35]通過(guò)對(duì)金納米顆粒進(jìn)行功能化修飾粘蛋白1(MUC1)適配體和自組裝,制備了具有高比表面積的離子通道(圖4b)。 通過(guò)調(diào)控金納米膜陽(yáng)極氧化鋁離子通道的最佳層數(shù),并在層間編碼適配體,建立了離子整流比與MUC1濃度之間的關(guān)系,實(shí)現(xiàn)了對(duì)MUC1的高靈敏檢測(cè)。 隨著2019年冠狀病毒的爆發(fā),快速、高度特異性和靈敏性的檢測(cè)試劑盒的研發(fā)成為研究熱點(diǎn)。 現(xiàn)有的綜合征冠狀病毒2(SARS-CoV-2)檢測(cè)方法主要基于酶促反應(yīng),需要昂貴的試劑,限制了在資源匱乏地區(qū)的普及使用。 基于此,Li等[36]設(shè)計(jì)了一種新的即時(shí)檢測(cè)工具。 如圖4c 所示,使用S1 適配體對(duì)多孔陽(yáng)極氧化鋁(PAA)進(jìn)行功能化,以特異性捕獲和檢測(cè)SARS-CoV-2 刺突S1 蛋白。 當(dāng)靶標(biāo)被適配體捕獲時(shí),納米通道表面的空間阻礙和電荷密度的變化將影響離子傳輸,導(dǎo)致電流大幅下降。 結(jié)合電化學(xué)技術(shù),SARS-CoV-2 刺突S1 蛋白無(wú)需酶促反應(yīng),一步靈敏地檢測(cè)SARS-CoV-2,檢測(cè)限低至1 fmol/L,且檢測(cè)結(jié)果與RT-PCR 結(jié)果完全一致,實(shí)現(xiàn)了快速、簡(jiǎn)便和高靈敏檢測(cè)。

        圖4 (a)凝血酶識(shí)別檢測(cè)原理示意圖[34]; (b)基于Au-AAO 離子通道檢測(cè)MUC1 的示意圖[35]; (c)用于檢測(cè)SARS-CoV-2的適配體功能化納米通道示意圖[36]Fig.4 (a) Schematic diagram of the principle of thrombin recognition detection[34]; (b) Schematic illustration of the detection of MUC1 based on the Au-AAO ion channel[35]; (c) Schematic illustration of the aptamer-functionalized nanochannels for one-step detection of SARS-CoV-2[36]

        蛋白質(zhì)水解是指用酶將蛋白質(zhì)分解成多肽和氨基酸,是一種不可逆的翻譯后修飾過(guò)程[37]。 當(dāng)納米通道上的探針被蛋白酶水解后,由于固態(tài)納米通道的“限域效應(yīng)”,引起表面電荷或者空間位阻變化導(dǎo)致固態(tài)納米通道的離子電流發(fā)生顯著的變化,從而有“信號(hào)放大”的作用[38-39]。 基于此,Li 等[40]構(gòu)建了非對(duì)稱納米通道原位自組裝肽,用于監(jiān)測(cè)細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)中的基質(zhì)金屬蛋白酶(MMP)(圖5a)。 在固態(tài)納米通道的表面修飾短肽單元,建立仿生細(xì)胞/細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)界面,當(dāng)MMP 與多肽連接位點(diǎn)發(fā)生反應(yīng)時(shí),離子電流發(fā)生變化,實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)胞外基質(zhì)中MMPs 的動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)。 此外,Xia 等[41]提出了一種利用納米通道外表面的潤(rùn)濕性變化來(lái)檢測(cè)腫瘤標(biāo)志物的策略。 研究人員在納米通道的外表面修飾了一種含有親水部分(CRRRR)、MMP-2 切割部分(PLGLAG)和疏水部分(Fn)的兩性肽探針(圖5b)。 在MMP-2 的作用下,由于疏水部分的釋放,外表面的親水性會(huì)增加,從而導(dǎo)致離子電流的增加。 研究人員還通過(guò)調(diào)節(jié)親疏水部分中苯丙氨酸(F)的數(shù)量(n),將檢測(cè)限降低到1 ng/mL(n=6),相比于n=2 時(shí)提高了50 倍。除了高靈敏的檢測(cè)MMP-2,該研究還證明了MMP-2 的表達(dá)與細(xì)胞周期有關(guān),在G1/S 期表達(dá)水平最高。 除以上2 種策略,Majumdar 等[42]通過(guò)調(diào)控固態(tài)納米通道的表面電荷進(jìn)行蛋白酶的檢測(cè)(圖5c)。選擇胰蛋白酶作為檢測(cè)方案的示范,當(dāng)胰蛋白酶切割涂在二氧化硅納米通道表面的聚-L-賴氨酸時(shí),納米通道表面電荷密度發(fā)生改變,通過(guò)監(jiān)測(cè)納米通道的離子導(dǎo)電性,實(shí)現(xiàn)對(duì)胰蛋白酶的靈敏檢測(cè),結(jié)果表明納米通道傳感器的靈敏度可達(dá)到5 ng/mL。

        圖5 (a) PAA 上的肽自組裝用于動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)仿生細(xì)胞/細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)界面的MMP 示意圖[40]; (b)多肽探針功能化的固態(tài)納米通道檢測(cè)MMP-2的示意圖[41]; (c)胰蛋白酶裂解胰蛋白酶-聚-L-賴氨酸反應(yīng)實(shí)驗(yàn)程序示意圖[42]Fig. 5 (a) Schematic diagram showing the peptide self-assembly on the block layer of PAA for dynamic monitoring of MMP activities at the biomimetic cell/ECM interface[40]; (b) Schematic of the solid-state nanochannel detection of MMP-2 by peptide probe functionalization[41]; (c) Schematic drawing of experimental procedures for the trypsin-PLL cleavage reaction[42]

        除以上提及的非共價(jià)識(shí)別和酶水解多肽外,利用蛋白質(zhì)上富含的巰基基團(tuán)也可實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的檢測(cè)和蛋白質(zhì)狀態(tài)的鑒定。 具體來(lái)說(shuō),近來(lái)Lou等[43]開(kāi)發(fā)了一種含馬來(lái)酰亞胺基團(tuán)的四苯乙烯基(MI-TPE)外表面探針修飾的納米通道陣列傳感平臺(tái)通過(guò)輸出光電雙信號(hào)實(shí)現(xiàn)未折疊蛋白質(zhì)的檢測(cè),此外,根據(jù)單個(gè)硫醇基團(tuán)的變化還可以用來(lái)區(qū)分蛋白質(zhì)的折疊和未折疊狀態(tài)的能力(圖6)。 半胱氨酸是最少暴露在折疊蛋白質(zhì)表面的殘基,蛋白質(zhì)的展開(kāi)將增加暴露的半胱氨酸硫醇基團(tuán),通過(guò)在納米孔道外表面修飾可以與硫醇結(jié)合的MI-TPE探針,當(dāng)納米通道陣列外表面探針MI-TPE與硫醇結(jié)合后,由于MI-TPE的光致電子轉(zhuǎn)移淬滅以及分子內(nèi)運(yùn)動(dòng)的抑制,外表面上的MI-TPE熒光團(tuán)被激活。 同時(shí),外表面增加的表面電荷密度也導(dǎo)致了跨膜離子電流的增強(qiáng)。 通過(guò)這種機(jī)制,該平臺(tái)能夠識(shí)別含有不同巰基數(shù)量的模型蛋白質(zhì)的折疊和未折疊狀態(tài),且2種信號(hào)的整合為特定蛋白質(zhì)構(gòu)象提供了一個(gè)明顯的信號(hào),從而提高識(shí)別的可靠性。 基于對(duì)細(xì)胞中未折疊蛋白含量的高靈敏度檢測(cè),有望實(shí)現(xiàn)正常細(xì)胞和亨廷頓病突變細(xì)胞的準(zhǔn)確區(qū)分。

        圖6 用于鑒定未折疊蛋白的外表面功能化納米通道陣列的示意圖[43]Fig.6 Schematic representation of POS functionalized nanochannel array used to identify unfolded proteins[43]

        2.3.2 多糖的檢測(cè)

        多糖在大多數(shù)生物過(guò)程和事件的發(fā)展和維持中起著重要作用,包括細(xì)胞間相互作用、癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移和免疫系統(tǒng)活動(dòng)[44]。 某些疾病的產(chǎn)生和發(fā)展通常也伴隨著蛋白質(zhì)糖基化[45]。 目前,已經(jīng)開(kāi)發(fā)了一些用于檢測(cè)細(xì)胞表面多糖的方法,例如質(zhì)譜[46]、核磁共振[47]、色譜法[48]、光譜測(cè)定法[49]和電化學(xué)技術(shù)[50],上述方法大部分需要預(yù)富集,并且通常需要大量樣品。 當(dāng)樣品資源稀缺且昂貴時(shí),分析將變得具有挑戰(zhàn)性。因此,非常需要開(kāi)發(fā)檢測(cè)簡(jiǎn)單、小型化、靈敏高和特異性強(qiáng)的傳感器。 基于此,Wang等[51]設(shè)計(jì)了基于納米通道-離子通道的超靈敏、無(wú)標(biāo)記檢測(cè)細(xì)胞表面糖類的方法(圖7)。 研究利用PAA 的非對(duì)稱納米通道-離子通道以及由納米通道陣列引起的放大離子電流和由非對(duì)稱幾何引起的離子電流整流效應(yīng),賦予PAA 靈敏的離子電流響應(yīng)。 固定在納米通道-離子通道表面的刀豆蛋白A 能與多糖特異性結(jié)合,基于此原理構(gòu)建的納米流體器件可用于實(shí)時(shí)和無(wú)標(biāo)記的選擇性識(shí)別和檢測(cè)糖基。 此外,由于離子通道的亞納米尺寸,探針固定和糖類識(shí)別在PAA 的外表面上進(jìn)行,避免了樣品對(duì)PAA 納米通道的堵塞。 結(jié)果表明,可以成功檢測(cè)濃度在10 fmol/L~10 nmol/L 范圍內(nèi)的糖類,檢測(cè)限約為10 amol/L,明顯低于大多數(shù)先前的工作。

        圖7 PAA膜表面改性檢測(cè)多糖原理示意圖[51]Fig.7 Schematic diagram of the principle of PAA membrane surface modification detection of polysaccharides[51]

        2.3.3 核酸的檢測(cè)

        核酸包括脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA),是由許多核苷酸單體組成的生物大分子化合物,是生命中最基本的物質(zhì)之一。 微小RNA(miRNA)被認(rèn)為是癌癥診斷和預(yù)后中的一種生物標(biāo)志物[52],近幾年發(fā)展的檢測(cè)方法通常需要大量的樣本,對(duì)于一些樣本稀缺或價(jià)格昂貴的樣本的檢測(cè)是非常困難的[53]。 因此,開(kāi)發(fā)用于miRNA 檢測(cè)的小型化、高靈敏度和特異性的生物傳感器仍然具有挑戰(zhàn)性以及重要的臨床意義。 Xia 等[54]開(kāi)發(fā)了一種生物仿生納米通道-離子通道雜交系統(tǒng),結(jié)合電化學(xué)檢測(cè)器,用于無(wú)標(biāo)記、超靈敏地檢測(cè)細(xì)胞中的miRNA(圖8a)。 首先,在納米通道-離子通道雜交膜的外表面固定了單鏈DNA(ssDNA)作為探針,ssDNA 可以與細(xì)胞中的目標(biāo)miRNA 雜交。 由于雜交系統(tǒng)的獨(dú)特傳質(zhì)特性,可以使用電化學(xué)技術(shù)實(shí)時(shí)、靈敏地監(jiān)測(cè)DNA-miRNA 雜交動(dòng)力學(xué)。 該系統(tǒng)可以輕松檢測(cè)到0.1 fmol/L~0.1 μmol/L的miRNA,檢測(cè)限為15.4 amol/L,遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于大多數(shù)報(bào)道的工作。 更重要的是,由于離子通道的超小尺寸,DNA 探針的固定和雜交過(guò)程可以在離子通道的外表面進(jìn)行,有效避免通道的阻塞和損壞,從而顯著提高了可重用性和準(zhǔn)確性。

        圖8 (a)納米通道-離子通道雜化物表面改性和檢測(cè)miRNA示意圖[54]; (b) DNA靶標(biāo)通過(guò)T4多核苷酸激酶反應(yīng)觸發(fā)的RCA過(guò)程示意圖[57]Fig. 8 (a) Illustration of surface modification and miRNA detection on the nanochannel-ionchannel hybrid[54]; (b) Schematic illustration of the RCA process triggered by DNA targets through the T4 polynucleotide kinase reaction illustration of surface modification and miRNA detection on the nanochannel-ionchannel hybrid[57]

        DNA被認(rèn)為是納米通道分析中強(qiáng)大的探針,能夠解決特定目標(biāo)識(shí)別和高效信號(hào)轉(zhuǎn)換的問(wèn)題,這是由于DNA具有可編程和可預(yù)測(cè)的Watson-Crick堿基配對(duì)。 因此,它可以通過(guò)已驗(yàn)證的擴(kuò)增技術(shù),如PCR和滾環(huán)擴(kuò)增(RCA),被植入到具有數(shù)百到數(shù)千個(gè)堿基對(duì)的DNA擴(kuò)增子中[55-56]。 Gao等[57]提出了一種集成的納米通道分析策略,通過(guò)將高負(fù)電荷的RCA擴(kuò)增子固定在納米通道外表面上,實(shí)現(xiàn)了通過(guò)空間電荷效應(yīng)增強(qiáng)離子信號(hào)的目標(biāo)識(shí)別(圖8b)。 由于高負(fù)電荷的RCA擴(kuò)增子具有100 nm的尺寸,離子電流急劇增加了7454%。 在孔徑(26±8) nm的聚對(duì)苯二甲酸乙二酯膜的單個(gè)納米通道的外表面上,由miRNA-21觸發(fā)的RCA擴(kuò)增子實(shí)現(xiàn)了對(duì)miRNA-21的單堿基錯(cuò)配檢測(cè),靈敏度達(dá)到了6 fmol/L。 理論和實(shí)驗(yàn)結(jié)果均表明,離子信號(hào)隨著每個(gè)納米通道的局部表面電位的增加而增加,并通過(guò)降低納米通道的孔隙率密度而進(jìn)一步增強(qiáng)。 該體系利用DNA作為識(shí)別分子,構(gòu)建了一個(gè)高靈敏度和特異性的傳感平臺(tái),對(duì)于操縱離子傳輸,離子電路的潛在邏輯門控和滲透能量轉(zhuǎn)換的潛在離子篩選方面具有應(yīng)用前景。

        2.4 細(xì)胞的檢測(cè)

        癌癥統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示,90%的癌癥相關(guān)死亡是由癌癥轉(zhuǎn)移引起的[58]。 當(dāng)腫瘤細(xì)胞從原發(fā)腫瘤部位轉(zhuǎn)移到外周血時(shí),它們將成為循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTCs)。 因此,在早期發(fā)現(xiàn)CTCs對(duì)癌癥的有效治療具有重要意義[59-60]。 Wang 等[61]提出了一種利用納米通道-離子通道雜交體與電化學(xué)檢測(cè)技術(shù)相結(jié)合的方法,實(shí)現(xiàn)對(duì)CTCs 的高效捕獲和靈敏檢測(cè)(圖9a)。 通過(guò)在孔徑~50 nm 的AAO 離子通道表面固定可以選擇性地與CCRF-CEM(一種CTC)細(xì)胞膜上高表達(dá)的跨膜受體蛋白酪氨酸激酶7 結(jié)合的適配體探針sgc8c,實(shí)現(xiàn)對(duì)CTCs的選擇性捕獲。 被捕獲的CTCs有效地覆蓋離子通道入口,從而阻塞了納米通道-離子通道雜交體中的離子流動(dòng),導(dǎo)致傳質(zhì)特性的變化。 此外,由于陣列通道相對(duì)于單一通道具有放大響應(yīng)的特點(diǎn),檢測(cè)靈敏度可以大幅提高。 對(duì)于急性白血病CCRF-CEM,該體系成功檢測(cè)到1×102~2×106個(gè)cell/mL,檢測(cè)限為100 個(gè)cell/mL。 本方法為CTCs 的捕獲、檢測(cè)和釋放提供了一種簡(jiǎn)單、靈敏和無(wú)標(biāo)記的技術(shù),在癌癥的早期臨床診斷和治療中具有巨大的潛力。

        圖9 (a)納米通道-離子通道雜化體上CTC 捕獲和釋放過(guò)程的示意圖[61]; (b) CTC 捕獲和釋放過(guò)程的示意圖以及DAN/AAO混合體的相應(yīng)I-V曲線[62]Fig. 9 (a) Diagrammatical illustration of the CTCs capture and release process on the nanochannel-ion channel hybrid[61]; (b) Schematic demonstration of the CTCs capture and release processes and the corresponding I-V curves of the DAN/AAO hybrid[62]

        然而,納米孔道小的表面積和相對(duì)光滑的表面是有效捕獲細(xì)胞的一個(gè)大挑戰(zhàn)。 離子通道的超小尺寸可能會(huì)阻止相對(duì)較大的藥物分子或帶負(fù)電荷的分子不能通過(guò),這會(huì)限制其在細(xì)胞下游分析中的應(yīng)用,如藥物分析運(yùn)輸、篩查和癌癥治療。 Li 等[62]構(gòu)建了靈敏的多模態(tài)(化學(xué)、電和光學(xué))平臺(tái)來(lái)研究細(xì)胞原位行為。 通過(guò)樹(shù)狀聚合物(聚酰胺,PAMAM)和二硫化碳連接AuNPs,形成樹(shù)枝狀聚合物-Au 納米顆粒網(wǎng)絡(luò)(DAN)薄膜,原位自組裝到孔徑~40 nm AAO 的表面形成了DAN/AAO 雜交膜(圖9b)。 由于AuNPs的高表面-體積比和PAMAM 的高密度結(jié)合位點(diǎn),形成的網(wǎng)絡(luò)形成更大的表面積,從而暴露更多的功能基團(tuán),導(dǎo)致DAN/AAO 雜交膜上更加不對(duì)稱的結(jié)構(gòu)和表面電荷密度分布,從而導(dǎo)致明顯的整流離子(ICR)輸運(yùn)。 DAN/AAO 雜化表面上氨基的存在使陰離子選擇性雜化膜能夠產(chǎn)生ICR 現(xiàn)象,也能促進(jìn)陰離子選擇性。 此外,ICR 性質(zhì)可以通過(guò)電解質(zhì)溶液的離子價(jià)態(tài)和pH 值來(lái)調(diào)控。 ICR 增強(qiáng)了制備的DAN/AAO 雜交膜生物分析的能力,可以實(shí)現(xiàn)對(duì)CTCs的靈敏捕獲和檢測(cè),檢測(cè)限為80個(gè)cell/mL,并具有良好的可重用性。

        3 結(jié)論與展望

        綜上所述,隨著固態(tài)納米通道的進(jìn)步,基于外表面功能化固態(tài)納米通道的生物傳感器可以在基于離子信號(hào)的變化下實(shí)現(xiàn)對(duì)離子、小分子、蛋白質(zhì)、多糖、核酸和細(xì)胞等一系列靶標(biāo)的高靈敏檢測(cè)。

        毫無(wú)疑問(wèn),基于外表面功能化固態(tài)納米通道在生物標(biāo)志物檢測(cè)方面取得了重大進(jìn)展。 然而,在生物標(biāo)志物檢測(cè)方面仍然存在一些挑戰(zhàn)。 例如,實(shí)際樣品中的檢測(cè)通常需要進(jìn)行繁瑣的預(yù)處理,希望外表面功能化固態(tài)納米通道的檢測(cè)能夠?qū)崿F(xiàn)簡(jiǎn)化甚至消除對(duì)樣本的預(yù)處理。 此外,復(fù)雜環(huán)境中生物標(biāo)志物產(chǎn)生假陽(yáng)性信號(hào),導(dǎo)致對(duì)生物過(guò)程的錯(cuò)誤判斷或相關(guān)疾病的誤診,希望外表面功能化固態(tài)納米通道可以實(shí)現(xiàn)復(fù)雜環(huán)境中那個(gè)多樣本的同時(shí)檢測(cè),從而顯著提高診斷準(zhǔn)確性。 最后,基于納米通道傳感器的傳感原理尚不清楚,當(dāng)靜電效應(yīng)、尺寸排阻效應(yīng)和潤(rùn)濕性變化3種效應(yīng)同時(shí)影響靶標(biāo)與探針?lè)肿酉嗷プ饔脮r(shí)的離子電流時(shí),目前的技術(shù)無(wú)法判斷哪種效果在目標(biāo)識(shí)別中起主要作用。 無(wú)論如何,基于外表面功能化固態(tài)納米通道的研究遠(yuǎn)未結(jié)束。 隨著先進(jìn)的微納米加工和表征技術(shù)的快速發(fā)展,我們相信在不久的將來(lái),基于外表面功能化固態(tài)納米通道可以取得令人振奮的成就。

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