關(guān)鍵詞 團頭魴; lpin1 基因; 基因表達; 肌肉損傷修復(fù)
骨骼肌衛(wèi)星細(xì)胞(skeletal muscle satellite cell,MuSC)是參與肌肉受損后修復(fù)和再生過程的肌肉干細(xì)胞[1]。一旦肌肉受到損傷,MuSC 就會響應(yīng)并退出靜止?fàn)顟B(tài),然后增殖成為生肌前體細(xì)胞或肌母細(xì)胞[2],增殖結(jié)束后分化成肌細(xì)胞,以相互融合或和肌纖維融合的方式來修復(fù)受到損傷的肌肉組織,并補充骨骼肌衛(wèi)星細(xì)胞數(shù)量[3-4]。在這個過程中,MuSC會受到多種因子的調(diào)控,特別是以Pax7(paired box7)表達為特征的MuSC 發(fā)揮著十分關(guān)鍵的作用,缺乏Pax7 的衛(wèi)星細(xì)胞,會導(dǎo)致肌肉再生失?。?-6]。
Lpin1 既可以作為一種磷脂酸磷酸化酶(phos?pha-tidic acid phophyhydrolase,PAP)參與磷脂和甘油三酯的合成[7],也可以作為一種轉(zhuǎn)錄輔激活因子,調(diào)節(jié)脂類代謝相關(guān)基因的表達[8]。之前的研究發(fā)現(xiàn)Lpin1 在脂肪分解和脂肪細(xì)胞分化[9-10]、肝臟脂肪酸和脂蛋白生成[11]以及線粒體自噬中都發(fā)揮重要作用[12-14]。LPIN1 缺乏癥患者會出現(xiàn)肌肉萎縮和橫紋肌溶解癥[15-16],LPIN1 基因雜合子突變的患者也易患他汀類藥物誘導(dǎo)的肌病[17]。LPIN1 缺乏的脂肪肝營養(yǎng)不良小鼠在肌肉損傷后,再生肌纖維橫截面會減少,肌分化因子(myogenic differentiation,MyoD)的表達降低[18]。另外,小鼠Lpin1 基因缺乏會導(dǎo)致其骨骼肌纖維表型顯著變化,肌膜下線粒體質(zhì)量也有所增加[19]。在斑馬魚中,lpin1 基因的缺失會導(dǎo)致肌分裂缺陷,初級和次級運動神經(jīng)元減少[20]。以上研究說明,磷脂酸磷酸化酶基因可能在骨骼肌損傷后修復(fù)的過程中扮演著重要角色。
前期基于團頭魴骨骼肌損傷后的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),lpin1 基因在團頭魴肌肉損傷后差異表達[21],為進一步研究該基因的功能,本研究克隆團頭魴lpin1 基因,檢測lpin1 在團頭魴成魚各組織及胚胎發(fā)育過程中的表達模式,并分析肌肉損傷對該基因表達的影響,旨在為深入研究lpin1 基因在魚類肌肉損傷修復(fù)過程中的作用機制提供理論依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 肌肉損傷試驗和樣品收集
本研究使用的團頭魴幼魚(1 齡)全長(15.62±2.33) cm,購自黃岡團頭魴養(yǎng)殖場,充氧袋打包運回華中農(nóng)業(yè)大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院試驗基地,并于池中暫養(yǎng)2 周后用于肌肉損傷試驗。供試魚用0.1% 的MS-222(Sigma)麻醉后,用直徑0.2 cm 的針頭插入其排泄孔上方側(cè)線附近的肌節(jié)中進行肌肉損傷操作,其中輕度損傷的長度約為0.3 cm,重度損傷的長度約為1 cm,深度約為0.5 cm。將損傷后的團頭魴魚體消毒后立即放入清水中,正常養(yǎng)殖。分別于損傷后0、24、48、72、96、144、216 h 取損傷部位的肌肉組織(規(guī)格為1.0 cm ×1.0 cm),所取樣品立即放入液氮中保存,每個時間點取9 尾魚樣本。
試驗所需胚胎及仔魚是通過3 對團頭魴親本人工授精而來。受精卵在平均水溫27 ℃左右的孵化桶中進行孵化,解剖鏡下觀察胚胎發(fā)育情況,取樣后立即放入液氮中保存。原位雜交所用胚胎去卵膜后于4% 多聚甲醛中4 ℃ 固定24 h 后脫水至甲醇中-20 ℃保存。另外,采集團頭魴成魚(n=3)肝臟、鰓、心臟、大腦、腸道和肌肉等6 個組織樣品,用于分析目的基因在各組織中的表達情況。
1.2 總RNA提取及cDNA合成
參照TRIzol? Reagent 說明書提取各時間點團頭魴胚胎、仔魚和成魚各組織及損傷肌肉的總RNA,用HiScript?ⅡQRT SuperMix for qPCR(+gDNA wip?er)試劑盒將提取的RNA 反轉(zhuǎn)錄成cDNA 后保存至-20 ℃。
1.3 基因的克隆
從筆者所在實驗室前期已有的團頭魴轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中獲得lpin1 基因的序列,通過PCR 驗證該基因的ORF 序列,并送至武漢天一輝遠(yuǎn)科技有限公司測序,PCR 引物見表1。
1.4 生物信息學(xué)分析
運用在線網(wǎng)站(www.ncbi.nlm.nih.gox/orffinder)預(yù)測氨基酸序列;使用MAGA 6.0 軟件構(gòu)建Lpin1 蛋白的系統(tǒng)進化樹、DNAMAN 軟件進行Lpin1 蛋白的多序列比對;蛋白質(zhì)信號肽預(yù)測、蛋白質(zhì)的理論分子質(zhì)量和理論等電點分析分別用軟件SignalP(www.cbs. dtu. dk/services/SignalP/)和Protparam(http://web.expasy.org/protparam)進行;利用NCBI 的CDD數(shù)據(jù)庫(www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd)預(yù)測Lpin1 蛋白的結(jié)構(gòu)域。
1.5 熒光定量PCR
為分析lpin1 基因的時空表達譜,本研究分別以團頭魴成魚各組織、胚胎發(fā)育各時期和不同損傷程度的肌肉的cDNA 為模板,以ef-1α 作為內(nèi)參基因,試驗步驟參照文獻[22],結(jié)果通過2-ΔΔCt法計算目的基因的相對表達量并使用GraphPad Prism 6 進行制圖。數(shù)據(jù)以Mean±SD 表示,采用單因素方差分析方法(ANOVA)和Duncan’s 進行差異表達分析,當(dāng)Plt;0.05 時為差異顯著。
1.6 整胚原位雜交
以團頭魴cDNA 作為模板擴增lpin1 基因,PCR產(chǎn)物回收后參照下列反應(yīng)體系進行體外轉(zhuǎn)錄:回收產(chǎn)物1 μg,DIG-labeling UTP Mix(10×)1 μL,Tran?scription buffer(5×)2 μL,T7/SP6 RNA 聚合酶(20U/μL)1 μL,RNase Inhibitor 1 μL,DEPC 水加至20μL;吹打混勻后37 ℃水浴2 h,然后加入1 μL DNas?eI 37 ℃水浴15 min 除去DNA 后合成探針。整胚原位雜交的步驟參照文獻[23]進行。
2 結(jié)果與分析
2.1 基因的序列分析
團頭魴lpin1 基因的ORF 序列長度為2 694 bp,編碼897 個氨基酸。預(yù)測的蛋白理論分子質(zhì)量為98.93 ku,理論等電點為5.43。SignalP 預(yù)測結(jié)果顯示,Lpin1 蛋白N-末端無信號肽,為非分泌型蛋白?;诙鄠€物種Lpin1 氨基酸序列的系統(tǒng)進化分析顯示,魚類聚為1 個分支,爬行類、鳥類和哺乳類形成另一分支,在魚類分支中團頭魴與鯉和斑馬魚的親緣關(guān)系最近(圖1)。多序列比對結(jié)果如圖2 所示,團頭魴Lpin1 和鯉的相似性最高(80.92%),其次是斑馬魚(79.55%),最低的是白沙鳉(53.33%)。對不同物種Lpin1 蛋白結(jié)構(gòu)域分析表明,該蛋白的氨基端、中間和羧基端都有一段高度保守的序列,分別為Lipin-N、Lipin-mid 和LNS2(Lipin/Ned1/Smp2)結(jié)構(gòu)域。
2.2 團頭魴lpin1 的時空表達
使用熒光定量PCR 分析lpin1 基因在團頭魴成魚各組織和胚胎各發(fā)育階段的表達,結(jié)果發(fā)現(xiàn)lpin1mRNA 在肌肉和心臟中的表達量最高且顯著高于其他組織(圖3)。另外,lpin1 基因在胚胎發(fā)育過程中的各個時期均有表達,但在出膜后的表達量相對較高,且隨著發(fā)育的進行其表達量逐漸增加并在出膜后8 d達到峰值(圖4)。整胚原位雜交結(jié)果進一步顯示,lpin1 在受精卵期就能檢測到高表達,并且在體節(jié)生成期前的各時期呈現(xiàn)持續(xù)而一致的泛表達模式。從肌肉效應(yīng)期開始,可以在體節(jié)肌中觀察到弱表達,而在眼、端腦、中腦以及后腦中檢測到強信號,心跳期表現(xiàn)得尤其明顯;隨后的出膜期,其表達主要在大腦、肝臟和腸道,并且在體節(jié)肌中持續(xù)表達(圖5)。
2.3 肌肉損傷后團頭魴lpin1 和pax7 基因表達的變化
熒光定量PCR 結(jié)果顯示,與未損傷組相比,lpin1 和pax7 基因在輕度和重度損傷后24 h 的表達均下調(diào)。輕度損傷后,lpin1 表達量在48 h 達到峰值,然后降低,但在48~216 h 其表達量均高于對照組;而pax7 基因表達量在損傷后96 h 顯著升高,并在144 h 達到最高。重度損傷后,lpin1 表達量在72h 和216 h 時顯著高于對照組;pax7 表達量在48 h 和96~216 h 均顯著高于對照組,且在96 h 達到峰值(圖6)。
3 討論
本研究獲得了團頭魴lpin1 基因ORF 全長2 694bp,編碼897 個氨基酸。通過對不同物種功能結(jié)構(gòu)域分析發(fā)現(xiàn),該蛋白的氨基末端和羧基末端都有一段高度保守的序列,分別為Lipin-N 和LNS2(Lipin/Ned1/Smp2)結(jié)構(gòu)域。其中LNS2 結(jié)構(gòu)域包含了磷脂酸磷酸酶活性序列DxDxT 和轉(zhuǎn)錄共激活因子功能的活性位點基序LxxIL,DxDxT 的存在將Lpin1 鑒定為鹵代酸脫鹵酶超家族(haloacid dehalogenase super?family, HAD)的成員[24],PGC-1α 和PPARα 能通過與LxxIL 直接作用調(diào)節(jié)脂肪酸氧化基因的轉(zhuǎn)錄[8]。進化樹分析結(jié)果顯示團頭魴與其他魚類聚為一個分支,且與鯉和斑馬魚的親緣關(guān)系最近。Lpin1 的結(jié)構(gòu)域和進化樹分析說明其在進化過程中可能具有保守的生物學(xué)功能。
本研究發(fā)現(xiàn)lpin1 mRNA 在團頭魴成魚肌肉和心臟中的表達顯著高于其他組織。類似地,在小鼠中,lpin1 基因在脂肪、心臟和骨骼肌中高表達[7, 25]。斑馬魚中,l pin1 基因在胚胎早期發(fā)育過程中泛表達,隨后開始在體節(jié)中特異表達,受精后24 h 在頭部和體節(jié)肌表達,受精后72 h 僅在神經(jīng)嵴、頭肌和胸鰭處檢測到,但受精后6 d 在肌節(jié)特異性表達恢復(fù)[20]。與在斑馬魚中研究相符,我們的研究結(jié)果顯示,lpin1mRNA 從受精卵到體節(jié)生成期呈泛表達;肌肉效應(yīng)期和心跳期在眼和腦中檢測到強表達,出膜期在腦、肝臟和腸道的特異表達尤為明顯,在這個過程中,lpin1 在體節(jié)肌中持續(xù)弱表達。
當(dāng)骨骼肌出現(xiàn)損傷后,肌衛(wèi)星細(xì)胞被激活,通過增殖、遷移和分化形成肌細(xì)胞,經(jīng)過融合過程后形成新的肌纖維以修復(fù)受傷的肌肉組織[7,26-27]。肌衛(wèi)星細(xì)胞增殖分化過程中,受到生長因子和轉(zhuǎn)錄因子等不同類型信號分子的調(diào)控[28-29]。Pax7 作為肌肉發(fā)育和再生所需的MuSC 標(biāo)志物[30],在哺乳動物損傷后骨骼肌再生中發(fā)揮關(guān)鍵作用[31-32]。研究發(fā)現(xiàn)團頭魴肌肉損傷后,Pax7+細(xì)胞的數(shù)量在損傷后96~144 h達到峰值,且重度損傷的肌肉中Pax7+細(xì)胞的增殖比輕度損傷的肌肉更顯著[21]。在斑馬魚中,pax7 和pax3 的表達水平在損傷后4~5 d 達到峰值[33]。在小鼠成肌細(xì)胞中,Lpin1 可以抑制細(xì)胞外信號調(diào)節(jié)激酶1/2(extracellular signal-regulated kinase 1/2,ERK1/2)磷酸化進而抑制肌肉再生[18],而ERK 信號的激活發(fā)生在肌肉再生的早期階段[34]和傷口愈合過程中[35]。另外,在脂肪肝營養(yǎng)不良中Lpin1 缺乏會影響骨骼肌的再生能力[18],斑馬魚中l(wèi)pin1 缺失也會導(dǎo)致骨骼肌發(fā)育受損[20]。本研究也發(fā)現(xiàn)與損傷前相比,lpin1 基因在肌肉損傷修復(fù)過程中的表達發(fā)生顯著變化,這些結(jié)果都說明lpin1 基因可能參與肌肉的損傷修復(fù)過程。
綜上,本研究克隆獲得團頭魴lpin1 基因,其Lip?in-N、Lipin-mid 和LNS2 結(jié)構(gòu)域在進化上高度保守。時空表達結(jié)果顯示lpin1 在團頭魴成魚肌肉中的表達量最高,從受精卵到出膜后20 d 的各個時期均有表達,且肌肉效應(yīng)期和心跳期時在頭部和體節(jié)中特異表達。另外,本研究也發(fā)現(xiàn)團頭魴肌肉不同程度損傷后,lpin1 與pax7 基因表達變化呈現(xiàn)相似趨勢,這些結(jié)果可為研究lpin1 基因在魚類肌肉損傷和修復(fù)過程中的分子機制奠定基礎(chǔ)。