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        青貯玉米品質(zhì)相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析

        2024-01-01 00:00:00劉鵬飛王棟陳澤輝郭向陽吳迅王安貴涂亮祝云芳

        關(guān)鍵詞 青貯玉米; 品質(zhì)性狀; 全基因組關(guān)聯(lián)分析 ; 單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn); 優(yōu)異等位變異; 候選基因

        近年來,隨著人們生活水平不斷提高,肉類、蛋類、奶類等畜牧產(chǎn)品的市場(chǎng)需求也逐漸擴(kuò)大,畜牧業(yè)也因此迅速發(fā)展[1]。畜牧業(yè)的發(fā)展必然會(huì)加大對(duì)飼料的消耗,國(guó)內(nèi)飼料原料(玉米、小麥、大麥、高粱等)已經(jīng)不能滿足需求,仍需從國(guó)外進(jìn)口一部分玉米等飼料原料[2]。

        青貯玉米作為一種優(yōu)質(zhì)飼料資源,生物產(chǎn)量高、營(yíng)養(yǎng)價(jià)值高、適口性好、消化吸收率高,其資源創(chuàng)制和種植推廣可有效保障畜牧業(yè)的發(fā)展[3-4]。2023 年中央一號(hào)文件明確指出“大力發(fā)展青貯飼料”,據(jù)統(tǒng)計(jì),2023 年全國(guó)青貯玉種植面積達(dá)333 萬hm2 以上(http://www.nahs.org.cn/)。

        品質(zhì)性狀是評(píng)價(jià)青貯玉米的指標(biāo)之一,如粗蛋白含量、淀粉含量、中性洗滌纖維(neutral detergentfiber, NDF)含量、酸性洗滌纖維(acid detergent fi?ber,ADF)含量和可溶性糖含量等[5]。其中,粗蛋白作為生命活動(dòng)必需的基礎(chǔ)養(yǎng)分,其含量越高,飼料營(yíng)養(yǎng)品質(zhì)越好[6],越有利于牲畜的生長(zhǎng)與發(fā)育。淀粉在青貯玉米中含量較高,是飼用價(jià)值的重要基礎(chǔ),更是牲畜所需能量的主要來源[7]。中性洗滌纖維(NDF)和酸性洗滌纖維(ADF)是衡量青貯玉米作為粗飼料好壞的重要指標(biāo)[8]。NDF 主要包括木質(zhì)素、纖維素和半纖維素,可被牲畜部分吸收利用,其可吸收利用程度與牲畜的采食量有關(guān)[9];ADF 主要包括飼料中的木質(zhì)素和纖維素,牲畜一般不能吸收利用,且ADF含量越高,消化率越低[10]。一定量的可溶性糖有利于青貯發(fā)酵過程的進(jìn)行,其含量的高低是能否青貯成功的關(guān)鍵因素[11]。同時(shí),體外干物質(zhì)消化率是衡量青貯玉米營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)可消化性的尺度,是評(píng)價(jià)青貯玉米營(yíng)養(yǎng)價(jià)值的綜合指標(biāo)之一[12]。因此,揭示粗蛋白、淀粉、NDF、ADF、可溶性糖和體外干物質(zhì)消化率的遺傳機(jī)制對(duì)青貯玉米的選育具有重要意義,如利用分子標(biāo)記輔助選擇,通過遺傳改良提高青貯玉米的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值。

        前人對(duì)玉米粗蛋白、淀粉、NDF、ADF、可溶性糖和體外干物質(zhì)消化率的遺傳規(guī)律進(jìn)行了一些研究。Cardinal 等[13]以源自B73 × B52 的200 個(gè)重組自交系為試驗(yàn)材料,在葉鞘中檢測(cè)到11 個(gè)QTL 與ADF顯著相關(guān),在莖稈中檢測(cè)到11 個(gè)與ADF 和NDF 均顯著相關(guān)的QTL。Park 等[14]以158 個(gè)02S6140 ×KSS22 的F2 單株為定位群體,結(jié)合SSR 標(biāo)記,鑒定出4 個(gè)與糖含量相關(guān)的QTL。Zhang 等[15]以298 個(gè)BHO × B73 的F2:3家系為作圖群體,定位到與油分、蛋白質(zhì)和淀粉含量相關(guān)的QTL 分別有6 個(gè)、6 個(gè)和5個(gè)。Wang 等[16]以368 份自交系為材料,鑒定出73 個(gè)與ADF 含量顯著相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(sin?gle nucleotide polymorphisms,SNPs)。李燦[17]利用全基因組關(guān)聯(lián)分析的方法挖掘出了2 個(gè)與ADF 關(guān)聯(lián)的候選基因。李雪瑩等[18]通過構(gòu)建F2分離群體,利用SSR 標(biāo)記對(duì)玉米總淀粉、直鏈淀粉和支鏈淀粉基因QTL 進(jìn)行初步定位,共檢測(cè)到17 個(gè)與玉米淀粉含量有關(guān)的QTL。盧雨晴等[19]利用全基因組關(guān)聯(lián)分析對(duì)玉米自交系及測(cè)交群體的ADF 性狀進(jìn)行顯著SNPs 篩選,定位到部分與ADF 顯著相關(guān)的位點(diǎn)。Truntzler 等[20]利用QTL 元分析手段,對(duì)59 個(gè)與消化率性狀相關(guān)的QTL 進(jìn)行分析與比較,發(fā)現(xiàn)26 個(gè)與消化率相關(guān)的元QTL 位點(diǎn)。

        雖然對(duì)青貯玉米相關(guān)營(yíng)養(yǎng)指標(biāo)性狀的遺傳規(guī)律進(jìn)行了相關(guān)研究,也挖掘到了部分顯著相關(guān)的遺傳位點(diǎn),但主要集中在NDF 和ADF 等性狀,且未有高密度的遺傳圖譜,有待進(jìn)一步深入研究。此外,大多數(shù)研究是分別對(duì)這些指標(biāo)的相關(guān)遺傳位點(diǎn)進(jìn)行單獨(dú)挖掘,同時(shí)對(duì)多個(gè)營(yíng)養(yǎng)指標(biāo)進(jìn)行定位的相關(guān)研究較少;對(duì)多效遺傳位點(diǎn)挖掘的缺乏不利于一因多效位點(diǎn)在分子輔助育種上的應(yīng)用。同時(shí),前人所用材料主要以溫帶材料為主,對(duì)Suwan 等熱帶材料青貯品質(zhì)相關(guān)遺傳機(jī)制研究較少。因此,本研究基于包含5.6 萬個(gè)SNPs 的Maize SNP 50 芯片對(duì)183 份含有Suwan 和Tuxpe?o 等熱帶資源的自交系進(jìn)行基因型鑒定,結(jié)合表型數(shù)據(jù),進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析,挖掘出與玉米粗蛋白、淀粉、NDF、ADF、可溶性糖和體外干物質(zhì)消化率相關(guān)的QTNs,并利用生物信息學(xué)篩選出相關(guān)的候選基因,以期為后續(xù)選育營(yíng)養(yǎng)品質(zhì)優(yōu)良的青貯玉米品系提供科學(xué)依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        本研究的供試材料由183 份骨干自交系組成,包括Suwan、Tuxpe?o、Iodent 和Lancaster 等資源,遺傳背景豐富,且不同自交系間的株型、果穗等性狀差異較大,如青貯品種黔青446 的親本QB446 為熱帶材料,其植株葉片寬大且葉間密,生物產(chǎn)量大;溫帶自交系齊319、HCL645 等植株葉片數(shù)較少且窄,生物產(chǎn)量較低。

        1.2 田間設(shè)計(jì)

        183 份供試材料于2019 年4 月種植于貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院試驗(yàn)基地(106°39′ E, 26°30′ N),行長(zhǎng)3 m,行距60 cm,株距25 cm,單行區(qū),2 次重復(fù),自然散粉,常規(guī)田間管理。

        1.3 基因型鑒定

        當(dāng)供試材料長(zhǎng)到5 葉期,利用離心管采集葉片,采用改良CTAB 法提取基因組DNA,檢測(cè)合格后送北京康普森生物技術(shù)公司,基于包含5.6 萬個(gè)SNPs標(biāo)記的高密度基因芯片對(duì)供試材料進(jìn)行基因型鑒定。

        1.4 表型數(shù)據(jù)的測(cè)定與分析

        在籽粒乳線位置1/2 時(shí),每個(gè)材料選擇5 株長(zhǎng)勢(shì)、株型等較為一致的植株進(jìn)行收獲,并從地上部10cm 處收割;接著整株進(jìn)行粉碎并混合均勻,每行材料各取2 份1 kg 樣品分別裝入布袋,并于105 ℃烘箱中進(jìn)行1~2 h 殺青,再在65 ℃下烘干至恒質(zhì)量,然后進(jìn)一步粉碎為粉末,過孔徑0.25 mm 篩備用。

        本研究主要測(cè)定玉米粗蛋白、淀粉、NDF、ADF、可溶性糖和體外干物質(zhì)消化率;其中,粗蛋白的測(cè)定參照GB/T 6432-2018《飼料中粗蛋白的測(cè)定凱氏定氮法》的操作程序執(zhí)行;淀粉的測(cè)定參照GB/T20194-2018《動(dòng)物飼料中淀粉含量的測(cè)定 旋光法》的操作程序執(zhí)行;NDF 的測(cè)定參照GB/T 20806-2006《飼料中中性洗滌纖維(NDF)的測(cè)定》的操作程序執(zhí)行;ADF 的測(cè)定參照NY/T 145-2007《飼料中酸性洗滌纖維的測(cè)定》的操作程序執(zhí)行;可溶性糖的含量采用蒽酮-硫酸法測(cè)定;體外干物質(zhì)消化率采用胃蛋白酶-胰蛋白酶兩步體外消化法進(jìn)行測(cè)定。

        參照GB/T 25882-2010《青貯玉米品質(zhì)分級(jí)》對(duì)供試材料進(jìn)行品質(zhì)分級(jí)(表1)。利用Excel 2019軟件對(duì)表型數(shù)據(jù)進(jìn)行整理,用SPSS 統(tǒng)計(jì)分析軟件進(jìn)行描述性統(tǒng)計(jì)分析。

        1.5 全基因組關(guān)聯(lián)分析以及候選基因的預(yù)測(cè)

        根據(jù)最小等位基因頻率(minor allele frequency,MAF) gt; 0.05 且樣本缺失率lt; 20% 的標(biāo)準(zhǔn),篩選出高質(zhì)量SNPs?;赗 4.2.1 軟件的GAPIT 語言包,利用混合線性模型(mixed linear model,MLM)對(duì)表型和基因型進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析。以Plt;0.001 為閾值,鑒定出控制玉米粗蛋白、淀粉、NDF、ADF、可溶性糖和體外干物質(zhì)消化率的關(guān)鍵QTNs(quantita?tive trait nucleotides);同時(shí),參考Shim 等[21]的方法計(jì)算出顯著SNPs 的表型變異解釋率(phenotypic varia?tion explained, PVE)。在此基礎(chǔ)上,結(jié)合玉米B73 參考基因組(Ref Gen V4),利用生物信息分析手段,篩選出相關(guān)的候選基因。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 表型分析

        測(cè)定結(jié)果顯示,供試材料的粗蛋白含量6.46%~13.35%,變異系數(shù)為13.08%;淀粉含量6.71%~18.02%,變異系數(shù)為20.77%;NDF 含量40.83%~65.26%,變異系數(shù)為5.38%;ADF 含量19.46%~37.58%,變異系數(shù)為12.31%;可溶性糖含量4.31%~35.84%,變異系數(shù)為44.97%;體外干物質(zhì)消化率37.05%~57.73%,變異系數(shù)為7.59%(表2)。其中,粗蛋白含量≥7%的有181份自交系;淀粉含量≥15% 的有81 份;ADF 含量≤29% 的有114 份,≤26% 的有51 份,≤23% 的有11 份;NDF 含量≤55%的有48 份,≤50% 的有7 份,≤45% 的有1 份。按照青貯玉米品質(zhì)分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)(表1),有17 份自交系的品質(zhì)符合三級(jí)標(biāo)準(zhǔn),分別為14D1310、15D551、16XH-51、17HG825、17HG837、17HG850、QB44、QB193、QB196、QB506、QB662、QB2663、QB2721、QB2778、QB2894、M03 和Mei22。其中QB506 作為金玉818的親本,已于2019 年通過貴州省青貯玉米審定,符合該試驗(yàn)的結(jié)果。

        為進(jìn)一步了解不同性狀間的相關(guān)性,對(duì)玉米粗蛋白、淀粉、NDF、ADF、可溶性糖和體外干物質(zhì)消化率等性狀開展了Pearson 相關(guān)性分析(圖1);結(jié)果表明,淀粉含量與粗蛋白含量、ADF 和可溶性糖均呈極顯著負(fù)相關(guān)(Plt;0.01);相關(guān)系數(shù)分別為-0.27、-0.21 和-0.42;可溶性糖與ADF 呈顯著相關(guān)(Plt;0.05),相關(guān)系數(shù)為0.18;而NDF 與可溶性糖呈極顯著負(fù)相關(guān)(Plt;0.01),相關(guān)系數(shù)為-0.30。

        2.2 親緣關(guān)系和主成分分析

        根據(jù)主成分分析結(jié)果及其系譜信息,可將183 份自交系大致分為4 個(gè)類群(圖2A)。其中,Ⅰ群主要包括Suwan 種質(zhì),如T32;Ⅱ群主要包括Iodent 種質(zhì),如HCL645;Ⅲ群主要包括Lancaster 種質(zhì),如Mo17;Ⅳ群主要包括Reid 種質(zhì),如Shen5003?;贙inship分析(圖2B),發(fā)現(xiàn)大部分自交系間的親緣關(guān)系系數(shù)為0.0~0.5,僅有少部分為0.5~1.0,表明該183 份自交系間的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。同時(shí),主成分和親緣關(guān)系作為協(xié)變量用于后續(xù)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析。

        2.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析

        根據(jù)最小等位基因頻率MAFgt;0.05 且樣本缺失率lt;20% 的標(biāo)準(zhǔn),篩選出40 498 個(gè)高質(zhì)量SNPs 用于全基因組關(guān)聯(lián)分析。利用MLM 模型分別鑒定出31、61、11、36、20 和42 個(gè)與粗蛋白、淀粉、NDF、ADF、可溶性糖及體外干物質(zhì)消化率顯著相關(guān)的SNPs(Plt;0.001)(圖3)。

        與粗蛋白顯著相關(guān)的SNPs 分布在9 條染色體上(圖3A),其中4 號(hào)染色體上有11 個(gè),2 號(hào)染色體有5個(gè),3 號(hào)染色體上有4 個(gè),1 號(hào)和10 號(hào)染色體上各有3個(gè),5 號(hào)染色體上有2 個(gè),6 號(hào)、7 號(hào)、8 號(hào)染色體上各有1 個(gè)。粗蛋白顯著相關(guān)SNPs 的表型變異解釋率為5.80%~11.40%,其中位于3 號(hào)染色體上的SYN1589 表型變異解釋率最高。

        與淀粉顯著相關(guān)的SNPs 分布在9 條染色體上(圖3B),其中6 號(hào)染色體上有19 個(gè),2 號(hào)染色體上有16 個(gè),4 號(hào)染色體上有7 個(gè),9 號(hào)染色體上有6 個(gè),5 號(hào)和8 號(hào)染色體上有4 個(gè),1 號(hào)和10 號(hào)染色體上各有2個(gè),3 號(hào)染色體上有1 個(gè)。淀粉顯著相關(guān)SNPs 的表型變異解釋率為5.78%~11.38%,其中位于6 號(hào)染色體上的SYN22472 表型變異解釋率最高。

        與NDF 顯著相關(guān)的SNPs 分布在6 條染色體上(圖3C),其中5 號(hào)染色體上有4 個(gè),1 號(hào)和2 號(hào)染色體上各有2 個(gè),3 號(hào)、7 號(hào)和10 號(hào)染色體上各有1 個(gè)。NDF 顯著相關(guān)SNPs 的表型變異解釋率為5.78%~7.85%,其中位于1 號(hào)染色體上的PZE-101058310 表型變異解釋率最高。

        與ADF 顯著相關(guān)的SNPs 分布在8 條染色體上(圖3D),其中2 號(hào)染色體上有9 個(gè),4 號(hào)和6 號(hào)染色體上各有6 個(gè),3 號(hào)和8 號(hào)染色體上各有5 個(gè),1 號(hào)染色體上有3 個(gè),7 號(hào)和10 號(hào)染色體上各有1 個(gè)。ADF 顯著相關(guān)SNPs 的表型變異解釋率為5.81%~10.37%,其中位于2 號(hào)染色體上的PUT-163a-29947492-1846表型變異解釋率最高。

        與可溶性糖顯著相關(guān)的SNPs 分布在6 條染色體上(圖3E),其中4 號(hào)染色體上有8 個(gè),5 號(hào)染色體上有4 個(gè),9 號(hào)染色體上有3 個(gè),2 號(hào)和10 號(hào)染色體上各有2 個(gè),7 號(hào)染色體上有1 個(gè)。可溶性糖顯著相關(guān)SNPs的表型變異解釋率為5.78%~7.35%,其中位于10 號(hào)染色體上的SYN19780 表型變異解釋率最高。

        與體外干物質(zhì)消化率顯著相關(guān)的SNPs 分布在7條染色體上(圖3F),其中6 號(hào)染色體上有28 個(gè),3 號(hào)染色體上有6 個(gè),2 號(hào)、7 號(hào)和8 號(hào)染色體上各有2 個(gè),4 號(hào)和5 號(hào)染色體上各有1 個(gè)。體外干物質(zhì)消化率顯著相關(guān)SNPs 的表型變異解釋率為5.79%~11.33%,其中位于6 號(hào)染色體上的PZE-106069016 表型變異解釋率最高。

        進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),有4 個(gè)遺傳位點(diǎn)存在一因多效的特性。其中,6 號(hào)染色體上的SYN6712、PHM1190.3 和SYN7541 同時(shí)與淀粉、體外干物質(zhì)消化率顯著關(guān)聯(lián);SYN6712 對(duì)淀粉和體外干物質(zhì)消化率的表型變異解釋率分別為6.66%、5.80%;PHM1190.3 對(duì)淀粉和體外干物質(zhì)消化率的表型變異解釋率分別為10.72%、6.45%;SYN7541 對(duì)淀粉和體外干物質(zhì)消化率的表型變異解釋率分別為6.12%、7.27%。4 號(hào)染色體上的PZE-104072386 同時(shí)與ADF、可溶性糖顯著關(guān)聯(lián),表型變異解釋率分別為6.41%、6.18%。

        2.4 多效位點(diǎn)的等位變異鑒定和表型效應(yīng)分析

        SYN6712、PHM1190.3、SYN7541 和PZE-104072386 是本研究發(fā)現(xiàn)的多效位點(diǎn)。在本研究供試群體中有164 份材料在SYN6712 攜帶T/T 基因型,10 份材料攜帶C/C 基因型,4 份材料攜帶T/C 基因型,其余5 份材料基因型缺失;并且在該位點(diǎn)攜帶T/T 基因型材料比攜帶C/C 基因型材料的淀粉含量和體外干物質(zhì)消化率分別平均增加3.80% 和3.62%,差異均達(dá)到極顯著水平(Plt;0.001)(圖4A),說明T/T 基因型是SYN6712 的優(yōu)異等位變異。在PHM1190.3 上有164 材料攜帶T/T 基因型,15 份材料攜帶C/C 基因型,2 份材料攜帶T/C 基因型,其余2 份材料基因型缺失;基因型為T/T 材料比基因型為C/C 材料的淀粉含量和體外干物質(zhì)消化率分別平均增加4.12% 和2.76%,差異分別達(dá)到極顯著(Plt;0.001)和顯著水平(Plt;0.01)(圖4B),說明T/T 基因型是PHM1190.3 的優(yōu)異等位變異。在SYN7541 上有131 份材料攜帶A/A 基因型,44 份材料攜帶G/G基因型,其余8 份材料攜帶A/G 基因型;基因型為A/A 材料比基因型為G/G 材料的體外干物質(zhì)消化率平均增加2.74%,差異達(dá)到極顯著(Plt;0.001),而該位點(diǎn)變異對(duì)淀粉含量沒有顯著影響(圖4C)。在PZE-104072386 上有121 份材料攜帶A/A 基因型,49 份材料攜帶C/C 基因型,9 份材料攜帶A/C 基因型,其余4 份材料基因型缺失;基因型為A/A 材料比基因型為C/C 材料的ADF 和可溶性糖含量分別平均降低2.03% 和4.39%,差異均達(dá)到極顯著(Plt;0.001)(圖4D)。其中,品質(zhì)符合三級(jí)標(biāo)準(zhǔn)的17 份自交系在多效位點(diǎn)的優(yōu)異等位變異均有2 個(gè)及以上(表3)。

        2.5 候選基因預(yù)測(cè)

        針對(duì)4 個(gè)多效遺傳位點(diǎn)進(jìn)行候選基因挖掘,結(jié)合公共數(shù)據(jù)庫(www.maizegdb.org),對(duì)候選位點(diǎn)進(jìn)行功能注釋,尋找位點(diǎn)附近的候選基因,通過評(píng)估預(yù)測(cè)基因與表型性狀之間的關(guān)聯(lián)性,篩選到4 個(gè)相關(guān)聯(lián)的候選基因。其中,同時(shí)與淀粉、體外干物質(zhì)消化率顯著相關(guān)的SYN6712、PHM1190.3 和SYN7541 分別與Zm00001d037272、Zm00001d037386 和Zm00001d037532 相關(guān)聯(lián)。同時(shí)與ADF、可溶性糖顯著相關(guān)的PZE-104072386 與Zm00001d051166 相關(guān)聯(lián)。其中,Zm00001d037272 編碼α-甘露糖苷酶,該酶是真核生物蛋白質(zhì)N-聚糖修飾的關(guān)鍵酶;在植物細(xì)胞壁中的糖蛋白含有大量N-聚糖結(jié)構(gòu),α-甘露糖苷酶對(duì)N-聚糖的修飾會(huì)直接影響細(xì)胞壁的結(jié)構(gòu);因此,α-甘露糖苷酶的表達(dá)可能破壞了青貯玉米的細(xì)胞壁,使其軟化利于發(fā)酵,提高體外干物質(zhì)消化率;同時(shí),參與糖蛋白的降解,與淀粉的形成密切相關(guān)。Zm00001d051166編碼苯丙氨酸解氨酶,該解氨酶是植物代謝途徑的關(guān)鍵酶之一,參與可溶性糖等次生代謝物和ADF 中木質(zhì)素的合成。

        3 討論

        3.1 青貯玉米親本的重要性

        我國(guó)青貯玉米產(chǎn)業(yè)起點(diǎn)晚、資源少、規(guī)模小,有待進(jìn)一步發(fā)展?,F(xiàn)階段,我國(guó)青貯玉米育種存在的主要問題之一是缺乏優(yōu)異的青貯親本,選育符合育種目標(biāo)的親本為當(dāng)前的難題之一。本研究發(fā)現(xiàn)17 份自交系的品質(zhì)符合青貯玉米品質(zhì)三級(jí)標(biāo)準(zhǔn),且17 份自交系在多效位點(diǎn)的優(yōu)異等位變異均有2 個(gè)及以上。其中,QB506 的粗蛋白、淀粉、NDF 和ADF 含量分別為10.98%、15.27%、54.81% 和28.43%。筆者所在團(tuán)隊(duì)利用QB506 作為親本之一,組配的金玉818 已于2019 年通過貴州省青貯玉米審定。同時(shí),金玉818的另一個(gè)親本T32,其粗蛋白含量為10.35%、淀粉含量為16.28%。此外,我們選育的另一個(gè)青貯玉米黔青446 的雙親(QB446、QB1545)同樣有較高的粗蛋白和淀粉含量,QB446 的粗蛋白和淀粉含量分別為10.75% 和14.72%,QB1545 的的粗蛋白和淀粉含量分別為10.96% 和12.97%。

        熱帶、亞熱帶玉米種質(zhì)具有生物產(chǎn)量高、品質(zhì)優(yōu)、抗逆性強(qiáng)、持綠期長(zhǎng)等特點(diǎn),符合當(dāng)前青貯玉米的育種目標(biāo),對(duì)我國(guó)的青貯玉米品種選育起著關(guān)鍵性作用。我國(guó)育成的大部分青貯玉米品種含有一定的熱帶血緣[22-24],例如京科青貯301、北青貯410、中農(nóng)大青貯67、雅玉青貯8 號(hào)、雅玉青貯26 和雅玉青貯04889 等[25]。優(yōu)良自交系是品種的保障,為了進(jìn)一步利用熱帶種質(zhì),國(guó)內(nèi)科研單位相繼選育出了一批糧飼兼用自交系,如Suwan 種質(zhì)S37、YA3729、YA3737,巴西熱帶種質(zhì)YA8201、YA8702,Tuxpe?o種質(zhì)YH-1 等,這些自交系的成功選育為我國(guó)青貯玉米的發(fā)展拓寬了新的途徑。常海濱[26]認(rèn)為熱帶、亞熱帶玉米與溫帶材料組配是青貯玉米的雜種模式之一。同樣,采用“熱×溫”模式組配的金玉818 和黔青446 為品質(zhì)優(yōu)、產(chǎn)量高、抗性好的強(qiáng)優(yōu)勢(shì)組合,適宜在貴州等西南地區(qū)種植[27-28]。

        3.2 多效遺傳位點(diǎn)分析

        遺傳位點(diǎn)的多效性對(duì)青貯玉米相關(guān)品質(zhì)性狀研究起著重要的作用,多效遺傳位點(diǎn)的鑒定有助于更好地理解不同品質(zhì)性狀間的遺傳相關(guān)性。Park 等[14]利用02S6140 和KSS22 構(gòu)建作圖群體,發(fā)現(xiàn)4 號(hào)染色體的umc1088-bnlg1265 區(qū)域同時(shí)與玉米的淀粉、葡萄糖和蔗糖有關(guān)。Wassom 等[29]發(fā)現(xiàn)在8 號(hào)染色體上的bnlg162–umc1130 區(qū)域同時(shí)與玉米籽粒的油分、蛋白和淀粉相關(guān)。Wang 等[16]利用368 份玉米自交系的莖稈品質(zhì)性狀進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)在1 號(hào)染色體的chr1.S_18202551、2 號(hào)染色體的chr2.S_198724413 和5 號(hào)染色體的chr5.S_79867527 均同時(shí)與ADF 和體外干物質(zhì)消化率相關(guān),4 號(hào)染色體的PZE-104075114、7 號(hào)染色體的chr7.S_2739958 和8號(hào)染色體的chr8. S_150908620 均同時(shí)與NDF 和ADF 相關(guān),6 號(hào)染色體的PZE-106111799 同時(shí)與NDF 和體外干物質(zhì)消化率相關(guān),6 號(hào)染色體的chr6.S_155653406 同時(shí)與NDF、ADF 和體外干物質(zhì)消化率相關(guān);其中PZE-104075114 與本研究發(fā)現(xiàn)的多效位點(diǎn)PZE-104072386 相隔4.15 Mb,chr6. S_155653406 與本研究發(fā)現(xiàn)的多效位點(diǎn)SYN6712、PHM1190.3 和SYN7541 分別相距40.52、35.42 和30.84 Mb,可見,6 號(hào)染色體可能存在著大量與青貯玉米品質(zhì)性狀相關(guān)的多效遺傳位點(diǎn),有待進(jìn)一步深挖,進(jìn)而構(gòu)建高密度青貯玉米品質(zhì)性狀相關(guān)的遺傳圖譜,利用分子輔助選擇產(chǎn)量高、品質(zhì)優(yōu)的青貯玉米品系。

        挖掘多效遺傳位點(diǎn)的優(yōu)異等位變異是利用分子標(biāo)記輔助選擇育種的首要條件之一[30-31];因此,α-甘露糖苷酶的表達(dá)可能破壞了玉米植株的細(xì)胞壁,使其軟化利于畜牧消化,提高體外干物質(zhì)消化率;同時(shí),參與糖蛋白的降解,可能與淀粉的形成密切相關(guān)[32]。Zm00001d037386 編碼跨膜蛋白,跨膜蛋白是細(xì)胞與外界聯(lián)系的橋梁,參與細(xì)胞膜內(nèi)外物質(zhì)交換、能量和信號(hào)的傳遞[33],可能與淀粉等物質(zhì)的吸收有關(guān)。Zm00001d037532 編碼6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-26-二磷酸酶,參與糖的代謝[34],可促進(jìn)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的降解,利于牲畜消化,提高體外干物質(zhì)消化率。Zm00001d051166 編碼苯丙氨酸解氨酶,該酶作為植物代謝途徑的關(guān)鍵酶之一,參與次生代謝物的合成,如可溶性糖和ADF 中木質(zhì)素等[35]。這些候選基因的發(fā)現(xiàn),可為品質(zhì)相關(guān)性狀的功能基因克隆提供一定的科學(xué)依據(jù)。

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