卓瑪,錢炳旭,吳曉東,戴建君,薛峰*
(1. 教育部動物衛(wèi)生與食品安全國際聯(lián)合研究實驗室,江蘇 南京 210000;2. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)三亞學(xué)院,海南 三亞 572000;3. 中國動物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心,山東 青島 266000)
非洲豬瘟(African swine fever,ASF)是一種急性、高度傳染性的豬病,在世界范圍內(nèi)導(dǎo)致大量豬死亡,給全球養(yǎng)豬業(yè)帶來巨大經(jīng)濟(jì)損失[1]。非洲豬瘟于1921年在肯尼亞被首次確診,1957至1972年傳入歐洲、美洲;2007年傳入歐亞接壤的格魯吉亞,隨后傳入俄羅斯并在高加索地區(qū)安家[2];2012至2018年傳入烏克蘭、白俄羅斯、歐盟立陶宛、匈牙利等國家[3];2018年8月以來在中國多地陸續(xù)發(fā)現(xiàn)疫情[4]。
由于目前尚無有效的非洲豬瘟疫苗[5-7],因此非洲豬瘟的防控主要依靠嚴(yán)格的生物安全措施。已有研究顯示,CD2v和MGF是非洲豬瘟病毒(ASFV)2個毒力基因,敲除后ASFV的毒力顯著降低[8-10],常用于作為ASFV減毒活疫苗缺失的靶點(diǎn)。目前,可鑒別檢測ASFV野毒株與基因缺失株的方法研究相對較少。為此,本研究選擇ASFV p72、CD2v、MGF110-14L基因,擬建立一種可鑒別ASFV野毒株與常見的疫苗候選缺失株的多重?zé)晒舛縋CR(qPCR)檢測方法,為ASFV的日常檢測提供便捷。當(dāng)前,我國針對ASFV的檢測依舊以O(shè)IE推薦的普通PCR和熒光定量PCR為主[11-14]。趙凱穎等[15]建立了ASFV實時熒光RAA檢測方法。但是,普通PCR或熒光定量PCR檢測方法存在一個明顯缺陷,即只能定性檢測病毒核酸,而不能有效鑒別樣品中是否具有感染性的活病毒。也就是說,只要樣品中存在一定量的病毒,不管是完整的具有感染性的活病毒還是通過加熱、紫外線等手段破外了遺傳物質(zhì)但保留了病毒核酸的滅活病毒,當(dāng)使用普通PCR或熒光定量PCR檢測時均會對其進(jìn)行擴(kuò)增。因此,迫切需要一種可以鑒別ASFV活/死病毒的鑒別檢測方法。準(zhǔn)確鑒別臨床樣品或飼料中是否存在具有感染性的活病毒,對非洲豬瘟的防控具有重要意義。隨著科技的不斷發(fā)展,出現(xiàn)了很多可鑒別檢測活/死微生物的檢測方法,其中包括流式細(xì)胞分選技術(shù)、拉曼光譜檢測方法、病毒分離培養(yǎng)等方法。董振華等[16]利用分離培養(yǎng)與拉曼光譜技術(shù)相結(jié)合,監(jiān)測區(qū)分沙門菌為死菌還是活菌;Schaad[17]利用Bio-PCR方法達(dá)到檢測活菌的目的;Lin等[18]通過脫氧膽酸鈉-單疊氮丙啶-qPCR快速準(zhǔn)確地檢測蝦中的活副溶血性弧菌。
疊氮溴化丙錠(PMA)是一種新型的核酸結(jié)合染料,能夠穿過細(xì)胞膜不完整的細(xì)胞,經(jīng)過暗孵育以及曝光處理后,PMA與DNA結(jié)合形成穩(wěn)定的共價鍵,從而修飾細(xì)胞死亡后暴露出來的DNA分子[19-21]。通常將PMA與qPCR結(jié)合,可同時達(dá)到定量和精確檢測感染性病毒與非感染性病毒(活/死病毒)核酸的目的。PMA在食品以及植物病原菌檢測活菌研究中已被廣泛應(yīng)用,如于璇等[22]利用PMA與qPCR技術(shù)相結(jié)合,建立了十字花科黑斑病菌(Pseudomonassyringaepv.maculicola)活菌的檢測方法。本研究將PMA與qPCR技術(shù)相結(jié)合,建立了一種ASFV多重PMA-qPCR檢測方法,既可實現(xiàn)單管鑒別ASFV野毒株與基因缺失株又可以同時鑒別檢測ASFV活/死病毒,為臨床檢測ASFV帶來更多的便捷。
豬肺泡巨噬細(xì)胞(PAMs)、ASFV、豬細(xì)小病毒(PPV)、豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)、偽狂犬病毒(PRV)、豬流行腹瀉病毒(PEDV)、口蹄疫病毒(FMDV)、豬德爾塔冠狀病毒(PDCoV)、豬圓環(huán)病毒2型(PCV2)、塞內(nèi)卡病毒(SVA)、pET-28a載體和23份臨床陽性樣品,均由中國動物衛(wèi)生流行病學(xué)中心提供。
根據(jù)ASFV China/2018/Anhui毒株序列,利用Bio Edit軟件分析核酸序列,應(yīng)用Snape Gene針對ASFV p72、CD2v、MGF1110-14L基因的保守序列分別設(shè)計特異性引物與探針(表1)。引物和探針均由通用(安徽)生物技術(shù)有限公司合成并純化。
表1 引物與探針序列
表2 多重PMA-qPCR與普通qPCR方法檢測實際樣品
1.3.1 重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品的構(gòu)建與鑒定
ASFV China/2018/Anhui毒株由中國動物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心提供并保存,利用病毒核酸提取試劑盒提取ASFV基因組DNA并以其為模板,利用普通PCR擴(kuò)增目的基因片段。PCR反應(yīng)體系:Green Mix 12.5 μL;上下游引物各1 μL;ASFV DNA 2 μL;去離子水補(bǔ)充至25 μL總體積。反應(yīng)程序:94 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,52 ℃ 30 s,72 ℃ 20 s,35個循環(huán);72 ℃ 10 min。
將ASFV(p72、CD2v、MGF110-14L)基因的PCR產(chǎn)物與pClone007載體連接、轉(zhuǎn)化至DH5ɑ感受態(tài)細(xì)胞,氨芐固體培養(yǎng)基上過夜培養(yǎng),菌液PCR鑒定正確后送至擎科(南京)生物技術(shù)有限公司測序,命名為pClone007- p72、pClone007-CD2v、pClone007-MGF110-14L。提取質(zhì)粒,利用酶標(biāo)儀測定質(zhì)粒濃度,計算拷貝數(shù)。 去離子水將質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行10倍連續(xù)稀釋,稀釋至質(zhì)粒終濃度為1×1012~1×101copies/μL,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3.2 多重qPCR引物、探針、退火溫度優(yōu)化
采用方陣法優(yōu)化引物、探針濃度,總體積為25 mL,其中2×PerfectStart Ⅱ Probe qPCR Super Mix 10 μL,引物F和R(10 μmol/L)各自加0.4、0.6、0.8、1.0、1.2 μL,探針P(10 μmol/L)加0.4、0.5、0.6、0.7、0.8 μL,Pclone007- p72、Pclone007-CD2v、Pclone007-MGF110-14L重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品各2 μL,混勻后作為模板,去離子水補(bǔ)充至25 μL。使用優(yōu)化好的引物和探針體系優(yōu)化退火溫度(56~64 ℃)。
1.3.3 特異性試驗
ASFV pClone007- p72、pClone007-CD2v、pClone007-MGF110-14L、PPV、PRRSV、PRV、CSFV、PEDV、FMDV、PDCoV、PCV-2、SVA病毒核酸為模板,去離子水為陰性對照,按優(yōu)化好的反應(yīng)體系進(jìn)行多重qPCR擴(kuò)增,以驗證該方法的特異性。
1.3.4 靈敏度試驗
分別以10倍連續(xù)稀釋的(102~108copies/μL)pClone007-p72、pClone007-CD2v、pClone007-MGF110-14L質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品混合液作為模板,去離子水為陰性對照,Ct值≥35判定為陰性,進(jìn)行多重qPCR擴(kuò)增,以質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品稀釋倍數(shù)為橫坐標(biāo),Ct值為縱坐標(biāo),驗證該方法的最低檢出限。
1.4.1 活/滅活病毒懸液制備
將ASFV感染PAMs細(xì)胞后,收集上清液,抽提病毒DNA,計算拷貝數(shù)。將病毒原液制備成1×106copies/μL,制得ASFV病毒懸液,另取1×106copies/μL ASFV病毒懸液在100 ℃下滅活15 min后制得ASFV滅活病毒懸液。
1.4.2 抑制滅活病毒擴(kuò)增不抑制活病毒擴(kuò)增的最適PMA濃度優(yōu)化
各取1×106copies/μL ASFV活/滅活病毒懸液,分別加入不同質(zhì)量PMA使其終質(zhì)量濃度為0、5、10、15、20、25 μg/mL,避光孵育15 min(后續(xù)進(jìn)行優(yōu)化),利用鹵素?zé)羝毓?5 min(后續(xù)進(jìn)行優(yōu)化),光照強(qiáng)度設(shè)為60 W(后續(xù)進(jìn)行優(yōu)化),提取DNA后進(jìn)行多重PMA-qPCR反應(yīng)。
1.4.3 暗孵育時間優(yōu)化
選取1×106copies/μL ASFV滅活病毒懸液,取6份200 μL滅活病毒懸液加入PMA混勻使其終質(zhì)量濃度為10 μg/mL,避光孵育0、5、10、15、20、25 min,曝光15 min(后續(xù)繼續(xù)優(yōu)化),光照強(qiáng)度60 W,提取DNA后進(jìn)行多重PMA-qPCR反應(yīng)。
1.4.4 光照時間優(yōu)化
選取1×106copies/μL ASFV滅活病毒懸液,取6份200 μL滅活病毒懸液,加入PMA混勻使其終質(zhì)量濃度為10 μg/mL,避光孵育10 min,光照0、5、10、15、20、25 min,光照強(qiáng)度60 W (后續(xù)優(yōu)化),提取DNA后進(jìn)行多重PMA-qPCR反應(yīng)。
1.4.5 光照強(qiáng)度優(yōu)化
選取1×106copies/μL ASFV滅活病毒懸液,取6份200 μL滅活病毒懸液加入PMA混勻使其終濃度10 μg/mL,避光孵育10 min,曝光15 min,光照強(qiáng)度0、20、40、60、80、100 W,提取DNA后進(jìn)行多重PMA-qPCR反應(yīng)。
取10倍梯度連續(xù)稀釋的活病毒懸液(101~108copies/μL)各200 μL,按優(yōu)化好的PMA條件處理,提取DNA后進(jìn)行多重PMA-qPCR反應(yīng),另設(shè)不加PMA對照組,即普通qPCR反應(yīng),以病毒稀釋倍數(shù)為橫坐標(biāo),Ct值為縱坐標(biāo)。Ct值小于35即可判定為陽性。
為驗證PMA對ASFV非感染性病毒擴(kuò)增產(chǎn)生抑制效果,將1.4.1方法中制備的1×106copies/μL ASFV活/滅活病毒懸液,各取1 mL加入4份ASFVp72基因臨床陰性樣品(Ct值=42)中,經(jīng)PMA處理后進(jìn)行多重PMA-qPCR檢測,分別驗證人工感染的ASFV活/滅活病毒樣品中活病毒存活數(shù)量,同時采用普通qPCR反應(yīng)進(jìn)行對比。
以中國動物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心提供的23份陽性臨床樣本,各取200 μL制備病毒懸液,利用OIE推薦的普通qPCR方法與本研究建立的多重PMA-qPCR檢測方法,分別對23份臨床樣本進(jìn)行驗證。同時,將這23份樣品100 ℃滅活15 min后按照上述兩種方法分別檢測,并比較其檢測結(jié)果,計算多重PMA-qPCR方法檢測活病毒的準(zhǔn)確率。
2.1.1 重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品的構(gòu)建與鑒定
使用ASFV DNA為模板,利用設(shè)計好的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果顯示,擴(kuò)增后獲得與預(yù)期大小一致的目的基因片段,依次為p72(158 bp)、CD2v(124 bp)、MGF110-14L(156 bp)。將目的片段回收純化后克隆于pClone007載體上,構(gòu)建重組質(zhì)粒pClone007- p72、pClone007-CD2v、pClone007-MGF110-14L,重組質(zhì)粒經(jīng)菌落PCR鑒定和測序鑒定正確,測得重組質(zhì)粒濃度分別為193、172.4和200 ng/μL,換算成拷貝數(shù)分別為11.4×1011、13.2×1011和3×1011copies/mL,作為多重qPCR的標(biāo)準(zhǔn)品。
2.1.2 多重?zé)晒舛縋CR引物、探針、退火溫度優(yōu)化
經(jīng)優(yōu)化后,確定反應(yīng)體系為25 μL:2×PerfectStart II Probe qPCR Super Mix 10 μL;引物濃度分別為p72 F和R(10 μmol/L)各加0.4 μL,p72 P(10 μmol/L)加0.2 μL,CD2v F和R(10 μmol/L)各加0.4 μL,CD2v P(10 μmol/L)加0.3 μL,MGF110-14L F和R(10 μmol/L)各加0.3 μL,MGF110-14L P(10 μmol/L)加0.6 μL;3個基因的質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品各3 μL混勻后作為模板;去離子水補(bǔ)充至25 μL總體積。擴(kuò)增溫度為60 ℃,整個擴(kuò)增包括45個循環(huán)時qPCR具有良好的擴(kuò)增曲線。
2.1.3 特異性試驗
按照1.3.3驗證該方法的特異性,結(jié)果顯示,該方法對ASFV- p72、ASFV-CD2v、ASFV-MGF110-14L重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品的擴(kuò)增結(jié)果為陽性,其余結(jié)果均為陰性(圖1)。表明本研究建立的方法具有較強(qiáng)的特異性。
1. p72基因;2. CD2v基因;3. MGF110-14L基因;4. 陰性對照和PPV、PRRSV、PRV、CSFV、PEDV、FMDV、PDCoV、PCV-2、SVA病毒核酸
2.1.4 敏感性試驗
將pClone007- p72、pClone007-CD2v、pClone007-MGF110-14L3個重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品原液制備成3×108copies/mL,各取10 μL混勻后連續(xù)稀釋,Ct值≥35為陰性。結(jié)果顯示,多重qPCR方法的最低檢測線為102copies/mL(圖2)。表明本研究建立的多重qPCR檢測方法有較高的靈敏性。
A:1~8. 101~108copies/mL的Pclone007-p72重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品;N.陰性對照;B:1~8. 101~108copies/mL的Pclone007-CD2v重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品;N.陰性對照; C:1~8. 101~108copies/mL的Pclone007-MGF110-14L重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品;N.陰性對照
2.2.1 PMA處理濃度優(yōu)化結(jié)果
選取1.4.1方法中制備好的1×106copies/μL ASFV活/滅活病毒懸液,各取200 μL活/滅活病毒懸液分別加入PMA終濃度為0、5、10、15、20、25 μg/mL,提取DNA后進(jìn)行多重PMA-qPCR擴(kuò)增。圖3A結(jié)果所示,活病毒懸液中隨著PMA質(zhì)量濃度的增大Ct值稍有波動但不明顯,當(dāng)加入PMA終質(zhì)量濃度為10 μg/mL時,不抑制活病毒的擴(kuò)增。圖3B結(jié)果所示,滅活病毒懸液中隨著PMA質(zhì)量濃度的增大,Ct值也逐漸上升,抑制擴(kuò)增效果越明顯,當(dāng)加入PMA終質(zhì)量濃度為10 μg/mL時,Ct值趨于平衡,繼續(xù)增加PMA終質(zhì)量濃度對Ct值的影響不大。因此,選擇PMA終質(zhì)量濃度10 μg/mL為本研究最適PMA處理濃度。
A.活病毒懸液添加不同PMA濃度;B.死病毒懸液添加不同PMA濃度
A.PMA暗孵育時間優(yōu)化;B.PMA光照時間優(yōu)化;C.PMA曝光強(qiáng)度優(yōu)化
A. p72基因(PMA-qPCR);B. CD2v基因(PMA-qPCR);C. MGF110-14L基因(PMA-qPCR);D. p72基因(普通qPCR)
A. 普通qPCR檢測4份人工感染的活病毒樣品;B. 多重PMA-qPCR 檢測4份人工感染的活病毒樣品;C. 普通qPCR檢測4份人工感染的滅活病毒樣品;D. 多重PMA-qPCR檢測4份人工感染的滅活病毒樣品
2.2.2 暗孵育時間優(yōu)化
取1×106copies/μL ASFV滅活病毒懸液200 μL,加入PMA混勻使其終質(zhì)量濃度為10 μg/mL,避光孵育0、5、10、15、20、25 min,光照強(qiáng)度60 W,光照15 min,進(jìn)行多重PMA-qPCR。結(jié)果顯示,當(dāng)避光孵育10 min時,Ct值達(dá)到37,繼續(xù)延長時間對Ct值的影響不大(圖4A)。因此,選擇最適的暗孵育時間為10 min。
2.2.3 光照時間優(yōu)化
取1×106copies/μL ASFV滅活病毒懸液200 μL,加入PMA混勻使其終質(zhì)量濃度為10 μg/mL,避光孵育10 min,光照時間0、5、10、15、20、25 min,光照強(qiáng)度60 W,進(jìn)行多重PMA-qPCR。結(jié)果顯示,當(dāng)光照15 min時,Ct值為37,隨著光照時間的延長Ct值并無明顯變化(圖4B)。為節(jié)省試驗時間不必繼續(xù)延長試驗時間,因此選擇最理想的曝光時間為15 min。
2.2.4 光照強(qiáng)度優(yōu)化
取6份1×106copies/μL ASFV滅活病毒懸液200 μL,加入PMA使其終質(zhì)量濃度為10 μg/mL,避光孵育10 min,曝光15 min,光照強(qiáng)度0、20、40、60、80、100 W,進(jìn)行多重PMA-qPCR。結(jié)果顯示,當(dāng)鹵素?zé)艄庹諒?qiáng)度為40 W時,達(dá)到抑制ASFV滅活病毒懸液擴(kuò)增的理想條件(圖4C)。
通過對PMA濃度、暗孵育時間、曝光時間以及曝光強(qiáng)度進(jìn)行優(yōu)化后,確定了PMA終質(zhì)量濃度10 μg/mL、暗孵育10 min、光照強(qiáng)度40 W、光照15 min時PMA實現(xiàn)對ASFV活病毒擴(kuò)增不受抑制,同時抑制滅活病毒擴(kuò)增的多重PMA-qPCR理想效果。
為驗證該方法的靈敏性,本研究利用多重PMA-qPCR與普通qPCR方法進(jìn)行靈敏度對比。結(jié)果顯示,多重PMA-qPCR和普通qPCR方法的靈敏度均為102copies/μL。
多重PMA-qPCR。p72:y=3.158x+3.742 7,R2=0.999(圖5A);CD2v:y=0.148x+3.71,R2=0.991(圖5B);MGF110-14L:y=0.152 7x+3.764 3,R2=0.993(圖5C)。普通qPCR。p72:y=3.414x+1.461,R2=0.999(圖5D)。綜上所述,PMA對活病毒的擴(kuò)增幾乎無影響。
利用多重PMA-qPCR方法與普通qPCR方法驗證4份人工感染的ASFV陽性樣品,結(jié)果如圖6所示。當(dāng)樣品中全為ASFV活病毒時,多重PMA-qPCR結(jié)果與普通qPCR中ASFVp72基因的Ct值幾乎一致,多重PMA-qPCR檢測p72基因Ct值分別為26.1、26.75、26.3、26.75;普通qPCR檢測p72基因Ct值分別為25.4、25.4、25.4、25.4。多重PMA-qPCR方法檢測CD2v、基因Ct值分別為26.3、26.7、26.3、26.1;檢測MGF110-14L基因的Ct值分別為26.3、26.5、26.3、26.3。統(tǒng)計學(xué)差異性分析顯示,多重PMA-qPCR檢測3個基因之間Ct值無顯著差別(圖6A,圖6B)。當(dāng)樣品中均為ASFV滅活病毒時,普通qPCR反應(yīng)仍能測得p72基因Ct值為28.0、28.0、28.0、28.0(圖6C),而經(jīng)PMA處理的多重PMA-qPCR方法測得p72、CD2v、MGF110-14L 3個基因Ct值,p72基因Ct值為36.5、36.8、36.4、36.7;CD2V基因Ct值為35.5、36.1、36.3、36.5;MGF110-14L基因Ct值為36.3、36.5、36.2、36.3(圖6D),符合臨床陰性樣品標(biāo)準(zhǔn)檢測線(Ct值≥35),說明滅活病毒的DNA被PMA抑制,不能繼續(xù)擴(kuò)增。顯然,相比于普通qPCR方法本研究建立的多重PMA-qPCR方法更能有效區(qū)分樣品中的ASFV活/滅活病毒。
利用多重PMA-qPCR與基于p72基因建立的普通qPCR方法對23份陽性樣本以及對應(yīng)23份滅活樣本進(jìn)行檢測。結(jié)果顯示,普通qPCR方法對感染性活病毒樣品與加熱滅活的非感染性死病毒樣品對p72基因的陽性檢出率均為100%;本研究建立的多重PMA-qPCR方法只能在感染性活病毒樣品檢出p72基因,不能在加熱滅活處理的非感染性死病毒樣品檢出p72基因。表明,本研究建立的多重PMA-qPCR方法能有效區(qū)分臨床樣品中的ASFV感染性與非感染性病毒(活/死病毒)。此外,對23份臨床樣品的多重PMA-qPCR檢測發(fā)現(xiàn),CD2V和MGF110-14L基因也均為100%陽性(圖略),說明臨床樣品中未發(fā)現(xiàn)這兩個基因的缺失株。
非洲豬瘟是由ASFV感染引起的豬的一種急性、熱性、高度接觸性傳染病,具有跨國跨地區(qū)的傳播能力,是養(yǎng)豬業(yè)的頭號殺手[23]。中國是養(yǎng)豬大國,ASFV感染導(dǎo)致我國養(yǎng)豬業(yè)受到嚴(yán)重的影響[24],當(dāng)務(wù)之急是建立完善的ASFV檢測體系,做到高速、高效、精準(zhǔn)地檢測ASFV,使其病毒扼殺在傳播初期。
目前,我國ASFV的檢測仍以普通PCR和熒光定量PCR為主[25]。然而,這兩種方法不能有效區(qū)分樣本中的感染性與非感染性病毒[26]。PMA-qPCR技術(shù)在植物病原菌檢測活菌的研究中被廣泛應(yīng)用[27-28],研究發(fā)現(xiàn)PMA能實現(xiàn)在不干擾活菌擴(kuò)增的條件下實現(xiàn)對死菌擴(kuò)增的抑制,這一現(xiàn)象彌補(bǔ)了普通PCR和熒光定量PCR的不足,很大程度上提高了病毒檢測的準(zhǔn)確性。
本研究建立的多重PMA-qPCR方法,當(dāng)加入PMA濃度為10 μg/mL、暗孵育10 min、光照強(qiáng)度40 W、光照15 min時PMA能夠抑制滅活病毒核酸擴(kuò)增且對活病毒核酸擴(kuò)增無影響,表明該方法能有效區(qū)分非洲豬瘟感染性活病毒與非感染性死病毒。通過對比普通qPCR與PMA-qPCR的靈敏度可知,兩者的靈敏度均為102copies/μL;多重PMA-qPCR與普通qPCR方法驗證人工感染樣品,結(jié)果顯示,當(dāng)樣品中全為ASFV活病毒時,多重PMA-qPCR結(jié)果與普通qPCR中ASFVp72基因的Ct差別不大;當(dāng)樣品中均為ASFV滅活病毒時,普通qPCR反應(yīng)仍能測得p72基因,而經(jīng)PMA處理的多重PMA-qPCR方法測得p72、CD2v、MGF110-14L基因Ct值,符合臨床陰性樣品標(biāo)準(zhǔn)檢測線(Ct值≥35),說明滅活病毒的DNA被PMA抑制,不能繼續(xù)擴(kuò)增;將PMA-qPCR方法用于23份實際非洲豬瘟陽性樣品的檢測,結(jié)果顯示,該方法檢測臨床樣品中帶有感染性活病毒的準(zhǔn)確率為100%,說明多重PMA-qPCR方法能有效區(qū)分臨床樣品中具有感染性的非洲豬瘟活病毒。由于本研究建立的多重PMA-PCR方法還能檢出CD2V和MGF110-14L基因,而這兩個基因是ASFV的毒力基因,常用于構(gòu)建ASFV疫苗缺失株的靶點(diǎn);因此,多重PMA-qPCR方法有望用于野毒株與疫苗缺失株鑒別檢測。
綜上本研究建立的多重PMA-qPCR檢測方法,具有特異性強(qiáng)和靈敏度高的特點(diǎn),可高效檢測ASFV活病毒,彌補(bǔ)了常規(guī)分子生物學(xué)檢測方法的缺陷,解決了目前臨床ASFV檢測方法的不足,給養(yǎng)豬業(yè)帶來更多的便捷,對ASFV早期診斷具有重大意義。