張萬(wàn)巧 閆 磊 朱麗娜 馬秀偉
中國(guó)人民解放軍總醫(yī)院第七醫(yī)學(xué)中心兒科醫(yī)學(xué)部 1.兒科研究所,2.兒內(nèi)科,3.出生缺陷防控關(guān)鍵技術(shù)國(guó)家工程實(shí)驗(yàn)室,4.兒童器官功能衰竭北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(北京 100700)
基于串聯(lián)質(zhì)譜(tandem mass spectrometry,MS/MS)的?;鈮A分析可用于輔助診斷有機(jī)酸血癥、脂肪酸氧化異常等多種遺傳代謝病[1](inherited metabolic diseases,IMD)。參與支鏈氨基酸及奇數(shù)碳脂肪酸代謝的多種羧化酶功能障礙導(dǎo)致體內(nèi)3 羥基異戊酰輔酶A 和3 羥基2 甲基丁酰輔酶A 的累積,二者通過肉堿酰基轉(zhuǎn)移酶酯化為3 羥基異戊酰肉堿(3-hydroxyisovalerylcarnitine,C5OH)[2]。據(jù)報(bào)道C5OH 是篩查多種羧化酶缺乏(multiple carboxylase deficiency,MCD)、3-甲基巴豆酰輔酶A 羧化酶缺乏(3-methylcrotonyl-coenzyme A carboxylase deficiency,3MCCD)、3 羥基3 甲基戊二酸尿癥(hydroxymethylglutaric aciduria,HMGA)、β-酮硫解酶缺乏(beta-ketothiolase deficiency,BKT)等多種疾病的有效標(biāo)志物,在新生兒篩查中得到廣泛應(yīng)用[3]。由于C5OH 相關(guān)疾病眾多,臨床表現(xiàn)及干預(yù)治療差異巨大,如何快速有效地對(duì)篩查異常患兒進(jìn)行鑒別、診斷十分關(guān)鍵。為探討中國(guó)北方臨床高危兒中C5OH 指標(biāo)的異常情況及對(duì)后續(xù)診斷的貢獻(xiàn),本研究綜合利用基于MS/MS、氣相質(zhì)譜(gas chromatography-mass spectrometry,GC-MS)的 代謝分析以及基于外顯子組測(cè)序的遺傳分析,通過研究C5OH 異?;純旱募膊∽V、代謝表型與變異基因型的關(guān)系,以期為優(yōu)化臨床診斷及干預(yù)決策提供參考和依據(jù)。
回顧性分析2012年11月至2021年10月中國(guó)人民解放軍總醫(yī)院第七醫(yī)學(xué)中心所有行MS/MS 篩查的0~7歲住院患兒的臨床資料。
本研究獲得患兒家長(zhǎng)的知情同意和醫(yī)院倫理委員會(huì)的批準(zhǔn)(No.2018-1)。
1.2.1 血/尿遺傳代謝病篩查 干血斑樣本采用非衍生化的方法,在Xevo TQD 串聯(lián)質(zhì)譜系統(tǒng)(美國(guó)Waters 公司)上,使用氨基酸和脂酰肉堿同位素內(nèi)標(biāo)NSK-A、NSK-B(美國(guó)劍橋同位素實(shí)驗(yàn)室)進(jìn)行檢測(cè)分析[4]。對(duì)初檢陽(yáng)性患兒進(jìn)行召回,重新采血樣復(fù)查?;鈮A譜并接受尿液GC-MS 檢測(cè)。尿液樣本采用尿素酶前處理,經(jīng)三甲基硅烷衍生化通過TRACE GC ULTRA-ISQ 氣相色譜質(zhì)譜儀(美國(guó)Thermo Fisher 公司)進(jìn)行分析[5];尿素酶、甲基硅烷化試劑BSTFA+TMCS(99:1)為美國(guó)Sigma 公司產(chǎn)品。所用化學(xué)試劑為色譜級(jí)純的甲醇、甲酸(美國(guó)Fisher Scientific 公司),分析級(jí)純的丙酮、正己烷、無(wú)水乙醇(北京化工廠)。質(zhì)譜檢測(cè)各代謝物指標(biāo)的切值,參考國(guó)家臨檢中心2019 版專家共識(shí)[6],結(jié)合本實(shí)驗(yàn)室質(zhì)控優(yōu)化確定[7]。指標(biāo)檢測(cè)結(jié)果超出切值上限或下限之外的認(rèn)定為指標(biāo)異常(升高或降低)。在疾病判斷時(shí),某指標(biāo)異常直接提示某種IMD 的被歸為篩查該病的主要指標(biāo);某指標(biāo)異常與某種IMD 相關(guān),但需與主要指標(biāo)結(jié)合才能做出判斷的被歸為次要指標(biāo)[8]。
1.2.2 基因變異分析及診斷標(biāo)準(zhǔn) 采集患兒及其父母EDTA 抗凝外周血,提取血液基因組DNA。采用Nimblegen 全外顯子芯片進(jìn)行捕獲,利用Illumina Hiseq 測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行高通量測(cè)序分析(北京智因東方轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中心)。所得疑似致病變異采用Sanger 測(cè)序驗(yàn)證,并參考美國(guó)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)學(xué)會(huì)(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)分類標(biāo)準(zhǔn)對(duì)可疑變異進(jìn)行致病性評(píng)估[9]。患者在同一致病基因上存在純合或復(fù)合雜合變異,且變異評(píng)估為“致病或可能致病”,結(jié)合血、尿代謝篩查結(jié)果及臨床表現(xiàn)給予診斷[10-11]。
采用SPSS 19.0 統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。計(jì)數(shù)資料以例(%)表示。非正態(tài)分布計(jì)量資料以中位數(shù)M(P25~P75)表示。
共檢測(cè)患兒53 119 例,檢測(cè)年齡3.0(2.0~3.7)天,男31 087 例、女22 032 例,男女比例1.41:1.53 119 例患兒中檢出C5OH 增高48 例,其中伴有其他指標(biāo)升高的共12 例,包括:?jiǎn)伟?-羥基丁酰肉堿(3-hydroxybutyryl carnitine,C4OH)升高4 例,單伴丙酰肉堿(propionyl carnitine,C3)升高4 例,同時(shí)伴C4OH、C3 升高2 例,同時(shí)伴甲基巴豆酰肉堿(methyl butyl carnitine,C5:1)、C4OH 升高2例。通過尿液GC-MS 檢測(cè),其中9 例檢出C5OH相關(guān)疾病代謝異常,生化診斷為有機(jī)酸血癥:包括MCD 4 例(血中C5OH、C3 同時(shí)增高),MCD 或3MCCD 2 例(血中僅見C5OH 升高,但部分MCD病例C3 可正常),BKT 2 例,HMGA 1 例。
生化診斷IMD 的9 例患兒的異常酰基肉堿水平分析見表1。C5OH 指標(biāo)在其余未診斷的53 110 例住院患兒干血斑樣本中的檢測(cè)濃度為0.13(0.10~0.18)μmol/L;在2 例診斷BKT(ACAT1變異)的患兒中僅輕度升高(平均濃度為切值上限的1.5倍),且同時(shí)伴有C5:1、C4OH 升高;在6 例診斷MCD(HLCS或BTD變異)的患兒中顯著升高(平均濃度為切值上限的9.6 倍);4 例(66.7%)伴C3升高;其中2 例(33.3%)還同時(shí)伴有C3/乙酰肉堿(C2)升高。
表1 各基因型診斷病例的血液?;鈮A分析結(jié)果(μmol·L-1)
提示MCD 的4 例患兒中,2 例檢出HLCS變異,確診為全羧化酶合成酶缺乏(holocarboxylase synthetase deficiency,HLCSD);2 例檢出BTD變異,確診為生物素酶缺乏(biotinidase deficiency,BTD)。提示BKT 的2 例均檢出ACAT1變異;提示HMGA的1 例檢出HMGCL變異。生化診斷未分型疑似MCD 或3MCCD 的2 例,1 例檢出HLCS 變異,另1 例檢出BTD變異,最終確診MCD。
9 例患兒的基因診斷均與生化診斷相符,MCD或3MCCD 的6 例患兒的變異檢出情況見表2,共檢出2 種變異基因,5 例為復(fù)合雜合,1 例為純合;共檢出9 種變異型,其中3 種為新發(fā)現(xiàn)的,分別為c.1313delC(HLCS)、c.172T>C(BTD)、c.491dupG(BTD)。HLCS病例1 和3 為滿族、同胞姐弟。
本研究干血斑M(jìn)S/MS 檢測(cè)中C5OH 單一指標(biāo)篩查陽(yáng)性率0.090%(48/53119),最終診斷IMD 9 例,陽(yáng)性檢出率1: 5902,假陽(yáng)性率0.073%(39/53110),陽(yáng)性預(yù)測(cè)值18.75%(9/48);C5OH 合并多指標(biāo)(C4OH、C3、C5:1)篩查陽(yáng)性率0.022%(12/53119),其中7例確診,假陽(yáng)性率0.009%(5/53110)顯著降低,陽(yáng)性預(yù)測(cè)值升高(58.33%,7/12)。另一血篩主要指標(biāo)C5:1 在53 119 例住院兒中升高的例數(shù)為92例,篩查陽(yáng)性率0.173%,高于C5OH,但C5OH合并C5:1 升高僅2 例,且后續(xù)均確診為BKT,陽(yáng)性預(yù)測(cè)值達(dá)100%。C5OH 異?;純赫倩貜?fù)查并行GC-MS 檢測(cè)時(shí),C5OH 升高合并尿代謝物異常9 例,后續(xù)全部確診,無(wú)一假陽(yáng)性,陽(yáng)性預(yù)測(cè)值100%。
基于MS/MS 的IMD 篩查指標(biāo)的設(shè)置既要盡量避免陽(yáng)性患兒的漏診、誤診,又要將陽(yáng)性召回率、假陽(yáng)性率控制在可接受的范圍,以避免不必要的入院、檢查、隨訪以及家屬的焦慮。目前關(guān)于MS/MS 篩查指標(biāo)的陽(yáng)性率、假陽(yáng)性率以及陽(yáng)性患兒疾病譜等,國(guó)內(nèi)鮮見報(bào)道。C5OH 是MS/MS檢測(cè)的重要指標(biāo),已列入包括我國(guó)在內(nèi)的多個(gè)國(guó)家、地區(qū)的新生兒IMD 篩查項(xiàng)目[12]。由于該指標(biāo)與MCD 等多個(gè)有機(jī)酸血癥相關(guān),僅憑單一指標(biāo)難以實(shí)現(xiàn)分型鑒別。另外,嚴(yán)重感染、腦梗、腦出血、早產(chǎn)、營(yíng)養(yǎng)不良等因素也可繼發(fā)血中C5OH 的增高[13-14],造成假陽(yáng)性的增加[15]。目前,可利用臨床表現(xiàn)、GC-MS 尿代謝譜分析、酶學(xué)檢測(cè)和基因分析等多種手段來(lái)實(shí)現(xiàn)后續(xù)的確診。為考察C5OH 指標(biāo)的診斷效能,以及如何綜合利用各手段以優(yōu)化診斷程序,本研究在53 119 例0~7 歲的高危兒中進(jìn)行了為期9 年的觀察,發(fā)現(xiàn)C5OH 單一指標(biāo)的假陽(yáng)性率為0.073%,陽(yáng)性預(yù)測(cè)值為18.75%。與梅奧醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室提出的MS/MS 新生兒篩查指標(biāo)的推薦要求(假陽(yáng)性率<0.3%,陽(yáng)性預(yù)測(cè)值>20.0%)[16]大致相當(dāng)。本研究利用C5OH 合并多指標(biāo)C4OH、C3、C5:1 綜合分析,可顯著降低假陽(yáng)性率,并提高陽(yáng)性預(yù)測(cè)值,C5OH 合并C5:1 升高確診BKT 的陽(yáng)性預(yù)測(cè)值達(dá)100%。
尿GC-MS 代謝分析是降低MS/MS 篩查假陽(yáng)性的重要手段。本研究在對(duì)C5OH 異?;純翰裳獜?fù)查的同時(shí),采集尿樣進(jìn)行GC-MS 檢測(cè)。通過血、尿代謝譜綜合分析,生化診斷IMD 9 例。其中7 例,包 括4 例MCD、2 例BKT、1 例HMGA 可根據(jù)異常代謝物明確分型;另外2 例疑似診斷MCD 或3MCCD,未得到分型。后續(xù)對(duì)9 例生化診斷病例,利用全外顯子組測(cè)序技術(shù)進(jìn)行遺傳分析,2 例疑診病例均明確為MCD;全部遺傳診斷結(jié)果均與生化診斷相符。血MS/MS 聯(lián)合GC-MS 尿檢測(cè)可生化確診HMGA、BKT 等疾?。磺液罄m(xù)基因測(cè)序驗(yàn)證中,未出現(xiàn)假陽(yáng)性病例,陽(yáng)性預(yù)測(cè)值高達(dá)100%。本研究未觀察到MS/MS 篩查陰性患兒出現(xiàn)C5OH 相關(guān)IMD 的疑似癥狀。由于隨訪時(shí)間較短,難以獲得篩查陰性患兒的基因信息,存在缺乏篩查假陰性相關(guān)結(jié)果等局限。
本研究中C5OH 代謝異常的主要疾病類型為MCD。MCD 是由于患者不能利用生物素所導(dǎo)致的可引發(fā)包括神經(jīng)系統(tǒng)在內(nèi)的多系統(tǒng)異常的有機(jī)酸血癥,包括HLCS和BTD兩種基因變異類型[16]。根據(jù)基因分析,本研究中HLCS和BTD缺陷占C5OH異常病因的66.7%(各為33.3%)。上述結(jié)果與南方浙江地區(qū)針對(duì)新生兒人群的發(fā)現(xiàn)不同。浙江新生兒篩查的C5OH 異常病例除3MCCD 外,未檢出其他疾病類型,致病主要遺傳原因?yàn)镸CCC1、MCCC2基因變異[17]。本研究結(jié)果提示了中國(guó)北方C5OH異?;純旱倪z傳特點(diǎn),并在此基礎(chǔ)上發(fā)現(xiàn)了MCD相關(guān)的3 種新變異型:HLCS(c.1313delC)、BTD(c.172T>C)和(c.491dupG)。
本研究結(jié)果顯示MS/MS 篩查單一指標(biāo)異常存在較高的假陽(yáng)性,可通過結(jié)合多指標(biāo)聯(lián)合分析、GC-MS 尿代謝檢測(cè)以及遺傳分析降低假陽(yáng)性率,提高診斷特異性和準(zhǔn)確性。MS/MS 聯(lián)合GC-MS 的血尿代謝分析可快速、有效獲得C5OH 相關(guān)異常的生化診斷,于明確分子診斷前及時(shí)指導(dǎo)臨床干預(yù)?;驒z測(cè)對(duì)鑒別HLCSD、BTD 等類型,以及后續(xù)進(jìn)行遺傳咨詢、產(chǎn)前診斷仍具有重要意義。