婁樹寶 楊夢平 邢金月 翟玲俠 王輝 劉春生 王立春 宋繼玲
(1 黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院克山分院/國家馬鈴薯種質(zhì)資源試管苗庫(克山),161005,黑龍江齊齊哈爾;2 青海大學(xué)農(nóng)林科學(xué)院,810016,青海西寧)
馬鈴薯是世界第三大糧食作物,種植面積僅次于小麥和水稻[1]。目前,全球有160 多個國家和地區(qū)種植馬鈴薯,中國的馬鈴薯種植面積和總產(chǎn)量均居世界首位,但單產(chǎn)沒有達(dá)到世界平均水平[2]。馬鈴薯是無性繁殖作物,生長過程中會受到病毒的侵染并且不斷積累,導(dǎo)致種薯退化減產(chǎn)。病毒病是馬鈴薯生產(chǎn)上的主要病害之一,其危害程度僅次于晚疫病,是馬鈴薯生產(chǎn)中極難解決的問題[3]。自1916 年第一個馬鈴薯病毒病被發(fā)現(xiàn)以來,目前已發(fā)現(xiàn)40 多種病毒侵染馬鈴薯,我國已報(bào)道的有16 種[4-5]。危害我國馬鈴薯生產(chǎn)的主要病毒有PVX、PVY、PVS、PVM、PVA 和PLRV,其中馬鈴薯Y 病毒(PVY)危害最為嚴(yán)重[6]。PVY是馬鈴薯生產(chǎn)中最常見的一種病毒,可引起花葉、皺縮、壞死等癥狀。它是全球分布范圍最廣、破壞性最大的馬鈴薯病毒之一,幾乎遍布所有的馬鈴薯種植區(qū)[7]。馬鈴薯感染PVY 后一般減產(chǎn)50%,當(dāng)與其他病毒復(fù)合侵染后,最高可減產(chǎn)80%[8]。馬鈴薯X 病毒(PVX)又稱普通花葉病毒,一般只產(chǎn)生輕微癥狀,產(chǎn)量損失可達(dá)10%~40%,若與PVY 或PVA 復(fù)合侵染可導(dǎo)致塊莖產(chǎn)量損失80%以上[9-10]。目前,針對馬鈴薯病毒病缺乏有效的防治措施,主要通過莖尖脫毒技術(shù)或者選育抗病毒的馬鈴薯品種,其中培育抗病毒品種是控制病毒最為簡便快捷、經(jīng)濟(jì)有效的途徑[11-12]。
篩選高抗馬鈴薯病毒病的資源,發(fā)掘抗病基因?qū)Ψ揽伛R鈴薯病毒病具有重大的意義。隨著馬鈴薯病毒病抗性基因的克隆及抗性遺傳研究發(fā)展,開發(fā)分子標(biāo)記進(jìn)行輔助選擇,篩選出具有抗性基因的馬鈴薯品種是一個快捷、精準(zhǔn)的方法[13-14]。在引起馬鈴薯病毒病的病毒中,PVY 和PVX 是危害比較嚴(yán)重的2 種病毒。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)3 個PVY抗性基因Ryadg[15]、Rysto[16]和Rychc[17],對PVY 具有極端抗性。Ryadg來源于安第斯亞種(Solanum tuberosumssp.andigena),1996 年被定位在11 號染色體的末端[18],根據(jù)Ryadg基因開發(fā)的標(biāo)記RYSC3 在國外育種中已經(jīng)成功應(yīng)用[19-20]。Rysto是馬鈴薯抗PVY 的顯性基因,來源于S.stoloniferum[21],該基因也定位在11 號染色體,開發(fā)的STS 標(biāo)記YES3-3B 被用于檢測Rysto基因[22]。Rychc是顯性單基因,從日本品種‘Konafubuki’中發(fā)現(xiàn),被定位在9 號染色體的末端[23],根據(jù)該基因開發(fā)的STS 標(biāo)記Ry186 用于檢測Rychc極端抗性[24]。Rx基因?qū)VX 具有極端抗性,可以快速地抑制病毒在最初感染的細(xì)胞中的積累[25],Rx1來源于安第斯亞種,定位于12 號染色體上。Mori等[26]根據(jù)Rx1基因序列開發(fā)了STS 標(biāo)記Rxsp,重組率為1.3%,說明其與Rx1緊密連鎖。
常規(guī)的抗病育種選擇周期長、效率低,選育過程需要花費(fèi)大量的時(shí)間、財(cái)力和物力,但利用分子標(biāo)記輔助育種(MAS),可在育種早期進(jìn)行快速檢測,而且不受環(huán)境條件的限制,可加速育種進(jìn)程,提高育種選擇效率。本研究利用與抗PVY的基因Ryadg、Rysto、Rychc緊密連鎖的分子標(biāo)記RYSC3、YES3-3B、Ry186 和抗PVX 的基因Rx緊密連鎖的分子標(biāo)記Rxsp,對102 份主要育成品種進(jìn)行標(biāo)記檢測,目的是篩選出具有多個病毒抗性基因的馬鈴薯品種,為馬鈴薯抗病毒育種提供寶貴資源,同時(shí)為馬鈴薯分子標(biāo)記聚合育種提供參考依據(jù)。
供試材料為國家馬鈴薯種質(zhì)資源試管苗庫(克山)保存的102 份馬鈴薯種質(zhì)資源的脫毒試管苗,主要選擇國內(nèi)各育種單位近幾年登記的品種及部分野生種和原始栽培種。
取試管苗頂部莖葉,使用天根DP-320 試劑盒提取基因組DNA。用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測基因組DNA 質(zhì)量,DNA 樣品保存于-20℃冰箱。
分子標(biāo)記信息見表1,由上海生工生物工程有限公司合成。PCR 反應(yīng)體系20μL:2×TaqPCR Master Mix 10μL、正反引物各1μL、DNA 模板1μL、ddH2O 7μL。PCR 擴(kuò)增程序?yàn)?5℃預(yù)變性5min;95℃變性30s,55℃~59℃退火40s,72℃延伸1min,35 個循環(huán);72℃延伸5min,4℃保存。PCR 結(jié)束后,取4μL 擴(kuò)增產(chǎn)物與2μL 6×Loading Buffer 混勻,于1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測,在紫外燈下觀察并拍照。
表1 分子標(biāo)記信息Table 1 Information of molecular markers
對供試的102 份材料進(jìn)行基因組DNA 的提取。經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,DNA 主帶清晰,無拖尾、降解現(xiàn)象。各樣品間DNA 濃度均勻一致,純度高,質(zhì)量好(圖1)。
圖1 DNA 濃度與質(zhì)量檢測Fig.1 Examination of DNA concentration and quality
根據(jù)與馬鈴薯PVX 抗性基因Rx1連鎖標(biāo)記Rxsp 的擴(kuò)增結(jié)果(圖2)顯示,含Rxsp 標(biāo)記的材料可以擴(kuò)增出約1230bp 的特異性片段,102 份材料中有11 份材料含有Rxsp 標(biāo)記,占供試材料的10.78%。
圖2 部分材料Rxsp 標(biāo)記擴(kuò)增Fig.2 The PCR of Rxsp marker of part of accessions
根據(jù)與馬鈴薯PVY 抗性基因Ryadg連鎖標(biāo)記RYSC3 的擴(kuò)增結(jié)果(圖3)顯示,含RYSC3 標(biāo)記的材料可以擴(kuò)增出約321bp 的特異性片段,102 份材料中有95 份材料含有RYSC3 標(biāo)記,占供試材料的93.14%。含YES3-3B 標(biāo)記的材料可以擴(kuò)增出約284bp 的特異性片段(圖4),102 份材料中有101 份材料含有YES3-3B 標(biāo)記,占供試材料的99.02%。含Ry186 標(biāo)記的材料可以擴(kuò)增出2~3 條帶(圖5),能夠擴(kuò)增出587bp 的片段記為含有Ry186 標(biāo)記,102 份材料中有35 份材料含有Ry186標(biāo)記,占供試材料的34.31%。
圖3 部分材料RYSC3 標(biāo)記擴(kuò)增Fig.3 The PCR of RYSC3 marker of part of accessions
圖4 部分材料YES3-3B 標(biāo)記擴(kuò)增Fig.4 The PCR of YES3-3B marker of part of accessions
圖5 部分材料Ry186 標(biāo)記擴(kuò)增Fig.5 The PCR of Ry186 marker of part of accessions
表2 列出了不同品種抗性標(biāo)記的分布情況,其中只含有1 個標(biāo)記的品種有4 個,占供試材料的3.92%;同時(shí)含有2 個標(biāo)記的品種有62 個,占供試材料的60.78%;同時(shí)含有3 個標(biāo)記的品種有30 個,占供試材料的29.41%;同時(shí)含有4 個標(biāo)記的品種有6 個,占供試材料的5.88%。
表2 不同品種抗性標(biāo)記分析Table 2 Analysis of markers of distinct varieties
馬鈴薯是我國重要的糧菜兼用作物,但長期以來育種工作因?yàn)椴《靖腥径M(jìn)展緩慢,很多優(yōu)異材料在選種的過程中由于病毒侵染沒有及時(shí)脫毒處理而被淘汰掉,而隨著育種圃場規(guī)模的增加和病毒變異的加快,育種材料的脫毒工作日益繁重,因此,抗病毒育種在馬鈴薯育種工作中的重要性就凸顯出來。培育馬鈴薯抗病品種首先就需要擴(kuò)大遺傳背景和豐富遺傳多樣性,鑒定并篩選出抗病品種是獲得抗病親本材料的最基礎(chǔ)有效的手段之一。常規(guī)的病毒抗性鑒定方法周期長、效率低,而分子標(biāo)記輔助選擇運(yùn)用分子標(biāo)記技術(shù)可以快速篩選出具有不同抗性標(biāo)記的材料。
本研究利用4 個與馬鈴薯病毒病抗性基因連鎖的分子標(biāo)記(Rxsp、RYSC3、YES3-3B 和Ry186)對102 份馬鈴薯品種進(jìn)行檢測,結(jié)果表明,所有檢測的材料至少含有1 個抗性標(biāo)記,其中同時(shí)含2 個標(biāo)記的品種最多,同時(shí)含4 個標(biāo)記的品種只有6 份。在6 份野生種和原始栽培種中都至少含有2 個抗性標(biāo)記,說明野生種和原始栽培種中含有豐富的抗病毒基因,這些資源的利用對馬鈴薯育種工作起著決定性的作用。生產(chǎn)實(shí)踐證明,在生產(chǎn)上能夠較長期發(fā)揮作用的品種,除了品質(zhì)好、產(chǎn)量高等性狀外,抗病性好也是重要的原因,如克新1 號自1965 年開始推廣,由于高抗環(huán)腐病、抗PVY 和PLRV 并且耐旱和高產(chǎn),到目前為止仍有較大種植面積[29]。
本研究表明,所有供試材料中含有YES3-3B標(biāo)記的品種最多,為101 份,占供試材料的99.02%,含有Rxsp 標(biāo)記的品種最少,為11 份,占供試材料的10.78%,這與黃鑫華等[30]的研究結(jié)果一致,并且檢測到隴薯10 號、冀張薯5 號和云薯401 同時(shí)含有RYSC3 和YES3-3B 標(biāo)記,內(nèi)薯7 號同時(shí)含RYSC3、YES3-3B 和Ry186 標(biāo)記,大同里外黃同時(shí)含Rxsp、RYSC3 和YES3-3B 標(biāo)記,這與黃鑫華等[30]研究結(jié)果也相符,但與白磊等[11]的研究結(jié)果不同。白磊等[11]研究認(rèn)為,隴薯10 號不含RYSC3 和Ry186 標(biāo)記、黑美人不含RYSC3 和Ry186 標(biāo)記(本研究中黑美人同時(shí)含RYSC3 和YES3-3B 標(biāo)記)、隴薯11 號只含RYSC3 標(biāo)記(本研究中隴薯11 號同時(shí)含Rxsp、RYSC3、YES3-3B 和Ry186 標(biāo)記),造成這一結(jié)果差異的原因還不清楚。本研究還檢測到克新23 號和克新25 號均含有RYSC3、YES3-3B和Ry186 標(biāo)記,2 個品種是姊妹系,基因來源于同一個父母本。
分子標(biāo)記技術(shù)作為一種輔助選擇手段,與人工接種病毒鑒定結(jié)果不能100%吻合,所以我們下一步的研究方向是對篩選出的含有多個抗性標(biāo)記的材料進(jìn)行人工接種鑒定,以確定其病毒抗性組成,并且依托國家馬鈴薯種質(zhì)資源試管苗庫(克山)平臺,加大對資源庫保存資源病毒抗性分子標(biāo)記的檢測,篩選出含有多個不同抗性標(biāo)記的材料作為親本用于聚合育種,在育種早代進(jìn)行分子標(biāo)記檢測,結(jié)合產(chǎn)量、品質(zhì)等性狀綜合評價(jià),創(chuàng)造出聚合多個抗性基因的優(yōu)異材料,提高育種效率,縮短育種年限,真正做到分子標(biāo)記輔助選擇與聚合育種有效結(jié)合。
本研究利用抗PVY 和抗PVX 基因的分子標(biāo)記對102 份育成品種、野生種和原始栽培種進(jìn)行標(biāo)記檢測,結(jié)果表明,含有YES3-3B 標(biāo)記的材料最多,占比99.02%;含有Rxsp 標(biāo)記的材料最少,占比10.78%;只含有1個標(biāo)記的品種有4個,占比3.92%;同時(shí)含有2 個標(biāo)記的品種有62 個,占比60.78%;同時(shí)含有3 個標(biāo)記的品種有30 個,占比29.41%;同時(shí)含有4 個標(biāo)記的品種有6 個,分別是隴薯11號、S.acaule、富金、云薯105、晉薯8 號和大西洋,占供試材料的5.88%。