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        巴彥淖爾酸粥細菌菌群多樣性分析及其與風(fēng)味的相關(guān)性

        2023-09-28 03:49:38熊子康孔祥聰馬佳佳王玉榮
        中國釀造 2023年9期

        熊子康,張 青,鄒 銓,孔祥聰,馬佳佳,王玉榮*

        (1.湖北文理學(xué)院 食品科學(xué)技術(shù)學(xué)院 湖北省食品配料工程技術(shù)研究中心,湖北 襄陽 441053;2.湖北文理學(xué)院 食品科學(xué)技術(shù)學(xué)院 乳酸菌生物技術(shù)與工程襄陽市重點實驗室,湖北 襄陽 441053;3.河套學(xué)院 農(nóng)學(xué)系,內(nèi)蒙古 巴彥淖爾 015000)

        酸粥一般以小米、大米或糜米等谷物為原料經(jīng)自然發(fā)酵制成的極具地方特色的谷物發(fā)酵制品,口感酸爽細膩,具有開胃助消化的功效,在內(nèi)蒙古、廣西、山西和陜西等地較為常見[1-3]。谷物在發(fā)酵過程中會改變自身原有的形態(tài)、風(fēng)味以及營養(yǎng)結(jié)構(gòu),并產(chǎn)生氨基酸、維生素和有機酸等豐富的營養(yǎng)物質(zhì),從而使其更易于消化[4-6]。為保證其品質(zhì)及食用方便性,多地嘗試將其開發(fā)成商業(yè)化產(chǎn)品,然而,目前酸粥的生產(chǎn)仍主要依賴于家庭作坊式制作[7]。該模式一般采用自然發(fā)酵,由于受到地域、氣候等的影響,不同地區(qū)生產(chǎn)的產(chǎn)品所包含的微生物多樣性不同[8];此外,發(fā)酵過程使用的容器多不密封且不能人為控制溫度,發(fā)酵料液內(nèi)部微生物群亦需較長時間才能達到平衡,增大了有害微生物侵襲的可能性[9]。巴彥淖爾或稱“巴盟”,屬內(nèi)蒙古自治區(qū),該地區(qū)發(fā)酵酸粥所用原料一般為糜米,制作工藝主要為糜米加水蒸煮,在米粒完全煮透前取適量米湯放涼,置于桶內(nèi)或玻璃罐中,自然發(fā)酵24~30 h即可。每次將發(fā)酵好的酸粥預(yù)留一部分作為下一次發(fā)酵的“引子”,因而明確該地區(qū)傳統(tǒng)發(fā)酵食品酸粥樣品中微生物資源構(gòu)成極其重要。

        越來越多的學(xué)者認識到微生物的多樣性與食品中各種風(fēng)味之間存在著重要聯(lián)系。自21世紀以來,以Illumina MiSeq為代表的第二代高通量測序技術(shù)因其準確率高、通量高和速度快等優(yōu)點使其在食品微生物多樣性研究領(lǐng)域得以廣泛應(yīng)用[10-11]。電子鼻技術(shù)是一種用來檢測揮發(fā)性風(fēng)味物質(zhì)的技術(shù)手段,具有實時、無損和快速等特點[12]。電子舌技術(shù)是一種用來檢測滋味的技術(shù)手段,具有客觀性強、檢測響應(yīng)快和標準化控制等特點[13]。向凡舒等[14]基于該技術(shù)解析了利川腌菜細菌群落結(jié)構(gòu),并采用電子鼻技術(shù)研究腌菜的風(fēng)味品質(zhì),結(jié)果表明,腌菜特征風(fēng)味物質(zhì)的形成可能由變形桿菌屬(Proteus)、嗜冷桿菌屬(Psychrobacter)和腸球菌屬(Enterococcus)等多種微生物共同作用產(chǎn)生;CAI W C等[15]利用高通量測序技術(shù)和電子感官技術(shù)綜合評估了3種低溫大曲的微生物結(jié)構(gòu)、微生物功能和風(fēng)味特征,結(jié)果表明,低溫大曲中高溫放線菌屬(Thermoactinomyces)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、糖多孢菌屬(Saccharopolyspora)、鏈霉菌屬(Streptomyces)和乳桿菌屬(Lactobacillus)主要影響低溫大曲的滋味,而嗜熱子囊菌屬(Thermoascus)和復(fù)膜孢酵母屬(Saccharomycopsis)主要影響其風(fēng)味。張青等[16]利用高通量測序技術(shù)研究了巴彥淖爾酸粥細菌構(gòu)成,發(fā)現(xiàn)乳桿菌屬(Lactobacillus)和醋桿菌屬(Acetobacter)為其優(yōu)勢細菌屬,表明該方法應(yīng)用于酸粥類谷物發(fā)酵食品可行且地域因素對同類型發(fā)酵食品微生物組成存在一定影響,因此有必要對巴彥淖爾酸粥品質(zhì)或微生物與產(chǎn)品品質(zhì)之間的關(guān)聯(lián)性開展深入研究。

        本研究使用高通量測序技術(shù)對巴彥淖爾酸粥進行細菌群落結(jié)構(gòu)解析,同時結(jié)合電子鼻和電子舌仿生學(xué)技術(shù)對其氣味和滋味品質(zhì)進行分析,并對優(yōu)勢細菌屬與風(fēng)味品質(zhì)之間的相關(guān)性進行研究,為酸粥菌株發(fā)掘和品質(zhì)提升提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        酸粥:于2021年6月中旬采集自內(nèi)蒙古自治區(qū)中西部巴彥淖爾市(E105°12′~109°53′,N40°13′~42°28′),共7份樣品,編號為BM1~BM7。

        DNeasy mericon Food Kit 脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)基因組提取試劑盒:德國QIAGEN公司;引物338F/806R:由武漢天一輝遠生物科技有限公司合成;5×TransStartTMFastPfu Buffer、脫氧核糖核苷三磷酸(deoxyribonucleoside triphosphate,dNTPs)Mix和FastPfu Fly DNA聚合酶:北京全式金生物技術(shù)有限公司;參比溶液、陰離子溶液、陽離子溶液和內(nèi)部溶液:日本Insent公司。

        1.2 儀器與設(shè)備

        MiSeq PE300高通量測序平臺:美國Illumina公司;Nanodrop2000紫外可見分光光度計:美國Nano Drop公司;Veriti FAST梯度聚合酶鏈式反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)儀:美國ABI公司;UVPCDS8000凝膠成像分析系統(tǒng):美國ProteinSimple公司;PEN3電子鼻(配置10個金屬氧化傳感器):德國Airsense公司;SA 402B電子舌:日本Insent公司。

        1.3 實驗方法

        1.3.1 MiSeq高通量測序

        將酸粥樣品振蕩均勻,使用DNeasy mericon Food Kit DNA基因組提取試劑盒從酸粥樣品中提取細菌基因組DNA,并采用Nanodrop 2000紫外可見分光光度法測量其濃度和質(zhì)量,將條帶清晰且OD260nm/OD280nm值介于1.8~2.0之間的DNA進行細菌16S rRNA V3-V4區(qū)的PCR擴增,其中正向引物為338F(5'-ACTCCTACGGGAGCAGCAG-3'),反向引物為806R(5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3'),參照WANG Y R等[17]的PCR擴增體系及PCR擴增程序進行擴增,擴增后使用1%的瓊脂糖凝膠電泳(120 V,30 min)進行檢測,將檢測合格的擴增產(chǎn)物寄送至上海美吉生物有限公司使用Illumina MiSeq測序儀完成雙末端測序。

        1.3.2 生物信息學(xué)分析

        根據(jù)GUO Z等[18]的序列質(zhì)控條件進行質(zhì)控以獲得高質(zhì)量序列:根據(jù)雙端序列的重疊關(guān)系首先對下機序列進行合并、去除嵌合體以及采用兩步UCLUST法構(gòu)建操作分類單元(operational taxonomic units,OTU),通過Greengenes v13.5、核糖體數(shù)據(jù)庫項目(ribosomal database project,RDP)v11.5和SILVA v132數(shù)據(jù)庫對每個OTU進行同源性比對注釋和微生物多樣性解析[19]。

        1.3.3 基于電子鼻技術(shù)對酸粥樣品氣味的測定

        采用電子鼻對酸粥樣品的氣味進行測定。將酸粥樣品搖勻,吸取15 mL樣品于電子鼻樣品瓶中,45 ℃水浴保溫30 min,于室溫靜置15 min后進行測試,并重復(fù)3次。按照RUSINEK R等[20]的方法,選取49 s、50 s和51 s時的響應(yīng)值為數(shù)據(jù)點,并求其平均值為最終結(jié)果。其中,電子鼻配置的10個傳感器分別為W1C(芳香型化合物)、W5S(氮氧化合物)、W3C(芳香型化合物)、W6S(對氫氣有選擇性)、W5C(烷烴芳香成分)、W1S(甲烷)、W1W(有機硫化物和萜烯類)、W2S(乙醇)、W2W(有機硫化物)和W3S(烷烴類)。

        1.3.4 基于電子舌技術(shù)對酸粥樣品滋味的測定

        采用電子舌對酸粥樣品的滋味進行測定。將酸粥樣品8 000 r/min 離心15 min后,取上清液于樣品瓶中,4 ℃?zhèn)溆?。按照GAO B H等[21]的方法對樣品中5個基本味(酸、苦、澀、咸、鮮)和3個回味(苦味、澀味和鮮味的回味)進行測定,重復(fù)測定4次,選取后3次有效數(shù)據(jù)并求取平均值作為最終結(jié)果。

        1.3.5 數(shù)據(jù)處理

        使用Origin 2017軟件對酸粥樣品中優(yōu)勢細菌門、屬以及核心OTU的相對含量和電子鼻、電子舌雷達圖進行分析,并對各樣品中OTU的出現(xiàn)次數(shù)進行水平階梯圖的繪制;使用R軟件的“vioplot”安裝包對樣品中各滋味品質(zhì)的響應(yīng)值進行小提琴圖繪制;使用Cytoscape軟件對酸粥中優(yōu)勢細菌屬與各氣味、滋味指標之間相關(guān)系數(shù)絕對值>0.5的相關(guān)性進行網(wǎng)絡(luò)圖的繪制。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 酸粥樣品的細菌菌群結(jié)構(gòu)分析

        以細菌16S rRNA V3-V4區(qū)為測序靶點,通過Illumina MiSeq高通量測序后7份酸粥樣品共產(chǎn)生了265 424條高質(zhì)量序列,經(jīng)兩步UCLUST分析,共得到1 633個OTU,序列分別隸屬于3個門、5個綱、10個目、16個科和24個屬。將平均相對含量≥1.00%的細菌門或?qū)贇w為優(yōu)勢細菌門或?qū)?,相對含量?.00%的細菌門或?qū)贇w為其他?;陂T水平的酸粥樣品中細菌菌群組成相對含量見圖1。

        圖1 基于門水平的酸粥樣品中細菌菌群組成Fig.1 Bacterial community composition in sour porridge samples based on phylum level

        由圖1可知,厚壁菌門(Firmicutes)和變形菌門(Proteobacteria)為酸粥樣品中的優(yōu)勢細菌門,其平均相對含量分別為88.71%和9.97%,且各樣品中Firmicutes的相對含量均>70.00%,其中,樣品BM3、BM4、BM6和BM7中Firmicutes的相對含量較高,分別為95.79%、96.55%、99.65%和99.07%;不同樣品中Proteobacteria的相對含量有一定差異,其在樣品BM4、BM6和BM7中其相對含量均<1.00%,由此可見,不同樣品間細菌門組成存在一定的差異。本研究進一步在屬水平上對其細菌菌群組成進行解析,基于屬水平的酸粥樣品中細菌菌群的相對含量見圖2。

        圖2 基于屬水平的酸粥樣品中細菌菌群組成Fig.2 Bacterial community composition in sour porridge samples based on genus level

        由圖2可知,乳桿菌屬(Lactobacillus)、醋酸桿菌屬(Acetobacter)和魏斯氏菌屬(Weissella)為酸粥樣品中的優(yōu)勢細菌屬,其平均相對含量分別為85.45%、9.81%和1.60%,且所有樣品中Acetobacter和Weissella的相對含量均存在明顯差異。在樣品BM1、BM2和BM5中Acetobacter的相對含量均>15.0%,而在樣品BM4、BM6和BM7中相對含量均<1.0%;Weissella僅存在于樣品BM7中,其相對含量為11.19%。由此可見,同一地區(qū)不同酸粥樣品間其細菌屬組成亦存在一定的差異。Lactobacillus和Weissella均為乳酸菌屬,隸屬于厚壁菌門,可在密閉條件下快速生長繁殖,生成大量乳酸,在形成酸性無氧環(huán)境后,隨著好氧菌的死亡,進一步將碳水化合物轉(zhuǎn)化成乳酸、乙酸和丙酸等,以改善食品的風(fēng)味并延長其保質(zhì)期[22];此外,Weissella是兼性厭氧化學(xué)螯合菌,在食品發(fā)酵過程中,其可以合成酯類、有機酸和短鏈脂肪酸等風(fēng)味物質(zhì),從而提高發(fā)酵食品的產(chǎn)品質(zhì)量[23]。Acetobacter隸屬于Proteobacteria,可將乙醇和乳酸氧化為乙酸和乙酰丁酸[24]。說明酸粥樣品中存在絕對優(yōu)勢的產(chǎn)酸菌,該研究結(jié)果與張青等[16]所分析基于門、屬水平的酸粥樣品中細菌菌群的群落組成基本一致。

        2.2 基于OTU水平的細菌群落結(jié)構(gòu)分析

        本研究在細菌門、屬水平解析酸粥樣品細菌菌群組成的基礎(chǔ)上,進一步分析7份酸粥樣品中OTU的出現(xiàn)次數(shù)及核心OTU(在所有樣品中均存在的OTU)的相對含量,結(jié)果見圖3。

        圖3 酸粥樣品中操作分類單元的出現(xiàn)次數(shù)(A)及核心操作分類單元相對含量(B)Fig.3 Occurrence times of operational taxonomic unit (A) and relative content of core operational taxonomic unit (B) in sour porridge samples

        由圖3A可知,7份樣品中共產(chǎn)生了1 633個OTU,然而核心OTU(OTU3082、OTU4824、OTU639、OTU1596、OTU281、OTU839和OTU895)僅有7個,占OTU總數(shù)的0.43%,但其中包含了63 755條高質(zhì)量序列,占質(zhì)控后合格序列總數(shù)的24.02%;在樣品中出現(xiàn)1次的OTU有822個,占OTU總數(shù)的50.34%,其中包含13 297 條高質(zhì)量序列,僅占質(zhì)控合格序列總數(shù)的5.01%。由圖3B可知,OTU3082、OTU4824、OTU639、OTU1596、OTU281、OTU839和OTU895平均相對含量分別為11.63%、6.63%、4.78%、0.83%、0.09%、0.04%和0.03%。而平均相對含量>1.0%的核心OTU僅有3個,其中2個核心OTU隸屬于Lactobacillus,分別為OTU3082和OTU639;1個核心OTU隸屬于Acetobacter,為OTU4824。該結(jié)果進一步說明,在巴彥淖爾酸粥樣品中,Lactobacillus和Acetobacter為核心細菌屬。

        2.3 酸粥樣品感官特性測定結(jié)果

        2.3.1 基于電子鼻技術(shù)酸粥樣品的氣味檢測結(jié)果

        本研究進一步采用電子鼻測定酸粥樣品氣味,電子鼻響應(yīng)雷達圖見圖4。

        圖4 酸粥樣品氣味電子鼻傳感器響應(yīng)雷達圖Fig.4 Response radar diagram of sour porridge samples ordor by electronic nose sensor

        由圖4可知,納入本研究的酸粥樣品在不同傳感器上的響應(yīng)強度不同,僅有W1W(有機硫化物和萜烯類)、W5S(氮氧化合物)和W1S(甲烷)這3個傳感器對酸粥響應(yīng)強度較大,均>19,而其他7個傳感器對酸粥響應(yīng)強度較小。其中W1W、W5S和W1S這3個傳感器對樣品BM7的響應(yīng)強度均為最大,分別為63.02、37.75和37.31;對樣品BM4的相應(yīng)強度均為最小,分別為40.27、19.63和24.03。為進一步探究各樣本間的氣味的異同,本研究對各傳感器所測數(shù)值進行處理,結(jié)果見表1。

        表1 電子鼻各傳感器對酸粥樣品氣味的響應(yīng)強度Table 1 Response intensity of electronic nose sensors to the odor of sour porridge samples

        由表1可知,巴彥淖爾酸粥在W1W、W5S和W1S這3個傳感器上的平均響應(yīng)值分別為51.43、27.63和29.14。由此可見,酸粥揮發(fā)性風(fēng)味物質(zhì)中有機硫化物和萜烯類物質(zhì)、氮氧化合物和甲烷的含量較為豐富。除W6S和W3S外,其他8個傳感器對酸粥樣品的響應(yīng)值差異均較大,變異系數(shù)均>8.0%,由此可見,7份酸粥樣品在氣味方面存在較大差異。

        2.3.2 基于電子舌技術(shù)對酸粥樣品滋味的檢測結(jié)果

        酸粥樣品的電子舌檢測結(jié)果見圖5。由圖5A可知,酸粥樣品在酸味、咸味、鮮味的回味和鮮味指標上的差異較大。其中,樣品BM7在酸味指標上的響應(yīng)值最大,為7.45;樣品BM3在酸味指標上的響應(yīng)值最小,為-22.64,但其在鮮味指標上的響應(yīng)值最大,為7.38;樣品BM4在咸味指標上的響應(yīng)值最大,為12.21,其在鮮味的回味指標上的響應(yīng)值亦最大,為9.05。由圖5B可知,酸粥在各滋味指標中差異最大的是酸味,極差值為28.37;其次是咸味、鮮味的回味、澀味和鮮味,極差值分別為14.01、10.96、9.18和8.43;而在澀味回味和苦的回味上的差異較小。Lactobacillus和Acetobacter作為酸粥中的優(yōu)勢細菌屬,可以產(chǎn)生大量的有機酸來降低pH,從而增加酸度[21,25]。由此可知,酸粥樣品中滋味品質(zhì)的差異主要是由酸味引起的。

        圖5 酸粥樣品滋味電子舌響應(yīng)雷達圖(A)及小提琴圖(B)Fig.5 Response radar diagram (A) and violin diagram (B) of sour porridge samples taste by electronic tongue

        2.4 優(yōu)勢細菌屬與風(fēng)味的相關(guān)性分析

        酸粥樣品風(fēng)味特征與其發(fā)酵菌群息息相關(guān),為探究不同菌群對自然發(fā)酵酸粥滋味和氣味的影響,本研究對樣品中優(yōu)勢細菌屬與氣味物質(zhì)、滋味進行相關(guān)性分析,其相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)圖見圖6。

        圖6 酸粥樣品優(yōu)勢細菌屬與氣味及滋味的相關(guān)性Fig.6 Correlation between dominant bacterial genera and odor and taste of sour porridge samples

        由圖6可知,Weissella與酸粥的澀味呈現(xiàn)顯著負相關(guān)(P<0.05),相關(guān)系數(shù)R2=0.998;Acetobacter與芳香型化合物的生成呈極顯著正相關(guān)(P<0.01),相關(guān)系數(shù)R2=0.999,與苦的回味呈極顯著正相關(guān)(P<0.01),相關(guān)系數(shù)R2=0.999;Lactobacillus與氮氧化合物的生成呈現(xiàn)顯著正相關(guān)(P<0.05),相關(guān)系數(shù)R2=0.999,與乙醇類物質(zhì)的生成呈極顯著負相關(guān)(P<0.01),相關(guān)系數(shù)R2=0.999。由此可見,Acetobacter和Lactobacillus對于酸粥中芳香類風(fēng)味物質(zhì)和氮氧化合物的形成有著積極的作用,Weissella對于酸粥中酸味的形成亦發(fā)揮著積極影響。

        3 結(jié)論

        巴彥淖爾自然發(fā)酵酸粥樣品的細菌菌群組成存在一定差異,優(yōu)勢細菌門為Firmicutes和Proteobacteria,優(yōu)勢細菌屬為Lactobacillus、Acetobacter和Weissella,所有樣品包含7個核心OTU。就氣味和滋味品質(zhì)而言,其揮發(fā)性物質(zhì)的差異主要集中在氮氧化合物、甲烷和萜類化合物上,而其滋味差異主要體現(xiàn)在酸味方面。經(jīng)相關(guān)性分析得知,Acetobacter和Lactobacillus對酸粥芳香類風(fēng)味物質(zhì)和氮氧化合物的產(chǎn)生具有積極作用,Weissella對酸粥酸味的形成亦具有積極影響,在后續(xù)發(fā)酵酸粥工藝中,可進一步為其滋味品質(zhì)的提升進行研究,完善酸粥風(fēng)味和滋味品質(zhì)的雙向促進,優(yōu)化酸粥的生產(chǎn)工藝條件,提升工業(yè)化生產(chǎn)。

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