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        2007—2022年中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬研究文獻(xiàn)可視化分析

        2023-09-25 06:51:44陶永彪汪龍德毛蘭芳李正菊靳三省吳毓謙張瑞婷
        關(guān)鍵詞:中醫(yī)藥研究

        陶永彪 ,汪龍德 ,毛蘭芳 ,李正菊 ,靳三省 ,吳毓謙 ,張瑞婷

        1.甘肅中醫(yī)藥大學(xué),甘肅 蘭州 730020; 2.甘肅中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院,甘肅 蘭州 730020

        線粒體自噬是細(xì)胞自噬對(duì)線粒體的選擇性降解,可促進(jìn)線粒體的周轉(zhuǎn),維持線粒體質(zhì)量,防止功能障礙線粒體的積累[1],通??煞譃閮纱蠊δ苋?,即PTEN誘導(dǎo)推定激酶1/E3泛素連接酶(PINK1/Parkin)依賴和PINK1/Parkin獨(dú)立兩類。線粒體自噬常參與代謝活動(dòng)、細(xì)胞分化、凋亡等生理過程,是治療腫瘤、退行性病變和代謝異常類疾病等的重要靶點(diǎn)。目前中醫(yī)藥調(diào)控線粒體自噬治療疾病的相關(guān)研究日益增多,相關(guān)領(lǐng)域發(fā)文量逐年增長(zhǎng),為進(jìn)一步了解中醫(yī)藥調(diào)控線粒體自噬治療相關(guān)疾病的研究現(xiàn)狀、熱點(diǎn)、作者及機(jī)構(gòu)的合作情況,本研究對(duì)相關(guān)領(lǐng)域文獻(xiàn)進(jìn)行可視化分析。

        1 資料與方法

        1.1 數(shù)據(jù)來源與檢索策略

        以“線粒體自噬”為主題詞檢索中國(guó)知識(shí)資源總庫(CNKI)、中文科技期刊數(shù)據(jù)庫(VIP)、中國(guó)學(xué)術(shù)期刊數(shù)據(jù)庫(萬方數(shù)據(jù))、中國(guó)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(CBM)。CNKI檢索式:主題詞=線粒體自噬or mitophagy,語言分類選擇中文,學(xué)科分類選擇中藥學(xué)、中醫(yī)學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合;萬方數(shù)據(jù)檢索式:主題詞=線粒體自噬or mitophagy,文獻(xiàn)類型選擇期刊論文和學(xué)位論文,學(xué)科分類選擇中國(guó)醫(yī)學(xué);VIP檢索式:任意字段=線粒體自噬or mitophagy,學(xué)科分類選擇中醫(yī)學(xué)、中醫(yī)基礎(chǔ)理論、中醫(yī)臨床基礎(chǔ)、中醫(yī)診斷學(xué)、中醫(yī)內(nèi)科學(xué)、中醫(yī)外科學(xué)、中醫(yī)兒科學(xué)、中醫(yī)婦科學(xué)、中醫(yī)腫瘤科、中醫(yī)骨傷科學(xué)、中醫(yī)皮科、中醫(yī)五官科學(xué)、中藥學(xué)、方劑學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合;CBM檢索式:常用字段=線粒體自噬or mitophagy,學(xué)科分類選擇中國(guó)醫(yī)學(xué)、藥學(xué)。檢索時(shí)間范圍均為2007年1月1日—2022年7月1日。

        1.2 文獻(xiàn)篩選標(biāo)準(zhǔn)

        納入標(biāo)準(zhǔn):中醫(yī)藥干預(yù)線粒體自噬相關(guān)研究期刊論文和學(xué)位論文,文獻(xiàn)類型為原著。

        排除標(biāo)準(zhǔn):①與中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬不相關(guān)的文獻(xiàn);②綜述、系統(tǒng)評(píng)價(jià)、Meta分析、會(huì)議、論著、科技成果、專利等;③內(nèi)容重復(fù)的文獻(xiàn),僅保留1篇。

        1.3 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換與篩選

        將初檢得到的文獻(xiàn)題錄按“NoteExpress”格式導(dǎo)出,并用NoteExpress3.6.0軟件對(duì)文獻(xiàn)查重處理,逐條閱讀文獻(xiàn)摘要,按納入和排除標(biāo)準(zhǔn)剔除重復(fù)和不相關(guān)文獻(xiàn),記錄各數(shù)據(jù)來源,將數(shù)據(jù)來源(DS)統(tǒng)一修改為“CNKI”以便后續(xù)操作,納入的文獻(xiàn)以“Refworks”格式導(dǎo)出,并以download_*格式命名。對(duì)同一詞的中英文進(jìn)行統(tǒng)一,如“活性氧”“ROS”統(tǒng)一為“活性氧”。

        1.4 數(shù)據(jù)分析

        將納入文獻(xiàn)的年度發(fā)文量以表格形式導(dǎo)出至Excel2016,利用Excel數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)繪制發(fā)文量分布圖。將文獻(xiàn)題錄以Refwork格式導(dǎo)出,依據(jù)普賴斯定律(N=0.749,Mmax為作者最大發(fā)文量)確定核心作者,利用VOSviewer1.6.18對(duì)納入文獻(xiàn)的作者及關(guān)鍵詞進(jìn)行共現(xiàn)分析。在CiteSpace6.1.R2軟件中新建模塊,將前期導(dǎo)出的文獻(xiàn)進(jìn)行格式轉(zhuǎn)化,繪制關(guān)鍵詞聚類、突現(xiàn)分析與時(shí)間線圖。選擇時(shí)間區(qū)域?yàn)?007—2022年,時(shí)間切片(year per slice)為“1”,節(jié)點(diǎn)類型(node type)選擇“keyword”,節(jié)點(diǎn)閾值選擇“50”。

        2 結(jié)果

        初檢得到文獻(xiàn)CNKI 384篇、萬方數(shù)據(jù)730篇、VIP 222篇、CBM 492篇。經(jīng)篩選,最終納入726篇文獻(xiàn)。

        2.1 發(fā)文時(shí)間

        20007—2022年,中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)文量總體呈上升趨勢(shì),見圖1。2007—2014年為研究初始階段,發(fā)文較少,發(fā)文量總體處于緩步上升期,年均發(fā)文量為10.5篇。2015—2018年發(fā)文迎來第2個(gè)上升階段,偶見平臺(tái)穩(wěn)定期,年均發(fā)文量顯著高于2007—2014年,年均發(fā)文52.5篇。2019—2020年發(fā)文量持續(xù)增長(zhǎng),是該領(lǐng)域發(fā)文的高峰期,發(fā)文量高達(dá)261篇,年均發(fā)文130.5篇。2021—2022年間發(fā)文稍有回落趨勢(shì),發(fā)文171篇,但仍為研究熱點(diǎn)。

        圖1 2007—2022年中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬研究文獻(xiàn)發(fā)文時(shí)間分布

        2.2 核心作者

        納入文獻(xiàn)作者共2013位,其中以單德紅和劉文俊發(fā)文最多,均為8篇,依據(jù)普賴斯定律可得N=2.118,即發(fā)文量≥2篇的作者為該領(lǐng)域的核心作者,共計(jì)232位。高產(chǎn)作者有單德紅(8篇)、劉文?。?篇)、張靜(6篇)、許欣竹(5篇)、董佳梓(4篇)、宋囡(4篇)等。利用VOSviewer軟件構(gòu)建核心作者共現(xiàn)密度視圖(見圖2)。該領(lǐng)域形成以單德紅、劉文俊、董佳梓等為代表的研究團(tuán)隊(duì),研究團(tuán)隊(duì)所屬機(jī)構(gòu)主要集中在遼寧中醫(yī)藥大學(xué)。

        圖2 2007—2022年中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬研究文獻(xiàn)作者共現(xiàn)密度視圖(發(fā)文量≥2篇)

        2.3 關(guān)鍵詞

        2.3.1 共現(xiàn)分析

        本研究共納入關(guān)鍵詞1782個(gè),頻次前30位的高頻關(guān)鍵詞見表1。通過VOSviewer繪制共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò),見圖3。結(jié)果表明,該領(lǐng)域的疾病譜集中在帕金森病、阿爾茨海默病、糖尿病腎病、肝癌、心肌缺血再灌注損傷、腦缺血再灌注損傷等,研究方式主要為實(shí)驗(yàn)藥理,涉及的藥物為白藜蘆醇、姜黃素、黃芪甲苷等,作用機(jī)制為抗腫瘤活性、神經(jīng)保護(hù)等,分子機(jī)制和信號(hào)通路以線粒體自噬、細(xì)胞凋亡、氧化應(yīng)激和Parkin信號(hào)通路等為研究熱點(diǎn)。

        圖3 2007—2022年中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬研究文獻(xiàn)關(guān)鍵詞共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)

        2.3.2 聚類分析

        利用CiteSpace對(duì)數(shù)似然率(LLR)算法對(duì)關(guān)鍵詞進(jìn)行聚類分析(見圖4),得出#0細(xì)胞凋亡、#1自噬、#2作用機(jī)制、#3電針、#4實(shí)驗(yàn)藥理、#5氧化應(yīng)激、#6動(dòng)物模型、#7肝癌、#8動(dòng)物實(shí)驗(yàn)、#9巨噬細(xì)胞、#10抑制機(jī)理、#11動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)、#12脾氣虛13個(gè)重要聚類模塊,聚類模塊值Q=0.5718,平均輪廓值S=0.8525。Q>3、S>0.5表明聚類結(jié)果合理,同質(zhì)性高,圖譜效果可信。

        圖4 2007—2022年中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬研究文獻(xiàn)關(guān)鍵詞聚類

        2.3.3 聚類時(shí)間線和突現(xiàn)分析

        采用CiteSpace軟件在關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析基礎(chǔ)上進(jìn)一步進(jìn)行突現(xiàn)分析(見圖5)和聚類時(shí)間線分析(見圖6),突現(xiàn)分析可反映各時(shí)期最突出的關(guān)鍵詞,聚類時(shí)間線分析可反映各聚類關(guān)鍵詞演變情況。結(jié)合可知近年來中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬研究領(lǐng)域主要研究方向的熱點(diǎn)變化和發(fā)展趨勢(shì)。

        圖5 2007—2022年中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬研究文獻(xiàn)突現(xiàn)關(guān)鍵詞

        圖6 2007—2022年中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬研究文獻(xiàn)關(guān)鍵詞聚類時(shí)間線

        由圖可知,2007—2014年研究特點(diǎn):此階段主要反映中藥單體提取物調(diào)節(jié)線粒體自噬的相關(guān)機(jī)制,如姜黃素、大蒜素、熊果酸等,處于該領(lǐng)域基礎(chǔ)研究的初級(jí)階段。2015—2022年研究特點(diǎn):此階段中藥提取物的研究種類顯著增加,如黃芪甲苷、丹參酮、丹皮酚等;中藥復(fù)方的機(jī)制研究逐漸增多,出現(xiàn)保元湯、健肝顆粒等;中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬治療的疾病譜系被深入挖掘,如結(jié)腸癌、肺癌、衰老、缺血再灌注損傷等,相關(guān)機(jī)制研究較前明顯細(xì)化。

        3 討論

        線粒體自噬是重要的穩(wěn)態(tài)機(jī)制,是保守的細(xì)胞內(nèi)分解代謝過程[2]。線粒體參與物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)及能量轉(zhuǎn)換,促進(jìn)臟腑生理功能活動(dòng)[3],與中醫(yī)學(xué)“氣血相關(guān)”理論具有相似性。本研究發(fā)現(xiàn),線粒體自噬研究的疾病譜主要為帕金森病、阿爾茨海默病、糖尿病腎病、肝癌、心肌缺血再灌注損傷、腦缺血再灌注損傷等,涉及白藜蘆醇、姜黃素、黃芪甲苷等益氣活血類藥物活性成分,與中醫(yī)理論相契合。

        關(guān)鍵詞共現(xiàn)及聚類分析可知,中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬的研究涉及疾病類型、藥物選擇、實(shí)驗(yàn)內(nèi)容、分子機(jī)制等方面。中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬治療疾病方面的作用機(jī)制可歸納為以下幾類:①腫瘤防治。如黃芪多糖通過刺激肝癌SMMC-7721細(xì)胞中微管相關(guān)蛋白輕鏈3B(LC3B)、Beclin-1和LC3結(jié)合蛋白p62相關(guān)自噬蛋白的表達(dá),抑制腫瘤細(xì)胞活化[4]。②神經(jīng)退行性疾病。如丁苯酞可抑制腦中微小核糖核酸miR-137表達(dá),增強(qiáng)線粒體自噬,從而發(fā)揮神經(jīng)保護(hù)作用[5];穿心蓮內(nèi)酯通過增加parkin蛋白表達(dá)激活線粒體自噬水平,改善帕金森病行為狀態(tài)[6]。③代謝異常類疾病。如孫敏等[7]研究認(rèn)為,中藥復(fù)方益氣解毒方可通過降低Nix蛋白表達(dá),抑制自噬泡產(chǎn)生,改善腎小管上皮細(xì)胞線粒體自噬紊亂,從而發(fā)揮治療糖尿病腎病作用。④缺血再灌注損傷。如電針百會(huì)、神庭可顯著上調(diào)BNIP3L和核因子激活信號(hào)通路多功能蛋白p62表達(dá),從而激活線粒體自噬,減輕腦缺血再灌注損傷[8]。多項(xiàng)研究認(rèn)為,線粒體自噬是改善肝臟[9]、腎臟[10]、心肌[11]缺血再灌注損傷的靶點(diǎn)。

        實(shí)驗(yàn)研究多集中在動(dòng)物模型藥理實(shí)驗(yàn)領(lǐng)域,藥物選擇以中藥提取物為主。如吳冰等[12]發(fā)現(xiàn)白藜蘆醇可通過介導(dǎo)糖尿病小鼠心肌組織AMPK-P53信號(hào)通路,增加parkin蛋白表達(dá),從而恢復(fù)線粒體自噬功能,發(fā)揮保護(hù)心肌功能作用;向菲等[13]發(fā)現(xiàn),白藜蘆醇具有減輕腦缺血/再灌注損傷的潛力,其機(jī)制可能與提高線粒體基質(zhì)金屬蛋白酶和三磷酸腺苷(ATP)水平,改善線粒體自噬水平,清除再灌注造成的線粒體堆積有關(guān);王翠娟等[14]通過體外實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),姜黃素能升高腫瘤細(xì)胞內(nèi)氧化應(yīng)激水平,并啟動(dòng)線粒體自噬,從而抑制卵巢癌細(xì)胞SKOV-3和A2780細(xì)胞增殖;梁國(guó)強(qiáng)等[15]發(fā)現(xiàn),黃芪甲苷通過上調(diào)腎組織ATP、線粒體DNA數(shù)量,降低LC3、Beclin-1和Nod樣受體蛋白3、Caspase-1蛋白表達(dá),抑制阿霉素誘導(dǎo)的腎病大鼠線粒體過度自噬及炎性反應(yīng)。

        時(shí)間線圖和關(guān)鍵詞突現(xiàn)分析發(fā)現(xiàn),2015年以前的研究形式單一,研究的疾病以腫瘤為主,如肝癌、卵巢癌等,以臨床研究為重點(diǎn),中醫(yī)藥的應(yīng)用相對(duì)較少,主要集中在單味藥提取物;2015年以后研究的疾病類型逐漸豐富,神經(jīng)退行性疾病、缺血再灌注損傷、代謝異常類疾病的研究被發(fā)掘,同時(shí),腫瘤仍是研究熱點(diǎn),中藥復(fù)方研究被重視,以小續(xù)命湯、保元湯、健肝顆粒等為代表,其調(diào)控線粒體自噬機(jī)制被逐步闡明。

        綜上所述,本研究基于VOSviewer和CiteSpace軟件繪制知識(shí)圖譜,分析近年中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬治療相關(guān)疾病研究概況。該領(lǐng)域發(fā)文量呈逐年遞增趨勢(shì),總體發(fā)文量較高,核心作者群集中,研究類型豐富,但研究團(tuán)隊(duì)間合作分散,可能是該領(lǐng)域發(fā)展較緩的重要原因,今后需加強(qiáng)區(qū)域間交流合作。目前,中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬治療疾病的研究方向集中于腫瘤、神經(jīng)退行性疾病、代謝異常性病變、缺血再灌注損傷等,涉及的中藥及有效成分包括白藜蘆醇、姜黃素、黃芪甲苷等。今后研究除提高中藥復(fù)方的關(guān)注度外,還需細(xì)化線粒體自噬機(jī)制研究,深入研究中醫(yī)藥調(diào)節(jié)線粒體自噬治療各類疾病的調(diào)控機(jī)制,為中醫(yī)藥的發(fā)展提供基礎(chǔ)研究證據(jù),同時(shí)不斷完善研究類型,結(jié)合臨床,發(fā)揮中醫(yī)藥特色。

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