2023年3月20日,浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院鄭敏教授與張龍教授團(tuán)隊(duì)合作在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在線發(fā)表了題為“A new method to synthesize multiple gRNA libraries and functional mapping of mammalian H3K4me3 regions”的研究論文(DOI: 10.1093/nar/gkad198)。
研究報(bào)道了一種可逆終止子技術(shù)整合入gRNA文庫合成工作的可控模板依賴延伸(CTDE)方法。研究人員將CTDE方法應(yīng)用于染色質(zhì)免疫沉淀獲得的組蛋白H3K4me3區(qū)域的DNA,構(gòu)建了大規(guī)模的gRNA文庫,篩選并確定了哺乳動物細(xì)胞增殖必需位點(diǎn)的功能元件。最后選取一個重要的功能區(qū)域進(jìn)行深入研究,證實(shí)了LINC00339內(nèi)含子中的一個必要位點(diǎn)能夠調(diào)節(jié)其自身信使RNA的表達(dá),并且該長鏈非編碼RNA是維持HepG2細(xì)胞增殖的新型細(xì)胞周期調(diào)控基因。CTDE方法具有高效率、低成本和可自動化等顯著優(yōu)勢,可廣泛應(yīng)用于哺乳動物基因組中功能元件的鑒定和研究。
潘辰、李然、水麗艷博士研究生和肖政云助理研究員為論文第一作者。研究得到國家自然科學(xué)基金、浙江省重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目等資助。
浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)2023年2期