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        基于Shapley additive explanations(SHAP)分析乳腺X線檢查假陰性乳腺癌的特征

        2023-07-31 05:18:04楊蔚張寧妹張朝林尹清云
        關(guān)鍵詞:乳腺癌

        楊蔚 張寧妹 張朝林 尹清云

        乳腺癌仍然是全球女性最致命的惡性腫瘤,早期診斷可顯著改善患者預(yù)后和生存率[1]。乳腺X線攝影(mammography,MG)篩查的廣泛推薦應(yīng)用使死亡率下降20%~40%[2]。由于費(fèi)用低廉、操作簡(jiǎn)單、省時(shí)、對(duì)鈣化極其敏感等優(yōu)勢(shì),MG仍然是目前乳腺癌首選的篩查和診斷工具[3]。然而MG作為一種二維成像技術(shù),通過識(shí)別可疑病灶的形態(tài)特征來判斷良惡性,具有較高的假陽性和假陰性率。

        MRI是檢查乳腺癌最敏感的影像技術(shù),具有最高的準(zhǔn)確性和較高的特異性。大量研究[4]建議補(bǔ)充乳腺M(fèi)RI以提高乳腺癌的檢出率,特別是對(duì)于乳腺密度較高的女性,MRI能夠發(fā)現(xiàn)MG檢查以外的大約16%~20%的額外病灶。

        Shapley additive explanation(SHAP)分析是一種統(tǒng)計(jì)學(xué)方法,通過R軟件,將預(yù)先設(shè)計(jì)好的模型中包含的各個(gè)變量的貢獻(xiàn)價(jià)值用長短不等的直方圖展示出來,能夠可視化的對(duì)整體系統(tǒng)中的每個(gè)變量的貢獻(xiàn)進(jìn)行公正的評(píng)估,這意味每個(gè)變量的價(jià)值都能在整體中單獨(dú)考慮,發(fā)揮作用[5]。該方法已被廣泛用于數(shù)據(jù)分析中。

        本課題旨在利用一個(gè)相對(duì)較大的、單中心的長期數(shù)據(jù)庫來回顧性地探討能夠在MRI發(fā)現(xiàn)而MG假陰性的乳腺癌相關(guān)的臨床病理及影像學(xué)特征,并應(yīng)用SHAP分析導(dǎo)致MG假陰性檢查結(jié)果的主要因素。讓影像科醫(yī)生和臨床醫(yī)生加強(qiáng)認(rèn)識(shí),提高警惕,適當(dāng)?shù)难a(bǔ)充乳腺M(fèi)RI檢查以提高癌灶的檢出率。

        方法

        1. 臨床資料

        該研究通過了寧夏醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(倫理編號(hào):KYLL-2022-0251)?;仡櫺允占?018年1月—2022年5月來我院就診的可疑乳腺癌患者2769人。納入標(biāo)準(zhǔn):①病理證實(shí)為一側(cè)單灶,浸潤性或非浸潤性乳腺癌伴/不伴導(dǎo)管原位癌(ductal carcinoma in situ,DCIS);②均有MG及MRI檢查,且兩者相隔時(shí)間不超過45 d[6];③臨床、病理資料完整,影像圖像質(zhì)量清晰可用;④既往無乳腺癌病史,無放療、激素治療或化療史。排除例數(shù):經(jīng)病理證實(shí)為良性病變的患者983例;MRI和/或MG缺失或MRI和MG檢查時(shí)間間隔>45 d的147例;病理數(shù)據(jù)缺失或不完整的56例;既往有乳腺癌病史,或縱隔淋巴瘤、肺癌或卵巢癌史接受了放療和化療的38例;單乳多灶性乳腺癌患者67例;MG和MRI檢查均為陰性而腋窩淋巴結(jié)被病理證實(shí)為乳腺癌轉(zhuǎn)移的臨床隱匿性乳腺癌6例。最終,1472例患者(包括33例同時(shí)性雙乳癌)共1505個(gè)病灶納入研究。包括124個(gè)DCIS、1個(gè)小葉原位癌(lobular carcinoma in situ,LCIS)、10個(gè)導(dǎo)管內(nèi)乳頭狀癌、1207個(gè)浸潤性導(dǎo)管癌(invasive ductal carcinoma,IDC)、30個(gè)浸潤性小葉癌(invasive lobular carcinoma,ILC)和133個(gè)其他癌(包括44個(gè)髓樣癌,43個(gè)浸潤性微乳頭狀癌,20個(gè)黏液癌,6個(gè)大汗腺癌,5個(gè)惡性葉狀腫瘤,5個(gè)淋巴瘤,3個(gè)癌肉瘤,3個(gè)化生癌,2個(gè)浸潤性乳頭狀癌,1個(gè)內(nèi)分泌癌和1個(gè)轉(zhuǎn)移癌)。

        2. 影像檢查方法

        為保證圖像的真實(shí)可靠,所有患者均在穿刺活檢,微創(chuàng)旋切或手術(shù)前接受MG及乳腺M(fèi)RI檢查。

        2.1 MG檢查

        用Siemens Mammomat Novation DR全數(shù)字化乳腺X線機(jī),每例患者均獲得雙側(cè)乳腺頭尾位(craniocaudal,CC)及內(nèi)外斜位(medio-lateral oblique,MLO)圖像。

        2.2 MRI檢查

        所有患者均在GE 1.5 T 或3.0 T MR上進(jìn)行掃描,包括動(dòng)態(tài)對(duì)比增強(qiáng)MRI(dynamic contrast enhancement MRI,DCE-MRI)及彌散加權(quán)成像(diffusion-weighed imaging,DWI),使用8通道專用乳腺表面線圈。患者取俯臥位,雙乳自然狀態(tài)置于乳腺線圈中,分別行以下掃描。①橫斷位DWI:TR/TE 5000 ms/70 ms,層厚4 mm,視野320 mm×320 mm,矩陣132×132,b值分別取0、1000 s/mm2;②矢狀位脂肪抑制(fat suppression,F(xiàn)S)快速自旋回波(fast spin-echo,F(xiàn)SE)T2WI:TR/TE 3800 ms/94 ms,層厚2 mm,視野200 mm×200 mm,矩陣288×224;③橫斷位DCE-MRI梯度回波序列(gradient echo sequence,GRE) FS T1WI:翻轉(zhuǎn)角15°,TR/TE 5 ms/2 ms,層厚2 mm,視野320 mm×320 mm,矩陣448×352。對(duì)比劑采用釓噴酸葡胺注射液(Gd-DTPA,商品名為馬根維顯,拜耳醫(yī)藥保健有限公司生產(chǎn),0.2 mmol/kg),經(jīng)肘靜脈以2.5 mL/s快速團(tuán)注,然后10 mL生理鹽水沖洗導(dǎo)管內(nèi)對(duì)比劑。注射前后連續(xù)采集8個(gè)時(shí)相,總持續(xù)時(shí)間432 s。

        3. 圖像分析

        2名放射科醫(yī)師(分別為21年工作經(jīng)驗(yàn)的主任醫(yī)師和4年工作經(jīng)歷的住院醫(yī)師)在不知曉患者術(shù)后病理的情況下獨(dú)立閱片,若有不一致經(jīng)商量達(dá)成共識(shí)。根據(jù)第5版美國放射學(xué)會(huì)(American College of Radiology, ACR)乳腺影像報(bào)告和數(shù)據(jù)系統(tǒng)(Breast Imaging Reporting and Data System Atlas 5th Edition,BI-RADS?5th)標(biāo)準(zhǔn)[7],對(duì)MG的表現(xiàn)進(jìn)行描述及評(píng)估。腫塊大小(RECIST 1.1標(biāo)準(zhǔn))在橫斷位DCEMRI晚期時(shí)像上選取腫瘤的最大徑線測(cè)量。

        4. 病理分析

        記錄患者的組織病理學(xué)檢查結(jié)果,包括病理類別、浸潤性導(dǎo)管癌級(jí)別、激素受體(hormone receptor,HR)狀態(tài)、人表皮生長因子受體2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)狀態(tài)、Ki-67表達(dá)等病理學(xué)指標(biāo)。激素受體陽性為雌激素受體(oestrogen receptor,ER)和/或孕激素受體(progesterone receptor,PR)陽性,即標(biāo)準(zhǔn)免疫組化方法核染色>1%[8]。HER2陽性為HER2評(píng)分3+,或HER2評(píng)分2+的腫瘤通過熒光原位雜交技術(shù)顯示基因有擴(kuò)增。

        5. 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

        應(yīng)用SPSS 26.0軟件和R v. 4.1.1(R Development Core Team,Vienna,Austria)軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。連續(xù)資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差或中位數(shù)(上,下四分位數(shù))表示。臨床、病理和影像特征比較使用Mann-WhitneyU檢驗(yàn)、獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)或χ2檢驗(yàn)。采用logistic回歸分析明確MG假陰性乳腺癌的獨(dú)立危險(xiǎn)因素,并構(gòu)建聯(lián)合模型。繪制受試者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲線,評(píng)估獨(dú)立危險(xiǎn)因素及聯(lián)合模型的診斷效能。應(yīng)用SHAP分析聯(lián)合模型中各獨(dú)立危險(xiǎn)因素導(dǎo)致MG假陰性結(jié)果的貢獻(xiàn)價(jià)值。通過組內(nèi)相關(guān)系數(shù)(intraclass correlation coefficient,ICC)和Kappa檢驗(yàn)對(duì)病灶大小、MG密度、鈣化狀態(tài)和病灶MRI強(qiáng)化類型的觀察者間變異性進(jìn)行評(píng)估。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        結(jié)果

        入組1472例患者,平均年齡(51.64±9.92)歲,范圍20~86歲,包括33例雙側(cè)乳癌;共1505個(gè)病灶,其中373個(gè)MG假陰性乳腺癌(圖1為MG假陰性乳腺癌病例的影像學(xué)表現(xiàn)),1132個(gè)MG陽性乳腺癌。

        圖1 典型病例影像女,44歲,表現(xiàn)為MG假陰性的乳腺癌患者,病理證實(shí)為右乳非特殊型浸潤性癌2級(jí),三陰性,Ki-674%。雙側(cè)乳腺頭尾位(CC位)圖像(A、B)和內(nèi)外斜位(MLO位)圖像(C、D)顯示,雙側(cè)乳腺不均勻致密,雙乳未見可疑鈣化;橫斷位DCE-MRI圖像(E)示右乳外上象限可見一17.3 mm的強(qiáng)化腫塊(箭所指);橫斷位DWI圖像(F)示腫塊明顯高信號(hào)(箭所指)。

        2名診斷醫(yī)師對(duì)病灶大小、MG密度、鈣化狀態(tài)及病灶強(qiáng)化類型評(píng)估均有良好的一致性。病灶大?。篒CC=0.936(95%CI 0.801~0.967);MG密度:κ=0.912(95%CI 0.792~0.959);鈣化狀態(tài):κ=0.895(95%CI 0.774~0.923);病灶MRI強(qiáng)化類型:κ=0.903(95%CI 0.810~0.944)。

        373個(gè)MG假陰性乳腺癌[平均年齡(48.43±9.04)歲,范圍23~80歲]和1132個(gè)MG陽性乳腺癌組[平均年齡(52.58±10.75)歲,范圍20~86歲]在年齡、絕經(jīng)狀態(tài)、病灶大小、MG密度、鈣化狀態(tài)、病灶MRI強(qiáng)化類型、病理類型、病理分級(jí)、PR狀態(tài)、Ki-67指數(shù)、分子亞型、腋窩淋巴結(jié)狀態(tài)等方面均有顯著性差異(均P<0.05),而在ER狀態(tài)和HER2狀態(tài)上沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(均P>0.05)。詳見表1。

        表1 MG假陰性乳腺癌與MG陽性乳腺癌臨床、病理及影像學(xué)特征比較

        此外,373 個(gè)MG假陰性乳腺癌中原位癌/浸潤性癌比率約為 17%(55/318);1132個(gè)MG陽性乳腺癌中原位癌/浸潤性癌比率約為8%(80/1052),兩者具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P<0.001)。

        多因素logistic回歸分析結(jié)果顯示,較小的病灶(OR=1.066,95%CI 1.048~1.083,P<0.001)、致密或不均勻致密MG密度(OR=0.006,95%CI 0.001~0.060,P<0.001)、無可疑鈣化(OR=0.002,95%CI 0.001~0.010,P<0.001)、非腫塊樣強(qiáng)化(non-mass enhancement,NME)(OR=0.034,95%CI 0.017~0.067,P<0.001),、原位癌(主要為導(dǎo)管原位癌)(OR=0.360,95%CI 0.152~0.850,P=0.02)和腋窩淋巴結(jié)陰性(OR=0.516,95%CI 0.369~0.723,P<0.001)與MG假陰性乳腺癌獨(dú)立相關(guān)(表2)。將上述6個(gè)獨(dú)立相關(guān)因素構(gòu)建聯(lián)合模型,顯示出較高的預(yù)測(cè)效能,AUC為0.871(95%CI 0.851~0.890),靈敏度為84.06%,特異度為80.71%,陽性預(yù)測(cè)值為93.11%,陰性預(yù)測(cè)值為62.49%(表3)。

        表2 MG假陰性乳腺癌相關(guān)特征的logistic回歸分析結(jié)果

        表3 ROC分析MG假陰性乳腺癌獨(dú)立相關(guān)特征的診斷效能

        應(yīng)用SHAP對(duì)聯(lián)合模型中單個(gè)獨(dú)立相關(guān)因素進(jìn)行的評(píng)估(圖2)顯示,病灶大小、MG密度和病灶MRI強(qiáng)化類型是導(dǎo)致MG假陰性結(jié)果的主要因素,而病理類型、鈣化狀態(tài)和腋窩淋巴結(jié)狀態(tài)是重要補(bǔ)充。

        圖2 應(yīng)用SHAP分析導(dǎo)致乳腺癌MG假陰性結(jié)果的因素

        討論

        這項(xiàng)回顧性單中心研究旨在探討僅能夠在MRI發(fā)現(xiàn)而MG假陰性的乳腺癌相關(guān)的臨床、病理和影像學(xué)特征,有助于影像科醫(yī)生或臨床醫(yī)生提高警惕,適當(dāng)補(bǔ)充乳腺M(fèi)RI檢查,以提高癌灶的檢出率,避免漏診而影響治療方案的選擇,改善預(yù)后。

        在本研究中,我們回顧相對(duì)較大的1505個(gè)樣本量,發(fā)現(xiàn)MG假陰性乳腺癌發(fā)生率約為25%,該數(shù)據(jù)與Choudhery等[6]研究相一致。

        本研究中,病灶較小、致密或不均勻致密MG密度、NME、無可疑鈣化、原位癌(主要為DCIS)和腋窩淋巴結(jié)陰性與MG假陰性乳腺癌獨(dú)立相關(guān)。根據(jù)SHAP分析(圖2),病灶大小、MG密度和病灶MRI強(qiáng)化類型是導(dǎo)致MG假陰性檢查結(jié)果的主要因素,而病理類型、鈣化狀態(tài)和腋窩淋巴結(jié)狀態(tài)是重要補(bǔ)充。

        我們的結(jié)果表明,致密或不均勻致密腺體是導(dǎo)致MG假陰性乳腺癌的一個(gè)危險(xiǎn)因素,與最近報(bào)道[9]的一項(xiàng)前瞻性隨機(jī)研究結(jié)果相仿。該研究表明,乳腺密度極高的女性通過補(bǔ)充MRI檢查提高了癌灶檢出率。事實(shí)上,致密的乳腺很難通過MG對(duì)病灶進(jìn)行準(zhǔn)確評(píng)估,并且可能具有更高患癌風(fēng)險(xiǎn)[10]。MRI不受乳腺密度的影響,通過多方位,多序列成像顯示病灶,尤其DCE及DWI顯著提高乳腺癌的診斷率。

        小病灶與MG假陰性的檢查結(jié)果顯著相關(guān)。先前的研究證實(shí):小病灶,多灶性或多中心性病變大多不能通過MG完全檢出,通常檢出率低于50%[11],而未發(fā)現(xiàn)的額外惡性病灶是保乳術(shù)后復(fù)發(fā)的主要原因。另外,在我們的研究中,有33例同時(shí)性雙乳癌(占2%)都是通過MRI檢查發(fā)現(xiàn),而它們中的12例(占36%)為雙側(cè)MG假陰性,MG假陰性率高于本研究的平均值(約25%)。筆者認(rèn)為導(dǎo)致這一結(jié)果可能是雙乳癌降低了MG對(duì)照觀察之間的差異,故強(qiáng)調(diào)在可能存在多中心、多灶性乳腺癌或同時(shí)性雙乳癌病例中應(yīng)當(dāng)補(bǔ)充MRI以提高癌灶檢出率。

        在我們的研究中,DCIS與MG假陰性檢查結(jié)果獨(dú)立相關(guān)。近年來DCIS的發(fā)病率顯著提高,約占新發(fā)乳腺癌病例的30%[12]。DCIS通常在MG中表現(xiàn)為鈣化,尤其是高核級(jí)DCIS更容易出現(xiàn)惡性鈣化[13]。在我們這項(xiàng)研究中共有124個(gè)DCIS病例,MG假陰性組和MG陽性組中分別為46和78例。假陰性組和陽性組的低核級(jí)DCIS病例分別為20例(43%)和7例(9%);中核級(jí)DCIS病例分別為15例(33%)和14例(18%);高核級(jí)DCIS病例分別為11(24%)和57(73%),2組之間低、中、高核級(jí)DCIS比例具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P<0.001)。低核級(jí)和中核級(jí)DCIS因病灶小且多無鈣化而被遺漏。

        在我們的研究中,NME與MG假陰性檢查結(jié)果緊密相關(guān)。根據(jù)第5版ACR BI-RADS,相對(duì)于MRI上腫塊樣強(qiáng)化病灶,非腫塊樣強(qiáng)化病灶是指增強(qiáng)掃描后病灶無空間占用效應(yīng)的區(qū)域反映。由于沒有空間形態(tài),在MG中不易發(fā)現(xiàn)。人工智能的應(yīng)用,將顯著提高診斷率[14]。

        當(dāng)然,如果在MG中存在其他間接體征,例如乳房變形、乳頭凹陷、皮膚增厚和乳頭牽拉移位等,盡管未見到惡性病灶的直接征象,也要高度警惕,以防假陰性的可能,需補(bǔ)充乳腺M(fèi)RI以提高癌灶檢出率。

        這項(xiàng)研究有一些局限性。首先,這是單中心回顧性研究,病例的選取可能會(huì)導(dǎo)致偏倚;其次,作為金標(biāo)準(zhǔn)的病理僅涉及乳腺M(fèi)RI的可疑區(qū)域,很少檢查整個(gè)乳腺,可能導(dǎo)致MG假陰性結(jié)果被低估;第三,未應(yīng)用數(shù)字乳腺斷層攝影(digital breast tomography,DBT)、全數(shù)字化乳腺攝影(full-field digital mammography,F(xiàn)FDM)及對(duì)比增強(qiáng)光譜乳腺X線攝影(contrast-enhanced spectral mammography,CEM)等更敏感的檢查技術(shù),或人工智能和影像組學(xué)等更先進(jìn)的方法,導(dǎo)致MG假陰性結(jié)果可能被高估。

        總之,較小的病灶、致密或不均勻致密的MG密度、NME病灶、無可疑鈣化,原位癌和腋窩淋巴結(jié)陰性與MG假陰性乳腺癌獨(dú)立相關(guān)。SHAP分析顯示,病灶大小、MG密度和病灶MRI增強(qiáng)類型是導(dǎo)致MG假陰性的主要因素,病理類型、鈣化狀態(tài)和腋窩淋巴結(jié)狀態(tài)是重要補(bǔ)充。對(duì)此類患者需補(bǔ)充乳腺M(fèi)RI檢查以防止漏診。

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