核酸,是脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)的總稱,被認(rèn)為是生命的最基本物質(zhì)之一。自從19世紀(jì)末被發(fā)現(xiàn)以來,關(guān)于核酸的發(fā)現(xiàn)和研究,已經(jīng)為人類破解生命的奧秘打開了一扇門;而在上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院分子醫(yī)學(xué)研究院研究員楊洋眼中,這些記錄著龐大生命遺傳信息的生物聚合物,還有另外的“用武之地”——基于其分子識別和自組裝功能,以及優(yōu)異的可編程性、良好的生物相容性等優(yōu)點(diǎn),核酸可以被視作一種精巧的分子信息材料或基礎(chǔ)的分子砌塊,通過精確組裝能衍生出很多自然界不存在的形態(tài)。以此為基礎(chǔ)構(gòu)建的分子機(jī)器,可以在生物傳感、生物成像、智能藥物、納米機(jī)器、數(shù)據(jù)存儲等領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)應(yīng)用,進(jìn)而打開物理、化學(xué)、生物醫(yī)學(xué)、工程學(xué)乃至信息科學(xué)等多學(xué)科交融發(fā)展的突破口?!袄碚撋?,一種材料可以衍生出無數(shù)種產(chǎn)品。從這個意義出發(fā),以核酸為主要材料的分子機(jī)器應(yīng)用可以說無可限量。我現(xiàn)在要做的就是以核酸材料為出發(fā)點(diǎn),錨定核酸納米結(jié)構(gòu)自組裝、磷脂膜精確調(diào)控、仿生功能納米結(jié)構(gòu)和核酸信息存儲等主要研究方向,去探索其無限的可能性?!?/p>
興趣和幸運(yùn)的相逢
“從個人成長的角度,我的經(jīng)歷可以凝練為兩個關(guān)鍵詞,一個是興趣的驅(qū)動,一個是幸運(yùn)的成長?!?/p>
幼年時,搬家的螞蟻、精彩的《動物世界》欄目、自然界的風(fēng)火雷電……都是楊洋的興趣所在,這也為他多年后考取南開大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院埋下伏筆?!霸?001年有機(jī)會進(jìn)入生命科學(xué)學(xué)院學(xué)習(xí),是我成長路上第一次幸運(yùn)的際遇。”4年的專業(yè)學(xué)習(xí)讓楊洋對于生命科學(xué)有了框架性的認(rèn)識,而在中國科學(xué)院國家納米科學(xué)中心劉冬生教授課題組攻讀博士的經(jīng)歷,則是他從學(xué)科啟蒙走向科學(xué)啟蒙的重要一步。
甫一入學(xué),劉冬生教授關(guān)于“四鏈螺旋DNA結(jié)構(gòu)”的研究就吸引了他的全部注意力。“區(qū)別于常見的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu),真核細(xì)胞內(nèi)天然存在的染色體端粒區(qū)內(nèi)富含鳥嘌呤(G)的DNA序列可以4段為一組,形成近似正方形的螺旋堆疊,這些G-四鏈體與人類壽命、衰老乃至癌癥密切相關(guān)。值得注意的是,其互補(bǔ)方向上的富含胞嘧啶(C)的區(qū)域也可以在弱酸性條件下形成另一類有趣的四螺旋,稱作i-motif,利用它的酸堿依賴性我們可以構(gòu)建一類靈敏的分子開關(guān)?!本瓦@樣,再一次選擇從興趣出發(fā),他在劉冬生教授的指導(dǎo)下正式踏上了科研的漫漫征程。
在楊洋攻讀博士期間,已有一部分歐美科學(xué)家嘗試?yán)肈NA這種特殊的分子材料“編織”更大的結(jié)構(gòu),“就像我們用毛線來打毛衣、打手套、打圍巾一樣,利用DNA也可以‘編織’各種各樣的二維結(jié)構(gòu)或圖案”。楊洋所說的“編織”,正是核酸納米結(jié)構(gòu)自組裝的研究范疇。
平時對學(xué)生“高標(biāo)準(zhǔn)、嚴(yán)要求”的導(dǎo)師劉冬生,很快發(fā)覺到了楊洋的興趣所在。在結(jié)構(gòu)DNA納米技術(shù)領(lǐng)域頗有建樹的華裔科學(xué)家、亞利桑那州立大學(xué)教授顏顥回國參會時,劉冬生教授為楊洋爭取了一次與這位業(yè)內(nèi)翹楚交流的機(jī)會。在對談中,厚積薄發(fā)又滿懷熱忱的楊洋得到了顏顥教授的認(rèn)可,并幸運(yùn)地獲得了赴美開展博士后研究的機(jī)會。自此,楊洋關(guān)于核酸納米結(jié)構(gòu)自組裝的了解和研究,也真正從“紙上得來”走到了“躬行致遠(yuǎn)”。
在亞利桑那州立大學(xué),楊洋逐步掌握了DNA“編織”技術(shù)的精髓,并躊躇滿志地開啟了多項(xiàng)研究?!澳菚r我決心要在科研道路上‘大展拳腳’,最多時曾平行開展6項(xiàng)課題,經(jīng)常工作到凌晨一兩點(diǎn)鐘。”楊洋回憶道,“但是這些工作中僅有少數(shù)達(dá)到了可以發(fā)表的水平,更多研究都因?yàn)榉N種原因未能實(shí)現(xiàn)預(yù)期的結(jié)果。盡管如此,我的導(dǎo)師始終耐心指導(dǎo),并告訴我失敗本身也是科學(xué)研究的一大魅力,這給予了我極大的鼓舞和動力?!苯?jīng)過思考和總結(jié),楊洋“所有的彎路都沒有白走”,連續(xù)發(fā)布的兩篇關(guān)于DNA納米結(jié)構(gòu)組裝設(shè)計(jì)基礎(chǔ)原理的學(xué)術(shù)文章,成了他在這個領(lǐng)域嶄露頭角的標(biāo)志。
在做出成果的同時,楊洋也思考著“下一步往哪里走”的問題。“領(lǐng)域內(nèi)外的專家都認(rèn)為DNA納米結(jié)構(gòu)就像樂高零件,可以拼出各種各樣的事物。這個比喻指向了兩種解讀,從正面來看,DNA納米結(jié)構(gòu)如同樂高一樣千變?nèi)f化、異彩紛呈、潛力無限;但從負(fù)面來看,樂高終歸是玩具,真的能賦予它前所未有的功能嗎?在我看來,這個答案是肯定的,因?yàn)轱w天的‘神舟’、潛海的‘蛟龍’何嘗不是一顆顆螺絲、齒輪構(gòu)建而成的呢?漫漫長路只待求索而已?!本痛?,探索如何將其他功能分子與DNA結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)結(jié)合起來,使其應(yīng)用于更廣闊的場景,成了楊洋為自己定下的新目標(biāo)。2012年年底,在顏顥教授的引薦下,楊洋前往美國耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院,加入學(xué)術(shù)新銳林晨翔教授的課題組,開啟了新的征程。
“這又是一段幸運(yùn)的時光,僅比我大一歲的林教授作為耶魯大學(xué)最年輕的學(xué)術(shù)帶頭人之一,充滿了科研的熱情與活力。他亦兄亦友,生活中春風(fēng)化雨,科研上細(xì)致入微,從實(shí)驗(yàn)室的建設(shè)、科學(xué)思維的展開和實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的討論,帶領(lǐng)我全方位多角度地提升了自己,讓我邁過了科研路上‘看山不是山’的關(guān)鍵門檻?!边@一階段,楊洋開始挑戰(zhàn)利用DNA組裝結(jié)構(gòu)框架來束縛和操控磷脂雙分子層這一艱巨的任務(wù),并在這一前沿領(lǐng)域取得了亮眼成果。相關(guān)論文先后兩次發(fā)表于《自然·化學(xué)》(Nature Chemistry),為DNA納米結(jié)構(gòu)工具在生物膜相關(guān)的基礎(chǔ)和應(yīng)用研究方面打開了一道全新的大門。
興趣催生動力,良師指明方向。在興趣和幸運(yùn)之間,楊洋的科研之路行穩(wěn)致遠(yuǎn)、捷報頻傳,而他回國報效、投身更廣泛實(shí)踐的經(jīng)歷,也正于此時悄悄揭開序章。
祖國和時代的呼喚
“要從自己眼前的小領(lǐng)域里面稍稍跳出來一些,要具有更遠(yuǎn)大的志向和理想,然后學(xué)以致用?!?/p>
2017年,楊洋接到了恩師劉冬生的電話?!爱?dāng)時劉老師語重心長地說:‘世界正在起變化,未來科學(xué)研究的重心會在中國,國家有對人才的期許和要求,也有充裕的資源和機(jī)遇,你開始準(zhǔn)備和計(jì)劃了嗎?’一語驚醒夢中人,在美國習(xí)慣閑適生活的我瞬間感受到了壓力和責(zé)任。這通電話讓我意識到,無論是在科研或是在時代的道路上,我都應(yīng)該邁出新的一步,回到祖國發(fā)光發(fā)熱了?!?/p>
抱著這樣的想法,楊洋以研究員的身份入職上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院分子醫(yī)學(xué)研究院(以下簡稱“研究院”)。研究院所屬的上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟(jì)醫(yī)院科研平臺,給了楊洋更近距離接觸臨床醫(yī)學(xué)的機(jī)會,研究院院長譚蔚泓院士“利用核酸為代表的分子工具解決臨床醫(yī)學(xué)重大問題,服務(wù)人民健康”的強(qiáng)烈信念也深深地影響了他。在國家“四個面向”方略的指引下,楊洋再一次出發(fā),投入新一輪的科研攻關(guān)中,并在全息病毒模擬、囊泡可控制備、生物醫(yī)學(xué)工具開發(fā)等前沿方向均取得了一系列創(chuàng)新性成果。
“生命活動的關(guān)鍵場域在納米尺度,四類生物大分子組裝而成的結(jié)構(gòu)形態(tài)涌現(xiàn)出諸多功能,并在億萬年進(jìn)化中留下了最強(qiáng)者。”楊洋介紹道,“例如各類病毒、各種細(xì)胞內(nèi)外囊泡,它們與細(xì)胞的相互作用精準(zhǔn)而高效,用我們組裝的核酸納米裝置來精準(zhǔn)學(xué)習(xí)和模擬這些生命元件和體系,可以最大化地發(fā)揮其優(yōu)勢,創(chuàng)造全新的工具服務(wù)于生物醫(yī)學(xué)研究。”圍繞生命元件功能模塊模擬的科學(xué)問題,楊洋構(gòu)建了全息仿病毒多面體核酸納米框架,探索了框架內(nèi)外修飾分子的理化參數(shù)與仿生效應(yīng)之間的關(guān)系,實(shí)現(xiàn)了精準(zhǔn)的功能化調(diào)控。利用核酸納米框架構(gòu)建仿病毒裝置器件,他還在大小、形貌、外部識別分子修飾、內(nèi)部遺傳物質(zhì)搭載等因素上全面模擬天然病毒,設(shè)計(jì)制備了具有正二十面體對稱性的框架核酸;并利用其內(nèi)外拓?fù)涞奈ㄒ恍院腿婵蓪ぶ沸裕瑢ζ渫獠亢蛢?nèi)部模塊進(jìn)行精準(zhǔn)修飾,實(shí)現(xiàn)了框架外部病毒功能蛋白展示和內(nèi)部病毒基因組高效包裝。在研究過程中,楊洋與合作者共同構(gòu)建了病毒蛋白可控展示的分子裝置,為相關(guān)研究提供了安全、簡潔、可控的工具平臺,并為藥物驗(yàn)證和疫苗開發(fā)提供了新思路。
與此同時,楊洋從囊泡可控制備角度入手,打破直接合成單一尺寸脂質(zhì)體的傳統(tǒng)思維,利用框架核酸作為負(fù)載包覆脂質(zhì)體以調(diào)節(jié)其密度,并通過密度梯度離心實(shí)現(xiàn)了脂質(zhì)體依據(jù)大小精確高效的分選,進(jìn)一步利用分選脂質(zhì)體研究了基于量化曲率的仿分泌囊泡細(xì)胞理化反應(yīng)。這一技術(shù)使大規(guī)模制備尺寸均一的脂質(zhì)體成為可能,也為功能膜蛋白研究、外泌體分選、納米載藥體系構(gòu)建等重要研究方向提供了新的工具選擇。
基于核酸納米框架構(gòu)建的分子工具在檢測、調(diào)控和遞送方向具有顯著優(yōu)勢和巨大潛力,楊洋團(tuán)隊(duì)還開發(fā)了具備功能元件協(xié)同效應(yīng)的核酸納米框架分子器件,在一些具體場景中展示了這些納米器件在標(biāo)志物檢測、病毒侵染阻抑、基因靶向遞送等生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用上的能力。通過總結(jié)前期的成果和經(jīng)驗(yàn),目前已有更多通用、高效、精準(zhǔn)的分子裝置進(jìn)入系統(tǒng)性開發(fā)階段。這些研究成果發(fā)表在《自然·化學(xué)》(Nature Chemistry)、《美國化學(xué)會會刊》(JACS)、《德國應(yīng)用化學(xué)》(Angewandte Chemie International Edition)等化學(xué)領(lǐng)域的知名刊物上,并獲得國際同行的廣泛認(rèn)可和引用。
充分運(yùn)用核酸納米框架這一前沿化學(xué)生物學(xué)工具,楊洋團(tuán)隊(duì)在為相關(guān)研究提供基礎(chǔ)性、決定性的支持的同時,不斷提出和整合適用于不同應(yīng)用場景的關(guān)鍵性、變革性解決方案,充分挖掘其在生命體系的化學(xué)模擬與構(gòu)建、生物功能導(dǎo)向的自組裝體系構(gòu)筑和精準(zhǔn)高效診療技術(shù)開發(fā)等方面的巨大潛力。對于像楊洋這樣的年輕人,團(tuán)隊(duì)的領(lǐng)導(dǎo)者、領(lǐng)域內(nèi)的先行者譚蔚泓院士、樊春海院士對他們寄予厚望,并號召他們“要從自己的小的領(lǐng)域里面稍稍跳出來一些,要具有更遠(yuǎn)大的志向和理想,然后學(xué)以致用”。而在前沿領(lǐng)域奮斗不輟的楊洋,也正在追求科研與應(yīng)用相平衡的道路上,踐行著這則箴言。
現(xiàn)在到未來的延續(xù)
“對現(xiàn)在所做的科研成果進(jìn)行驗(yàn)證,在更廣闊的領(lǐng)域?qū)で髮W(xué)科交叉融合發(fā)展的可能,這將是一個龐大而意義深遠(yuǎn)的工程,需要我和我的團(tuán)隊(duì)、我的學(xué)生共同完成?!?/p>
導(dǎo)師的悉心教導(dǎo)、寬容和支持,曾是求學(xué)期間楊洋得以成長的重要動力;如今作為團(tuán)隊(duì)的負(fù)責(zé)人,他同樣期待以這樣的方式惠及后來人。
在楊洋看來,科研之路永無止境,遇到困難和挫折是行走其間的常態(tài),樂觀的心態(tài)是應(yīng)對這些狀況的不二法門?!翱蒲兄械拇煺?,我甚至不將其定義為挫折,而是把它當(dāng)作一個可以解決的問題去分析研究,這是支持我一直走在科研道路上的巨大動力?!边@一態(tài)度也在共同進(jìn)步的過程中逐漸成為楊洋團(tuán)隊(duì)的共識。在連續(xù)兩項(xiàng)國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目和科技部國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目的支持下,團(tuán)隊(duì)逐漸成長為一支科研實(shí)力強(qiáng)勁、學(xué)科特色明顯的年輕團(tuán)隊(duì);而楊洋對于學(xué)生自主性、多樣性研究的引導(dǎo)和支持,也成為開拓相關(guān)研究新思路、新方法乃至全新研究領(lǐng)域的重要動力源。
談及未來發(fā)展,楊洋坦言,將核酸納米框架仿生裝置相關(guān)成果應(yīng)用于重大疾病的醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化和產(chǎn)業(yè)化,將是他和團(tuán)隊(duì)擁抱產(chǎn)業(yè)的第一步。屆時,他們不僅可以為癌癥等重大疾病的早期檢測和診療提供一類基礎(chǔ)性工具,更可以設(shè)計(jì)納米機(jī)器人進(jìn)行精準(zhǔn)給藥,并有望進(jìn)一步用于修復(fù)器官、去除癌變細(xì)胞或更換有缺陷的人體基因等精準(zhǔn)醫(yī)療場景。與此同時,他們也積極探索DNA存儲技術(shù)發(fā)展的可能性,為其提供堅(jiān)實(shí)的理論和模型基礎(chǔ)。從對自然科學(xué)好奇的孩童,到投身研究樂以忘憂的科學(xué)工作者,楊洋的初心始終未變——“目前人類對世界的認(rèn)識不過九牛一毛,還有廣闊的世界等待我們進(jìn)一步發(fā)掘和認(rèn)識。”楊洋笑著說道,“核酸納米領(lǐng)域同樣有著廣闊的空間有待探索,而我們要做的,就是立足當(dāng)下、開拓邊界,探索更多的‘合作方案’和應(yīng)用場景。在這個過程中,如果我能在任何一個方面前進(jìn)哪怕一小步,我都會高興得不得了。這是我的興趣所在,也是我的動力所在?!?/p>