肖 振,李盛華
1.甘肅中醫(yī)藥大學(xué),甘肅 蘭州 730000
2.甘肅省中醫(yī)院,甘肅 蘭州 730050
激素性股骨頭壞死(steroid induced osteonecrosis of femoral head,SONFH)是一種常見的進(jìn)行性骨病,80%的患者會(huì)在1~4年內(nèi)出現(xiàn)髖關(guān)節(jié)塌陷,最終需行人工關(guān)節(jié)置換,給社會(huì)家庭帶來沉重負(fù)擔(dān)[1]。SONFH的發(fā)生是由于免疫相關(guān)疾病過度使用糖皮質(zhì)激素(glucocorticoid,GC)造成。GC 誘導(dǎo)的骨內(nèi)皮細(xì)胞凋亡可激活血栓形成并減少血管生成[2]。骨內(nèi)皮細(xì)胞包括骨微血管內(nèi)皮細(xì)胞(bone microvascular endothelial cells,BMECs)和內(nèi)皮祖細(xì)胞(endothelial progenitor cells,EPCs),在維持血管穩(wěn)態(tài)以及股骨頭血供中起著重要的作用。由骨內(nèi)皮細(xì)胞受損引起的血管生成受損、細(xì)胞凋亡異常、血栓形成和脂肪栓塞被認(rèn)為是SONFH 的關(guān)鍵發(fā)病機(jī)制[3-8]。研究發(fā)現(xiàn),骨細(xì)胞不能在距離血管超過100 mm 處存活,所以學(xué)者們普遍認(rèn)為血管發(fā)育總是先于成骨[9]。多項(xiàng)研究表明,血管內(nèi)皮損傷與SONFH 密切相關(guān),來自SONFH患者的BMECs 具有抑制遷移、血管生成受損和凋亡活性增加的特點(diǎn)[10-11]。另外,通過血管造影觀察血管化大轉(zhuǎn)子的骨移植治療股骨頭壞死能明顯改善股骨頭的血液灌注,并大幅改善患者髖關(guān)節(jié)活動(dòng)功能[12]。因此,改善骨內(nèi)皮細(xì)胞形態(tài)及功能是防控SONFH 發(fā)生和發(fā)展的重要調(diào)節(jié)因子。
血管生成是支持SONFH 修復(fù)的關(guān)鍵因素。研究發(fā)現(xiàn)使用普伐他汀和淫羊藿苷能促進(jìn)血管新生,預(yù)防SONFH 的發(fā)生[13-14]。銀杏葉提取物能增加SONFH 模型小鼠血管內(nèi)皮細(xì)胞的活性,抑制甲強(qiáng)龍誘導(dǎo)的內(nèi)皮細(xì)胞凋亡和功能喪失,逆轉(zhuǎn)激素對(duì)磷酸化磷脂酰肌醇-3-羥激酶(phosphorylated phosphatidylinositol-3-hydroxykinase,p-PI3K)、磷酸化蛋白激酶B(phosphorylated protein kinase B,p-Akt)和磷酸化內(nèi)皮型一氧化氮合酶(phosphorylated endothelial nitric oxide synthase,p-eNOS)表達(dá)水平的抑制,預(yù)防骨壞死[15]。本研究基于生物信息學(xué)分析篩選SONFH 中與血管生成相關(guān)的差異表達(dá)基因,進(jìn)一步通過基因本體(gene ontology,GO)和京都基因與基因組百科全書(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,確定SONFH 發(fā)病機(jī)制,以及核心基因的表達(dá)、功能、相互作用及信號(hào)通路,并進(jìn)一步篩選靶向中藥活性成分,為靶向修復(fù)骨內(nèi)皮細(xì)胞和探索SONFH 的治療靶點(diǎn)提供新思路。
從GEO數(shù)據(jù)庫檢索“steroid induced osteonecrosis of the femoral head”或“SONFH”獲得GSE123568和GSE74089 數(shù)據(jù)集。GSE123568 包含10 個(gè)對(duì)照樣本和30 個(gè)SONFH 樣本,GSE74089 包含SONFH 和對(duì)照各4 個(gè)樣本。檢索Genecards 數(shù)據(jù)庫獲得SONFH靶基因2174 個(gè)。再通過檢索“endothelial cells”和“glucocorticoid”,獲得GSE25269 數(shù)據(jù)集,包含2 個(gè)對(duì)照組內(nèi)皮細(xì)胞樣本和2 個(gè)地塞米松干預(yù)的細(xì)胞樣本。使用Prel 語言處理數(shù)據(jù)集,R 軟件的svg 包對(duì)數(shù)據(jù)集去批次處理,通過limma 包限定P<0.05 獲得DEGs,制做熱圖進(jìn)行可視化分析。
將各數(shù)據(jù)集DEGs 導(dǎo)入venny2.1 軟件,獲得SONFH 中與血管新生相關(guān)的關(guān)鍵基因。進(jìn)一步使用David 軟件獲取GO 富集和KEGG 通路相關(guān)信息。
通過STING 平臺(tái)和Cytoscape 3.9.0 軟件,深入了解SONFH 中差異表達(dá)血管新生相關(guān)基因的內(nèi)在聯(lián)系。使用MCODE 插件對(duì)基因進(jìn)行聚類分析,使用CytoHubb 插件獲取核心基因。
為了驗(yàn)證核心基因篩選的可靠性,使用GSE123568 數(shù)據(jù)集鑒定選定的核心基因的表達(dá)水平。進(jìn)一步使用CTD 數(shù)據(jù)庫驗(yàn)證核心基因與SONFH 之間的相互作用關(guān)系。
CTD 數(shù)據(jù)庫是比較毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫,采用CTD 數(shù)據(jù)庫搜索靶向作用于核心基因的中藥活性成分(限定interactions≥2)。
在TCMSP 平臺(tái)、ZINC 數(shù)據(jù)庫搜索與核心基因作用指數(shù)最高的中藥活性成分的3D 結(jié)構(gòu)(mol2 格式),在PDB 數(shù)據(jù)庫中輸入核心基因Uniprot ID,下載相關(guān)靶蛋白的pdb 格式文件,經(jīng)PyMOL 去水加氫后,使用Autodock vina1.1.2 軟件進(jìn)行分子對(duì)接,再用PyMOL 軟件將結(jié)果可視化。
1.7.1 細(xì)胞及試劑 人BMECs 購自ICELL(上海)生物技術(shù)股份有限公司,白藜蘆醇(resveratrol)、3-MA(PI3K 抑制劑)購自MCE 上海皓元生物醫(yī)藥科技有限公司,注射用甲潑尼龍琥珀酸鈉(methylprednisolone sodium,MPS,輝瑞制藥有限公司),實(shí)驗(yàn)時(shí)將MPS 溶于ECM 培養(yǎng)基,3-MA 和白藜蘆醇分別溶于 DMSO,原液濃度均為 100 mmol/L,后續(xù)實(shí)驗(yàn)使用內(nèi)皮細(xì)胞培養(yǎng)基(endothelial cell medium,ECM)稀釋至合適濃度。0.1%胰蛋白酶-EDTA、細(xì)胞計(jì)數(shù)試劑盒8(cell counting kit 8,CCK-8)、RIPA 裂解液(北京索萊寶科技有限公司);蛋白酶和磷酸酶抑制劑(Thermo Fisher Scientific公司,美國);Matrigel基質(zhì)膠(BD Biosciences公司,美國);Transwell 小室(24 孔培養(yǎng)板)、96 孔培養(yǎng)板(Corning 公司,美國);血管內(nèi)皮生長因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)兔抗多克隆抗體(1∶1000)、PI3K 兔抗多克隆抗體(1∶1000)、Akt 兔抗多克隆抗體(1∶1000)、磷酸甘油醛脫氫酶(reduced glyceraldehyde-phosphate dehydrogenase,GAPDH)兔抗多克隆抗體(1∶5000);辣根過氧化物酶(horseradish peroxidase,HRP)標(biāo)記羊抗兔二抗(1∶5000)均為ImmunoWay 公司產(chǎn)品。
1.7.2 白藜蘆醇對(duì)MPS 干預(yù)后BMECs 增殖的影響使用ECM 培養(yǎng)制備BMECs 混懸液,細(xì)胞數(shù)2×105個(gè)/mL,加入96 孔板中,每孔100 μL,空白組不加細(xì)胞僅加100 μL ECM。過夜貼壁后,對(duì)照組加入ECM,處理組分別用終濃度25、50、75、100、200 μmol/L 白藜蘆醇+20 μg/mL(終質(zhì)量濃度)MPS[16]處理24、42、72 h 后,每孔加入10 μL CCK-8 避光孵育2 h。酶標(biāo)儀(BioRed,美國)檢測450 nm 處的吸光度(A),計(jì)算細(xì)胞活力。實(shí)驗(yàn)重復(fù)3 次。
細(xì)胞存活率=(A處理-A空白)/(A對(duì)照-A空白)
1.7.3 白藜蘆醇對(duì)MPS 干預(yù)后BMECs 遷移的影響
(1)劃痕實(shí)驗(yàn):將細(xì)胞以2×105個(gè)/孔接種于6孔板內(nèi),分為6 組:對(duì)照組、模型(10 mg/mL MPS)組、3-MA 抑制劑(10 mg/mL MPS+5 mmol/L[16]3-MA+100 μmol/L 白藜蘆醇)組及白藜蘆醇低、中、高劑量(10 mg/mL MPS+50、100、200 μmol/L白藜蘆醇)組。細(xì)胞在無血清培養(yǎng)基中饑餓8 h 后,用200 μL 移液管吸頭刮去內(nèi)皮細(xì)胞,洗滌未附著的細(xì)胞,每組給予相應(yīng)藥物,培養(yǎng)0、24 h 后拍照,計(jì)算劃痕愈合率。實(shí)驗(yàn)重復(fù)3 次。
劃痕愈合率=(0 h 劃痕寬度-24 h 劃痕寬度)/0 h 劃痕寬度
(2)Transwell 遷移實(shí)驗(yàn):分組和給藥同劃痕實(shí)驗(yàn),消化細(xì)胞并用PBS 洗滌3 次去除血清影響,用無血清培養(yǎng)基調(diào)整細(xì)胞密度為1×105個(gè)/mL,每孔加入200 μL 細(xì)胞懸液于Transwell 小室內(nèi),24 孔板內(nèi)加入750 μL 含10% FBS 的ECM 培養(yǎng)基。每組給予相應(yīng)藥物,孵育24 h 后,Transwell 小室用甲醇固定,0.1%結(jié)晶紫染色;隨后用棉簽去除每個(gè)小室內(nèi)部未遷移細(xì)胞,倒置顯微鏡下觀察。隨機(jī)取3 個(gè)視野計(jì)數(shù)遷移細(xì)胞并取均值,實(shí)驗(yàn)重復(fù)3 次。
1.7.4 蛋白質(zhì)印記分析 分組和給藥同劃痕實(shí)驗(yàn),BMECs 給予相應(yīng)處理48 h 后,通過RIPA 裂解緩沖液(含蛋白酶和磷酸酶抑制劑1∶100)提取蛋白質(zhì),紫外分光光度計(jì)測定蛋白濃度并稀釋濃度至10 mg/mL。加入5×上樣緩沖液混合均勻,在95 ℃下加熱5 min 導(dǎo)致蛋白質(zhì)變性。使用8% SDS-PAGE 分離膠分離40 μg 蛋白質(zhì)樣品,然后將其轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,用10%脫脂牛奶封閉2 h,然后一抗在隨后的4 ℃下孵育過夜。之后,與其相應(yīng)的二抗進(jìn)行孵育。用電化學(xué)發(fā)光法觀察條帶。Image Lab 3.0 軟件用于量化條帶灰度值。實(shí)驗(yàn)重復(fù)3 次。
使用GraphPad Prism 9.0.0 統(tǒng)計(jì)分析,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)以±s表示,多組間比較采用單因素方差分析,兩組間比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),P<0.05 表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
數(shù)據(jù)集和平臺(tái)信息見表1,通過GEO2R 獲得差異表達(dá)基因,以P<0.05 為條件篩選DEGs,GSE123568 包含12 796 個(gè),GSE74089 包含12 120個(gè),Genecards 包括2354 個(gè),其中GSE123568 和GSE74089 的數(shù)據(jù)經(jīng)Perl 語言處理合并及R 軟件(svg 包)矯正后,使用ggplot2 包將數(shù)據(jù)可視化,見圖1,SONFH 差異基因火山圖及熱圖見圖2。綜合各數(shù)據(jù)集共獲得SONFH 的DEGs 963 個(gè),見圖3-A。同樣篩選GSE25269(P<0.05)數(shù)據(jù)集獲得與血管生成相關(guān)的2373 個(gè)DEGs,前50 個(gè)DEGs 熱圖見圖3-B。
圖2 SONFH 的DEGs 火山圖和聚類熱圖Fig.2 Volcano map(A)and clustering heat map(B)of DEGs of SONFH
表1 數(shù)據(jù)集基本信息Table 1 Basic information of data set
圖1 GEO 數(shù)據(jù)矯正Fig.1 GEO data correction
將SONFH 中與血管生成相關(guān)的基因定義為關(guān)鍵基因。將各數(shù)據(jù)集DEGs(P<0.05)導(dǎo)入venny 2.1 軟件,獲得118 個(gè)SONFH 中與血管新生相關(guān)的DEGs(圖3-C)。其中74 個(gè)在SONFH 中表達(dá)上調(diào),44 個(gè)在SONFH 中表達(dá)下調(diào)。
圖3 SONFH 和血管新生相關(guān)的DEGs 及關(guān)鍵基因的篩選Fig.3 SONFH and angiogenesis related DEGs and screening of key genes
使用DAVID 數(shù)據(jù)庫進(jìn)行關(guān)鍵基因的GO 富集(圖4-A、B、D)和KEGG 通路富集分析,GO富集中生物過程主要涉及正調(diào)控血管生成、細(xì)胞黏附、炎癥、細(xì)胞增殖、遷移和傷口愈合等;細(xì)胞組分主要涉及細(xì)胞外間隙、細(xì)胞外基質(zhì)和胞外區(qū);分子功能涉及蛋白質(zhì)結(jié)合、血小板衍生生長因子和蛋白酶結(jié)合等。KEGG 主要富集到PI3K 信號(hào)通路、黏附斑信號(hào)通路、細(xì)胞外基質(zhì)受體互作通路和Ras 相關(guān)蛋白1(Ras-related protein 1,Rap1)信號(hào)通路等,關(guān)鍵基因與通路的桑基氣泡圖見圖4-C。
圖4 關(guān)鍵基因的GO 和KEGG 富集分析Fig.4 GO and KEGG enrichment analysis of key genes
將DEGs 導(dǎo)入STRING 平臺(tái),隱藏?zé)o連接的節(jié)點(diǎn),獲得包含102 個(gè)節(jié)點(diǎn)和443 條邊的PPI網(wǎng)絡(luò),再導(dǎo)入Cytoscape,使用NetworkAnalyzer 工具計(jì)算節(jié)點(diǎn)屬性,節(jié)點(diǎn)大小對(duì)應(yīng)度(degree)大小,見圖5。再使用Cytoscape 的MCODE 插件尋找關(guān)鍵的子網(wǎng)絡(luò)6 個(gè),見圖6-A~F,其主要子網(wǎng)絡(luò)(圖6-A)涉及vegf 激活的血小板衍生生長因子受體信號(hào)通路對(duì)細(xì)胞增殖、一氧化氮介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)節(jié)、冠狀血管形態(tài)發(fā)生和細(xì)胞黏附的正調(diào)節(jié)。
圖5 關(guān)鍵基因PPI 網(wǎng)絡(luò)(節(jié)點(diǎn)大小對(duì)應(yīng)度值大小)Fig.5 PPI network of key genes(node size correspondence degree value size)
通過Cytoscape 軟件中的CytoHubba 插件篩選關(guān)鍵基因中最大中心度(maximal clique centrality,MCC)評(píng)分前10 位的基因,定義為核心基因。通過篩選依次為血管內(nèi)皮生長因子(vascular endothelial growth factor,VEGFA)、白蛋白(albumin,ALB)、胰島素(insulin,INS)、胰島素樣生長因子1(insulin-like growth factor 1,IGF1)、透明質(zhì)酸的受體(CD44)、整合素β-1(integrin beta-1,ITGB1)、Thy-1 膜糖蛋白(Thy-1 membrane glycoprotein,THY1)、血小板衍生生長因子受體β(platelet-derived growth factor receptor beta,PDGFRB)、受體型酪氨酸蛋白磷酸酶 C(receptor-type tyrosine-protein phosphatase C,PTPRC)和膠原蛋白α-1(collagen alpha-1(I)chain,COL1A1),見圖6-G。進(jìn)一步對(duì)核心基因富集通路分析,結(jié)果顯示通路主要富集到PI3K-Akt、黏附斑、Ras 和Rap1 信號(hào)通路等(圖7),與關(guān)鍵基因富集通路大致相同。
圖6 PPI 網(wǎng)絡(luò)基因簇模塊(A~F)與核心基因(G)Fig.6 Gene cluster module of PPI network(A—F)and core genes(G)
圖7 核心基因富集通路圖Fig.7 Enrichment pathway map of core genes
通過驗(yàn)證GSE123568 數(shù)據(jù)集鑒定選定的10 個(gè)核心基因的表達(dá)水平,發(fā)現(xiàn)核心基因表達(dá)均差異明顯(P<0.05,圖8-A),尤其PTPRC、CD44、IGF1和VEGFA的差異最為顯著,其中CD44、ITGB1和PTPRC表達(dá)上調(diào),其余皆表達(dá)下調(diào)。進(jìn)一步受試者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)分析顯示PTPRC、CD44、IGF1、PDGFRB、ITGB1和VEGFA的曲線下面積(area under curve,AUC)值分別為0.897、0.837、0.777、0.770、0.767 和0.703(圖8-B)。
圖8 核心基因在SONFH 中的表達(dá)情況Fig.8 Expression of core genes in SONFH
再使用CTD 數(shù)據(jù)庫驗(yàn)證核心基因與SONFH 之間的相互作用關(guān)系(圖9),結(jié)果發(fā)現(xiàn)COL1A1、IGF1、VEGFA和PTPRC與SONFH 作用指數(shù)較高,提示可能為干預(yù)修復(fù)SONFH 的重要靶點(diǎn)。
圖9 核心基因與SONFH 相互作用指數(shù)Fig.9 Interaction index of core genes and SONFH
CTD 數(shù)據(jù)庫中靶向作用于核心基因的中藥活性成分(interactions≥2)見表2。結(jié)果顯示白藜蘆醇、姜黃素、雌二醇和槲皮素等與核心基因相互作用指數(shù)較高,提示這些活性成分可能是作用核心基因促進(jìn)血管新生修復(fù)SONFH 關(guān)鍵藥物成分。
表2 靶向作用核心基因的中藥活性成分Table 2 Active components of traditional Chinese medicine targeting core genes
通過Autodock vina 軟件分子對(duì)接,顯示靶向核心基因的主要中藥活性成分白藜蘆醇與VEGFA、PTPRC、ITGB1、PDGFRB、IGF1和CD44結(jié)合能均小于-5 kcal/mol(1 kcal=4.2 kJ),結(jié)合穩(wěn)定,結(jié)合能依次為-6.2、-6.1、-5.9、-5.6、-5.2 和-5.3 kcal/mol。白藜蘆醇與各蛋白形成氫鍵豐富,結(jié)構(gòu)構(gòu)象穩(wěn)定,如與VEGFA通過氨基酸殘基SER-9、GLY-42、GLY-41、LYS-103 形成4 個(gè)氫鍵;與PTPRC通過氨基酸殘基SER-828/SER-829、ARG-834、GLY-833、HIS-797、GLN-872 形成6 個(gè)氫鍵;與PDGFRB通過氨基酸殘基SER-40、SER-39、SER-77、ARG-19、ARG-37、PTR-1 形成6 個(gè)氫鍵;與ITGB1通過殘基ARG-309、THR-310、SER-233 形成3 個(gè)氫鍵;與IGF1通過氨基酸殘基GLY-19、GLN-15 形成2個(gè)氫鍵;與CD44通過氨基酸殘基SER-109、ILE-26、GLU-37 形成3 個(gè)氫鍵(圖10),結(jié)果提示白藜蘆醇有可能通過核心基因VEGFA、PTPRC、ITGB1、PDGFRB、IGF1 和CD44發(fā)揮修復(fù)SONFH 的作用。
圖10 白藜蘆醇與核心基因結(jié)合位點(diǎn)Fig.10 Sites of resveratrol binding to core gene
2.8.1 對(duì)BMECs 增殖的影響 CCK8 檢測顯示,白藜蘆醇濃度為100 μmol/L 且作用48 h,能顯著改善MPS 對(duì)BMECs 活性的抑制,見圖11。
圖11 白藜蘆醇對(duì)MPS 干預(yù)后BMECs 活力的影響(n=3)Fig.11 Effect of resveratrol on BMECs activity after MPS intervention(n = 3)
2.8.2 對(duì) BMECs 遷移的影響 劃痕實(shí)驗(yàn)和Transwell 實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖12)表明,基于劃痕愈合率和細(xì)胞遷移數(shù)量兩方面,模型組BMECs 的遷移顯著低于對(duì)照組(P<0.05),白藜蘆醇低、中、高劑量組BMECs 的遷移明顯高于模型組,白藜蘆醇中劑量組明顯高于3-MA 抑制劑組(P<0.05)。
圖12 白藜蘆醇對(duì)細(xì)胞遷移的影響(±s,n=3)Fig.12 Effects of resveratrol on cell migration(±s,n=3)
2.8.3 對(duì)細(xì)胞蛋白表達(dá)的影響 Western blotting 檢測結(jié)果(圖13)顯示,與對(duì)照組比較,模型組PI3K/Akt/VEGF 通路蛋白表達(dá)降低,其中PI3K 表達(dá)水平降低顯著(P<0.05);與模型組比較,白藜蘆醇低、中、高劑量組中Akt、VEGF 蛋白相對(duì)表達(dá)量均明顯升高(P<0.05),白藜蘆醇中、高劑量組PI3K 蛋白相對(duì)表達(dá)量明顯升高(P<0.05),而3-MA抑制劑組較白藜蘆醇中劑量組通路蛋白表達(dá)明顯降低(P<0.05)。
圖13 白藜蘆醇對(duì)MPS 誘導(dǎo)降低的BMEC 中PI3K/Akt/VEGF 信號(hào)通路蛋白表達(dá)的影響(±s,n=3)Fig.13 Effects of resveratrol on PI3K/Akt/VEGF signaling pathway protein expression in MPS induced BMECs(±s,n=3)
SONFH 是難治性骨科疾病,主要由血液供應(yīng)中斷和凝血系統(tǒng)功能障礙引起,導(dǎo)致骨細(xì)胞死亡、股骨頭塌陷。GC 的使用抑制了血管生成、骨修復(fù)和一氧化氮的代謝,通過調(diào)節(jié)血管活性介質(zhì)如內(nèi)皮素-1、去甲腎上腺素和緩激肽來誘導(dǎo)骨內(nèi)股骨頭動(dòng)脈血管的收縮導(dǎo)致股骨頭缺血,以及增加骨內(nèi)壓引起缺血,促進(jìn)內(nèi)皮細(xì)胞的凋亡,減少流向股骨頭的血量[17-20]。骨內(nèi)皮細(xì)胞不僅可以形成微血管系統(tǒng),為發(fā)育中的骨骼提供營養(yǎng),還可以在體外和體內(nèi)增強(qiáng)間充質(zhì)干細(xì)胞的成骨分化,促進(jìn)骨修復(fù)。因此,尋找SONFH 中與血管生成相關(guān)的基因,在診斷和修復(fù)SONFH 方面具有重要作用。
本研究分析了公共數(shù)據(jù)庫中可用的微陣列數(shù)據(jù)集GSE123568、GSE74089、GSE25269 和Genecards數(shù)據(jù)庫,獲得SONFH 的DEGs 共963 個(gè),血管生成相關(guān)DEGs 共2373 個(gè),獲得SONFH 中與血管生成相關(guān)的關(guān)鍵基因118 個(gè),其中74 個(gè)在SONFH 中表達(dá)上調(diào),44 個(gè)在SONFH 中表達(dá)下調(diào)。這些基因主要富集于正調(diào)控血管生成、細(xì)胞黏附、炎癥、細(xì)胞增殖和遷移、傷口愈合等,大部分作用于細(xì)胞質(zhì)和核質(zhì)。有研究證實(shí)細(xì)胞因子IL-10 和TNF-α 與SONFH 的發(fā)生有關(guān)[21]。據(jù)報(bào)道,促紅細(xì)胞生成素通過刺激VEGF 的表達(dá)來促進(jìn)血管生成,以保護(hù)股骨頭免受GC 誘導(dǎo)的骨壞死的侵害[22-23]。細(xì)胞黏附相關(guān)蛋白R(shí)ap1 在SONFH 中下調(diào),對(duì)股骨頭內(nèi)微血管內(nèi)皮細(xì)胞黏附及遷移造成障礙,未能對(duì)受損血管內(nèi)皮及時(shí)修復(fù),加速骨壞死進(jìn)程[24]。此外,KEGG 富集分析主要涉及PI3K-Akt 信號(hào)通路、黏著斑信號(hào)通路、細(xì)胞外基質(zhì)受體互作通路和Rap1 信號(hào)通路等。參與這些途徑的大多數(shù)基因都被上調(diào)了。PI3K-Akt是一個(gè)重要而復(fù)雜的信號(hào)通路,其在干細(xì)胞調(diào)節(jié)的細(xì)胞存活、增殖、遷移和血管生成中起著核心作用。激活PI3K-Akt 信號(hào)通路可顯著增強(qiáng)各種組織中內(nèi)皮細(xì)胞的功能[25]。黏著斑激酶(focal adhesion kinase,F(xiàn)AK)是一種非受體蛋白酪氨酸激酶和支架蛋白,可介導(dǎo)許多細(xì)胞功能,包括黏附、遷移和侵襲。FAK 抑制劑可減少滑膜成纖維細(xì)胞的侵襲和遷移,因此,抑制FAK 可能有助于改善在SONFH 發(fā)展中的骨髓水腫和滑膜炎[26]。黏著斑與細(xì)胞生長、形狀和運(yùn)動(dòng)有關(guān)。研究表明,黏著斑是股骨頭壞死后未成熟關(guān)節(jié)軟骨中顯著豐富的生物學(xué)途徑[27]。本團(tuán)隊(duì)前期研究發(fā)現(xiàn)非創(chuàng)傷性股骨頭壞死可能與信號(hào)通路Rap1/PI3K/Akt 受到抑制導(dǎo)致其表達(dá)下降所引起的血管內(nèi)皮損傷有關(guān)[24]。細(xì)胞外基質(zhì)受體互作通路與血管生成、軟骨生成和軟骨退化有關(guān)[28],且在股骨頭壞死的髖軟骨中顯著富集[29]。本研究結(jié)果提示PI3K-Akt 信號(hào)通路、黏著斑和Rap1 信號(hào)通路等參與了SONFH 的發(fā)病機(jī)制。
10 個(gè)核心基因是VEGFA、ALB、INS、IGF1、CD44、ITGB1、THY1、PDGFRB、PTPRC和COL1A1。這些核心基因都可能在SONFH 發(fā)生和發(fā)展中起到重要作用。VEGFA基因位于染色體6p31.3[30],是編碼血管內(nèi)皮生長因子的成員,與VEGF 受體在胞外結(jié)合,刺激細(xì)胞內(nèi)酪氨酸激酶,促進(jìn)內(nèi)皮細(xì)胞增殖,增加血管通透性。已有研究將VEGFA 啟動(dòng)子區(qū)域內(nèi)的多個(gè)遺傳多態(tài)性與非創(chuàng)傷性SONFH 的疾病狀態(tài)聯(lián)系起來。VEGFA 是血管生成的關(guān)鍵介質(zhì)[31],誘導(dǎo)內(nèi)皮細(xì)胞增殖,促進(jìn)細(xì)胞遷移,抑制細(xì)胞凋亡并誘導(dǎo)血管通透。使用VEGF受體拮抗劑可以在動(dòng)物模型中阻斷血管生成并誘導(dǎo)SONFH[32]。IGF1 調(diào)控細(xì)胞生長、分化,如刺激成骨細(xì)胞和內(nèi)皮細(xì)胞的增殖,促進(jìn)組織再生與修復(fù)。IGF1 可逆轉(zhuǎn)地塞米松對(duì)PI3K-Akt 信號(hào)通路的抑制,并抑制其下游叉頭框蛋白O1(forkhead box protein O1,F(xiàn)OXO1)的表達(dá),進(jìn)而治療SONFH[33]。CD44 抗原是透明質(zhì)酸(hyaluronic acid,HA)的受體。通過其與HA 和其他配體(如骨橋蛋白、膠原蛋白和基質(zhì)金屬蛋白酶)的親和力來介導(dǎo)細(xì)胞與細(xì)胞、細(xì)胞與基質(zhì)的相互作用,其與HA 的結(jié)合在細(xì)胞遷移中起作用。PDGFRB 通過促進(jìn)周細(xì)胞和平滑肌細(xì)胞向內(nèi)皮細(xì)胞的增殖、遷移和募集,在血管發(fā)育中起至關(guān)重要的作用[34]。PTPRC 是抗原受體激活T 細(xì)胞所需的蛋白質(zhì)酪氨酸-蛋白質(zhì)磷酸酶。有研究發(fā)現(xiàn)微重力環(huán)境中的小鼠股骨頭出現(xiàn)了骨吸收,檢測髓腔分離的細(xì)胞顯示早期間充質(zhì)干細(xì)胞造血分化的基因 PTPRC 的表達(dá)顯著下調(diào)[35-36]。COL1A1 在SONFH 模型兔中的表達(dá)被抑制,使用葛根素后COL1A1 的表達(dá)升高,且SONFH 模型兔的成骨能力增加[37]。目前ALB、INS、CD44和THY1等核心基因在骨壞死中的作用機(jī)制尚不清楚,有待于進(jìn)一步研究。
通過GSE123568 數(shù)據(jù)集鑒定,發(fā)現(xiàn)核心基因尤其是PTPRC、CD44、IGF1和VEGFA的表達(dá)差異最為顯著。ROC 分析顯示PTPRC、CD44、IGF1、PDGFRB、ITGB1和VEGFA的AUC 值均大于0.7,具有較大可能性成為SONFH 潛在生物標(biāo)志物,Ma等[38]在1 項(xiàng)漢族人群VEGFA與SONFH 的遺傳關(guān)系的研究中,VEGFA單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNP)基因型rs2010963與SONFH 顯著相關(guān)。通過CTD 數(shù)據(jù)庫驗(yàn)證核心基因與SONFH 之間的相互作用關(guān)系,發(fā)現(xiàn)COL1A1、IGF1、VEGFA和PTPRC與SONFH 作用指數(shù)較高,提示可能為干預(yù)修復(fù)SONFH 的重要靶點(diǎn)。目前已有通過VEGFA 防治SONFH 的研究,有研究發(fā)現(xiàn)促紅細(xì)胞生成素通過刺激VEGFA 的表達(dá),可保護(hù)股骨頭免受GC 誘導(dǎo)的骨壞死的侵害[39]。CTD 數(shù)據(jù)庫篩選靶向核心基因的中藥活性成分,發(fā)現(xiàn)白藜蘆醇、姜黃素、雌二醇和槲皮素等與核心基因相互作用指數(shù)相對(duì)較高,為防治SONFH 提供了新的方向。
分子對(duì)接顯示白藜蘆醇與SONFH 中與血管新生有關(guān)的核心基因結(jié)合穩(wěn)定,并通過體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn)證實(shí)白藜蘆醇能顯著上調(diào)本研究篩選的核心基因VEGFA及PI3K/Akt 信號(hào)通路的表達(dá)水平,表明白藜蘆醇對(duì)激素干預(yù)的BMECs的損傷具有修復(fù)作用,主要通過激活 PI3K/AKT/VEGF 信號(hào)通路提高BMECs 的活性并促進(jìn)細(xì)胞的遷移。也有研究發(fā)現(xiàn),白藜蘆醇可以改善SOFNH 兔模型中的骨骼血液供應(yīng),以保護(hù)血管內(nèi)皮細(xì)胞并減少血栓形成[40-41]。研究表明,姜黃素可通過抑制Janus 激酶1/2(Janus kinase 1/2,JAK1/2)-信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活因子1(signal transducer and activator of transcription 1,STAT1)途徑抑制SONFH 模型小鼠細(xì)胞M1 極化來防止炎癥介導(dǎo)的骨細(xì)胞凋亡[42],與本研究篩選結(jié)果一致,說明姜黃素有很大潛能成為臨床治療SONFH 藥物的新選擇。
通過生物信息學(xué)分析鑒定了SONFH 血管新生相關(guān)的核心基因和通路,尤其是PTPRC、IGF1、VEGFA、ITGB1、PDGFRB和CD44核心基因和PI3K信號(hào)通路、黏附斑信號(hào)通路、細(xì)胞外基質(zhì)受體互作通路和Rap1 信號(hào)通路等,它們可能與SONFH 發(fā)病密切相關(guān);篩選出白藜蘆醇最有可能成為預(yù)防或逆轉(zhuǎn)骨壞死的潛在藥物,并進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。本研究有助于理解血管新生在SONFH 發(fā)病機(jī)制中的作用,為尋找具有SONFH 診斷或治療價(jià)值的生物標(biāo)志物的相關(guān)大樣本研究提供參考依據(jù)。
利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突