徐麗譚鉞宗曉娟吳舉彬 魏海蓉
(1.山東省果樹研究所,山東 泰安 271000;2.沂源縣農(nóng)業(yè)農(nóng)村局,山東 沂源 256100)
WRKY家族是植物中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,其成員具有一個或兩個高度保守的WRKY結(jié)構(gòu)域,N端包含一個保守的WRKYGQK七肽序列,C端包含一個C2H2或C2HC鋅指基序[1,2]。根據(jù)WRKY結(jié)構(gòu)域的數(shù)量和C端鋅指基序的結(jié)構(gòu),WRKY家族可分為三類:Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ類[1]。自第一個WRKY蛋白(SPF1)[3]被發(fā)現(xiàn)以來,WRKY轉(zhuǎn)錄因子在植物中的功能研究取得了很大進(jìn)展,發(fā)現(xiàn)WRKY在響應(yīng)生物和非生物脅迫以及在植物信號傳導(dǎo)、生長發(fā)育調(diào)控中發(fā)揮著重要作用[4-7]。例如擬南芥的AtWRKY18、AtWRKY33和AtWRKY46已被證明參與病原體和水楊酸(SA)介導(dǎo)的 防 御 反 應(yīng)[8-11];AtWRKY8、AtWRKY25、At-WRKY33和AtWRKY47參與非生物脅迫反應(yīng)[12-15];AtWRKY71結(jié)合到FT和LFY的啟動子上,通過上調(diào)其表達(dá),加速擬南芥的開花[16];At-WRKY71可被H2O2、ABA和甘露醇快速誘導(dǎo),可能在植物對非生物脅迫的響應(yīng)中發(fā)揮作用[17];水稻的OsWRKY71和OsWRKY51共同參與GA和ABA信號通路,控制α-淀粉酶活性,調(diào)節(jié)種子休眠[18];OsWRKY71可以通過調(diào)控下游基因OsTGFR和WSI76的表達(dá)來提高轉(zhuǎn)基因水稻植株的耐寒性[19];轉(zhuǎn)小麥TaWRKY71的擬南芥通過促進(jìn)IAA向MeIAA轉(zhuǎn)化,改變生長素穩(wěn)態(tài)水平,從而引起葉片休眠[20];香蕉的MaWRKY31、MaWRKY33、MaWRKY60和MaWRKY71基因表達(dá)在冷藏期間受ABA處理誘導(dǎo),并且能直接結(jié)合到MaNCED1和MaNCED2基因啟動子的W-box上激活其表達(dá)[21]。目前關(guān)于WRKY基因功能的研究主要集中在草本植物如擬南芥、小麥、煙草、水稻中,在木本植物中報道的非常少,關(guān)于WRKY71轉(zhuǎn)錄因子在甜櫻桃砧木中的功能研究尚未見報道。
砧木是限制甜櫻桃生產(chǎn)的關(guān)鍵問題之一。甜櫻桃矮化砧木吉塞拉(Prunus cerasus×Prunus canescens)是將酸櫻桃與灰毛葉櫻桃進(jìn)行種間雜交培育出的三倍體雜種,目前是甜櫻桃生產(chǎn)中最受歡迎的矮化砧木[22,23],但是該品種的根系發(fā)育較弱,對寒冷、干旱和鹽分等環(huán)境脅迫的抵抗力較差,因此改善其抗逆性迫在眉睫。由于雜交的雜合性和多倍體性,利用傳統(tǒng)的雜交育種方法改良甜櫻桃砧木比較困難,而且周期較長,利用單基因或多基因遺傳轉(zhuǎn)化是有效改善該品種存在問題的一種有效方法,其中關(guān)鍵基因的挖掘是前提。鑒于WRKY基因在植物抵抗生物和非生物脅迫中的重要性,我們以甜櫻桃砧木‘Gisela 6’為材料,對其WRKY71轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行功能鑒定,可為甜櫻桃砧木抗逆品種選育提供理論依據(jù)和技術(shù)支持,并為甜櫻桃的分子設(shè)計育種提供基因資源。
本試驗于2021年在山東省果樹研究所完成。甜櫻桃砧木‘Gisela 6’組培苗在附加0.5 mg/L 6-BA、30 mg/L蔗糖和6 mg/L瓊脂的MS基本培養(yǎng)基上繼代培養(yǎng),置于26℃恒溫培養(yǎng)箱(光照16 h、黑暗8 h)中培養(yǎng)3周后,分別轉(zhuǎn)移到添加200 mmol/L甘露醇、200 mmol/L NaCl、200 mmol/L茉莉酸甲酯(MeJA)和150 mmol/L水楊酸(SA)的培養(yǎng)基上,另將部分組培苗置于4℃培養(yǎng)箱中進(jìn)行低溫脅迫處理,每個處理重復(fù)3次,每個重復(fù)9瓶。分別于處理0、2、4、6、12、24、48 h取組培苗葉片。放入液氮冷凍后保存于-80℃冰箱備用。
1.2.1 RNA的提取與PcWRKY71基因的克隆利用植物總RNA提取試劑盒(天根生化科技有限公司,北京)提取‘Gisela 6’葉片總RNA,然后按照One-Step gDNA removal and cDNA synthesis試劑盒(全式金生物技術(shù)有限公司,北京)說明書進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA。
根據(jù)甜櫻桃轉(zhuǎn)錄組和基因組數(shù)據(jù),設(shè)計合成PcWRKY71基因全長引物PcWRKY71-F(5′-CTACTTCCATGTCTGATCATGAAC-3′)和Pc-WRKY71-R(5′-AAGATGATCGTGATGAGAGGAG-3′)。以反轉(zhuǎn)錄合成的cDNA為模板PCR擴(kuò)增PcWRKY71全長序列。PCR反應(yīng)體系包括2×Phanta?Max Buffer 25μL、Phanta?Max Super-Fidelity DNA Polymerase 1μL、10 mmol/L dNTP Mix 1μL、10μmol/LPcWRKY71-F 2μL、10μmol/LPc-WRKY71-R 2μL和cDNA 2μL,ddH2O補足至50 μL。PCR反應(yīng)程序為95℃預(yù)變性3 min;95℃變性15 s,56℃退火15 s,72℃延伸1 min,35個循環(huán);最后72℃延伸5 min。
PCR擴(kuò)增產(chǎn)物通過1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測,目的片段用瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(天根生化科技有限公司,北京)切膠回收,將回收的目的片段連接到pEASY-Blunt載體上(全式金生物技術(shù)有限公司,北京),然后轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞DH5α,在氨芐青霉素抗性的LB平板培養(yǎng)基上培養(yǎng),挑取單個菌落進(jìn)行PCR擴(kuò)增檢測,陽性菌落送生工生物工程(青島)股份有限公司測序。
1.2.2PcWRKY71基因的生物信息學(xué)分析 用NCBI在線ORF Finder(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)預(yù)測PcWRKY71基因的開放閱讀框。用ProtParam(http://us.expasy.org/tools/ProtParam.html)預(yù)測基因編碼蛋白的分子量和等電點等;利用ProtScale軟件(http://www.expasy.org/cgibin/protscale.pl)分析氨基酸序列的疏/親水性;用Plant-mPLoc軟件(http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/plant-multi/)預(yù)測其亞細(xì)胞定位;利用MEGA 7.0軟件鄰位相連法(Neighbor-Joining,NJ)構(gòu)建不同物種WRKY71蛋白序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹。
1.2.3 qRT-PCR檢測PcWRKY71在不同處理下的表達(dá)模式 利用試劑盒分別提取甘露醇、NaCl、MeJA、SA和4℃低溫處理后‘Gisela 6’組培苗葉片的總RNA,反轉(zhuǎn)錄合成cDNA,然后利用qRTPCR檢測PcWRKY71基因在不同處理下的表達(dá)量。qRT-PCR的引物為qF(5′-GATAAGCATCAATCACAAC-3′)和qR(5′-TGTAATCCATAGGTCCTT-3′),以甜櫻桃β-actin基因(accession no.FJ560908)作為內(nèi)參,參照Ultra SYBR mixture with Rox試劑盒(康為)說明書,利用ABI7500型熒光定量PCR儀進(jìn)行擴(kuò)增。qRT-PCR反應(yīng)條件:95℃變性10 min;95℃變性15 s,55℃退火1 min,72℃延伸40 s,40個循環(huán)?;蛳鄬Ρ磉_(dá)量根據(jù)2-ΔΔCt方法計算。
以甜櫻桃砧木‘Gisela 6’葉片提取RNA反轉(zhuǎn)錄合成的cDNA為模板,以PcWRKY71-F和Pc-WRKY71-R為引物擴(kuò)增獲得約1 000 bp大小的目的片段,經(jīng)測序分析,該片段大小為1 095 bp。經(jīng)NCBI的ORF Finder分析表明,PcWRKY71基因起始密碼子為ATG,終止密碼子為TGA,開放閱讀框為1 014 bp,編碼氨基酸337個(圖1)。通過核苷酸序列分析發(fā)現(xiàn)PcWRKY71有1個WRKY保守結(jié)構(gòu)域和1個C2H2的鋅指基序(圖1),表明其屬于WRKY家族第Ⅱ類成員。Prot-Param軟件分析結(jié)果表明,PcWRKY71編碼蛋白分子量為37.41 kDa,理論等電點為6.72,不穩(wěn)定系數(shù)為57.13,屬于不穩(wěn)定蛋白;親水性平均數(shù)(GRAVY)為-0.960,表明該蛋白親水性氨基酸的數(shù)量高于疏水性氨基酸數(shù)量,預(yù)測該蛋白為親水性蛋白。經(jīng)Plant-mPLoc軟件預(yù)測,PcWRKY71定位在細(xì)胞核上。
圖1 PcWRKY71基因的cDNA序列及預(yù)測的氨基酸序列
利用NCBI的BLAST程序進(jìn)行序列比對,Pc-WRKY71基因序列與梅(XP_008225356)、碧桃(XP_007214251)、蘋果(XP_008383508)和白梨(XP_009353824)的WRKY71基因的核苷酸序列相似性分別為96%、94%、76%和75%。綜上,分離得到的cDNA序列是甜櫻桃砧木‘Gisela 6’的WRKY71基因,GenBank登錄號為MG450655。
為了分析PcWRKY71蛋白與其它植物同源蛋白的進(jìn)化關(guān)系,在NCBI下載甜櫻桃、櫻花、梅、扁桃、碧桃、蘋果、白梨、野草莓、可可、陸地棉和野茶樹的WRKY71蛋白序列,通過MEGA 7.0構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果表明,甜櫻桃砧木與甜櫻桃和櫻花親緣關(guān)系最近,與陸地棉和野草莓親緣關(guān)系較遠(yuǎn)(圖2)。
圖2 PcWRKY71轉(zhuǎn)錄因子與其他植物的WRKY71轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列的進(jìn)化樹分析
為探究PcWRKY71是否參與甜櫻桃砧木對干旱、鹽害和低溫脅迫的響應(yīng),利用qRT-PCR方法對其在不同逆境脅迫下的表達(dá)情況進(jìn)行分析,結(jié)果顯示,在甘露醇脅迫下,PcWRKY71基因的表達(dá)量在處理2 h開始升高,12 h達(dá)到最大值,之后下降,每一個時間點的表達(dá)量均高于未處理時(圖3)。NaCl脅迫后,PcWRKY71基因上調(diào)表達(dá),在處理2 h快速上升,48 h達(dá)到最大值(圖4)。4℃低溫脅迫2 h,PcWRKY71基因表達(dá)量開始升高,6 h時表達(dá)量低于對照(0 h),24 h表達(dá)量達(dá)到最大值(圖5)。表明干旱、鹽和低溫脅迫均能誘導(dǎo)Pc-WRKY71表達(dá),尤其受甘露醇和NaCl脅迫誘導(dǎo)明顯。
圖3 200 mmol/L甘露醇處理下PcWRKY71基因的表達(dá)
圖4 200 mmol/L NaCl處理下PcWRKY71基因的表達(dá)
圖5 4℃低溫處理下PcWRKY71基因的表達(dá)
SA和MeJA是植物防御病原菌侵染的兩個重要信號分子。為了明確PcWRKY71基因表達(dá)是否受激素影響,我們分析了SA和MeJA處理下PcWRKY71的表達(dá)量變化,結(jié)果顯示,在SA處理48 h內(nèi),PcWRKY71基因表達(dá)量逐漸增加,但均低于對照(0 h),說明SA對PcWRKY71具有負(fù)調(diào)控作用(圖6);MeJA處理對PcWRKY71表達(dá)具有正調(diào)控作用,表達(dá)量均高于對照(0 h),且在處理48 h內(nèi)先上升后下降,在處理6 h達(dá)到最大值(圖7)。
圖6 150 mmol/L水楊酸處理下PcWRKY71基因的表達(dá)
圖7 200 mmol/L茉莉酸甲酯處理下PcWRKY71基因的表達(dá)
WRKY71作為WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族的一員,在調(diào)控植物生長發(fā)育和逆境脅迫等方面具有重要功能[16,20,24]。本研究從甜櫻桃砧木中克隆得到PcWRKY71基因,其編碼的蛋白具有典型的WRKY結(jié)構(gòu)域WRKYGQK,屬于第Ⅱ類WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族,預(yù)測是一個不穩(wěn)定的親水性蛋白,亞細(xì)胞定位于細(xì)胞核上,這與水稻和香蕉的WRKY71轉(zhuǎn)錄因子的核定位結(jié)果一致,說明它可能在細(xì)胞核中起作用[25,26]。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示甜櫻桃砧木與甜櫻桃和櫻花的親緣關(guān)系最近,與其都屬于薔薇科櫻亞屬一致。
WRKY轉(zhuǎn)錄因子是植物對脅迫反應(yīng)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的重要組成部分。在水稻中OsWRKY71特異受冷脅迫誘導(dǎo),正向調(diào)控水稻的抗寒性,但不受ABA、鹽、干旱處理的影響[19]。紅麻的HcWRKY71基因受鹽、干旱和重金屬鎘脅迫誘導(dǎo)表達(dá),轉(zhuǎn)Hc-WRKY71基因提高了轉(zhuǎn)基因擬南芥幼苗的耐鹽性[27]。我們對甜櫻桃砧木進(jìn)行干旱、鹽害和低溫脅迫處理,結(jié)果表明PcWRKY71表達(dá)受干旱和鹽脅迫上調(diào)表達(dá),對兩種脅迫的響應(yīng)模式基本一致,均在處理2 h開始上調(diào)表達(dá),分別在12、48 h表達(dá)量最高。PcWRKY71對低溫處理的響應(yīng)僅在處理6 h時下調(diào)表達(dá),其它時間均上調(diào)表達(dá)。因此推測PcWRKY71表達(dá)受多種非生物脅迫影響,但對不同脅迫的響應(yīng)程度不同。
通過低溫、脫水、鹽脅迫、ABA、H2O2、乙烯、SA和MeJA處理,香蕉幼苗中MusaWRKY71的表達(dá)顯著上調(diào),表明MusaWRKY71能響應(yīng)多種脅迫[26]。水稻的OsWRKY71能被SA、MeJA、ACC多種防御信號分子上調(diào),并在損傷和病原菌感染時上調(diào),表明OsWRKY71可能在水稻生物脅迫應(yīng)答中起作用[25]。為分析激素對PcWRKY71表達(dá)模式的影響,對甜櫻桃砧木進(jìn)行SA和MeJA處理,結(jié)果顯示SA處理顯著抑制了PcWRKY71表達(dá),這與在香蕉和水稻中的研究結(jié)果不同,說明不同物種中WRKY71基因?qū)に氐膽?yīng)答存在一定差異。MeJA處理后PcWRKY71上調(diào)表達(dá),處理6 h表達(dá)量達(dá)到最高值,說明PcWRKY71基因可能在植物MeJA介導(dǎo)的信號途徑中起正調(diào)控作用,這與WRKY71在香蕉和水稻中的研究結(jié)果一致。
綜上所述,本研究從甜櫻桃砧木中克隆了PcWRKY71轉(zhuǎn)錄因子序列,具有典型的WRKY結(jié)構(gòu)域,屬于第Ⅱ類WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族。Pc-WRKY71基因受干旱、鹽害和低溫等非生物脅迫誘導(dǎo)表達(dá),并受激素SA和MeJA影響。本研究結(jié)果可為進(jìn)一步揭示PcWRKY71基因的功能以及研究其在調(diào)節(jié)櫻桃抗逆性和響應(yīng)植物激素過程中的作用提供參考。