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        環(huán)丙烷二酰胺類雜合藥物的設(shè)計與合成

        2023-03-04 12:29:28賈一多李爽張尹萌祁夢瑤祝宏
        當(dāng)代化工研究 2023年3期
        關(guān)鍵詞:結(jié)構(gòu)

        *賈一多 李爽 張尹萌 祁夢瑤 祝宏

        (武漢工程大學(xué) 化工與制藥學(xué)院 新型反應(yīng)器與綠色化學(xué)工藝湖北省重點實驗室 湖北 430205)

        本論文以抗腫瘤藥物卡博替尼和一些報道活性較好的化合物中間體4[1]為先導(dǎo)化合物,在文獻的調(diào)研過程中[2],基于卡博替尼,我們采用以下設(shè)計思路,如圖1,留環(huán)丙二酰胺結(jié)構(gòu)維持原有的五原子鏈長,對氟苯胺結(jié)構(gòu)完全保留,用嘧啶環(huán)代替喹啉環(huán),在此基礎(chǔ)上,將嘧啶環(huán)上引入不同的芳香取代基,可以增加化合物的抗腫瘤效果,因此,在查閱大量參考文獻后[3-6],我們選擇了九個藥物分子4a~4i,在第一部分與中間體4進行雜合。我們將卡博替尼結(jié)構(gòu)中的喹啉結(jié)構(gòu)替換為結(jié)構(gòu)多樣的芳基磺酰胺、芳酰胺、芳雜環(huán)、飽和雜環(huán)和芳醛等藥效分子,通過計算機Sybyl軟件進行分子篩選,從9個化合物中得到了打分最好的6個化合物,即5a~5f,其打分結(jié)果均比卡博替尼的分值高,見表1,分子對接使用的c-Met蛋白的晶體結(jié)構(gòu)來源于PDB數(shù)據(jù)庫,晶體結(jié)構(gòu)的ID為:c-Met的3LQ8和4MXC。打分結(jié)果用Total-Score表示[7]。研究表明[8-9],該類化合物對酪氨酸蛋白激酶受體(c-Met)具有潛在的抑制活性。對目標化合物5a~5f進行逆合成分析后,本研究擬定了如圖2所示的合成路線。

        圖1 c-Met抑制劑的設(shè)計

        圖2 合成路線

        表1 設(shè)計化合物的對接打分結(jié)果

        續(xù)表

        1.材料

        (1)儀器。OPM100型熔點儀(上海恰森儀器有限公司);FT-MS高分辨質(zhì)譜儀(賽默飛世爾科技公司);400/54Premium Shielded核磁共振波譜儀(德國Bruker公司)(CDCl3或DMSO-d6為溶劑,TMS為內(nèi)標)。

        (2)藥品?;前反柞bc(98%),上海麥克林生化科技有限公司;2-氨基-5-硝基噻唑(98%),上海畢得醫(yī)藥科技有限公司;磺胺甲惡唑(98%),上海畢得醫(yī)藥科技有限公司;3,5-二甲基哌啶(98%),阿拉丁試劑(上海)有限公司;香蘭素(98%),上海麥克林生化科技有限公司;硅膠,200~300目,青島海洋化工有限公司;其余所用試劑均為分析純或化學(xué)純。中間體2參考文獻[10]方法制備;中間體3,4參考文獻[11]方法制備。

        2.方法與結(jié)果

        (1)目標化合物的制備方法

        ①5a~5f的制備(以5a為例)

        在反應(yīng)瓶中加入中間體3(0.426mg,1.00mmol),4a(214mg,1.00mmol)和DMF 10mL,攪拌使其溶解;加入無水碳酸銫(0.652g,2.00mmol),氮氣保護下于70℃反應(yīng)12h。冷卻至室溫,將反應(yīng)液過濾,濾液滴加至100mL冰水中,緩慢加入數(shù)滴1mol/L稀鹽酸,直至開始出現(xiàn)沉淀,攪拌逐漸沉淀,過濾,濾餅用蒸餾水洗滌至中性和干燥。減壓濃縮后經(jīng)硅膠柱層析[洗脫劑:二氯甲烷/甲醇=80/1,V/V]分離純化,得黃色固體423.1mg。

        用類似的方法合成5b~5f。

        (2)抗腫瘤活性測試方法

        5-FU是一般化學(xué)療法,與卡博替尼相比更具有普遍性,因而,我們以5-FU為陽性對照,采用MTT法[9],針對打分結(jié)果較好的六個化合物,進行了人肝癌細胞(HepG2)的體外抑制活性實驗。

        (3)結(jié)果

        ①合成。以1,1-環(huán)丙烷二甲酸為原料,經(jīng)過?;陀H核取代等反應(yīng),合成出一系列中間體,在中間體3的合成過程中,有兩個反應(yīng)位點,即氨基和酚羥基,在EDCI和HOBT的催化反應(yīng)下,經(jīng)過茚三酮反應(yīng),發(fā)現(xiàn)不存在伯胺,核磁和質(zhì)譜的印證下,得到中間體4,我們將中間體4結(jié)構(gòu)中的嘧啶結(jié)構(gòu)替換為結(jié)構(gòu)多樣的芳基磺酰胺、芳酰胺、芳雜環(huán)、飽和雜環(huán)和芳醛等藥效分子,分別與磺胺醋酰、2-氨基-5-硝基噻唑、磺胺甲惡唑、3,5-二甲基哌啶和香蘭素這五種藥效團對接合成,得到終產(chǎn)物5a~5e,在合成以上化合物的過程中,發(fā)現(xiàn)副產(chǎn)物5f的抗腫瘤效果很好,因而獲得了5a~5f六類化合物。

        ②分子-靶蛋白的相互作用。參考文獻[12],圖3為5a~5f的分子-靶蛋白作用圖情況,由圖2可見,在與c-Met靶蛋白(3LQ8和4MXC)的對接中,與中間體4和卡博替尼相比,5b與ASP1228殘基發(fā)生Π-陰離子相互作用并且與ASN1167發(fā)生陽離子-Π的相互作用,5f與更多殘基發(fā)生了相互作用,5f上3,5-二甲基哌啶存在有多個烷基化作用。5e與ALA1108和ILE1084發(fā)生Π-烷基化相互作用,與ASP1228發(fā)生Π-陰離子相互作用,5e的鏈長延長,致使其與靶點的相互作用更強。有助于提升抗腫瘤細胞活性,使用嘧啶環(huán)取代喹啉環(huán),有助于增強化合物與靶點的疏水作用。而卡博替尼在與氨基酸殘基作用時的作用力,以氫鍵和范德華力為主。相互作用力較弱,容易斷裂。

        圖3 分子-靶蛋白相互作用圖

        ③抗腫瘤活性。5a~5f的體外肝癌的抑制活性見表2,由表2可見,所有化合物對腫瘤細胞均具有抑制活性,其中,抑制活性較差的化合物5a、5c和5d濃度大于0.02mmol·L-1時,抑制率大于31%,相較之下,抑制活性較好的化合物5b、5e和5f濃度大于5μmol·L-1時,5f、5b和5e對人肝腫瘤細胞(HepG2)的抑制率均大于60%,優(yōu)于陽性對照藥物5-FU。該結(jié)果與分子對接預(yù)測打分一致,具有進一步的研究價值。

        表2 化合物5a~5f的體外抗腫瘤活性

        3.結(jié)論

        本實驗設(shè)計并合成了6個結(jié)構(gòu)新穎且靶向于c-Met受體的環(huán)丙烷二酰胺類雜合藥物(CPDAs),經(jīng)計算機輔助藥物設(shè)計驗證了其合理性。我們對合成的六個化合物進行了生物活性測試,以5-FU為陽性對照,采用MTT法測試目標化合物體外對肝腫瘤細胞(HepG2)的抑制活性。結(jié)果表明,濃度為2.5μg·L-1時,5b、5e和5f對腫瘤細胞的抑制率分別為(60.98±0.78)%、(63.12±3.06)%和(66.16±1.08)%,是陽性對照藥物5-FU的三倍,而卡博替尼的IC50為17.034μg·L-1,明顯優(yōu)于卡博替尼[13-14]。隨著現(xiàn)代科學(xué)的迅猛發(fā)展,腫瘤化學(xué)治療藥物已有很大進步,我們通過分子對接預(yù)測了化合物5a~5f對目標靶點的對接效果,但是還需要進一步的生物活性研究。

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