張彩霞,劉新年,杜川,王新衛(wèi)
耶氏肺孢子菌肺炎(Pneumocystis jirovecii pneumonia,PJP)是由耶氏肺孢子菌(Pneumocystis jirovecii,PJ)引起的人類呼吸系統(tǒng)機會性感染,多發(fā)生于免疫功能低下者。由于PJ不能在體外培養(yǎng)基生長,故目前確診PJP仍是通過染色鏡檢發(fā)現(xiàn)呼吸道標本特征性的包囊或滋養(yǎng)體為主,但傳統(tǒng)的染色方法靈敏度不高,使得大部分PJP患者不能得以準確、快速確診[1]。因此,還需結(jié)合臨床表現(xiàn)以及其他檢測方法。目前,多項研究顯示血清1,3-β-D葡聚糖定量檢測(G試驗)[2-6]可輔助診斷PJP,且數(shù)值的高低可鑒別PJ定植和感染,數(shù)值越高,感染可能性越大,但鑒別二者的截斷值尚無定論。另外,隨著宏基因組二代測序(metagenomic next generation sequencing,mNGS)技術(shù)興起,由于該技術(shù)具有廣覆蓋、迅速高敏、無偏倚性的特點,已被廣泛應(yīng)用于疑難、危重、特殊病原體檢測[7-9]及感染性疾病診斷中[10-12],因此提高了PJP的診斷率。盡管mNGS應(yīng)用前景廣闊,但仍存在無法明確背景菌、污染菌、定植菌、致病菌等情況,尤其PJ可以共生或以正常菌群的形式定植于人體呼吸道,故當mNGS檢出PJ序列時,那么其是定植還是感染呢?其有無合適的截斷值予以判斷呢?本研究擬通過比較PJ感染者與定植者的臨床特點以及血清G試驗、肺泡灌洗液mNGS序列數(shù)的差異,從而探討肺泡灌洗液mNGS技術(shù)、血清G試驗在判斷PJ感染與定植中的價值以及二者相關(guān)性。
1.1 一般資料 對2018年9月至2022年5月在江漢大學附屬湖北省第三人民醫(yī)院收治住院治療且行肺泡灌洗液mNGS技術(shù)檢出PJ序列數(shù)的40例肺部感染患者的病例資料進行回顧性分析。根據(jù)mNGS檢出PJ是否抗PJ治療分為兩組:PJ感染組(mNGS檢出PJ,抗PJ治療有效者)21例,PJ定植組(mNGS檢出PJ,未抗PJ治療好轉(zhuǎn)出院者)19例。PJP診斷標準:(1)臨床表現(xiàn)為咳嗽、發(fā)熱、呼吸困難、進行性缺氧等;(2)影像學表現(xiàn)為多發(fā)性結(jié)節(jié)、多發(fā)斑片影或?qū)嵶冇啊⒛ゲA痈淖兓蚍伍g質(zhì)彌漫浸潤病變等;(3)mNGS檢出PJ序列;(4)由兩位及以上具有高級職稱且經(jīng)驗豐富的醫(yī)生共同診斷;(5)抗PJ治療有效。兩組排除標準:(1)年齡<18歲;(2)無肺部感染及病原學證據(jù);(3)mNGS前行經(jīng)驗性抗PJ治療者;(4)肺部真菌感染者,嚴重心臟疾病及嚴重心律失常者,近1個月發(fā)生心腦血管事件者,嚴重精神心理性疾病及無行為能力不能配合完成肺泡灌洗液mNGS檢查者等;(5)臨床資料不完整;(6)后期隨訪不符合診斷者。本研究通過江漢大學附屬湖北省第三人民醫(yī)院倫理委員會審批(2022倫審科第009號)。
1.2 方法
1.2.1 臨床資料 收集患者一般資料包括性別、年齡、體質(zhì)指數(shù)(BMI)、吸煙史(定義:近1年內(nèi)平均至少吸煙1支/d)、基礎(chǔ)疾病及用藥史〔慢性腎臟疾病、血液系統(tǒng)疾病、自身免疫性疾病、惡性腫瘤、人類免疫缺陷病毒(HIV)感染、實體器官移植、慢性肺部疾病、糖皮質(zhì)激素/免疫抑制劑使用情況〕,臨床癥狀(發(fā)熱、咳嗽、咳痰、呼吸困難、胸痛、咯血),影像學特點(磨玻璃滲出影、間質(zhì)改變、實變、結(jié)節(jié)、胸腔積液、囊狀),實驗室指標〔白細胞計數(shù)、中性粒細胞計數(shù)、淋巴細胞計數(shù)、降鈣素原(PCT)、C反應(yīng)蛋白(CRP)、乳酸脫氫酶(LDH),動脈血氧分壓/吸入氧濃度百分比(PaO2/FiO2)、CD4+T淋巴細胞計數(shù)〕,進行血清G試驗、半乳甘露聚糖檢測(GM試驗,用于鑒別真菌感染患者)。
1.2.2 支氣管肺泡灌洗液采集 患者禁水、禁食4 h,2%利多卡因噴霧局部麻醉咽部和鼻腔后,在olympusBF-260型電子支氣管鏡下采集支氣管肺泡灌洗液,按《肺部感染性疾病支氣管肺泡灌洗病原體檢測中國專家共識(2017年版)》[13]進行操作,嚴格遵守無菌原則,灌洗部位根據(jù)胸部影像學確定,病變局限者選擇病變段,彌漫性病變者選擇右肺中葉或左肺上葉舌段。當支氣管鏡到達目標支氣管段或亞段后,將頂端嵌頓在入口處,經(jīng)操作孔道快速注入37℃ 0.9%氯化鈉溶液,總量60~120 ml,分次注入(20~50 m1/次),注入后立即以100 mm Hg(1 mm Hg=0.133 kPa)負壓抽吸,回收率40%~60%,回收的灌洗液裝入滅菌容器中,一份(≥10 ml)送檢進行常規(guī)細菌、真菌培養(yǎng),一份(≥5 ml)行mNGS檢測。
1.2.3 mNGS檢測方法 支氣管肺泡灌洗液干冰保存送至深圳華大基因(mNGS標本的采集、保存和運輸嚴格按照該公司標準化規(guī)范執(zhí)行)行mNGS檢測,對樣本中微生物核酸序列進行分析,與該公司病原數(shù)據(jù)庫進行比對,得出報告結(jié)果序列數(shù),從而對微生物進行鑒定。檢測過程包括:核酸提取、RNA逆轉(zhuǎn)錄、目標片段化、文庫構(gòu)建、上機測序(測序下機后去除低質(zhì)量和長度<35 bp的數(shù)據(jù)以獲得高質(zhì)量的數(shù)據(jù))、生物信息分析、報告解讀等。
1.3 統(tǒng)計學方法 采用SPSS 22.0統(tǒng)計軟件分析,符合正態(tài)分布的計量資料以(±s)表示,組間比較采用t檢驗;非正態(tài)分布的計量資料以M(P25,P75)表示,采用Mann-whitney U檢驗進行組間比較;計數(shù)資料以相對數(shù)表示,組間比較采用χ2檢驗、校正χ2檢驗或Fisher's確切概率法;采用受試者工作特征(receiver operating characteristic curve,ROC)曲線評估m(xù)NGS與血清G試驗判斷PJ感染與定植的價值,計算ROC曲線下面積(area under the curve,AUC)、靈敏度、特異度、最佳截斷值。采用Spearman秩相關(guān)分析mNGS與血清G試驗相關(guān)性。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
2.1 兩組患者一般資料、基礎(chǔ)疾病及用藥史比較 兩組性別、年齡、BMI、吸煙史、基礎(chǔ)疾病情況比較,差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05);PJ感染組糖皮質(zhì)激素/免疫抑制劑使用率較PJ定植組高,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),見表1。
表1 兩組患者一般資料、基礎(chǔ)疾病及用藥史比較Table 1 Comparison of general information,underlying diseases and medication history between two groups
2.2 臨床癥狀及影像學特點比較 PJ感染組與PJ定植組發(fā)熱、咳嗽、咳痰、呼吸困難、胸痛、咯血比例比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。PJ感染組磨玻璃滲出影、間質(zhì)改變比例高于PJ定植組,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05);兩組實變、結(jié)節(jié)、胸腔積液、囊狀比例比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),見表2。
表2 兩組患者臨床癥狀及影像學特點比較〔n(%)〕Table 2 Comparison of clinical symptoms and imaging characteristics between two groups
2.3 實驗室指標比較 兩組白細胞計數(shù)、中性粒細胞計數(shù)、淋巴細胞計數(shù)、PCT、CRP、LDH、PaO2/FiO2比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05);PJ感染組CD4+T淋巴細胞計數(shù)低于PJ定植組,血清G試驗、mNGS序列數(shù)高于PJ定植組,差異均有統(tǒng)計學意義(P<0.05,表3)。
表3 兩組患者實驗室指標比較Table 3 Comparison of laboratory indicators between two groups
2.4 mNGS序列數(shù)與血清G試驗鑒別PJ感染與定植的價值 mNGS序列數(shù)與血清G試驗鑒別PJ感染與定植的最佳截斷值分別為24個、106.7 ng/L,AUC分別為0.95、0.89,靈敏度分別為95.2%、76.2%,特異度分別為78.9%、89.5%(圖1、表4)。
表4 mNGS序列數(shù)與血清G試驗鑒別PJ感染與定植的價值Table 4 Value of the number of sequences of pneumocystis jirovecii detected by mNGS and serum G level measured by serum G test in differentiating pneumocystis jirovecii infection from colonization
圖1 mNGS序列數(shù)與血清G試驗鑒別感染與定植ROC曲線Figure 1 The ROC curve of the number of sequences of pneumocystis jirovecii detected by mNGS and serum G level measured by serum G test in differentiating pneumocystis jirovecii infection from colonization
2.5 血清G試驗與mNGS序列數(shù)相關(guān)性分析Spearman秩相關(guān)結(jié)果示mNGS檢出PJ序列數(shù)與血清G試驗水平呈正相關(guān)(rs=0.769,P<0.001,圖2)。
圖2 mNGS檢出PJ序列數(shù)與血清G試驗的相關(guān)性Figure 2 Correlation between the number of pneumocystis jirovecii sequences detected by mNGS and serum G level measured by serum G test
由于呼吸道PJ定植相當普遍[14-15],為避免臨床過度治療及延誤治療,識別定植與感染很重要。本回顧性研究通過比較PJ感染與定植不同之處,以期能為臨床鑒定感染與定植提供依據(jù)。
在一般資料、基礎(chǔ)疾病、用藥史方面,本研究發(fā)現(xiàn)19例PJ定植組和21例PJ感染組絕大多數(shù)來自免疫缺陷患者如HIV感染、血液系統(tǒng)疾病、惡性腫瘤、實體器官移植、自身免疫性疾病、長期使用糖皮質(zhì)激素/免疫抑制劑者等,部分來自慢性肺部疾病,另外定植組尚可見于免疫功能正常人群。因此,PJ感染或定植除需重點關(guān)注免疫抑制個體人群外,尚需關(guān)注慢性肺部疾病。BABIC-ERCEG 等[16]及LOWE等[17]的研究亦提示PJ感染或定植與慢性阻塞性肺疾病、肺囊性纖維化以及間質(zhì)性肺炎等多種呼吸系統(tǒng)疾病密切相關(guān)??梢?,慢性肺部疾病在PJ感染或定植中亦扮演一定角色。同時,本研究發(fā)現(xiàn)PJ感染組約52.4%患者接受過糖皮質(zhì)激素/免疫抑制劑治療,而PJ定植組19例中僅有1例使用過糖皮質(zhì)激素/免疫抑制劑,提示長期應(yīng)用此類藥物可能是PJ感染的高危因素。因此,當存在上述基礎(chǔ)疾病,尤其接受糖皮質(zhì)激素/免疫抑制劑治療的患者應(yīng)該警惕PJP的發(fā)生。
在臨床表現(xiàn)方面,本研究發(fā)現(xiàn)PJ感染組與定植組在臨床癥狀如發(fā)熱、咳嗽、咳痰、呼吸困難、胸痛、咯血等癥狀間并無明顯差異,提示通過臨床癥狀無法區(qū)分二者。近年來,臨床上常用肺部影像學改變、血液中CD4+T淋巴細胞計數(shù)、血清G試驗、LDH等[18-19]指標輔助診斷或預(yù)測PJP。本研究發(fā)現(xiàn)PJ感染組典型磨玻璃滲出影、間質(zhì)改變高于PJ定植組,但兩組影像學特點如實變、結(jié)節(jié)、胸腔積液、囊狀改變間比較無統(tǒng)計學差異。同時,本研究中兩組LDH并無差異性,與ESTEVES等[2]研究一致,提示靠LDH無法鑒別定植與感染,分析原因可能為LDH升高更多反映的是肺組織損傷的嚴重程度,不具特異性。但血清G試驗PJ感染組明顯高于定植組,與LIU等[20]研究一致,分析原因可能與當PJ感染后經(jīng)肺泡巨噬細胞吞噬、消化,1,3-β-D葡聚糖從胞壁中釋放入血有關(guān)。另本研究發(fā)現(xiàn)PJ感染組CD4+T淋巴細胞計數(shù)明顯低于定植組,幾乎所有PJP患者的外周血CD4+T淋巴細胞計數(shù)<200個/μl,而且發(fā)現(xiàn)此部分患者mNGS檢出PJ序列數(shù)明顯高于定植組。因此,對于某些免疫功能低下的患者,在治療過程中需密切監(jiān)測CD4+T淋巴細胞計數(shù),一旦CD4+T淋巴細胞數(shù)呈下降趨勢時,需警惕PJ感染,此時可結(jié)合影像學、血清G試驗、mNGS檢查來判斷。
鑒于多項研究[4-6]顯示血清G試驗對于診斷PJP以及判斷治療效果有一定的價值。而DAMIANI等[21]人發(fā)現(xiàn),實時熒光定量PCR可以根據(jù)PJ序列數(shù)不同來區(qū)分PJ感染或定植,但是序列數(shù)的臨界值很難確定?;诖耍欠窨梢愿鶕?jù)mNGS檢出PJ序列數(shù)及血清G試驗來區(qū)分PJ感染和定植呢,其鑒別二者的臨界值又如何呢。本研究以臨床最終診斷PJP感染與定植為“金標準”,發(fā)現(xiàn)mNGS序列數(shù)與血清G試驗鑒別感染與定植的最佳截斷值分別為24個、106.7 ng/L,AUC分別為0.95、0.89,靈敏度分別為95.2%、76.2%,特異度分別為78.9%、89.5%。同時,本研究分析了血清G試驗與mNGS檢出PJ序列數(shù)相關(guān)性,以期了解血清G試驗與PJ負荷是否相關(guān)。本研究發(fā)現(xiàn)mNGS檢出PJ序列數(shù)與血清G試驗水平呈正相關(guān),與JIANG等[22]研究一致,但與HELD等[23]和LIU等[20]的研究不同,他們認為血清G試驗與PJ負荷并不相關(guān)。分析造成差異的原因可能為:1,3-β-D葡聚糖并非PJ特異性標志物,且各研究間納入分組標準及樣本量不同。因此,本研究提示血清G試驗與mNGS除可以輔助診斷PJP外,尚可將PJ感染與定植區(qū)分,當血清G試驗水平≥106.7 ng/L、mNGS檢出PJ序列數(shù)≥24個時,診斷PJ感染價值較大,mNGS檢出PJ序列數(shù)與血清G試驗水平呈正相關(guān)。
PJ定植相當普遍,臨床上如何鑒別定植與感染是一大難題,本研究通過比較PJ感染者與定植者間臨床特點、血清G試驗、肺泡灌洗液mNGS序列數(shù)的差異,從而探索血清G試驗及肺泡灌洗液mNGS序列數(shù)判斷PJ感染與定植的價值,并求得截斷值,為臨床判斷定植與感染提供了幫助,避免過度治療及延誤治療。但本研究亦存在一定局限性:(1)mNGS報告的解讀,尚無統(tǒng)一標準,盡管本研究嘗試了判斷PJ感染與定植的mNGS序列數(shù)截斷值,但由于受樣本量小的局限,未動態(tài)監(jiān)測血清G試驗與mNGS中PJ序列數(shù)變化以了解其對評估治療療效有無價值。今后需擴大樣本量,進行多中心前瞻性研究進一步驗證。(2)對于判斷PJ感染與定植,無標準的診斷參數(shù),本研究以是否抗PJ治療有效且經(jīng)隨訪確認,故可能存在一定選擇偏倚。
綜上,考慮鑒別PJ感染與定植的模型可能包含:(1)免疫缺陷,尤其糖皮質(zhì)激素/免疫抑制劑使用;(2)影像學表現(xiàn)為典型磨玻璃滲出影、間質(zhì)改變;(3)外周血CD4+T淋巴細胞計數(shù)降低,尤其<200個/μl;(4)血清G試驗升高;(5)mNGS檢出PJ序列數(shù)。血清G試驗及mNGS檢出PJ序列數(shù)數(shù)值越高,感染可能性越大,血清G試驗與PJ負荷呈正相關(guān)。今后研究方向:擴大樣本量,動態(tài)監(jiān)測血清G試驗與mNGS中PJ序列數(shù)變化,了解其對評估治療療效有無價值。
作者貢獻:張彩霞進行文章的構(gòu)思與設(shè)計,文章的可行性分析,文獻及資料收集、整理,撰寫論文;劉新年進行論文的修訂;杜川協(xié)助采集數(shù)據(jù)、分析數(shù)據(jù);王新衛(wèi)負責文章的質(zhì)量控制及審校,技術(shù)支持,對文章整體負責。
本文無利益沖突。