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        基于生物信息學(xué)及分子動(dòng)力學(xué)探討牛膝影響鐵死亡治療骨質(zhì)疏松機(jī)制

        2023-02-17 03:13:40肖劍偉蔡旭郭粉蓮黃新民汪榮盛
        特產(chǎn)研究 2023年1期

        肖劍偉,蔡旭,郭粉蓮,黃新民,汪榮盛

        (1.深圳市福田區(qū)風(fēng)濕病專(zhuān)科醫(yī)院風(fēng)濕免疫科,廣東 深圳 518000;2.上海市光華中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院風(fēng)濕免疫科,上海 200052)

        骨質(zhì)疏松癥(Osteoporosis,OP)被定義為一種全身性骨骼疾病,其特征是骨量、強(qiáng)度和微結(jié)構(gòu)的系統(tǒng)性損害,從而增加了脆性骨折的發(fā)生率[1]。調(diào)查顯示,我國(guó)絕經(jīng)后的女性,OP的患病率為48%[2]。骨質(zhì)疏松癥的治療方式包括生活方式措施和藥物治療。生活方式包括改變飲食結(jié)構(gòu)、補(bǔ)充礦物質(zhì)和鍛煉等。而藥物治療最常用的治療骨質(zhì)疏松癥的藥物包括雙膦酸鹽、阿侖膦酸鹽、唑來(lái)膦酸、地諾舒單抗和甲狀旁腺激素(PTH)衍生的藥物以及激素替代藥物等。然而,由于部分藥物存在較多不良反應(yīng)限制了藥物的長(zhǎng)期使用。

        鐵死亡是最近發(fā)現(xiàn)的一種非凋亡的與脂質(zhì)過(guò)氧化相關(guān)的細(xì)胞死亡的形式[3],大量研究顯示其參與了神經(jīng)系統(tǒng)、癌癥等疾病的發(fā)生發(fā)展過(guò)程[4,5]。對(duì)鐵死亡通路相關(guān)靶點(diǎn)的調(diào)控有望成為治療疾病的一種新策略。

        中藥中含有豐富的天然化合物,其在化學(xué)結(jié)構(gòu)和生物活性方面也表現(xiàn)出豐富的多樣性,并且毒性更小。因此,使用中藥治療骨質(zhì)疏松成為當(dāng)前研究熱點(diǎn)之一。在大量治療骨質(zhì)疏松的中藥中,牛膝味苦,性平,歸肝腎經(jīng),具有強(qiáng)筋骨、補(bǔ)肝腎等功效,十分適合治療以“腎虛”“脾虛”為病機(jī)的骨質(zhì)疏松。研究顯示,用牛膝提取物對(duì)去卵巢骨質(zhì)疏松大鼠治療后,治療組的骨密度(Bone mineral density,BMD)較對(duì)照組均有所提升,提示牛膝的活性成分能提升去勢(shì)大鼠的BMD[6]。而王艷等[7]的研究發(fā)現(xiàn),用牛膝治療去卵巢大鼠能夠抑制其骨量丟失,從而達(dá)到預(yù)防骨質(zhì)疏松的目的。以上結(jié)果顯示,牛膝具有的抗OP的療效,然而其具體機(jī)制尚需進(jìn)一步明確。

        本研究以生物信息學(xué)為基礎(chǔ),篩選出與OP發(fā)病及鐵死亡相關(guān)的關(guān)鍵基因并進(jìn)行試驗(yàn)驗(yàn)證,同時(shí)結(jié)合分子對(duì)接和分子動(dòng)力學(xué)探討牛膝通過(guò)影響鐵死亡治療OP的作用機(jī)制。

        1 材料與方法

        1.1 數(shù)據(jù)檢索及數(shù)據(jù)差異基因分析

        以“Osteoporosis”為關(guān)鍵詞,在GEO數(shù)據(jù)庫(kù)(www.ncbi.nlm.nih.gov/geo) 中檢索,檢索到GSE56116、GSE2208和GSE7158共3個(gè)數(shù)據(jù)集,見(jiàn)表1。使用R軟件(V 4.04)的limma包對(duì)編碼蛋白的mRNA進(jìn)行差異分析,取adjust P<0.05及|LogFC|值大于0.5。

        表1 GEO數(shù)據(jù)集Table 1 Details of the data set

        1.2 預(yù)測(cè)牛膝作用靶點(diǎn)

        通過(guò)中藥系統(tǒng)藥理學(xué)技術(shù)平臺(tái)(TCMSP)[8]檢索牛膝化學(xué)成分,將口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥40%及類(lèi)藥性(drug likeness,DL)≥0.18作為活性小分子化合物的篩選條件,將具有較高活性的化合物進(jìn)行篩選提取并將小分子化合物作用靶點(diǎn)轉(zhuǎn)化為基因名并使用Cytoscape 3.7.1軟件繪制“藥物化合物靶基因”相互作用網(wǎng)絡(luò)圖。

        1.3 鐵死亡相關(guān)基因及靶點(diǎn)獲取

        通過(guò)FerrDb數(shù)據(jù)庫(kù)(www.zhounan.org/ferrdb)[9],檢索鐵死亡相關(guān)基因。將上述結(jié)果與1.1、1.2步驟得到的靶點(diǎn)取交集,獲得牛膝影響OP鐵死亡途徑的潛在治療靶點(diǎn)并繪制韋恩圖。

        1.4 試驗(yàn)驗(yàn)證

        1.4.1 材料試驗(yàn)采用小鼠單核細(xì)胞RAW264.7細(xì)胞株購(gòu)自深圳市豪地華拓生物科技有限公司。ALOX12一抗(Abcam,ab168384)和二抗、GPX4一抗和二抗(Abcam,ab125066);內(nèi)參-actin(CST,#4970)。瓊脂糖凝膠(Solarbio,P1200)。BioTraceTMNT硝酸纖維素膜(Millipore,IPVH00010)。DMEM培養(yǎng)基、胎牛血清和胰蛋白酶(GIBCO,12430054、10100147、12605036);黃芩素(Sigma-Aldrich,491-67-8)、MTT試劑(Sigma-Aldrich,CT02)、二甲基亞砜(DMSO)(Sigma-Aldrich,C6164)、核因子-B受體活化因子配基(receptor activator of NF-B ligand,RANKL)(Sigma-Aldrich,207621-35-0)、巨噬細(xì)胞集落刺激因子(macrophagecolonystimulating factor,M-CSF)(Sigma-Aldrich,SRP3221)和青鏈霉素(sigma-Aldrich,P4333)。

        1.4.2 蛋白質(zhì)印跡法(Western blot,WB)檢測(cè)潛在治療靶點(diǎn)根據(jù)上述步驟得到的差異基因ALOX12,通過(guò)WB驗(yàn)證其在OP患者中的表達(dá)情況。選取福田區(qū)風(fēng)濕病專(zhuān)科醫(yī)院風(fēng)濕免疫科符合《中國(guó)老年骨質(zhì)疏松癥診療指南(2018)》OP診斷標(biāo)準(zhǔn),排除合并有惡性腫瘤、近6個(gè)月內(nèi)服用過(guò)激素類(lèi)藥物以及嚴(yán)重肝腎功能障礙的患者,共納入2020年4~6月確診的OP患者4例,其中男性2例、女性2例,年齡52~65歲,平均(58.8±5.4)歲。按照OP患者性別、年齡比例選擇4名深圳市福田區(qū)風(fēng)濕病專(zhuān)科區(qū)院體檢健康者作為對(duì)照組,其中男性2名、女性2名,年齡50~63歲,平均(57.3±5.9)歲。2組之間年齡差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=3.757,P=0.624)。本研究通過(guò)醫(yī)院倫理委員會(huì)審查(倫理審查編號(hào)FS202001012),研究對(duì)象均自愿參與,簽署知情協(xié)議書(shū)。ALOX12一抗和二抗(Abcam,ab168384);內(nèi)參-actin(CST,#4970)。瓊脂糖凝膠(Solarbio,P1200)。BioTraceTMNT硝酸纖維素膜為美國(guó)(Millipore,IPVH00010)產(chǎn)品。

        抽取靜脈血5 mL,樣本加入5 mL已經(jīng)混有苯甲基磺酰氟(PMSF)的蛋白裂解液(每1 mL裂解液加入10L PMSF)進(jìn)行蛋白定量。取適量的蛋白樣品上樣,進(jìn)行SDS變性10%聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE),室溫?fù)u動(dòng)封閉1 h。將膜按一抗蛋白和-actin蛋白的印跡位置剪開(kāi),置于含對(duì)應(yīng)一抗的Blotto溶液中,4℃搖動(dòng)作用過(guò)夜。TBST溶液中搖動(dòng)漂洗后加入二抗室溫作用,搖動(dòng)漂洗后將膜置于Western LightningTMChemiluminescence Reagent顯色劑中1 min。常規(guī)曝光后進(jìn)行顯影、定影處理。以-actin為內(nèi)參,使用Image J(V 1.8.0)軟件分析各條帶灰度值與內(nèi)參的灰度值比值作為目的蛋白的相對(duì)表達(dá)量。

        1.4.3 WB檢測(cè)黃芩素對(duì)RAW264.7細(xì)胞GPX4、ALOX12表達(dá)的影響RAW264.7細(xì)胞在含有100U/mL青霉素和100g/mL鏈霉素、10%FBS、10%M-CSF、10%RANKL的DMEM中培養(yǎng),并置于溫度為37℃、CO2濃度為5%的培養(yǎng)箱中。黃芩素用微量的DMSO溶液溶解,然后用DMEM培養(yǎng)基將黃芩素溶液稀釋至試驗(yàn)所需濃度,使DMSO的最終濃度不超0.1%。

        取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的RAW264.7細(xì)胞,常規(guī)消化收集細(xì)胞,計(jì)數(shù)并調(diào)整細(xì)胞密度至1 104個(gè)/孔,接種到96孔板中,當(dāng)細(xì)胞達(dá)到80%~90%融合度時(shí),根據(jù)既往文獻(xiàn)黃芩素體外使用配制濃度報(bào)告[10],將試驗(yàn)空白對(duì)照組及不同濃度的黃芩素組(5mol/L、10mol/L和20mol/L)處理48 h。

        收集上述各組細(xì)胞用裂解液提取細(xì)胞蛋白,進(jìn)行蛋白定量。取適量的蛋白樣品上樣,進(jìn)行SDS變性10%聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE),室溫?fù)u動(dòng)封閉1 h。將膜按一抗蛋白和-actin蛋白的印跡位置剪開(kāi),置于含對(duì)應(yīng)一抗的Blotto溶液中,4℃搖動(dòng)作用過(guò)夜。TBST溶液中搖動(dòng)漂洗后加入二抗室溫作用,搖動(dòng)漂洗后將膜置于WesternLightningTMChemiluminescence Reagent顯色劑中1 min。常規(guī)曝光后進(jìn)行顯影、定影處理。以-actin為內(nèi)參,使用Image J軟件分析計(jì)算GPX4及ALOX12蛋白的相對(duì)表達(dá)。

        1.5 分子對(duì)接

        明確ALOX12在OP患者中的表達(dá)情況后,通過(guò)RCSB網(wǎng)站檢索得到靶點(diǎn)的晶體結(jié)構(gòu),Pubchem數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取中藥活性小分子結(jié)構(gòu),使用AutoDock Vina對(duì)蛋白及小分子進(jìn)行半柔性對(duì)接,選取結(jié)合能最小的結(jié)果作為最佳配體。

        1.6 分子動(dòng)力學(xué)

        使用Gromacs進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬[11]。通過(guò)ATB網(wǎng)站(atb.uq.edu.au/)[12]生成配體小分子位置限制文件。通過(guò)Gromacs內(nèi)置命令將小分子及靶蛋白轉(zhuǎn)換為拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)文件。使用Gromos54a7_atb力場(chǎng)及SPC水分子模型,創(chuàng)建大小為1.2的十二面體水盒子并加入6個(gè)鈉離子來(lái)中和系統(tǒng)電荷。采用最速下降法使系統(tǒng)能量最小化。使用V-rescale進(jìn)行步長(zhǎng)為2 fs,總時(shí)間長(zhǎng)為100 ps的NVT系綜平衡,然后使用Berendsen算法在1 atm壓力下進(jìn)行100 ps的NPT系綜平衡。對(duì)蛋白質(zhì)中的重原子(非氫原子)施加位置限制后進(jìn)行總時(shí)長(zhǎng)為20 ns的動(dòng)力學(xué)模擬,步長(zhǎng)設(shè)定為2 fs。根據(jù)模擬得到的結(jié)果在去除體系的周期性邊界后提取20 ns時(shí)的結(jié)構(gòu)作為最終復(fù)合物構(gòu)象。使用Gromacs內(nèi)置命令計(jì)算復(fù)合物的均方根偏差(rootmeansquaredeviation,RMSD)、溶劑可及表面(solvent accessible surface area,SASA)、蛋白回旋半徑(Gyrate,GR)和氫鍵。使用g_mmpbsa軟件處理GROMACS生成的結(jié)構(gòu)(.tpr)和軌跡(.xtc)文件,并計(jì)算小分子與蛋白的結(jié)合自由能[13]。使用VMD[14]、PyMOL[15]、LigPlot+軟件[16]對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行可視化處理。

        1.7 統(tǒng)計(jì)分析

        使用R軟件(V 4.04)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。臨床樣本的蛋白表達(dá)水平使用t檢驗(yàn)進(jìn)行比較。P<0.05具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 差異分析結(jié)果

        結(jié)果顯示與正常組對(duì)比,GSE56116有760個(gè)mRNA存在表達(dá)差異,其中上調(diào)295個(gè),下調(diào)465個(gè);GSE2208有114個(gè)mRNA存在表達(dá)差異,其中上調(diào)78個(gè),下調(diào)36個(gè);GSE7158有276個(gè)mRNA存在表達(dá)差異,其中上調(diào)152個(gè),下調(diào)124個(gè)。

        2.2 牛膝作用靶點(diǎn)

        經(jīng)過(guò)篩選后得到牛膝有效成分9個(gè)。9個(gè)有效成分的作用靶點(diǎn)共106個(gè),將其轉(zhuǎn)化為官方基因名(Gene Symbol)。使用Cytoscape 3.7.1將藥物、化合物和靶基因繪制“藥物化合物靶基因”相互作用網(wǎng)絡(luò)圖,見(jiàn)圖1。該互作網(wǎng)絡(luò)包含了116個(gè)節(jié)點(diǎn)和222條邊。

        圖1 “藥物 化合物 靶基因”相互作用網(wǎng)絡(luò)圖Fig.1” Drug compound target gene” interaction network

        2.3 牛膝治療OP靶點(diǎn)

        根據(jù)1.3步驟獲得鐵死亡相關(guān)基因97個(gè),與2.1、2.2步驟所得結(jié)果取交集(圖2),得到潛在通過(guò)影響鐵死亡治療OP的的靶基因1個(gè)(ALOX12)。

        圖2 GSE56116、GSE22085、GSE7158、鐵死亡相關(guān)基因及牛膝作用靶基因交集的韋恩圖Fig.2 Venn diagram of intersection genes among the GSE56116,GSE22085,GSE7158,ferroptosis-associated genes and target genes of Achyranthes bidentata

        2.4 試驗(yàn)結(jié)果

        2.4.1 蛋白質(zhì)印跡法結(jié)果以-actin為內(nèi)參,在OP患者全血中,與對(duì)照組相比,ALOX12蛋白表達(dá)明顯上升(正常組:0.63±0.17,OP組:0.99±0.34,t=19.38,P<0.05),見(jiàn)圖3。

        圖3 WB結(jié)果顯示OP組患者的ALOX12蛋白表達(dá)水平升高Fig.3 WB results showed the levels of ALOX12 protein expression increased in the OP group

        2.4.2 黃芩素干預(yù)對(duì)RAW264.7細(xì)胞GPX4、ALOX12表達(dá)結(jié)果與對(duì)照組比較,不同濃度的黃芩素組RAW264.7細(xì)胞中ALOX12的蛋白表達(dá)水平明顯降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,見(jiàn)圖4。而GPX4蛋白表達(dá)無(wú)明顯差異,表明黃芩素能抑制RAW264.7細(xì)胞中ALOX12的表達(dá),而對(duì)GPX4蛋白表達(dá)無(wú)影響。

        圖4 不同濃度黃芩素處理后對(duì)RAW264.7細(xì)胞GPX4、ALOX12表達(dá)的影響(**<0.001)Fig.4 Effects of different concentrations of baicalein on the expression of GPX4 and ALOX12 in RAW264.7 cells(**<0.001)

        2.5 分子對(duì)接結(jié)果

        根據(jù)2.2及2.3步驟篩選得到小分子化合物黃芩素(baicalein)作用的靶點(diǎn)及鐵死亡相關(guān)基因ALOX12。分子對(duì)接結(jié)果顯示,黃芩素與ALOX12的Arg189、His365形成氫鍵,與Leu366、Thr396、Glu369、Asn400、Thr662、Leu193和Val190形成疏水鍵,提示黃芩素與ALOX12有較強(qiáng)的結(jié)合能力,可能通過(guò)與其結(jié)合后抑制ALOX12活性,見(jiàn)圖5 A。

        圖5 分子對(duì)接結(jié)果Fig.5 Molecular docking results

        2.6 分子動(dòng)力學(xué)模擬結(jié)果

        黃芩素與ALOX12的復(fù)合體在整個(gè)動(dòng)力學(xué)運(yùn)行過(guò)程中逐漸穩(wěn)定,RMSD波動(dòng)值小于0.1 nm(圖6 A)。復(fù)合物的溶劑可及表面呈逐漸縮小趨勢(shì)(圖6 B),復(fù)合物體系的蛋白回旋半徑(Rg)在模擬的過(guò)程中也逐漸縮?。▓D6 C),提示蛋白與小分子結(jié)合后蛋白逐漸收斂并使得結(jié)構(gòu)趨于穩(wěn)定。復(fù)合物體系氫鍵數(shù)量隨著模擬時(shí)間變化仍保持2個(gè)以上的連接(圖6 D),同時(shí),與模擬前結(jié)構(gòu),活性小分子對(duì)比位置無(wú)明顯變化,提示兩者結(jié)合穩(wěn)定(圖5 B)。

        圖6 蛋白小分子復(fù)合物體系的RMSD、SASA、RG和氫鍵數(shù)量Fig.6 RMSD,SASA,RG and number of hydrogen bonds of protein-small molecule complex systems

        結(jié)合能計(jì)算結(jié)果顯示,黃芩素與ALOX12的總結(jié)合自由能為(107.893kJ/mol±16.671kJ/mol)。結(jié)果顯示,黃芩素與ALOX12主要通過(guò)范德華力(154.481kJ/mol±10.798 kJ/mol)和靜電勢(shì)能(68.847 kJ/mol±11.810 kJ/mol),而極性溶劑化作用則對(duì)結(jié)合起抑制作用(101.368 kJ/mol±19.941 kJ/mol)。

        3 討論

        在骨質(zhì)疏松癥發(fā)病的各種原因中,骨穩(wěn)態(tài)的破壞是其發(fā)病的關(guān)鍵即由成骨細(xì)胞介導(dǎo)的骨形成減少和由破骨細(xì)胞驅(qū)動(dòng)的骨破壞增加,而鐵死亡在這個(gè)過(guò)程中發(fā)揮著重要的作用。鐵死亡的特征包括細(xì)胞內(nèi)鐵過(guò)載和活性氧類(lèi)(Reactive oxygen species,ROS)的大量堆積。而既往研究發(fā)現(xiàn),鐵過(guò)載和氧化應(yīng)激是骨質(zhì)疏松發(fā)病的重要因素之一,高度提示鐵死亡參與了骨質(zhì)疏松的發(fā)病過(guò)程。骨質(zhì)疏松癥患者存在明顯的鐵過(guò)載[17],其通過(guò)氧化應(yīng)激損傷促進(jìn)骨質(zhì)疏松癥的發(fā)生和發(fā)展[18]。研究顯示,鐵過(guò)載可影響成骨細(xì)胞的分化和活性[19],并且可以誘導(dǎo)成骨細(xì)胞的前體細(xì)胞骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞的自噬和凋亡[20,21],而使用降低鐵過(guò)載的藥物可以改善骨質(zhì)疏松情況[22]。在氧化應(yīng)激的狀態(tài)下,過(guò)載的ROS作為誘導(dǎo)鐵死亡模式啟動(dòng)的重要因素。ROS在大多數(shù)情況可以被機(jī)體內(nèi)抗氧化酶清除。鐵超載可通過(guò)Fenton反應(yīng)導(dǎo)致ROS形成增多[23]。ROS參與了成骨細(xì)胞的分化,過(guò)多ROS生成使正常的骨重建過(guò)程發(fā)生異常,使得骨形成減少而骨吸收增加,從而導(dǎo)致骨質(zhì)疏松[24,25],降低ROS水平能夠抑制破骨細(xì)胞分化[26]。另一個(gè)報(bào)道顯示[27],在去卵巢小鼠中,降低ROS水平可以抑制破骨細(xì)胞的產(chǎn)生從而阻止雌激素缺乏引起的骨質(zhì)疏松。試驗(yàn)顯示在卵巢切除術(shù)后小鼠中,Loureirin B可通過(guò)抑制ROS活性來(lái)抑制破骨細(xì)胞的產(chǎn)生從而防止小鼠的骨丟失,進(jìn)一步證實(shí)了ROS在骨質(zhì)疏松發(fā)病中的作用[28]。YANG等[29]發(fā)現(xiàn)內(nèi)皮細(xì)胞分泌的外泌體是細(xì)胞間通訊的重要介質(zhì),其通過(guò)抑制鐵蛋白吞噬作用依賴(lài)的鐵死亡,外泌體逆轉(zhuǎn)了糖皮質(zhì)激素誘導(dǎo)的成骨細(xì)胞對(duì)成骨的抑制作用。以上多個(gè)研究結(jié)果表明,鐵離子和氧化應(yīng)激在骨質(zhì)疏松過(guò)程中具有重要的作用。而由鐵介導(dǎo)的氧化應(yīng)激損傷導(dǎo)致的鐵死亡是近來(lái)新發(fā)現(xiàn)的細(xì)胞死亡形式,由鐵離子介導(dǎo)的鐵死亡可能導(dǎo)致骨質(zhì)疏松發(fā)生及病情進(jìn)展。調(diào)控鐵死亡相關(guān)的靶點(diǎn)有望成為治療骨質(zhì)疏松潛在手段。

        鐵死亡作為一種由鐵過(guò)載和脂質(zhì)過(guò)氧化驅(qū)動(dòng)的細(xì)胞死亡方式,其實(shí)質(zhì)是細(xì)胞內(nèi)脂質(zhì)氧化物出現(xiàn)代謝障礙,在鐵離子催化作用下發(fā)生代謝異常,導(dǎo)致脂質(zhì)過(guò)氧化從而誘導(dǎo)細(xì)胞死亡。鐵死亡有明顯區(qū)別于細(xì)胞凋亡的形態(tài)學(xué)特征,如線(xiàn)粒體膜破裂增加。脂質(zhì)過(guò)氧化作為一種自由基驅(qū)動(dòng)的反應(yīng),主要影響細(xì)胞膜中的不飽和脂肪酸。脂質(zhì)合成代謝失調(diào)會(huì)導(dǎo)致大量多不飽和脂肪酸積累,同時(shí)會(huì)消耗細(xì)胞內(nèi)的谷胱甘肽(GSH),導(dǎo)致更多的過(guò)氧化脂質(zhì)產(chǎn)生,從而提高了細(xì)胞對(duì)鐵死亡的敏感性。其中,多不飽和脂肪酸(PUFA)的氧化是由脂氧合酶(ALOXs)途徑介導(dǎo)的。LOXs是一種非血紅蛋白含鐵酶,主要功能是過(guò)氧化不飽和脂肪酸[30]。人類(lèi)LOX家族共有6個(gè)成員(ALXOE3、ALOX5、ALOX12B、ALXO12、ALOX15B和ALOX15)。在鐵死亡途徑中,鐵可以增加LOXs的活性,隨后LOXs通過(guò)介導(dǎo)PUFA過(guò)氧化產(chǎn)生花生四烯酸等,促進(jìn)鐵死亡。其中,ALOX12可以直接過(guò)氧化細(xì)胞膜上的磷脂形成磷脂過(guò)氧化物,然后在亞鐵離子的催化下,脂質(zhì)過(guò)氧化物與其他脂質(zhì)發(fā)生鏈?zhǔn)窖趸磻?yīng),導(dǎo)致鐵死亡的發(fā)生[31]。多個(gè)研究顯示,ALOX12的多態(tài)性與骨質(zhì)疏松發(fā)病呈正相關(guān)[32,33],提示ALOX12與骨質(zhì)疏松存在密切關(guān)系。一項(xiàng)研究顯示,黃芩素能夠與鐵結(jié)合,抑制血小板中ALOX12的表達(dá)[34]。Dai等[35]發(fā)現(xiàn),黃芩素能夠抑制ALOX12,減少鐵死亡,從而改善CCl4誘導(dǎo)的小鼠急性肝損傷。Bo Chu等[36]通過(guò)CRISPR/Cas9技術(shù)來(lái)生成敲除ALOX12的U2OS細(xì)胞的亞克隆,敲除了ALOX12基因的U2OS細(xì)胞鐵死亡受到抑制。由此可推斷,ALOX12是黃芩素的作用靶點(diǎn)之一,通過(guò)靶向ALOX12抑制其活性,可以影響鐵死亡過(guò)程,見(jiàn)圖7。

        圖7 牛膝治療OP的機(jī)制圖Fig.7 Mechanism diagram of Achyranthes bidentata for the treatment of OP

        祖國(guó)傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)根據(jù)OP的表現(xiàn)將其歸屬于“骨痹”、“骨痿”和“骨枯”等病范疇。腎藏精,精血養(yǎng)骨髓,髓枯則筋痿,腎虛能夠誘發(fā)骨質(zhì)疏松。從西醫(yī)學(xué)角度來(lái)看,骨髓干細(xì)胞能夠分化為成骨細(xì)胞及破骨細(xì)胞。鐵死亡會(huì)導(dǎo)致炎癥水平升高,產(chǎn)生的各種炎癥因子如腫瘤壞死因子-等,能夠抑制骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞成骨分化的生物效應(yīng),使骨形成減少導(dǎo)致骨量丟失,這與中醫(yī)腎虛導(dǎo)致的“骨枯”具有異曲同工之處。姚新苗認(rèn)為OP多屬本虛標(biāo)實(shí),本虛責(zé)于脾腎而標(biāo)實(shí)責(zé)于瘀血,在運(yùn)用補(bǔ)腎壯骨、健脾益氣治療的同時(shí)應(yīng)當(dāng)輔以活血化瘀之藥,常選用赤芍、川芎、丹參和牛膝等[37]。陳雯等歸納中藥治療骨質(zhì)疏松用藥頻次,活血化瘀藥作為重要治法,在活血兼有養(yǎng)血功能的中藥處方中,當(dāng)歸使用頻次為44次,骨碎補(bǔ)使用頻次為28次,牛膝使用頻次為26次,排在活血化瘀藥物的前三位[38],提示牛膝在治療OP中有著廣泛的應(yīng)用。現(xiàn)代研究證實(shí),牛膝及含有牛膝的復(fù)方藥物治療骨質(zhì)疏松療效明確,如含有牛膝的左歸丸、無(wú)敵丹膠囊具有滋陰補(bǔ)腎、填精益髓的作用,在臨床已被證實(shí)能夠改善OP患者癥狀[39,40]。牛膝含有大量的活性小分子成分,其中作為有效成分的黃芩素具有抗炎抗氧化作用[41]。研究顯示黃芩素可以抑制RANKL誘導(dǎo)的破骨細(xì)胞的形成以及抑制破骨細(xì)胞的骨吸收功能[10],提示黃芩素是治療骨質(zhì)疏松的潛在藥物分子。

        本研究顯示,在OP患者中,ALOX12蛋白表達(dá)較健康組明顯升高,提示其可能參與了OP的發(fā)病。作為牛膝有效成分之一的黃芩素,通過(guò)分子對(duì)接及分子動(dòng)力學(xué)結(jié)果顯示,其能通過(guò)多個(gè)氫鍵及疏水鍵與ALOX12緊密對(duì)接并形成穩(wěn)定結(jié)構(gòu)。在動(dòng)力學(xué)模擬過(guò)程中,整個(gè)復(fù)合物體系能夠快速收斂并達(dá)到穩(wěn)態(tài),說(shuō)明黃芩素能夠通過(guò)影響ALOX12蛋白的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性從而發(fā)揮抑制其活性的作用。試驗(yàn)結(jié)果顯示,不同濃度的黃芩素可以抑制RANKL誘導(dǎo)的RAW264.7細(xì)胞ALOX12蛋白的表達(dá),而不影響GPX4蛋白的表達(dá)。以上結(jié)果提示ALOX12可能作為牛膝治療OP的潛在靶點(diǎn),抑制ALOX12的活性,達(dá)到治療骨質(zhì)疏松的目的。

        綜上所述,本研究以生物信息學(xué)、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、分子對(duì)接及分子動(dòng)力學(xué)結(jié)合試驗(yàn)研究驗(yàn)證牛膝有效活性成分黃芩素可能通過(guò)靶向ALOX12影響OP鐵死亡途徑從而達(dá)到治療OP的作用,初步闡明了牛膝有效活性成分治療OP的潛在作用機(jī)制,為進(jìn)一步探討牛膝通過(guò)鐵死亡途徑治療OP提供了理論依據(jù)。然而,本研究的結(jié)果未通過(guò)動(dòng)物模型研究證實(shí),需要進(jìn)一步通過(guò)使用體內(nèi)外試驗(yàn)來(lái)驗(yàn)證。

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