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        洞庭湖和鄱陽(yáng)湖水體細(xì)菌空間分布特征及驅(qū)動(dòng)機(jī)制*

        2023-01-13 07:21:56馬沛明張俊芳周連鳳趙先富
        湖泊科學(xué) 2023年1期
        關(guān)鍵詞:藍(lán)細(xì)菌兩湖洞庭湖

        陳 威,馬沛明,張俊芳,楊 英,周連鳳,趙先富

        (1:水利部中國(guó)科學(xué)院水工程生態(tài)研究所, 水利部水工程生態(tài)效應(yīng)與生態(tài)修復(fù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 武漢430079) (2:長(zhǎng)江流域水生態(tài)監(jiān)測(cè)中心,武漢 430079)

        作為水生態(tài)系統(tǒng)中有機(jī)化合物的重要分解者之一,水體細(xì)菌在地球物質(zhì)化學(xué)循環(huán)中起到非常重要的作用[1]。水體細(xì)菌在直接或間接地參與大部分物質(zhì)和能量的循環(huán)過(guò)程中,其豐度和群落結(jié)構(gòu)對(duì)其功能發(fā)揮起到?jīng)Q定性作用。目前,在水生態(tài)監(jiān)測(cè)工作中,生物監(jiān)測(cè)對(duì)象主要為浮游動(dòng)植物、底棲動(dòng)物和著生藻類(lèi),針對(duì)微生物(細(xì)菌、真菌等)的運(yùn)用在國(guó)外有一些報(bào)道[2],但是在國(guó)內(nèi)還較少[3]。水環(huán)境監(jiān)測(cè)和評(píng)價(jià)的內(nèi)容是監(jiān)測(cè)物種或群落對(duì)環(huán)境變化的真實(shí)響應(yīng),并不包含空間結(jié)構(gòu)等隨機(jī)過(guò)程的影響。然而,水體細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)和動(dòng)態(tài)變化受多方面因素影響[4],因此,研究水體細(xì)菌的空間分布規(guī)律及群落構(gòu)建驅(qū)動(dòng)機(jī)制,摸清環(huán)境和空間對(duì)其群落組成影響的相對(duì)貢獻(xiàn),分離不同作用主導(dǎo)下的類(lèi)群,準(zhǔn)確篩選環(huán)境指示性物種或類(lèi)群,對(duì)廣泛地將水體細(xì)菌運(yùn)用于水生態(tài)監(jiān)測(cè)具有重要意義。

        生態(tài)學(xué)家們普遍認(rèn)為群落的分布機(jī)制受隨機(jī)性過(guò)程和確定性過(guò)程兩方面的共同影響,其影響的主次依據(jù)不同的生物類(lèi)群或其所處的不同生態(tài)系統(tǒng)而定[5]。隨機(jī)性過(guò)程主要與空間因子相關(guān),表征群落擴(kuò)散等作用方式;確定性過(guò)程主要與環(huán)境因子相關(guān),如水體理化和生境特征指標(biāo)[6],表征環(huán)境對(duì)特定物種的選擇作用。目前研究多關(guān)注細(xì)菌群落動(dòng)態(tài)變化[7-8]或其環(huán)境影響因子[9-11],如湖北梁子湖和后官湖浮游細(xì)菌研究表明,總氮、pH和總磷是其群落結(jié)構(gòu)的主要影響因子[8],忽視了空間因素對(duì)其分布格局和群落構(gòu)建機(jī)制的作用。然而研究表明,隨水流的擴(kuò)散作用是浮游生物類(lèi)群群落構(gòu)建的重要影響因素[12]。

        洞庭湖位于長(zhǎng)江中游,是我國(guó)第二大淡水湖,由于人類(lèi)活動(dòng)的影響,已經(jīng)明顯被分為東、西、南3 個(gè)湖區(qū)[13];鄱陽(yáng)湖位于長(zhǎng)江中下游,是我國(guó)第一大淡水湖泊,年內(nèi)水位落差巨大(變幅為 9.59~15.36 m)[14],兩者均為過(guò)水型淺水湖泊。與靜水型湖泊相比,過(guò)水型湖泊受單向水體流動(dòng)影響,水體細(xì)菌的分布受水體擴(kuò)散影響較為明顯,一定程度上可以減小環(huán)境對(duì)物種的選擇作用。因此,同期聯(lián)合調(diào)查洞庭湖和鄱陽(yáng)湖,比較兩湖在水體細(xì)菌組成和生境空間差異,全面了解湖泊生態(tài)系統(tǒng)中水體細(xì)菌空間分布特征和驅(qū)動(dòng)機(jī)制,對(duì)于更好地保護(hù)和修復(fù)湖泊生態(tài)環(huán)境具有深遠(yuǎn)的意義[10]。

        本研究擬從兩湖水體細(xì)菌群落組成、理化指標(biāo)和調(diào)查樣點(diǎn)空間關(guān)系的基礎(chǔ)上,探索過(guò)水型湖泊生態(tài)系統(tǒng)中水體細(xì)菌的空間分布特征及其影響因素,揭示水體細(xì)菌群落構(gòu)建內(nèi)在機(jī)理,為了解兩湖水生態(tài)系統(tǒng)的生物群落構(gòu)建及其健康管理提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 樣品采集與處理

        有研究認(rèn)為過(guò)水型湖泊存在對(duì)流性強(qiáng)的特點(diǎn),其富營(yíng)養(yǎng)化評(píng)估應(yīng)與河流一致,在流速不均勻的大型湖泊,還應(yīng)分區(qū)域進(jìn)行研究[15]。根據(jù)洞庭湖和鄱陽(yáng)湖過(guò)水型湖泊的特定,按其水流方向,將采樣點(diǎn)各分為上游(DU或PU)、中游(DM或PM)、下游(DD或PD)3組,其中洞庭湖分為DU(D01~12)、DM(D13~20,D28~30)、DD(D21~27,D31~33),鄱陽(yáng)湖分為PU(P06~08,P10~12)、PM(P09,P13~18)、PD(P01~05,P19~24),如圖1所示。

        圖1 洞庭湖(a)與鄱陽(yáng)湖(b)采樣點(diǎn)分布Fig.1 Distribution of sampling sites in Lake Dongting (a) and Lake Poyang (b)

        1.2 細(xì)菌DNA的提取和16S rRNA高通量測(cè)序

        兩湖水體微生物樣品全DNA的提取采用試劑盒(Axygen)的方法,通過(guò)1%凝膠電泳檢測(cè)提取效果,并使用Nanodrop(Nanodrop,美國(guó))測(cè)試其濃度,確保提取到足夠濃度的DNA。每個(gè)樣點(diǎn)分3個(gè)重復(fù)樣提取完后充分混合,后采用Hiseq 250平臺(tái)(深圳瑞奧康晨生物科技有限公司)進(jìn)行高通量測(cè)序。測(cè)序引物選用16S rRNA通用引物341F:5′-CCTAYGGGRBGCASCAG-3′和806R:5′-GGACTACNNGGGTATCTAAT-3′,PCR擴(kuò)增區(qū)域?yàn)樗w細(xì)菌16S rRNA基因V3-V4高變片段。

        1.3 數(shù)據(jù)分析

        對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行拼接、過(guò)濾等處理后得到有效OTUs(Operational taxonomic units)序列。將具有97%以上相似性的序列歸為一類(lèi),經(jīng)與Silva數(shù)據(jù)庫(kù)(V13.2)比對(duì)注釋后得到各位點(diǎn)的細(xì)菌種類(lèi)組成和豐度分布。通過(guò)對(duì)洞庭湖和鄱陽(yáng)湖共57個(gè)樣點(diǎn)的水體細(xì)菌16s r RNA V3~V4區(qū)進(jìn)行高通量測(cè)序檢測(cè)分析,經(jīng)注釋后檢測(cè)出OTU 序列27134~70515條,歸一化后為27134條,作進(jìn)一步分析用。

        本研究的環(huán)境數(shù)據(jù)可視化由R語(yǔ)言ggplot2包進(jìn)行,均值差異性檢驗(yàn)采用PERMANOVA方差檢驗(yàn);物種組成和多元分析在線(xiàn)(https://www.bioincloud.tech)完成;方差分解分析(Variation partitioning analysis,VPA)由vegan包進(jìn)行:首先,通過(guò)前向選擇(forward selection,adespatial包),篩選出對(duì)細(xì)菌群落影響顯著的環(huán)境因子;然后,基于鄰體矩陣主坐標(biāo)分析(principal coordinates of neighbor matrices,PCNM)計(jì)算采樣點(diǎn)之間的空間關(guān)系,同樣通過(guò)前向選擇篩選細(xì)菌群落潛在的空間影響因子;最后,通過(guò)vegan包的varpart函數(shù)對(duì)已篩選的環(huán)境因子和空間因子進(jìn)行方差分解分析;零模型分析通過(guò)picante包進(jìn)行:通過(guò)計(jì)算β最接近分類(lèi)指數(shù)(βNTI)和Raup-Crick指數(shù)(RC)對(duì)水體細(xì)菌群落的群落構(gòu)建過(guò)程進(jìn)行了分析。βNTI<-2的為同質(zhì)選擇,βNTI>2則為異質(zhì)選擇,|βNTI|≤2的部分均為隨機(jī)性過(guò)程,并依據(jù)RC的大小進(jìn)行分類(lèi):其中RC<0.95表示同質(zhì)擴(kuò)散,RC>0.95表示擴(kuò)散限制,|RC|≤0.95表示漂變。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 兩湖水質(zhì)特征

        圖2 洞庭湖和鄱陽(yáng)湖環(huán)境因子主成分分析Fig.2 PCA of environmental factors in Lake Dongting and Lake Poyang

        圖3 洞庭湖和鄱陽(yáng)湖環(huán)境因子Fig.3 Environmental factors in Lake Dongting and Lake Poyang

        2.2 兩湖水體細(xì)菌群落組成

        兩湖水體細(xì)菌一共檢測(cè)出20門(mén)(平均豐度低于0.1%的門(mén)歸為“其他”),其中洞庭湖優(yōu)勢(shì)的門(mén)類(lèi)有放線(xiàn)菌門(mén)(Acitinobacteria)、藍(lán)細(xì)菌門(mén)(Cyanobacteria)和變形菌門(mén)(Proteobacteria),D10~12位點(diǎn)變形菌門(mén)相對(duì)豐度較高,而D01、D18、D31~33位點(diǎn)擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes) 相對(duì)豐度較高;鄱陽(yáng)湖優(yōu)勢(shì)的門(mén)類(lèi)與洞庭湖相似,有放線(xiàn)菌門(mén)、藍(lán)細(xì)菌門(mén)和變形菌門(mén),其中P05號(hào)與P04位點(diǎn)距離近,但是其群落組成差別較大,P05位點(diǎn)壁厚菌門(mén)(Firmicutes)相對(duì)豐度高于其他位點(diǎn);在門(mén)水平上,洞庭湖和鄱陽(yáng)湖組不同位點(diǎn)之間差異較小,但是兩湖之間水體細(xì)菌組成存在一定差異(圖4)。

        圖4 洞庭湖(a)和鄱陽(yáng)湖(b)水體細(xì)菌門(mén)水平物種組成Fig.4 Bacteria community composition in Lake Dongting (a) and Lake Poyang (b)

        通過(guò)比較各組水體細(xì)菌組成在門(mén)水平上的相對(duì)豐度,可知洞庭湖上游組(DU)中放線(xiàn)菌門(mén)相對(duì)豐度較其他兩組高,而藍(lán)細(xì)菌門(mén)相對(duì)豐度較低;鄱陽(yáng)湖各組之間,水體細(xì)菌優(yōu)勢(shì)門(mén)相對(duì)豐度差異較小。水體細(xì)菌組成中,藍(lán)細(xì)菌門(mén)的種類(lèi)一直被廣泛關(guān)注,主要是因?yàn)樗{(lán)細(xì)菌在富營(yíng)養(yǎng)化水體中極易形成水華,危害水生態(tài)健康[13]。從兩湖內(nèi)部樣點(diǎn)群落組成比較來(lái)看,洞庭湖各樣點(diǎn)的藍(lán)細(xì)菌門(mén)相對(duì)豐度分布不均勻,各樣點(diǎn)平均相對(duì)豐度為18.76%,分布范圍為0.93%~51.31%,最高值出現(xiàn)在D29位點(diǎn)。具體分組上,在下游組(DD)樣點(diǎn)中相對(duì)豐度較低,平均為12.25%,上游組(DU)次之,平均為17.28%,在中游組(DM)最高,平均為32.84%;在鄱陽(yáng)湖中,藍(lán)細(xì)菌門(mén)在各樣點(diǎn)的相對(duì)豐度分布較為均勻,離長(zhǎng)江入口(湖口)距離較近的下游組(PD)樣點(diǎn)平均豐度最低,為16.02%,中游組(PM)樣點(diǎn)最高,為24.29%,上游組(PU)樣點(diǎn)處于中間水平,為20.81%,全湖各樣點(diǎn)均值為19.63%(圖5)。

        圖5 洞庭湖和鄱陽(yáng)湖各組水體細(xì)菌門(mén)水平物種組成Fig.5 Bacteria community composition of different groups in Lake Dongting and Lake Poyang

        2.3 兩湖水體細(xì)菌的空間分布格局及影響因素

        圖6 洞庭湖(DU、DM和DD)和鄱陽(yáng)湖(PU、PM和PD)水體細(xì)菌群落組成的冗余分析Fig.6 Similarity analysis of bacterioplankton community composition in Lake Dongting (DU, DM and DD) and Lake Poyang (PU, PM and PD)

        圖7 洞庭湖(a)和鄱陽(yáng)湖(b)水體細(xì)菌中藍(lán)細(xì)菌和其他類(lèi)群與環(huán)境因子之間的相關(guān)性Fig.7 The relationship (Mantel rest) between cyanobacteria and other bacterioplankton with environmental factors in Lake Dongting (a) and Lake Poyang (b)

        2.4 兩湖水體細(xì)菌的群落構(gòu)建機(jī)制

        采用方差分解的方法對(duì)環(huán)境因子和空間因子進(jìn)行分析,解析兩者對(duì)兩湖水體細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)形成的貢獻(xiàn)差異,推斷不同湖泊水體細(xì)菌群落的構(gòu)建機(jī)制[14]。結(jié)果表明:洞庭湖水體細(xì)菌群落影響因素中純環(huán)境因子解釋度為2.0%,純空間因子為15.0%,兩者共同解釋度為27.0%;而鄱陽(yáng)湖水體細(xì)菌群落影響因素中純環(huán)境因子解釋度為19.0%,空間因子為13.0%,兩者共同解釋度為6.0%(圖8)。零模型分析結(jié)果表明,隨機(jī)性過(guò)程是洞庭湖和鄱陽(yáng)湖水體細(xì)菌分布的主要作用方式,分別占58.5%和79.7%,主要由同質(zhì)擴(kuò)散和漂變組成,擴(kuò)散限制均為0;在兩湖中,確定性過(guò)程的作用占比低于隨機(jī)性過(guò)程,分別為41.5%和20.3%,由同質(zhì)選擇和異質(zhì)選擇組成,且占比差異較大,前者分別為36.8%和15.6%,而后者均低于5%,占比較小(圖8)。

        圖8 洞庭湖和鄱陽(yáng)湖水體細(xì)菌群落構(gòu)建方差分解和零模型分析Fig.8 Analysis of variation partitioning and null model analysis for the assembly mechanisms of planktonic bacterial communities in Lake Dongting and Lake Poyang

        3 討論

        本研究以水體細(xì)菌作為研究對(duì)象,同期調(diào)查洞庭湖和鄱陽(yáng)湖,獲取兩湖不同區(qū)域水體細(xì)菌組成和環(huán)境因子及空間因子數(shù)據(jù),運(yùn)用多元分析的方法探討水環(huán)境的空間異質(zhì)性、物種組成差異及影響因子,采用方差分解和零模型的方法分析水體細(xì)菌群落構(gòu)建的機(jī)制,加強(qiáng)了對(duì)過(guò)水型湖泊的生態(tài)過(guò)程的理解,同時(shí)也為湖泊生態(tài)健康的監(jiān)測(cè)和評(píng)價(jià)拓寬領(lǐng)域。

        3.1 兩湖水環(huán)境異質(zhì)性

        在本次調(diào)查期間,洞庭湖與鄱陽(yáng)湖在水環(huán)境條件上差異顯著,且鄱陽(yáng)湖內(nèi)部各樣點(diǎn)之間空間異質(zhì)性較洞庭湖更高。研究表明,高壩水庫(kù)中調(diào)水口的浮游植物豐度較其他位置低,且與其調(diào)水口流速和調(diào)水量呈顯著負(fù)相關(guān)[16],李哲等的研究同樣表明,三峽水庫(kù)季節(jié)性的調(diào)蓄變化導(dǎo)致的生境條件變化是藻類(lèi)生物多樣性改變的重要原因[17]。在本研究調(diào)查期間,洞庭湖和鄱陽(yáng)湖受上游河流來(lái)水和長(zhǎng)江干流水位變化的雙重影響,通過(guò)水位波動(dòng)對(duì)湖泊水生境和營(yíng)養(yǎng)狀態(tài)產(chǎn)生一定影響[18]。通過(guò)比較兩湖水環(huán)境參數(shù),洞庭湖水體營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)濃度較高、Chl.a濃度卻較低,可以推測(cè)其水體交換、流速等水動(dòng)力和擴(kuò)散條件較好,抑制了Chl.a的增長(zhǎng)。較好的擴(kuò)散條件使得TN、TP等營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)在各樣點(diǎn)之間分布更為均勻,因此,洞庭湖水環(huán)境異質(zhì)性較低,而鄱陽(yáng)湖水環(huán)境異質(zhì)性較高。

        3.2 兩湖水體細(xì)菌群落組成的空間分布格局及影響因子

        藍(lán)細(xì)菌已成為目前世界范圍內(nèi)湖泊生態(tài)環(huán)境的重要威脅對(duì)象,在條件適宜時(shí),極易發(fā)生水華等危害水生態(tài)健康的事件[19-21]。目前,除較為常見(jiàn)的微囊藻水華外[22-24],魚(yú)腥藻[25]、氣絲藻[26]等水華也逐漸在鄱陽(yáng)湖不同區(qū)域暴發(fā)。鄱陽(yáng)湖第二次科考結(jié)果顯示,部分湖區(qū)已經(jīng)出現(xiàn)了明顯的水華現(xiàn)象,藍(lán)藻(也稱(chēng)藍(lán)細(xì)菌)已成為各受控湖汊和碟形湖的主要優(yōu)勢(shì)類(lèi)群之一[27]。本次調(diào)查結(jié)果中,藍(lán)細(xì)菌門(mén)在兩湖各樣點(diǎn)均有一定程度的分布,并且呈現(xiàn)出相似的空間分布格局。在洞庭湖中,藍(lán)細(xì)菌門(mén)種類(lèi)的分布不均勻,其中中游湖區(qū)相對(duì)豐度較高,達(dá)到32.84%,而下游湖區(qū)較低;在鄱陽(yáng)湖中,藍(lán)細(xì)菌門(mén)相對(duì)豐度總體分布相對(duì)均勻,但是中部湖區(qū)樣點(diǎn)仍最高。文獻(xiàn)記載,洞庭湖水華主要發(fā)生在東部和西部湖灣區(qū)等水流較緩、水體交換率低的區(qū)域,過(guò)水河道區(qū)域則零星分布[28]。兩湖中部湖區(qū)較上游和下游區(qū)域,湖面寬,流速緩,這也可能是藍(lán)藻相對(duì)豐度較高的原因。張民等關(guān)于太湖藍(lán)藻水華空間擴(kuò)張的研究結(jié)果顯示,水華由西北區(qū)梅梁灣區(qū)域逐漸擴(kuò)張至中部湖區(qū),營(yíng)養(yǎng)鹽的空間分布和水文氣象是最主要的驅(qū)動(dòng)因子[29]。近年來(lái)隨著上游水利設(shè)施的建設(shè)和流域內(nèi)工農(nóng)業(yè)的發(fā)展,氮、磷濃度逐漸上升,兩湖富營(yíng)養(yǎng)化日益嚴(yán)重[30]。因此,過(guò)水河道,尤其是中部湖區(qū)藍(lán)藻水華的潛在風(fēng)險(xiǎn)較大。有關(guān)部門(mén)應(yīng)加強(qiáng)藻類(lèi)監(jiān)測(cè)和管理,減緩或避免進(jìn)一步擴(kuò)張。

        3.3 兩湖水體細(xì)菌群落構(gòu)建機(jī)制

        通過(guò)了解微生物群落變化的生態(tài)過(guò)程和影響因素,推斷群落穩(wěn)定性及其與生態(tài)系統(tǒng)功能之間的關(guān)系,有利于了解湖泊生態(tài)系統(tǒng)的變化過(guò)程及健康動(dòng)態(tài)[1]。因此,探究湖泊水體細(xì)菌群落的構(gòu)建機(jī)制是一項(xiàng)重要內(nèi)容。洞庭湖和鄱陽(yáng)湖屬于典型的過(guò)水型湖泊,其水量主要由上游河流匯集,經(jīng)湖區(qū)入長(zhǎng)江,水體的流動(dòng)對(duì)水體細(xì)菌的擴(kuò)散分布影響較大,但是近年來(lái)兩湖污染情況加劇,環(huán)境影響同樣不容忽視。環(huán)境因子和空間因子是影響物種分布的兩類(lèi)關(guān)鍵因子,前者指示了環(huán)境條件的差異對(duì)群落中不同物種的選擇作用,是一種確定性過(guò)程;而空間因子主要通過(guò)擴(kuò)散等作用影響物種在空間上的分布,是一種隨機(jī)性過(guò)程。越來(lái)越多的研究表明,兩者同時(shí)對(duì)物種的分布產(chǎn)生重要影響,研究的焦點(diǎn)在于哪種過(guò)程占主導(dǎo)地位以及如何量化兩者貢獻(xiàn)的大小[32]。

        本次調(diào)查方差分解結(jié)果顯示,洞庭湖以空間影響為主(42.0%),但其中有27.0%與環(huán)境影響重疊,而鄱陽(yáng)湖則以環(huán)境影響為主(25.0%),僅6.0%與空間影響重疊。值得注意的是,兩湖分別有55.0%和62.0%的變異不能被解釋。零模型分析結(jié)果顯示,隨機(jī)性過(guò)程(包括漂變和同質(zhì)擴(kuò)散)主導(dǎo)了兩湖水體細(xì)菌的空間分布(分別為58.5%和79.7%)。鄱陽(yáng)湖的環(huán)境空間異質(zhì)性較洞庭湖高(圖2),若確定性過(guò)程主導(dǎo),其物種組成相似度應(yīng)該較低,但其物種組成分析結(jié)果顯示較為聚集,即相似度較高(圖6),說(shuō)明鄱陽(yáng)湖受到的隨機(jī)過(guò)程影響高于洞庭湖,這與零模型分析結(jié)果一致。在確定性過(guò)程影響方面,洞庭湖受確定性影響相對(duì)比例較鄱陽(yáng)湖大,且主要體現(xiàn)在同質(zhì)選擇作用上,同樣與洞庭湖環(huán)境的空間異質(zhì)性較低一致。零模型分析是基于群落中各物種的譜系關(guān)系和豐度信息,通過(guò)建立“隨機(jī)群落”的方式,比較“觀(guān)測(cè)群落”與“隨機(jī)群落”之間的譜系組成關(guān)系,判斷不同群落構(gòu)建過(guò)程的比例[33],而方差分解則是基于典范分析或冗余分析通過(guò)排序得到[34],依賴(lài)于實(shí)測(cè)的環(huán)境因子和位點(diǎn)空間關(guān)系,在實(shí)際操作過(guò)程中,會(huì)有一部分方差無(wú)法解釋?zhuān)礆埐?。因此,本次研究中,零模型分析結(jié)果更好地解釋了兩湖水體細(xì)菌的群落構(gòu)建機(jī)制。

        綜上所述,洞庭湖和鄱陽(yáng)湖等過(guò)水型湖泊中生物群落的構(gòu)建受到隨機(jī)過(guò)程的重要影響,所觀(guān)測(cè)群落特征與真實(shí)水生態(tài)健康狀況之間存在較大的不確定性。因此,在水生態(tài)監(jiān)測(cè)工作開(kāi)展過(guò)程中,探究監(jiān)測(cè)對(duì)象群落構(gòu)建模式非常重要。

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