劉嘉玉,李澤穎,陳玲燕,梅杰,馬濤,張巖
214122 江蘇 無錫,江南大學(xué)無錫醫(yī)學(xué)院無錫市婦幼保健院 乳腺外科(劉嘉玉、馬濤、張巖); 214023江蘇 無錫,南京醫(yī)科大學(xué) 無錫臨床醫(yī)學(xué)院(李澤穎、陳玲燕、梅杰)
2020 年,女性乳腺癌的發(fā)病率已超過肺癌,占據(jù)全球癌癥發(fā)病率榜首,估計(jì)有230 萬例新發(fā)病例,占所有癌癥新病例的11.7%[1]。隨著乳腺癌早期篩查、診斷和治療方案的進(jìn)步,患者的存活率已有所提高。微小RNA(microRNA,miRNA)是一類內(nèi)源性的非編碼單鏈RNA,可結(jié)合靶基因mRNA 的3’-UTR 區(qū),在轉(zhuǎn)錄水平使mRNA 降解或在翻譯水平抑制蛋白表達(dá),其功能取決于與靶序列mRNA 的互補(bǔ)程度[2]。miRNA 表達(dá)異常可引起下游基因或信號(hào)通路的狀態(tài)發(fā)生改變,從而調(diào)控細(xì)胞增殖、凋亡、遷移等生物學(xué)現(xiàn)象[3]。癌癥生物學(xué)的最新進(jìn)展發(fā)現(xiàn),除了表觀基因組的修飾,miRNA失調(diào)也可作為惡性腫瘤發(fā)生和轉(zhuǎn)移的標(biāo)志。在乳腺癌中,miRNA 可通過調(diào)控DNA 和組蛋白修飾從而造成乳腺癌表觀遺傳學(xué)的變化[4],同時(shí)miRNA也可作為乳腺癌早期發(fā)展的生物標(biāo)記物,為其靶向治療提供指導(dǎo)[5]。有研究發(fā)現(xiàn),miR-30 家族,包括miR-30a、miR-30b、miR-30c、miR-30d 和miR-30e等,均可作為乳腺癌骨轉(zhuǎn)移抑制因子[6],且有研究證實(shí)miR-30e-5p 可通過調(diào)節(jié)異黏蛋白來抑制膀胱癌細(xì)胞的增殖和遷移[7]。然而,miR-30e-5p 對乳腺癌細(xì)胞惡性表型的機(jī)制研究還相對較少。P53 是經(jīng)典的抑癌基因,其失活會(huì)促進(jìn)乳腺腫瘤的進(jìn)展,尤其是在預(yù)后不良的三陰性乳腺癌中更為明顯[8]。P53 介導(dǎo)的miRNA 相關(guān)通路進(jìn)而影響腫瘤細(xì)胞惡性表型的機(jī)制還有待進(jìn)一步發(fā)掘?;诖耍疚闹荚谔接慞53 介導(dǎo)的miR-30e-5p 對乳腺癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響。
人乳癌腺細(xì)胞系MCF-7、MDA-MB-453 購自江蘇凱基生物技術(shù)股份有限公司。使用含10%胎牛血清(fetal bovine serum,F(xiàn)BS)的RPMI-1640 培養(yǎng)基培養(yǎng)MCF-7 和MDA-MB-453 細(xì)胞,培養(yǎng)條件:溫度為37℃,5%CO2。為進(jìn)行后續(xù)試驗(yàn),利用Lipofectamine 3000(Invitrogen) 對MCF-7 和MDA-MB-453細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)染操作。轉(zhuǎn)染的基本步驟:先將1.5 μL Lipo3000 轉(zhuǎn)染試劑加入25 μL 的Opti-MEM 培養(yǎng)液中混勻,同時(shí)將1.25 pL、2.5 pL、5 μL miRNA-467b的mimics-GFP 分 別 與25 μL 的Opti-MEM 培 養(yǎng)液混合,孵育5 min 后將上述兩溶液混勻,室溫靜置20 min,將50 μL Lipo-miRNA 復(fù)合體逐滴均勻地加入細(xì)胞培養(yǎng)液中,分別形成含有50 nmol/L、100 nmol/L、200 nmol/L 的miRNA mimics 的轉(zhuǎn)染體系,4 ~ 6 h 后換用新鮮培養(yǎng)液,終止轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染24 h后流式檢測轉(zhuǎn)染效率。
向培養(yǎng)液中加入1%終濃度的甲醛(0.275 mL,37%)固定10 min,使DNA 蛋白結(jié)合體交聯(lián),然后加入終濃度約為0.12 mol 的甘氨酸(0.675 mL,2 M),孵育10 min,終止交聯(lián)。加5 mL TNT Buffer,離心(2 000 r/min,4℃,5 min)后棄上清,取胞核沉淀保存?zhèn)溆?。向胞核沉淀中? mL NB buffer,轉(zhuǎn)移至兩個(gè)EP 管中,一管備用,另一管超聲切碎至DNA 片段集中在200 ~ 1 000 bp,超聲條件:500 W,超聲10 s,冰上放置2 ~ 3 min,共7 ~ 10 次,至液體變澄清。取100 μg DNA 至新EP 管內(nèi)(另準(zhǔn)備10 μg input備用),加入700 μL DB buffer 稀釋。然后加入2 μg抗體及2 μg 相對應(yīng)的兔或鼠IgG,4℃,轉(zhuǎn)盤轉(zhuǎn)動(dòng)結(jié)合1 ~ 2 h,離心(14 000 r/min,4 ℃,離心10 min),取上清,各加40 ~ 50μL 預(yù)處理過的蛋白G-Sepharose beads,4 ℃過夜。離心(3 000 r/min,3 min)棄上清,先后用RIPA I、RIPA II、LiCl buffer、TE buffer 洗滌1次。棄去TE buffer 后,beads 用200μL 洗脫buffer洗脫兩次,65 ℃下孵育10 min。收集洗脫后的樣品,加入2 μL 蛋白酶K,在65 ℃解交聯(lián)過夜,從而分離結(jié)合在一起的DNA 和蛋白。將各樣品進(jìn)行SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳,凝膠取出后拍照觀察目的片段表達(dá)量。
根據(jù)JASPAR 預(yù)測結(jié)合位點(diǎn),使用Primer Blast設(shè)計(jì)P53 在miR-30e-5p 前體結(jié)合片段的熒光定量PCR 引物,進(jìn)行PCR 反應(yīng)(94℃預(yù)變性3 min,94℃變性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸45 s,循環(huán)26 次,72℃最終延伸10 min),測定CT 值。引物序列如下:CCAGGCTCTAACCCACAT(正向); GTGGCAGAATCTCACAGG(反向)。
此外,qPCR 也被用于miR-30e-5p 表達(dá)水平的檢測,U6 作為內(nèi)參,引物序列如下:miR-30e-5p:GCGCGTGTAAACATCCTTGAC(正向),AGTGCAGGGTCCGAGGTATT(反向);U6:CTCGCTTCGGCAGCACA(正向),AACGCTTCACGAATTTGCGT(反向)。
細(xì)胞轉(zhuǎn)染后48 h,用0.25%胰蛋白酶消化1 min,然后將其重懸于含有10%FBS 的RPMI 1640 培養(yǎng)基中。將懸浮的細(xì)胞接種到96 孔板(Corning Incorporated,美國),細(xì)胞密度調(diào)整為4×104個(gè)細(xì)胞/mL(100 μL/孔),并在5%CO2恒溫培養(yǎng)箱中37℃孵育24 h、48 h、72 h。每個(gè)孔添加10 μL CCK-8,然后將板置于培養(yǎng)箱中2 h。用酶標(biāo)儀在450 nm 下測量每個(gè)孔的光密度值。每個(gè)實(shí)驗(yàn)重復(fù)3 遍。
將對數(shù)生長期的細(xì)胞消化接種到六孔板中,細(xì)胞饑餓過夜處理。待細(xì)胞集合度達(dá)80%左右,在用無菌槍頭在六孔板中均勻劃線,根據(jù)組別按1.1步驟轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染24 h、48 h 后,取出細(xì)胞,生物倒置顯微鏡拍照(放大倍數(shù)100×),用0 h 時(shí)劃痕邊緣與24 h、48h 時(shí)劃痕邊緣之間的距離來計(jì)算遷移距離。
用0.25%胰酶消化收集細(xì)胞,細(xì)胞饑餓過夜處理。使用不完全培養(yǎng)基調(diào)整細(xì)胞密度至1×105個(gè)/mL,取細(xì)胞懸液100 μL 加入Transwell 小室上室(Corning Incorporated),上室涂有Matrigel。將24 孔細(xì)胞培養(yǎng)板置于37℃,5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),24 h 后將小室取出,棄去孔中培養(yǎng)基,PBS 漂洗3 次,將小室內(nèi)PBS吸干凈,此過程快速完成,避免讓小室的膜過于干燥。用無水甲醇固定細(xì)胞15 min,小室翻轉(zhuǎn)晾干10 min。在24 孔板加入500 μL 含0.1%結(jié)晶紫,小室置于其中染色30 min。取出后PBS 清洗至無殘留,生物倒置顯微鏡下拍照(放大倍數(shù)200×)并計(jì)數(shù)。
將細(xì)胞放置在35 毫米皿中(6×105個(gè)細(xì)胞/皿)。轉(zhuǎn)染后48 h,所有細(xì)胞均用裂解緩沖液處理,以提取總蛋白。SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳和蛋白質(zhì)印跡分析依據(jù)標(biāo)準(zhǔn)方案進(jìn)行。先使用核蛋白和總蛋白提取試劑盒(凱基生物)提取核蛋白和總蛋白,MMP9(1∶1 000 稀釋, Abcam),CyclinD1(1∶1 000 稀釋,Abcam),β-catenin(1∶1 000 稀釋,Abcam),對于每個(gè)樣品,將蛋白質(zhì)的表達(dá)水平相對于GAPDH 標(biāo)準(zhǔn)化。
將蓋玻片浸入細(xì)胞培養(yǎng)基,使細(xì)胞附著生長。用PBS 洗3 次,每次5 min。然后用多聚甲醛(4%)將細(xì)胞固定15 min,將蓋玻片用PBS 洗3 次。接著,將蓋玻片放在含有0.5%Triton X-100 的PBS 液中孵育5 min,并將細(xì)胞用5%脫脂奶封閉1 h,然后加入β-catenin 抗體(1∶200 稀釋,Abcam),在4 ℃下孵育過夜。將蓋玻片用PBS 洗滌后加二抗(羊抗兔IgG-FITC,1∶100 稀釋,凱基生物)避光孵育1 h。在每張片子滴加50 ~ 100 μL DAPI 染液,避光放置5 min,PBS 洗三次。用防淬滅封片膠封片。激光共聚焦顯微鏡下觀察細(xì)胞中蛋白的表達(dá)情況,取3 個(gè)表達(dá)區(qū)域拍照(放大倍數(shù)600×)。
利用SPSS 26.0 統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件,計(jì)量數(shù)據(jù)以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,miR-30e-5p 的表達(dá)量比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),細(xì)胞增殖、遷移和侵襲比較采用t檢驗(yàn),P< 0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
通過染色質(zhì)免疫共沉淀與熒光定量PCR 檢測發(fā)現(xiàn),在P53 野生型的MCF-7 細(xì)胞中,P53 抗體結(jié)合的miR-30e-5p 啟動(dòng)子區(qū)序列顯著高于IgG,而在P53突變的MDA-MB-453 中,P53 抗體仍可與miR-30e-5p 啟動(dòng)子區(qū)序列結(jié)合,但較MCF-7 細(xì)胞弱(圖1A)。與對照組相比,轉(zhuǎn)染了P53 野生型質(zhì)粒的MCF-7 和MDA-MB-453 細(xì)胞,miR-30e-5p 的表達(dá)水平明顯上調(diào)(P< 0.05,圖1B),提示P53 可以轉(zhuǎn)錄激活miR-30e-5p。
MDA-MB-453、MCF-7乳腺癌細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-30e-5p 后,利用CCK8 法檢測其增殖能力變化。與對照組相比,轉(zhuǎn)染miR-30e-5p 的MDA-MB-453 和MCF-7細(xì)胞的增殖能力均受不同程度的抑制(P< 0.05,圖2),提示轉(zhuǎn)染miR-30e-5p 后乳腺癌細(xì)胞的增殖能力下調(diào)。
圖1 P53 與啟動(dòng)子結(jié)合轉(zhuǎn)錄激活miR-30e-5pFigure 1. P53 Binds to the Promoter to Transcriptionally Activate MiR-30e-5p
圖2 miR-30e-5p 抑制細(xì)胞增殖Figure 2.MiR-30e-5p Inhibits Cell Proliferation
利用劃痕試驗(yàn)檢測轉(zhuǎn)染miR-30e-5p 的MCF-7、MDA-MB-453 乳腺癌細(xì)胞的遷移能力。分別在劃痕后24 h,48 h 檢測遷移的距離,結(jié)果表明,轉(zhuǎn)染miR-30e-5p 的MDA-MB-453 和MCF-7 細(xì)胞的遷移能力受到抑制(P< 0.05;圖3)。利用Transwell 小室檢測其侵襲能力變化,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)染miR-30e-5p 的MDAMB-453 和MCF-7 細(xì)胞的侵襲能力受到顯著抑制(P< 0.05;圖4)。因此,轉(zhuǎn)染miR-30e-5p 后,乳腺癌細(xì)胞的遷移、侵襲能力均下調(diào)。
激光共聚焦顯微觀察發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)染miR-30e-5p的細(xì)胞,其核內(nèi)β-catenin 的水平明顯下調(diào)(圖5)。進(jìn)一步利用Western blot 實(shí)驗(yàn),觀察到轉(zhuǎn)染miR-30e-5p 細(xì)胞的核內(nèi)β-catenin 水平顯著下調(diào)。此外,β-catenin 靶基因MMP9 及Cyclin D1 表達(dá)水平明顯下調(diào)(圖6)。
圖3 miR-30e-5p 抑制細(xì)胞遷移(×100,*P < 0.05)Figure 3.MiR-30e-5p Inhibits Cell Migration (×100, *P < 0.05)
圖4 miR-30e-5p 抑制細(xì)胞侵襲(結(jié)晶紫染色,×200,*P <0.05)Figure 4.MiR-30e-5p Inhibits Cell Invasion (Crystal Violet Staining,×200, *P < 0.05)
A-B. Transfection of miR-30e-5p down-regulates the invasion ability of MDA-MB-453 cells; C-D. Transfection of miR-30e-5p down-regulates the invasion ability of MCF-7 cells
圖 5 激光共聚焦顯微觀察轉(zhuǎn)染miR-30e-5p 的細(xì)胞胞核內(nèi)β-catenin 的水平下調(diào)(DAPI 染色,×600)Figure 5.Down-Regulated β-Catenin Level in the Nuclei of Cells Transfected with MiR-30e-5p Observed by Laser Confocal Microscopy (DAPI Staining, ×600)
圖 6 Western blot 顯示MMP9、Cyclin D1 與核內(nèi)β-catenin 表達(dá)水平明顯下調(diào)Figure 6.Significantly Down-Regulated Levels of MMP9, Cyclin D1 and Nuclear β-Catenin in Western Blot
近年來,miRNA 通過調(diào)控靶基因的表達(dá)從而影響癌細(xì)胞生物學(xué)行為一直是乳腺癌領(lǐng)域的研究熱點(diǎn),其中,對于miR-30e-5p 的研究還相對較少。P53是人類癌癥中最頻繁改變的基因,在侵襲性腫瘤中約有50%存在突變,在三陰性乳腺癌等難以治療的癌癥中80%以上發(fā)生突變[9]。P53 調(diào)控的miRNA相關(guān)通路進(jìn)而影響腫瘤細(xì)胞惡性表型的機(jī)制還有待進(jìn)一步發(fā)掘。本文利用染色質(zhì)免疫共沉淀與熒光定量PCR 檢測發(fā)現(xiàn),在乳腺癌MCF-7 細(xì)胞中P53可結(jié)合miR-30e-5p 啟動(dòng)子區(qū)域,轉(zhuǎn)錄激活miR-30e-5p 的表達(dá)。
miR-30 家族具有抑制癌細(xì)胞侵襲和轉(zhuǎn)移的作用,其在5’端附近具有相同的種子序列,而在3’端附近具有不同的補(bǔ)償序列,在不同類型腫瘤中可同時(shí)發(fā)揮抑癌和致癌作用[10]。在乳腺癌中,miR-30或作為腫瘤抑制因子發(fā)揮作用[11-12]。研究表明,乳腺癌細(xì)胞中的miR-30c 表達(dá)降低,而miR-30c 能結(jié)合KRAS 轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的3’UTP 并沉默KRAS,抑制癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移[13],并靶向作用于VIM/TWF1 而抑制細(xì)胞侵襲[14]。此外,miR-30c 可通過HER/RACI 途徑發(fā)揮作用,或可作為他莫昔芬治療潛在的預(yù)后生物標(biāo)志物,為晚期雌激素受體陽性乳腺癌患者是否能從內(nèi)分泌治療中得到臨床獲益提供預(yù)測指標(biāo)[15]。miR-30 家族的另一成員miR-30e 通過直接靶向IRS1 阻斷AKT 和ERK1/2 途徑的激活以及HIF-1α和VEGF 的表達(dá),進(jìn)而抑制細(xì)胞增殖、遷移和侵襲[16]。此外,RPS6KB1 與miR-30e 的3’-UTR 結(jié)合而成為其直接靶標(biāo),促進(jìn)食管癌細(xì)胞增殖、侵襲和腫瘤生長[17]。有學(xué)者發(fā)現(xiàn),miR-30 可通過抑制乳腺癌中的CTHRC1 從而抑制癌細(xì)胞侵襲和轉(zhuǎn)移,并誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡[18]。
Wnt/β-catenin 是在進(jìn)化中高度保守的信號(hào)傳導(dǎo)途徑,具有調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖、分化、遷移、凋亡和干細(xì)胞更新等功能。其中,β-catenin 是鈣黏蛋白復(fù)合物的核心成分,可調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖中涉及的多種蛋白質(zhì)的表達(dá),如cyclin D1,在乳腺癌組織中該蛋白表達(dá)上調(diào),其核蓄積是激活Wnt/β-catenin 信號(hào)通路的關(guān)鍵[19-20]。研究發(fā)現(xiàn),β-catenin 可作為某些miRNA的 靶 基 因,包 括miR-26b、miR-135、miR-214、miR-216a 和miR-340[21]。本 文 發(fā) 現(xiàn) 乳 腺 癌 細(xì) 胞 表 達(dá)miR-30e-5p 后,腫瘤細(xì)胞增殖、遷移和侵襲能力受到抑制,且miR-30e-5p 可通過抑制經(jīng)典Wnt 通路發(fā)揮作用。
綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)P53 可介導(dǎo)miR-30e-5p表達(dá),通過抑制經(jīng)典Wnt 通路從而抑制乳腺癌細(xì)胞惡性表型,證明miR-30e-5p 有希望成為乳腺癌治療的潛在靶點(diǎn),為乳腺癌靶向治療提供指導(dǎo)。
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