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        碳青霉烯類耐藥肺炎克雷伯菌基因型檢測(cè)研究

        2023-01-11 13:19:38萬會(huì)林曹小利王小梅韓亞飛孔燕趙丹妹諸君
        臨床肺科雜志 2023年1期
        關(guān)鍵詞:耐藥研究

        萬會(huì)林 曹小利 王小梅 韓亞飛 孔燕 趙丹妹 諸君

        肺炎克雷伯菌是一種革蘭氏陰性桿菌,廣泛存在于哺乳動(dòng)物鼻咽和胃腸道中,是導(dǎo)致醫(yī)院感染發(fā)生的主要病原菌之一[1]。碳青霉烯類抗菌藥物是臨床抗感染常用藥物,包括亞胺培南、美羅培南、多尼培南等,其抗菌活性較強(qiáng)、抗菌譜較廣,且毒性較低,在治療革蘭氏陰性桿菌中具有重要應(yīng)用價(jià)值[2]。然而由于碳青霉烯類抗菌藥物的濫用及不合理使用,導(dǎo)致病原菌對(duì)該類藥物的耐藥性不斷增強(qiáng),并導(dǎo)致碳青霉烯類耐藥肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)形成[3]。我國多項(xiàng)調(diào)查報(bào)道[4-5],肺炎克雷伯菌對(duì)碳青霉烯類抗菌藥物的耐藥性及CRKP檢出率呈逐年上升趨勢(shì),CRKP感染治療已成為當(dāng)前臨床感染防控工作面臨的嚴(yán)峻考驗(yàn)。本研究檢測(cè)分析CRKP基因類型并對(duì)患者臨床特征進(jìn)行分析,以期為臨床防控及治療CRKP提供參考。

        資料與方法

        一、臨床資料

        回顧性分析我院2018年9月~2021年8月收治的56例分離出CRKP菌株患者的臨床資料。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)根據(jù)病原學(xué)檢測(cè)確診,經(jīng)血培養(yǎng)或痰培養(yǎng),攜帶細(xì)菌鑒定結(jié)果為CRKP陽性;(2)臨床資料完整;(3)年齡≥18歲。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)同一患者重復(fù)菌株;(2)可疑污染挑取血液或痰液可疑部位(膿、 黏液)涂片,革蘭染色后進(jìn)行顯微鏡檢查, 根據(jù)平均每個(gè)低倍視野下出現(xiàn)鱗狀上皮細(xì)胞(Squamous epithelial cells,SEC)和白細(xì)胞(white blood cell,WBC)的多少或比例,判斷送檢標(biāo)本污染程度,不合格標(biāo)準(zhǔn)[6]:SEC≥10個(gè)或WBC≤25個(gè);SEC/WBC≥1.25;SEC>0,WBC=0。本次研究符合《赫爾辛基宣言》相關(guān)要求。本次研究通過醫(yī)院倫理委員會(huì)審核,符合審核標(biāo)準(zhǔn),倫理同意號(hào):(同)2021-019-01。

        二、方法

        1 CRKP耐藥基因檢測(cè) 使用PCR擴(kuò)增和DNA測(cè)序檢測(cè)CRKP耐藥基因(包括KPC、IMP、VIM、NDM-1、OXA-48),引物參考相關(guān)文獻(xiàn)[7-8]設(shè)計(jì),并由TaKaRa生物技術(shù)公司合成,引物序列(見表1)。

        表1 CRKP耐藥基因引物序列

        2 細(xì)菌鑒定及耐藥性分析 使用全自動(dòng)微生物分析系統(tǒng)(Vitek 2 Compact 30,法國生物梅里埃)進(jìn)行病原菌鑒定及耐藥性分析,質(zhì)控菌株為大腸埃希菌ATCC25922,購自賽默飛世爾科技(中國)有限公司。

        三、觀察指標(biāo)

        記錄患者年齡、性別、收治科室、標(biāo)本來源、合并基礎(chǔ)疾病情況、抗菌藥物使用情況、住院時(shí)間以及侵入性操作情況等資料。

        四、統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        結(jié) 果

        一、CRKP基因型分析

        經(jīng)檢測(cè)及BLAST比對(duì),56株CRKP中檢出47株KPC型耐藥基因(83.93%)、9株NDM-1型耐藥基因(16.07%),未檢出IMP、VIM以及OXA-48耐藥基因(見表2)。

        表2 56例CRKP基因型分析

        二、不同基因型CRKP耐藥性分析

        耐藥性分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),KPC和NMD-1型耐藥基因?qū)Π鼻夏退幮圆町愑薪y(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)(見表3)。

        表3 不同基因型CRKP耐藥性分析

        三、不同基因型CRKP患者臨床特征分析

        KPC和NMD-1型耐藥基因?qū)?yīng)患者年齡、性別、收治科室、標(biāo)本來源分布情況、合并基礎(chǔ)疾病、抗菌藥物使用時(shí)間、3種及以上抗菌藥物聯(lián)用史、住院時(shí)間以及侵入性操作比較差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)(見表4)。

        表4 不同基因型CRKP患者臨床特征分析

        討 論

        碳青霉烯類抗菌藥物是臨床治療革蘭氏腸桿菌屬細(xì)菌感染的常用藥物,然而由于該類藥物頻繁及不合理使用使病原菌耐藥性不斷增強(qiáng),最終導(dǎo)致耐碳青霉烯腸桿菌形成,給感染防控、醫(yī)療工作帶來了極大的挑戰(zhàn)[9-10]。CRKP是耐碳青霉烯腸桿菌中最常見的一類細(xì)菌,同時(shí)也是臨床感染中最重要的病原菌之一,其在全球范圍內(nèi)廣泛傳播,CRKP已成為當(dāng)前臨床上亟待解決的醫(yī)學(xué)難題[11-12]。

        本文研究結(jié)果表明,56株CRKP檢出47株KPC型耐藥基因和9株NDM-1型耐藥基因,其檢出率分別為83.93%和16.07%,提示CRKP基因型主要以KPC型為主。黃秋艷等[13]研究報(bào)道,CRKP常見類型為KPC,少見NDM-1和VIM,陳婭等[14]研究也表明,分離CRKP均檢出KPC型耐藥基因,均與本文研究結(jié)果相符。值得注意的是,CRKP耐藥機(jī)制較為復(fù)雜,而其中產(chǎn)碳青霉烯酶是CRKP耐藥主要原因[15-16]。碳青霉烯酶主要包括A、B、D三類,A類主要水解頭霉素類以外幾乎所有的β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物,其主要包括KPC、SME、GES等,B類包括NDM-1、IMP、VIM等,相比于A類酶檢出相對(duì)較少,其對(duì)青霉素類、頭孢菌素類以及碳青霉烯類藥物耐藥性較強(qiáng),對(duì)單環(huán)β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物較敏感,D類主要包括OXA-48,在我國檢出率較低,其主要對(duì)苯唑西林有較強(qiáng)耐藥性[17]。本文研究結(jié)果表明,KPC型和NDM-1型耐藥基因?qū)Π鼻夏退幮杂忻黠@差異,氨曲南是臨床中常用的一種單環(huán)β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物,結(jié)合前文研究表明耐藥性差異與基因型類型不同有關(guān),CRKP不同基因型對(duì)于不同抗菌藥物存在異質(zhì)性,臨床治療CRKP患者可結(jié)合基因檢測(cè)結(jié)果合理使用抗菌藥物,值得注意的是,本研究中KPC和NDM-1對(duì)其他常用抗菌藥物的耐藥性也有所差異,但由于樣本量較少,兩者未見顯著差異,后續(xù)還需收集更多樣本進(jìn)一步分析驗(yàn)證。

        本研究進(jìn)一步分析患者臨床特征,結(jié)果表明,56株CRKP收治科室分別為重癥監(jiān)護(hù)室、腫瘤科、神經(jīng)內(nèi)/外科、康復(fù)科、消化內(nèi)科、腎內(nèi)科、泌尿外科、呼吸科、感染科、內(nèi)分泌科、普外科,其中CRKP分離的臨床科室在重癥監(jiān)護(hù)室占比最高,占28.57%(16/56),與相關(guān)研究報(bào)道相符[18]。重癥監(jiān)護(hù)室患者通常病情較嚴(yán)重,免疫功能較弱,病房環(huán)境相對(duì)復(fù)雜,且常常需要接受氣管插管、機(jī)械通氣、中心靜脈置管等侵入性操作,相比于其他科室患者更加容易發(fā)生感染,因此結(jié)合本文研究結(jié)果提示CRKP感染防控治療工作需重點(diǎn)關(guān)注重癥監(jiān)護(hù)室患者情況[19]。分析CRKP菌株標(biāo)本來源發(fā)現(xiàn),56株CRKP菌株分別來源于痰樣、尿液、血液、膿液以及其他(膽汁、引流液等),其中CRKP菌株來自痰樣標(biāo)本最多,占42.86%(24/56),其次為尿液,占26.79%(15/56),張侃等報(bào)道[20],CRKP分離菌株主要來源于呼吸道和泌尿道,與本文研究結(jié)果相符。既往相關(guān)研究也報(bào)道[21],呼吸道和泌尿道是人體與外界相通的腔道,是感染發(fā)生最常見的場(chǎng)所,結(jié)合本文研究結(jié)果提示,CRKP感染防控需加強(qiáng)患者呼吸道管理和基礎(chǔ)衛(wèi)生護(hù)理工作,以盡量避免患者發(fā)生呼吸道及尿路感染。但值得注意的是,本研究結(jié)果表明,兩組患者的年齡、性別、收治科室、標(biāo)本來源分布情況、合并基礎(chǔ)疾病、抗菌藥物使用時(shí)間、3種及以上抗菌藥物聯(lián)用史、住院時(shí)間以及侵入性操作等臨床特征比較差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,與既往相關(guān)研究[22-23]結(jié)論有所不同,分析其原因可能與本研究采集樣本量較少所致,增加樣本量兩組患者各指標(biāo)差異是否顯著化仍有待進(jìn)一步研究。

        綜上所述,CRKP基因型主要以KPC型最常見,占83.93%,不同基因型CRKP對(duì)常用抗菌藥物耐藥性存在異質(zhì)性,臨床抗感染治療需結(jié)合基因檢測(cè)及耐藥性分析制定合理方案,此外,不同基因型CRKP臨床特征無明顯差異,但由于樣本量較少,統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果可能存在片面性,研究結(jié)果可信度不高,此外,由于本研究樣本均取自同一中心病例,研究結(jié)論具有一定局限性,因此還需收集更多中心的樣本進(jìn)行多中心研究以完善本文研究。

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