蔣專 丁杰 張忠民 劉振華 吳明 樊斐 曾家興 周金海 劉航
(貴州醫(yī)科大學(xué),貴州 貴陽(yáng) 550000)
細(xì)胞自噬即細(xì)胞的自我吞噬,廣泛存在于真核細(xì)胞中,細(xì)胞通過(guò)對(duì)受損細(xì)胞器及衰老蛋白質(zhì)等細(xì)胞成分進(jìn)行降解再循環(huán)利用來(lái)維持細(xì)胞自身穩(wěn)態(tài)的過(guò)程〔1〕。處于細(xì)胞基礎(chǔ)水平的自噬具有保護(hù)功能,可維持細(xì)胞的穩(wěn)態(tài),而細(xì)胞在氧化應(yīng)激、缺氧、DNA損傷或者饑餓等環(huán)境下可誘導(dǎo)細(xì)胞產(chǎn)生自噬。鑒于其在維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài)、應(yīng)激反應(yīng)和功能的作用,因此,自噬需要嚴(yán)格調(diào)控就顯得不足為奇了〔2〕。通常,細(xì)胞自噬主要有以下3種形式:微自噬、巨自噬和分子伴侶介導(dǎo)的自噬(CMA)。
自噬過(guò)程的調(diào)節(jié)主要取決于能量和營(yíng)養(yǎng)傳感器的活動(dòng),自噬的調(diào)控機(jī)制十分復(fù)雜,隨著越來(lái)越深入的研究,已發(fā)現(xiàn)調(diào)控自噬的信號(hào)通路也越來(lái)越多,其中最主要的通路是哺乳動(dòng)物雷帕霉素復(fù)合物(mTOR)通路和非mTOR依賴通路。在創(chuàng)傷、饑餓及感染等應(yīng)激條件下,不同信號(hào)調(diào)節(jié)通路可能通過(guò)激活或抑制自噬來(lái)維持細(xì)胞內(nèi)環(huán)境的穩(wěn)定。近幾年,大量轉(zhuǎn)錄因子已經(jīng)被證實(shí)與自噬的調(diào)控相關(guān),轉(zhuǎn)錄因子在細(xì)胞自噬過(guò)程中扮演了重要的角色,并且可以應(yīng)對(duì)各種壓力〔3〕,其中,在自噬-溶酶體途徑中,轉(zhuǎn)錄因子(TF)EB是自噬-溶酶體途徑的主要調(diào)控蛋白〔4〕,其余轉(zhuǎn)錄因子例如叉頭蛋白轉(zhuǎn)錄因子(FoxO)家族成員〔5〕、腫瘤蛋白p53〔6〕等均被證實(shí)參與了細(xì)胞自噬的調(diào)控。
全基因組學(xué)研究表明,自噬包含一個(gè)復(fù)雜的表觀遺傳過(guò)程〔7〕。轉(zhuǎn)錄和表觀遺傳的調(diào)控已經(jīng)成為調(diào)節(jié)細(xì)胞自噬關(guān)鍵過(guò)程之一,自噬的誘導(dǎo)與組蛋白H4賴氨酸(H4K)16脫乙酰化和伴隨賴氨酸乙酰轉(zhuǎn)移酶(KAT)8組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶的下調(diào)有關(guān)〔8〕。重要的是,H4K16乙?;癄顟B(tài)似乎參與自噬生存或死亡決定,因?yàn)镠4K16ac在自噬過(guò)程中的下調(diào)受到KAT8的過(guò)表達(dá)或其對(duì)應(yīng)物沉默信息調(diào)節(jié)因子2相關(guān)酶(SIRT)1脫乙酰酶的抑制,增加自噬潮并促進(jìn)細(xì)胞凋亡。與H4K16的去乙?;嗨?,自噬誘導(dǎo)時(shí),在哺乳動(dòng)物細(xì)胞和酵母細(xì)胞中觀察到量化組蛋白H3賴氨酸4的三甲基化(H3K4me3)的表達(dá)減少,根據(jù)這些組蛋白標(biāo)記之間建立的分子聯(lián)系,應(yīng)答的調(diào)節(jié)因子還沒(méi)有被揭示〔8〕。通過(guò)穩(wěn)定組蛋白H3精氨酸(H3R)17甲基轉(zhuǎn)移酶組蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶(CARM)1、H2B單泛素化(H2Bub1)在饑餓期間下調(diào),葡萄糖水平下降增加了與轉(zhuǎn)錄激活相關(guān)的全基因組H3R17二甲基化,H2Bub1的減少導(dǎo)致自噬激活,去泛素特異性蛋白酶(USP)44可能是饑餓誘導(dǎo)的H2Bub1減少的原因〔9〕。在酵母中,雷帕霉素(一種已建立的TOR/mTOR抑制劑)的處理伴隨著H3K56ac殘基的減少。實(shí)際上,關(guān)鍵組蛋白修飾因子如KAT8和組蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶(CARM)1的蛋白質(zhì)水平的變化發(fā)生在自噬過(guò)程中,據(jù)報(bào)道,組蛋白修飾在長(zhǎng)期且積極的參與了細(xì)胞自噬的調(diào)控,通過(guò)自噬相關(guān)基因(ATG)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,驅(qū)動(dòng)調(diào)節(jié)反饋環(huán),有助于控制自噬潮,對(duì)代謝方向和細(xì)胞命運(yùn)的決定起著重要作用〔10〕。
賴氨酸特異性去甲基酶(LSD)1,是第一個(gè)鑒定出來(lái)的組蛋白去甲基化酶,在胚胎發(fā)育、上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化、細(xì)胞分化及腫瘤的增殖和侵襲轉(zhuǎn)移過(guò)程中都發(fā)揮了極為重要作用。LSD1在人類許多惡性腫瘤中高表達(dá),如乳腺癌、肺癌、肝癌、結(jié)直腸癌和卵巢癌等,并且最近已成為抗癌藥物研究的新的熱點(diǎn)靶標(biāo)。LSD1能通過(guò)多種途徑調(diào)控腫瘤的發(fā)生、發(fā)展,研究證實(shí),可以發(fā)生甲基化的組蛋白賴氨酸主要包括:H3K4、H3K9、H3K27、H3K36、H3K79 和 H4K20,其中 H3K4、H3K36 和 H3K79 的甲基化通常與基因轉(zhuǎn)錄激活有關(guān),而 H3K9、H3K27、H4K20 則主要促進(jìn)基因轉(zhuǎn)錄抑制〔11〕。LSD1 可以特異性地去除組蛋白H3K4、H3K9 的二甲基化和一甲基化修飾,調(diào)控靶基因的表達(dá)。研究發(fā)現(xiàn)LSD1通過(guò)多種機(jī)制參與自噬的調(diào)節(jié),本文就LSD1與自噬研究進(jìn)展作一綜述。
ATG翻譯后修飾是調(diào)節(jié)自噬所必需的過(guò)程,在哺乳動(dòng)物中,自噬的調(diào)控至少由數(shù)十種ATG蛋白質(zhì)介導(dǎo);其中,ATG16L1在先天免疫反應(yīng)和抗細(xì)胞內(nèi)病原體中,能特異性地參與細(xì)胞自噬的過(guò)程及破壞病原體蛋白,是參與細(xì)胞自噬的重要蛋白,而且,它還參與了自噬小體的形成〔12〕;含SET域蛋白(SETD)7是一種含有催化結(jié)構(gòu)域——SET結(jié)構(gòu)域的組蛋白賴氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶,通常能夠以甲硫氨酸為底物,使組蛋白H3K4甲基化,從而應(yīng)對(duì)各種細(xì)胞應(yīng)激的新型調(diào)節(jié)機(jī)制,SETD7可以甲基化p53 K369基因從而調(diào)控p53的乙酰化,其次,SETD7還能通過(guò)增加基因的啟動(dòng)子區(qū)組蛋白的H3K4水平激活轉(zhuǎn)錄;然而,SETD7介導(dǎo)的甲基化對(duì)ATG蛋白的作用及相應(yīng)的機(jī)制尚未完全闡明〔13〕。
Song等〔14〕研究發(fā)現(xiàn)ATG16L1在缺氧/復(fù)氧(H/R)處理的心肌細(xì)胞中的活性受甲基化和磷酸化的調(diào)節(jié),心肌細(xì)胞H/R能降低ATG16L1的SETD7表達(dá)和賴氨酸甲基化,同時(shí)增加心肌細(xì)胞中LSD1的表達(dá)水平,SETD7介導(dǎo)的ATG16L1的賴氨酸甲基化是抑制自噬的重要因素;SETD7在體內(nèi)和體外在K151甲基化ATG16L1,并且SETD7的特異性抑制劑阻斷ATG16L1甲基化,而已死亡的突變體不能甲基化ATG16L1,LSD1能夠除去K151處的ATG16L1甲基標(biāo)記,心肌細(xì)胞在經(jīng)受H/R時(shí),由于SETD7在K151處預(yù)甲基化的ATG16L1被酪蛋白激酶(CSNK)2低效磷酸化,促使具有發(fā)卡核糖核酸(shRNA)敲除SETD7的心肌細(xì)胞或通過(guò)抑制劑抑制SETD7增加細(xì)胞的自噬和減少的細(xì)胞凋亡。相反,CSNK2在S139預(yù)磷酸化的ATG16L1也是SETD7的反應(yīng)底物,表明賴氨酸甲基化與ATG16L1的磷酸化之間存在一定聯(lián)系。這些數(shù)據(jù)支持ATG16L1蛋白翻譯后加工修飾(PTM)在H/R期間有效影響心肌細(xì)胞凋亡的觀點(diǎn)。該研究尚不清楚ATG16L1是否可被乙酰化修飾及乙?;欠駮?huì)影響其甲基化、磷酸化及其功能。然而,PTM在自噬調(diào)節(jié)中的過(guò)程發(fā)揮機(jī)制和功能可能為自噬相關(guān)疾病治療提供新的靶點(diǎn),因此,需要更多的研究證明ATG16L1在自噬調(diào)節(jié)中的PTM的作用過(guò)程、機(jī)制和功能,這可能為自噬與心肌凋亡及其他相關(guān)疾病治療提供新的靶點(diǎn)。
自噬與腫瘤之間的關(guān)系仍存有爭(zhēng)議,自噬在腫瘤發(fā)生和發(fā)展中具有雙重作用。其中,在腫瘤發(fā)生的初始階段,自噬所起到的作用主要是抑制腫瘤發(fā)生,而在腫瘤晚期主要作用則是促進(jìn)發(fā)展〔15〕。腫瘤形成前期,自噬過(guò)程的受阻會(huì)導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生,而在腫瘤形成后自噬代謝卻更加活躍,可能是通過(guò)自噬為代謝活躍的腫瘤組織提供更多的物質(zhì)和能量〔16〕,正因?yàn)樽允稍趯?duì)腫瘤細(xì)胞生存決定的作用機(jī)制,因而,自噬抑制劑已被提出作為腫瘤治療方法之一:Sesn家族在哺乳動(dòng)物中通常存在Sesn1、Sesn2 和 Sesn3 3種亞型,其中,Sesn2是前白蛋白(PA)26相關(guān)蛋白的Sesn家族的成員,Sesn2 能抑制肥胖誘導(dǎo)的胰島素抵抗和糖尿病的進(jìn)展,其在調(diào)節(jié)細(xì)胞對(duì)氧化應(yīng)激的反應(yīng)和細(xì)胞DNA修復(fù)中具有重要作用〔17〕。Sesn2轉(zhuǎn)錄受p53的控制,p53激活其表達(dá)以響應(yīng)DNA損傷和氧化應(yīng)激〔18〕。 然而,在LSD1受到抑制后,Sesn2表達(dá)的激活發(fā)生在SK-N-BE神經(jīng)母細(xì)胞瘤(NB)細(xì)胞中,其中p53在密碼子135處攜帶錯(cuò)義突變,將半胱氨酸轉(zhuǎn)化為苯丙氨酸,并且突變的p53不能激活周期蛋白依賴激酶抑制因子(CDKN1A)/p21基因的表達(dá)。LSD1可以通過(guò)p53依賴性和p53依賴性方式調(diào)節(jié)Sesn2轉(zhuǎn)錄,因?yàn)長(zhǎng)SD1不與細(xì)胞的DNA單獨(dú)結(jié)合,需要與DNA相互作用受體結(jié)合〔19〕,是否存在能夠在Sesn2啟動(dòng)子募集LSD1的DNA結(jié)合因子仍有待進(jìn)一步確定。
在NB中,LSD1的過(guò)表達(dá)與細(xì)胞侵襲性、分化差和預(yù)后不良相關(guān)〔20〕;LSD1耗竭引發(fā)Sesn2基因啟動(dòng)子區(qū)染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)重塑,誘導(dǎo)Sesn2表達(dá)的轉(zhuǎn)錄激活,進(jìn)而抑制mTORC1活性,導(dǎo)致自噬增強(qiáng)。Feng等〔21〕研究發(fā)現(xiàn)LSD1與Sesn2的啟動(dòng)子區(qū)相關(guān)蛋白1輕鏈3(LC3)是通過(guò)與磷脂酰乙醇胺(PE)綴合而參與自噬的蛋白質(zhì),形成LC3-Ⅱ,通過(guò)滅活mTOR使自噬的激活敏感,mTOR是一種細(xì)胞營(yíng)養(yǎng)和能量主要的傳感器激酶,LC3是常用的自噬小體標(biāo)志物,可以用于細(xì)胞自噬水平的評(píng)價(jià);在前列腺和卵巢癌細(xì)胞中,LSD1抑制LC3-Ⅱ積聚和自噬體形成,如通過(guò)mTORC1抑制TFEB的核轉(zhuǎn)位,LC3-Ⅱ的積累和最終自噬體的形成所證明的;Sesn2是LSD1抑制的靶基因,LSD1的抑制觸發(fā)了Sesn2的轉(zhuǎn)錄激活,從而導(dǎo)致mTORC1活性降低,表明LSD1特異性轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)mTORC1級(jí)聯(lián)和自噬之間的直接聯(lián)系〔22〕。
TOR最初是于酵母中觀察到的,在酵母中,TOR1和TOR2基因能夠編碼高度同源的Tor1和Tor2兩種蛋白。而在哺乳動(dòng)物中,也已發(fā)現(xiàn)存在結(jié)構(gòu)和功能保守的TOR,被稱為mTOR;mTOR存在于2種蛋白復(fù)合物中,包括mTORC1和mTORC2,其中,mTORC1主要作用是調(diào)節(jié)細(xì)胞生長(zhǎng)、凋亡、能量代謝和細(xì)胞自噬,mTORC2作用則是參與細(xì)胞骨架的重組和細(xì)胞存活有關(guān)〔23〕;mTOR信號(hào)通路在調(diào)節(jié)自噬中起著至關(guān)重要的作用,并且mTOR在響應(yīng)各種細(xì)胞狀況,例如血清饑餓、應(yīng)激刺激和生長(zhǎng)因子匱乏時(shí)受到抑制〔24〕。
LSD1的過(guò)度表達(dá)與卵巢癌的侵襲性和預(yù)后不良有關(guān),然而LSD1過(guò)表達(dá)與卵巢癌進(jìn)展相關(guān)的分子機(jī)制仍然未知〔25〕。有研究表明,LSD1過(guò)表達(dá)在婦科惡性腫瘤中主要通過(guò)去甲基化非依賴性方式降低p62蛋白穩(wěn)定性來(lái)促進(jìn)腫瘤發(fā)生和抑制腫瘤細(xì)胞的自噬。此外,由LSD1抑制引起的較高p62和自噬潮水平可以減少體內(nèi)腫瘤生長(zhǎng),表明LSD1是腫瘤中自噬的重要調(diào)節(jié)因子〔26〕。Wei等〔27〕的研究發(fā)現(xiàn)LSD1敲低能夠誘導(dǎo)卵巢癌細(xì)胞HO8910中LC3 Ⅱ蛋白的積累,溶酶體抑制劑治療后,在LSD1耗竭期間觀察到LC3 Ⅱ積累和自噬潮增加,呈現(xiàn)了LSD1敲低介導(dǎo)的LC3 Ⅱ積累參與自噬誘導(dǎo)過(guò)程。卵巢癌細(xì)胞中LSD1耗竭誘導(dǎo)的自噬依賴于mTOR失活,其特征在于降低p70核糖體蛋白S6激酶(p70S6K)(一種下游效應(yīng)物和mTOR標(biāo)記物)的磷酸化。此外,mTOR激活劑MHY1485復(fù)蘇了p70S6K的磷酸化水平以響應(yīng)LSD1缺陷。該研究首次揭示了敲低或抑制LSD1誘導(dǎo)HO8910卵巢癌細(xì)胞中的自噬潮。雖然血清饑餓和TOR可以有效激活自噬,但是LSD1的消耗明顯促進(jìn)了饑餓和TOR誘導(dǎo)的自噬,證明了LSD1是自噬激活的抑制劑。該研究尚需要通過(guò)進(jìn)一步的研究來(lái)闡明饑餓和TOR如何改變LSD1表達(dá)的潛在機(jī)制,以及揭示可能介導(dǎo)卵巢癌中自噬過(guò)程的LSD1依賴性表觀遺傳變化,為卵巢癌提供更為有效的治療方案。
前列腺癌是常見(jiàn)惡性腫瘤之一,近年來(lái),雄激素剝奪療法(ADT)一直是前列腺癌的一線治療方法。然而大多數(shù)患者最終都將進(jìn)展為雄激素不依賴的去勢(shì)抵抗型前列腺癌(CRPC)〔28〕。LSD1在前列腺癌中高表達(dá),其抑制劑可作為一種新的、有前景的抗癌策略;N-{(1S)-3-〔3-(反式-2-氨基環(huán)丙基)苯氧基〕-1-(芐基氨基甲?;?丙基}苯甲酰胺(NCL1),采用體外篩選與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)相似聚類相結(jié)合的方法,作為一種選擇性的LSD1抑制劑,已經(jīng)報(bào)道了NCL1能夠削弱LSD1去甲基化酶的活性并抑制未經(jīng)去勢(shì)的前列腺癌中癌細(xì)胞的增殖〔29〕。
mTOR的抑制可在營(yíng)養(yǎng)缺乏期間保護(hù)腫瘤細(xì)胞免于凋亡〔30〕,一些研究已經(jīng)證實(shí),自噬與前列腺癌細(xì)胞對(duì)ADT的抗藥性和磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)/mTOR信號(hào)傳導(dǎo)的抑制劑有關(guān)〔31〕,亦有研究證實(shí)抑制LSD1的活性刺激了去勢(shì)抵抗性前列腺癌細(xì)胞的自噬。為了證實(shí)CRPC中的這種現(xiàn)象,Etani等〔32〕通過(guò)使用透射電鏡(TEM)和蛋白質(zhì)印跡(WB)檢測(cè)LC3-Ⅱ表達(dá)及LysoTracker分析(一種非特異性自噬標(biāo)記物)來(lái)檢測(cè)人前列腺癌細(xì)胞(22Rv1)中的藥物誘導(dǎo)的自噬,該研究發(fā)現(xiàn)CRPC細(xì)胞中LSD1高表達(dá),并且可使用NCL1在體外減少細(xì)胞增殖來(lái)抑制LSD1活性,NCL1對(duì)LSD1的抑制導(dǎo)致啟動(dòng)子區(qū)域中H3K4me2修飾的增加并誘導(dǎo)P21蛋白表達(dá)的增加。此外,NCL1在體外和離體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡的共同機(jī)制為胱天蛋白酶依賴性細(xì)胞凋亡,CRPC中自噬的刺激通過(guò)LSD1保護(hù)細(xì)胞免受抗腫瘤劑的侵害。此外,當(dāng)與調(diào)節(jié)自噬的藥物組合治療時(shí),NCL1可能更有效地抑制CRPC生長(zhǎng)。CRPC患者接受ADT治療時(shí),神經(jīng)內(nèi)分泌分化的出現(xiàn)往往提示預(yù)后不良,并且與化療抵抗性有關(guān)〔33〕。NCL1可能在獲得去勢(shì)抗性后的早期階段具有CRPC的治療潛力,包括無(wú)疾病狀態(tài)表型。因而,該研究尚需進(jìn)一步研究以結(jié)合ADT及靶向藥物清楚地測(cè)試其治療潛力,有必要使用生物標(biāo)志物幫助選擇患者的前瞻性試驗(yàn),以評(píng)估CRPC患者的幾種藥物(包括NCL1)治療更新的價(jià)值。
綜上,自噬作為一種存在于真核細(xì)胞中普遍的生命現(xiàn)象,廣泛參與了許多生理病理過(guò)程;目前,LSD1與細(xì)胞自噬取得不少成就,圍繞于該方面的研究也越來(lái)越多,目前還需要更多研究來(lái)揭示LSD1調(diào)控及干預(yù)細(xì)胞中的自噬通路和藥物臨床試驗(yàn)等,提供更多有效臨床依據(jù),為人類疾病如腫瘤等的治療方案打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。