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        不同玉竹種質(zhì)資源多糖含量檢測(cè)及ISSR分析

        2022-11-28 13:11:54何海永羅蕓芳楊雨環(huán)王金鳳譚清群趙玳琳李繼業(yè)趙詩(shī)燦
        種子 2022年10期
        關(guān)鍵詞:資源

        何海永, 羅蕓芳, 楊雨環(huán), 王金鳳, 譚清群, 趙玳琳, 李繼業(yè), 呂 紅, 趙詩(shī)燦

        (1.貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所, 貴陽(yáng) 550009;2.貴州綠之源農(nóng)業(yè)技術(shù)服務(wù)有限公司, 貴陽(yáng) 550009;3.貴州醫(yī)科大學(xué), 貴陽(yáng) 550025; 4.遵義師范學(xué)院, 貴州 遵義 563006)

        玉竹[Polygonatumodoratum(Mill.) Druce]是百合科、黃精屬植物,為根狀莖,近圓柱形,根莖長(zhǎng)且節(jié)多,故稱玉竹,最早記載于《神農(nóng)本草經(jīng)》。是一種藥食兩用的中藥材,在多本醫(yī)書(shū)中均有記載,《本草綱目》中用于治療風(fēng)熱濕毒,《本草便讀》中記載其具有滋陰養(yǎng)肺的功效,現(xiàn)代醫(yī)學(xué)研究發(fā)現(xiàn),玉竹還具有治療糖尿病、抗腫瘤、增強(qiáng)免疫系統(tǒng)等作用[1-5];玉竹還可以做成藥膳茶飲,如玉竹茶、玉竹粥、玉竹銀耳湯等[6]。我國(guó)玉竹種質(zhì)資源非常豐富,市場(chǎng)上主要將玉竹分為栽培品種和野生品種,栽培品種有湘玉竹[7]、西玉竹、東玉竹和海門(mén)玉竹[8]4種,調(diào)查發(fā)現(xiàn),貴州各個(gè)地區(qū)均有大量野生玉竹資源分布。玉竹的化學(xué)成分主要為甾體皂苷、黃酮、多糖、揮發(fā)油、凝集素等[10-14],其中多糖為主要的生物活性物質(zhì),也是關(guān)注最多的方向之一。肖嵐等[2]在玉竹多糖對(duì)在體和離體肺癌腫瘤抑制作用中發(fā)現(xiàn),玉竹多糖具有顯著的抗腫瘤作用。單穎等[15]通過(guò)50只小鼠模型發(fā)現(xiàn),玉竹多糖可以通過(guò)提高超氧化物歧化酶活性來(lái)清除自由基,減輕機(jī)體的損傷以延緩衰老。季峰等[16]研究發(fā)現(xiàn),玉竹多糖可以提高血清胰島素水平,達(dá)到降血糖的效果;Yan等[17]通過(guò)老鼠模型發(fā)現(xiàn)玉竹多糖可以降低腸道菌群數(shù)從而減輕肥胖。姜曉坤等[18]探索并明確了玉竹多糖微波超聲提取法最佳提取條件;仇宏偉[19]對(duì)超聲波輔酶法提取玉竹多糖進(jìn)行優(yōu)化;陳銀霞[20]對(duì)玉竹水提取醇沉法探索和優(yōu)化;Yong[21]等對(duì)玉竹多糖堿提取法進(jìn)行探索和優(yōu)化。

        在玉竹遺傳分析方面,主要采取分子標(biāo)記技術(shù)建立系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)來(lái)進(jìn)行分類[22],潘清平等[23]探索發(fā)現(xiàn),ISSR分子標(biāo)記法可用于玉竹的品種鑒定和優(yōu)良品種選育研究;周鈺等[24]研究發(fā)現(xiàn),微衛(wèi)星標(biāo)記在玉竹遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)評(píng)價(jià)中具有較高的潛在價(jià)值。路放[25]對(duì)8個(gè)不同品種的玉竹采用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)可以從分子水平檢測(cè)出玉竹的差異,同時(shí)也證明不同產(chǎn)地玉竹具有較豐富的遺傳多樣性;郝久程等[26]研究發(fā)現(xiàn),海島種群的遺傳多樣性高于大陸種群,說(shuō)明獨(dú)立環(huán)境下的遺傳變異現(xiàn)象比開(kāi)放環(huán)境下更為明顯;卜靜等[27]利用ISSR法對(duì)12個(gè)不同地區(qū)野生玉竹種質(zhì)資源的遺傳結(jié)構(gòu)和親緣性進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)不同產(chǎn)地玉竹有較高的遺傳多樣性,各產(chǎn)地個(gè)體差異較大可能與氣候環(huán)境相關(guān);周曄等[28]用ISSR法鑒別中藥玉竹和小玉竹,為玉竹種質(zhì)資源的鑒定與區(qū)別奠定基礎(chǔ)。但關(guān)于貴州不同地區(qū)及周邊省份的野生玉竹地方資源多糖含量和遺傳多樣性研究相對(duì)較少。 本試驗(yàn)以來(lái)自貴州省不同地區(qū)的13個(gè)野生玉竹種質(zhì)資源和4個(gè)其他省份的玉竹種質(zhì)資源為材料,進(jìn)行不同玉竹種質(zhì)資源的多糖含量和群體遺傳結(jié)構(gòu)特點(diǎn)研究,以期為玉竹種質(zhì)資源的發(fā)掘、保護(hù)和利用提供參考。

        1 材料和方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        17個(gè)供試玉竹種質(zhì)資源中,有13個(gè)樣品來(lái)自貴州;2個(gè)來(lái)在四川??;1個(gè)來(lái)自湖北省;1個(gè)來(lái)自河南省,樣品具體來(lái)源詳見(jiàn)表1。2020年3月采集各地玉竹種質(zhì)資源的根莖,帶土進(jìn)行包裝,用冰袋保存運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室,再去除樣品的須根、莖桿后,將根莖洗凈后保存于-80 ℃超低溫冰箱中備用,記錄采集地點(diǎn)。

        表1 玉竹種質(zhì)資源的來(lái)源Table 1 Source of Polygonatum odoratum germplasm resources

        試驗(yàn)材料包括植物基因組DNA提取試劑盒(離心柱形)、2×TaqPCR Master Mix、核酸染料,均購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司、6×Loading buffer(藍(lán)色)購(gòu)自北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司、瓊脂糖(Agarose)和核酸提取液(24∶1)分別購(gòu)自BioWest和Solarbio公司、無(wú)水乙醇購(gòu)自重慶川東化工(集團(tuán))有限公司。

        1.2 試驗(yàn)器材

        試驗(yàn)器材包括TGrinder第三代變速組織研磨器套裝(天根生化科技(北京)有限公司)、thermo scientific/micro 17離心機(jī)(Denmark)、100-024 VAC PCR儀(新加坡BIO-RAD公司)、DYY-6 C型電泳儀(北京六一儀器廠)、凝膠成像系統(tǒng)BIO-RAD(美國(guó)BIO-RAD公司)、XK-1200型手掌式醫(yī)用離心機(jī)(江蘇新康醫(yī)療器械有限公司)、RADWAG天平(上海精密儀器儀表有限公司)、立式壓力滅菌鍋(上海博訊實(shí)業(yè)有限公司醫(yī)療設(shè)備廠)、制冰機(jī)IMS-30(常熟市圣海電器有限公司)、電熱恒溫鼓風(fēng)干燥箱(寧波江南儀器廠)、超純水機(jī)(四川沃特爾水處理設(shè)備有限公司)、MiniT-H 2 C三聯(lián)多用途金屬浴(成都浩康科技有限公司)、電子天平(奧豪斯儀器(上海)有限公司)。

        1.3 試驗(yàn)方法

        1.3.1玉竹多糖含量檢測(cè)

        將2020年3月保存?zhèn)溆玫挠裰窀o在恒溫干燥鼓風(fēng)箱內(nèi)60 ℃烘干3 d后送往遵義市精科信檢測(cè)有限公司,根據(jù)《中華人民共和國(guó)藥典》2020年第四版規(guī)定的相關(guān)檢測(cè)方法,在溫度為15 ℃、濕度為45%的條件下,采用紫外-分光光度法進(jìn)行多糖含量的檢測(cè)。

        1.3.2玉竹DNA提取

        取玉竹新鮮組織約100 mg,加入液氮充分研磨,將研磨好的粉末迅速轉(zhuǎn)移到預(yù)先裝有700 μL 65 ℃預(yù)熱緩沖液GP 1的離心管中(實(shí)驗(yàn)前在預(yù)熱的GP 1中加入巰基乙醇),迅速顛倒混勻后,將離心管放在65 ℃水浴鍋中水浴20 min,水浴過(guò)程中顛倒離心管數(shù)次以混合樣品;再加入700 μL氯仿,充分混勻,12 000 r/min離心5 min;將所得上層水相溶液轉(zhuǎn)入一個(gè)新的離心管中,加入700 μL緩沖液GP 2,充分混勻;將混勻的液體轉(zhuǎn)入吸附柱CB 3中,12 000 r/min離心30 s,棄掉廢液;向吸附柱CB 3中加入500 μL緩沖液GD(使用前先加入無(wú)水乙醇),12 000 r/min離30 s,倒掉廢液,將吸附柱CB 3放入收集管中;再向吸附柱CB 3中加入600 μL漂洗液PW(使用前先加入無(wú)水乙醇),12 000 r/min離心30 s,倒掉廢液,將吸附柱CB 3放入收集管中(重復(fù)操作一次);將吸附柱CB 3放回收集管中12 000 r/min離心2 min,倒掉廢液。將吸附柱CB 3置于室溫放置數(shù)分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余的漂洗液;將吸附柱CB 3轉(zhuǎn)入一個(gè)干凈的離心管中,向吸附膜的中間部位懸空滴加100 μL洗脫緩沖液TE,室溫放置2~5 min,12 000 r/min離心2 min,將溶液收集到離心管中。

        1.3.3引物篩選

        試驗(yàn)所用引物選用哥倫比亞大學(xué)公布的100條通用引物序列中的41條,由擎科生物公司合成。選用4個(gè)凝膠條帶清晰的DNA樣品對(duì)引物進(jìn)行篩選,共篩選出11條較清晰的引物(表2)。

        表2 ISSR擴(kuò)增引物序列Table 2 ISSR amplification primer sequence

        1.3.4ISSR-PCR擴(kuò)增

        根據(jù)所選用的2×TaqPCR Master Mix確定PCR反應(yīng)體系和擴(kuò)增程序,反應(yīng)體系為25 μL:mix 12.5 μL,模板1 μL,引物1 μL,雙蒸水10.5 μL。反應(yīng)程序的退火溫度根據(jù)引物的Tm值設(shè)定,94 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性15 s,50 ℃退火20 s,72 ℃延伸60 s,變性到延伸進(jìn)行34個(gè)循環(huán),72 ℃再延伸7 min,最后4 ℃保持。

        1.3.5凝膠電泳

        取PCR產(chǎn)物與2.0%的瓊脂糖凝膠于120 V電泳85 min,制膠時(shí)加入TS-GelRed核酸凝膠染料用于對(duì)電泳條帶染色。電泳結(jié)束后,用凝膠成像儀在紫外條件觀察、拍照。

        1.3.6ISSR分析

        將有條帶出現(xiàn)的顯性位點(diǎn)用“1”表示,無(wú)條帶出現(xiàn)的隱形位點(diǎn)用“0”表示,建立“1”和“0”的數(shù)據(jù)矩陣,采用NTSYS 2.10聚類軟件計(jì)算遺傳相似系數(shù),再根據(jù)遺傳相似系數(shù)利用UPGMA法建立系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 不同來(lái)源玉竹多糖含量

        檢測(cè)結(jié)果(表3)顯示,17份玉竹多糖含量分別為9.33%、9.31%、9.18%、9.05%、8.37%、8.35%、8.33%、8.28%、7.74%、7.67%、6.43%、6.41%、6.38%、6.31%、6.25%、6.24%和6.12%。參試材料的多糖含量均高于《中華人民共和國(guó)藥典》2020版四部所規(guī)定的藥用玉竹多糖含量(不得低于6%)。玉竹多糖含量最高的是來(lái)自四川省瀘州市敘永縣的13號(hào)(9.33%);最低的是來(lái)自貴州省遵義市湄潭縣茅坪鎮(zhèn)的15號(hào)(6.12%)。17份玉竹多糖含量平均值為7.63%,其中2號(hào)、3號(hào)、4號(hào)、6號(hào)、7號(hào)、8號(hào)、11號(hào)、12號(hào)、13號(hào)和14號(hào)均高于平均值,表明這幾份玉竹種質(zhì)資源的品質(zhì)相對(duì)較好。

        表3 不同玉竹種質(zhì)資源的多糖含量Table 3 Polysaccharide content of different germplasm resources of Polygonatum odoratum

        對(duì)不同玉竹種質(zhì)資源多糖含量進(jìn)行Duncan新復(fù)極差分析,結(jié)果表明,在5%顯著水平下,不同玉竹種質(zhì)資源之間的多糖含量均呈顯著性差異。在1%顯著水平下,5號(hào)貴州遵義綏陽(yáng)玉竹和1號(hào)貴州畢節(jié)七星關(guān)玉竹,多糖含量相差不大,二者之間差異不顯著,其余各個(gè)品種差異顯著。

        2.2 多態(tài)位點(diǎn)分析

        將初篩的11條引物分別與17個(gè)樣品模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,篩選出條帶多且清晰的2條引物(表4),將篩選出來(lái)的2條引物再次與17個(gè)模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。對(duì)篩選出的2個(gè)ISSR引物的PCR產(chǎn)物用2%的瓊脂糖凝膠進(jìn)行85 min的電泳,并用凝膠電泳成像系統(tǒng)在紫外條件下觀察并拍照保存。如圖1所示,2條引物共擴(kuò)增出27組條帶,其中27組為多態(tài)性條帶,多態(tài)性條帶比例為100%,擴(kuò)增片段均在200~3 000 bp之間。同一引物對(duì)不同來(lái)源的玉竹樣品的擴(kuò)增條帶不完全相同,說(shuō)明這兩條引物能較好地反映17個(gè)樣品的多態(tài)性。

        表4 ISSR引物擴(kuò)增條帶數(shù)Table 4 Number of bands amplified by ISSR primers

        將引物單獨(dú)使用時(shí),能將一些玉竹樣本與其他玉竹樣本區(qū)分開(kāi),如圖1B所示,4號(hào)玉竹在1 200 bp處與其他玉竹有區(qū)別;8號(hào)玉竹在500 bp處與其他玉竹有區(qū)別。將擴(kuò)增出的條帶放在一起對(duì)比時(shí),也能看出玉竹之間的相似和區(qū)別,如圖1 A,7號(hào)玉竹與5號(hào)、11號(hào)、12號(hào)在250 bp處都有條帶,與5號(hào)、6號(hào)、11號(hào)、12號(hào)、15號(hào)、17號(hào)玉竹在500 bp處都有條帶,與1號(hào)、2號(hào)、4號(hào)、5號(hào)、6號(hào)、7號(hào)、8號(hào)、9號(hào)、11號(hào)、12號(hào)、13號(hào)、15號(hào)玉竹在1 200 bp處都有條帶,這些條帶顯示7號(hào)玉竹與其他玉竹在多態(tài)性上存在差異。同樣,在圖1 B中6號(hào)玉竹和7號(hào)玉竹在條帶的多態(tài)位點(diǎn)上相同,推測(cè)6號(hào)玉竹和7號(hào)玉竹的遺傳背景可能相同。

        圖1 引物UBC 844(A)和引物UBC 845(B)電泳圖 Fig.1 The electrophoresis diagram of primer UBC 844(A), the electrophoresis diagram of primer UBC 845(B)

        2.3 遺傳相似性分析

        使用NTSYSps 2.10 e軟件對(duì)17份玉竹種質(zhì)資源進(jìn)行聚類分析,在0.56至0.63處分為三大類。結(jié)果(圖2)表明,第Ⅰ類群含有10個(gè)品種,為1號(hào)、2號(hào)、3號(hào)、9號(hào)、10號(hào)、13號(hào)、15號(hào)、16號(hào)、17號(hào),占總數(shù)的58.82%,7個(gè)品種來(lái)自貴州,其余3個(gè)分別來(lái)自四川和湖北。其中親緣性最近的1號(hào)和15號(hào)分別來(lái)自貴州省畢節(jié)市七星關(guān)區(qū)、貴州省畢節(jié)市納雍縣;2號(hào)和13號(hào)分別來(lái)自四川省雅安市石棉縣、四川省瀘州市敘永縣;9號(hào)和17號(hào)分別來(lái)自貴州省畢節(jié)市大方縣、貴州省貴陽(yáng)市花溪區(qū)。第Ⅱ類群含5個(gè)品種,為5號(hào)、6號(hào)、7號(hào)、11號(hào)、12號(hào)、14號(hào),占總數(shù)的29.41%,均來(lái)自貴州。親緣性最近的11號(hào)、12號(hào)分別來(lái)自貴州省貴陽(yáng)市白云區(qū)和貴州省黔西南州興義市萬(wàn)峰林鎮(zhèn)。第Ⅲ類群只有1個(gè)品種為4號(hào),占總數(shù)的5.88%,來(lái)自河南省洛陽(yáng)市蒿縣。

        圖2 引物UBC 845系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) Fig.2 The phylogenetic tree of primer UBC 845

        用NTSYS 2.10軟件分析ISSR標(biāo)記的0,1數(shù)據(jù)矩陣,計(jì)算出17份玉竹的遺傳相似系數(shù)在0.163 8~0.923 0之間(表6),平均遺傳相似系數(shù)為0.639 6,說(shuō)明17份玉竹之間存在遺傳分化。其中1號(hào)與15號(hào),2號(hào)與13、15號(hào),10號(hào)與17號(hào),11號(hào)與12號(hào),13號(hào)與16號(hào),15號(hào)與16號(hào)遺傳相似系數(shù)最大為0.923 0,說(shuō)明親緣性最近。6號(hào)與8號(hào)的遺傳相似系數(shù)最小,為0.163 8,說(shuō)明親緣性最遠(yuǎn)。

        表6 不同玉竹種質(zhì)資源遺傳相似系數(shù)Table 6 Genetic similarity coefficients of different Polygonatum odoratum germplasm resources

        3 討論與結(jié)論

        參試的17份玉竹的多糖含量范圍為6.12%~9.33%,玉竹多糖含量極差分析表明,不同來(lái)源的玉竹多糖含量之間絕大多數(shù)都存在顯著差異,其中在1%的顯著水平下只有1號(hào)和5號(hào)玉竹的多糖含量沒(méi)有顯著差異。不同的玉竹多糖提取方法所檢測(cè)的多糖含量不同,本次玉竹檢測(cè)所用方法為水提醇法,并非玉竹多糖提取最高效的方法;同一種方法對(duì)不同產(chǎn)地的玉竹的提取效率也不同。檢測(cè)結(jié)果表明,不同地區(qū)的玉竹多糖含量有所區(qū)別,貴州省畢節(jié)市大方縣的6號(hào)玉竹、四川省瀘州市敘永縣的13號(hào)玉竹、湖北省宜昌市五峰土家族自治縣的3號(hào)玉竹、河南省洛陽(yáng)市蒿縣的4號(hào)玉竹的多糖含量分別為9.31%、9.33%、8.28%、9.05%,具有明顯的差異。同一省份不同地區(qū)的玉竹多糖含量也有一定的差異,貴州省畢節(jié)市大方縣的6號(hào)玉竹、貴陽(yáng)市的12號(hào)玉竹、安順市的14號(hào)玉竹的多糖含量分別為9.31%、8.37%、9.18%,也具有顯著的差異。同一省份同一地區(qū)的玉竹多糖含量也有區(qū)別,貴州省畢節(jié)市大方縣的6號(hào)、8號(hào)和9號(hào)玉竹的多糖含量分別為9.31%、8.35%和6.41%,差異也同樣明顯。總之,來(lái)自不同省份、同一省份的不同地區(qū)或同一地區(qū)的不同玉竹種質(zhì)資源之間的多糖含量都有顯著差異,這與劉玉鳳等[29]的研究結(jié)果相一致。

        參試玉竹的平均遺傳相似系數(shù)為0.636 9,多態(tài)性條帶占比為100%,表明不同玉竹種質(zhì)資源具有較高的遺傳相似性,同時(shí)具有較豐富的遺傳多樣性。來(lái)自同一地區(qū)的玉竹大多數(shù)會(huì)聚為一類,1號(hào)與15號(hào)、10號(hào)與17號(hào)、11號(hào)與12號(hào)、15號(hào)與16號(hào)都來(lái)自貴州省、2號(hào)和13來(lái)自四川省,其遺傳相似系數(shù)均為0.923 0,親緣性最近。但也有例外,四川省13號(hào)與貴州省的16號(hào),遺傳相似系數(shù)為0.923 0,親緣性也為最近。系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)將玉竹種質(zhì)資源在遺傳相似系數(shù)0.56處分為三類,除了第Ⅰ類群中的有省份混雜外,其余兩類都是來(lái)在同一省份。就系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)而言,親緣性最近的都是來(lái)自同一省份的玉竹種質(zhì)資源。這與卜靜等[27]在不同產(chǎn)地野生玉竹種質(zhì)資源多樣性與親緣關(guān)系的ISSR分析中所得的結(jié)果相似。因此,玉竹的遺傳親緣性與生長(zhǎng)地區(qū)之間有一定的相關(guān)性,也可能與人類活動(dòng)導(dǎo)致玉竹種質(zhì)資源的遷移有一定的關(guān)系。

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