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        基于文獻(xiàn)計(jì)量的國(guó)內(nèi)水稻耐鹽性研究態(tài)勢(shì)分析

        2022-11-26 06:54:32周雨晴劉永昊SHAHIDHussain劉高生戴其根
        關(guān)鍵詞:水稻研究

        王 洋,張 瑞,周雨晴,劉永昊,SHAHID Hussain,劉高生,戴其根

        (揚(yáng)州大學(xué)農(nóng)學(xué)院,江蘇揚(yáng)州 225009)

        0 引言

        據(jù)聯(lián)合國(guó)教科文組織和糧農(nóng)組織不完全統(tǒng)計(jì),中國(guó)鹽堿地面積為9913萬hm2[1]。中國(guó)成為繼澳大利亞和俄羅斯之后世界第三大鹽堿地分布地區(qū)[2],鹽堿地作為重要的土地后備資源具有巨大農(nóng)業(yè)和經(jīng)濟(jì)發(fā)展?jié)摿?,其改良與利用是實(shí)現(xiàn)中國(guó)農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的重要舉措[3]。水稻是沿海灘涂和鹽堿地改良的首選糧食作物,研究水稻耐鹽機(jī)理對(duì)提高鹽堿地水稻產(chǎn)量有重要意義,有利于進(jìn)一步保障國(guó)內(nèi)糧食安全[4]。

        21世紀(jì)以來,現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)在各個(gè)領(lǐng)域(包括水稻鹽脅迫領(lǐng)域)內(nèi)發(fā)展迅猛,相關(guān)文獻(xiàn)積累量也呈爆炸式增長(zhǎng)[5]。文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)方法可以對(duì)科技論文進(jìn)行質(zhì)與量的綜合評(píng)價(jià)[6],它是一門以整個(gè)人類知識(shí)體系為對(duì)象,運(yùn)用定量分析和計(jì)算技術(shù)對(duì)社會(huì)知識(shí)的知識(shí)能力和知識(shí)的社會(huì)關(guān)系進(jìn)行綜合研究的交叉學(xué)科[7]。此方法已廣泛應(yīng)用于作物學(xué)、生態(tài)環(huán)境、食品科學(xué)、土壤學(xué)等領(lǐng)域[8-15]。本研究用CiteSpace和VOSviewer對(duì)近年來國(guó)內(nèi)在水稻鹽脅迫領(lǐng)域內(nèi)的高質(zhì)量論文進(jìn)行文獻(xiàn)分析,整理國(guó)內(nèi)在水稻鹽脅迫研究方面的探索路徑與研究熱點(diǎn)等,以期為今后的水稻鹽脅迫領(lǐng)域的研究提供參考。

        1 資料與方法

        1.1 數(shù)據(jù)來源

        以國(guó)內(nèi)資源最豐富和用戶量最大的中國(guó)知網(wǎng)(CNKI)作為數(shù)據(jù)庫(kù)為數(shù)據(jù)源[16],檢索方式為高級(jí)檢索,以“鹽脅迫”和“水稻”為主題詞,時(shí)間跨度為1990—2020年,初步檢索得到611篇論文。為保證文章質(zhì)量,引文索引為北大核心期刊和CSCD收錄論文,檢索條件為(((主題%='水稻'or題名%='水稻'or title='水稻'or v_subject='水稻')AND(主題%='鹽脅迫'or題名%='鹽脅迫'or title='鹽脅迫'or v_subject='鹽脅迫'))AND(是否基金文獻(xiàn)='Y'))AND((年 Between('1992','2020'))AND((核心期刊='Y')OR(CSCD期刊='Y'))),之后經(jīng)過人工識(shí)別,篩選剔除重復(fù)或者相關(guān)性較弱的,最后得到相關(guān)文獻(xiàn)442篇。

        1.2 研究方法

        輸出參考文獻(xiàn)格式為Refworks格式,后在CiteSpace軟件中轉(zhuǎn)化為WOS格式。機(jī)構(gòu)名稱皆只使用該期刊文獻(xiàn)的第一機(jī)構(gòu)單位,機(jī)構(gòu)名稱統(tǒng)一為機(jī)構(gòu)的一級(jí),例如將“浙江大學(xué)農(nóng)學(xué)系”改為“浙江大學(xué)”。

        以文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)為基礎(chǔ)對(duì)水稻鹽脅迫領(lǐng)域的科學(xué)文獻(xiàn)進(jìn)行評(píng)估。文獻(xiàn)計(jì)量分析是近年來對(duì)特定領(lǐng)域內(nèi)的結(jié)構(gòu)進(jìn)行回顧、評(píng)估和客觀表示的最常用方法之一[17]。用荷蘭萊頓大學(xué)的Nees Jan van Eck和Ludo Waltman開發(fā)的VOSviewer_1.6.16和由英國(guó)籍華裔、美國(guó)德雷塞爾大學(xué)陳超美教授開發(fā)的CiteSpace 5.7.R5繪制關(guān)鍵詞共現(xiàn)等科學(xué)知識(shí)圖譜[18],Origin 2018pro作圖。CiteSpace和VOSviewer可用來對(duì)一個(gè)研究領(lǐng)域或一個(gè)學(xué)科的學(xué)術(shù)文獻(xiàn)進(jìn)行可視化分析[19]。其網(wǎng)絡(luò)視圖可以直觀地反映出分析數(shù)據(jù)權(quán)重大小和分析數(shù)據(jù)之間的相互關(guān)系,各種網(wǎng)絡(luò)圖譜不同節(jié)點(diǎn)代表作者/關(guān)鍵詞等要素,節(jié)點(diǎn)越大與字體越大代表出現(xiàn)次數(shù)越多,節(jié)點(diǎn)間的連線代表節(jié)點(diǎn)間研究?jī)?nèi)容相似或有合作關(guān)系,并用統(tǒng)一顏色表示[20]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 水稻鹽脅迫方面研究文獻(xiàn)年度發(fā)文量變化

        從圖1的水稻鹽脅迫方面每年的文獻(xiàn)發(fā)文量可知,1990—2000年國(guó)內(nèi)水稻鹽脅迫方面文獻(xiàn)發(fā)文量處于緩慢增長(zhǎng)階段,期刊文獻(xiàn)總發(fā)文量為21篇;2001—2010年文獻(xiàn)發(fā)文量處于快速增加階段,期間期刊文獻(xiàn)總發(fā)表量為132篇;2011—2020年水稻鹽脅迫方面論文產(chǎn)出量呈爆炸式增長(zhǎng),期間期刊論文總發(fā)表量為289篇。

        圖1 國(guó)內(nèi)水稻鹽脅迫領(lǐng)域每年文獻(xiàn)發(fā)文情況

        2.2 水稻鹽脅迫領(lǐng)域作者合作共現(xiàn)分析

        CiteSpace依據(jù)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)和聚類的清晰度,提供了聚類模塊值(modularity,Q值)和聚類平均輪廓值(silhouette,S值)2個(gè)參數(shù)指標(biāo),它們可以作為評(píng)判繪制效果的一個(gè)依據(jù)。一般情況下,Q>0.3意味著聚類結(jié)構(gòu)顯著,S>0.5聚類就是合理的,S>0.7意味著聚類是令人信服的[21]。從圖2可知,關(guān)鍵詞聚類分析圖的聚類模塊值為0.9546,表明該關(guān)鍵詞聚類是合理的;聚類平均輪廓值為1,表明該關(guān)鍵詞聚類是令人信服的。每一個(gè)聚類都代表一個(gè)機(jī)構(gòu)單位,字體越大,表示該作者在水稻鹽脅迫領(lǐng)域貢獻(xiàn)越大,從圖2A能夠看出研究者在所處機(jī)構(gòu)內(nèi)各自組成穩(wěn)定的合作關(guān)系,其中對(duì)水稻鹽脅迫研究較多、貢獻(xiàn)較大的團(tuán)隊(duì)有于志晶、代金英、劉健、劉君、劉向東等。

        圖2 水稻鹽脅迫研究作者聚類共現(xiàn)分析圖

        VOSviewer分析了在水稻鹽脅迫領(lǐng)域發(fā)文量至少3篇以上的作者,由圖2B可知,水稻鹽脅迫領(lǐng)域作者共現(xiàn)分析圖中共顯示32個(gè)作者群,這32個(gè)作者群中的作者都是1990—2020年中每年平均發(fā)文量為3篇以上的作者。莊杰云團(tuán)隊(duì)和王仁雷團(tuán)隊(duì)是進(jìn)行水稻鹽脅迫研究較早的團(tuán)隊(duì);2015年左右,趙宏偉團(tuán)隊(duì)和張所兵團(tuán)隊(duì)是進(jìn)行水稻鹽脅迫研究的中堅(jiān)力量;近幾年戴其根團(tuán)隊(duì)、謝先芝團(tuán)隊(duì)、張均華團(tuán)隊(duì)是進(jìn)行水稻鹽脅迫研究的后起之秀;而劉國(guó)振團(tuán)隊(duì)、周鴻凱團(tuán)隊(duì)和張燕紅團(tuán)隊(duì)進(jìn)行水稻鹽脅迫研究長(zhǎng)達(dá)10年之久。圖2C展示作者之間的合作關(guān)系,趙宏偉團(tuán)隊(duì)和鄒德堂團(tuán)隊(duì)合作最多,而孫健和張麗麗團(tuán)隊(duì)在2010年前后合作較多。

        2.3 水稻鹽脅迫領(lǐng)域關(guān)鍵詞聚類共現(xiàn)分析

        由圖3A可知,關(guān)鍵詞聚類分析圖的聚類模塊值為0.686,表明該關(guān)鍵詞聚類是合理的;聚類平均輪廓值為0.9243,表明該關(guān)鍵詞聚類是令人信服的。關(guān)鍵詞聚類中數(shù)字越小表示聚類中包含的關(guān)鍵詞越多,每個(gè)聚類都是由多個(gè)緊密相關(guān)的詞組成。從圖3可知,關(guān)鍵詞聚類為10個(gè)類群,按數(shù)字從小到大分別為鹽脅迫、生物信息學(xué)、耐鹽性、非生物脅迫、干旱脅迫、種子萌發(fā)、植物、水稻幼苗、生長(zhǎng)發(fā)育和轉(zhuǎn)錄因子。

        圖3 水稻鹽脅迫文獻(xiàn)關(guān)鍵詞聚類共現(xiàn)分析圖

        關(guān)鍵詞聚類共現(xiàn)分析可用于發(fā)現(xiàn)該領(lǐng)域的研究方向、識(shí)別論文的研究主題和查找某一研究方向的經(jīng)典文獻(xiàn)等[13]。1990—2020年在水稻鹽脅迫領(lǐng)域共1836個(gè)關(guān)鍵詞,重復(fù)次數(shù)為4次以上的關(guān)鍵詞定為高頻詞,統(tǒng)計(jì)出158個(gè)高頻詞,去掉高頻詞中的英文重復(fù)部分,在簡(jiǎn)化后的關(guān)鍵詞基礎(chǔ)上繪制1990—2020年水稻鹽脅迫領(lǐng)域關(guān)鍵詞共現(xiàn)的科學(xué)知識(shí)圖譜[23],結(jié)果劃分為8個(gè)聚類(圖3B),分別代表該領(lǐng)域內(nèi)8個(gè)研究方向:(1)基因表達(dá)(黃色聚類),關(guān)鍵詞有免疫印跡、啟動(dòng)子、表達(dá)模式、轉(zhuǎn)錄因子和表達(dá)譜等;(2)脯氨酸(深藍(lán)色聚類),關(guān)鍵詞有滲透脅迫、鹽堿脅迫和抗逆等;(3)轉(zhuǎn)基因水稻(粉紅色聚類),關(guān)鍵詞有冷脅迫、農(nóng)藝性狀和滲透調(diào)節(jié)等;(4)水稻(綠色聚類),關(guān)鍵詞有耐鹽性、種質(zhì)資源、綜合評(píng)價(jià)和苗期等;(5)鹽脅迫(紫色聚類),關(guān)鍵詞有水稻幼苗、抗氧化酶、酶活性、種子萌發(fā)和雜草稻等;(6)非生物脅迫(紅色聚類),關(guān)鍵詞有產(chǎn)量、品質(zhì)和研究進(jìn)展等;(7)光合作用(天藍(lán)色聚類),關(guān)鍵詞有葉綠素?zé)晒?、水楊酸和生理特性等;?)粳稻(橘黃色聚類),關(guān)鍵詞有SSR標(biāo)記和誘抗劑等。

        2.4 水稻鹽脅迫領(lǐng)域高被引文獻(xiàn)分析

        由表1可知,國(guó)內(nèi)水稻鹽脅迫領(lǐng)域相關(guān)文獻(xiàn)中被引次數(shù)最高的是《熱帶亞熱帶植物學(xué)報(bào)》的《干旱、鹽和低溫脅迫對(duì)水稻幼苗脯氨酸含量的影響》,被引頻次為402次;其次是來自《中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)》的《鹽脅迫下鈣對(duì)水稻幼苗光合作用及相關(guān)生理特性的影響》,被引頻次為245次。從高被引文獻(xiàn)的發(fā)表時(shí)間來看,這些文獻(xiàn)中80%的文獻(xiàn)是2000—2010年發(fā)表。被引頻次前10位的文獻(xiàn)發(fā)表單位皆為高校和科研院所,且高校和科研院所所在地均為灘涂鹽堿地和鹽堿地較多的省份。高被引文獻(xiàn)著眼于鹽脅迫下水稻滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)、生理特性和光合特性等生理生化方面,可以看出生理生化研究在水稻鹽脅迫研究領(lǐng)域的重要性。

        表1 1990—2020年高被引文獻(xiàn)及期刊來源

        2.5 水稻鹽脅迫領(lǐng)域科研單位分析

        由圖4可知,湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)、揚(yáng)州大學(xué)、廣東海洋大學(xué)、上饒師范學(xué)院、吉林師范大學(xué)、河北師范大學(xué)、江蘇沿海地區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所、湖北大學(xué)、東北農(nóng)業(yè)大學(xué)和中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院在水稻鹽脅迫領(lǐng)域研究較多,各個(gè)機(jī)構(gòu)單位在水稻鹽脅迫方面的發(fā)文量依排名先后而遞減。水稻鹽脅迫研究機(jī)構(gòu)單位和地域關(guān)系很大,多為水稻種植地區(qū)的沿海省份和鹽堿地面積較大的省份。

        圖4 1990—2020年高被引機(jī)構(gòu)單位共現(xiàn)圖

        2.6 水稻鹽脅迫領(lǐng)域關(guān)鍵詞魚眼圖分析

        從圖5可知,關(guān)鍵詞聚類分析圖的聚類模塊值為0.686,表明該關(guān)鍵詞聚類是合理的;聚類平均輪廓值為0.9243,表明該關(guān)鍵詞聚類是令人信服的。魚眼圖的分類關(guān)鍵詞與圖3的關(guān)鍵詞聚類一樣,區(qū)別在于魚眼圖將一個(gè)聚類群中的各個(gè)關(guān)鍵詞按出現(xiàn)年份先后從左到右依次排列(時(shí)間線圖)[24]。從圖5可以看出,近年來在水稻鹽脅迫領(lǐng)域方面?zhèn)戎赜诟瞪L(zhǎng)、礦質(zhì)元素、基因家族表達(dá)分析、不同水稻品種的耐鹽性、水稻苗期耐鹽性、基因編輯技術(shù)在水稻耐鹽育種方面的應(yīng)用、鈉鉀平衡等方面的研究。

        圖5 1990—2020年關(guān)鍵詞魚眼圖

        2.7 水稻鹽脅迫領(lǐng)域關(guān)鍵詞突現(xiàn)分析

        關(guān)鍵詞突現(xiàn)分析可以探測(cè)出頻次變化率高的關(guān)鍵詞,確定研究領(lǐng)域的前沿內(nèi)容[25]。通過關(guān)鍵詞突現(xiàn)分析得到水稻鹽脅迫領(lǐng)域中排名前20位的突現(xiàn)詞(圖6),水稻鹽脅迫研究初期主要突現(xiàn)詞是相對(duì)鹽害率;之后是種子引發(fā)、籽粒充實(shí)和細(xì)胞質(zhì)膜透性;近幾年的突現(xiàn)詞為非生物脅迫、堿脅迫、轉(zhuǎn)錄因子和基因表達(dá)。

        圖6 1990—2020年關(guān)鍵詞突現(xiàn)圖

        3 結(jié)論

        通過科學(xué)知識(shí)圖譜可視化分析得出國(guó)內(nèi)水稻鹽脅迫高質(zhì)量文獻(xiàn)產(chǎn)出經(jīng)歷了指數(shù)型增長(zhǎng)的過程,即從1990—2000年處于緩慢增長(zhǎng)階段,2001—2010年處于快速增加階段,2011—2020年產(chǎn)出量呈爆炸式增長(zhǎng)。從關(guān)鍵詞共現(xiàn)聚類將水稻鹽脅迫領(lǐng)域分類10大類,分別為鹽脅迫、生物信息學(xué)、耐鹽性、非生物脅迫、干旱脅迫、種子萌發(fā)、植物、水稻幼苗、生長(zhǎng)發(fā)育和轉(zhuǎn)錄因子。從作者和機(jī)構(gòu)文獻(xiàn)產(chǎn)出量看,趙宏偉、劉國(guó)振和周鴻凱團(tuán)隊(duì)的文獻(xiàn)產(chǎn)出量最多,趙宏偉團(tuán)隊(duì)和鄒德堂團(tuán)隊(duì)合作關(guān)系多且久遠(yuǎn),從水稻鹽脅迫文獻(xiàn)被引機(jī)構(gòu)單位來看,研究單位以高校和科研所單位為主體,且大多地處沿海地區(qū)和鹽堿地地區(qū)。通過魚眼圖和突現(xiàn)分析可以及時(shí)抓住水稻鹽脅迫研究熱點(diǎn),本研究表明,水稻根系研究、生理特性研究、基因表達(dá)研究和基因編輯技術(shù)育種等方面是水稻鹽脅迫研究的主要方向。

        4 討論

        中國(guó)鹽堿土面積大、分布廣,根據(jù)各地區(qū)不同氣候因素以及地區(qū)分布,鹽漬土可以分為濱海鹽堿土和灘涂、黃淮海平原鹽漬土、東北松嫩平原鹽堿土、半荒漠內(nèi)陸鹽堿土及草原鹽漬區(qū)[26-27]。開發(fā)利用鹽堿土能夠保障耕地資源,增加糧食儲(chǔ)備。水稻是改良鹽堿地的先鋒作物,國(guó)內(nèi)外在水稻耐鹽堿研究方面也取得了一定成果,但仍需進(jìn)一步研究、完善、優(yōu)化整合,形成一個(gè)完整的體系,可以從以下方面開展工作:(1)深度開展水稻全生育期耐鹽機(jī)理研究,水稻耐鹽機(jī)理是提高水稻耐鹽性的基礎(chǔ),本研究表明很多水稻耐鹽性研究都在芽期和苗期,對(duì)全生育期研究相對(duì)較少,產(chǎn)量是糧食生產(chǎn)的重要結(jié)果,水稻耐鹽機(jī)理應(yīng)該圍繞產(chǎn)量結(jié)果展開;(2)加強(qiáng)水稻耐鹽基因的發(fā)掘,鑒定能夠同時(shí)控制不同生長(zhǎng)階段、遺傳性好且穩(wěn)定的優(yōu)異耐鹽基因[4];(3)加強(qiáng)耐鹽堿水稻種質(zhì)創(chuàng)新和新品種選育,篩選耐鹽水稻品種是提高鹽脅迫下水稻產(chǎn)量的重要途徑;(4)國(guó)內(nèi)各地氣候、鹽堿土理化性質(zhì)不同,各地研究團(tuán)隊(duì)?wèi)?yīng)篩選適合本地區(qū)生長(zhǎng)的耐鹽水稻品種及其他作物,并研究其耐鹽機(jī)理,提高鹽堿地作物產(chǎn)量;(5)加強(qiáng)鹽堿土改良,土壤是作物生長(zhǎng)的基礎(chǔ),鹽堿土改良與耐鹽堿水稻相結(jié)合才能更好地提高作物產(chǎn)量;(6)土壤鹽漬化地區(qū)的各耐鹽堿研究團(tuán)隊(duì),及全國(guó)的耐鹽堿研究團(tuán)隊(duì)加強(qiáng)合作、交流,開展深入、系統(tǒng)的研究,為所在地區(qū)及全國(guó)的鹽堿地農(nóng)業(yè)生產(chǎn)貢獻(xiàn)智慧;(7)耐鹽研究成果系統(tǒng)化、理論化,最后通俗化;(8)加強(qiáng)農(nóng)業(yè)推廣,一切耐鹽性研究都是為了農(nóng)業(yè)生產(chǎn)實(shí)踐,加強(qiáng)耐鹽研究成果的推廣是提高鹽堿地作物產(chǎn)量的最后一環(huán)。

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