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        circKEAP1通過影響miR-661/LIF軸促進骨肉瘤細胞增殖和遷移*

        2022-11-01 03:25:30黃曉文張能華陳興英費春霞徐屹寧
        中國病理生理雜志 2022年10期

        黃曉文, 張能華△, 陳興英, 袁 梅, 費春霞, 徐屹寧

        (1浙江中醫(yī)藥大學附屬嘉興中醫(yī)院檢驗科,浙江 嘉興 314001;2浙江大學醫(yī)學院附屬邵逸夫醫(yī)院骨科,浙江 杭州 310020)

        骨肉瘤是來源于間葉組織最常見的原發(fā)性惡性骨腫瘤,好發(fā)于青少年及兒童,主要表現(xiàn)為骨骼或關節(jié)處的腫脹感與疼痛,活動后加劇,部分可觸及腫塊[1]。骨肉瘤的發(fā)病率約為3/100 萬,占全世界相關年齡段腫瘤的2.4%[2]。過去幾十年來,隨著新輔助放化療結合手術的應用,骨肉瘤的治療方式有了顯著的進步。盡管如此,骨肉瘤的患者預后僅有微小的提升。而伴有化療耐藥與腫瘤組織轉(zhuǎn)移的骨肉瘤患者,其五年生存率僅為15%~30%[3]。骨肉瘤治療目前尚無特異性的有效靶點。在體外水平尋找抑制骨肉瘤細胞增殖與遷移的靶點,是后續(xù)開發(fā)新型有效的臨床治療藥物首要與關鍵步驟。

        與傳統(tǒng)的線性RNA 不同,環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)是一種呈現(xiàn)環(huán)狀閉合結構的非編碼RNA,不具備5'末端帽子和3'末端多聚腺苷酸尾巴,且有更高的穩(wěn)定性,表現(xiàn)為對RNA 酶更高的耐受[4]。circRNA 廣泛存在于機體各個組織器官中,在特定條件下具有一定的功能,與其他RNA 或蛋白共同維持生物體內(nèi)微環(huán)境的穩(wěn)態(tài)。circRNA 可與特定的蛋白相互作用,從而影響靶蛋白功能[5]。少部分circRNA被證明具有翻譯功能,能夠翻譯蛋白或肽段行使其生物學功能[6-7]。此外,circRNA 存在廣泛的微小RNA(microRNA,miRNA,miR)的結合位點,能夠海綿吸附 miRNA 并調(diào)節(jié)其下游靶基因[8]。miRNA 是一類不具備編碼功能的短核苷酸單鏈RNA 分子,參與轉(zhuǎn)錄后基因表達調(diào)控,在腫瘤發(fā)生和心血管疾病等生物學過程中發(fā)揮著重要作用[9]。其中,miR-661 被證明可通過調(diào)節(jié)細胞色素C 增強星形孢菌素或腫瘤壞死因子α介導的骨肉瘤細胞凋亡[10]。

        此前有研究報道,circRNA circKEAP1 在系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者外周血單核細胞中的表達量顯著下調(diào)[11]。此外,還有學者報道 circKEAP1 對預測肺腺癌患者的生存率具有重要意義[12]?;虮磉_集合數(shù)據(jù)庫(GSE140256)分析結果顯示,circKEAP1 有較高的豐度,且在多個骨肉瘤細胞系中顯著高表達。由此推斷,我們探討了circKEAP1 通過海綿吸附miR-661,進而調(diào)控其靶基因白血病抑制因子(leukemia inhibitory factor,LIF)影響骨肉瘤增殖與遷移的分子機制,并為探索基于circKEAP1-miR-661-LIF 軸的骨肉瘤新型治療靶點提供依據(jù)。

        材料和方法

        1 材料

        凋亡檢測試劑盒購自BD;24孔Transwell板及小室購自Corning;CCK-8 和雙螢光素酶報告基因檢測試劑盒購自碧云天生物技術有限公司;小干擾RNA、miR-661 模擬物與miR-661 抑制劑購自上海吉瑪制藥技術有限公司;LIF過表達質(zhì)粒購自漢恒生物科技(上海)有限公司;Lipofectamine 3000、胎牛血清、DMEM 高糖培養(yǎng)液、Opti-MEM 培養(yǎng)液、胰蛋白酶溶液和 PBS 購自 Thermo Fisher Scientific;總 RNA 提取試劑盒購自康為世紀生物科技股份有限公司;逆轉(zhuǎn)錄試劑購自艾科瑞生物;熒光定量PCR SYBR Green熒光染料購自翌圣生物科技(上海)股份有限公司;熱穩(wěn)定性的DNA 聚合酶(Taq 酶)購自南京諾唯贊生物科技股份有限公司;放線菌素D 購自Selleck;引物購自北京擎科生物科技有限公司;

        2 細胞

        293T、143B、HOS、U2OS、SJSA-1、MG63 和hFOB1.19 細胞系均購自美國模式培養(yǎng)物集存庫(American Type Culture Collection,ATCC),培養(yǎng)條件均為含10%胎牛血清的DMEM 高糖培養(yǎng)液,培養(yǎng)環(huán)境為5%CO2、37 ℃恒溫恒濕細胞培養(yǎng)箱。

        3 主要方法

        3.1 PCR 與RT-qPCR 根據(jù)總RNA 提取試劑盒說明書提取處理后的U2OS、HOS、MG63、143B、SJSA-1與hFOB1.19 細胞的總RNA。隨后使用艾科瑞生物的逆轉(zhuǎn)錄試劑將總RNA 逆轉(zhuǎn)錄為互補DNA。PCR為 10 μL 體系,其中 2× Taq 酶取 5 μL,互補 DNA 取0.5 μL,正、反向引物各取 0.25 μL,去離子水取 4 μL。反應條件:95 ℃預變性3 min;95 ℃變性15 s,60 ℃退火20 s,72 ℃延伸30 s,共35個循環(huán)。將上述PCR 產(chǎn)物加入1%瓊脂糖膠,120 V 恒壓電泳30 min后顯影。對于RT-qPCR,將β-actin 作為內(nèi)參照。反應體系為 10 μL,其中 2× SYBR Green 預混液取 5 μL,正、反向引物各取0.25 μL,互補DNA 按照1∶10用去離子水稀釋后取4.5 μL。反應條件:95 ℃預變性5 min;95 ℃變性10 s,60 ℃退火/延伸30 s,共40個循環(huán)。采用 2-ΔΔCt方法計算 circKEAP1 及 KEAP1 的相對表達量。circKEAP1 的正向引物序列為5'-CGAGAAGTGTGTCCTCCACG-3',反向引物序列為5'-CACTCAGGGACCTCCCCAAAAT-3';KEAP1 的 正向引物序列為5'-CTGGAGGATCATACCAAGCAGG-3',反向引物序列為5'-GGATACCCTCAATGGACACCAC-3';β-actin 的正向引物序列為 5'-AGAGCTACGAGCTGCCTGAC-3',反向引物序列為5'-AGCACTGTGTTGGCGTACAG-3'。

        3.2 質(zhì)粒構建 選擇上海漢恒生物科技有限公司的 pHBLV-CMV-MCS-3FLAG-EF1-ZsGreen-T2A-PURO 載體,依次加入載體DNA(1 g/L)、10×Buffer、超純水、限制性核酸內(nèi)切酶(EcoR I和BamH I)試劑,輕輕吸打混勻,置于37 ℃水浴鍋中反應2 h;酶切結束之后進行瓊脂糖凝膠電泳,回收目的片段。設計的引物進行目的片段PCR 擴增后,瓊脂糖凝膠回收得到正確大小的目的片段。將目的基因片段(大于100 ng)、線性化載體、無縫克隆試劑預混液與超純水配置克隆連接體系,于在50 ℃反應30 min后,置于冰上5 min。隨后將DH5α 感受態(tài)細胞從-80 ℃冰箱拿出來之后立刻放到冰上融化,加入1 μL目的質(zhì)粒,冰上放置30 min,42 ℃熱激90 s,立刻插入冰上冰育2 min,隨后加入 500 μL 不含抗生素的 Luria-Bertani(LB)肉湯培養(yǎng)液,在37 ℃恒溫搖床上震蕩培養(yǎng)60 min。將菌液涂到相應抗性的固體平板上,涂布均勻,然后將板倒放37 ℃恒溫箱培養(yǎng)16 h。次日,挑陽性單克隆,進行測序,確認序列無誤后,使用質(zhì)粒抽提試劑盒對質(zhì)粒進行擴增抽提。

        3.3 細胞轉(zhuǎn)染 將細胞接種于6 孔板中,待其生長到50%~60%密度備用轉(zhuǎn)染。準備兩個微型離心管,分別加入100 μL 的Opti-MEM 培養(yǎng)液。對于小干擾RNA 的轉(zhuǎn)染,在第 1 個微型離心管中加入 5 μL 的 Lipofectamine 3000,另一個微型離心管中加入10 μL 20 μmol/L 濃度的小干擾RNA,將兩個微型離心管共孵育15 min 后,將上述樣品滴入細胞培養(yǎng)液中。對于質(zhì)粒的轉(zhuǎn)染,在第1 個微型離心管中加入5 μL 的Lipofectamine 3000,另1個微型離心管中加入1 μg濃度的質(zhì)粒,并加入2 μL P3000。將兩個微型離心管中的溶液共孵育15 min 后,再將上述樣品滴入細胞培養(yǎng)液中。24 h后,換用新鮮的培養(yǎng)液繼續(xù)培養(yǎng)。

        3.4 CCK-8 法檢測細胞活力 將細胞接種于96 孔板,轉(zhuǎn)染si-circKEAP1 或miR-661 抑制劑或過表達LIF 后,將處于對數(shù)生長期的143B 細胞取出,棄去培養(yǎng)液,用PBS 溶液洗滌一遍后加入含有10% CCK-8溶液的培養(yǎng)液,進一步培養(yǎng)2 h。隨后將96孔板置于酶標儀檢測450 nm 的吸光度(A)值,并計算細胞活力。

        3.5 流式細胞術檢測細胞凋亡 將細胞接種于6孔板,轉(zhuǎn)染si-circKEAP1或miR-661 抑制劑或過表達LIF 后,將處于對數(shù)生長期的143B 細胞取出。使用PBS 溶液洗滌細胞,隨后使用無EDTA 的胰蛋白酶溶液將細胞消化下來,再次用PBS 溶液洗滌后,使用400 μL Binding Buffer重懸細胞。向上述樣品中加入5 μL Annexin V-FITC 和5 μL 碘化丙啶(propidium iodide,PI)并在避光條件下孵育15 min。最后將樣品置于流式細胞儀中上機,并分析細胞凋亡比例。

        3.6 細胞遷移實驗 將細胞接種于6 孔板,轉(zhuǎn)染sicircKEAP1 或 miR-661 抑制劑或過表達 LIF 后,將細胞消化并離心重懸計數(shù),均勻的鋪在24 孔Transwell板上層小室。上層小室中加入無血清培養(yǎng)液,下層加入含有10%胎牛血清的培養(yǎng)液。24 h 后使用4%多聚甲醛固定,在孔板中加入結晶紫染液染色1 h,隨后使用清水洗凈。取出Transwell 上層小室,擦去上層多余的細胞,置于顯微鏡下觀察,并記錄典型視野。

        3.7 螢光素酶報告基因?qū)嶒?將293T 細胞接種于24 孔板中,每組設置3 個復孔,待其貼壁并生長達到密度50%~60%。將1.5 μL Lipofectamine 3000試劑、1 μL P3000試劑、500 ng對應螢光素酶報告基因質(zhì)粒(野生型或突變型)及3 μL 標準濃度的miR-661 模擬物(或miR 陰性對照)于無血清Opti-MEM 培養(yǎng)液中共孵育15 min,并轉(zhuǎn)染入293T 細胞中。36 h 后參照雙螢光素酶報告基因檢測試劑盒說明書,使用裂解液裂解細胞并加入螢火蟲螢光素酶底物,通過化學發(fā)光儀檢測螢火蟲熒光素酶活性,隨后檢測海腎螢光素酶活性,計算螢火蟲螢光素酶與海腎螢光素酶活性的比值。

        3.8 Western blot 實驗 將三羥甲基氨基甲烷3.02 g、甘氨酸18.8 g 和十二烷基硫酸鈉1 g 加水溶解,定容至1 L,制成電泳液。將三羥甲基氨基甲烷5.8 g、甘氨酸2.9 g 和十二烷基硫酸鈉0.376 g 加水溶解,定容至800 mL,并加入200 mL 甲醇,制成轉(zhuǎn)膜液。組裝電泳槽,倒入電泳液,在配好的SDS-PAGE 膠中每孔加入15 μg 蛋白樣品與適量蛋白標準品。接通電泳儀電源后,首先以恒壓80 V 進行電泳,隨后以120 V 恒壓電泳直至樣品移動至分離膠末端。將PVDF 膜置于甲醇中激活,隨后將海綿、雙層濾紙、凝膠、PVDF 膜、雙層濾紙,海綿從下到上依次安裝并夾緊。根據(jù)目標蛋白的分子量大小,在冰浴中按280 mA 恒流的條件轉(zhuǎn)膜90 min。使用TBST 溶液配制5%的牛血清白蛋白溶液,將PDVF 膜置于配置好的牛血清白蛋白溶液中室溫封閉1 h。TBST漂洗后,將對應PVDF 膜裁剪后置于對應配置好的Ⅰ抗中,4 ℃搖床孵育過夜或室溫下孵育1 h。取出PVDF 膜,使用TBST 溶液洗滌3 次,每次10 min。將與Ⅰ抗對應種屬的Ⅱ抗按1∶10 000 的比例配制于5%牛血清白蛋白溶液中,將PVDF 膜置于含有Ⅱ抗的溶液中,于室溫在搖床上緩慢孵育1.5 h。取出PVDF 膜,使用TBST 溶液洗滌3 次,每次10 min。使用電化學超敏發(fā)光液進行曝光顯影。使用ImageJ 軟件對目標條帶進行灰度定量分析。

        從“伙伴”到“對手”:《美國國家安全戰(zhàn)略報告》的話語空間分析 ……………………… 劉文宇 徐博書(6.8)

        4 統(tǒng)計學處理

        用GraphPad Prism 8.0 軟件進行統(tǒng)計學分析,KS檢驗數(shù)據(jù)符合正態(tài)分布,方差分析數(shù)據(jù)符合方差齊性。數(shù)據(jù)以均數(shù)±標準差(mean±SD)表示,兩兩比較比較采用t檢驗。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

        結 果

        1 circKEAP1 在骨肉瘤細胞系中表達上調(diào),且具有更高的穩(wěn)定性

        通過對基因表達集合數(shù)據(jù)庫(GSE140256)的數(shù)據(jù)進行分析,我們篩選到在骨肉瘤組織中表達顯著上調(diào)的circRNA circKEAP1,又名has_circ_0049271(圖1A)。RT-qPCR 結果顯示,相比于對照成骨細胞hFOB1.19,骨肉瘤細胞系 U2OS、HOS、MG63、143B和SJSA-1 中circKEAP1 具有較高的豐度,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.01),見圖1B。circKEAP1 是由其母基因KEAP1的2 號外顯子自身成環(huán)形成,一代測序確認其circRNA 結構,且成環(huán)剪切位點為“TGGA”(圖 1C)。PCR 結果顯示,circKEAP1 僅存在于互補DNA 中,且不存在于基因組DNA 中。相比之下,其母基因KEAP1則同時存在于互補DNA 和基因組DNA 中(圖1D)。此外,我們使用放線菌素D 抑制RNA 合成。RT-qPCR 結果顯示,相比于 KEAP1 線性RNA,circKEAP1 具有更高的穩(wěn)定性,12 和 24 h 降解速率有顯著差異(P<0.05或P<0.01),見圖1E。

        2 circKEAP1 促進骨肉瘤細胞活力與遷移,抑制其凋亡

        構建針對circKEAP1 環(huán)狀剪切位點的小干擾RNA,使用 Lipofectamin 3000 將 si-circKEAP1 轉(zhuǎn)染入143B 細 胞 。 RT-qPCR 結 果 顯 示 ,143B 細 胞 中 的circKEAP1 表達顯著下降(P<0.01),見圖2A。CCK-8 實驗結果顯示,敲減circKEAP1后,143B 細胞的活力顯著降低,48 和72 h 相比差異有顯著統(tǒng)計學意義(P<0.01),見圖2B。細胞遷移實驗結果顯示,敲減circKEAP1后,143B 細胞的遷移能力顯著下降(P<0.01),見圖2C。此外,流式細胞凋術結果顯示,敲減circKEAP1后,143B 細胞的凋亡比例顯著上升(P<0.01),見圖2D。

        3 circKEAP1 結合 miR-661 影響 143B 骨肉瘤細胞的活力和遷移

        通過檢索CircBank 數(shù)據(jù)庫與CircInteractome 數(shù)據(jù)庫,預測能與circKEAP1 結合的miRNA 并取二者交集。進一步通過生物信息學分析與文獻檢索,得到在骨肉瘤細胞中具有抑癌作用的miR-661(圖3A)[10,13]。circKEAP1 與 miR-661 存在較高評分的結合位點(圖3B)。構建miR-661 模擬物、野生型及突變型雙螢光素酶報告質(zhì)粒。雙螢光素報告基因?qū)嶒烇@示,miR-661 能與circKEAP1 結合,而不能與位點突變的 circKEAP1 結合(P<0.01),見圖 3C。構建miR-661 的抑制劑,將 si-circKEAP1 與 miR-661 抑制劑(或miRNA 抑制劑對照)共轉(zhuǎn)染入143B 細胞。CCK-8 實驗結果顯示,miR-661 抑制劑能部分逆轉(zhuǎn)敲減circKEAP1介導的細胞活力降低,在48 和72 h 有顯著差異(P<0.05 或P<0.01),見圖3D。細胞遷移實驗結果顯示,miR-661 抑制劑能部分逆轉(zhuǎn)敲減circKEAP1引起的細胞遷移減少(P<0.01),見圖3E。此外,流式細胞細胞術結果顯示,抑制miR-661 能部分逆轉(zhuǎn)si-circKEAP1 介導的凋亡增加(P<0.01),見圖3F。

        4 miR-661能與LIF相互作用

        Figure 1. The characteristics of circKEAP1 and its expression alteration in osteosarcoma cells. A:the differential expression of circRNAs in osteosarcoma and its adjacent tissue in GSE140256;B:the expression level of circKEAP1 in osteoblast hFOB1.19 and different osteosarcoma cell lines including U2OS,HOS,MG63,143B and SJSA-1;C:schematic illustration demonstrated the formation of circKEAP1 via exon 2 of KEAP1,and the formation of circKEAP1 was validated using PCR followed by Sanger sequencing;D:PCR confirming the existence of circKEAP1 in 143B cells(circKEAP1 was amplified by divergent primers in cDNA but not gDNA,while KEAP1 was amplified by convergent primers in both cDNA and gDNA);E:the expression levels of circKEAP1 and KEAP1 mRNA in 143B cells treated with actinomycin D at the indicated time points were detected by RT-qPCR. Mean±SD. n=3.**P<0.01 vs hFOB1.19 group;△P<0.05,△△P<0.01 vs circKEAP1 group.圖1 circKEAP1的特性及其在骨肉瘤細胞中表達的改變

        為進一步探究circKEAP1 發(fā)揮作用的下游靶基因,我們將轉(zhuǎn)染si-circKEAP1 后的143B 骨肉瘤細胞進行轉(zhuǎn)錄組測序。熱圖顯示敲減circKEAP1的143B細胞與對照差異RNA 表達情況(圖4A)。TargetScan數(shù)據(jù)庫預測miR-661下游有1 293個靶基因。將預測數(shù)據(jù)與轉(zhuǎn)錄組中下調(diào)的RNA 取交集,進一步生物信息學分析結合文獻檢索,可得高評分靶基因LIF(圖4B)。在 143B 細胞中,使用 si-circKEAP1 敲減circKEAP1,進一步 RT-qPCR 分析顯示 LIF 的 mRNA 水平顯著下調(diào)(P<0.01),見圖4C。生物信息學分析結果顯示LIF基因上有3 個miR-661 的結合位點,分別位于3'非翻譯區(qū)135~157、983~1005 和1978~2001。分別構建針對3個位點的Luc-LIF突變型雙螢光素酶報告質(zhì)粒(以及Luc-LIF 野生型對照質(zhì)粒),miR-661 模擬物(與miRNA 對照)在293T 中共轉(zhuǎn)染。螢光素酶報告基因?qū)嶒灲Y果顯示,miR-661 能與LIF 結合,且3個位點均有較強的結合能力(P<0.01),見圖4D。

        Figure 2. circKEAP1 knockdown inhibited the viability and migration of 143B cells. A:the expression level of circKEAP1 evaluated by RT-qPCR;B:CCK-8 assay showing the viability of 143B cells transfected with si-circKEAP1 at 24,48 and 72 h;C:Transwell assay demonstrating the migration ability of 143B cells after circKEAP1 knockdown(scale bar=100 μm);D:flow cytometry detecting the apoptosis rate change after 143B cells transfected with si-circKEAP1. Mean±SD. n=3.**P<0.01 vs NC group.圖2 敲減circKRAP1抑制骨肉瘤細胞143B的活力和遷移

        5 circKEAP1通過LIF提高骨肉瘤細胞活力并促進其遷移

        Figure 3. circKEAP1 enhanced the viability and migration of 143B cells through miR-661. A:Venn diagram demonstrating the targeted miRNAs of circKEAP1 predicted by CircBank and CircInteractome database;B:the interaction regions and the sequence of circKEAP1,miR-661 and mutant circKEAP1;C:luciferase reporter assay showing the interaction between circKEAP1 and miR-661;D:CCK-8 assay revealing the viability changes of 143B cells transfected with si-circKEAP1 and miR-661 inhibitor;E:Transwell assay showing the migration ability of 143B cells transfected with si-circKEAP1 and miR-661 inhibitor(scale bar=100 μm);F:flow cytometry detecting the apoptosis rate change of 143B cells transfected with sicircKEAP1 and miR-661 inhibitor. Mean±SD. n=3.**P<0.01 vs NC+miR-NC group;△△P<0.01 vs si-circKEAP1+miRNC group;##P<0.01 vs Luc-circKEAP1 WT+mimic NC group;▲▲P<0.01 vs Luc-circKEAP1 WT+miR-661 mimic group.圖3 circKEAP1通過吸附miR-661促進骨肉瘤細胞活力與遷移

        討 論

        Figure 4. miR-661 could interact with LIF. A:heatmap of RNA sequencing demonstrating the differential expression genes between 143B cells treated with si-circKEAP1 and controls;B:Venn diagram showing the overlap between target genes of miR-661 predicted by TargetScan database and down-regulated genes in RNA sequencing data;C:RT-qPCR revealing the LIF mRNA expression after circKEAP1 knockdown;D:luciferase reporter assay exhibiting the interaction between LIF and miR-661 in the 3 predicted binding sites(diagram illustrates the sequences of the 3 binding sites). Mean±SD. n=3.**P<0.01 vs Luc-LIF WT+mimic NC group;△△P<0.01 vs Luc-LIF WT+miR-661 mimic group;##P<0.01 vs NC group.圖4 miR-661能與LIF基因相互作用

        circRNA 是一種共價閉環(huán)的非編碼RNA,不具備5'末端帽子和3'末端多聚腺苷酸尾巴。40 多年前,circRNA 首次被發(fā)現(xiàn)。隨后很長一段時間,這種RNA 被認為是一種無意義的剪切產(chǎn)物[14]。然而,近些年隨著高通量測序及針對circRNA 生物信息算法的發(fā)展,越來越多的circRNA 在真核細胞中被發(fā)現(xiàn)并鑒定,且呈現(xiàn)出一定的組織特異性分布[15]。大部分circRNA 定位于細胞質(zhì),經(jīng)可變剪切從編碼蛋白的基因中產(chǎn)生。通常circRNA 由一個或多個外顯子構成,也有少量由內(nèi)含子或內(nèi)含子聯(lián)合外顯子構成[16]。盡管circRNA 相對于線性基因表達豐度稍低,但其高度的穩(wěn)定性使得circRNA 在許多病理生理過程中發(fā)揮著重要的作用。小鼠circRNA-42398通過調(diào)控TGF-β1/Smads 信號通路抑制肝星狀細胞活化[17]。在結腸癌中高表達的circPTK2 可以與波形蛋白(vimentin)的Ser38、Ser55 和Ser82 位點相結合,促進結腸癌的進展。這也使得circPTK2 有望成為治療結腸癌的潛在靶點[18]。在骨肉瘤中此前有研究報道,circECE1 通過競爭結合c-Myc 蛋白泛素化位點,減弱c-Myc蛋白泛素化降解,促進TXNIP轉(zhuǎn)錄進而促進骨肉瘤的瓦博格效應[19]。鑒于circRNA 重要的生物學功能與作用,尋找在特定疾病中具有較高豐度與穩(wěn)定性的一類circRNA,可能是干預并治療特病疾病,尤其是腫瘤的重要靶點。

        Figure 5. LIF overexpression reversed circKEAP1 knockdown-induced inhibition of viability and migration of 143B cells. A:RT-qPCR revealing the mRNA expression of LIF in 143B cells transfected with si-circKEAP1 and LIF;B:Western blot revealing the protein expression of LIF in 143B cells transfected with si-circKEAP1 and LIF;C:CCK-8 assay demonstrating the viability of 143B cells transfected with si-circKEAP1 and LIF;D:Transwell assay showing the migration rate change of 143B cells transfected with si-circKEAP1 and LIF(scale bar=100 μm);E:flow cytometry detecting the apoptosis rate change of 143B cells transfected with si-circKEAP1 and LIF. Mean±SD. n=3.*P<0.05,**P<0.01 vs NC+Vec group;△△P<0.01 vs si-circKEAP1+Vec group.圖5 過表達LIF能逆轉(zhuǎn)敲減circKEAP1介導的細胞活力和遷移抑制

        本項研究中,我們通過分析基因表達集合數(shù)據(jù)庫GSE140256,首次檢測并篩選出在骨肉瘤組織中顯著表達上調(diào)的circRNA circKEAP1。經(jīng)RT-qPCR確認,相對于成骨細胞hFOB1.19,該circRNA在各骨肉瘤細胞系中高表達,同時使用放線菌素D 驗證了其具有較高的穩(wěn)定性。這表明circKEAP1 在骨肉瘤細胞中可能具有潛在的重要功能。circKEAP1 是由其線性轉(zhuǎn)錄本第2 號外顯子成環(huán)而來,針對其剪切位點我們設計了小干擾RNA,通過敲減circKEAP1的方法,驗證了其具有促進骨肉瘤細胞143B 增殖與遷移,同時抑制凋亡的功能。circRNA 具有較多微小RNA 結合位點,可通過海綿樣吸附微小RNAs 發(fā)揮作用[4]。這也是circRNA 被報道最多的作用機制之一。因此通過分析數(shù)據(jù)庫CircBank 與CircInteractome,結合文獻報道m(xù)iR-661可通過增強骨肉瘤凋亡抑制骨肉瘤進展,我們鎖定了miR-661 可能是潛在的circKRAP1 下游之一。circKEAP1 表面具有miR-661的反應元件,我們通過螢光素酶報告基因?qū)嶒烌炞C了二者的結合。此外,抑制miR-661 可以部分逆轉(zhuǎn)敲減circKEAP1對骨肉瘤細胞的抑制作用,這進一步驗證了miR-661是circKEAP1的下游信號分子。

        為進一步探究下游的效應基因,我們通過轉(zhuǎn)錄組測序分析篩選受circKEAP1 調(diào)控的基因,同時通過TargetScan 數(shù)據(jù)庫生物信息學分析miR-661 下游靶基因,取二者交集,經(jīng)過篩選得到LIF基因。LIF基因是白細胞介素6 細胞因子家族中最具多效性的成員之一,可激活多種信號通路,例如JAK/STAT 通路、MAPK 通路和PI3K 通路等。盡管如此,其在不同類型細胞中可能具有矛盾的相反作用,包括刺激或抑制細胞增殖、分化和存活等[20]。有學者報道,LIF可通過激活STAT3 通路促進骨肉瘤生長[21]。本研究中,我們驗證了LIF可與miR-661相互作用,且3個結合位點均有較高的結合力。過表達LIF基因可部分逆轉(zhuǎn)敲減circKEAP1介導的腫瘤增殖抑制、凋亡增加與遷移減弱。這表明,circKEAP1 可通過對miR-661的海綿吸附作用,進一步調(diào)控LIF,發(fā)揮其對骨肉瘤細胞的促腫瘤作用。當然,我們并不排除circKEAP1能夠靶向其他微小RNA,或者通過結合其他RNA 結合蛋白,甚至發(fā)揮翻譯作用引起骨肉瘤的生物學改變。該部分研究將在后續(xù)進一步展開。

        綜上所述,circKEAP1 能夠通過吸附miR-661,進而調(diào)控其靶基因LIF,促進骨肉瘤細胞的增殖與遷移。在體外水平,circKEAP1-miR-661-LIF 軸是干預骨肉瘤細胞生物學行為的重要信號靶點,為骨肉瘤治療提供了參考資料。

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