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        牛源嗜麥芽寡養(yǎng)單胞菌的分離鑒定、毒力、耐藥基因及生物學特性分析

        2022-10-21 02:46:40任雨龍李暢洋高炳南王秋菊
        中國獸醫(yī)學報 2022年8期
        關(guān)鍵詞:耐藥檢測

        任雨龍,李暢洋,孫 愉,張 昊,魏 笑,高炳南,王秋菊

        (1.黑龍江八一農(nóng)墾大學 動物科技學院,黑龍江 大慶 163319)

        嗜麥芽寡養(yǎng)單胞菌(Stenotrophomonasmaltophilia,SMA),屬于黃單胞菌科,寡養(yǎng)單胞菌屬,是一種嚴格需氧,能夠感染人和動物的致病菌。該菌通常能夠引起奶牛的呼吸道感染、敗血癥、心內(nèi)膜炎和菌血癥等[1]。臨床表現(xiàn)為采食量、產(chǎn)奶量下降,高熱,呼吸急促同時伴有神經(jīng)系統(tǒng)癥狀,嚴重的會引發(fā)多器官衰竭,甚至死亡[2-3]。

        隨著抗生素在畜牧養(yǎng)殖中的廣泛應用,SMA的耐藥性給感染后的治療帶來了極大的困難。由于該菌在動物臨床上的致病性不如其他病原體,故對其生物學特性、存在的毒力和耐藥基因,以及耐藥表型的研究報道少見[4]。目前,關(guān)于豬源、人源和魚源SMA的研究均有報道,但關(guān)于牛源SMA的試驗研究較少[5-7],且并未對該菌的毒力、耐藥等特性進行系統(tǒng)分析,臨床上參照豬源或人源等分離菌株的生長特性以及耐藥特性等信息,對奶牛SMA感染進行防治,不具有充分的指導意義。

        因此,為進一步了解牛源SMA的生化特性、毒力和耐藥特征,本試驗通過從荷斯坦奶牛瘤胃內(nèi)分離出目標菌株,并對其生長特性和耐藥表型等信息進行分析,旨在豐富牛源SMA的生物學信息特征,為科學防治SMA的感染以及合理用藥提供幫助,以期減少SMA感染所帶來的經(jīng)濟損失,增加奶牛養(yǎng)殖業(yè)的生產(chǎn)效益。

        1 材料與方法

        1.1 樣品采集在黑龍江省大慶市某規(guī)?;B(yǎng)殖場選取12頭荷斯坦奶牛,其中高產(chǎn)奶牛6頭,健康狀況良好,采食量正常。低產(chǎn)奶牛6頭,呼吸急促,采食量相對較少。一共采集12份瘤胃內(nèi)容物,置于37℃泡沫保溫箱中保存,迅速帶回實驗室進行后續(xù)試驗,采樣奶牛信息如表1所示。

        表1 采樣奶牛信息

        1.2 主要試劑與儀器血瓊脂基礎(chǔ)2號(HB6230)、MH肉湯(NB6231)、MH瓊脂(HB6232)、LB肉湯(HB0128)、胰酪大豆胨瓊脂培養(yǎng)基(HB0177-1)購自青島海博公司;Taq Master Mix、DL2000 DNA Marker、瓊脂糖購自TaKaRa公司;細菌DNA提取試劑盒購自北京天根生化科技有限公司;氨芐西林、紅霉素、克拉霉素等14種藥敏紙片購自杭州天和微生物試劑有限公司;質(zhì)控菌株嗜酸乳桿菌ATCC4356購自廣東微生物菌種保藏中心。

        1.3 細菌的分離培養(yǎng)將瘤胃內(nèi)容物使用無菌醫(yī)用紗布過濾掉飼料殘渣,為了后期方便挑取菌落,用生理鹽水稀釋至不同的濃度(10-1,10-2,10-3,10-4,10-5,10-6,10-7,10-8),取10-6,10-7,10-83個濃度在血平板上均勻涂布,置于37℃常規(guī)恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng),每組3個重復。每隔12 h進行挑菌操作,將菌落用劃線法接到新培養(yǎng)基平皿中,重復此步驟4~5次,直至平皿中菌落完全相同,沒有雜菌。

        1.4 DNA提取及測序取分離純化后的菌液,利用DNA提取試劑盒提取細菌DNA,添加細菌通用引物,進行PCR擴增,其中上游引物序列:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′,下游引物序列:5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′。預期擴增產(chǎn)物目的基因大小為1 500 bp左右,引物由上海生物工程公司完成[8]。

        25 μL反應體系:Premix Taq 12.5 μL、上下游引物各1 μL,模板DNA 5 μL,ddH2O 5.5 μL。反應程序:95℃ 3 min;95℃ 30 s,55℃ 45 s,72℃ 延伸30 s,30個循環(huán);最后72℃ 延伸5 min。

        PCR產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳檢測,將符合預期基因大小的樣品送至上海生物工程公司進行測序,再將測序結(jié)果與GenBank中已經(jīng)登錄的菌株進行同源性比對分析,使用MEGA 7.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。

        1.5 生化特性試驗將所有分離的純化菌株接種到硝酸鹽還原、甲基紅、靛基質(zhì)、硫化氫、尿素酶等生化特性培養(yǎng)基中,觀察結(jié)果。培養(yǎng)基的配制以及鑒定方法主要參照《伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊》第九版和《微生物學及檢驗技術(shù)實驗指導》。

        1.6 溫度特性結(jié)合序列比對與生化特性試驗結(jié)果,從分離的17株菌中挑出4株SMA進行生化特性分析。從各菌株培養(yǎng)液中抽取20 μL菌液于980 μL LB液體培養(yǎng)基中,以LB液體培養(yǎng)基為對照,置于搖床內(nèi)150 r/min,分別在32,34,36,37,38,40℃下培養(yǎng)24 h,每個溫度做3個重復,利用酶標儀測定D600值,以溫度(℃)為橫坐標,吸光度值為縱坐標繪制溫度曲線。

        1.7 耐酸堿特性同1.3接菌方法,在pH值分別為3,4,5,6,7,8,9的LB培養(yǎng)基中接菌,每個酸堿度做3個重復,置于搖床內(nèi)150 r/min,培養(yǎng)24 h,測定D600值。以pH值為橫坐標,吸光度值為縱坐標繪制耐酸耐堿特性曲線。

        1.8 耐膽鹽特性將接種菌液的無膽鹽LB培養(yǎng)基作為空白對照組,膽鹽濃度分別為0.5%,1.0%,1.5%,2.0%為試驗組,每個膽鹽濃度3個重復,置于搖床內(nèi)150 r/min,37℃,培養(yǎng)24 h后,測定D600值,并以膽鹽濃度作為橫坐標,培養(yǎng)液吸光度值為縱坐標繪制曲線。

        1.9 藥敏試驗本試驗以嗜酸乳桿菌ATCC4356為質(zhì)控菌株,將各菌株接種到MH肉湯培養(yǎng)基中,培養(yǎng)24 h后,抽取100 μL菌液置于MH瓊脂培養(yǎng)基上,均勻涂布。將各類藥敏紙片緊密貼于平皿中,倒置培養(yǎng)24 h后,記錄抑菌圈直徑。藥敏結(jié)果參照美國臨床實驗室標準化委員會NCCLS(2013)公布的標準,做出耐藥(R)、中介(I)、敏感(S)的判定[9-10]。

        1.10 毒力基因測定選擇與奶牛常見疾病關(guān)系較為密切的毒力基因mrkD、fimH和wabG為檢測基因,以添加特異性引物的菌株P(guān)CR擴增產(chǎn)物為樣品,檢測菌株中存在毒力基因的種類[11](表2)。

        表2 毒力基因引物信息

        1.11 耐藥基因的檢測參考相關(guān)文獻[12],并根據(jù)藥敏試驗結(jié)果,從GenBank中檢索到有關(guān)耐藥基因的序列,獲得鏈霉素類、碳青霉烯類、大環(huán)內(nèi)酯類等耐藥基因序列信息,利用DNAStar Lasergene 11.0 查找出各基因序列中的保守序列,在NCBI上設(shè)計引物,得到6類7種耐藥基因的引物序列(表3)。

        表3 耐藥基因引物信息

        1.12 菌株致病性檢測選取健康BALB/c小鼠35只,SPF級,4周齡,體質(zhì)量21~24 g,分為5組,每組7只。對照組小鼠灌喂LB液體培養(yǎng)基,剩余4組分別灌喂?jié)舛葹?×1011CFU/mL的SMA PMIK-2-a、PMIK-2-b、PMIK-2-c、PMIK-2-d菌液,灌喂量為300 μL/只,持續(xù)灌喂7 d,自由飲水,觀察小鼠健康狀況[13]。

        2 結(jié)果

        2.1 細菌的分離培養(yǎng)如圖1所示,分離菌株在TSA瓊脂培養(yǎng)基上呈灰白色,略凸起,圓形的點狀菌落。鏡檢觀察,菌體為直或者略彎曲的桿狀形態(tài),為革蘭陰性桿菌。

        圖1 分離株在TSA瓊脂培養(yǎng)基上的形態(tài)(A)及革蘭染色結(jié)果(B)

        2.2 PCR擴增產(chǎn)物檢測提取菌株DNA,進行PCR擴增,將PCR擴增產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳檢測后,發(fā)現(xiàn)目的基因片段大小為1 500 bp左右,與預測基因片段大小相符(圖2)。

        M.DL2000 DNA Marker;1~5.16S rDNA擴增產(chǎn)物

        2.3 基因序列比對將測序結(jié)果在NCBI的GenBank中進行同源性比對分析,發(fā)現(xiàn)所有分離菌株的同源性均在99%以上,初步確定分離菌株為SMA PMIK-2。

        2.4 系統(tǒng)發(fā)育樹利用MEGA7.0軟件將測序結(jié)果建立系統(tǒng)發(fā)育樹,進一步證明試驗所篩選出來的菌與GenBank比對結(jié)果的準確性,同源性達到100%(圖3)。

        K7為目標菌株序列;發(fā)育樹節(jié)點的數(shù)值代表Bookstrap值;編號數(shù)值為GenBank數(shù)據(jù)庫的登錄號

        2.5 生化特性鑒定本研究主要對所分離的17株菌進行革蘭染色、硝酸還原、靛基質(zhì)(吲哚)、產(chǎn)蛋白酶、淀粉酶、尿素酶、接觸酶以及發(fā)酵葡萄糖、產(chǎn)硫化氫等特性鑒定(表4)。參照伯吉氏系統(tǒng)細菌學手冊第9版,檢測結(jié)果基本符合SMA的生化特性。

        表4 分離菌株生化特性鑒定

        2.6 溫度特性在不同溫度條件下,4株SMA PMIK-2的生長狀況相似,均在培養(yǎng)溫度為38℃時,吸光度值達到最高,即菌群數(shù)量達到最大。而隨著溫度繼續(xù)升高,菌群數(shù)量開始迅速下降,即38℃為PMIK-2的最佳生長溫度(圖4)。

        圖4 SMA PMIK-2溫度曲線

        2.7 耐酸堿特性不同的培養(yǎng)基酸堿度對SMA PMIK-2的生長影響是不同的。當培養(yǎng)基pH在3.0~7.0之間時,PMIK-2的生長數(shù)量處于穩(wěn)定上升的狀態(tài)。當pH=7.0時,SMA PMIK-2菌群數(shù)量達到峰值,若培養(yǎng)基pH值繼續(xù)增加,菌群數(shù)量開始快速降低,說明PMIK-2的最佳生長pH值為7.0(圖5)。

        圖5 SMA PMIK-2耐酸堿特性曲線

        2.8 耐膽鹽特性隨著膽鹽濃度的增加,SMA PMIK-2的數(shù)量開始下降,當膽鹽濃度在0.5%~1.5%時,菌群數(shù)量下降較為迅速,繼續(xù)增加膽鹽濃度,菌群數(shù)量繼續(xù)下降。但當膽鹽濃度達到2%時,菌群數(shù)量依然大于對照組的50%,說明SMA PMIK-2具有較強的膽鹽耐受能力(圖6)。

        圖6 SMA PMIK-2耐膽鹽曲線

        2.9 藥敏試驗SMA PMIK-2在所使用的14種抗菌藥物中,對卡那霉素、頭孢氨芐、頭孢唑啉、克拉霉素、紅霉素、環(huán)丙沙星、諾氟沙星、氧氟沙星高度敏感,對多西環(huán)素中度敏感,對鏈霉素、氨芐西林、四環(huán)素、亞胺培南、慶大霉素等藥物不敏感(表5)。

        表5 藥敏試驗結(jié)果

        2.10 毒力基因檢測利用瓊脂糖凝膠電泳檢測SMA PMIK-2的PCR擴增產(chǎn)物,發(fā)現(xiàn)fimH、mrkD和wabG3種毒力基因在PMIK-2菌株均被檢出(圖7)。

        M.DL2000 DNA Marker;1.mrkD基因;2.fimH基因;3.wabG基因

        2.11 耐藥基因檢測同2.9檢測方法,檢測SMA PMIK-2的PCR擴增產(chǎn)物,在PMIK-2的基因中檢測到鏈霉素、碳青霉烯類和四環(huán)素類耐藥基因,與藥敏試驗結(jié)果相符(圖8)。

        M.DL2000 Marker;1.AadA1基因;2.BlaSHV-1基因;3.ErmF基因;4.TetD基因;5.TetA基因;6.Sul 1基因;7:GyrA基因

        2.12 菌株致病性檢測隨著灌喂天數(shù)以及菌液濃度的增加,小鼠死亡率出現(xiàn)不同程度的上升,灌喂1.0×107,1.0×109,1.0×1011CFU/mL組濃度的死亡率分別為28.6%~42.9%,42.9%~57.1%,71.4%~85.7%。剖檢死亡小鼠發(fā)現(xiàn)胸腔,肝臟、胃腸道均存在不同程度的出血現(xiàn)象。除LB組外,各組剩余存活小鼠體質(zhì)量、采食量和飲水量均較灌喂前下降,且精神萎靡,運動能力大幅度下降,出現(xiàn)畏寒扎堆的現(xiàn)象(表6)。

        表6 SMA PMIK-2致病性檢測

        3 討論

        本研究從荷斯坦奶牛的瘤胃內(nèi)分離到17株SMA PMIK-2,其中高產(chǎn)奶牛組4株,低產(chǎn)奶牛組13株。從中挑選出4株同源性存在差異的PMIK-2,對其生物學特性、耐藥性、耐藥基因和毒力基因等進行檢測分析。

        參照伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊第9版,分離菌株P(guān)MIK-2的生化特性鑒定結(jié)果與菌種屬基本一致。在本試驗中甲基紅特性檢測結(jié)果為陰性,與其他報道結(jié)果不一致,說明PMIK-2的生長繁殖不能以葡萄糖為營養(yǎng)原料,這可能是由于菌株來源不同導致的[14-15]。

        目前諸多對SMA的研究中,少見對其溫度、耐酸堿以及耐膽鹽特性的報道。而在本試驗中發(fā)現(xiàn)PMIK-2的最適生長溫度為38℃,最佳生長pH為7.0,具有較強的耐膽鹽能力。當膽鹽濃度增加到2.0%時,菌群生長數(shù)量在對照組的50%以上,說明SMA PMIK-2具有較強的耐受能力,能夠通過奶牛瘤胃并在腸道中存活。

        有研究發(fā)現(xiàn)豬源和人源SMA的耐藥檢出種類具有相似性,對慶大霉素、氧氟沙星、四環(huán)素和氨芐西林均呈現(xiàn)高度耐藥性[16]。這可能是因為2種來源的SMA均為革蘭陰性菌,且在一些相同種類的抗生素藥物的長期作用下,形成了較為相似的耐藥譜型[17]。豬源SMA呈現(xiàn)多種藥物耐藥性是由于養(yǎng)殖場內(nèi)廣泛使用一些磺胺類等藥物作為飼料添加劑導致的,而人源SMA的多種耐藥性可能是人醫(yī)臨床上對該菌感染的治療,長期使用多種抗生素藥物引起的[18]。人源和豬源SMA的耐藥表型與本試驗結(jié)果略有差異。本試驗中SMA PMIK-2僅對鏈霉素、氨芐西林、四環(huán)素、亞胺培南、慶大霉素等藥物存在高度耐藥性,而對卡那霉素、頭孢氨芐、頭孢唑啉、克拉霉素、紅霉素、環(huán)丙沙星、諾氟沙星、氧氟沙星等抗生素藥物高度敏感,這可能是由于奶牛養(yǎng)殖場長期使用的藥物與其他地點不同造成的。

        在PMIK-2中檢出的AadA1、BlaSHV-1和TetD3種耐藥基因與藥敏試驗結(jié)果相符。還有研究在SMA的基因中檢測到了fim、mrkD毒力基因以及BlaSHV-1和TetD耐藥基因,這與本試驗結(jié)果相同[19]。此外,在PMIK-2的基因中還檢出了wabG毒力基因,結(jié)合小鼠灌喂試驗結(jié)果,表明SMA PMIK-2對BALB/c小鼠有較強的致病性。因此,在本試驗中,分離PMIK-2菌株數(shù)量的差異有可能是2組奶牛生產(chǎn)狀況不同的原因之一。

        在臨床治療中,通常針對菌株所具有的毒力,以及攜帶的耐藥基因來決定使用藥物的種類[20]。因此,在治療SMA PMIK-2引起的疾病時,使用鏈霉素、碳青霉烯類和四環(huán)素類藥物的治療效果可能不是十分理想。

        此外,還有研究發(fā)現(xiàn)在SMA的耐藥性與耐藥基因的檢測結(jié)果之間存在差異,可能是除基因耐藥以外的其他耐藥機制引起,比如細菌細胞壁通透性的改變、細菌表達外排泵造成藥物的外排等原因[21]。在PCR試驗中,模板、試劑和焦磷酸鹽分子的聚集等因素也會導致在定量方面結(jié)果不夠準確,容易產(chǎn)生假陽性或假陰性結(jié)果,從而出現(xiàn)耐藥基因與耐藥表型不一致的情況[16]。

        綜上所述,SMA PMIK-2的最適生長為38℃,最佳生長pH為7.0,具有較強的耐膽鹽能力。其基因中攜帶毒力基因fimH、mrkD和wabG,以及耐藥基因AadA1、BlaSHV-1和TetD。PMIK-2對鏈霉素、氨芐西林、四環(huán)素、亞胺培南、慶大霉素等藥物高度耐受,且具有較強的致病性。在奶牛的養(yǎng)殖過程中應當注意SMA PMIK-2的預防以及治療,在臨床治療時應該避免使用具有耐受性的藥物,同時還要注意多種藥物合理搭配使用,這樣才能避免更多耐藥菌株的產(chǎn)生,從而減少SMA感染所帶來的經(jīng)濟損失。

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