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        膜聯(lián)蛋白A5在胰腺癌中的預(yù)后意義及機(jī)制的生物信息學(xué)分析

        2022-10-12 07:46:24仲成成李銘旭張功銘胡偉王仲
        中國(guó)普通外科雜志 2022年9期
        關(guān)鍵詞:胰腺癌免疫組化通路

        仲成成,李銘旭,張功銘,胡偉,王仲

        (徐州醫(yī)科大學(xué)附屬連云港醫(yī)院 1.肝膽外科 2.病理科, 江蘇 連云港 222001)

        胰腺癌是一種高度侵襲性的惡性腫瘤,其病死率幾乎與發(fā)病率相似[1-2]。胰腺癌早期癥狀不典型,許多患者確診時(shí),已經(jīng)出現(xiàn)局部進(jìn)展或遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移,不適合手術(shù),導(dǎo)致5年生存率低于11%[3]。此外,胰腺癌具有獨(dú)特的腫瘤微環(huán)境[4],缺乏有效的靶向治療手段,使胰腺癌患者的預(yù)后較差。因此,尋找可靠的分子標(biāo)志物對(duì)胰腺癌早期診斷及治療均有重要意義。

        膜聯(lián)蛋白A5(ANXA5)是鈣依賴磷脂結(jié)合蛋白家族的一員,通常存在于細(xì)胞質(zhì)中,它可以與鈣和磷脂結(jié)合,作為各種生理過程的內(nèi)源性調(diào)節(jié)因子[5]。參與細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、炎癥、腫瘤增殖、轉(zhuǎn)移和耐藥等[6-8]。已有研究[9]表明,ANXA5可能通過抑制RTK-Ras/Raf/MEK/ERK信號(hào)通路中的蛋白激酶C(PKC)活性參與癌變過程。在腎癌[10]、肝癌[11]中發(fā)揮促癌基因的作用,但在胃癌[12]、宮頸癌[13]中發(fā)揮抑癌基因的作用。目前ANXA5在胰腺癌中的具體作用機(jī)制尚不清楚。

        本研究利用TCGA和GEO數(shù)據(jù)庫,分析ANXA5在胰腺癌中的表達(dá)情況,及其在胰腺癌中的預(yù)后意義,并通過基因集富集分析(gene sets enrichment analysis,GSEA)進(jìn)一步預(yù)測(cè)其在胰腺癌中的信號(hào)通路,從而研究ANXA5在胰腺癌發(fā)生、發(fā)展中的作用機(jī)制。并通過免疫組織化學(xué)方法檢測(cè)ANXA5在胰腺癌組織中的表達(dá)情況,分析其與胰腺癌臨床病理特征的關(guān)系,并探討其在胰腺癌中的預(yù)后價(jià)值。

        1 資料與方法

        1.1 數(shù)據(jù)集資料

        下載并處理TCGA數(shù)據(jù)庫(http://www.portal.gdc.cancer.gov)中179例胰腺癌患者的RNA-seq數(shù)據(jù)及臨床病理資料;從GEO數(shù)據(jù)庫(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)中下載并處理3個(gè)胰腺癌數(shù)據(jù)集,包括GSE16515(平臺(tái)為GPL570,由36個(gè)腫瘤樣本和16個(gè)正常樣本組成)、GSE21501(平臺(tái)為GPL4133,由102個(gè)腫瘤樣本組成)與GSE15471(平臺(tái)為GPL570,由39個(gè)腫瘤樣本和配對(duì)正常樣本組成)。其中TCGA數(shù)據(jù)庫與GSE21501數(shù)據(jù)集具有患者完整臨床信息。

        1.2 病例資料

        選取采用的胰腺癌組織標(biāo)本為徐州醫(yī)科大學(xué)附屬連云港醫(yī)院2018年9月—2021年9月經(jīng)病理確診的49例胰腺癌患者的組織標(biāo)本?;颊吲R床數(shù)據(jù)特征見表1。胰腺癌臨床分期按照國(guó)際抗癌聯(lián)盟(UICC)第8版分期標(biāo)準(zhǔn)。所有入組患者術(shù)前均未接受任何針對(duì)腫瘤的治療,術(shù)后未進(jìn)行化療及靶向治療。本研究經(jīng)我院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(倫理審批號(hào):KY20190924002),所有患者均簽署知情同意書。

        表1 ANXA5表達(dá)與胰腺癌患者臨床特征的關(guān)系[n(%)]Table 1 Relationship between ANXA5 expression and clinical characteristics of patients with pancreatic cancer [n (%)]

        1.3 免疫組織化學(xué)檢查

        手術(shù)切除的胰腺癌與癌旁組織標(biāo)本經(jīng)4%多聚甲醛固定包埋在石蠟后切成4 μm厚的切片。將切片在二甲苯中脫石蠟并在梯度乙醇中再水合。用3%過氧化氫溶液阻斷內(nèi)源性過氧化物酶活性,并用3%山羊血清阻斷非特異性結(jié)合。隨后,將ANXA5一抗 (Affinity Biosciences有限公司,P08498,1∶100稀釋)于組織切片上孵育,4 ℃下孵育過夜。將磷酸鹽緩沖鹽水孵育的切片設(shè)定為陰性對(duì)照。將切片與過氧化物酶綴合的二抗一起溫育。二氨基聯(lián)苯胺用作色原體,蘇木素復(fù)染后,在200倍顯微鏡下觀察并拍照。

        1.4 免疫組化評(píng)分

        由2名與本研究無關(guān)的病理醫(yī)師采用雙盲法獨(dú)立評(píng)估免疫組化評(píng)分。免疫組化評(píng)分[14]由陽性細(xì)胞比率和染色強(qiáng)度組成,根據(jù)陽性細(xì)胞比率:<25%為1分,25%~50%為2分,51%~75%為3分,>75%為4分;染色強(qiáng)度評(píng)分:無色為0分,淡黃色為1分,棕黃色為2分,棕褐色為3分;將ANXA5表達(dá)的陽性細(xì)胞比率和染色強(qiáng)度相乘,陽性細(xì)胞率與染色強(qiáng)度之積分為0~4分為ANXA5陰性表達(dá),5~12分為陽性表達(dá)。

        1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

        使用R 4.0.5軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,采用Kaplan-Meier法繪制生存率曲線,采用Spearman相關(guān)分析基因間的相關(guān)性,0.1≤|r|≤1.0時(shí)定義為存在相關(guān);對(duì)預(yù)后影響因素進(jìn)行單多因素Cox回歸分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;使用GSEA4.1.0軟件進(jìn)行基因集富集分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié) 果

        2.1 ANXA5在胰腺癌中高表達(dá)

        通過數(shù)據(jù)庫分析ANXA5在腫瘤組織和非腫瘤正常組織中的表達(dá)水平,在GSE15471、GSE16515與TCGA數(shù)據(jù)庫中,胰腺癌組織中的ANXA5表達(dá)量明顯高于正常組織,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05)(圖1A-C)。通過免疫組化法檢測(cè)我院49例胰腺癌組織和癌旁組織中ANXA5的表達(dá),胰腺癌組織較癌旁正常組織表達(dá)明顯增高(P<0.001),與上述數(shù)據(jù)庫分析結(jié)果一致(圖1D-F)。

        圖1 ANXA5在胰腺癌組織與正常組織的表達(dá)情況 A:GSE15471;B:GSE16515;C:TCGA;D:49例樣本表達(dá)情況;E-F:免疫組化檢測(cè)ANXA5的表達(dá)Figure 1 Expressions of ANXA5 in pancreatic cancer tissues and normal tissues in GSE database and TCGA database A: GSE15471; B: GSE16515; C: TCGA; D: Expression of ANXA5 in the 49 samples; E-F: Immunohistochemical staining for ANXA5 expression

        2.2 ANXA5表達(dá)與胰腺癌患者生存的關(guān)系

        在有臨床信息的GSE21501和TCGA中,采用“survival”包繪制Kaplan-Meier生存率曲線,結(jié)果顯示(圖2),ANXA5的低表達(dá)與良好的預(yù)后明顯有關(guān)(均P<0.05),并根據(jù)免疫組化評(píng)分,以最佳截?cái)嘀祵?9例胰腺癌患者分為高表達(dá)組與低表達(dá)組,其中高表達(dá)組20例,低表達(dá)組29例,分析患者預(yù)后信息,ANXA5高表達(dá)患者的預(yù)后明顯差于低表達(dá)患者(P=0.008 2)。

        圖2 ANXA5表達(dá)與預(yù)后的關(guān)系 A:GSE21501中Kaplan-Meier生存率曲線;B:TCGA中Kaplan-Meier生存率曲線;C:49例樣本的Kaplan-Meier生存率曲線Figure 2 Relationship between ANXA5 expression and prognosis A: Kaplan-Meier survival curve in GSE21501; B: Kaplan-Meier survival curve in TCGA; C: Kaplan-Meier survival curve of the 49 samples

        2.3 胰腺癌預(yù)后影響因素

        為分析ANXA5表達(dá)與臨床病理因素對(duì)于胰腺癌預(yù)后的關(guān)系,在TCGA、GSE21501與我院49例樣本中進(jìn)行單因素Cox回歸分析,結(jié)果顯示在TCGA數(shù)據(jù)庫中,ANXA5基因高表達(dá)是胰腺癌預(yù)后的危險(xiǎn)因素(P=0.029),在我院49例樣本中顯示ANXA5表達(dá)(P=0.014)、臨床分期(P=0.036)及性別(P=0.043)與胰腺癌預(yù)后相關(guān)。多因素Cox回歸分析示在TCGA數(shù)據(jù)庫中,ANXA5基因高表達(dá)是胰腺癌預(yù)后的危險(xiǎn)因素(P=0.03),在我院49例樣本中顯示ANXA5高表達(dá)(P=0.041)是胰腺癌預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。根據(jù)我院49例胰腺癌樣本ANXA5表達(dá)的免疫組化評(píng)分(計(jì)量資料采用t檢驗(yàn))進(jìn)一步分析其和臨床病理參數(shù)的關(guān)系,ANXA5的表達(dá)與患者臨床分期(P=0.000 94)及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(P<0.001)有關(guān)(圖3);根據(jù)ANXA5表達(dá)陽性率(四格表χ2分析)提示ANXA5表達(dá)與淋巴轉(zhuǎn)移相關(guān)(P<0.001),而與性別、年齡、組織分化、臨床分期、神經(jīng)浸潤(rùn)無關(guān),差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05)(表1)。

        圖3 GSE21501與TCGA中單多因素Cox回歸分析及49例樣本中ANXA5表達(dá)與臨床病理參數(shù)的關(guān)系 A:GSE21501中單多因素Cox回歸分析;B:TCGA中單多因素Cox回歸分析;C:49例樣本中單多因素Cox回歸分析;D-I:49例樣本中ANXA5表達(dá)與臨床病理參數(shù)的關(guān)系Figure 3 Univariate and multivariate Cox regression analysis of TCGA and GSE21501 and the relationship between ANXA5 expression and clinicopathological parameters in 49 samples A: Univariate and multivariate Cox regression analysis in GSE21501; B: Univariate and multivariate Cox regression analysis in TCGA; C: Univariate and multivariate Cox regression analysis in the 49 samples; D-I: The relationship between ANXA5 expression and clinicopathologic parameters in the 49 samples

        2.4 胰腺癌中ANXA5基因通路富集分析

        為了解胰腺癌患者ANXA5基因通路富集情況,使用GSEA4.1.0軟件進(jìn)行基因集富集分析,結(jié)果顯示,在GSE21501數(shù)據(jù)集(P<0.01)與TCGA數(shù)據(jù)庫(P=0.04)均富集到TGF-β通路(圖4)。

        圖4 GSEA富集分析中TGF-β通路情況 A:GSE21501;B:TCGAFigure 4 Enrichment analysis of the TGF-β pathway in GSEA A: GSE21501; B: TCGA

        2.5 ANXA5基因與TGF-β通路及EMT的相關(guān)性

        TGF-β通路促進(jìn)細(xì)胞遷移、侵襲和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵機(jī)制之一是誘導(dǎo)上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT),為了解ANXA5基因與TGF-β通路及EMT的關(guān)系,在GSE21501數(shù)據(jù)集與TCGA中選取TGF-β通路及EMT的相關(guān)基因,采用R軟件繪制相關(guān)性熱圖,結(jié)果顯示,ANXA5基因與TGF-β通路的TGFB1、TGFBR1、TGFBR2、SMAD4基因均正相關(guān)(結(jié)果均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義),且在GSE21501數(shù)據(jù)集中,ANXA5基因與上皮標(biāo)志物E-cadherin(CDH1)呈負(fù)相關(guān),與間質(zhì)標(biāo)志物N-cadherin(CDH2)、VIM基因呈正相關(guān),由此可表明ANXA5基因與TGF-β通路及腫瘤EMT轉(zhuǎn)化有高度相關(guān)性(圖5)。

        圖 5 ANXA5基因與TGF-β通路及EMT相關(guān)基因的相關(guān)性熱圖 A:GSE21501;B:TCGAFigure 5 Heat map of the relationship of the ANXA5 gene with the TGF-β pathway and EMT related genes A: GSE21501;B: TCGA

        3 討 論

        胰腺癌是消化道惡性程度最高的腫瘤,診斷主要依靠高分辨率超聲、內(nèi)鏡超聲、計(jì)算機(jī)斷層掃描或磁共振成像,除手術(shù)外,目前不能切除的胰腺癌主要以化療[15]為主,包括單藥吉西他濱,吉西他濱加納米顆粒白蛋白結(jié)合紫杉醇,和FOLFIRINOX(葉酸,5-氟尿嘧啶,伊立替康,奧沙利鉑),盡管如此,胰腺癌患者的預(yù)后仍然很差[16-17]。因此,挖掘新的生物標(biāo)志物并研究胰腺癌發(fā)生、發(fā)展的分子機(jī)制是改善胰腺癌患者生存預(yù)后的重要措施。

        ANXA5基因位于染色體4q28-q32,為1.6 kb長(zhǎng),分子量為35.8 kDa,包括12個(gè)外顯子和1個(gè)內(nèi)含子,參與多種生理病理過程[18]。近期研究[19]發(fā)現(xiàn)在接受常規(guī)化療的兒童急性髓系白血病患者中,ANXA5的高表達(dá)與不良結(jié)局相關(guān)。另外研究[12]發(fā)現(xiàn)相較于癌旁正常組織,內(nèi)源性ANXA5在胃癌組織中表達(dá)顯著降低,但是無法解釋的是ANXA5高表達(dá)的胃癌患者的總生存率顯著低于ANXA5低表達(dá)的胃癌患者,ANXA5基因敲除可促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移,同時(shí)抑制胃癌細(xì)胞凋亡。目前在胰腺癌中尚缺乏針對(duì)ANXA5基因的研究,本研究基于生物信息學(xué)技術(shù),在GEO數(shù)據(jù)集及TCGA數(shù)據(jù)庫中分析了ANXA5在胰腺癌中的表達(dá)情況,并通過Kaplan-Meier生存率曲線評(píng)估其過表達(dá)對(duì)胰腺癌預(yù)后的價(jià)值。分析結(jié)果表明,ANXA5在胰腺癌組織中的表達(dá)顯著高于正常組織,且高表達(dá)ANXA5基因的胰腺癌患者的預(yù)后更差。進(jìn)一步單多因素的Cox回歸分析表明,ANXA5高表達(dá)可以作為判斷胰腺癌預(yù)后的危險(xiǎn)因素。在49例胰腺癌患者組織中ANXA5的表達(dá)明顯高于癌旁組織,且此基因高表達(dá)預(yù)示著較差的預(yù)后,與上述數(shù)據(jù)庫結(jié)果一致。并且在有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者中的表達(dá)要明顯高于無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者,表明了ANXA5與胰腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移呈正相關(guān),提示ANXA5的高表達(dá)可能與胰腺癌細(xì)胞的遷移和侵襲相關(guān)。本研究結(jié)果與ANXA5在胃癌組織的研究說明ANXA5在不同癌癥中既可以發(fā)揮抑癌基因作用,又具有促癌基因作用。

        在小鼠肝癌研究[11]發(fā)現(xiàn)ANXA5可以通過ERK2/c-Jun/pc-Jun(Ser73)和ERK2/E-cadherin途徑介導(dǎo)小鼠肝癌Hca-F細(xì)胞的體外惡性行為,證明ANXA5是肝癌Hca-F細(xì)胞系淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中的重要分子和肝癌的潛在治療靶標(biāo)。在前列腺癌細(xì)胞中,ANXA5通過抑制NF-κB p65磷酸化來抑制COX-2的表達(dá),ANXA5可能在細(xì)胞對(duì)促炎刺激的炎癥反應(yīng)中具有重要的保護(hù)作用,因此,將ANXA5的抗炎作用應(yīng)用到前列腺癌治療中,可以達(dá)到抑制腫瘤發(fā)展和改善耐藥的效果[20]。然而,目前尚不清楚ANXA5在胰腺癌組織高表達(dá)的具體作用機(jī)制。GSEA基因集富集分析顯示,在GSE21501數(shù)據(jù)集與TCGA數(shù)據(jù)庫均富集到TGF-β通路,提示ANXA5基因可能通過TGF-β通路在胰腺癌中發(fā)生作用。

        TGF-β信號(hào)通路參與到許多疾病的發(fā)病機(jī)制,如結(jié)締組織疾病、纖維化和癌癥[21],參與了肝癌[22]、肺癌[23]、胃癌[24]等腫瘤的發(fā)生與發(fā)展。在小鼠模型中,通過抑制膽固醇途徑可誘導(dǎo)TGF-β信號(hào)通路,從而促進(jìn)胰腺癌基層分化[25]。所以檢測(cè)胰腺癌中TGF-β信號(hào)通路活性具有重要作用。TGF-β信號(hào)通路活性檢測(cè)主要包括TGFB1、TGF-β受體(TGFBR1、TGFBR2)及SMAD4基因[26-28]。有證據(jù)[29]顯示,TGF-β通路促進(jìn)細(xì)胞遷移、侵襲和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵機(jī)制之一是誘導(dǎo)上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)。EMT的標(biāo)志是E-cadherin的缺失和Ncadherin、vimentin、slug、snail等的上調(diào),這些對(duì)實(shí)現(xiàn)運(yùn)動(dòng)和侵襲特性至關(guān)重要,并允許細(xì)胞通過細(xì)胞外基質(zhì)遷移并在遠(yuǎn)處形成轉(zhuǎn)移[30-31]。本研究中,通過繪制ANXA5基因與TGF-β通路相關(guān)基因及EMT標(biāo)志物的相關(guān)性熱圖,結(jié)果顯示ANXA5基因與胰腺癌TGF-β通路相關(guān)基因及腫瘤EMT標(biāo)志物高度相關(guān),表明ANXA5基因可能通過TGF-β通路及誘導(dǎo)上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)促進(jìn)胰腺癌的發(fā)生、發(fā)展。

        綜上所述,高表達(dá)ANXA5可以作為判斷胰腺癌預(yù)后的危險(xiǎn)因素,其機(jī)制可能是通過TGF-β通路促進(jìn)胰腺癌EMT轉(zhuǎn)化,有望成為胰腺癌診治的新靶點(diǎn),但本研究關(guān)于ANXA5在胰腺癌中的作用機(jī)制僅為生物信息學(xué)分析,有待進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。

        利益沖突:所有作者均聲明不存在利益沖突。

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