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        敵敵畏降解菌的篩選鑒定和降解能力研究

        2022-10-03 07:35:00張榮趙振華白鶴賈曉強
        應(yīng)用化工 2022年8期
        關(guān)鍵詞:生長

        張榮,趙振華,白鶴,賈曉強

        (1.天津大學(xué) 環(huán)境學(xué)院,天津 300350;2.天津大學(xué) 化工學(xué)院,天津 300350;3.天津華勘環(huán)??萍加邢薰?,天津 300170)

        敵敵畏(DDVP)是一種高效的有機磷殺蟲劑,2018年使用量達(dá)到了104t[1],嚴(yán)重污染環(huán)境[2]。三氯乙烯(TCE)是含氯污染物的代表物,其已被列入有毒有害水污染物名錄[3]。

        DDVP通過光催化化學(xué)降解[4]、化學(xué)水解[5]和微生物法降解[6]進行降解。目前能夠?qū)DVP進行降解的細(xì)菌如銅綠假單胞菌、鞘氨醇單胞菌等[7-15],真菌有曲霉屬、木霉屬和酵母屬等[16-18]。對TCE進行降解的有惡臭假單胞菌屬[19-20]、伯克霍爾德氏菌屬[21]。

        本研究以DDVP為唯一碳源,從土壤中篩選出多株高效降解菌,研究其對DDVP降解特性和生長最適條件以及對TCE降解情況,對農(nóng)藥污染土壤的原位修復(fù)提供實驗基礎(chǔ)和理論依據(jù)。

        1 實驗部分

        1.1 試劑與儀器

        DDVP(有效成分含量77.5%);三氯乙烯由阿拉丁公司購得;細(xì)菌基因組提取試劑盒和瓊脂糖凝膠試劑盒均購自博邁德生物技術(shù)有限公司;引物由擎科(北京)生物技術(shù)有限公司合成;其他試劑均為分析純。

        ME204精密天平;FE20K pH計;LDZX-75KBS立式壓力蒸汽滅菌器;SW-CJ-2FD超凈工作臺;HNY-111B恒溫培養(yǎng)振蕩器;GC-430氣相色譜儀;HT-TFG-01通風(fēng)櫥;UV-1200紫外分光光度計;Powercycler 96 PCR儀;DYY-6C電泳儀;LRH-150生化培養(yǎng)箱;DW-HW328超低溫冰箱;ECLIPSE E200顯微鏡;H1650-W臺式迷你離心機。

        1.2 土壤樣品采集

        于天津市某農(nóng)藥廠污染地塊采集農(nóng)藥污染土樣,約100 g,用封口袋封裝留存。

        1.3 培養(yǎng)基

        1.3.1 無機鹽(MSM)培養(yǎng)基(g/L) NH4NO31,K2HPO41,KH2PO41,MgSO4·7H2O 0.2,NaCl 5,CaCl20.02,F(xiàn)eSO40.05,酵母粉0.02,pH=7.2。

        1.3.2 LB培養(yǎng)基(g/L) 蛋白胨10,酵母粉5,NaCl 5。

        1.3.3 YPD培養(yǎng)基(g/L) 酵母膏10,蛋白胨20,葡萄糖20。

        1.3.4 MRS培養(yǎng)基(g/L) 蛋白胨10,牛肉膏10,酵母膏5,檸檬酸氫二銨2,葡萄糖20,吐溫80 1(mL/L),Na2CO35,K2HPO42,MgSO40.58,MnSO40.25,pH=6.5。

        1.3.5 富集馴化培養(yǎng)基 MSM培養(yǎng)基依次加10 g/L 土樣+100,300,500 mg/L農(nóng)藥作為碳源,逐級馴化。

        1.4 敵敵畏降解菌分離

        參考賀赟[22]的方法,以敵敵畏為唯一碳源,利用菌種馴化、搖瓶富集的方式分離土壤中的降解菌株。具體步驟如下:①在250 mL錐形瓶中加入100 mL MSM液體培養(yǎng)基,并濕熱滅菌。加入100 mg/L 的DDVP,再添加5 g土壤樣品,于30 ℃,200 r/min搖床中培養(yǎng)10 d;②取步驟①中的培養(yǎng)液5 mL加入到200 mg/L DDVP的MSM液體培養(yǎng)基中,放于30 ℃,200 r/min搖床中培養(yǎng)10 d;③取步驟②中的培養(yǎng)液5 mL加入到300 mg/L DDVP的MSM液體培養(yǎng)基中,放于30 ℃,200 r/min搖床中培養(yǎng)10 d。

        稀釋涂布后,平板法篩選單菌株。取轉(zhuǎn)接后經(jīng)降解的菌液1 mL于1.5 mL移液管中,以10倍稀釋法稀釋成10-5、10-6、10-7、10-8、10-9涂平板,篩選單菌落劃線培養(yǎng)[23]。

        1.5 敵敵畏降解菌菌株鑒定

        1.5.1 菌株形態(tài)學(xué)鑒定 分離得到的目標(biāo)菌株劃線在6種固體培養(yǎng)基平板上,以分離出單菌落,放入30 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng),觀察菌株生長情況及菌落形態(tài)、大小、顏色、邊緣等菌落的基本特征。采用革蘭氏染色法確定菌株革蘭氏類型。掃描電子顯微鏡觀察菌株顯微結(jié)構(gòu)。

        1.5.2 16sRNA基因序列分析 利用細(xì)菌基因組DNA快速提取試劑盒提取目的菌株基因,以上述提取的基因組DNA為模板,使用16SrDNA通用上游引物27F和下游引物1492R, 27F:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3和1492R:5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′擴增降解菌株的 16S rDNA 區(qū)域序列。經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳驗證,將PCR產(chǎn)物送往金唯智測序公司進行測序,測序結(jié)果使用NCBI數(shù)據(jù)庫中的BLAST程序查找同源序列進行比對分析,確定種屬。

        1.6 敵敵畏降解菌生長條件探究

        1.6.1 生長曲線測定 將篩選菌株按1%接種率接種于對應(yīng)富集培養(yǎng)基中,搖瓶培養(yǎng)220 r/min,30 ℃ 恒溫培養(yǎng)。初期每2~3 h取樣測定OD600(即溶液在波長為 600 nm 處的吸光值),根據(jù)菌株生長情況不同,后期可根據(jù)具體情況調(diào)整測樣間隔時間直至菌株生長到衰退期。

        1.6.2 培養(yǎng)條件探究 最適溫度的測定分5個水平,分別為20,25,30,37,40 ℃。每個水平做3個平行實驗。利用分光光度計法測定菌濃。

        1.6.3 生長pH條件優(yōu)化 最適pH值的測定分5個水平,分別為5,6,7,8,9。每個水平做3個平行實驗。利用分光光度計法測定菌濃。

        1.7 DDVP降解率及其耐受能力測定

        1.7.1 DDV農(nóng)藥提取及其分析 降解菌株在對應(yīng)富集培養(yǎng)基中培養(yǎng)活化至對數(shù)生長期,離心,去上清,無菌MSM培養(yǎng)基洗滌菌體3次,并對菌體進行稀釋,制成OD600在3左右的菌液,用等體積培養(yǎng)基懸浮菌體,4 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        將菌液按照1% 的接種比例分別接種于含有DDVP 100,200,300,500,1 000 mg/L的無機鹽基礎(chǔ)培養(yǎng)液中(MSM,不含瓊脂),搖瓶220 r/min,最適溫度下培養(yǎng)7 d。取上述培養(yǎng)液15 mL,8 000 r/min離心,去除菌體,取上層清液10 mL,加人10 mL丙酮,劇烈振蕩;再加入氯化鈉至飽和,劇烈振蕩1 min,室溫下靜置5 min,使水相與丙酮相分層。移出上層丙酮,過無水硫酸鈉柱,收集流出的丙酮,留待氣相色譜測定。

        1.7.2 氣相色譜測定條件 GC-430氣相色譜儀,F(xiàn)ID檢測器:檢測用色譜柱為Rxi-1HT(30 m × 0.32 mm × 0.25 μm)非極性色譜柱。方法:進口溫度290 ℃,檢測器溫度300 ℃,載氣為氮氣(99.999%),流速1 mL/min不分流,進樣1 μL。程序升溫60 ℃ 保持1 min,以30 ℃/min升至130 ℃,再以5 ℃/min升至170 ℃,280 ℃保持2 min。采用色譜純丙酮為溶劑,按峰面積定量。

        底物的降解率計算:在每個樣品中,包括對照組和實驗組。在計算出底物殘留峰面積的積分之后,底物降解速率公式如下:

        式中,AF指的是殘留底物的峰面積。

        1.8 TCE降解率及其耐受能力測定

        降解菌株的培養(yǎng)部分同1.7.1節(jié),用正己烷萃取培養(yǎng)基中底物。每瓶萃取 2 次,萃取液取至50 mL 試管中,用有機系濾膜過濾,去掉細(xì)微雜質(zhì),將樣品裝入 1.5 mL 的干凈的離心管中,置于-20 ℃ 保藏,待氣相色譜測定。

        氣相色譜條件同1.7.2節(jié),方法:進口溫度250 ℃,檢測器溫度260 ℃,載氣為氮氣(99.999%),流速1 mL/min,分流比10∶1,進樣1 μL。 程序升溫40 ℃ 保持4 min,以20 ℃/min升至250 ℃。采用色譜純正己烷為溶劑,按峰面積定量。

        2 結(jié)果與討論

        2.1 DDVP降解菌分離

        采用富集培養(yǎng),逐級馴化,平板劃線分離的方法,從長期受DDVP污染的土壤中分離篩選目的菌,在富集培養(yǎng)基上獲得了5株DDVP降解菌株(圖1A),命名為PD-1、PD-2、PD-3、PD-4、PD-5。對5株菌進行掃描電鏡觀察(圖1B),菌落形態(tài)特征描述見表1。

        表1 菌落形態(tài)特征Table 1 Colony morphology

        2.2 DDVP降解菌分子生物學(xué)鑒定

        將各個菌種純化后的PCR產(chǎn)物用DNA測序,獲得的16SrDNA序列在NCBI中比對(表2)。

        表2 16SrDNA比對結(jié)果Table 2 16SrDNA comparison result

        2.3 環(huán)境因素對DDVP降解菌生長的影響

        溫度對5株菌生長的影響都較大,生長情況在10~40 ℃范圍內(nèi)呈現(xiàn)先增大后減小的趨勢(圖2A),檢測培養(yǎng)24 h的OD600值,5株菌的最適溫度分別為25,25,35,25,37 ℃。pH值4.0~9.0范圍內(nèi),除PD-1外,其他菌株生長趨勢均隨pH增大而增大(圖2B),5株菌的最適pH值分別為6,8,7,9,9。

        2.4 DDVP降解菌降解率及耐受情況分析

        對5株菌進行7 d,5個濃度梯度的降解率測定結(jié)果見表3。

        表3 DDVP降解率Table 3 Degradation rate of DDVP

        由表3可知,5株菌在DDVP 含量100 mg/L下降解程度均超過75%,其中PD-3、PD-4降解率超過了80%,最高降解率為PD-4的82.46%。隨著DDVP濃度的增加,降解率呈下降趨勢,當(dāng)DDVP含量達(dá)到1 000 mg/L時,PD-4降解率為24.89%。

        對5株菌進行了TCE降解率測定,在TCE濃度100 mg/L,30 ℃條件下培養(yǎng)5 d,PD-1降解率達(dá)到53.57%。5株菌可耐受TCE濃度為500 mg/L。

        表4 TCE降解率Table 4 Degradation rate of TCE

        2.5 討論

        以微生物修復(fù)手段為主的含磷農(nóng)藥污染降解技術(shù)是解決土壤農(nóng)藥殘留的有效途徑。文獻(xiàn)中已經(jīng)報道了很多能夠降解或無害化農(nóng)藥殘留的微生物,包括真菌、細(xì)菌、放線菌等,其中以細(xì)菌為主。蔡穎慧等[13,23]從污染土壤中分離得到甲基桿菌屬DDW-1,在溫度28 ℃,初始pH為7.0條件下,500 mg/L DDVP經(jīng) DDW-1菌株代謝3 d后,降解率達(dá)63.7%。楊瑞紅等從南疆長期使用有機磷農(nóng)藥的梨園采集葉片,分離出DDVP降解菌假單孢菌屬PP-Y1,在pH 6.5,培養(yǎng)7 d條件下DDVP降解率達(dá)53.4%。本研究從長期受農(nóng)藥污染土壤中篩選出了5株高效DDVP降解菌,經(jīng)鑒定1株屬于氣單胞菌屬,4株屬于芽孢桿菌屬,在DDVP 100 mg/L,裝液量100 mL/250 mL,培養(yǎng)7 d條件下,降解率均超過75%,最高達(dá)到82.46%,比蔡穎慧和楊瑞紅的研究都高。利用微生物降解DDVP潛力巨大,微生物不僅可以降解DDVP,還可以降解其他含磷污染物和其他含鹵污染物,體現(xiàn)了微生物對環(huán)境的強大適應(yīng)能力。

        DDVP降解菌株的效率與環(huán)境因素的影響密切相關(guān),溫度、pH、DDVP濃度等因子均可以影響它們的降解率。DDVP濃度對降解率的影響相當(dāng)大,當(dāng)DDVP濃度<300 mg/L時, DDVP的增加,會促進菌株生長,當(dāng)DDVP濃度>300 mg/L時,則抑制菌株生長,這與付文祥等[16]的研究基本相同。DDVP是一種復(fù)雜的有機物,一方面可以作為碳源被微生物利用,另一方面,由于DDVP具有一定的毒性,不能被微生物直接利用,當(dāng)DDVP濃度較大時,會阻礙菌株生長,使生長量和降解率下降。

        除含磷農(nóng)藥對土壤的污染外,以三氯乙烯為代表物的含氯污染物也會對農(nóng)用土地產(chǎn)生污染。錢麗敏從高濃度三氯乙烯污染土壤中分離出一種叢毛單胞菌Comamonassp.以醋酸鈉為共代謝基質(zhì),10 d對TCE降解率超過90%[24]。本文研究了5株菌對TCE的降解和耐受能力,結(jié)果表明5株菌能夠有效降解和耐受TCE,說明在實際操作中能夠適應(yīng)復(fù)雜的污染環(huán)境,同時對多底物進行降解。

        3 結(jié)論

        (1)從長期受農(nóng)藥污染的土壤中篩選出了5株對DDVP有良好降解能力的菌株,確定其最適溫度分別為25,25,35,25,37 ℃,最適pH值分別為6,8,7,9,9。

        (2)5株菌表現(xiàn)出高效的DDVP降解能力。在DDVP 100 mg/L,裝液量100 mL/250 mL,培養(yǎng)7 d條件下,降解率均超過75%,最高達(dá)到82.46%。隨DDVP濃度的增大,降解效率不斷降低,當(dāng)DDVP濃度為1 g/L時,PD-4降解率為24.89%。

        (3) 探究了5株菌對TCE的耐受能力,5株菌在TCE 100 mg/L,裝液量100 mL/250 mL,培養(yǎng)5 d條件下,降解率最高為53.57%,并顯示出對TCE良好的耐受能力。

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